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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s56 | supercontig | LSalAtl2s56:118096..129666 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009073 >EMLSAP00000009073 ID=EMLSAP00000009073|Name=EMLSAP00000009073|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=637bp
MSSYSSELTDGTGLRFQAETTKVVTTKHSMKAINICLWFCATFGALVGLC
YLVFDPLVKHVVLKRLILSNNSETSEIWENPPITPHFKVYLFNLTNPEGV
FNGTEIPRLVEVGPYVYHEKWLKEGVIWHNNGTMSYKTRKVFSYQRELSV
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EELIWGYDESLFELAKFVGDGPPTNKFGFFSAKNDSNDLSTYTMYTGENN
PYDLSKISSFNGKSHLNFWKNDECNLVRGSDGSTFNPYISKSDTLWFFND
QLCRSLPLVYDQEVMSRSLPGYRFKPRYDVYKSPSTVPENDCYCTDQTLC
DMIGDGMFAVSACQFDAPIILSWPHFLGANSSYQSSVEGLSPQLDSHGFW
FDIQPTTGTTMSARARIQINLAVKNIPAFSQLEKVKDIIMPILWFDEGIE
ELGSELTEVIGQAVLTPPIYKNYIFCIFLGFCASTFVIFLVALIRFALNK
SLNHTPSEGICRDNLIRNLGAQLNNPQVRGTGLCKSHHDDDGASAPMLPP
SDPSSACSSTDSSRLTXANHSRNSSTGSTLSSSAVVITQDSSSVNIPRTD
SSVQILSETSSIPTNYDSASRLKSLLNPKKKLPNTDY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s56:118096..129666+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009073-704920 ID=EMLSAT00000009073-704920|Name=EMLSAT00000009073|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11571bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s56:118096..129666+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTCTCTTCATGGCGAATAGTTTTGTGAAACTCGTAACTCAGTATCACGTG
ATATTTCTTCAAAGTGATCCGTAAGAGTAGATTCTAAATGGTGGAAAGAG
GTGTGCTTGTGGGTAACTTGGTGGTAAGAACAAAATAATAGGAATGAGAA
ATACCAACTCCCTTCCTCTCTTTTGCAGCTTGCTGGCTGGGGMCCCTTTA
AAAGCCATTTCCAGAAAAGGATCTCTTGCAACTCTTATTACTGGTGCTGC
TGATAATCCCTCTCTCTCTCACACGCCACGGCAACTTGATCCATCGTCAT
CATTAGTTTATCATCCTAGAAGAGCGACTTGAAGAGGGTGAACATTGTAT
ATGAATTTATAAGAGATACTTCTGTGTCTTATTACTTGTGCCCTAATAGT
GAAATATTTATTTATTCATTCTAATATATTATATAATTAATTGAGGCATC
AATTTGGAGACTGCTACGAGTCTTTACTTCATATTAATTGTCTATCTGGT
GGAATTATTGTCCATATTGTTAATTAAATAGAGACACTCATTCATCCACA
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TGATACTCTACTTAAATCACCATCATGACCATGACGATGTTTCAAAGCAT
TCCTCTCTTCCCCTCTCTCCCTCTCTCTTCTCTCACTCCTTAATTTAACC
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GACAGTTTTCAATGACATATGTCAAATTATTTCTTCTATTTTGTAAATAC
AAACGTATTGTATTGACGAACAAGGACAACTATAGTTTTTATAGTGATAT
