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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s50 | supercontig | LSalAtl2s50:1176489..1224141 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008341 >EMLSAP00000008341 ID=EMLSAP00000008341|Name=EMLSAP00000008341|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=238bp
MDTICVISHNIQCSDPLKVVQEYERSVIFRLGRLRKGGAKGPGIFFVIPC IDTYRKVDLRTVSFDVPPQEILTKDAVTVSVEAVIYYRISDASAVVNKLE NHSHSTHLLAATTLRNVLGTKHLAEILSERETISHVMETTLDEATDPWGV KVERVEIKDVRLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEQKASRALREA SDLRYLQTLNTISAEKNSTIIFPVPMDVISHFLNKKVD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s50:1176489..1224141+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008341-704188 ID=EMLSAT00000008341-704188|Name=EMLSAT00000008341|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=47653bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s50:1176489..1224141+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGGATACAATATGCGTAATAAGTCATAATATTCAATGCAGTGACCCTCT
TAAAGTAAGAGATGGAATATGAAATGATACAGTTTGGGTGAACATAACTA
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TCCGTCATCCAAACACCAAGGCCCTCAAAGCCACACCCAGTCATCACTTG
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GTTTTAGTTATTAACATGCCCAAAATACTACCAATTAGCATTGCTATACA
TGATCCCTCCCCCGGATTTTGAGTAAAAAGTGGAGGGGGGGGGGGGAATC
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TGTCCCAATATCACTCGGAGACTTTTTGAAGCAAATGTAACTTTATTATT
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AGAAGACTCGTGACCTCCCCACACACCCCCAACTGTTTCCGGCTGGTTTT
TGGCATTTTTAGACACCTCATGTGAAAGCTTTTAGGAGTCTGACTCACAT
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CCAAGCTTTCTAAAGAACTTCTGAGCAAAGTCATGCTCATTTTGGCCAAA
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TTTACACATTTCCTCAGCTTTTATTAAAGGAGCAGTTTGAATAAGAAATT
ATTTATAATCTTATTAAACTTTCGTTCATTCATCCAAGAAAGAACGAAAG
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TATTCATATAGTGACGATATAAATCCAGATTTTGAAAAAGTAAGCTAGTG
AATCACCTGAGCAGCTCTTTTTATTACTATTACGAAATGACATTTGCTTT
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TATTTTTGGACTTTTTGGTGCAATGATAATGTTTGCCTAAACATTTTCTC
ATTTCCTCATCATGAGTGAGGAAAAATACCAAAAGGCCGCGTATTTCAGA
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AAGTACTCCAGTAACCTGTTTTTCAAGTTAGCCAAGATAAAGAATGATGG
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GTATTTTCTTCATACATGAGGACCCCACGCTAACTTTTAGAAGAGGTCAT
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CAGCCGAGATGACGTTTCATTAAATTAGATGCGAACAGCTATAAGATAAA
GGGAAATGATACAAATCCCCACTCCTTATCTGACAAGGATTCAGAGCAGG
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ACACTTATAATTCTCCAGTGAATATGATACTCAGAGTTATTTAAAAAAAA
TTCTACTTCTACAGCCTGATTTCCGCCCATTTTAAAAATGGGAATGATGT
TGTGCACCCTGTATACGGACATAGAAAATGCTTGACATAATATTTTCAGG
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TTGTACACATTGAAAATTTAAAAAAATAAATAAAATTCATTCTTGCATCA
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GGCCAAGTTCATTTTAAATAATCAATAAATACATCGTTAGAGAATATAAA
TTTGTTAAAGAGACTTTATATTAAATAAGTTGTTAATAGTTTATACTTTT
ATATTTAAAGAAAAAAGTTATCTGTCTGAGTAAGACTCTAAAAAAAACAC
