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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s483 | supercontig | LSalAtl2s483:98021..182334 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008124 >EMLSAP00000008124 ID=EMLSAP00000008124|Name=EMLSAP00000008124|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=377bp
MTKNEKFRIPIQSVVEEKCNKIKFDNSGCTPLFDKISCWPGGQPNTLIII PCFDEFRGIKYDITKNATRFCYANKTWASKADYNECIPLNGSHKEYLDPE YSDYTHSIYFIGYSISLLTLLISFIVFISFKEMRCLRNKIHINLFFTYIM SNFFWILTSAFQTVMTSNNGSAYIWCISIVFLRYFHLSTFFWMFVEGLYL FVQVIATFSVENSTFKLRHYLIIGWGIPLMIIILWSTLTANSSSTIMSTW LNYDESNLTSQKYNYQEKNGSDLEHLFNDDTLTCPFIDKNSYEWIYTGPV IVVLMLNSFFLVWIMWGFAVTLPYCFLNTEVRNITKNNWERWKMIRSLQN NSQNRNSITLATFYGXXSRKXSLFRCV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s483:98021..182334+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008124-703971 ID=EMLSAT00000008124-703971|Name=EMLSAT00000008124|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=84314bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s483:98021..182334+ (Lepeophtheirus salmonis) GCCTTTTTTTCAGGAAGAATGACAAAAAATGAAAAGTTCCGAATACCTAT
TCAATCTGTCGTAGAAGAAAAATGCAATAAAATTAAATTTGATAATTCAG
GATGCACTCCTCTATTTGACAAAATATCGTGTTGGCCTGGTGGTCAACCT
AACACACTTATAATTATACCATGTTTTGATGAGTTCAGAGGAATAAAATA
TGACATAACAAGTAATATAATTAACCTTCAAACAATTACAAGGGGCGTCC
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TTATATTCATTCAGGGAGTACTAGATATTTGGAGAGTTCATGCATTTTCT
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ATTAAACCCATGAAACTATTTCCCTTTTCTCTGATTTCCCTACTTTTTCT
TTCTTTTTTCTTAAAAGTGAAGAAATCTGAAAAAAATACTTAAATTTTTT
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CTTCAAATTCAATTTGATAATTTTGGGTAAGAAAGTTAAAATATGATGGG
AAGTTTTTCTACTTTTAACAATTAATTTCCTTTACAGGACAGAATACAAT
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ATTGCAGCTTCGGCGTAATTTCCAAATATTATTATTATCCACAAAAAATT
GAATGAATTGAAGATTTAGTAGAAGTTGTCGTCAAAGTATCTACAAAATT
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AAGTATCACATGTTTACCTTCAAATTTACTTCTCCTGGAGTTTTACACGT
AAAAGAATGGCCTAATAGTTCACAAACTCTTTCTTTAAACTTATTAAAAC
ATGGAATTTTGTTCAATGTATTACCTCTCTCGATTTTTGAAAAGTATATT
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CCTCAATTAAATCATGGACTACTTTTCAGGTGGAGGCACACCACTAGCGA
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GACAGGAGCATTGTTTGTTTCGTATTCTTCTCTATCCCTGAGAATGTTTA
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ATATATATATATATATATATACTTTTTATTATTCATTTCTATCGACAATG