TTGTTCGAAGATATATGTAGTTCATCCATTTCCGAATATGTATTTTTTTT
TTATTTACACTCACGAGGGTTAAAACGATTATCACGTCCCTGATGATTAT
GTAGGAAGAACCAATAGGGTGCTTGAGTCCATCATTTCAATAGATTCCTC
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TACACGAATTTTTAAGTGAAGAATCAAAGTCAAGCACTGATTGAGATCCA
TATCGGTGGCCCAGAGTACTTTAAGTGCAATAATAAACAAGTATATAACC
TTCTCCCCATGCCGGATCTCGAGGGAAGTCGACAAAATCTGTTTTCTATG
AAAGAAATCCACCCTATATAGTTAATTAGGTGTTCTTATGTAATAACTAA
TTCGGGGTGTTCATATAAATCTCACCTATCAACGATATCCGTTGATACCG
TGACCGGAGTCTACTGTACTACCTTCATATCCATCAATTGTCAATTGATA
ACTAATTATGATAAGGATAATAAACACCATAGTGAGAGTAACGTTACACT
TGTGTAGTCCTTCACTTCCTTATTATTATAAAATGTCATCTTTTGCCGAT
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TTGGTAAATTATATTAAGTATTCTCAATATTACTAGACGTTTCTTTCATC
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TAATAGTTTAGTTTAACAATTAAGTTAGCTTGACCCCTCGAAAATAATAG
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ACATGATAGAAAAGTTTTAAAAGATCTACAGGGCATGTAGCTGGGCGGCT
TCTGGCACCTGGCGATGATGCCGTTCTCTTAAGGGATGCTATCAATTGTT
TTGCTTAAAACACGGTCATTTTTGGCGTTGTAAATGGCCTCATTGGGATA
TAACTTTGTTCGGGTAAAGAGTAGCTATCTCGAACTGAATTCTTTTTAAA
ATTAATTTATTTTACAATTTCATCATTTTCACAAAAGTTTATTCAAATTC
ATAAATTTATATTGAATTTATAAACTAGAGCATATCTTCCCGAAATTCTT
CCTAAGCCTGTATATGTATAATTACAACAAAACTTAAAATTAAATTAATT
TAGACTTAATTGTTATTATCAGGTCACTACCAATTATGTATATACTTTTT
GATATAATAGATATTCTCGAATATTTCGTGTTTTAATTATTCGAATTCTA
GTTAATCAGATAGAATTTCGAACGAGTTCGAGTAACTTTCAGAAAATAGT
CTAGTTTTTTTGTTTTGTTTTTCAAGTTAGAGTTATCCTCGAATCCAAAA
TCGTAATCGAATCCAAAAATACTCAAAGTTGATTTTTTCCCCTATTGATT
CAATAACATTATTGGCGTAAGCCCAAGTAAGTAGTGTTGTATCAGTCCTT
ATTTATTCCGTACAGTCCAGTCTTTGGGGCGGGMCCTTAAGACTCAGTAC
TTTGGACTGTCAGTCCTAGCAATGATAAAAAAGAAGATACAAAGTCGTGT
GTCGTCATCAAGGGCCGAAATTTATAAGTTTTAAGACTGGTATGCAGGAC
TGGACCGAGAGTGAGCTGGACGGGACTGGAGTCTTCCGTCCCAAATAAGG
ACCGACATAACACTACTTGCAAGTGCATGTGAACTGCAGTTAGTGACACT
TGTTTTACATTATTATTCCAATTAGAATCGAAAAATATGGAATTGCCGTT
CCTAATTTTAGTACGGGAACGGGTACATAAATATTCGTATCCTGACAACA
CTCAAATGAATTACGTCGAGACTTGAAATCAAAAATAAATAAAGCATTGA
AATGTAGGATTTGTTTGTCAAAAAGTTGTTGACTTAAGTAAAGTCGGTTT
TTACGTATTTAAGTAATAATCAAATCTAACACTGCAAATCATTATTCATG
GGGTTGTATTTTTGAGTGTACTACTATGTCAATGTAGTTTTTGTTGATAC
AGAAGTCGTCAATTCATTCTTGTACGGAATGATTTATATATTTGTTATAA
TACTATGTTGTACTACATTTAAAATCTTTTCTACGCAATATTAATTTTTC
TGTACACTTGTGTATGTTAAAAAATATTGAGATTTCACTATGTAATTTAC
