EMLSAT00000008382, EMLSAT00000008382-704229 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008382
Unique NameEMLSAT00000008382-704229
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s512supercontigLSalAtl2s512:316680..332384 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008382 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008382EMLSAG00000008382-691148Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000037207EMLSAE00000037207-746135Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037208EMLSAE00000037208-746136Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037209EMLSAE00000037209-746137Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037210EMLSAE00000037210-746138Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037211EMLSAE00000037211-746139Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037212EMLSAE00000037212-746140Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037213EMLSAE00000037213-746141Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037214EMLSAE00000037214-746142Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037215EMLSAE00000037215-746143Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037216EMLSAE00000037216-746144Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037217EMLSAE00000037217-746145Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037218EMLSAE00000037218-746146Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776285auto776285Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008382EMLSAP00000008382Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008382

>EMLSAP00000008382 ID=EMLSAP00000008382|Name=EMLSAP00000008382|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1191bp
IQSTLSQVIKDKKLFNAANPAIVLCDKDLEDALNVRSFHVSQFSYYITKQ
FQFIKCEPPTDPRSNLEAASSTDSLSTESNHVPCEYSHKNSSQSNLRRQP
SVDYKVEGTFIISKELRDTFKLLDNFKSEQSLFEYSEVLSYLSKYIIKKK
DTFFDPRNVKIANIEGDLLERAFKVKAFHRSQVTALLDREINRVPIIDEV
KVEDLTTKEECNIQENDGDYSKSSSCHFVEDEDQNDHKRKFSIEYEKSEE
QPGCSSSSSPPKRVRRLSTYTVSILGYDSTDEETIYSAQGYETVAMSEGS
HHSKSCDNENMHSSGSSNEDEMVYSVEYEINDDDDEEDNEEDRRRKNNEN
SDEDSELDDVVLMAXVLDLMEEEKEFWADSESDIDDEFEIKDTKSVYKCC
KCGEQNKVILSYCDSCWQERKETFPKREKPRKKRRHVIRNTLASDELIMM
RNGGAAPTQSDTGEEFRTKNKEVIPSYLRSYSQPCSSATSSKMSNHYESQ
DSGLGSQDSICSEKSRDDSSEENDFEGIYTPFKSYNPTKSSLASNNDKTQ
NESFSGCTFCFRRPKNATLIHGNIGHTDEKGNSKCSKRYQNSYHGYHLSS
KSISSRKISSQDTTIGPSRKQEEIYFFRKTLEDSEKVLPDSSERAILLRR
LAWRYPKERPFLIPESSDIIDNEDGVNNFAGPTLALAEGYRNQSHKWKSS
