EMLSAT00000008415, EMLSAT00000008415-704262 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008415
Unique NameEMLSAT00000008415-704262
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s514supercontigLSalAtl2s514:308954..336980 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008415 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008415EMLSAG00000008415-691181Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000037346EMLSAE00000037346-746274Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037347EMLSAE00000037347-746275Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037348EMLSAE00000037348-746276Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037349EMLSAE00000037349-746277Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037350EMLSAE00000037350-746278Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037351EMLSAE00000037351-746279Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037352EMLSAE00000037352-746280Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037353EMLSAE00000037353-746281Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776186auto776186Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008415EMLSAP00000008415Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008415

>EMLSAP00000008415 ID=EMLSAP00000008415|Name=EMLSAP00000008415|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=541bp
MYAFNVRNNLQVCSKGLTCCTEEMEQKMWATSRKQFNKAMXXSISDVKSF
FAXXAYKFDDFFIDLLATSKIKFHALFQKLYGIIYERNSDVFIDFFRDLQ
DYYNTGEVDLEDALKRFFEQLYQRMFEVFNSHHDFDKTYLSCVSTTMRKL
QPFGNVPKKLTEQLRRSFVATRTFSQGLLEGKKIAYKIMKLTPRDQCLTA
WMKMSNCPSCQGYRSYQHPCENYCLNVMRGCLAYYSELGDSWNKFVVAIQ
NVTDRLVGLFDIERVVEPIGVKISDAIMNFQNNGFDVSVKVYDECGTPXI
HKRGASNPYRGFSLAXRSKRSYTNEEDMPEVHSDYEKEDTKLKILIREIK
ESIWKTHGFWEKLPGDICNKDRHARRDKCWNGSDIGIYKHPLIPAGLQYQ
DNNPEVNNIESPEPINSGDCENTDDEDCYTSADYDYYGYSGSGSGEEDGR
VHSYNEKTDNYDINEEDEDAEENWPPWVXPKSQVPKTPSIIVTTSKPKSK
SSSGTTSSGSRTRVPKSLKGLLYYLVPLFTCLLGNAISVSW
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mRNA from alignment at LSalAtl2s514:308954..336980-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008415-704262 ID=EMLSAT00000008415-704262|Name=EMLSAT00000008415|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=28027bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s514:308954..336980- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTATGCTTTTAATGTGAGTAAGTACGGGGAGGGGGGGGGGGGYTTATA CTTTTTTTTTATTCATACTCTCTTTTTTTTCATAACTATGTTTTGTAGTT