EMLSAT00000008300, EMLSAT00000008300-704147 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008300
Unique NameEMLSAT00000008300-704147
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s502supercontigLSalAtl2s502:47815..74989 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008300 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008300EMLSAG00000008300-691066Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000036857EMLSAE00000036857-745785Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036858EMLSAE00000036858-745786Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036859EMLSAE00000036859-745787Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770577auto770577Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008300EMLSAP00000008300Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008300

>EMLSAP00000008300 ID=EMLSAP00000008300|Name=EMLSAP00000008300|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=672bp
MSGTLFTLVMDSMFHDLDTDAPQDIGISGTGINRMMYADDTILICNNLKS
LHVYLESFEIAAAKVGIPLNSNKLRLLSIIEGNKKVLKKKYIGYKXILHW
AKRTRKRLKVVRMSIILVVLTMFVLILYGNNILFETDHEVSKFRSSYIPP
EVIEFESNFVPNAGFMGKPYYISSQTKEEIDAVVKKYAFNKVASDQINVK
RILPDFRYNECLKIKYNETNXPSTSIILIFNGEALSVLLRTIWSIITQTP
PSLLKEIILIDDGSQTREMKEMLPMYMKSRFPKKVKLHRLKFQKGLIFAR
IAGAEFATGEVITFLDSHCEVTKGWIQPLLQRISENNHTVVIPQIDSISD
RTLSYHGVSNGNYINVGTFTWSGHFSWTSYTGKRESFTDPVPTPTMAGGL
FAINRKFFWHIGGYDNGMIGWGGENLELSFRLWRCHGRIETIPCSHVGHI
FRSFHPYFIPKDSHGINTVRMAEVWMDDYKGFFYLYRTDLREKAKIIAKD
LRDRHEIKKRLDCKSFKWYLESVIPGKFKMADEGIYWGRIRNVMWNDICL
DHLQRDSGHNRESYVMGQYPCHSILGSTQYFVYSSNHQLRNEFMCGDVSN
LQEFVMNACTENNNLDPTWIYTDKKQLIHQKSGLCLTADTFNAGSNLLMK
LCIVKTDNVDIKIQQWEFEFRK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s502:47815..74989+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008300-704147 ID=EMLSAT00000008300-704147|Name=EMLSAT00000008300|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27175bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s502:47815..74989+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTCAGGCACTTTATTCACTTTAGTGATGGATTCTATGTTTCATGATTT GGACACTGATGCGCCTCAGGACATTGGGATCTCTGGTACTGGTATCAACA GAATGATGTATGCTGATGATACTATCCTAATATGTAACAACCTTAAAAGC CTTCATGTCTACTTAGAATCTTTTGAAATTGCAGCAGCTAAAGTTGGTAT ACCATTGAATAGTAACAAGTTACGTCTGTTGTCTATCATAGAGGGGAATA