TTAGAACTCTTAATGTGCGGTTTTTTTTTATCACAATATGTTGAATATTG
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AGCCTTATTGTTAATGTTCTGTCGTAAGATGCATTAATGCTTATAGAAAA
GGGCTTAAAAATGTTTTGTTTCCCACTTCGTAATATGCAACATATATACT
ACATACCTGGATATTAAAAAGTATATAATTGTAATAAGTGTTAATCGTAG
TAATTTATCAATTATATTATATGGCTAAACAATAAATACAAAATATGAAT
ATAAACTTAAATCAATGAAGTATATAAATAAATACATATTTGAATTACAC
CATAATTTACACTTGATAATCAAGAAAATAATTTTAATTATTAATGTCAT
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ATTTAGTGTAATCCGTAATTTATTTATTGAATATTGATCTGGAGATCCTA
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GCAACTCCAATAATGAGGCTTCTACATAGTCCCATCCTCATTCACCCTTT
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AAAAAAACATTTTATGTTTTCAAGCTCTTTTATAAGCATTATTGCATCCC
ACGACGGAACAATAGAGCTTCTTTTTACAATGTGGAATGTGGAAGTTCGC
GATCCGGATCAAAAGATGTAGATAAATCGGTATTTGTGCTGTCAAAGTTA
CATAATGTGCCTTATAATAGAAAACAAGTAGATTAAAATTTAAAAAATGA
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AACATCTTGTAACAAATAATTCGTGGGCCAAGATCAAAGTTAATGGAAAT
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GTATCGTCACGACTGCTGGGCAAGAGAGGGAGATTTTGACGTCATAAAGA
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GGACTACGTTGTGTGCCAAGAGATAGGAGTTTGGTATCCTTGGAGTATGA
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ATTATTATTACGATAGTAATAACTATTCACCATTRCAAAATAGTATAATG
TATTCGCGCAATGAAACTGTCTGTTGTGCAGTTGCAGGAAAGTGCTTGTC
ATCGAAAGGATCCATGAGGGAAATACCCTAGAATTTATGAGAATCATTTT
GAGAAAAATGCTTCTAAAGGGATTTAAGGGGGGAATTGNACCATTCCAAA
ATAGTATAATGTATTCGCGCAATGAAACTGTCTGTTGTGCAGTTGCAGGA
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AACTAAGAGAGTGGACCATTTTGAAGAAGATTCTAATGAAATATATAGGG
AGGCAGTTGACAAATCATCCGAAACCAACTTAAAATCAACTCAACCACTT
GTGTTAGAAAATGTTAACACATCTAATCAAGCATGTGTATCGCGGATTAT
AAAAATTAGTTGTGCTTCTAATACCAGAAAAGATCCACTCGTTCTAGAAC
TCGAGTCACCAAGGAAACAGAATTCAGATTTACACGGAAAAGTGAAAATC
CTTTAATAGGAAAATAAATTATAAAAATCCTAATCTAATTTTAAGGAAGA
GATGAAAGGAAAACTGGAAAAGAGATTTACTAAATCTCAATGTAAACTCA
GTATCAGTGGGACGAGGTTTGGAAAATTGAATGAGGAGGATTTTGTTAAA
GAACTTATACTGAAGTAATGGTTGTTGAGAATACTCCTGTCAGATCTGAA
GTAGTCCAATATTTTGTGTCTATGTTTCAACAAATTACAGGTTATAGTTT
CATCAATGCACTAATGTATATATAATAATCCCGCATCCCCTTGTAGGTCC
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AAATTATGATGAAAATACAATAGAACAACCTTCTAATGATTTACATCTTC
CTAAAATCTGGGAAGATGCTTTTTTTTATGTTATGTATTTATTATGATTT
ATGTTTATCATTACATAACAATGCATACTATGATTTTTTTTTAAATTTGT