LTFRDIQPWMSTSTPLTKEAQTSSQGDPLARLLSLPLKKKEDEVAQVPPL
ATSKSLEENSMSKKQLESHRFNFKPVLKSNVAPKHQTLFKEDKPLFSHKK
ASVPSHYHHVPHKQEEPKETAFMTGHDKLISDVQLRYGQKTVQKRLGTTR
SSPLSTFKPPVKEDKNISPLVANVLSSNEGGSSMNEENIDPLYKGIDPKM
IELIKNEIMHNGAEIQWDDIAGLEFVKTMVQEIVVFPLMRPDIFTGLRGP
PKGLLLFGPPGTGKTLIGKCIASQSKSTFFSISASSMTSKWVGEGEKMVR
ALFAVARVHQPSVVFIDEIDSLLTARSDTEHESSRRLKTEFLVQLDGATT
TGDERILIVGATNRPQDLDEAARRRLVKRLYVPLPDKEARLKIIENLLSS
QTHRTTEDDVIEIAELADGYSGADMANLCKEAAMGPIRSLDYSKIEFLSA
DDVRPIQKSDFIDALRQVRASVTDKDLDGYLEWNNKFGAGK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s512:316680..332384-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008382-704229 ID=EMLSAT00000008382-704229|Name=EMLSAT00000008382|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15705bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s512:316680..332384- (Lepeophtheirus salmonis)
ATTCAAAGTACATTAAGCCAAGTGATTAAGGACAAAAAGCTTTTTAATGC AGCAAATCCTGCGATTGTACTTTGTGATAAGGATCTTGAAGACGCTTTAA ATGTCAGATCCTTCCATGTTAGTCAATTTAGGTAAGATTACATAAAATTT GTTGAGCACGAGCCTGATTTTTAATTTACTTTCTAGTTATTATATAACCA AACAATTCCAGTTTATAAAATGTGAACCACCTACTGATCCTAGAAGTAAC TTAGAGGCAGCATCATCAACGGACTCATTGTCAACGGAAAGCAATCATGT TCCTTGTGAATATTCCCATAAAAATTCTAGTCAATCAAATTTGCGTAGAC AACCGTCTGTTGATTATAAAGTGGAAGGGACCTTTATCATTAGTAAAGAA CTGAGAGATACGTTCAAGCTCCTTGATAACTTTAAAAGTGAGCAATCACT TTTTGAGTATAGTGAGGTATATCAAAGTCTCATAAGTCGTAATATATTTA TGTATTCTTGGAAATATTGAGTGAGTCAACATTTTATGTATTTTATTTAT AGGTTTTATCTTATTTATCCAAGTATATTATAAAGAAAAAGGACACATTT TTTGATCCTAGGAATGTTAAGATCGCCAATATCGAAGGCGATCTCTTGGA ACGAGCTTTTAAGGTTAAAGCGTTCCATCGGAGTCAAGTGACGTAAGTTT TCATTTGCTTGTCTCGCAGGCAATTTATTATGCATTACTTATTAGAGCTC TACTTGATCGCGAAATAAATCGTGTACCGATCATTGACGAAGTAAAGGTT GAAGATCTAACAACCAAAGAAGAATGTAATATTCAAGAGAATGACGGCGA CTATTCAAAAAGTAGTTCTTGTCATTTTGTTGAGGATGAAGATCAAAACG ACCATAAAAGAAAGTTTTCTATTGGTAATATCCTTTGACCGTACATACGG TGGTAACTTACAATATTCTCTTACCTTATTTTCAGAGTATGAAAAAAGTG AAGAGCAACCAGGTTGCTCAAGTTCGTCGTCTCCTCCAAAGAGAGTTAGG AGACTCTCGACTTATACAGTATCTATTTTAGGGTACGACTCAACTGATGA AGAAACTATTTACTCGGCTCAAGGGTATGAAACTGTTGCTATGAGTGAGG GTAGTCACCACAGTAAGAGTTGTGACAATGAGAATATGCATAGTTCCGGT AGCTCAAATGAAGATGAAATGGTATATAGTGTCGAATACGAAATCAATGA TGATGATGATGAAGAAGATAATGAAGAAGATCGTCGTCGTAAGAATAACG AAAATTCGGATGAAGACTCTGAACTTGATGTAAGTTCTAAAGCGGTAACA GAGTTTAATCTCAACTTACCTCAACTTTGTTATGAGTTATTTGATTTTAT CATTGTTAGTTGTGTTTTTTAATTAGATACGGTGAATTATGTTCATATGA CATTCCTGCAATATAAGTAAACTATCAATTTTGTTTTCTAACTTCTTGCT CTACTCGTGATACAATTATAATTCATGTATTAATTTACTACTAAAATATT