EMLSAT00000008539, EMLSAT00000008539-704386 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008539
Unique NameEMLSAT00000008539-704386
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s526supercontigLSalAtl2s526:86601..103104 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008539 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008539EMLSAG00000008539-691305Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000037946EMLSAE00000037946-746874Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037947EMLSAE00000037947-746875Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037948EMLSAE00000037948-746876Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037949EMLSAE00000037949-746877Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037950EMLSAE00000037950-746878Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037951EMLSAE00000037951-746879Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037952EMLSAE00000037952-746880Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037953EMLSAE00000037953-746881Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037954EMLSAE00000037954-746882Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037955EMLSAE00000037955-746883Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037956EMLSAE00000037956-746884Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037957EMLSAE00000037957-746885Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771777auto771777Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008539EMLSAP00000008539Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008539

>EMLSAP00000008539 ID=EMLSAP00000008539|Name=EMLSAP00000008539|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=3704bp
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SSVLEIYKTCEKKRALPTNENRLNSLHACMAVQMTESIQRLCLLSMNEFN
EFMVEINVLNGGGQVQGSKWSKKKKRKKSECSEVTRIEDSGFIIHLKMSE
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PIILENIVKNFKSNIIQIIRIQSQKPREYIKNYDTYMYLINGQADEDIND
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RKISVLREIILKKMSNDHQRQNHQLCERFEKISKTALSAPNNTEELVELK
SKVNHIKNVIMLNMEKGLKEAARRLVFLSDYLQFTTAEMKSNTKTFQWQA
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KLNPFYRLYETSMEFMNKQKTWYECPMGTHDPADIETEVESSWKLVSQLE
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KWEERLLXXQXXMDEWLKVQGIWLYLEPIFSYPDIMAQMPEEGRRFTTVD
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GLDIKINPQCAIFVTTDSLQTLNNSIPYNVRSLFRPVAMAXPDGXMIXEL
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PDDVLKKAIIDQCQKHNLESTPYFLSKVQQLYDMMDLCDGVMLLGGSFGG
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NKLIESSELKGKSDNELIPVFEGIFYFSCIWSIGGICHEDGKKKFNSEFK
KIMYNENNEALNLSDNVINEENFSSWEPTFPLPREDQKTVFDFKLIVGTK
PEWQKWDVEVSNISLPRDIYACQLNISTCETVKYNHLMNMLVENSKPFLL
IGSSGTGKSSYVKNMLHNKLDPDKFSYIELYFTSVSSPTVTQSLVMSKLD
