EMLSAT00000008775, EMLSAT00000008775-704622 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008775
Unique NameEMLSAT00000008775-704622
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s545supercontigLSalAtl2s545:156635..171883 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008775 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008775EMLSAG00000008775-691541Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000039041EMLSAE00000039041-747969Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039042EMLSAE00000039042-747970Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039043EMLSAE00000039043-747971Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039044EMLSAE00000039044-747972Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039045EMLSAE00000039045-747973Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039046EMLSAE00000039046-747974Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773476auto773476Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008775EMLSAP00000008775Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008775

>EMLSAP00000008775 ID=EMLSAP00000008775|Name=EMLSAP00000008775|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=431bp
MAPCCRDCFEWLVSFAINVDNHDSYGSQNSTNKEEQEEESSGGFENILKG
YTGEIKPLSMFKKQLFNRHGYNLAVFPGGIVKGVREAFNPHAVLHILTVG
IGEIIIQGLESGTFIAMDSTGKVYGEEDPRDDRVRFMEHVHGNYVTYLNK
KYAHMGWYLALKQSGSPKRGELTSYPWPQKAILFTYRDPYPKSIPAIQLR
NQHGYLLRLKDLKVTGSSRTSTEMAKNKXVGKPRNYKLASGVVRFGKSKM
YHKKAIYKFXRQLPKRRAHRIAKKPEKLSRRVRPTLTPGTIAVILAGIHK
GKRIVILKELSSGMLLISGPFKLNNCPIRRINQRYLLATSTKLDVSSIKM
PENINDDYFRRLRAAKKPAGSVFEGKKEEYKPSEQRKKDQVEVDKQLLNV
IMKHPEASLLKQYLKKSFGLSKGQYPHNMKF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s545:156635..171883+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008775-704622 ID=EMLSAT00000008775-704622|Name=EMLSAT00000008775|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15249bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s545:156635..171883+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTAAAAAGTAGTTTTCTTTCATGTCTATATCCTTACACGTTCTTTAATGT GAAATAAATTATTATAATTTCCGACGGGGGTTTATGTACATATTCTATTC TATTTCACTATGAAAGTTTTAATTAAATGAAAACAAAATGGCACCTTGCT GTAGAGACTGTTTTGAATGGTTAGTAAGTTTTGCCATTAATGTTGACAAC CATGACAGTTATGGATCTCAAAACTCTACTAACAAAGAGGAACAAGAAGA AGAGTCATCTGGAGGATTTGAAAATATTTTAAAAGGCTATACGGGTGAAA TTAAGCCTCTAAGTATGTTTAAAAAACAGCTATTCAATCGACATGGATAT AATTTGGCAGTTTTCCCTGGAGGAATAGTAAAAGGTAGGGTATTGTTATG TTTATATAGTTTATACATCAATGACAATATTATTCCTTTTATACCTAGTT GAGGCTTGAGTATACATATATGTTATAATACCTAATGTATAAGATAACAT