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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s542 | supercontig | LSalAtl2s542:233216..342343 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008728 >EMLSAP00000008728 ID=EMLSAP00000008728|Name=EMLSAP00000008728|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=669bp
MNQTLQSRTQRTNFQFLKRQCRDRGELFNDNEFISSIKSINNLCKTINYP IVWMRPHEICSNPKFIAEGVTQFDVNQGEYGDPWLLAAISSLTLTPKFLD RVVPPDQNFDYGYCGVFRFRFWQFGDWVEVLIDDRLPTSKGKLIFLHSSD PSEFWAALLEKAYAKLYGRYEALIYGITSKTLQDLTGGIVQSFPLNGHDK FLTFQVLNSAVPRSTLLIASINIDQNNPNCLYGRQGLIPSHVYSITGLAR IHGGESYLVRLKNPYGKGEWIGPWSKESKEWEKLGERDKELLSIRIQNEG EFWISFDDFIYEFSQLDLVHIGPDDWMSETALHNKKPWRAVLARRRWRSG YNAGGSPAYPETTALNPQFHIQIPRTPNKCHVVVSVTQQYNTIPLGRKWK NKLHHIGFAVYEVPSQMTRLNPYYVSEKKPLDVTNHSVAREVVTFFTLPP GDFIIVPQTNVPNCDGKFLLRILTDEQSNIWEVNEDNVLFRNVFSEFESN TEFNQNSFLINKLIAKYPHDIDATILYKALRNNWKTYLLERPSLELCKSL VMLRDFNISGRLNMTEIPAIFHLLQFWKSAFLKYAQNQTSKTSSFNLRFI LWEAGVTXSNKVLECLILRFVKNKIISSESYMTVMVRLHLAHERYHSIDT KMKGNPLSLEEVILMTIYS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s542:233216..342343+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008728-704575 ID=EMLSAT00000008728-704575|Name=EMLSAT00000008728|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=109128bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s542:233216..342343+ (Lepeophtheirus salmonis) CCTGTAAGTACTATTTCTCTTTTTTTAAATTATGTTCATTGTATTCTGAT
CTTTGTGACGAGAGCGTCTCCTTCCAAAAGAAAGTCTTCCAACTCGACTT
AATCATGCAGTCTAAGACTCGACACTTTGCTTGGACACGAAAGCTAAGAT
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GTATTCACTTCATTATTTTCCACGACRAAAACGWAAGAAGGCAAAAAAGT
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AATAATAATAATATGTTAATTAGGTACTAAAACAATGACAAGATTTACCC
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TAGGCTTTTATGTTCTCCAAGAATTAAAACCAAAGAAAGATACTTTTAAA
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TAATAATTATTTTATTTCAATTTGTCTGAATATTATATTATTAATTATTA
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ATTACCTACATATATGCATAAATAGTTCATGGGAACTCTTACGTAATAAA
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GTGAGGATTTAGGATCTCCACATCACTATTCGTTTAATAAATTGCAGATT
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AATAATGGTGTAATGCAAATATGTATTTATTTATGTACTTCATTAATTTT
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TTCTTATTCAATAATTTCATAAATTAAAAAATTATATCTTCAACAAAAAT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAATGTGATGAGAAGCATCATTTTGATC
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ACAAATTTCGCTTCTTTAATTGTATAGAACAATATTATTATTAAAAATTG
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AGTAAACACATAAGAATACCCCACACTGTTTTTAATCTAATACACTTTCT
TTTCCTTTAAGGTAAGTATTCATTGCATTAACATATTCATGAAGAAGTTT