CTAATATTTATAGGAGATACATATGAAAAAACGTTGTCTTAAATGGTACT
AAATATACCTTGGAATAGGTTGCGAATGTGAATTGCTCAACTGTCTCTCA
CTTTGGAATATAATTACCTGACAAATTCATTTTTGAATACATACCTACAT
ATAGGGGCCTTAGTAATGCCTTATACAAAACTGATTATATGTTTTGCATC
GCTGCAAATAATTATTTCATACCCACCGATCTTAGTGATTACTAAAATGA
GTATGAATAAAAATATATTTATATATTTGATCTGTCATGATGAGCAATGA
GTAAAGGATATGATCAATCACGAGTGCATTTCCACCGATCACTGTCGTAA
CTTGTGGACATGGTATGCACAACTTCTGTTTTCTGTACAATTTGTAACTT
GTACGCTTTATTTGATTAAAAGATCAGTCATTTTAATAACCAAAAATTAA
TTAATACTATGATTTTGATCTATTAAAATAACTTACTTATTATTTACTAG
CAGAAGTACCCGACATTGCTCGGAGGGATTAGGCGTCGACGAACAGATAC
ACCTTGCTCCATTTATATAGAAGGTTACTTCCCAAGTAATTATCAGTGTT
ACTCTTTGTTTTTCATGGGTGCACTCACACGTAGTTACTATATACATGGA
GGTTATCTCCTTAAGAATGAGAAAATTTAATAAAAAAACATTGTTCAGTT
TGCCAACAACATAAAACTCGCACGCCAAAAAAAGTTTACAGCCCTAAATC
TTTTTTTAATATGACGCACTGAGCAAAAGCTACACACGCTGTTTGTTAAA
AATGAGTCTCCACCTGCAGACAAACTTTGCTTTATTAATATAGAAGATTT
ACGAGTTATGATAATTGTCAATATTTGACCTCAGCTAAGAAATTTCGGAG
TTTAGTCATCGATGAGGGATTGTTTTATTGACATGATGAATTTGTAAGTA
CCGGTTGTAGTACCAATTTAGTATAGTATTGTTTTAAATAAATCAATACT
TGTATTGGGCCGGTCCAGTCTAGTCTTAGGACCGGTCCTATCGATCTTTG
ATTTTTTTTCTAAAAATGTTGATTGTTTATTCAGCCAAATATGATATATG
AGATATGTATCAAGATTATTGCACATACCTGTCGAAAAATAATATTTTTT
TCATTATAATACAATATAACACGAACAAATACTATTTTACTAAGTTTTAT
AGTTTATTCTATTATGTAACGGAATAATAATAAAAAAGAAAAACTCCCTC
AATGACATCACGAGGTATCGATTTTACCTTCTTTATGGACTGACAAATGG
GACTGGAATGGACCGTGGTCATCTGTTCTAAATAACACTTGACTGACCGA
CTCAACACTTGTCAATAGCACAGTACGTCGAGTGCAGTACTGGACCAGCA
CTAACTTATGCCAAATAGTACGAAAATATTTGTATCATGTGAAAACACTT
TATGCAACTTGCGCAATTTTATTTTGTAAGTTGCAACTTGTACACGACAA
ATATATTTAGAAGAAGCACAATACAACTGTCTGCATTATTTGTCAAATGA
TAGTATTAGATCGGCCCTAGCCTTCATTTCTAATCAGTCTTTTTTTTCTT
CATCTATGAGTCTTTTTTTTCAAATTGGTCTGGTCTTTCTCTTCATTCCA
CAGTTACAATAAAATTCCGTGGTAAAAATTCAGACCTAGGACAGACAAAA
TTAATCAGTACCGGACTGATAGGACTGTAATCTTTTTAGACAGATCCAAT
TCAATCAAATGATACTTGAAACGAACCGGCATTTGATTGTTCTATGCTAT
TCTATGTATTTTATATGTTGGCGTGTCTCATTGTAATCATATATTAATTG
TTTTGCTCTAAGGATTTATAAAAAACTTTTTTGCATGACGTTTGATAAAG
ATAAAAACAAATGTTTTTGCTGTTTTTTTGGTCATATTGCGGTCGGTCCA
GAAAGAGGTTCTCTCATCTCCACTACGTATATATATATATACATGAATAA
CTGGACTTAATATTTAAGTTTACGTATGATTATAGTTATTTTTTTATTTA
TTTGCAAGTAAAATAGTGGTTGAATGAACGCAATGTGTAATTTGAAGGTC
ATATATATGTATAATTGTGATATGCAGTATCCTATACATAATATATTATT
TATAATTTTTGGCCCTTTCTTTAAGTGAAATATAGTTTGTTTTTTCGTTT
CTACTACCTATTGTAAAACAAATTCAAAATTTCAATCAGAACACTTTTTA