GATCCTTGTAGATGTAATTATGTGGCACTTTATCACAATGTCCAATTCTT
TAATGCCGGGAGTGACAAAGTAACAAGATCTTTTGTTAAATTGAACTCCA
CACATTCTCCGAGGAGTCTTCATCTAGTATCTTCATTTGATGAAGAATGC
TTATGATAATTTATAGCCATCCTAACAAATGACAGTCGATACAAATAACT
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TGATACAATTAATTATGACAAGGCTGAATAGTTATCACAGAATAACTAAT
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TTATATTAATCTTGGGATAAAATTAATTGAATATCTTTGGTTAAATTAAT
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AAGTAGATGGAAAAACAAAATCGTTACTTGCGAAGAAGTGATATTAACTA
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TCTATTGTTTCCTAGAGTAATTTATTTTTTGTCAAAATCTATTCCTCAGG
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TACTTACATGTTCCCTATAAATATTTTGGAATAAGGTTATGAAGACTAAG
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GGGCAGAACCACCTTCTCCATAACATCCAGGTAGACCTCTGTATTGACCT
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CCTCACATGGCTGGTGCAGGTGGCTATCCACCTCTTGTTCTGCTAGTTGA
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CCGGGCTGCTTTGTGTGCTTGWGCTTGTTGAGCAATTTTGTTGAATTCAT
CAGCCTGCTGTCCTTGGCCTTCTGGGTCAAGATCTGGCCCACCTGTATCT
TTGTAGNGAATTCATCAGCCTGCTGTCCTTGGCCTTCTGGGTCAAGATCT
GGCCCACCTGTATCTTGTAGCTCCTGCACCTTAAATCCTCAGATACACAG
TCCCTTATTGTTTTCTAATGGCAGSCCATATCCCRCACCATGGCCTTCAT
GGACCTGGMAGGGMCATCCTCAACCATCTTCTTCACCTTGACGACAAAGT
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ATGGTGGCATCAACATCCCAGGTGTCTTCTAGCTTCTTACGGATACGCTG
AACAGTCCGTAAATTCACTCCTAAGGTTGAAGTAATCGTTGAATTGGAGA
TTTCACCTCTATTATTAACCAATGCCATGACTACGGCGGYCCTCAAAAGC
TCCTCGTTCCACTTATAGTTCTTTATCTCCTCATATGATGACGACATGAT
GCTTACTGAACTACGTACCGTCAGCTGACGAGAATAGCTTTCCTATTTGG
TAACCGGTTTTTTATTGGATAATGANGTCTTCAAGTTATCAAGGTTTAAA
GTAGGCGACAATCTGATCCCCGCTCTCTGTATTTTCGATTTTAGGAAAAA
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AATGCCTGGGACATTAAACTATTATATTTAATTCTGAACCCTTTTGCTTC
ATATAGAACAAAAAATTAAAACCTTAAAAATTTTAAAAATTTATCTTGCT
CCATATTTTATGTATAGTTGCACTCTTTTTTTTATATGAGATAACGAAGA
AAAAATATTCAAGTGCCGGCCGTTGAACTGTAGTTGGCTCAACTGTCATT
TTATGGTCAAAAATCCTTTGTTGTATGATCTTTTTTTTCTTCTCTAAACA
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ATGCATAATTCTTAGATTTTTGTGTTTTTTCTTTTTATTTTATACGAAGT
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TGTTCTGGAGTATTAAGAAATTGCATGAATCTCAATTCTAATTATTTATC
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AAGTTTTTTTACTCTTCCGTTTTTTTAGTTAAAACTGAAGAGATAATTTT
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ATTGCTTTATAATTGTATAAATAAACATTATACCTGTAAATTAGACCTCC