AAAAAGTCCTCAAGTACGTTGACCCCTCCCATATACTCACTAGTTCGGAT GGTACTATCTAAAATATGGAAATAAATTATTTTTAGAAGTATTAAGGTAT ACACCACTCTAGTTTTGGGCAACAAAGAGCGGATATCATCAATGAACAAT GGTCCTGCAAACATGCCTTCCAGCACAAGGCTTCGGCGTAGAGAGGGTTA TAATATAGTTAACTACTTGGACTTGAAGTTACACCGGCCAGGAGTGCAGG TTTAAAAAAATAAAGTTTACAAAATAGGGGAGAATACATTAAAACCAGAT CTTGCATTAGTACAAGAAGGGAATTTGCACATATTGGACCCCACAATTGT TGGGAATACAACTGATTTAGTCTCGGCCAATACCGTAAAAAAAATATTTG TCAAACGACTTACTGGAATCTATTAAGCTAAAACACTTTCTGGAGAATGT AGTGTTTTGTGAAGTAAGAGGGATCGCCATGAATTGAATTCATTTGTTCA GTGAAGCTACCTTAATGCTGTCATGAATAGGAGAAGTATGAATATTTTGA AAGTTGCTTATAGAGATAATTATCCTGTCTGGTGTGATGTGATGGACAGG CTTMAAACATACTTTTTAATTCTTAAGATACAGGACAAAAGGAATTTAAC ATAGACAGTAAAATTGATATCAATAAAGTCTGGAAACGGTTCGTATTGGT TGTAAAACTATATAAAATTTTATGTCCTTCTTTAAATGCACATTACCTTT AAGAGTTATCTTTTTTCATCAATAAATTACTGAAGTCCTTTGAAGTATCC TATTGGATAAAAGCTTCCTCTACTTAAATAACAATTATATTTTCGTTTGA TATTCTAGCGGATGAAGTGGCTTCGGACGTATATTTATGCGTTGACAGAT ATTTGGGAATATTTTAAAATATACACAGAACTGCTGAAGGCTTCAAATAA CGCTTGTGAATTTGATTGTTCTGTAACTTGAATTTTTGAAATTCTCTCCA TTTGTTAGTACACTCACTGACAAGATTATCTTCCTGAAAGTGGAGTGAAA ACACTTCTGAATACTCAAAAGGTACCTAGGCTCCTTTAAATTGCCGTATA ATTCCTCTTAGCCACTTATCTTTTGAGGGTTCATCTTGAAATAATTAATC ATGAATAAGTAAAATGGAGGGGTTGGTCAATTCTCTATAATATCTGGAAT TAGACATATCAATACAATATTTGTTGGGCATAATGAGTGATGAGCAACAA AGAACTGGATTTTGAAATATGCAGAAAATTGTATTTATTTTTAAAGACTT TAGCTTAGATGCTATATTGCTTCAGCTTGTGGCGATATAATAACAATTAT TACTCTAATACATTCAATAGATCCTAGGATATACTTACAATCAAAAGCTT CACTAAAAGTATTTTAACTTCCGAGTTTACAATTGGCTACAATATCAATA ATTATTAATAAGAAATCATAAACTCTATGTATCTTCTAAAATAAATAACT CAAGGGAAAGAGATTGTGACTGATTGACTTAAAATTTGTAAGCTATCAAA ATACCTATTTCAAAGGTCATAAAAAGGTTTTATTTACTATTTAGTGAGCT TAATTTAATTATTTGTTATAATTAGCCAATAATTGCAAAATATTTTTCAT AATAGTAATGTCAAATGTGTTTTGCAGTGTATTATAAAAATAAAATAGCT ACGGATACAAGGTATCTATGCTTCTTGTCCATAAAAAAGTATACCTATCT AAAAAATATCAATAGAAGTATGTTGATGATCAATGGCATCAAACGTGTTC TTTGGAATCCAACCAAAGTTTCAAGAGTTTGTCTAGTAAAATGACATCAT TGAGTTTTTTAAAAGGATGTTACTCCATTTTATATTCGAAGTATTCGTAC TTGAATTATTTGCTTTAGGCCCATTTTGAGAATAATGTTTTTGATGAAGT ATCCAAAGGGATAATGGAGTTTTGATATATAATGCAATTATTTCTTATTA TTTGAACATTAGTTTAAAAAAAACGAAAGCTCTCGTTAAGCTGAAACTTT TTATTTAGGCATCTATCTCATGTATTCAAACATCCAATGTCATGAGGAAT TCACCTATTCGTCTCCTTGCCTAAGTCTAAGTTTATTTGGAAAMAGTTTC TATATGAGTTTTGACTGGCTCNNNNNNNTCATTGAGACCGTAATGTCAAA