GTATATTTATGACGCTCTGCACTTAATATTTAAAAAAATTATTATTTAGC
TGTTATTATCATTCTTGAATCATTCTTCACAAAACTATTTGGTCTCTTTT
AAAAGTCTAAATTAAGTACTATAGTACGTACAAACACCGCCTTGGCAACT
AATATAACTATTTTATGAAAAATAATTTTAAAAATCTTGAGAAACGGGGT
TAAGCTTTTTATATATTTAAAAAATGAGATCACTTATGACATTTGAATAC
AATTTTTCCTCAAACTTAAGGGCTTTCATTTGCTGTATTTAAAAAAAAAC
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TTCAATAAATTATACTATAGTATCGTCAATTAGTTAAAAATAAATATATA
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TTACATAATTCCTTGTTACCGCATAAGTAAATTACCTGGTCGAAAGCTCC
AACATAACGAAATATTAACTTATCTGCATAAACTCCCAACATCAACATGG
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AGTAAAAAATACTGTTTATTTATTCTGCTAATATCTAATGAGCGTTTATA
TATACAATTTAATATTTGTTTGTCTTGTAGATGTTAAATAGATGTTTAGT
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TGAGTGCTGTCATCAAGGACCAAGCTTAATAAGTTTCTAGGACTGATATA
CGGGACGGAAATGGTCTGGACCGGAGTGAATCATAGTAGGTCATAAGTTA
GGATCGAAACAATTTTGTAGTAATGTAGTTCAATTTGCAAACAGTATAAT
TTAGAGATCTGCGTAAAAAATACAATGTTCAATCAATGCCAAATCATAAC
AATAATTTAAGTATTTAATACACAGGCAGACATTTACAATTATTTTGATA
TATATATATATATATGCATGATATACATTAGGGTGGGTGGCGAACCAGCT
TCAAATAGATTCAAGACTGAAGGACTGATTTATCGTACCTTAGGACAGAT
AAAGGGTAAAAAAGACTGGACTAATTAGAAAAAAAGACTTAAGGGAGAAA
AAAATATTCAACGGGTATGTAGTTCTAGGACCGATACAAGACTAGCTCAA
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GGTAAAACCATATTTTTATATATTTGATAGCTACATTTAATGACCTTCAA
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AAAAGCTTTGACAGGCCCGTGCGACCTCGTGCAAATCCAGCTTTGCGATT
TTACAGGTATTGGACTTTTACCAGGGCCTCAACAAACGAATGATACTTGG
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GGGATTACAAAATAAAACTACAAAACCAGAACCAGTAGAATGGCAATGCT
GGATCGTCCAGGTCAGACAAAGGTTCAGGCAATTTCATAATAAATAATTG
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ACCACGAGGAAGAAGATCAGATTCACAACACATTTGATCTATTTTGTAAT
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TGAGTTATTTTTGGAATCACGGCCTAATTTGAGTTGATGTTAAAATCTCC
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TTCATGACTGTATGGCMGGGGGCACAGTCTTGGGTCCACTTATAGTTGTT
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AAAAATTCGAAAAATCGATAGTTATTTATAGAAAATTTAATTTTTTTTTC
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TGTACTGGTATATACAAAAAAGGAAAATAAATAGAATATATGGTCATTCA
AGGTACTTTTTTTTTCTTGAAAGGGAAAAACAGACTGAAATGTAATCAAT
TTGTCGAAATAAATAGGAAATTTATACAATAAATTGTATCAATAAATGAT
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AATAAACTGAGATAAAATTTGGTGAAACTTTGTAGGAAAGTTATATATTA
AACCATTAAATTTTGAGAGGTCAACGTTACTCATTTCTTATTTGTGTGTT
CTTCTAAAGCCTATTAAGTTACTAATTGATTTTGATGAAACAATGTTGCA
AAGTAATATTTGTGAGCATTACTATACCATTTAATTTTGAAAGGTCATGG
ACCAAATTTAGGGTCACACACAAACTTATTTTTATAACGGGCTTACGAAT
TCAGTAGGAACTTTGTAGGAAGATTATATAAGAAAAAAGTAACTGGCCAT
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CTCACATTAAATTTTGAGAGTTCAAACCATATTTTTATTTTGTGCCATGT
CTTCAATACGGGGTCGAACAGAAGCTTAGCTGGCCTTGATGAAGTCTGAG
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AATCCAGGGGGTTAACGTCAGGTGAGGAGGACGAAGGCCAGGAATCTGCG
GGGCAGAAGGCAGTAATGCTCTCCCTGCAGAAATGCTGTACCTTATTGGA
CATACGAGCTGGGCCGTTGTCTTGTATAAACACTTAATTGTCCCTCAGGA
ACGTGCTTTTCAACCATGCCTAGACATGGTACCAGAGGACTTTGTAGTAG
ACTTCCGTGTTGACATTCTCGTTGGTCTTGAAAAAGTAAGGAAGCATCTT