GCAACTTTGTGACCCCCTTACTCAAACACAACATGGGGTTATTTCCAGAT ATTCAATATACAATTACCGAGTGGTCCATTAAAATCTGAACACTTTAGAT TTTAAACTTCAACAAGATATAATTTATTCATTAACAATATAATTTCAACA AAATTAATACCCAAAATAGATGTGTGTCTAAGGTTTCTCTTAATCATTAA TGTAGCCGTCCTTAGCGGCAATTATGGCTTCCAGGGGCCGGCAAAAGGCC TGGCTCCCACTGCAGATGTAGTCCAATATCATGGCATCCCAGTGCTGGCT GACAGGGGCTTTGAGGCCCTGGTTGGTTAGATGACAGTCACTGAAGGTCT TCTCATTGACTTGCATCCAAAAGGAATAGTCGAGTGGGTTGGCATAGGGG CCTAGAGAGGCCAAAAGTGTGAAAAAAAACACTGAAAAGACTCATTTAAA 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TAGCAATGGGTAGGGATGGAAATTTATACGGGCACAAGGACTCCTCCAAT CCAGATACACTCTTCATTCAACACAGCCATGTAACTAACTACATACCGAG TGGTCATTAAAATCTCAACACTTTGAAATTAAAACTTTAATTTGAAATAA TTTATTAATTAACAATATAATTACAACAAAATGAATACTCAAAATGGATG TGTGTCTGAGCTCTCTTACTCATTAATGTATCCGCCCTTATTGGCAATGA TGGCTTCTGGGTGGTGGGGAAAGGCCCGGCATCTATTGCAGATTAGTCAT CTGTCATGGCGTCCCAGTGTTGACTGACAGTGGCTTTGAGGACCTCAGAG TTTGGATGACGTACACTGCAGTCCGTCCCCTCGACATGCAATAAAAAAGG TATAGTATAAGGGTTCCGCACCAGGGCTGTAGGGTGTCAAAAAGTGTCAA AAAATAACTCAAAAGAGTCTTATAACGGAGGAGATGGGTTTCTTTCATTG CTTTGTGTCAAAAGTGGCCTCTCCACCCTCACGAGGCTCTTTCCAGGCAC TTTTTTATAGCTCTCAGGACTGTCTGCTGTGAAATCCCGAGATCTCTTGC ATTGCCCCTCATGGACTTGAGGGGATTGACCTGGACTGTTTTCTTTAACT CCTCCGGATCCAGTTTGGTTTGTCTGACAAAACCTTTTATCCTCTCCAAC GTTTCGGACTTTCTGAGAGCGTAAGCGGTGGTCCTAGAGAAGTTCAACTC CTTGGAATGTGCGAATGGAAATTCGTCCATCACGTTTGATTGTGATTTTC TCGACTTTTACATAAGGTAGAGAGCTCAGGTTTATTTTGTTTTGTAACTA ATTGTTTATGCTTTAATGATATAACAATATATGAATTAATTTCAATTACT CAACCTTCATTAGTTATTAAATCAGTACAGATTTCAATGGACCATCGGTT 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ATTAAATTTTTGGCTTAATTACTACATGCTAAAAACCAAGATTATATAAT GCAAAAAATCGAGTATAATATTTAGTATACATATTTAGAAATTTGCTCCA CCTAAAATACATTTTCATACGTAGTATTTGAGTAGAATCGAATGCATCTC TAAAACTTATTCCATATATGTTTGTGATATATTACAAATGAACATATAAC AGTTTGAGTGAAATTGAAAATAGACATGTTTAATTTTTTTTAGGTCAAAA TTATGACCTCGTGACCTTATGGATAAAAACTCATTTGTTGGTTTATACAA TAAAATATAACAAAAGAATAAAATAATTATCTATTAAATGGTTTTAATTA TAGATCGATATCTTCAATGGCATTCAAGATACAGCAATTTAAAAATAAGG TAGTTGGCGKCGAGGACGAAACTTTAGAAGCCGTTAAATTCTGAACCAGA GGACAAAAAGGGCTAAAATTTTGGATTTTTGAGTTTTTGAAAAAAAAATT AAAGAATTAAATATCAAATATTAAATTTTTCGGAAAAATTAAATTCAAAA ATCCAGAGCTATTTACAAGAAATTACATTTTTTGAAAAAAAAATTCAAAA ATCCAGAACTATTTACAAGAAATTAAATTTTTAGAAAAAAAATTCAAAAA TTCAGTGATATTTAAAAAAAAATTAAAATTCAAGAATTAAATATCAAATA CTAAATTTGTCAAAAAAGTTCCAAAAATCCATAACAATTCTCAAAAAACC ATGAAGACACCCCTGGGAGCACATATTTTATACAACTCTACATATTATAC TAGCAATGGAATTTAGAGGTGGTCGAAAAATCAGAATTTTAAAAATTGAT AATTAGGGGAAATTAGGAAATCTGTAATACTATGTATAAAAAAATATTCA ATGCTAAATTTAAGGACAATTGAATATATTTTGGAGGTTTCCCCAATTTA 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