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TCAATTCAAAAATTCTATAAAAAAAATAGTGTTCATTTAATAATATGGGA
AGTAAAGTAAGAAATATATACATTTTCCACAGTCTTTTCACGGTTCATAG
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GTCCAAGATTCCACATGTGGGTCTTAGTACTCTTTTTATCTAGATTGGTG
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TATTTAATTTCTCCATATTTAAGTTTCACTGGCCAAGGTGCAGTGTTGGG
GTTCTACCTTGAGCTTCTTATTAACGGATATAGTAACTTCCTCTTTGAGA
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TCTTCCCACTCCAAAAATGATCTTCTTGTTGCTTGAAAAGGTACTTACTT
TTATAATTTTGGTGGATGATGTTCACTGTGGAACTCGAGTCGTACACTAG
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GAGATCAATGCATATATTTTTGGCTCAACTTTATCAAACAAAGCTAGGCC
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CTTTGGATTTGATGCCACCTTATATATAACTAAAGGAACTACCTGGGGGT
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GGAAGAATGGAAGTCTTATTCTTCTTTATTGTGGTACCAGTTTTGACCTC
AAAATATCGAAAACTTCAATATAATTTCAATACTCTTTTTTAGTTGTTTT
TCAGAGTTTGCCTCAATGATTAAAATAATATGAATAGCATAAAGGTCGAT
GGCATGCTTTTCTTTTTTAAAACTTACTCCAAAACCCTTTATTTACGTAT
ATTGTTTCTGTAAGTACGTTAAGAGCAGCTATAAAGAGTAGCAGTGACAC
AGGGCAGCCCTGACGGCAACTTCTTCTTTCCTTCTAGATTACTTTACATG
ACAGTCGATGTCCCATTATACAGTAGAGCTCTTATTGAATTAAAATATTT
ATTGGGAAGAAGTTTTTTACAGCTCTCATGACATGTCTGTGTTTTATAGA
GTCATAAGCTTCGGAAAAGTCAACAACAATGAAGGCTCCATCTGATTCTC
TTTTAGACACTGCTTCAATTACGAATTGGATATTCCATGACATATCTGAT
TTTCCTTCTTTTAAAAAAAACCCTTTTGCTCAATACCAAACTTTGCGTTC
AAAATAGGCTCAATCTGTTTTGACCTGCTACAATCCTATATGCAACATTT
ACTATGGTTACTGACCTCCAATGGTTGAAATCAGTGCTGTTGCCCTTTTT
TAGTAATAGGAATATTCTTCCTGTAGTAAGAGGCATTGGTCACCGTCTTG
ATTTTTCCATGTATTTCCCCAAAAGGAGGAGATAGGGAGCTATTTCTTTT
TTTACCAAAACCAAAAATCTTCCCGCTAATACCATCTGTGCCACTAGCCC
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TTCTATAAGAGTTGGAACTGAAGACAGATTTTGGGAATCGAAGGAAAATA
CTTGCTCATCACTTGCGAGAGATGCGCTTATTCGAAACTCTGTATTCCAC
GTCGGACAACAGGATGAAAATTCCTCTAAGGAATACTACCACGCATTATA
AGACAGCAAAATTGAGGAGAAATTCCAGCATCGAAACAATGAAAAGATCC
ATTCACGATGAGTGGGGAATTTAAATATTTCCATAATTATTATTTATAAT
TTCTTTATTGAATTTGTACGAAATGCGGTATTATATTTTGGTTTTATTTA
TTATGGGGTATGAAGTAATTATTATTACATGGTAAAAGTAAACATTATTA
AGATAATGTTGTATATTTACTATTACACCCCCATAGAAATTATGATGAAT
ATTTAAAGACACAGAATCATTCAAAATCCTTGGATATGCATATTTTTTAA
TTTTTTTTTTTTAAGGACAACATAGTATATTTTTATATGTTGTAAGTAAT
GATTTATCATCTTGTATAAGTTATTTGGGTCTAAAGAAATGATTCCGACT
TTGAAATTTTTTAGAAAATACATCTTGGAAAGAAGATTCCTGGATTACAA
CAATTTATCCAATACATCCAACAATTCCTATAATAACAAAAAATAGTTTA