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LKELNETIRSIFSRIVLWHLDTKGFSKEFDPCINQVINATLGVHKFVVSE
LLPTPKHSHYLFSLKEFSRVICGVLLSVPETMTDLLCMKRLWVHEILRVY
YDRLVHTKDRDIFLNCVKAETRKNLMIDFDELFGELKSTEATVTENDLRK
LMFCDFGDSKNSEEDKFYKSVTDIDHIRRVSEDLLDKYNQISRKPMELVL
FDFALEHLCRISRVLKQPESHMIFIGLGGSGRQSLSRLAAHISGFEFHQI
ELGKDDELYKWKSELKTVLKKTSHKLEPSLEIVENMKNLEKDMDKSMHTD
GSLQALFSLFVKRIKENMHIIFAMSPTSNSFRRNLVRFPALMDRCTINWF
HQWPNDALNFVSNKFLMGIDFRPGELKSCVSLCEFFHNSSIKLSKKMSGK
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VMQTEMNAIQPKLVVASKDVDEVLSIVDKEQYEVTEQDKILKSEESIVNE
KKKLADTIRSDCESELAEXTSFVEASLEMISSLSQSELSSIRGMKGPTIS
LKLNTEALCCLKGIKSDKIPDPSGVVGKMIDDFWGPTKRLLADPKFLESF
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SLDMYEKVARNIAPKRETLTKADTDFQESLENLTGKKEILRRSQEKLKII
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AKYFQLTGDILLSVGIIAYLGPFFQEIRDEQIQLWQKKAKELNITFSEDF
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YIFGEQDVELCKFHLESVYQSSTEEISGSALSTLQYLISACSYGGRMEDE
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TETNHNILRMGEATHYLKNVLEGETFLHKLRLTQREEAKIPESNKKMEDK
EDEFIKMRQTMSKILNLLPEEFETTENNSFSEDKILNIVLDQELQKYNDL
LDTMKESLESAIMSIDGCGIMTKEIQELLEFIKNDEIPSIWMNMAYPILE
SLSGFLEDLRLRTEFLLNWQTHGPPKVYWLTALFEPGDFFIAILYLHSLK
MGIPFHELTLECKFDQNADEGILVKDLYLVGAHWNDEKSCITDSDRQNIY
CKMP
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mRNA from alignment at LSalAtl2s526:86601..103104-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008539-704386 ID=EMLSAT00000008539-704386|Name=EMLSAT00000008539|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16504bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s526:86601..103104- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTACGGAGGAATATCTCAATTAGATCTTCCGTATGCTGTTAGATATCG ACTACGATTCAACAAAGACTACAAAGGACCAAATACAGCTCTTGAGTATG AATACAATTCAAACATAAGAGAGAATAAGAAATTCATTCCGGGGATTGAC ATCCCCAATGTACAAGTGAGGAAAGACTATGATCGACGTTTGAGAGAGAG AAGAAAAAGAAGAAAGGGGATAGAGGATCCTCAAAAAGAAACTGAAAGAA CCTTAGAAAAAATAGATGCTAAAATTTTAAAAAATGAACCCATCAAAAGA CCAAGACGACAGAGTTATATGGAAATGCTACATTGTGGAGGTATAAATAT GATTATATTTTATACACGCTTGTAAAAACATGATATGTTTTGTCTAAATT GTTCTGAAAGCTGTTTAATATTCTTTGATATCTATATTTATCAATTTTGA GAGTTTTAAGGAAATTTATCTGTCCGTTTAAAAAAAAAAAAAATAGATGT AAATGTCCGATTTTCAAAATTGTGGGCAATATTTAAATTTTTTTTCCAAA AAAATTTATTTTGGAAAGTTTTGTGAATTTAGCTTTAAATTTTTGACTTT TTAAACAAATTAATTTTTGGATTTAAAAAAAAATCCAAAAACCAAGCACC TTCCCCCTCAAAAAAAAATATATACATACGATCCTGCGGACGCCCCTGCT AGGCAGACGCTGTACATGTATCGCATACATCGATTTTTTCAAAAACGGGC TGATAATTTTTCTTGAAACTTTTATAATATATGGAACTTCGGACACTTTG CCGAAAACCTTATTACCGAACGGACACTTTCCGAATTACCTCTATGACAA ATGGACAAATTCTCGAAAAAAATAATAAAAATATTTGATGATGATTAGTG CTGCAATACAATATAATTATCTATTAGACTATTTCAATGACAAAAACATC ATGATAATCTTCATGATCGGCATCCAGAAGTGTCGATCAGGATTTGACCA GTTACATAGGAGCACCAACACATTCTATCTATCCATTTACATCGCCCATT