GAAGTTCAGCTTTGGGAATATGTCTCTTTTATGATTAAGGACTGTTTCAC AAAGATAAAGAAGACATCACATCTTTTTAATCAGGATTTTTCAAGATAAT AGCACTGAATATAGTAAATTCATGAATTACAACTTTAAACCCAGTAACCG AATTTAAATTTAAATAGAATTCTTCGTATTACAATCATTTTGAGTAACAA CGACAAGAGACGAAAATCTATCAAGAATTTCTCTTCATACAATTTATAGA AATATAAAAACTATGTTTATCTGAGCCATAGCTCTTAGTTATCTTGGTGA GTCAGTCCTTGCTCACTAAAGAAACAGATTCCGAGGTTTGAACTTATTTG ATATTAACATCAAAATGAGTAGAGGCAGTCCATACTCATCTAGAAACCCT TTTCGAAGAAGAAAAAAAGTAATTTTTCTTGAATAGCAACATTGACTATT AAATGGATTAGTTTTAATGGATTTAAATCCAAATTGTAATTCAAAGACTA CTAGCGAGAACCGAAAAGGACTTCATACGTTTTTTATTTTTGGAAAAGAG TAAATTCTTGAAATTAACTTCTTGGGTTGTCTAACTTATCTTTGGAAGAA CCACTTTGCGTCAATAATACTTTTTATTTAATTATCACTTAATGAAATCG CTTTCATAAAGTCTCAAGTAATAAAATTAAAGGACTTTTGTCAACGGGTG ACCCAAATTCGTCTTTCTCTAGCTAGTAGCCAGTATTTTTTGCTGGATAA TCATAATTATTATACAAGGAGGTTTATTATTCATTGTATTGTACTATGGA AGTGGGTTTCTTACTACATATCTATGTACATTGTACACTTTTAATCATAA TTAATCTGGATGCCATCTAAGAAATGGATTTATATATACCTACATCAACC CATAAATATATATTACGAATATTAAAAATATGCGTTACAGTATTTGCATG GAAGTTAAATAATATTCAGTAATATTTAATTATTTTTCTATGAAATTTAT TTTTTATTTATTCCCTTATTTTATTACCTCATAATCTGTTGTCCAAGTAT GTGTACATTTGATTTTGACACTCCATATAACAGTATTTTTCCGTAATGTG GTGCCACTCACTGGTGATGTATTTACAAACGAAGATAAGTCAACAAAGTA CACGCTCTATTGGCAGTCTTCTTTTATTGTACGTTAAACAGCCAAAATCC AGGTCTACAGCTGAACATATGTATTAATAATATCTACCACAGTCTAGTGT TTATCATATTTAAAGTAAAGTTTCAGATAGCNNNNNNNNNNNNNATTTAC TTTTTTTAAAMCAACATTTTCTATTTGTAAAAAGATTCAGAATTTTTAAA 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CCTACAGTTTTATTTTATAATAATTATTATTTAATAATGTCTAAATTACA TACGTCATTTATGAAGGTTTGGGAATGAACCCTAGGAATATCTTATTTTT CCTACTTTTACTAACGTTTTAATTTTTGATGTTTATCTAAAGAAACCTAA ACATCAATTAATTAGCATTGATGTTGAAATTAATTATACCTAATAATTAT AAAAATTAAAATTTGAATCTTCAACAGATTATTTTGCTTATGGAGAATGA CTCTCCAAATGCATCTACAAGTGTTTATGTAATTCCATTCAAAGATCCTT ATGAGCAAACCGATGAAGATAGGGATAACTAAGAAATAATTTGAAAAGAG CTCAATTGTCTTTGAAAAAGTTTGTTGAGCTCCAATACTGAGGTTTGTAT TCATCATCAAGATGACTTAGACGAAATTGAACATCCAAATTTCGATCAAA CTCAACGCATGTTTGAAAAAGAACAAATTACCGGTACATATAATCAGANT AATATATATCAGAATAGTTTTTTTTTATTTTATTTGTAGACGAATAGAAA GAGAAAACCGTCTTTCAACTGATCGTCGAAATCTAAAACGAATTTGAATG TTATGAGAAAACAGTTCCCGGCCAAATATSGCATCCAAGGTAAAATTCCA CATTATAAAAATTCAAAATGGAATAACTTAAAAATTCCATTTGATACCGA TTCTACACCAACTACCTACGACTTCATACAAATTATTCATACTGGATTTC TGTGTAGAGAAGAACAGAAGTGGAGACGAACCGATCTGCCTGTCGCTCAA