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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s51 | supercontig | LSalAtl2s51:944140..953887 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008484 >EMLSAP00000008484 ID=EMLSAP00000008484|Name=EMLSAP00000008484|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=357bp
MGRKKIQISRITDERNRQVTFNKRKFGVMKKAYELSSLSSGFNMTHVGGT
PGNGDATTHYGTPDALQLPSPGAVNHSSSPHRPNSGALLEIPSSNNGYPD
PISSPHSPSPSVPVSTSPIIKKDLSENSSRTNQQQQSLKVSIPSTNNESV
QSSLSSLSYGGFSSSSSSGIILSHTQSSDFSLSSDINSLHAAWNNSGGVT
NNHGISHGIPQLSISSSSPPPGKNSGNQSNADNLLSHTVKAEPLSPRDGG
GHHLRIGTPSMSHLSPLHINTSGHSTPTSGLHNRLSPNLPDPAHSHNSGG
HPSGNTNSHQPPPPNSLHHHHSQSNNDSLYSEPNNGCHSPNSMPPTKRLR
MADNWSS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s51:944140..953887- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008484-704331 ID=EMLSAT00000008484-704331|Name=EMLSAT00000008484|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9748bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s51:944140..953887- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGGTCGGAAAAAAATACAGATTTCTCGGATAACAGATGAACGAAATCG
ACAAGTAAGTACTCAACAAAATCTTGACGGCAAAATTATTTCCTTTGCAA
AAATAAAAATAACATGTCACGCTCTTMCCTATATTGTMCCTCTCAAGCCT
TTCTCCATTAAGCAACAGAAAATAAGGCCTAAAATCAGATCATTCGTGGT
TACCCAATCATTTTGAATTATTCCCAACGTAGCTTAACAAAAGCACATTT
AACCACCAATCGACGTTTAAAACACAGATCAGGGGAATAAAAGCTGAAAT
ATCGACAGCTCAAAACAAACTGCAGTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTA
GTTGTGTGTGTGTGTGTATGTGAGGAAGTAATGATGTGATGTACAATGAT
CAGTGCTCTATAAATGACACAACATGTTCTTTAATGTCTCCCACAAATCC
TTCCTTCTACAAAAAAAGAGAAAGAATAACGGAGCTGGGATAATTTTTTC
TCTGGATCTCAATGAGCGTAGGCTTCCATCATACTCAGTCGCTCCTCGAA
AAGGAAATATACCTTATGTATATTGTCTTCAAATACTACTCCTCAGTCAG
ATGGAGTCATTGGAATACTATATAGTGTAGCTGTGCAACTCCATCCGACC
AATTAAATGAGGATTTACAAAAATAAAGAGGAATGAAGAATAGTCCAAGA
GTATTGTTGTGTATTGTAGGATTTTTTTATAGGAGCTCTAGAACAATCAA
GGGAGAGCCCAATAAAGATTAAAATATAAACTACCGTTTACTGACATAAT
GTCGGGKTAACGATTTTACCTTATAGAAGGTAATTATTCAATTGAAAGTA
ATATATTACTAATTTTGATCAAATAATAATATACTCACTGCCTCAAGACC
TACCTTATATATCAATTTATGTCAGCTGTTTATATCTCTACCTATTCCCC
AACTTAGTTTTGTTCTTTGATACTCGAACTAAAACTTGTTGGTGATGTCC
