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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s502 | supercontig | LSalAtl2s502:47815..74989 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008300 >EMLSAP00000008300 ID=EMLSAP00000008300|Name=EMLSAP00000008300|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=672bp
MSGTLFTLVMDSMFHDLDTDAPQDIGISGTGINRMMYADDTILICNNLKS LHVYLESFEIAAAKVGIPLNSNKLRLLSIIEGNKKVLKKKYIGYKXILHW AKRTRKRLKVVRMSIILVVLTMFVLILYGNNILFETDHEVSKFRSSYIPP EVIEFESNFVPNAGFMGKPYYISSQTKEEIDAVVKKYAFNKVASDQINVK RILPDFRYNECLKIKYNETNXPSTSIILIFNGEALSVLLRTIWSIITQTP PSLLKEIILIDDGSQTREMKEMLPMYMKSRFPKKVKLHRLKFQKGLIFAR IAGAEFATGEVITFLDSHCEVTKGWIQPLLQRISENNHTVVIPQIDSISD RTLSYHGVSNGNYINVGTFTWSGHFSWTSYTGKRESFTDPVPTPTMAGGL FAINRKFFWHIGGYDNGMIGWGGENLELSFRLWRCHGRIETIPCSHVGHI FRSFHPYFIPKDSHGINTVRMAEVWMDDYKGFFYLYRTDLREKAKIIAKD LRDRHEIKKRLDCKSFKWYLESVIPGKFKMADEGIYWGRIRNVMWNDICL DHLQRDSGHNRESYVMGQYPCHSILGSTQYFVYSSNHQLRNEFMCGDVSN LQEFVMNACTENNNLDPTWIYTDKKQLIHQKSGLCLTADTFNAGSNLLMK LCIVKTDNVDIKIQQWEFEFRK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s502:47815..74989+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008300-704147 ID=EMLSAT00000008300-704147|Name=EMLSAT00000008300|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27175bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s502:47815..74989+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGTCAGGCACTTTATTCACTTTAGTGATGGATTCTATGTTTCATGATTT
GGACACTGATGCGCCTCAGGACATTGGGATCTCTGGTACTGGTATCAACA
GAATGATGTATGCTGATGATACTATCCTAATATGTAACAACCTTAAAAGC
CTTCATGTCTACTTAGAATCTTTTGAAATTGCAGCAGCTAAAGTTGGTAT
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AGGTCTACAGCTGAACATATGTATTAATAATATCTACCACAGTCTAGTGT
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TAATTATTAGTTCTTTTCTTTTATTTTTTATGTAATTTGTGCGCAATAAG
TGCTGTATAGTTTATAAGTTTTTGCATTATTAATCTTTCTGGAGGAAAGT
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TACGTCATTTATGAAGGTTTGGGAATGAACCCTAGGAATATCTTATTTTT
CCTACTTTTACTAACGTTTTAATTTTTGATGTTTATCTAAAGAAACCTAA
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AAAAATTAAAATTTGAATCTTCAACAGATTATTTTGCTTATGGAGAATGA
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CTCAACGCATGTTTGAAAAAGAACAAATTACCGGTACATATAATCAGANT
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GAGAAAACCGTCTTTCAACTGATCGTCGAAATCTAAAACGAATTTGAATG
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TGTGTAGAGAAGAACAGAAGTGGAGACGAACCGATCTGCCTGTCGCTCAA