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GTAGTTTTGAGAATGTATAATTGTTCACTTAGACACCACAGCACGATTCG
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ATTTTTTTTTAAATCTAATCATAAAATATGATTCTATTTTAGCTAAAATT
ATCAAGAATTATGATACACAACTCATTAAATGGGAAAAACAAGTACTTAA
ATGGTCACAATAACGGGAGTAGTAGCTTTGGATGATTTGCAACTAGTTTG
TCTGACATTAGTTTCTTCACTTAAAGACTTGGTAATTAAATTATTTTTCT
GTATATATAATTTATTGTTGTTATTAGTTATATTATTGCAATTGTTTAAT
TTTGTATATTTAACATAAATGAATGATGGTTTATTTTTTAGAATGTAGAT
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GAAATACTCTACTTTGTCTTTTCATTAGTTATTATTCTGAGAATATGGTT
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TGGATAAAAAACGTCTAAGTTAATTAAACGTAGTATATCTTCATTAAACA
TTTTGCTAATACATACTTTCATTATACCCTCAAAAATCATAATAAAGCAA
GCACATGATAATCACATCAGTATTTTAAACAATGATACCATAAGTCTTTC
TCCCCCTTCCCTTCTCCTTGCACGCGTTTTTCTCTACACAATTATAAACT
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AGGATATCAAAATGCGAAAATTTTGAATTCTTAGGAAGGGAATAGATGAG
AGGATGCTGATCCATATATCTGAATACTCTGTTGGAAAGATCCATTCAAA
TCATAATAAATTTAATGTCTTGAAAGTTAATAATTATGACGTCACAGCCA
ATTATCTTTATTCAATTTAATTTGAGATATATAGCATATATATAGCAATA
TACAATAATCAAATTCACACGCTGAGAAATCATTGGGCACTGGTCAGCGT
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TTTATCTACATACTAAAAAATAAACCATCATACATTTATGTTAAATATAT
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TACGGAATATTGAAATAATAGATTGTTCCACATAATATTTTCTTGTTTTG
ACATCGGAATTCAATTAAATATGTCATAACTTAAGGTTGCAAAACACAAG
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AATCTAAATAATTATTAATAATAAAGTAAATGTCAAAATCATATAATTAG
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TATGTAGTAATGTTCGGTAATATTACTCTTTATTNCTCTACCGATGAAAT
CTAAATAATTATTAATAATAAAGTAAATGTCAAAATCATATAATTAGACA
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TAGTAATGTTCGGTAATATTACTCTTTATTAAGAGCATCAAAAAAGATGT
TTCCCTGTTGTTTATGCTTGTATATAACATACTATTATCATGAAGGATAC
ACACAATTGCTAATTATAATGTTACACCCAATGTAACTACTTGCGTTGTA
TGAGTTTTCTGAACACCATTTCTTGGAGCTTATCAACCATAGCTATTCCT
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TAACATACCCAAGTCTTTAAGTGAAGAAACTATTCTCAGACAAACTAGTT
GTGAACCATCCAATGCTACTACTCCCGTTGTTGTGACCTTTTAAGCACTT
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ATATTTTAGGGTTATATTAAAAAAATATTGAATACTTACTGTTAGACAGT
ACAAAATTCAGAGTTCCATTTCGAAAATAGCAAATATTTATACTTTTTAC
TGATAACTTTGATCGAAATTTCATGGGATGATTCTAGATATGCTGAAAAT
TATCTCAACTTCACAATTAACAATGGGGTTATATCTATAAATGACATGAT
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TTATATTAGCATATGTGCTAGCATAATTTCTAATGTGTAATCACTTCCAA
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GAACTAATATTTCTTCTATTTTCTTTTTCATTCAATATGAGTATTGAGAT
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ATGCATGCATTACTCATTGAGAGGGGTTGTTGGAATCGTTGAAAAAGAAC
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GGTACCCTTGCATCTTCTAAAACACTTTTCTTCAGTATTGTACTAATCAT
