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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s502 | supercontig | LSalAtl2s502:254518..290606 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008299 >EMLSAP00000008299 ID=EMLSAP00000008299|Name=EMLSAP00000008299|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=419bp
MPPSKRENETLSSTSASNRSSTGTDDTGITPVPEETFLEKANDKVIELAN STGLKQWHVIVIISVVTLSLLLCFGWCIWRFFKKKRPRDKKKKDGKLEGD DEDYLVDNEEEVDIKDEPDKMRDSKEYLGKLQYKLEYDFNTQTLNVTAIQ CSELPALDMGGTSDPYIKVYLMPDKKRKFETKVHRKTLNPFFNETFAFKN VPYSETFDKVLVFAVFDYDRFSKHDQIGEVKVPLCMVDLAQTIEEWKDLC SVKVDDQYLGDICFSLRYVPTSGKLTVGILECKNLKKMDITGASDPYVKI KLLDRKGKRIGKRKKHQSRWRVNLELTVSDYDRIGTSDPIGRVILGYNRK GAEIKHWREMVENPRRPVIHWHVLQDPEPGEDDDDEKKKDSKKAKDGSKK EGTGSGNGANPGSGNGTTK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s502:254518..290606+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008299-704146 ID=EMLSAT00000008299-704146|Name=EMLSAT00000008299|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=36089bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s502:254518..290606+ (Lepeophtheirus salmonis) TACGCCTCAAAGCAAACCAAATATAGAAGAAGGGAAAAATTCATTCTTTT
CGAACGCAGTCCCGGTTTAAAAGTATTTGGAGAAAGGAGTGAGGTTCTCT
CTCTTCTTCTTTCGACTTTGGTACTTTTAGTAGTTGTGTGACGTGTATGC
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ATATAAGTGTACAATGCTCATCAAAAGAGATATAAAAGCAATATCATCAC
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ATAAAATTTCCAAAAGAGTGGTCAATGGTAATTTAAACTTCATTTACATT
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ATTTATATTAAATTCAGACAATGAAATTATAGTAAGATAAGAGATTGTCA
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GAGACAAGATATTTCATCTTGAGGAGATATGCAAGGGTAATTTGAAAATT
TTCCAACCTATCACAGATATAATATCTTTTTCATAATTTCTATTTTTCAA
CATAGTCTCCTTGTCAGCCCACACACTTCTCCCTGTAATACGCCATCTTT
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GTTTCTACTTCTTTTTTTTCCTTTTTTTGAAGCCGTTTCCACCACTGTTC
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TTACGGCTCSATACTAGATTTTGTTAATTTTCACAAAGACACAGAGACGA
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ATTTAGCCATTAAACTAAGAAACATATCAATTACCCCGTGAACCATCTGA
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ATAATAGCTTTGAGCTATTTTTCTACTGACTTAAATATGAAAATTTCAAC
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ATCCTTATTAATATCAGCTTCCTGTCGTATGATTTTAGAAAATGAATTAC
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GAATATTGTAATTATATTTAAATGAATATATATTCATTTATCGTAAAAAA
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CGGTAAACATAAGTTTTTTTTTTCTTTCCACAGATCCTTTCTTTAATCAT
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AGTAAAGTAGGGATACATCAATTTGATCGTAGTTTAGTAATGTGAGCAGG
ATGACTGTTCATAAAAATATGATCCATTTGAATGAAAGATAAACTTGACA
AGTTGTGCATATCTAAATTTGTATTTATTTTAATCACTTAATGATAATTA
ATTATTAAATTAATAAGTGTTGAGATTGCAATGGACTACCCGTTAGTTTT
TTCTTAAGTACATACGTAGATTAATAGATATATTCATTATCATTAGACCA
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GAAATGAAATTAAGTACTCTGTAAATGACTTGTTTACTGAAAAACTGAGA
AAATTGAAAAATATATTATTCATTCTATGTTCTTCCTCATAGCTTTATTT
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TGAAATTGGTTTATTTAGGAGCGTATATATAAATATATATTTAGTTTAAT
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TTTAKACCAATTCGGACGGACATCTTGGTTGATACTGTAGTCTCAAATTG
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TGAAATATTTTCATTTTCCCAAAGCATTTTATTAAATAACTCTTGCAATA
TTTTTCCCACGATATTATTCTCCATAACTGTTTTGGTTGTGCCTCCTTCC
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GTATAATGTCTGTAAGAATACCCTAACACGCACCTGAGCAACACTGGGTA