CCGTAGAAGTCAATCCCAAGAGTTCAGACCATAGAGAAAGAAATGCGTAG AGGCGACAAGCTGCACGGATGATTAAACAAAAATATCAGCTGACATAGGC TGMATAATATGAGGMCCCATTTCCTTATATTTTCCACCTTTATAATAATA GTCAATTCCATCCAGAGAAATGATATTCAACTCTGATTGACTCCAATGGT CTAATAAAAAGTAGACGGAGCAACAACGTATTTCCTTTAGGATCATCTAT TCCATTTACATTTTTGTTTAACTAATAGTAATAGTCTACAAATTATATAC ATCTAAATATGAAAACAAAGAGAACCAAAGCTATAAACCAAGTGGGGAAA ATTAGACCAAGTTATAAATATTTGTACAAAGTATTGGTTGCTAGGGGCAT CAAGTATAAATCATTTTGACTGAGTTCACAAATGAACANGATAGAGCCTC CAGGTATATTTACTAAATTTTAGAACATAAAAACATCCATCTAGGTTGTG CTATCTATTAGTTGTGAGTGGAGATGCTCTTAAGGGGGGATATAGAATTT TAAACGATACTGATGACTGAATGCATTATGAAATGGTACACCCACACGGA AATGATACCAGGGACTAATTTGAAGCTTTCGACTGAACTTCAGCTTCTTT TGGCCGTTTTGAGAGCCACCCAGGTTTTCATTTGATTGAGCTCTAATGGC TATTCTTGTTCATCAAAGAGTCTCTATACCCTTTTAACTCAATTATAAAG GGCAATTATGTACAGAGATAAGCAGGATTGGGAGTCTACTACTCAAGCTT AGAGTCGTATTTGTGTTTTAAAATTGTGAAAAAGCTTTGTTTTAAAGCTT TAGAGAGAATAAAATATGAACTGATATGCAAAATAAAACGTAGGAACTTT ATTTATCTATTTGTGAGTAGTAAGTGGGGAGCATTAGTAGTGTGTACAGA AAGCCTACTATTATGGCTGTTTATATAATTTATTACTTGTTAGAGTTAAA GAAAGAATTATTCTCTATACATGTATATGTATATTTTTATATCAATGTAC ATTTGGAAAATAAGGGTATACATAGAAWTATCMACRAATATTTCTTTCAA CATAATTTACTTAGGTACTTTCTTTCCTTAAATTACGTTTAAAGATGTGT TGAGGAACATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGTTTAAAATATTCCCTTTCTC TTCCTTTGGTGATTGTCTTTCAATAGTGCCTCGAGATACTCAAATATATA AATATATACGTGACCGTCTTGTGTTTCTTTTTTTTTTMMGTGGGYGTCAA GTTCTCACGTAGTAGACTTTATTGTATATGACTGTATTTAATGATAAAGA GCTCATTTGAAATTTAAATTAGGTAATTTTTTAATAGGATTATACAGTTT GTATTTCTGCTTAACCCGCTATGTAGTTGGAAATAGGTCAAGAACACTTA AAGGCATTGTATGTAAGTATTATTATTACTATGTACATGGAATTAATATG TAAAGCAGAAACAGCTCAATCACTTCATCAAAACTTATCTACATGATGAT ACGTTGTGACCCCCGAAACACTACTACAAAAGCTTCTCAAAAAATGAGAA GGGAATAGATTTGTATACTACTATTAATTATAATTGGGGAACACTGATTT TGCACTAATGAATTCGAGCCAAAAAAGGATTTTATCTTTGAGCGGATAAT CCAAAATTGATCTCAGTTTTTCTTTCAGTCATTTGAATTCTGAAATATCT AGGATTATTATCATTCAGAGTCATTTTTTGCTCTTAAAACAATTACTATA TTAAAAATAGGATTAATAAAACTTATGTAAAAGCGTTTTAACTGTTAAAT TCGAGATGAATATTTTTATATATACTTTTTTTTTTTAAATTTATACATTG AATATTTTTCTATAACATAAGCTATGATATTACTTATTCATATGTATTAT GAATAAGTAATATGGATCTAAAGAAGAGTCTCATTTTTCAGCCTAAAAAT ATATCAAGTTCAGAATCAATAAAAACACTGTATAATCATAAAGATACAAT TATATAAGTTTTATTAATCCAGATATTTCCGAATTCAGATGAATGAGAGA AAAAAATGAGATCAGTTTTGCATTCGGCCCTCAAAGAAACATTCAATTAT TTCCTTCAATTCGTTTGTACAAAATTTCCCAACCTAGTTGTTTCTCTGTG TTATCATACTTACATAATAAATTTATGAAATATTCTAATTTATCATTTGA AGCCATTGCAAATTGCATTTACTCGTTGCAAAATCCATACTCCAAATTAA AGTGAGCATAAATATTTAATAAATAAAAAGTATATTATGTGGGTAAGAGC