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CCCAAAATAGATTCGATGAATTTATACTGTATACACATTTCGCTAACAAC
AACTATTTTGGAAAGTTTCAATGCTCTTGAAAACCCCTAACAGAACTGCA
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GTGTTTATAGAAATAGTGGTATAATTTTAAATTGAAAGAAGAAACAATTT
ATTTTATTAATTGATTTTAGATGAGTATGTACAAAACTCCTGCTAACAAA
TTATGGTGAAAATATTAACACCAAACTTAAAACAGTAAACAGATATTTCT
TCTGTACGTTACGATAATGTAGTGCATCTAATTGTCAAAATAAATAAACG
AAATGCTTGTGCATCTTGTTTGTCAAGATACATATATAGATGCAAAAACT
ATGACACAGGTTTTTGTGCTAATTGTTTTGAAAAATACCATATTCAACAC
TTGTAAATAGTATGTAAACACGTATTTTTTATACATATTTATCGTAACAA
AGTTAACTTGGAATAAAAGAATACGAAAATTAGTTATAACCCTATTTATT
ATCATAGCATCATTTTAATTTATAGGTAAAAATATTTTTGTTGGAGATCT
TTCCAAGTGTACGCATCAACAGCACAAGTGACACTTTTGATGAAAAAATG
ATTTTGAATATTAATAAACGTACTAATAGAAGCTATTTTAGAAAATTTCA
TAAAAAAATTCAAACGATTTCTACACTCGGGAAGTAATGGGTTAAAGAGG
ATTGTTAATGTCAACCTACGTGTTTCCAGAAAATGTGTGAACTCTCCATG
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TTTAGTCCCGGTGAAGAATTATAATTAAATTTCCATTGATCGGAGTAATC
AGTAACGTATTTGTTTCTCTATGACGTAACGGTATTAATAGCCTTATAAC
GATATGGTTCAAACTTGTGAGTAAATCACACTTATTCCAACATTAAACCG
ATAAAACCGTTCCAATTTCATCCTTATCTTCTCTTTTATTTAATTTCCTT
TCATTTTTTTTTTCTTGAAGAATAAGAAACCATGAAATATTTGGATTTAC
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GTCAAAAGGTCCTCAAAAAATAGGAGCTATTATAATAAAAATGGACTGAA
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ACACTTCAGTGAACGCTCTTTTAAGAAAATTCTAAATGACTTTGATAAAC
TTATAAAAAATGCATCGCCCAATCTTGAATCTTTGCAACAGAAAATGCTA
ATCTTTATAACTACGAAATATTCATTAAGAAAATACCTAAAAAAATCATC
CGGATGATATTCCCGCCATAAGTGAAATATTATCTAAGATAGAAGAAGAA
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TTTATCTAAATCGCAGTTCTCTAGATTTAAATGCACCTACTGTTATGAGC
AACCTGTGGATTCAAAGGATATCTTACCATAACATTCGATGAATTAGTGG
AGAATTATGGCAAAACTAAAATACTAGACCAAATAAGCCAAGGAGGACTC
TATTCCGTTAGTAACGTCACGTTTTCTCTTGTAGTTCAAATACATAATGT
CTACAGAAAATATCAAAGCTATTATTTTTTCAATGCCAAAATCTTTAAAG
TGTATTTTCTCAAATTTATTGGATTAAAATTCTTTGTGAAGATATTCAAG
GAGATCATAAATACTTAAATAGAAATTTTAAGTCATTTCTATTTAAGTGT
TTGACGTAATAACAAAAATTGATTTAAAAACTTTTTTTTAAAATCAATAA
AGAAACATCTATAAATTGTGTGGTTCTTTTTTTAATATAATTCTTCTCCT
GCTGACTAACATGGCTTGTTCTCCTTAATAAGAAAAGAGGTCACATAGGT
CGGCTATGACTCCTAAATAATAACTTGAACCAGCTTTCATATTAAAAATT
ATATGTATATGTTTATAAAATTGTATAGGATGAAGATTATTTATGACCAA
TGGCCTCAGCCATACTGTGAAAAATTCGTGAGCATTCCAAATTGTTTAAG
AGTTCCGTGCTCTTAGCAAGATAAACTATTCTTTTCAATTTACACTCACT
ACGTCTCTAATAATTACTTCCTTTTTACAAATTTAGAAAAGAGTAGGACG
CATTTCCTCTGTAGGCTGTCCTTCTTTATGTGGCATATCTAACTTCTAAC
TTAATTAAACCCCAACTTGTTTTCAAGATAAAGATAAAATCTACTATAAA
