EMLSAT00000008287, EMLSAT00000008287-704134 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008287
Unique NameEMLSAT00000008287-704134
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s500supercontigLSalAtl2s500:327173..353431 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008287 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008287EMLSAG00000008287-691053Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000036781EMLSAE00000036781-745709Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036782EMLSAE00000036782-745710Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036783EMLSAE00000036783-745711Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036784EMLSAE00000036784-745712Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776420auto776420Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008287EMLSAP00000008287Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008287

>EMLSAP00000008287 ID=EMLSAP00000008287|Name=EMLSAP00000008287|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=105bp
MHMFVKVNAKPLTFDEVYNQSSPTNCTVYCGGITTGLSEELLQKTFSHFG
CIQEIRIFKDKGYAFIRMNKFMSVCSTKIFFRKPNNNYYYVAVKKLILFV
ILFPI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s500:327173..353431+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008287-704134 ID=EMLSAT00000008287-704134|Name=EMLSAT00000008287|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26259bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s500:327173..353431+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCACATGTTTGTTAAAGGTAAATAAATATATAATTAGGATTTACTCCA TAAAGCTGGTTATACATTTCAAAGGTTTACCTATAAACATAAGTGGAATA AAGAATAGAAGACTTTTTTTTTCTTGGAAATTTAATCAAGTATAAATAAT CGACTTCTACCTTTCAAGTATTTATACTTATAGGCCAATTATATTTATGA TCTGAAGAAAACATAATTTAAAAAACATTTTTTCCCTCCATGTTGTGGTG GGATTTTAGGAGTTTGTTAAAAAGAAATCTCGCATGAACAAACAAATTGT CCTTAATTGAAACATATATATCAAGTTTGAGTCTGAATTAAATTATTAAA TGAAAAACTGATGATGTTTTTAATTATTTCTCAAAAATTAGGCCTCTCCC AGAATATACTTTTCAACACGAAACCAAAACATAGACCAAAAAAATTTTAG GGCATCAACGGATATGTAGATCAAAATTGGTTAATCATATACATCAGTTA ATACATATACATCTATATAAATTGAATCATTTATAGTAATTGGATGGAAA AGTCCCGGGCTTTACAGAGAAAATTACTTTTTTATTCCCTTTATAGACCA GAGACTTTATAGCAATTTCAATCAATTGCATCAAGAGTCAGTGTAAAATT AAAACAGGAAATTGTTTTGGAAATAACAAAAGCAGTCTCACACTTGGCAC AATAACTCACAAACTAATGAGCAAATTGTCATGCAACTTTTGACATCTTT CTTTTGAGGGTTTGTTCTGATTGAAAATAAGGTGAATTAAAAAAAATAAA AATAGGACCATCTATGTGAGAAGCCCGAAACCGAACCCACTATGTAGTTT TTTACCGCAATATAAAAAAATCAACTGTGGAGCATCAGCGGATATGTTAT TCTATTTCTGACTATCTGTTTCTTTTAATGGATTAATGTTTGAGTGACTT ATAACACAGGCCTCGTTTTCATTGGTGCTCCACTCATAATAATCCAAAGA ATTCAGGTTGGGTGAGCATGGGGATCTCAAATCTATGTACCAAAATCCTT CAGATCCTAAGGTAATTTTGAATCATAATAGAAGTTTTTGCTGGTCCATC TAATTAAGTCCATATCCATTAATAGCGAATTTGTCCATATTAAGGAACAT TTGGATCAGGGGTGTCCTTTATCCTTTCTCAACTACCTCAATTTTATCCA CGTGTTGTTTTAGGTCGCCCAGAATGAATGGAGTTTAGAAAATCATTCAG TTTCTTCAAAAAGCTTTTAAGGTTATAAACAGTCTTACGTAGGACTTAAA ATCTTTTGAAACCCTGTGGGAGAGAGTCCCCAGTCTTAATTTGAGGGTAA ATGCGTTTATATGGTTCTTTCATTTTGTCTCCTAGTTACTTATCCGTCAT GTTTTTGTAATATTTTATATGGAATTAAACCTTTTGAAAATTTCTTTAAA AATAGATATGGTCCATATCTATTTTCAAAGATATCTAACATTTCATTTTT TAGAACATTTAAAATATTTTAAAAAAATTGTGTAAGGTATTATGAGACAC TTTCTATAAATCCCTCGAGGTTGAGTATCTATATAAAAATGCAAACCATT GGATTCTAATTTATAATATATACATGTATAAATATTATTAAATGGGCTAA AACGAAGGGATATACATACGTTTATATAATTTGTTTTAGTCATGTGAAGA TATGTAAAATAAAATGGTTCAGCTGAAAAGGGAGACCTACAGCCCTATTT TGTTCCGCTTTCCCTTCTATAGAAAAGATAAACATGTTATCACTTCATTA TTAAATTAAAATTCATTTATTTTAATGAAACTCATACTACATGACATTCA TTTGCATATTTTCTTCACATTTAACATAAATGATACAACATTAATTGAAT 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