ACTGTTGTCGGACACCACGACGTCAAGTACAATGACCTAGGCTGGAGGTT
TGGTCCTGAAGGTGCCCTCAAACGTTGCTTTTGATTCAGCCAAGAACTGG
TCATTTTTTAGTTCTGAACAGCATCCACTTGTCCGTATGATTGCACACAC
TCTGCCATTTTGCTGGTTGGTCGGACATGTTTCATAGCACAAAACCAAAA
AAAACATCAAATAGTAGCTCTTTGTCCGTTCTTTCGAATGGCACCTGGTA
CAAAATTTTCAGACTTCTAGAAATGAAATTAGACATCCTAGTTTTTGAGT
CCTTATCCTGCATACTGTTTATGGAGAAAAGAAGTTTAGTGTATATGGCG
TCGGAGAATTACCTCTCTAGAACTCAATGTGTGCAGATTTGATTCACAGT
TTTTTACAAAGAAAGAAATATAAATTACTGGCAAAGGATTACCCCGTGTT
GCTCGATCCAAGGATGAAGCCAGAAATCACATTGAGAATGTTATTTCTTC
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CTAGATAAATCAATGAGTTTTCTTTAGCAAAAAAATTGTTTTAGTAATGA
TATTCACCCACAGAATTATGAGGTTGAATGTATATGAATCTTTAAGGTTG
TAATATTTTAAATAAATTAAATAATAAAAAAATACAACCGCGATTCCATT
GGAAGAAATGGTCATCACTTCTCCGCTATCAACTATTAATCATTTGACAT
GATGAATTGTTCATATTGGAAAATACTAATGGATTGACAAACAAGCCTAA
TATTAGAAAGAAACAATGTTCTTCTCATAGAGTTATTTTCAATCATAAGT
ACTCCGATTAACCATATAAGATGACTACATGAAGTGTCGTATATATTTTT
TGAGAATTGTTTCTTTCGTAATTAAACTTATTCATCATACTATCTCTTAA
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AATGACCATTTAGCCAAATATCTGTTTGGCAATTTGCCCTTGGGCGAAAT
ATAATTCTGCAATTGTTCTTGAGCAACAATATTACCGACTTGAATGTGAA
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GATAGTTACTCACCATAGTTTCGGCCATTTTGGAAAGGGCAATTATTATT
CAAAAATTATTTAAGTGAGTTCGTGCGAGTATTATTATTTTTTTTAAATC
AGAATTTTTATTTTTTCAAAAGAGTCCCTTTGTAACTTTACACACTCAAA
TTAGCAAAATTACAGACGGGACAGGTTATAGAGTGAGATAATTCCTGGAA
GAAGTAAGTAGAGTTCAAGGACACTATTTTGAAAAATAAAATAAAAATTC
AGAATTTTTATTTTACAAAAAATACACATCAACTCACGTAAAGAGTGAGA
TGCACCATAGAAAGATTTAAAAAGTGTTTGGAAGAAGAAAAATGATATAT
TTATCCCTTCCAAGAACAACTTTCCCACCCTCAAGCATTAGGTTTTGGAC
AGAACTACAAAGTTGTAAAATTTGTACCAAAAAATTGTTATAATTTATGT
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TTCCTCAATGAATGGTAATAAATTATAGGTCTTAAGTACTATTGATTTAT
TAAACTAGAAAAGTGACTTATTTATAAGTTAACTTTTAAAAATTTCAAAA
CGTGCTTTAAAATCAATACAATAACAGTTCTCCAATATTTCTAAAGTCTA
AATTATTATGGCGGGAAGAGSATAGCCATTAAACATGTTAGAGCATTAKT
TAGTCTTMTGAATAGTTAATAATATCAGAGTAAAGTGTAACGTTGAAGTA
GAGGTTGTAAGTACTCTTGTTTCTCGATTATGAGTATATAAATTATGCTC
AAAAACTTATGAATGTATTAGCAATAGATAGATTTTGATCGTTTATATTT
CTTGTTCATCTAGTTAAATATCTTATATTCCAAACATTTTATATATACCA
GACACAATTATGTATTATATATACTAATACCTATAGCTATAAACTAGATT
TATATAATTTATAGTTTCTAGTCTCAAATGATTCATAGCACTTAGATAGG
CTTTCAAATATATAATCAAAAAATTATGTGTTGGAGTCGGGCATTTTATT
CCCTACCTCTGCAGCCCTAGTTTTTGGGGCATTGAACATGTGTTGTCTAA
TGGAATATTTAGCACGACACTGAAAAAAAAGGAGTGACTTAAGAAAAACA
GATTATATCCAGTCTTTGGACGTTACTCCCATAGCAAATCTTCATCAGTG
GGCAAATTGATCAAATTGGCTTATATATATTTCTAAAGAAAAATGTAGGT
GTTCCTTTATTAAATGAATGCAAAGGACTGAAATATATGTAGACCATCTG
ATTAGAAAGTTTTTTTTTTGTTCTTTGTTTGAAGGACGAAGTTTTTGCAA
TATGTAATAATGCATAATTTAGATTCTGTCTACCCCTTACTCCAATACCA
TTGATACGGTGCAAAAACGATAAGAATATTACAAGGAAACTATGTACACT
ATGTACTATAGGCAGTCGAATGTATATACCAGGTGGATACTAAATAATTA
CGCTGTTCTTGAATACTCAATTTATATACCAAATAATAATTTGAAGAAAA
TATAATTTTGTTTCTTTTTTCTCTTTATTTCAATGCTTATTAAGATGAGG
TATAATCATCCAATTTAAGCCAAATATACCCCGTTCGGTTCCATAACTTG
CCGTAGATCATGGATAATGCTCTCGGGAGAAGTTATTCTCTTGAACTTAT
GGATGTACGTTCGCACCCAGGTGATTCCTAGAGAAAGAAATAAACTATAC
GTATATGGATTTCACCAAAAGATTCCTTGGTTAGATTGAGTAAATGTATT
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