TTTTTTCAACTATCTTACGTAATGCCTTCTTGGGAAAATAGTCATTTTTC
AACTTTCCGTTCTCCTTTATAGTATACATATTATGCAGGGCCATATGCTG
TAGCATCCCTCCAAATGAAGGAATTTTGGTTTTTTACTAGACTATTTAAT
ATTTCAAATTTAATTTAAAAAAAAAATGAAAGTAGCAAAAAATGATTCTA
ATGATGAAATTGACAGGTTCCACCTATTTTAGTGGCTAAATACAGTCTCG
TAAGTCGAATAAAGGTTCTAAACTATGGTTAACATTCATAGGTACCGTAA
CTTACCCAAGAAATTTGAATACAAAGTATATAATTGATCGAAATATGTCT
ATGAAATATTCGTCTGTATGTTTATAATATTAGAATGTTCAAAATATTGA
TTTTTCTTCAAGATTGAGTCGATTCATTTTAAGAATCAGAGTTCATGTCC
GTATTTTATTTTTTTATAGATGAGGTTATAACATATAGAAAACGATAATT
TTATTCGGCAATCCATATTCTTAGCTGCTTTTAGAAATATTTTTATTGAA
GTATGGAGAAATAAAAGTCTTACTTAATAAGTAAGTAACATTTCCATTGC
ATATATTGGTCAAAATGTTTATTAAATGTTTTTTAGCCATGTGTTTTTAT
GTGTTACCCTCTAGTATAATTAAAAAATCGCCAAATGATATTATTATAGG
TGCATAATTAAAATAATTATCTCATTGTATTGTTTTTTCTCTCTAAAAAA
AGAGTGTAGGAGCTGATGACGTATAATTAATAATGCGGGCAAAAATCTTA
GATAATGCGCTCTCCCCTCTTAGAGTAATATTAACATCTAGTTCTACTTA
TAGCCGCAAGAGTTACAATTTTGATAGAGAGTCGGAGATATTTATGACAT
TTATAATTCAGTTTCTCTTTTCTCATGCAAAAGATAAGAGTTAGTTTCGA
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GAGTTTACTGAATAGTATGAATTTCATCTCAAATTAGTCTGTGAAAAAAT
AGAAGACTTTCGAATCATTTATTATTATTTTTGTAAGTAAGAATGCACTA
TAATTTGATTTCATTTCTATATACCTATAACATAATTTTATTGAGTAATG
ACAACTCCCTCCGTGGTAATCCTTCTCAATCTCAATCCATTTGTTATTCA
TCGTAATGTTTATGTTATGTAATTATTTTACATCAATTTATTAGGGTACA
AAGTGTTCCAAAACACATTCCACTCCCTTAACAACCTCATTTATTTGGCA
TTTACATACATTTGTATGTATACATTTTAAATATCAATGATAATCAATCT
CTTAATTTATATATATTATTTAATCATCAATTCAATGGATTTAATTTATT
CGTGTCCCCATAAATTCTACAGAACGAGAAGGATAATTGAATAGAAATTG
TCTCATTTATTTAAAGTGAGCAGAGAGACTTTGGGTGATAATCCCTGGGT
TTGATTATTCATATAAATGCAGTTTGATTTGGAACTTATTTCGATTACGG
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TATGAAAAAAAAAGACAAAAACTATTGATTTAAGACGACATTTTTAGTTA
TTTGAGATAAAATAATTTTGATAGGCATTTTTCTAACTTATAAAATATAT
TTATACAGTTTTTTTTTCTAAAATATCTCATGGAACAAAAAAGAAAAGAT
AAAAAAGTTATGAAAATTTGACGATCCACATCATTTAATGTTACTATTTC
AGAAAGGAAAGATTAAAAAAAAATTATGTTATTCTCTTTTTTTGCTCTAT
AAACCAACTTTAGAAAAAAACTTTATGGACATTTTTTATAGATTAGAATA
ATGTCTTATCATAATTAATTGGGTACAAAATAATGATTTATACGTTATTT
TTTTTTTCATGAAATATATAACTTTTGTCTCATTTCAATCTTTGAATGGA
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AATAATTCCATTCTCACACAATAAGATCTGTATAAGTATGTATATATATA
TAATCCTCAGTGTATCGCTCAACAGCTTGGTGTCAATTTAATTAATATTT
TTCTAAAATACTACGTGCATGTTGTACATTAACATATGTAATTAAGTAAC