CAACAAAGCTACTTCCCCTTACTGCTCTCTCACGTGCATCATCGTGCCCT
TTATGCTATTTGTCGTGCCCATATCGTTCTTTATGGGCAGTAATCTGCCA
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AGACGAAGGAGAATTAAACGGTTCATCATTTCATTTGGACGTACCAAAGT
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GTTAACAAATTGTTTGGGGAAGTATGTCAAGGAGGTTTGAAAAGAATAAA
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AACAACAAGGGAGGTCAGTGACGGCAATTTTGATTGGCCCTTTGGACGGA
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TGACCTTCAAATCATTTCCTCTTACAAGAAAAAAAAGATACATAAAAAGA
TGAACTCTTGGAGTTTTTTATGTATCTTATGCACTATGTATTTTATGCAA
GAGCAAACAATGTAAAGAACATCGTCATAAGCTCAGTTTATAAGTGATTG
GGAGAAGATTTTGTCCCGATTAGAATTTAAATTTTCATCACTGATGCCGC
CTCGTATTGTCTCAAAGCAGGAGGAGATCTTCGAAAAAAATCCTTTATTG
ATTCACATTATATGTATTTCTCATGGATAACATAGAGTAGCAGATATGGT
TCAATAAAAGTTTCCATTAACGAACGAACTTATTTCCCATGTGAAGAAGA
GGTTTTACAATTCTGGAAGAAGAAAGAGAGTATTTACTGCTTCGTACAAA
GTTCCCCTCGCTCCATGACCAATTATAACAATATAGGGAACTTGTTTAAA
AGCAGTGGAGTACTACTATCATCACTTCGACGTCTTCACAGAATATTTAA
ACAGCCTTGATGGAGATTTGAAATCAACCAGAAGAGCACAAGAAGTAGTT
AATAATGATTCCTTAAGAGAAGAAGTCGTATTTATGCAGTAATTTTTTTT
GTCAAATACCTTTGGCAATAACTGCGCTTGAGTAAAGATTGCCTCTTCTT
ACCAGCCTAACTATAGTAGAAAATCTGACTCAAGATTTCAAGGAAGAACC
ATTCACGACCAAGTTAAAAGAAGTTCTTTAAACGAATCCTGGTTACACAA
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CAATTATGATGCTGAGAGAGTCTTTAGTATGATGAATATCATGAATACAA
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TAACAATATTTTTTAAATAATTAGTTACTTTATTGCCTAATTTCTATTCT
TAAGATTTCGTGTCAAAGTTATCTATTCATCTTTTGTGGTCACAAAGAAG
TTATGACTGAGTACACTTCCTGTAAYGATTCGTTTGATTTTCTCTAACTT
ACAATATATTTTGTCTTGCATAAATTTACAGAATATAATATACATTTATA
AAGTTATTTATAGGGAAGTTATATATTAATAATATACAACAATCCCTCTT
CCTTCATGTGTAAATAAATAAATCATTTAAACTAAAGATACAGGGTGTCC
ACGTTGAATGGGAACTATCTTAAAATTCAAGCTGCTTGATAAAAATGGAA
TTTGGAGTGTATTTGTTAATATGAAAAAGTTCTACATGATATTGAACAAT
AAATTTATTCAACATGTCCTCCCTCAGCAGCCACCATCTTTTCCATCCTG
CCCCTAAAGGATTTGCATGCCCTGATGACTTCCGCAGAATCGACAGCATT
CCACTCCCTCGTAATGGAACCCTTCAGGACCGCGATGCTCTTGTTGCTGA
CTTTGCACACTTCCCTCTCCAACTTCCCCTACCAGTAGTAATCACACGGA
TTGAGGTCGGGTGAGTTGGAGGGTCAGGTGTTGCGATCCCAAAATGTGAT
ATGGTGGGAGTTGAAGAGGTTAGTGATCCTCATGGCGATGTGTGCGGCGC
TGAGTCTTGTTGGAATATGAGCTCCCTCCCAGCGGCCGTATCCTTCATCC
AGGGAATGACGAACTCCTCCATGACTTCGCAGTACCTTATTGTGTTAAAC
CTTTCCTTGCGATTGAAGAAGAAAGAAGGCGTCACCTCACCGGTGCTGCT
GATGACACCCAGGGTCATCACGGAGGCCGGGAACTTTGTGGTGAAGACTT
GCAGGGACCTCTTCTCTCTTCTTGGCAAGCCACCTGTCATTCTGGACGTT
GTAGCTTCTGTCGACAGTCCAGTTCTTCTCGTCGGRGAAGATGATTCTTC
CTCCATGGCTCTTCAGGTCATTGAGGAGACGCTTATTGTTGGTGAGCCTG
GTGTCCTTCATGGATGCCGTGAGGATGTGTTGTTTGGCCATTCGGTATGA
CCTGTACCCGAGGTCCTCATTCATAGCTTTGCAGACCAGCTGCTTGCTCA
CTTCACGGTTCTTGGCCAACCTGGACAAGGAAGTACCTGGCGAAGCTTTG
ATGGACTTTCGGAGGCCTTCAAGGAAGCGGGGAGTTCGGATTCGATCACT