TTCAATAAATGCTGCTTTGGCTTTGAAACAAATTTTGTGAGAAAGGGAAT AATAATTATAACTGAATATGGAGTCAATCAAACATTTAATTCATAATGAT ACAATATATATATTGATTCTTAAGTTTCTATTTATGAACATATTATTATC TATATATTAAGGCTAACATATAGAATTTATATATAGGATGTCGTATTAAT GGCTAKAGTTTTAGACCTGATGGAGGAAGAAAAGGAATTTTGGGCCGACT CAGAGTCTGATATAGATGATGAATTTGAGATTAAAGATACTAAATCTGTT TATAAATGTTGTAAATGCGGCGAACAGAATAAGGTCATATTATCGTACTG 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TAAGAGGTATCAAAATTCATATCACGGTTATCACCTTTCAAGTAAGTACA TTTTTCAATTCTTTTTTTTTTTTTTACTTCAACTTATATAAATAAAATAT TCGGAAAAATGAAAGCTTTGTAACTTATCTTATTTGTGACAAAATTGTCT TTAATTCACCGTTTTAAATACTATGTATTCTGACCAATAAAGTAACTGAA ACAAAAATGTCATTAATATGGTATATTCCCGTGATTAAATTGAACTGTCA TTCAGCTAGCTACTAAAGATTCAGATAGTACATATACAGCGTTTTCACTG ACATTCTAAGTTACATCATAATGGAAGGAGACGCCATTTTGAGGATTCAA TGTTGATATTTTTACTATATAAAATGGACACATATTCGATAAATCTTGAT TAAACTCGCATCAAACGGCTTTATAAATAGAAAGACAATACTTTGTTCCA ATGAGAAAACACTGACATTTGCATGTCATCAAAGTAATGTGTACTAAAAA TGGTTAGAATTGTACAATTATTTGTTGTTGTTGGTCGATTAGGAACACAA AAAGTAGGGTAGTTACAGACAAAATTCATATTCTTTACATTGTAATAATT AATTTGTAACACGAAAAGCTGATTTTGTATAACAATGTAATAAAATATTT TTAATTCATCAACTTAGGGAATAAATATGTAATAAAACAAGGCAATTGAG AGATAAAATTTTTATAGACAGTAAGGTTTAAGTTCTTTTTGTTGGTTACA CTTTGACATCCATTAGTTCACTATTTTCCTTAATATTAATGAAGAAAAGG GTTTCATTGTTATAAAACTTGGTTGTTAGTCCCACTTACTGGACGACATC AAAAATGTGAAGTCATGTGAAAACGCTCTATTGTACAATTTCGTTATTAA TTATGAACTATTTTGTTATTGAGATGATATCCTATCCAGATTTTTTATTA TTCATTGATTCATTACATGAAAGCTGCTCCGACCTTATGACCTTTAGATA TGACAACAATCGCCAATTTTCAAAAATAATACCTCTCACTGTTCAGAAGC CCATTATAGATATGTGGTCTGTCAACAGAAAAATAAGCTAGAATTATTTT TCTCGAAATTAAGTATGGGCTACATTTGTATTCTTTGACAAATTATCGTG TATATATATATATAAGCAATTACCGACTCAAATATGTCTGAAATATATGT ATATCTATATAGTAAAAAGGAAGTACAAAATAAATTGGGATTATCTTTTC TTGATTTTCAAGATTGCTTTTAACTTGGTAATATGTGTTCTAGTAAGCAC AACTAATTAGTAATTACCATCATATTAAAATGTATTATTGAATGGGGTCC ATCGTTAGCAATTATTACTACGAATCATTGCTGAAATCCGTATAATTAAA TTTTTGTGTCTACATTTCAGATCTATTTCCTCGAGAAAGATATCATCCCA GGATACCACGATAGGACCCAGTAGAAAACAGGTTTGTAAAATTCACTTGT CATAGAAAGCTAATACATATTGATATCATATTGTTATGGGTTTGTCTAAG GCAAACATAATTGGTTATTTGTGAAAAATAAATCTTATTGCAGTTGTAAC TTTTTGCTATTAACTGTAGTGATAAGTAATATTCATTGATCCAATTATGG GATGCATGCTCTTAATATACAAAAATCTTAGTTGGATTCTAATAAGCATC ACAAAAGGGTATTTAAATGATTGATACCTTGTATTTTGAATAGACCATGT ATTAATCAATTGCAAGCGGGGGCTGCAAGGTCTCAAAATTAGAAAGGAAG GGAGATAACAAATTTATCTGCAGAAATGTAATATTTATCTTCAAAAGAGC ATTTTATTTAATGGGGAGTGGCAATAGGGCGTGAACAAAAAATCAAAATA TATATTATCCGCAAGGTGGTATGACTTTCTGTTCCTGGGCTTCTACAAGT ATAGATTACTTGAGGGGATATCTACGTAATAATGATAATTATAATAATTC