TTGACCCATACATGCAGAGATTGCGAATGTCTCAGACACTTAAGACTTCA
TGTAGAATATTAAGTACCTAGTATGTAAATAAATAACAAATATTGGGTCT
CTCTCCCGTTTGTATTTCAAGCTTTGTCAATGCTCTTCAGTATTAAATGT
AGAATCGTTCAACACTTTGTCATTTAGGACATTAATATAAGACCAWAAGA
AGAAAAATCGATAGTAGACATAAACGTCAGGGTAAAATTGTATACATATT
AGTTAGTAGTGATATAACAACGTGATCAATGTATGTATAATATATATTCA
TTGTGTCTCTGACGTCAAATGGGAATACTCTCTTGTTGTTGCGAAGGGCC
TTTTTTACTCTTAGATATTTTTTAGCACACCAGAGTAACTCAATTTTCAT
AAATTAAGAGAGGCAAATATATATATATATGTTAGTTTGTTTTTAAAAAA
GAAGAAAGCTTCAATCTATGTACTATATACATTTATATTTTTGTACTTTT
TTTTTTTTAAATTCTTAATAATATATTATTTTTCAAATCCTTTAGGTCAC
GTTCAATAAACGAAAATTTGGTGTGATGAAAAAGGCATATGAGCTCAGCG
TTCTTTGCGATTGTGAAATAGCCTTAATTATATTTAGTTCTTCGAACAAA
CTCTATCAATACGCTTCAACTGATATGGACAAAATATTGCTCAAATACAC
AGAATATAATGAACCTCATGAATCTCTAACTAACAAAAACATTATAGACG
TAAGGAAGTTTGTTTAATACCTTTAACACTTAATTTTTGACACTAAAATA
CAAGAATAAGGGGGTATASCCGCCAGACTCTTTGCATATTGTTGCCATCA
AAAATGATCCCACCTGTTTTTAAGCAATGTAAATGAGTCAATTTGTCTAA
AAAATTATTTTGAAATTGATGAAATGGTTTGAAGATCTTTCTTCATATTT
TTTTTTTAATATATAACAATAAATACACAATAGAATAATTATGGTATAGC
ACTTCTATTCGTGGACGGATAGTATCAAAAATGATATCACCAAAGTTTCA
AAACTATACTGGCCAATAATTTTATGACATTTGAATCTGTTCTCATTAAT
ATATCAAGAATAATGAATGATTTTTAGTCGGTTTTGATTAGTTCTGATTA
ATATAGCTTCAATACAAGTATTAACTTGCTGCAAAACACCAAAAGAATGA
ATTCATATATATCTGAGTATATGTTTTAACAAATAAATAAATAATTTCCA
CTCGTAATCTTCAATGGCTTAATAAGTAAAAAATTTGAAACGATAGGGTT
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TCTAATGGACATCTAAGGAATGTCAGTCTTAATATCAAAAGTACCCTGTA
AACCAATTGCTCCCAGCCTTTTGGAACTTGCAAGCAGTCCCGTTAGTATG
ATTTTACTTTTTGACAAATTGGAAGTAATTTTTTGGGAAGGATCCTTTTT
TAGAAAAAACTTGCGACAAAGAAAAAAATAAATTTTTTACCAAGATACGA
GGTTTGATCAAAAGGAAACCGTTATTTTGTCATTCTAAATTTAATTGTTA
ATTTTTACTTAAATTTTCGAATACTGAAAAAATGGAAAGAAAAAATTAAT
TTCGGGGAAATCTTTAACAACTTTTGAAAACTTTTTTTATATTCTTCAAA
ATTTAGCATTTTGTAGTAAGTAAATGCTTTTGAAGAATATAAAATCTTCC
CAAAGATTTTAAATATCTACGTGAAATTAATTTGTTTTTTCTATTTTTCC
AATACTATAAAACACAGCAAAAGCATTTTCGTCTGTAAAAACAACTGTAT
TGAACATGTGTACCAACATAATAAAAAATGAATTTGAGAGTAGTACAATC
ATTTTTTGACAACGATATTTTAGGGACGGGCCTGCTTGTGAGTAAATCAA
TTTGTACAATAATAGAAAGACATTGTTTCAATAATATAGATATCTGTTCC
CCTTTTGTTTTTATTTTGATATGACATGCTGAGCTTTAGCTACACACTCT
CCTTCCTAGGATGTGCACACTCAAAAATAATGAATTGACAAATAAATAAA