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GGTCAAACACGTTGTTCTAAAAAGATTGATATTATCAAATAATTCAGAAA
CGTCTGAGATATGGGAAAATCCGCCTATAACACCTCATTTTAAGGTGTAT
TTATTCAATCTCACAAATCCAGAAGGAGTTTTCAATGGAACTGAGATACC
TCGATTGGTTGAGGTTGGGCCCTATGTCTATCAGTAAGGAGGGATTATAC
AATTCTGTATATGATTAAGTGATTAAAAATTTCTTCTTTTTTTAGTGAAA
AATGGCTGAAAGAGGGGGTCATCTGGCATAATAATGGTACTATGAGCTAC
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TTCTGTAGATAAAATACTAACACTCAATGTTCCACTGCTCACTGCCTATT
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GCACAACTCTTAGAATATCAGCCCTGGGTTGAAAAGACTCCAGAAGAATT
AATTTGGGGATATGACGAGTCCTTGTTTGAATTGGCAAAATTTGTAGGAG
ACGGGCCCCCAACTAATAAATTTGGATTTTTCTCAGCTGTAAGAAAATTT
ACCTCTTTTAAATAATAAATCACTCCTAATAACAGCTTTTCCCTTTCCAG
AAAAATGACAGTAATGATTTATCAACATATACAATGTACACTGGTGAAAA
TAATCCCTACGATTTAAGTAAAATATCCTCTTTTAATGGAAAAAGTCACT
TAAACTTTTGGAAAAACGATGAGTGCAATTTGGTGAGAGGCTCTGATGGT
TCAACGTTCAATCCATACATTTCCAAGAGTGATACTCTTTGGTTCTTTAA
TGATCAGTTATGCAGGTCCTTACCTTTAGTCTATGACCAAGAAGTGATGA
GTCGTAGTCTTCCAGGATATCGCTTTAAACCTCGCTATGATGTTTATAAA
TCTCCTTCTACTGTTCCTGAGAATGATTGTTATTGTACTGACCAGACGTT
GTGCGACATGATTGGAGATGGAATGTTTGGTATTTATCTTACTAGGGAGT
CATTTGAATAATGAAATATCTAATTATTTCTAATTTCTAGCCGTTTCTGC
CTGCCAATTTGATGCACCGATTATACTAAGTTGGCCGCACTTTTTGGGTG
CTAATTCAAGTTACCAAAGTTCAGTAGAGGGTTTGTCTCCTCAACTGGAC
TCCCATGGATTTTGGTTTGATATTCAGCCTACAACTGGTACAACTATGTC
AGCACGAGCAAGAATTCAAATCAATTTAGCAGTAAAAAATATTCCCGCAT
TTAGTCAATTAGAAAAGGTAATAGTGTTCTAATAAAACAAAGAAGCATAA
AGCTAAACGAAAAATATTTTCTTTTTATTTTCAGGTGAAGGACATAATTA
TGCCTATCTTATGGTTTGATGAGGGTATTGAAGAACTAGGATCCGAGTTA
ACAGAAGTTATTGGACAAGCAGTCCTAACTCCGCCCATCTACAAAAATTA
TATATTTTGTATATTCCTTGGTTTCTGTGCCTCAACATTCGTTATATTTC
TTGTTGCACTGATTCGCTTTGCTCTGAACAAGAGTCTTAACCACACTCCA
TCCGAGGGAATTTGTAGGGACAATCTTATACGTAACTTGGGAGCTCAGTT
GAACAATCCGCAAGTACGAGGAACAGGTCTTTGTAAGTCACACCATGACG
ATGATGGAGCCTCTGCTCCCATGCTTCCCCCTTCAGATCCTTCTTCTGCT
TGTTCCAGCACGGACAGCTCAAGACTCACTKCAGCCAATCATAGTAGAAA
TTCTTCTACAGGCTCCACTCTATCATCCTCAGCTGTAGTCATAACTCAAG
ATTCTTCATCTGTGAACATTCCACGTACAGATAGTAGTGTTCAAATCCTT
AGTGAAACTTCATCTATTCCTACAAACTATGATTCTGCAAGTAGACTGAA
ATCATTGCTAAATCCAAAAAAGAAACTGCCAAATACAGATTACTAAGATT
TTATATATTTAAATTATATTATGTGTTCTTGAAATATTTATGTATGAATG
TGTTTGTATAATGCTGGCTGG back to top
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