GTATTTCAATCATTAATTGATTGACTCCTTCTATTCTCTAAACATTACAA CGGTTCTATTAGCTGTTTAAGCCAACTTTTAAAGCATTTTTATTATGAAA TAAATCAATTAACACTTTCCGTTACAAATAATTAAATATTTCATTTTTTT TAAATTGGAGTAACATGATTGGGAATCATAATTACATACTATTGGACTAT ATGAATCATCATCTAATGTATGTTTCATTTTTTTTCGGCAAAGTTTCTGT TCGACAGAGTGTCTTTCGGCAAAGTGTCTACGCACGAATATATATGTTTA TATAAGCAAGACTGTTGGATGGTCTCAAGCATTTGAATAAACAATATTTT TTGTGTGATATTTGCAAACTTTCCTTAGACTGTATAGCGTCATCCTCAAA GGAGGAGATTTAAGAAATGTGTACTTTAAAAAAATGTAGCCTTCAAAATC GTAAGTTATCATTATTTTTTGGTGTTCAGAGTCAAAATTTGCTATTTATA ATTGTTCAGAACAACTAAAAACCTTGAAGCTATAAAATCAGTTATCATTT TATCGTAGGTTCATTGTGGTAATTGCTAATTAGCACAATAAACAAATTTG TTTTCATCTGTAAAATGACTTTGGACTTATAAAATATGTATTTAATTTTG ACACTCTATAACTCAGGTAAAATGCCTATGCCTGGGAAAAGAATGAAGAA GTCTGTTTGCAATAGAGGCGGATCAAGTCGTACAAACTATAAAAGCTATG CAGAATCTAGGAAGAATCGAGAAAAATTTCGCAAGAGGCTAGTTGAAGTC ATAATGCACCGTGATGAATGGGATGATGAGGATGCAGATCCTTCATGGAC TGGAGCTCCCCTTACAACAAAGGAAAAAGATTTATTAAGGTGNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTT ATGAATCTGGATTTTTTAAATGAGTATGATTTCTTTAAATTTAAAATATT CTTTATAAACAAACACAGACTATTTTTATGACGTTGATTTGATTAAAATT CTTATTTTAATCAATTAATTTCATGGATGGCTTATATTATCTACAAATTA ATTGCCCGAATGTAGCAAATTGATAGGCTAAAATGTCAGTTAAGGGTAAT ATACAGGCCGCAGGGGAGKCTGCAGGATTATATATATATTTTTTTTAGAG GGGGGGGGGGGTAGAGGCTCGGTTTTTAGATTTTTTTAAAATACAAAAAG TAAAAAAAATTCGGATAAAATTAAATTTTTTGAATATAATTTAAAATAGA ATTTCTCAAGAAAAGAAAATTTAAAAAATTGAATTTCTCAAAAAAAATAT AATTTTAAAAATTGAATTTCTCAAAAAAAAAATAATTCAAAAATCCACAG CTATCAACATAAAATATAATTTTTTGGAAAAGAATTACAAAAATTAAATT TTATATTTGAATTTTTTTCAAAAAATTCAAATATAAAATTTTTTAACAAA AAGGAAATGTTCCTTAAATTGAGGTGGGCTACAGTGCCTCTATCCCACCC ACGGAAGAAGCTCCTCACGTGGGTMATCATAGCCAATAAACTATAATACT ATAATCGTGCACTACTCAAAAAAAAAACACCTCCATTTTGATAATAAAAT CAATTATGATTAAGCTTTCTCTTTATGTAGAAGTCCGTTTAAAAAAAAAA ATAAAAGAATTATTCTCAATTGATGAATGCGAAGAAATTCAACATATTTT ACGTTTTACCCACGCGTTAATAAAAGTAATTTTGGGTAACCTACTTTAAA TAGGAAAAAAATTAATCCATATAGCCTATAGTAAATTATATTCCTTACTG TATTGAATGAACCTATATATATAATGTTGTTTTTTACTTAATAACTTTCT TTCTCTTCCAGGAACTTTTTATTTGGTTAATATTTTTTAAAGCATATATT CCCCCCCCCCCCCAAAAAAAATAATAATAATAAAGGCACTTAAATAAATT ACAGCCATTTGACCCCACTTTACCGTATTTATTGTACGTATTATATTCTC TTTAAAGTGACATATTCAAAGATTGTACTCAAACTTTTAGCATTGTATTC TGACCCTCCCCCTAGTCCTGGTCACATTTCTTTAAACCTCTCTTTCTATA AACTACGTACTTTGAATGTACATGGCTCCTACTTTTAACTTTATTAAAAA AAACATCCTTATTATTTAATCATTTCAATTATTATGAACTGATACTATTT TCTCTTAAATTTCAAAATATGTTTAGATATTATTACTACATACACAACGG TATTGACACACGCTATGTTGCATCTATGAGCTCTAAATGGCTAAAACGGA TAATGACAATGGTTCCACGAAGATTAATGAAAAACCAAAAAGGAATTAAC AACATTCATGCTGAAATTCGAAAAGATTATCTTTTTGCAGTAAAGAAATC CATTGTTGATTTTGTTTTGAAAGGTATTCTTCATTGAGAACTTTCTTTTG TAAGGATAATTCATTCATTTATATTTATAAGAGCCTGAAATCGATGAAGA TGAACGCTTTTTAGATGAGGATGATGAAACAGAGTTAACAATTGAGTTGG CCGGAGTCTCGAATGCATGGAAAAAACTATATATTCAGTCTCGAAAGTAC CTAAGACTTAATTTGCATCCAATTAGTTCTTGCTTACTTCAGATGCTTAA 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