AGAGTTGTATTATTTTATCGTAATACGGCGCCATTCTCTGTTGCCTTATT TACAAACTAATATCATCATAATAAACAACGCTCACCCTCAATTTCTTACG ACTTTGAATAAGAGATAACACGGGGAACACTCATTTTGTAGAAATGAATT TAACATTGAGTGCAAAATCCAAAACTGATCTTAGTATTTCTTTGAGTCAT CTGAATTCTGAAATATCTGATATTATATTAATTCGTAACTATTATCGTTC AGAGTCCATTTTTTCCCTTAAAACAATTCCCAAATTAAAAGTAGGATTAA TTAAACTAAACTTATGTAAACGTGTTTTTATGATTAAAAAGTGTTTTTAC TGATTCTGTATCTTGTTCTGAACTCAATATATTTCCATTATTAGGCTAAA AAATGATGAAAAACGACACTCTCCTTTAGACACTTATAACTTTTTCCTAA TACATAGGGATGAGGAATATAATTGAATATCATAGAAAAATATTCAATGT ATAATTTAAAGTAATATGCATCTCGAAGGATTTTTGTTCCATTTGGTATT CTTTAAGTGATCCCATTTTGAAATATTAAAATTATCAACTCATCGTGAAT GGATCGCTTTATTGTTTCGATCATGGTATGTCATTCCCNAAGAATGGAGT CCACTCTACTCCCTTATGAGGTCTGGTATTTTTCCTCGGATGAATTCTCC TCCCGCCGTCCCTCGTGAAATTAAGAATCCGAATATTTCTTGAGATGGAT GATCAAGTTAGAATTATCTTCCTTCGAATGCCTCGATCTTTCTTTTAGTG GGCATGACGTCATTAAATTAGCATTGAAATCGGAAAAAGTAATATGATAA 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GAGCAAGAACCCTGAGAACAGGAGCTCTTTACGTCTATACAAATATAAAA CATATCTCCAATATTTTTGGAAAAGTGAATGCAGGGGCATCCGCCGGGAG TGGACTCAAGGGGCGATTTCCTTAATTATTCCACCAAACGACATCATATT CGGGGATCTATCTCATGTATTATTAATCGTTCTTTAGTCGCCAAGGAAAC CTATTCCGAGACTTTGCACTTCTTTTACATTAGCATCTTAATGAAGATGA TGAGAGTCAATCGAAACTCAACTTGGAACTCTTTCCGAAGAAATAGGAAA ACTGAGACTAGGAGACGAATAGAGGGATTCTTGGCAAACGAACGTTCCTC ATGAATACACGAGATAGATTCCCAAATATGATATCGTTAGGTCGAATAAT TAATCAAATCACTACCTATGGCCATAATCTGATAAAATCAAAGAGTTTTT TTAGCTACGTAGAAATATTGAAAAGGATTATTATTGTCAACCTACGTGTT TCCAGAAAATGCGTGAACTCTCCATGTGTATAGTGCTCGCTGGATGGATG TAACGAAAAGCTTCCTTTAAGTCCCAGCGAAAAATCATAATCGGATCGGA GTAATCAGTAATGTATGTTTTTCTATGACGTAACGGTGGTATTCAGTAGT TCGGACAATATAAATGGGCCAAGTAGGAATAAATCGACTTTTTTAATCTT GGAGAGGAATTAACTTATTTACGACTAATTATGATAGATCTTTAAAGATG GTATAGGAATGGGCTCAATTTTTTTGATTTTTTATACTCCTAGGTACAGT AATAGCTTCTGATACGATTGCTCCGATACTAAGAAATTTGTCCAAGGCGG AACATAAATTTTTATCCAAATACGAGGTGTGTTCAAAAAGTAAGGTGATT TTTAAGAAAAAATATTAATTTATTCATTAATATTTATGTTGTCCCCTTCA AAGTAATCCCCTTGGATACAGTACACTTGTGCCAACGCTATATCAATCCT CAAAGCACTTTTCATAAACACTTTTCGGTGTAACTTCTAGCTCTTTCAGC GCTGCAGTCTTTATCTCCTCAATCGTTGCACATCTCGTCCTTTAATTAAT AGGGTTCGTTAGTTATGGGAACAAGGAAAAGTAACATATCGGCCCAAATC CGGTGAATATGGTGACTGAGGGAATATTGTGGTGTTGTTTTTGGCCAAAT ATGCGACAATTCTTTTGTTCAAATTATGCAGTTTCGGAACAAACTTCACT GAGACTCGTCTCATGCCCAAAACGTCGGAAATATTTTTATGGCACTAGCC AACCCGATATGTCAATATTATCAGCAACTTTTTTGAGTTTCGACAGTTTT CTTCTGTTGTTGMCCTCCTTGGGCGTCCAGAGGGAGGATTGTCATTGGCA TCTTTCTGGCCATATTGGAAGAGTTTTTACCACTTGTAAACATTATTTTT