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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s509 | supercontig | LSalAtl2s509:210442..226458 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008337 >EMLSAP00000008337 ID=EMLSAP00000008337|Name=EMLSAP00000008337|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=676bp
MLFFSPFTLERVLQTSIDDFSLIKNQIDIEDLKYGDVLFRIKNCLSMDDK IQNIEAEYEIQELNIWISDIVDTYEACPSSKSQHKQKRKPTLYFAILSSE NKTNVSCKNNKSTITNNIVRPKEAPPDPPIFDKDSINLNIRNDIITDKFL DKTNINLFCTEPLYHQFYCHENDEMQSDKYSTRSLICCSFRRFQKRTLWS ELSEVKNHLLNLTKNEVKLQEALFEVITSEASYLKSLNILISHFISSTKL VGNFVDDSSSSIQEGILSKRECHILFSDIIYIRDVSKKFFIELENQWQKS IFLENILPIIEIFGAGDFKHYVKYTANQIYQDRLLSQKLLSSNDEFKNIM KELESDPICESLSLHSFLILPLQRITRYPLLVSAILKYLPLLDEPRVDTC KSALKLLNNLVNDCNESARHMDRMEEMLILSRQFDFMSEGSIPLLSPNRW LIRKTRVTGLMYNNTTSELKKKFSCRLKVNKQHLNLCLFTDLLVIVKQKS EDHYKVLDHCPRNLAHISDVSLNEENNYPDKFTPDLNKVDLHCLSWLTIL HKHADKTLEFLITFDSESEKSCWNKLLYHECLDNFTENIYESWHCPVIQT LTDYGQGSFFFRKGTHADVLRKETEWLFVKSIIDKKAGWIPISLTEEVDS NHIKAKNLRQRHRLFKLVSNNFSLSY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s509:210442..226458+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008337-704184 ID=EMLSAT00000008337-704184|Name=EMLSAT00000008337|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16017bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s509:210442..226458+ (Lepeophtheirus salmonis) TATTTATAAAGGAATGCTATTTTTCAGTCCTTTTACACTTGAAAGGTAAG
TTGATAAAATATTATATAAAATACAATCGTAATAACAAAAATTCCAGGTA
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TTCCTTCATTACGGACGGTCCATTAGTATTCTGTCTCACTCCTGTACATC
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CTCTAACTTTATCTAACGCATCAATAATTGTGTCCAGCAATTTATGATAT
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ACTTCAGTTTCTGCTTTTAATAACTCTCAGCTCATGAGACACCTGATCAC
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TATAGTCTTATTTTTCGTTTTATTTCAATGCTAAATAAAAAAATCATACA
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CATCCAATCTCCTGGAGTTTTTGGTACGTTATCAAAGATATATGATGTCT
GGCGTTGTCTTCTTGTCTCCTGTTCAGCAATGCTGGCTGTTTCTGTACGA
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TCCCTTTCAGGTAGTAAAAATGTAAAATATAACGAATTTCTTTCCATACT
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TATGTGACAAATAATGAATAAGATCTACTTAGTTAATGAAAGGGATAAAT
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ATATTTTTATACAGTTTATTCTTCCCTTGTGAATTAACTTAACCTATTCG
GTTTTTTTTTATATTAATATTATAAACGAATACTTGATATAATTAATGTA
TTAATTAATTAATCTTTAATAAAAATTTATTGTTATATGCTGTCTGTTGT
AATCTTTTAACCTTTAGTTTCACTTTTAACCCTACTTTTCACTTTACCCA
TTTTTTTCATTATTACTTTGATCTTTTCTTACTTCTGATCGAGTTTTTTC
CTTCTCGCAGAGTTATAACAGCAAAAACACTTATAATGGTTGCCTATGCT
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AGTACTTGAAATATTCAATAAATACTACTTCTACTTTTTACATCGTAGAA
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TTCTTAACTATAGTCTGTAACTGGCGTTACTACAGCCCCAATGGAAATAT
TTGACGATGCATTTGTTGCTTTCTCAAACACTCCACTATTTTTAATCCAT
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CGTTAGGACCATCAAAGTATGCTACGGAAACCAAGTACTCTGTTGTATTA
TTTTATGGATTTGTTTATAATTTCATTTCATGTGCCATAGGATAACCTGA
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CGACATATATCATTTTGAGGAGAACAGTAATTGTAATATCAACGATAAAT
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GTAGCTCACGAATATGATCATTACTCATTACACTTATACTTTGTTATTTC
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GTTTTGTAATTTTTTGAATTTTTCAGCTCATTTTAAGCAAGTATCTGGTT
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GTGAAGTTGGTGCCACATTCTTATTCTAAACTGAAATGAATGAATATACA
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TCCAGTTTATTAATATCTCCATTTTCGTTACAGAATCTACTACACTTCAT
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TTCTTGTATTACTTGACACACTGATCGCAAATCTGTAATTAACTTTTTCG
TATCGAACCTGGTTTTCGAGAATTTTCGATTTGAATTTCTACTTTTTTAT
TCGTACAGGTTAGAATCAACATTTAAGAATGAAATAATCAATACTCCGAA
CCTCAATTAGTTTATGGCTTTCAAATTTTTATTTCAAATATGTCCTTATA
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AAAAATGAAAGTGAAAAGATTTTGTTATTTCTGTAAAAAGGAATTGAAAA
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AATTTTAGTTTAACTGATTAGTTTGATTGATTGGTCGTGAAGTGTCCAAG
AACTATTGAAAGGTTTAAAATTGATTCACTTACCACTGGAGTGATCCATA
TGATATATGCAGTGAGGTAAAAAGGCTCAATCCTGTCTATCTCAAAGCAG
TCTGGATGGGCTAATACAAGACTTAATTAGGACACTTGATGCTTTCGACG
AACGAAGGTCTTTCAAATACTGACAAACTCGATGGGAGAAAAATAATTCG
ATCTCATGAACATGGCTTATAATCGTGTCTATCAGAATGCCCGTTTCGAC
TATCTCTTCATCTACCTTGCTAGGCTTCCCTACGTTATTTAATTCGGAAT
TTAATATTTTCCATTTTATTTTAAATTACGTTAATTATTTATACTATCTT
GAAAGGTTAATTGCTCAATGTATATGTAGATAATGTTAATGTAGTATTTT
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TAAAGGATTCCTTACTTTATTACAATGAATCGATATTTTCAATGTATTTT
CTATATATCTGTATCGCTTCGATTAAGATTTGGTGAAAATTATTTATAGT
TAAGCTCCCTCTAATACTGTTTGAATTATACATGTTTTTCGGAACAAGCA
GTTGCTAACCATCACCCTCATGTCTCAAAACTACTTCCTCATCCCGATGT
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CTCTAAATCTGAGTTAATTAGAAAARAAYTAATATTTWATTTATACTTAG
CATATAAAATGAGATGAGTATGAATCATAACAACAAAAAATATTGTTTTA
TTAATTAAATTGAGTATATGTGTCGAGTGTTGGCTATTTTATATGTATAC
GTTATATTAACTACAAATTATCATTAAAAAGATTTAAGCTTTTGCAATTT
GATGAATATAATTATCTAATTTATATAAAATATTAATCTAAAAAAATGTT
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TGTTTATCATGGTTAACAATTCTACATAAGCATGCAGATAAAACATTGGA
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ATAAAACAACAAATAAG back to top
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