EMLSAT00000008637, EMLSAT00000008637-704484 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008637
Unique NameEMLSAT00000008637-704484
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s532supercontigLSalAtl2s532:229776..238340 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008637 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008637EMLSAG00000008637-691403Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000038310EMLSAE00000038310-747238Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000038311EMLSAE00000038311-747239Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774933auto774933Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008637EMLSAP00000008637Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008637

>EMLSAP00000008637 ID=EMLSAP00000008637|Name=EMLSAP00000008637|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=62bp
MPKEYGLTQTMKLSNEFANVVGKKEAFRPKFIKFVLKKHNLQDPEKKQYF
NPVKKMVIFPKI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s532:229776..238340+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008637-704484 ID=EMLSAT00000008637-704484|Name=EMLSAT00000008637|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8565bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s532:229776..238340+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCCTAAAGAATATGGTTTAACCCAGACGATGAAGCTCTCGAATGAGTT CGCCAACGTTGTCGGCAAGAAGGAAGCTTTCAGACCAAAGTTCATCAAGT TTGTCCTTAAGAAGCACAATCTCCAGGATCCCGAGAAGAAACAATACTTT AACCCCGTCAAAAAGATGGTCAATATTTTAAGAGAGAAGACAGCATTTGT GAGGACCAAGTTNCCTCAAGGTGCAGCTTTCTGAATAAATATAGAAACTA CCAAAACTCCAATGCACAAAATTGAAGACACAAATTAAACAAATACAAAA AAAACAACATCGATTTCTTACTCTCTAAAAATATCTACTTTGGCCGTCGT TCTACCCCGTAAACAAATTACATACAANNNNNNNNNNNNNNTTTTAATCA ATATATTAWAATGATTAACGTCAATCTATATCTACAATAAATATACATTA TATGTTATCAGAAAAAAAAAGATTTAGCTTCATGTTCAAACTTGATCCTA GTTTATGTGGTTAWWGAAAMTTTTATCTTATTTTGTWACATCTAACAAAT NNNNAGTTTTATTCTCTGAATTTTTAAAGCCAATAAATTATTCAAGATTA GATGTTAAAATTGGTAATACAAAATTTGCTCAACATTTATTGATAATTTC AAAAAAGTTTCTTTTCTATATACAAAATAGTATGTTAATGTATGGCGAGA TTGTCTTCCAATAGTAAAATATATTTTTCAGAGATGTAGTTATATCTGTA TATTTATTATTTATGTATGCAAGTTATATTTAAAAAGCTTTAGAAAAATT GAAGGACACAGTGAATTTTTATGCTTTGCTATCAAATTATACGGCATGTT TAGAGATGAAATTAAGAACTCGTAGTTTTATAGGTTGATATATACATAAG ACTGTTTCAAATTGTGGAGTCACTGTGGAATTTTATGTCAATGATTGTAT ATTCTTTGTAGTTGAATCAGTCTATAACAATGCAGATAAATAAAATTTCG AAGAGGTTGTTATTCACAGAGCGAATTGGTTTAATGATTTAGTCATTGTG AGATATTAACACCACATTTCAGTGTTCCTTAATCATTCATACTTTTATTA TTCATTAAATAATCATAAAAATTCAAAATTTAGTGGGAGCTCTCATGGTC ATTTCACGCCATAACTTCCAACAATTTCAAAAAAGTAAGCTATTAACAAG