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Associated RNAi Experiments
Table of all RNA interference experiments conducted using this feature, grouped by Phenotype CV: -Missing-
Gallery Image |
Title |
Gene or target symbol |
Sex/Stage |
Phenotype |
Date |
|
M-F115 |
|
female |
No visible phenotype -Missing- |
14.05.2013 - 09:00 02.07.2013 - 00:00 |
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s532 | supercontig | LSalAtl2s532:318941..329907 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008639 >EMLSAP00000008639 ID=EMLSAP00000008639|Name=EMLSAP00000008639|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=469bp
APIDEGNKKEVVVDHNIVIADGLACDWXYNHIYWTDTGTNSINLAEFDGR LISTIIVDDLEEPRSIALHPAKGYVLYIAILVYFTFIFSWMFWSDWGEDP KIERAGMDGSHRETIISETLRWPNGITLDLVLDKLYWIDAKLNIVGSSDL DGSNSRVVYYSKQNLKHPFSISIFEDWMYWTDWERKAIFRANKFNGKDKQ VPMVIHVYHPYRQKDSINHCLPLNGRCSHVCVPAPQFTKDSAKTACVCPN GLRLSHDNLNCVHDPNYVPHRDSRLFKLSEKSQFNDSFHLSKYFNHNEYY LGPRSSLNETYKKSEKNSQVVSPLPNGNNETAGFXAGXAIGIGAGXILLL FLVRIHNPFPLYSYQYDMYLQVLMAIYRCFWYKSLQSINFDNPVYRKASE EGNGSRGGRNSSSPGAALLGMTIEREQSSFPQRNLTTLTLSSDISEATEI QPLNSNDTHVCSSEEVINS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s532:318941..329907- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008639-704486 ID=EMLSAT00000008639-704486|Name=EMLSAT00000008639|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10967bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s532:318941..329907- (Lepeophtheirus salmonis) GCACCCATTGATGAAGGTAATAAGAAAGAAGTTGTTGTGGACCACAACAT
TGTCATAGCGGATGGKCTTGCATGCGACTGGRTCTATAATCACATCTATT
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TTAAATTTAAAAAAAATATATACATTAAATTCCTTCTTTTTTTATTGGGG
AGGGGGTACAGCCCCTCCAGCCCACCCCTTACGGACGCCCTTGCTACTTT
TTGACCAAAATCGACGGGMCTTCTCTAGATATTTTATTTGAATTTAAGAC
AGTCTTAATAGGTAGCGTACCCTTTATTATTATCATTTTAATTTATTGGT
CATTTTGTATACCTCACAAACCTTTATCTCCTTACTTTTTAATTGAAAAA
AATACCTACAAAAATATGACTAATGTTTTTCCCTATCTTTTTCAGGCGAC
AGAAATACAACCCTTAAATAGTAACGACACACACGTGTGTTCATCAGAGG
AGGTCATCAATTCGTGA back to top
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