AATACATGAATGCTCTTATTAATATTTTCTCCCTATTGTGAAAAGGATCA TGTCTCAGCGACGCATAAAAACATGTCGTGAATGATTTTTCTAGAACGGA TTTTACAAAAAGACCGGACCAGACTGAAGTTGGATTGAATTAGTATAAAT CTTAATGGTCTCAGAGTAGTCTTGGATCCGATCCACCAAACTATGGATTA CTTCCTATAAGCCATTATTTAGTGATATAAATCGTATCTATAATGGGCAT GTTTAAAAAAAAGAAGGATATTCGTAAGAATGAATCCCATGTTGATCCCC AATTATAACTCCTTTTATGAGTACACACGAATGTTCTATCAAGTTTTGAA TATAATTGAATCTATTTAGGAAAGGAAGTTCATAATTAAATAATAATGAC GACCGCTAAAGAAAAGAAAACGCATTAAGTAGCGGGACAGCTAAAAAATA CACACGATTTACATCACTACCTATATGTTTTCTTTAGCAAGGTGTTTATT GGATGAGTCAATAGGTAACCTACTATTATGTATTTCCTTCACATTCATAT NAGGAAAGGAAGTTCATAATTAAATAATAATGACGACCGCTAAAGAAAAG AAAACGCATTAKGTAGCGGGACAGCTAAAAAATACACACGATTTACATCA CTACCTATATGTTTTCTTTAGCAAGGTGTTTATTGGATGAGTCAATAGGT AACCTACTATTATGTATTTCCTTCACATTCATATTGAGGGTCATTCCTTT CTTCCAAAGAGATTCACACAAATCCCCCTCTCCTCAATAGGATGAATAAA GTTCTACTAAAAGCTTTGTGAGCCTTCATTAACCAAATTCCCTGAAGAAA TATATGTATATTAGAAGAAAAGGTGGACCACACACATCAATACAAAATTT CCATAGTTCTTTGATAATAATATGTGTATTTTTTTTGTTCTCGTGAGTTC ACAAGTATTTTTTATTTTATTTTTTTGTATGGATTTGTATAGGAAGACGA AAAGGATTGGGAACACGGGAATATTGAGATGTATGATACACACGTGAATA TGTTCGCACACAGCAGACACTCATGATTTCTGTTTCTTTTCCATTCTTTT GGGTGAGAAGAAAATCATGAGAAAAGATGATTGAGTTTTGCAAATTCCTT TAAAGTTAATTTAAGAGTGTTAAAATGAAACAAATAGGGTTATATTTAAA CACCTTGGACTACGTGCAACATCAGTTTGATGGAAATGATTCATAACTAA GAGTAGCTTTTATGGCAATAATCAACGTGAACCCTTTCCTCCGAAAAGAA GCAGAAAAGGGCCCAAAATCAATTGGTAGTTGGGCAAATATTCCCGACTA TGGAATTCATTAGCGTCTTTGATAAATACAATTTATTTTCCATTGTCTTC TTTAATGTCAACATAATATATTAACAACTGGAAATGCTTACAACATAGCA CCGCTTCTGCCTTATTATTCAATCTGTGACGTCAATAAAACTGATATATA GAGCTTGTTTCCAGAAAAAAAAATATATATATATAGTTTATTTTTACCTA TAAGTACTTTTAAGTGTAGCTCTAGAAATATATAATTTGCTCAATATTAC TTTTAAAGAGAAATGTTGTTGAGTTCCAAGGCTTCTTCATTGAGTGACAT GTAAAAAAAAAGCCTCAATGAAGTGTGTCCTTGTATGGCTCATATATAAA TGCCTTAAATGTGAGCGACTTGATTTTACATAGTCTTAGGTACAACGAGT GTGGTATGAAAAGTTTCCAATCTAGATACAATACATTTTTTATATAATAT TTTTCAACATAGTCTCCCTATAACTCTACACATTTTTTCCAACAATGTTC CCATCCCTGTAKCCTGTACAAATAGTACCCCACMTTTTTCTCTGCAAATG TTCACGAGCCACTTTTTGTTTTTGGCTCAATTACTCACAGTTGGATTGAA TTACACGCATCAAATCTTAACAAAAACAAGCCTTTATAGGTCTTCTATTG TTTGAATCTATTACAAGATTACACTCTCAAAAAAAAAACTCAATTCAACT TACTCAAACGACTTTTACATAACAACTATCCGTCCAAAATGGTTAAAACT TTGGTGAGTAACTTTCGACAGATGCTAGATAAATGTGACTAGCTTTTATT TACTGCCATTTTTACCTTGAAGTCGGAAACTTTTGAGCCCACCCTCGTAT ATGTATACCTTTTTGCTGATCCGTTCCTTTTGAAAAATTATCTTTGAATA AAACCTGATTTTTTATATTTGTGTATTAGGTGTATATCTTTATAAATGCC TTAAGCATTGAAAAAAGGATATTGAGTATGGGGTATTTTATAACCTATAA