TGTTTTTATGGTATAAATATACTATATATTTATGTATGAAAGTATGAAAA TTTGAAATCAATCAGTTCATTAACTTTAGAAATATGGCATCTAAATTTAG CAAAATCAAATATATTTTCTAAAAAAAAAAGAGCCCCGAAATTTAATTAA ACTTTCACATTTACATAAATAACTCGCCCATTTTTTTATCCAATTATATT GATTTTGAATAATCGGTCAGCAAATAAAAAAATATGAGCACTTTTCCATT TATCCCCGAACAACCTTCTTAATAACCTCGTAGGTAATATGTTGGTTGAC AACTTTATTTTATGTGTGTTTTAGTTGTAGATGTACTAGTCTAATAATTT AAAAAAAAAATAAAGTAACGATTATCCAGTTTGTATTAAAGATCTTTTTC GATTTTGAATTATAATTATTTGAAAATCATGAATGTGACTCTAGATAAGA TTCGGATAAAAATACATGTGCAACTTAAGCTCAGCTCGTCATGTTAAAAA AGAAAAGAAAGGAGAGTACATATATAAAATTTTGAATGATAATTTAGATG AGGTTTAGAAATAGATGTGTGTAGCTAAAGCTACGTGCGTCATATGAAAA GGAGAAATTAAAAGGATTGTAATGACTAAACAGTTTATAGTATGTTAGTT TTTTTGTTGTTTACCACTTGAAAAATATTTTTTAATGTCTCTAGCTGATA TATTCTCTCTCCTCAAAAAGTATTAAGTAACTATGTGCGACTGTGTTTTG AATTACGGGGAATAACACTGATGATTTTCTAGGGAGTTATCTTCTAAATT AATAAAGCGAATTAATATTATAAAAGGAAAATTTGTCTGTTCGTCACCAT TTAATAACTCTTAGTAATGCACAGTACTAATAAAACAAAGTTTGAAACAA ATAAAGAAAAAAAAATGTGATTTTCTTTGTATGTTGTATTGCCATTTAGC CATTTAGGCATTTAGATTCTTCAATTGCAATTTTTAATATTTTACGAGGG TCATTTGAAAAGTCCGTGATAATTCCAAGAGATTACACTACTAGACCGTA TTGATGTTATGTTTAGTTATTAGCATCTCTTGAAAGAACGCACACCATTT TTCTGCATGATTTGTTCATTTCATTCCGTTTGTCATTGGTTTGAATCGAG GAATCAGAAATAAAGATTATGGAAACTGTCTTTTGGATTCGCGTTATACC TGTACTTCAAGTTGAAGTCTGGAGGCCTTTGGCTAGAATATCCTAATGAA AATATATTAATTCAAAGGAACAATGGGTAGATGAAGGTCTATGTATATAC CAGGATATCCATCCAATTAATCAGTAAATTAAAGGACCAATCCACCAATA TATTTAGCATTTAGATTACACTGTCTACATAGAGATACAATACATGCTTC ATTTCTCTCTTTTACTTAGATCTCTTTATTTAATTACCCTGGGCATCCTT CTCCTCCTTGATGTTTAAATATTCATTGGTTTGATGTTACCTTTTTTTAC TATTTAAATAAAGTTATGATTTTTATAAAACACATTACATTTATAAATTA TAAAGTTTTTAACTCTATATGGTTAAAAAAAAAAAAAAAATTAGGTCATA GCTTAAGTATTGTTAAGCTTTGATAGCTTTTCAACTTGATGTATTGTACT TGTCTATCATTGCTTTGGCTTATGAGATATCGGTAATCAAAATTATACTT TTTTTATCTTTAAGACTTCAGAACTCAGAGTTAAATTGAGCTACATATCA CTAATTTCATTTCTAAGATATTATTTAAAAAAAATTGCAAGCCAAATTTA GTAAAATCCGTTTCCTAGTGAAAATTTATCATTCAATGTCCCATTATTCT TCTACATGTTCGAGTATGTATGTTATAAATAAAATAATACGTTAATTTTA TTGACCTTAAAGTACCATCAATGGAAATTTTTGGTACTTTTAAATTTTAT TTGCAGTGCTTCGAAAGGATTAATAATAATATGTTACCGACAAAAATTTT GCCTTAGTAGTTCTACATATTTATATAGTAGACTCCGAAATAGACTTTAA AAGCTTTCAAAGATTTTACAATCCCCTTTAAAGAGTCTAAATATTGTGCG AATATCGATGGATAATACCTAATAACATCACCTCCATCTTTCCATCCAGA TTCAGAAGTATCTGTAACCATCAAAGAGAAGGCAGCATACCTTGCAATAG CTGAGATGATAACAGCGCTTATCTTTTCATCAGCCAAGGGTTCATTATTT GGAATTTTGCTGGCAATAAGAGCCTAGGAATTCAATAACGATAATTCCAA CGCCTTCCGTTTTGAAAGCCAAAAAAAACCAGTGCCTTCTTTAAATTTTG ATTCGTGATGATCTACTCCCTTTAACACTGAGACAATCTACGAAAGCGTG TTTGGAGGAGTTAAACGTTTTTCCACAGTCTTTTTTTGTTCTAATTAGCC