CTTGCATTTGATATATGATTATTTTTTTCTATCGTGAAAACAATCTATAA
TTGTATGCTCTAACATTTCCTTATCTCTATTTGTCTTTTACATTGAAGGT
AATATACTTTGAAATATTGGTTTTTTTTTCCATAAAATTATTAAATATTT
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TTTATCATTTTTTCTGGTTTTATCCCACATTTGTGTTATATCAAACAGAA
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ATAAACCGGTAAGCGTCCTTTTCAAATTGTTTTGCTGTACTGACTGCTGT
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TAGGGATTTCTATAAAAAGACAGAATAATCGACTTAAACCGAGAAAGTTA
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ATGTTAAAAATATTTAAGACGGAGTCTTTAACATCTACACAGTTGTTAAA
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AAAAAGGGATAATTTAAAAGAATTGTGACAGCTTTTCTCTTTGTAACCCC
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TTTGATATTTGCAAAAACAACTTGGGATTATCTTTCCAAAGATAAGAGAG
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TATTATGTTGGCTAGCTGTTACCTTAAAAAAACAATAGATGCCAGATAAG
ATGGAGTTACCATGGCGAACGCTATGCCAAGTTCAGCAATTGAGTTGGGG
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CTAAAAATATATTATACAACATGGTAAAACTGTCGTGGAGGTCGGACAAC
CTTACAACCTGTCTGTCTATTCCAAATCCGAGTTATGAATTCAGGAGAAA
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GCATAGTTTGGCAATACTGGCAATACATGGTGTATGTTATAAACATTACC
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CCTGAGTGCCTATCAATTCTAGTCGAAATTGAGTAGGATAGGCAAAGACA
CAGAGGCAGAAAATGKCATATTCTCACGAATCTGTCTAGGGGGGGGGGGG
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CAACCTTAATTTACTTCACCTATTTTTATCTTAAAAAAGTGAGATGATTT
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TAATGCAGTCCATTAATTTCATTATCCTTTGTTATTGAGAGATGCCTAAA
TCCTCACACTCCAATCCATTGAAATTTAATTATGATTCATTGCCAGGAAT
TAAAGAAATCTTTTCATTGCTCTTCGTTACATCCATCCAGGGAGTACTAT
ATACATGAAGAGTTCACTGATTTTCTAGAAACACGTAAGCTGAGATTAAA
AATCCTCATTAGTATTTCTACGTGGCTAAAAAACTCTTTGAGTTTATCAT
ATTATGGTTATGGGTAGTGATTTAATTCATTATTCGACCAAAAGACTTCA
TATTTGTGGATCTATCTCATGTATTCATGAGAAACCTTAGTTTACCTAGA
AGAATCCCTGTATTCGTCTTCTAGCTACAGTTTTCCTACTTCTTCGAAAA
GAGTTCCAAGATGACTTTCGACTGTCTCTTCTAATCTTAATTTAGATAGT
AATGTAAAATAACATTGAACTTCGAAATAGATTTCCTTAGTGACCGAGGT
GCAACTCATGAAGAAAGGGAAGAGTTCTTATTGTTTTAGATGATTTTTAA
GAAAATAAAAATATAGTTCATTCACTCCTTGTCACGTAGTGACGCATGAT
TAAAATAAGGAGTTTTAGAAACGGTAATAACTGGCCATGATTAATTTGAG
GATTTTGTGTTTATAATTATTCAATGAAGCCTTACAACATTACTTACGAA
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CCTTTTATCGCAGAAGTATTTTTATTTCTATAAAATGATTGAAAATTATA
TTTTTTTAGCCACGTAGAAATATTAAGCAGGATTGTTAATGTCAATCTAT
GCGTTTCCAGAAAATGTGGGAACTTTCCTTGTATGTAGTGCCCTTGGCTA