ACAATCCAACCTTCAGTGAAAAGGTGAACAGTGATACAGCTTGAACGAGT GATGCCATAATGTACTAATAGCTATCTCAAAGCGACATAAAACAATATGT ATTGGCAAAGACGGGAAGGCTCAATAAATATCGTAATAAAAAACCGATGT 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AGTAACGTATTTGTTTCTCTATGACGTAACGGTATTAATAGCCTTATAAC GATATGGTTCAAACTTGTGAGTAAATCACACTTATTCCAACATTAAACCG ATAAAACCGTTCCAATTTCATCCTTATCTTCTCTTTTATTTAATTTCCTT TCATTTTTTTTTTCTTGAAGAATAAGAAACCATGAAATATTTGGATTTAC AAGAAAAAAATCATAAGATTATACTTGATTTTTTTTTAAAGGGAGGTTTT GTCAAAAGGTCCTCAAAAAATAGGAGCTATTATAATAAAAATGGACTGAA GGATAATAATAATAAAAAGGAAGAATAAATGCGTACTAAATTGTGAGTAG ACACTTCAGTGAACGCTCTTTTAAGAAAATTCTAAATGACTTTGATAAAC TTATAAAAAATGCATCGCCCAATCTTGAATCTTTGCAACAGAAAATGCTA ATCTTTATAACTACGAAATATTCATTAAGAAAATACCTAAAAAAATCATC CGGATGATATTCCCGCCATAAGTGAAATATTATCTAAGATAGAAGAAGAA CCTTCGTGTTAGATTAAATGAAAAATCAGTTATTTATTTGTTTCGGGATA TTTATCTAAATCGCAGTTCTCTAGATTTAAATGCACCTACTGTTATGAGC AACCTGTGGATTCAAAGGATATCTTACCATAACATTCGATGAATTAGTGG AGAATTATGGCAAAACTAAAATACTAGACCAAATAAGCCAAGGAGGACTC TATTCCGTTAGTAACGTCACGTTTTCTCTTGTAGTTCAAATACATAATGT CTACAGAAAATATCAAAGCTATTATTTTTTCAATGCCAAAATCTTTAAAG TGTATTTTCTCAAATTTATTGGATTAAAATTCTTTGTGAAGATATTCAAG GAGATCATAAATACTTAAATAGAAATTTTAAGTCATTTCTATTTAAGTGT 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TATTAACTAATTTAGCATATTTTATGTTATCGTTGGGATTTGAAACTTAA AGGGCTCATTGTTACACCACGCCCATTCAATCAAACTTTCTTGAGTATAT TGGAGGAATAAACCAACGAAAAAGGCTCATTGTAACAACACACCCAGTCA ATAAGACTTCTTTGAGTGTATTAGAAGAAGAGACTGTAGCGTGGTAATTG ATGCTGAAAGAGGTCATTATATAATCATTCGCGTGAACCTTGAAGCATAA GAGACTCATTGTAACACCACACATATTCAGTTTGACTTCTTTGAGTATAT TAGAAGAAGGGATTTTAGTGGGGTATTTGAAGCTTTATGGGATAATTATA AAAGCATGCGCGGGGGCTTAGAAGGTTCAAGGGCTCCTTGTAATATCTAT TTTTTTTATTTTTGTTTTTGTAGATATCGTCAGTTGTGTTAAAGACGGAT GAACTGATAATTAAAAATAATATAGCTTATTGAACGAAATTTTGAAAGTA ATCAAGCTATTCAATTCAAACACCGTCAATAAGACACTAAATATCAATTA TGAAAATTATTTTATTTGAAAGCTCAAATAATAATTCAAACTTTAATTAT TCTTTATATATTATAAAAAAGAATAAAAAATAAATAAATGATGAAAATTA CTCAACCCCAAGATCGCTTGAAAGTCCAAAACCTTGGTATATATTTCAGG TATAGGATTACAATAAGATCAATTAAACAATTTAAAATGTAATCTTATAA TATAAAACTTTATACTTTTCAATTTCTCACACGTGTTCTCCATATTACAT AATACAATATAATAATAATAATGTGAGATGCTCTCTGACGTGAGAGCGTC GTAATATTAGGGAAGAGGCATAGCTCACGAGCCGAGCTCTTAACATCTAT CATCACATCAAGAAAATAACATGACCAAGTTAACTTCGGAGGAACAAATA 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