TTTTGAGAAAAGTATCTTCAGTCACAAAATTTCTTCATTAATTGCTTTTT CAGCTAAAAAAAGACAGAGAATAGACATTATATTAATATAGGAAACTATT TCAGCACCTTACATTCAACTCTTGTGAGGAGATTATATCTCCTTAATTTT TTTATGTATCAAATTACACAGGGTTGTCCAATTTGTATTAGTTCCACCGT GTCTTTGCCATTCGATGTCTAAAATTTCAACCCTATTTTTGATATTACAA TCTAAAAGTTTAGTCTAAGAGTTTGGGTTAACATCCAGACCTGTGGGAAT ATTTTTCAAAAAACTTTAAAAGGACTTCAATTCTTGTAACTACCTAACTG ATGTTAAGTGTTGTCTTCGACAAAAAATGAGACATCATCTGTATAAGTAT CAAGTAAATCTTTAGAATTGCCTAAGGAAATTCCAACTCCCTTCATCTCC TTAGCGAATATACACAAAATACTTCAATTGCAGCAATAGATAACAAAGGT GCTGCAGGAAATCCTTCCCTGCTACTCTTTTTGAGAAGAATAAGCTCACT TACACAATCATCAATGTCGATTGTAGATTATCCAGCAAGGTTCTTATTGG ATTGAAAAAACGCATAGACAATAGCTTTTTAACAGCCTGAGAGAAATGAT TCAATTTCATTCTTCACTCCCAGCAAGATACTTGGTTTTGTGCAAGATTA TTCGCAATTTTAAAAAGTTCAAAACATTTAGATGAAAATAGTCCTTTGCT TGTTTTTTCGTAATTCTACCTATTTTTTCTTAACACTATTTTATTGTTGT TTTGTCAGTTTCTATAAACTTGTTTACTCCTTTTTTTGTCATCGTTTTAA GTGTATTGTAATATTTTGTTTTCTTTTTTTCTAGGAAAGTAATTTTATAC TTAAATGTTTATTGTAAGATGCAACTTTTCTAAATAAATAAGGAGGGGGG AAAAGTTAATTAGTTGTTGTATATTATATGAATATCATTGCTACTATTTA CATATGTTTTGACACGATTAATATAGATATGTGTTGCTCTATTTACAATT ATCAAACCTATAAATACTCCCCTATATAATTTATCAGTATTTGTGCTTGA GTAACCTCCGATTTCTCAAATACATCTGTCCATTTTCACCCTTGACAATA TATGACCGATGATTTTCACGAATAGAATTGATAATTGCAATAGAATCTTA TTCTCCCTTAATAGGATTCCGAACTTTGATATGTTTTCCAACTTCAAGCA TTGGTATATACTGAGCTCCCATAGAATTCCTATTTTTAATCTGCTTTCGT TTTCTCTCCGCGATCTTCATTATAGAGTCAGATATTCTTGGATTGGTGAT TCATGTGCAGCAATCAAAGTTCGGAGTTATCTTCGAAATAACCACTCTAC AGGTTAAAGACCCCCTCCCCCTTGGTGTATTCATCCACTCTAATATTGAC GATTTAAATTTTTCTATGTCGACATTCCCATTTCTCCAGCATTTTTTAAG TGATCTTTAATTCCTTTAGCAGCTGCTTTAGCATGCCTGTTGCTTTAGGG GTAGTGTGAACTTGATTTCTCATGTTGTATTTTAAAATGATTATAGAATT TTCTGTCTTATATAGATTTGTATTGTGTTCCCCCATCGATTCTCAAACGG TTTGGAATTCCAAATATCACCATGTGACCTTTCAACGTACCGACTACATT TTTATATTTGGAGCCTTGTGAAATTGGATCCAGGAAGGTTATTCCCTGMA TCGATCTACACAAACTTGTAAATATTTCCCTCCATATTCAAAAATATCTG CTGGCGTTGCCTCATATGNNNTCTCTTTAYWAATTCTTCAATAATTGTCT CACCAGGCTGACTATTTCGAAATCGTTGACATTTTTCACAATTCTAAATT TTTTGACTGACATCATTCTAAAAATTGGGCTAATAGTAAAATTTTCTTGC TCTTTTCTTTGCTGTTAACATCCCCAAATGGGGGTTATGAAGTCCTTCGA GCCCTTTGGGACGGATTTTCCTTGGCATTATAATTGTACAATTGACCATT AATATTAATCTTTCTCTAGATTCTTTCTCAACAGATAAAAGGTTCTACAT ATTCTTGTAAAGATGCGATGGATGAATTCGCGGTAACTTTCTGACGTCCT TTCCTTCTAGTAATGATTTACTAACTATTATATTGTCTTCGTCTTCTTTT ACAGCGTTAAACATTTCATCCAAGACATTGTCTTCTTTTAATATTCTATA ACAAATAGCTTAGCATTTATTGGGTCTTAAATTTCTTTTGACACAGATGT CTCAATTTGAGCTTTTTTCNNATGCATCTGCGATGAAATGAGTCTTTTAT TCTAGGTTGAAGTTGTGTGGGGCTAATTTTTTTTACAAATCTCGATATAC GTGAGCTATTGATTGCTCCCATATCAGTTTTATTAATAATACCAAAAGAC TTCTTGTGATCCTTATTGATTTTAAATTATCTTCCTAAAAGATAAATTTT