TTTAAATATTATTATCCATGGGTACAACGTGTTTTTTCTTTCTCTCTTTC CCATGGTACGCACCCCCCTATTTATGTTTAGTCTCTCTGCTAATGAATGG MGTAGCTCTTTTTATTATTGTGTTAGTTCTTTTTGTTTGTTAAGGAACGT CTAAATTAAGTACAACATGTTCATGACATGAAATTACCACCGTTTATTTA GGATATTATGGTACTGACTGAGTAAGTAAAAAGGAAAAAAATATATATCA TTTCTCTTTATAAAATTATAGACAAGGAAAAAGCTTTTTTTCTTTGAAAG GGCATTAAAAAAAAGTAAGCCAAGTGATAATTAGGAACAGGAAGGAATCC ACCTGGGAGAGGGGGTAGCAACTCAGTTGGATAAGTATAAGATGCTTTCA AAGGAAGAAGTGTCACACAAAAAGGTCAAGGATTWCATTTTTTTTTTTTT TAAAGTATTTGGTGTCCAAGTTAAAATTAGTAATGTAATGGATCCTTACA TGACAGCAATGTTNGGATCTGTACTTATTTATCCGATCTAGTCTTAAGAC GGGTCCTATCAATCCTTGGGACTAGTCCTCTGGATTGCCAGTATTAGAAC TGATTAAAAAAGTTGAATGACGTCATAAAGTAACGAAATGTATAAGTTTT TAGGACTTATATGCAGAACTTAACAGTACCAGACATAGACTCAACTGGAC GGGACTGCAGTTTGTAGTCCTAAATAAGGACATATACAACACTAGATGAC AGTTCAGAGGTTTTGTGAACGGTTGACAGACCCACATAGAGTATCTTTAT GTAAATGGCCCGTCAAAGAATTGAAGAAATGGGCTCTCGTTTAATAGCCA GGCTCAAATATAAACACACATCTCTTGACCCACATAGAGTATCTTTATGC AAATTACCAGTCAAAGAATTGAAGAAATGGGTTCTCGTTTAATAGCCAGG CTCAAATATAAACACACATCTCTTGACCCATTTTGTCAGTCAAATATCAG TACAAAGCTTAAGACAAAGGATGATGGGCCCATTAAAAAAATCATTAGAA TGTCTCTTTTGGAGATTTGTGAAATAGCAGTTACTCATTTTTTCTCGTGA CGTATGGAATTTTTTCCACCTGTACATAATTTACCTTGTTAACTCCATTA AAAAGGTAAATTCATGGAAGACATTATTTAGTTAGCCATAAGGTAATTCC TGGCACACTCAGGCCCTCTACCGGACAAAAAAATATTACTGTAGTCAACT AAATTTGGAGAAAAATAGATTTCGTAGTCTTTGGTTTTATATCTTTGGCT CAGTGTTGCGCATTCTTTGTTGTCTCTAAATCACGACCTTACCTCAATTT ACTAACTTATTATCAGCTGTCGATTCTTTCACTTTATCTGTTTTGAGCGT TGATGGATTAAAATTCATTAGTTATTTCTTTATACTTAGATGTTGTGTCT TCAAGAATTAAAAATATCAAATTCTGCTCAGATTACCTTCTAGATTATTC GAATTAGCTGTCGTGGAGCAGCTGTGAGCAATTCCCAGCAGCTATCAAAT AATAAAGCCAGGATTAGAAGAATTTCCCAACTGATTTTGAGGCCTTTTGT TTAGTTTCTTTGTAAAGATATTGGCTGSTAGAACACAAATAAATGTTATT CAGATTATCCTTAGTTAAAAGTAGAATAATGGTTTTGTTCTTTGGAGAGG ATAATTCATACATAGTCTTTCAGAATAAATGGAATCTTTTTTATGGGATG 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GAAAATGTTAAGTGATACAATAAGGTGTTGGGAATTCAACTAATAAGTAA GAGTCAATTGTTCCAAATGATCTTGTTAAGGTTTTTTTATATAGGTAATA CATGTATACGAATTTCCGTTAAGGAAGGGGCTCTTAGCAATGTGACCAGT AGGCTATAAATTTATGTACAAATGTTAGAAACTATGGAGAAATTGTACCA GTATTGCCCTTTGGCCTTATGATCAAGAGTATTATAATCGGCATATTTTA TCCGTCAAATAATGCATATTAATAGTAATATGCATTTAATATATTATGTG CCCTTGATTTCCCATTTTTGACCGATTAAAGTGATGTGCTAACTAAATTC TAAGTTTAATATATATATTGAATTCCTCGACAACAAAAATTAAATTGTTT TATCATTAGCTGTTGTTTTTTTAAATAAGGAATAAATTCTCAATTGCAAG TTAGTAGGTTGGCACCAAGAGTTGAAAAGGTTATCGTTGCGGTTCAGCCT TAAATGCTTTTTACTACATGTAGATATTCTCTTGTTGAACCTATTATATT ACGAGGTGAAGATGATAATAAAAAAATATTTTAATTCCGTTAAAGTAACA