CACCCTGTATTAATGTACAAAGTCCCAACTTATTAGCCACAGCTGGTACA
TAAATTTAACATTTTGAAGAGGTATTTATTTTGTTAATATATTTAAACAA
ATGTTTTAAGGTACGGATTAATTGTTACTTGATAATCAGATATTGGAATT
AAAGGAATTTATTTCAATTAAGTTTTTTTTTATTTGTATGCCAATTATAT
TTTACTGCAATTTTTATTTCCTCTAAAAAAATTCATGTCCTTAAGCTTCC
GTTAGTGAACATCCTTTTTTTGAGGTAGTTAATTAACTTGGGCTCAACGT
TAACTTAAATATTAAACAGATTTTATTTCTTGATATACGGCTAATAATAA
CTCAAAACTGCGCTAATTAATCATAACAACATTAGATTTGGTCATCAACA
AAATATTATTCCTTTTCGATAAAAAATTCTATGAAATTTTAATTACTTGG
AACAAACTTTTTGTACTAAAAATGTACTCATTTACTTTGATGATATTGAG
TGTAATGTATGGGATAACAGCTGGTAATTGATTTGTAGCAATGTGTATAC
CCTAAATTGAAAACCGACAAATAGAAGGAACAAAAGAACGGCTTAAATGT
AATTAAATTTTAACATTCATTAAAAATTCCAAATAGTTGAAAGAAAATAC
ATTTTTGCAATAATAAAAGTTGCATTCATTCTTAAATATGCTTCAAGAGC
ATATTAAAATCTATTTTAAACAGATTTAAAGCAATTTTCTTAACATTGGG
GTGCAGAAAATCCCAGTACAACAACGAAGGGTCAATTTGTGTTTTTTATT
ATAAAATCAAATTGATGCTTGTAAAGTCATTTTATCAAATCTTTTTAGGC
TTTAAATAAGAAAGAAAACAAGGGTGGACCAGGGTGCAGTCCTACGGGCG
ATGACTCTGATTTGGATTGTGAGCCAAATTTAACTCCTAGAACTGAAGCA
AAGTACAATAAGATTGACGAGGAATTCCAGAGTATGATGCATAGAAATCT
TCTAAATGGAAATAGAGTGAGTCATTTTAATATATATGTTGTGTAATAGT
TACGATTCTTTCAAAGTTGTACCATGAGCAAATTGTACAAGCTGTATCAC
AAAAATGAAATATATTATTTTATAATTATTTTTAGAATAATTGAGAGTAT
TGGTGAGAAGGATAATGTAGTAATTGAATATTCTATTTATGATTGATATA
TTAGTAATTTAATTTTGGCTTTCTTAGGTATTTTTCAGCACATTACCATA
AAGGCCAAATTCACACGGCTATGTTACTCGTAAATACATAATAAATAAAT
ATATTTTTAAAAGATCAAATTGAAATAATTGTTCATTAAAATGACTGAAT
ATGTAATTAAATAAGGCATTATTAGACGTCGAAACTTGTAACTTGTATAT
AAATGATACTATAACATAAAACTGACCTGGGCAGAAAATAAGAAACGGAA
ACAAAAATGACTTATGAGCTATGTTTTTGCTTCTATAACAAGCATAGCAA
TTTGAAGACAAGGGTCCAAATAGTATTTTGCCACGTAGTAGAGTTACTTT
AATACTGTAACACAGGAGGTATGAACAAGCTAACAAAATAAATTATTAAG
ATGGTCCAGAGATCCTGACCCTTGTAAAAAATCAACCAATTAAAAAACGT
TTCTACACCATTTGAATTCATTTATTCATCATCTTTATTCTATTAACTCT
GTTGTTTATATGATATATTTGTTTTTGATATGTCAGGCCCTTACCTTTAT
TGCATTTCCCAACCTTTCTTCTAAAAAAATAGAAAAAGGTCCAAAACTAG
TTGATAGTTAGTCAATTCATCCTAACTAATCTGCCTAATTTTTGTAAAAC
CTATCACCCACATGTTTTTTGCCTTGCCTCCACAAAATAAATGATGTTTT
CCAGATTTGCTTGCTTTGATAAATTAGTTATAAGCTATATTGTTAAACAA
ACAAAGTAAATTGACTTAATTCTCATTCAATAGCTACTTAATTAATTTAA
ATAGGTTTGACAATAAATAAAAAAAGGTGGTTGTTCACATGTGAAATATA
GGTTTTACAATCAGAGCGCAGTATGGAGTTATTATTCAATCATTGAACTG