GCATTTTTCGATGGCTCGAAGTAAATAAAGTATTCATAAGTTGCTTATCT TGATTAAGTCTCAAGCATAAATCTTGGTTCGTAGAGTACCAATTTTTGAC ATCGTTCTTCTCCTTGCATAAGTCCATAATCCATCTCCTAATCCATGTAG TCTTGAAGCATCGTACATTATTGTTACTTGCTTCTTTGAATATAGTGAGT GAGGATTGGTGATGTACATAATATATTTTTACTTTTTCAAACAACTTTGA TTGATCACTTAACCATTGGAATACTTTTTTGTAACTTAATAATCACCTTA ATTGAGTCATAGGAAGTACAACATCCTATCTTGGTTTACCAAACCAAAAA ATACTTTGAAGCTGTGAAATATTCTTGGGTTTAAGGAATTTAATGATTAC TTCAATTTTACACAAATCCGCTTTAATACCGTTTTTCTTAGTATGAAACC CGCAAATTTGATTTCTTTTCCAATTTGTATCTTATTTGGTTTCAATATCA TCCCCTTTTCTTCATAACTTTGTCCAAGAGGTCCTTGACTTCTTTCCATG TCTCTCCATATCCCAAAATATCATCAACTATTTTATGAATGTTTTAATAC CTCTCATTGCAGAGTCACCTCAGGGCCTATATTTATCTCCTGAAAGTTTA AACCAATTGGAGCTCTTGTGACTTGTTTTTTCCCCAATAAGTAAGAAATG TGGTAAATGCTTTGCTTTTTTCATCCAAAGGAACTTGCCAGTAGCCTTTT GATGCATCCAGAGTGAAACATATTTTTGCATTTTGAGATAATGGTATTTT TTTTACTTTGTTTGGTGTATGAAAGGGCTGATTTGGTCGATCTACATATT TTTTCAATCATCTATAATCCATTACACTTCTAACCTCATCCGGAGTCTTC TTAGGAACAATATACATCGGACTTGTCCTTTATATTGGTTTTTCAACTGG TGCAATGATTCCTTGTATCTCAATTTTGCTTAGCTTAACTAAAGTCGCCT CTCTATATGTATGTGGAATTGAACGGTTTACCAGTGTTCTAATAGGCATT TCATTGGTTTCAAACTATCGTAGAGATCAGAAAGAAGTATCCACTTGTAT TTAATACGGAAGATATGATTTTCATAATCACTTGTATTTACTGATTGAAT TGAAAAAACCTAATTATGAATGTGTTTAATATTATTGGGAAATTCCTTTG GTATCACAAATAAGTCTCGATAAATGTCATTAAAGTAACACTTCATCGAT AGTAGGGGACACACATCCTATGGTGTTCACCTTGCGGTCTTGAATATCGA TTATCATACTCACAGCCCCTTAAAAATTTAAGGGTTTGATCTCCTGTATT TGACCATTTGCCTTCGATCTATATTCAGCTTCGCTGCTTTTTAAAAACTT GATAGAACTAACTTCTCAATTGCTCCAGAATCGGGATTGCATTTAATTCA AATTCTTGACTCACGGTTTTTTGTATTTGATAAATTTTTATTTTAATCAT TGGAGTCGGATTTTGAATTTCACTTGCTTAATTCCAATTATTTACATTTT GACAATCTCAGTTTTTTTATTTTTGCAATTTGAATTTTTCTTCTTATTGT GTTCAAAATGTCCTATTTTATTGCTTGAAAANNTTACATTTTGACAATCT CAGTTTTTATTTTTTGCAATTTGAATTTTTCTTCTTATTGTGTTCAAAAT GTCCTATTTTATTGCTTGAAAAACATTTTTWTTTATTGGTGGGCACTCAT TTTGGCTATGACTCTGACCTCAACATCTTTGACATTTTTGTACTGGCGTT GAAATATATTTTTATAATTATTCACCTTTGATGTCTTGATATGGATTTGA TTGTCAAATTGATCTTGTTTGATATCTGCACTTTCCCATGAAAAAAACTT CTCACAAATATCCTGTAGAGTTGGTTTCTTCAATTTAAGTATTTTTTTAG AAGATTCTTGTTCTGTAGTCCTACTACAAGACGAATTCTCAAATGGTCTT CAATAGCGCAATTTTGGAGCTTTTCTTCCTCTGCTATCGCTTTTGCTCGG TTAAAAAAAGAAGCAAAATTTTCCTTTCTTGACTGAATAAATTTATTGAA GTCAATTCTCGGATTCAAGACGGAGTATTTTCTTGGTAATGCCATTCAAC CAATCAAAACAAGCATAAACACATTTAATGTCGCCCATATCTAAGAACTG TTCCAGATTACCCCAACAACACGAAGAAAGACAATTATCTAGATATCCTC GCTGCTCATCCAACAGGAATTTAGAATTTAAATTCGTAGAATAGAATCTC CGGAACAACTTCATCCAGTGCTCTTTACATTAATAACAAAAATAGTCCAA TTTAATATATAAGGTATGAAATTTAATGATTCCTTAATTTATAGGTTATA TTTCCAAAAATTTGA
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