TCTCAGAACAGTTTTCACCGTTTGCCATCGTCAAAATTTCAAGTACTTTG GAGCACTTAATTTCATTTTTTAGACAAAATTTGATGCAAATTCTTCGATC TATGTTTTTCAATAGCAAAAACTTTCTAACCACCCAAAATACTTTTAAGG GTTATGCCTCTCACAAACAAAATAAACGCATTATATAGCTGAAACGGTAA ATACCAAGGTTAATGTATTTCTATTAGCCTTGGTAAATAATAAATATATT TTCGTGGCGAGTGTATTAAAAATCGAATATACCAAATGTTCGATGCCCAC GAAATTTGAAAAGTCACCTTACTTTTTGAACACACCTTCTATGGATTTTG AAAAAAATGTGCTGAAAGAATATTAAGAATATGTCAAGTTTTTTTAAAAA CAAATACATCTTTGTTTCAAATTTTTATTTGTTCTAAGCCCTCTTAAGAT AAAATTTTCTGTGTTTCAAAAAGTTTATTTCTCTATAGTTTAGTATTTGG AATCATTATTAATCATTGAGAGTTCCTTTTCCAATTTTAAATTGTTTGGT TTAATATGGAAATACGTTTGAAAAACTAAATGTAGGACAATTTAAATTAA AACTATGTATTATTATATTCAAAGTCCCCTTTTTTAATAGTATTGCTTTG ATTTTTCAAAGAGCTTCCTAAACAAAATCAAGTATTTCAAAGTTCCTGAT AGCCTTCAAATCATTCGAAAGGGACTAATCATTTTTTTAAAGCCCACGTC CGTTTGTTACAATCTTATGTATATGTTTTGAGGCAAATAAAAATAAATAC TTTCACAAATTTTTTAAAACGCAGAAAATTTTAACCTAAGTTTGCTTTGG AACAATCAAAACACAGGTATATTCAGTTTATATTTTTTCATTTAACGCAT TTTTTTAAGAATTCACAATATATTGGTGAAACGTGTTTGCTTTAAGAATG AAAATAAAGATGAGATTGTTTTTATCAAAAATTGATGGATGAATATGAAT TCAATCCATCCTCCTCTATTTTCAGTCAAATCCTAATCTCAAGGGCAAAA AAAATATAGAAGTTATGACAAATGCATCATAGAAATTTCAAGCCTTTTTT TCGTACTGTCTATGTTATAAGTTATAACAAAGACAGTACTTGGTGTAGGT TATAACTTATAACCTACACCAAAACCTGTGATCTAATAAAATATGATATT TCAATAAGACAACACAGCTTTCTTAAACATCAAGAAAATTGGATAAAATT TTCAGGAATTACAGAGTACAGTATTGTGCAAAAGATGATAATTTTAAGTA CCTGCAATTGAATTGTATAATACGAAATTCGAGTATATGAATATCTTACC ACGCTCTCCAGACAATAAATGATCATTATTGAAAAAGAAAAAAAGAGAGG TTAAAATTAAAGACAAAGTGCTTTGATAATGCGCAGTAATAAAGATTGAA GGTGCTTAAGTCGGGATAAAATTTATGTACTTCGCATGGACATATTGGTT GGAAACTTTACGAAATACTAGATAATTAAATGTTTTAACGCCCATTATAC CTTTTATTTGATCCATTCTACCCTATCCGTGATTTTGGATGTTATTTTGA GATAGTTTATTTTCCAACGATTGGGSGATTAAAMGAAGCAARAGATTGAA AAAAAAAAAAAAAAAATAGACCAGATAAAAGATTAACAATTTATCTACAT TAAATATAAATGACATCAAATTGATTTCCCCCATTTAAGTAATGAAAATC CAGCATTTCCATGGGGATTTCCAAAATACTTCTAGACACCTAAATATTAT AAATTAAGCCTTATAATGATGCAAGTAGATAAAACAAATACATTTAAAAA AACTTAATTGTCTTCGTTGATTTCAAGAGTTTCATGGGTTTAGCCTTATG TATTTTCATTTGTTCAAAACTAACTAAAAATTAGGCTTTTAAGTGACACT ATACCGTCTCAGTCAATTTTTCGAGTACAATAGGGTATTTTTGGATACGA GCTGAGAAAGTGTGATATTTGTTCATTAATAAGTTCATAAGAAAATGAAG AACAGTTGTGTACCATCACAATGTTACGCGATTAATAGTAAAAGGAAATA AATTTATAAAAATTATAGATAATTTGTGAGTTTAGTTAAGTTAATTCTAA GGTGGGAAGGGTTTAATTATAGTTATTTATGACCAGGATAAATTGCTTTG ACAAAAACGAATAAAACTCGTATATTGTACATTAGTATTACTCAAGTAAT CTTTAAAAAAATGAAATATTATGAATGACTAAATTTAATTATATTATTGG GGGTTTATCCCTTCTCCTCTATTGATAAAATATATATTATATGTACATGA 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