AGAATTATTCACAGATTAACAATAGCTAATTCAAATTTAACCTATCAACG
TTCAGAACAATGATAATAGGAGAAGAAGAAGAAGAAAATGACAGCTGTCA
ATAAAATACAGTGTCATTTTTTATAGATATTATTGTATATGTATATTATT
TACTATTCCTCTTGCAAATCAATTGTAAAATTTGCATTTAATTTGTTGTA
TAATTTTTGTAAAAAAATTAAAATACACACAACAATAATAATGAACCGGT
TATTTTCTTTGATTGATAACAAATCCACATTTTAAGCTATATACTGTTCC
CCGGGTCAGCATCATGTTGTCGTATCACATACATATGTACTTTAAATCGA
GAGATCAATCCATTAACTAATCTGTATTTTTAATCCACAGAGTCTTTCCT
CTGGTTTTAATATGACACACGTAGGTGGAACACCGGGAAATGGGGATGCA
ACCACACATTATGGAACTCCAGATGCACTTCAGCTGCCCTCACCAGGAGC
AGTTAATCATTCATCTAGTCCGCATAGACCGAATTCCGGAGCGTAAGAAC
AGAAGTTTTTTCTTATTAAAAGTATTGATTAAACCATGCGTGATATTGAA
GTCCTACATCACTTTTTTGCAACAATTGCACATTGACGTAGATATAATGC
ATATATAAGTATACTTATGTAAAAATTTCTCCTTTCATTGGCCTCTAGGT
ATACCTATGTATGTATATAATTTCTACAACTTTGAAAAGTGGGATTCAAG
ATCGCAAAAGAATTGTCATATCTATTATATATTATTTTAAATAAGATAAA
AGATGGATTTGATCATTAGTTAAGTAATTAAATATATGAAAGAGTTTTTT
TATATATGAAATTGTTGTTGAAGACCCTTTGCAAATTTGTTGGTTATTAA
AGAAAGCCAAGGGTTGGAGGATAAACGTTACCTGGCTCCTAAAATATGAC
TAAACTATAATTCCATTGTAGAAAGGCTGAATATTATTCTTCCTCTATAC
ATAAGGCTTCGCTTTAAAAGAATAAATAAAAATAAGCCTTCATTCGAATC
ACTTAAATAAATTATATTTGAGAAATGATATAATCATGGAAAAAGTGAAA
GGTCTACTACGTATCATCAATTTTTTATTTCATTTACTGCGTAGTTGACA
TGTTAGATAAGAATCTTTTTTCATTTTACTTTTGCGATAATTATGAGAAC
TTAATAACCTTTTAATTATTAATATATATACAAAATTATTAATAAAATGA
ATATCATTTATCTACTATTTACATTGCTTTTTAGTTTATTGGAAATCCCA
AGTAGTAACAATGGGTATCCAGATCCAATATCCTCACCTCATTCTCCATC
TCCGAGTGTTCCCGTATCTACATCTCCCATAATTAAGAAGGATCTCAGCG
AGAACTCGAGTCGAACTAATCAACAACAACAGTCCTTGAAAGTATCGATC
CCCTCAACGAACAATGAATCTGTAAGATATCTTATTACTTTTTGGTCATT
AATGTTTACATCCTTCCTTAGGTACAGAGTTCATTATCCTCTCTTAGTTA
TGGTGGATTTTCTTCTTCTTCTTCTTCGGGTATTATTCTATCTCATACTC
AATCATCAGACTTCTCACTGAGTTCAGATATAAACTCTTTACATGCGGCA
TGGAATAATTCCGGTGGAGTTACAAATAATCATGGAATATCACACGGGTA
GGTTTATGTCCAATAAGCCCTCTTTAGTTACGTTACCATTACTCTCGATC
AGAGTTGTCTATATATATGGTCCGCAGCCGTGTGATGAGTCTTTTAAGGA
ATTCAACTATTGAATTTTGATTGATCCATTTATTTTAAATTCTGAGAAAA
ATAATCAATGGAAAAAATATTTTAATTCAATTCTCTCTTTCATTTCACAA
GTAGTCAACTAATAGATAGTCTGGTCTCGGTCCTTATTTAGGACTGGAGA
CTGTAGTCCGGKTCAGTTTAGTCCTGCGTATCAGTTCTAAAAGTCCTTTA
CTCAACTTTATTTGTTCGAGTAATGACAGTCCGACTCACCAGTCCTAAGA
CTGGACTGGATAGAATAAATAAAGACTTACACAACACTACTAATAAAAAA