AGTGCTCGGTTTACAGATTGAAAACTTCTGTTTTTCTGTTATTTTGTGTC
ATTTAACTATTTTTTCTTATGGATGCTACGTTGTATGAAAATTACATTAT
TTGTATTTAAATAGTCATATCAATAATTCTGCAGGGACAAAATGAGAGTC
ACAGAGTTTGTAAAAGGAAAGGTACTGAGGTAATGCCAGAGTCATCTTAT
ACATTATACATAATATAGAATACCATCCTCCCTCCACAAAAGGCCTCACT
CTTTTAATCTTTTAGAAAAAAAAAAAAAAATGCAGTATGACTATATTGCA
TATGCCGAGAAGGAGGGCTAAAACAGATGTCAACAATAAGTGTGTGCTGA
ATTAATATTATAGAAGTATATATTGAACATACACAGCCTATAATATTTTA
TATATTTCTATCGAATGTGAGACATGCACCTTGCTGATTCGGCCCATGAC
ACAAGGTTTTTAGTTCTACACCCAACCTGAGGGCTTGAAACTACTGTTTG
GTATTAGAAGGGTTCCTTGGATGTATGTGATGCATTGGCAATGGTTTTTA
GCTATCCCACACTKCCTCTGGGACKCCATCCAATCCGAGAGCTTTGAACT
AGTTTGTGGTATTAGAGGGACTGGTTGGATGTATTAAATGAATTGGTGGT
AGTTTTTAAGAATCTCTCAATACCCCCAAGGAAATGGCCAATTCGAGGGA
GGAGAGTATTCAACCGTATTTTAAGAGGCCCTAAGATATTTATTCTATAT
AGAAATAATATTACTCACACTTGAAGGTACTCCCTTGGGGNTTTGGAACA
AAAAAATAACTTTAGATATTGTCGAAATTATATTAAGCGAATTGATAATT
TGTTATTATTCATCATGAAGTCTAAACAAATTGGGGCAATATTCCTAACT
GGTAATTTTCTTCCATGCTAATTTTCTTCAGGCCAATCTTCCTTGTGTAG
TTTTCCGTCCACAGATTTCAATATTTAGATGGCATGGCAATTTAACATTA
ACATCCATAAAGGCAACTCTTCTCATGACTTTAATGAGAGCAATAACCAT
TTTAAGACGCAAATGATCAAGGACAGGGTCATTTTCTTCCAATATAAATA
TTGGATAAGTCATTCACCCTTGATAAAAACTGAGTAAGATAATATATTCA
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GGATTGAGCAAAAAAAAAAAAATATGATGTGCTTGTGGTCACCAATCTGA
GGGCCAAGGTACTCAATATAATGTATGGTGCAAGCTTTTCTGCTCAGCTG
TGTCTAGAAGTATCCAAGAGTTAATAAAGATTCACATAAGAATTTTTAGT
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GTGTTCCAGACAAAAAGTTATTATAAGTAGCACCACATGATTTGGATATT
TTTCAAATAACTTTATTAGATAGCTTCCATCATACAACATGTGTAAAGAG
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CGAAGGATAACAGTCTTATCTTTATAAATTTTTATGCAAGATCTGTTTTT
GAGTATTTTCCCAACGCATTCGTATGCCATCGACATATGCATTCAATATG
GTGTTGAAAGAATTTCCAAACCATCTATATTTTCTTAGTACGGACTTATC
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GTTAAGAGCAAAGGAAGATAGAAGAATCGAAGTTAGATACTTCTAACTTG
ATCATCAATAATAAGAGATGCTCAAATTCGTAATTCTATATTCCACGAGG
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AACGGAGTAGATTCCTTCCTTCAAAAGGATGGCCTATTATCGTTATTTAA
GCACCTGAGGATGATATCATGCTTTATGTTCACTACGGACACCCTGGACG
CTTCAAGAATCATCTCCAATGATCAGGAACTATTTGTGCATATTAATAAC
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TGATATGGTGGCCCTAACAGTTTGAATAATGTTTTAGATAAGANGCAGGT
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AGCATCGGATATCGGGTATAGGACGGTAATATTTTGATGTTAATATGGTG