TCTCATGTTGTGGCCTTTGCAGCAGMCCTTCCCCTCAACCTCCCAGACAT
TAAGATCCGGTACACCATGGTCTTGGGGTAGTTAAGAAGCTTGTAGATAG
CAGAGGGCTTGTGTCCCGCGCGAGCGAAGTCGAGGATGGCGTCTCTCCTT
GCTTGTTCCGTGATGACTATTGTTTGTTGTCAAAACAATTGTGGTGGAAG
TGATAGTGTATTGTTCATGCAACCTTTTATATTAGTATGATTTAACCACG
AATATCCACATTATGGATCTGGATGAAGTTTAAAGTAGTTCCTATTTATC
GTGGACACCCTGTATATTCTAAACGATACTCTTTTAATTGGGTTGGAATC
GAAATTTACCTTGAACTCTTGATGCAGCGACAGATACAATTGCACCACTG
TCCTATGTAGCTATTATATTTTTGAAGTAATTTCCATGGACATTCAATGC
ATCGATGAGTAATTTATTCAGTTCAAATTTTTGAATAGAGTTGATGATCG
AAATAATAGAGTTAAACCTTTTGATAGTAAATCATTTAGACTATTTTGAT
GATTCTTTGCCGTTCCTACTATTCTCCATTAATATATACTTCACATATTT
TATTTGCATCATCAAATAACCTTAATTATGGTTCTCTATAATTCCGGACT
GTGGTCAATTTGTTAACCGTCATACTTGAATGTTTTTTCAAATAGAAGTT
ATATGATTGTATTTAGGTCTAACGATGATTAGATATACTTTTTAATCCCT
ACCGAATGCGCGATATAATGGTGGCTTTGATGTTCTCTAATTATATTTGG
TCTTACAAGAAATAAGGAAATTGGGAGTGCTTGAAGTATTCAAGATGTAT
CATTGTCCATATTTGTAGTACAGCACGAATTCAAACTTATTCATGGAATG
GGTATTTGTGAAAGAAACTATATATAGTAGTGATTCATGCGTTATAAGCA
TTAAGGACACTAAAGGACTCTTAACAAGGAAAAGGTTTACTTAAAGTAGG
AGTTGACTTTAGGAGGATTGAACACGAAGAGTTTCAATGAACGATTTTTG
GGTGGATAATATATTTTTCGTACAATATATTTTGTCTTACATAATTTTAC
AGAATATAATATGCATTTATATATAGTTATTTATACGAAAATTATATATT
AATTATATACAAGACGTCCCTTAAGATGATTTCCATTCTAAGGGCTCACA
CATTACCATTACGTCATTACATAATATGATACTCAACTTCTTCCTCACGA
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TTGTAGTTACAGATTTTTCTTTATCTAAGTGGTTTTACGTAAGTAAACCA
TGAACATCTACAGCCTCATGCAACAATTATTATAGTTTGTATTTAATTTA
CACACATGCCATTAACAATTTGTTATATCCACCTTGTATAATGATCTTCG
TAACCAAAGTTTTATATTATGACAATTAATATTTAATACTATTTGTATCA
TACAATAAATTATAACTACCATTAAGACATTTTTTTGAAAATATTATTTT
GATTAAATAGTAACGCTATTAAATTTTGGTGAAGGAAAGCTTCTATATGT
TGTAAATTTTCAGATAAGTTGTAATGTTAAAAAAATCATTTTGAAATATC
TTATAAGTATGTTCGAAATTACCCGTCAGCCATCAAATATGATTTATGAA
TAAAAGTTTGTTTATGTCCGAAAGAAAATAGAGGAACCAGATAGTTGAAG
TTGTACTTACGGCCGCGCTTGCGCAAAACACGATTCCCACAACCCTACTC
ATTGATACGTAGTTGAGGAAAGTGACCAACATTTCTTCTCACGAAAGTCA
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ACGACAACAGTCAACACGTATAAAGTATTTATTTTTATACAATTTATAGA
AATCTATATGCTATGTTTATTGGAGCCATGTGATCTCTTTTTCAATGCTT
CAATATTTTGTTGCAAATTTTTTAGTATTCTTGAATTAGACACTCAGGAC
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TTTAAATATTTGATTAGAAATGGATAGACCATTTTTGAGCATAAGATTGA
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TGAGACGCCGATAAAAAAAAAACCCCATAAATAGACAGATATAAATACAT
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CTGACAAATATGGAGAATGTCTTTTTTTTTTGTATAATTTCTTGTCGGGA
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CTGTTCTTACCAAGGCACTGTATATCTTGTACGCCCTAAGTTCAAGGAAG
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TTGTTAGGTCCTTCAATAATTTGCCATCCCAATGCAAAGTTAAAGGAGAT
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