ATTCTACTATCTCTTATATTTGACTGATTTTTTTTCTCCCAATTTTCGTT AAATTTACTTTGTGTTCATACTAAGCATATAAAATGATAATTTTTTATTG TAGTATATTAATGTGAGTCTCTCTTTTAAAAAAATTACTATTATAAAAAA AGTATTGATTCCTGGAATTAACACCCATGTGTACAAACACTCCAGTATCC AATATTATACACATATATCTCCATGTCTTATCTAATTGAACAGTGTCTTC AAAGAAACTTTACACCCACTTATATAAACACTTTTTTCTCCTTTGTCGCA AGCAATTAATTCATTATTACATTATTCGTCAGTAGTTACAAACTCAAATC GACAGTAAATTGAAAAATGTACCATAGCAGACCTAGAAGGTTACTTACCC ACGAATATACAAATGCACTGGACCACACACAAGGCATGCTCCTGGACGAC TCAGAATAATAAGTGATTGACCACCAATGACGTCCATTATTTAAATAGAA GTGAATACATGCAAGTTTTTGAAGAAAACTCGTACCGATCATATATAAAT ATAGATTATGTTTTTATTAAATGAAGTTTTAAGTGGGGAAAAAATGTTAT AAATTTTTTAAAAAAACTACATTTGCCTTTAACCACTTGAAATTTTTCTT AAAAAAGGGAAGGACAAAAAAAAAATGGTGAGGGTTTTTTGTTATTGTTC TGTTAGAAATACCAAATGAAAAGTGTACCTTTATTTAAAGGTACACACTC TAATAGAAAAAATAGTTTTTTATAATCACTTATCCAACTTTTTATTAAAT TAAAAATTAAGTAAGAGTTTGATTTTCTTTGGGGTATTTTTCCCTTTAAA TCCCCACTAACATATTTGTATGATATTTTCTAATAATAATTTTATGACTT TTTTTTTAAAAAAATAATGAAAGAGTCTGCCTTCATTTTATGAGGTGATG GCATGAAGTTCATTTATTCTTTATATATATTTTAGTTAGTTATCACAGGT GTGCTGTTAATATGATAGGAGGAGGCTAGAAGGGGGTATAGATTAGTTTT GAGACTCAGTTCGAGACCGGTTTTTTTCCCCCTGGGTCTTAATTGATTTT TATAGACTGATTTATAGGTGTAGTTCGGTTCAGACCGTAGACCGAAGTTT AGTCACTTTCAAATCGTGGACAGTTTTTTATCAAGCACAAATGACGTCAA AAACATTCCATCTACGAGGGTAATTTGAAAAGTTTCCAAACTCAACTTGA AGATGACATCACCTGTAAATAAAAGCTAGTCATATCCAAGATTAATAGAA 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CTTCTCTGCCTACGAATACAATGCATGCCCCTCTGTCTAAAATGCAACTC TTTTTTTTAATGGTGCTCCTTTGTTCTATATTTCGATGTTGAACCCTAAT GAAATAATGTAATAAATTGTCTAAAAAAACTGTAAACTAAGTCAACCAAT AAATAAGAGTGTCATAATCAAAATATGAAACAACGCAGAGGATCAATTTT GGGGGGGAAATCACCATCTCTAAAGTATGCTGGGATGTAACCCCTCTACT GTGTACCGGGTGACCACAAGAGAGACACCAAATGCTTCGAAAAGATCCAA ATCAATGCCAAASCGGCCACAAGAATTGGCTGAGGCAGTTAAAGCACCAT TGATGGCAGAAGAGGGAAGATAACTCTGAATAGCCTGACTTGGGCATTGG ACAGCAGGCAAACGCTGCTTTGTGAAGTAAGACTTGAAAATTAGTGCCAG CAAGAGAACTCTTTGTCAGGGTTTGAAGCCTTTGGATCAAGTAAAGCCTC CCGAGTACGATAAACAACAAAGGTCCAACTGAAGGCCGCCATCATCAATG CTTGAGCCAATCTAGAGCAGAGCATTGTAAATAAATGATACGTAAAGTTC CGTACTAGGCTGAAAATGATCATTAAGGAAAAAGGTGGTGGCTATATTGA CGTAGAATGTAAATAAGGCGTCACTTGATTTTATTTATGAATTAAATTTT CCAAATTTGATGAGATTTTTTAAAGTATAATAATCTTTTTAATTTTCAAA AAGGCTTTTTATTTTAGACAGAGGAGCCTGTACGACTCAAGTATCTTTTA TCTATGTACATAAAATGCAATTGATTAGTTCTTGTTTTTTTTTTTAGAGA GAGGTTCTTTTTCAAAGGAGTTTACTTCTTGAGACTGTAAGAAGTTACAT TCTTTGTAAGAAAAAACTCTACTTCTACTAATTATATATTTTCCATGGAA 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