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TCTATGTCTTTTATATGACGTAACAGTAATAATTGCCGTGTAATGATATG
GTTCGAACTTGTTACTAAATCATACTGATTTGAACGTTAAGCTGATGAAA
TTAAGTATTTCCATTTCATCCGCACCTTATCTTTATTCTAATTTGCCATA
TTTATTTTTTTCTTGAAAGAGAAGAAATCATCAGAAAATACTTGAATTTA
TTAAAAAGGAAAGGTTTTGGGTCAAAGGGTCCTAAAAAAAAGGAAAATTC
TAGTAAAGATGGACTGAATGCTAATATTAAAAAAAAAAGGAAGAAGACAT
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TTNGACTTACAGTACAACAACTTTTTCCCATCTCTAGTAATTAAGGATTA
ATAAAACGTTTCGTATAAGGCATTATAATAAAAAAATAATATACTTTTTC
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TTACACTCGCCGGGATTTCGACGTTTTGACATCTCAAATAATTTATTTCC
ATTTTTTATATTTAGGTTATTCTCCTAAATATATATCTAATTGTCTTATT
TCATTATTCATGTGCACCATAAAATATTTGAATTTATCAGTCTTGTTTCT
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ATGTCCATAATTTTGGTAGTTTTAACTATGTTCGTTTTAATATTATATGG
AAATAATATATTATTTGAAACTGATCATGAAGTATCGAAATTTAGAAGTT
CTTATATCCCTCCTGAAGTAATTGAATTTGAATCTAATTTTGTTCCAAAT
GCTGGTTTTATGGGCAAACCTTATTATATTTCGTCTCAAACTAAGGAAGA
AATTGATGCGGTAGTGAAAAAATATGCATTTAATAAAGTAGCAAGCGATC
AAATCAATGTTAAACGAATTTTACCTGACTTTCGGTATAATGAATGCCTA
AAAATTAAATATAATGAAACTAATTTKCCTTCCACGTCTATAATATTAAT
ATTCAATGGAGAAGCCTTATCTGTCCTTCTCCGCACAATATGGAGCATTA
TCACTCAAACTCCACCAAGTTTATTGAAAGAAATAATATTAATTGACGAC
GGCAGTCAAACTAGAGAAATGAAAGAAATGTTACCTATGTATATGAAATC
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TGATATTTGCAAGAATAGCAGGTGCTGAATTTGCAACGGGAGAAGTCATA
ACTTTTCTAGGTACTTTTTATAATAATTATATGTATAAATGTATTTTACT
GTCATTAAGGTTACAACAATATGTTAAGTTTTTTTAATGAATTTATTTCT
TTAGAAAAGTTACATTCAAAAAAAAAAAATATAATTCAACATTCTAGTTT
AAAATAAATTCCCTAAACCAAAGTATTTCATCCCAAAAAGTTGATATATA
TGATTTTTGTTAACAATTCATTTTCAACAAAAATCTCCTTTTAATAAATT
TCTATGCAAATAAATAAACAAAACAAAGCCATAAAATAGCTAAAAATTTT
ATAAAAAAGAATGAGCAATAATATTTAAATAAAAGCATGAACGAATAATT
ATTATGTAGATCCGGAATAAGTTTTTAATTTCTTATAAATGTGCATTAAA
CTGCGCAAGAATTTTAAGCTTATATCTGGCAATGAGTGATAGTAGTTTAA
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CGGAGAAGGCAAAATATCGTGCTGCGATCAGAATAGCTCTGATTTCTTTG
ACTCGGATAGGCTCCACTACTGCCAACTTCTCTGCAATCATACTTCTACA
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TTACAGCAATTTTCAGTGTAATAAAATTTCTCGAAATCGGGAGTGTCGGC
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AATTGCTTTCCATCCCTGATTTCATATATGGAACTCGTGATCCTCTTCTT
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TATTCTTAGATAATGCTGTTCAATCCAACTTTTTTGGGTCTTTGAGATTT
AAGAAAAAAACAACTTTTTATTACTACTCTGACGTACAATGTCAATAGTA
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