AACGCCTTCAGTTGGTCAAAAAAAGAAAGAAAAAAATAGTAAATACATGT
TACATGTATGTTTTCTGACGTCATGAATTGTATTTTAACTGAAGGAGACG
CCATTTTGAGCTCAAAATTGATATTTTTACATCATAAAAGGGATATATTT
TCAATAAACCTTGATAAAACTCTATCAAATGGCTTTATGAATATAAAAAG
ATTGGATACACTTAATAAAACTAGGCAATTGAGCGATAAAATTTTATAAG
GACTAAGGTGTAAGTCTTTCTATTTATTGGTCACATTTTGAAATCCAATG
GTGCATTGTTTTTCTGTATATTAATGAAAAAAGAGTTTCCATTGTTCTAA
AACTTGGTTGTTTAGGCCAAAAATGATCGACATCAAAATTGTCATGTCAC
CTGAAAACGCTCCATTCCTTGCTTTAATGTTACATCTATATGAATGTTGG
CTTTCGGTATAGAAATAATTCTGATTGGTTTAATACCTAACTAATTCGGT
CTGACTTTGGTCTGGCTAGGGTTTTATAGGAAAATTTGGTTTCCTTAAAA
AAAATCCGATCTTGATCGGTTCTACAGAAAAAAATGACGTTTATTTAGCT
AAGAAGTTCCCTATTTTTTTCTTTTTTACTGGTTAACGTTTTTAATATCG
GCCTACAATTTAATTTTGGGTCGACGGTTCCAACTTCAATTTCACCCAAA
TTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAGTA
GGTCTAGAAAAAGRCACTTAAAAACCTCACCTACAAAATTATCCACCTCG
GGCCGTTCTTAACACTGTAAAACATGTATGTAATGTCCTATGAAACTCTA
AATGTTGTCAACCGCTGGTTTTTATCAATACCATATCTATATATGATACC
TTCTATGTTGTTTTTTTCTCTTATTTCAGAATTCCGCAGCTTAGTATATC
AAGTAGTTCGCCTCCTCCAGGAAAAAACTCGGGAAATCAGTCCAATGCAG
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GATCCTCCCATCCCCAGACCCAATCTATCACTTCAAAAATATTAACAATA
CTACTACGAATACTAATAAGTACTAACTTACTCATACTTGATAAAATATA
TCTTTTGTTTATTAGTCCATAGAGATCTAAGAGTTTGGAGTGACAATGTC
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TATTAAGTTTTATTAATTCGATGGAGTGAGTTGAGGTTTAGCCCTCGACC
AATAGTAGAAGAAGTTATCCATTTCGTTTTAATTATGCCGAATAATTTTA
TTAGTTAAGATAGCCTGTTACTTTCTCACTTTTTTCTCAGGATTTTGACC
TATAAGTTTATTATTGATGTAGCACTTTAAAGACAATATTAGGTTTTACA
TTATCCAAAGCATTTTATACCACAAGCTTAATTCTCTTGGGTGCCTGATG
CACTTATTAACTTTTTGAACTATTTCTGAACCACCAGACTTAATTATTTT
TTTTAAATTTAACTTTAATTAATTTTAGATCCAATTTAACAAATACCAAT
TATTTACTCATCATACAATAGTTTTCTCCTCTTCCATATGTTGCCACATA
TATATTTTTTTAATTCATCAATCTTTAAGTGGGTGTAGATCTAGCAATCG
ACCCATGGGATTTTTTTTAAACTCAAAAATCCAAAAGCAGTCCTAAGAAA
TATATACATATACTAATTCATGTGTGTCTATTTATCTATAGGTCATTCAA
CCCCCACATCCGGGCTACACAATCGTCTTTCTCCCAATCTACCGGATCCA
GCACATTCACATAATAGCGGTGGACATCCATCAGGCAACACGAATTCGCA
CCAACCTCCACCGCCAAACTCTCTTCATCACCATCATTCTCAATCCAATA
ATGATAGCCTCTATTCAGAGCCCAATAACGGTTGTCATAGCCCGAACTCT
ATGCCACCTACTAAAAGGCTTCGAATGGCAGACAATTGGAGCTCCTAA back to top
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