ATCGGTTGGATAAAAATTGTTAACTGCTCAAAACTTCAATTGAACTATAA
ATTATTACTGTCAGTACATTCTTTTTATTGTATTTTCTAATTTTGTGACT
TTTATACCATATTTGTCAATAATAACTATAATTCATCAAATATTAGAGAA
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GCTTTTATTATTTCATGAATATAATTGTTTAAAAGAAAGCTTGAGAACGT
ATTTACTAGAGTTAAGGCTCGGTCCGAGAACAAATTGGTGCCCTGTTTTT
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TTTTTCTRCTTCTTTTTTGTGGGACCGATGAATAACATATTTGACAGCAA
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AATTATAACCCTTTTAGACCAGTCTGAGATTTCCCTACCGACACCAGTGA
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AGAAAAAACCGAAAAAAATCGGTCTCAGMCCGAGTCTCAAGCCTAATGCT
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AAATATTGTGTTCATAATTTATATTGTAAGTATCACATGATGAAGTCTCC
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ATTATATTTGTGTTGACAGTGCACATATATATGTAAACCTAGTTGACGTC
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GCCTTTCATAAATTATAGAGCTGTTTGTCTCAGCTACAGCTTCTACGATT
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AATCTTGAATATATAACTAGAACAAAAACAGAACTATAAATAAAATATTC
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ACCTACCAATATTTTTTTTCGTTACAGACAAAAGCAAAACAAGTTATGAA
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CTCTATCATAGGATCCCATATCAACCACTCGGGTGAACTAATTACCCAAA
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ATAAGAAACTTTGTAATTCATAATAACGGAGATTAAATTGTAATTAAAGG
CTTTTGGAAGTTTTGGGACCCTACTCGGTACATATGTGGTGAATTAATAC
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ACCTCACTTTTACTATACATATTGCGATCATCCATAGGCTTTTTTTTGTG
ATAAGTGGAGATACTAAAAATGATTGATTATGGGTTAAAACCTTTATTTA
ATATATAATATTTAATTTCTCTCCGATACAGCTTATTTAGACTAAAATAT
ATCAAATTCTAATTACTTCATTGGGGTGATGAATTATTGCTACTTTAAAT
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AATTGACTATATTTATTCTTGAAGAAATACAAACGTAATTTGTCCTCAAT
TTTAAGAAAAATCATTGAATACAAATGACAGTATGCTTTTAAGCAATTCA
TTTTGTATGCAACTAATGTCAATATGACCTATTTTGATGCATATATTAAT
TTGTATATATTTTACAGTGTGAGCTAACCTACATATGTTATTTATTGCAA
AAGTATGGTTTTTCTTCCTCATGATATTGGCATAATCGTATTTAAGACTA
TGATTGATGGTGTAGAAACAAAACTAATTTAGTTTCTAGGAAAATATATA
ATCATGCTTGTACGAAGATACTTATTATATGAATAATATATACACACTTT
AACTCATATGTACCTATTATTTATATAGAAGAAAAAAAACAGTTATTAGA
GGGAAAGGTAATTTGCAAGACCATAATTTGTTTGTTTATGAGCTTCAGTA
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ATTTCAAGAAAAAACTTTGGATGGTCATCATCAAAGATTATGTACTCAAA
ATCTGCCCCTCCCCCCCCCCCAGTCTGAATGAGTACCAAGAAGCATGGAA
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CCCTTTTCTTTAGATAACTCTAAATTCCATAGTCCAGGGGTGCAAGGTTT
TAGGAGGAGGTGGGGCCACATGTTTATTGACTAATATGTTGGAAATTTTT
ATTGCATTACTTTTGGGGTTTATGGAACATATAGCTCGGAACACTGTCCT
GGTGCCAATCATATTTAACCTCAGGTTGGGGAAATCCAACTAGGGCTTAA
TGACATCATGCATCACTTTTGGTGTCCAGGAAATTCAGTGTAAACACACT
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TGGATTAAATTTAGAAATCTGACACATCTACAAGAGCTGATAACCAATAA
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TATTCACTGGAAGAAAACAGAAGCGATTCATCAAGCAAGATGGATGGCGA
TAAATATGTTCCCCCAGAAGATATTTATATTCAGCGAGGAAATGAAATAT
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GTTTTATACGTCAATATGGATGACTTCAGCATTTGCAGTGGATAKTCTCG
TAAATGATTTGACATTTTTCCAGAGATGTTATTGTCCCGAAGAATTGGTA
ATGAATTAGTGGAAGTTGTCATGAATAAGAAAGTCCATAACCACATGTGG
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TAATTATCAAAAGAGGAATATAACCCTGAAATTATATTCGACTAAAAAAT
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TGAAACTTAGGTCAGATTGGGAGCAAGAGCCTGTTGTATCATGGTCAGGA
AGTGAAGACCAGAAGAAAACAAAAAAATACATACATAATATTCGAGTGGT
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