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GCAATTTCCAGCTCCTCAAGAGAAAGTGCACAGTTTTTTTTAAGGACACT
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TGAAAATCGTTCAATCGAAAAATAGATTATTAAAATCCAAATCTAATTTT
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TTCCAGCATCTAAGTTCCTCCTAGTCCGTGGTTTAAAACATTGCCAAGAA
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GACATGCTTATTTTGTAGCTCCCGAATTATTTCTTGGAGCTGTTTACTGT
ACAGATATTTTGATTGTCACTAGTGTCAAACTCCGCGTACTATTTGATTA
TTTATTCCGTTTCCGAACAAACGCGTTTATCCAACTTCATCCCTTAACTC
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TGATGATATTTTCCTATGCTATTGCTAATCAGAAATCCATCCAATTCCTT
CCAATCCGTCTCGAAGGATCATGAATAAAACCTTTTTTTTTCTTTTTCGA
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AAAAAAGGGATATATATTCAAAAGAAATGCAACAATACAGGGAACACCAA
TATTACCAAGTGAAGGTTACAACTTTGCTATCCAGGTTTATTTGAGTACA
GATAAAGTCATTAAATAACAAAATGAACAGTGTACCGTATACTCAATATT
TAAATACAACAAATATTAGATTTAAAAAAAATGAGGTATATTAGGTATTA
TTATAATAATATATTAGAAAACCTATATATTGAGATAAATAAGAATTTTT
GTAATTTATGATAAGTTTCTCCATACTATCCCTTTATATTCAAATAATAA
AAGTGTATAATTTTGGGAGGAAGGAGAGTGTCCTAAAAGTATTTGATTTG
ATACCTAGATATAAAACTTTTGGTTATTACTTATTATACAAGCTTGCAAT
TCAAATTGTTGGCAAWTAAATYTTTMTTWAGTCCCATTAAATTAAATTTT
ACATTACTGAAATTAACGCATTGAAAATCACGTAAATACCCCTTGTAGAA
TATAATTTTATATTNCTTGTCGGCATACATTATTTTAAATAATTATGATG
AATTAAATGTTTTTTAGTCTAACCATAATAAAAAAACAAAGGAAAAAAGT
GAACTTTCAAAAACAGTTTCTCCCATTTTACGGGTTTTAGTACTAAAAAA
GTCTTCGTACAACACGTATTTCATAGAACAAGGATTTTTCTTGTTCCCAA
AAAAACCTCTCACGTGGGACCTCATGTATGTATAATTATTTTATTATGAA
TATTTGAAAAATACACCAAAAGTAAGCGGAAATTTTGATTTCATAAAGAG
ATGCTAACAAATTTCAAGAAACGACATCTAAAATCACGGTGATCAATCAA
AGAATGAACAAAAAAGAAAAACGAGGGTTTTCTTTTTTTAATCACAAATC
TATGAAATAAAATCAATTTTATTAAAAATTAGGAACTAAATCTACAGTGT
TAATGTTACGTTATTAATTCAAGTAAAATATTTCAATATTGGCAGTTCAA
TAATTTTGTTTAGTTCGAGAAAATAGATACTTWTTTWYTTTWTTTAAAWA
TAMATATAATTAATATTTTTTTTAATTTACAGGGATTTGCTGTCACCTTA
CCTTACTGCTTCCTTAATACTGAGGTTAGAAATATAACAAAAAATAACTG
GGAACGATGGAAAATGATTCGATCTTTACAAAATAATTCTCAAAATAGAA
ACTCAATCACGTTGGCTACTTTTTATGGCTGKGRATCTAGAAAAAAWTCA
TTATTTAGATGTGTATGATCAATACAATGTAACAAAAAAAATGTAATAAT
ATATATTATGATTTATATTAAGCAATAAATAAATATTTAATCTGCTTTAT
CAAAGTAATTTGCAAATATGTGTACTAAGACACTAGGGATATTAAAATAT
CGATAATTATAATGTTGAGTTGTGACCCCTTGGTATTATTAGTTATATTT
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AATGTTGAAATTATAAATACATAACATAAGTTTAATAATATTTATGAAGA
TTCGTTATTATTAATTGTATCGAAGTGATATTTCTTGAGGAAGCGTCTAT
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