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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s56 | supercontig | LSalAtl2s56:643388..654849 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009076 >EMLSAP00000009076 ID=EMLSAP00000009076|Name=EMLSAP00000009076|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=397bp
MNCNHTKRRYLILLVAITVLMIFLYNNCFPTITTINIIHGAKILFNHKKL MEQRLKTKKLTFEKYGDYRIVYDDILELEKLQSFNFDLRDIHRNVISKLY EVYGGSSSNIKKNLTPKQRFVMEQKEMICDALKSFKVLIYKQGDTNFRKM KKDHLFPSAPFLNNKRFNTCALISNSGSVIGSKLGTFIDAHDLVVRLNHA PTQGFEVDVGSKTDLRIVNSMILKKNIYNFFDISNILYHSNKTELLTFER SFLNQRFESWIKTQKPFLDFYFKKRENDLSEKFYMINYNSLWDMWKWLDS LVKYPIINYIPSSGFIGAQLLMRHCNILRLVEFIPSKRSTDLCHYFEKFR HKYCGYAGDHSLSAEKLIYYVMGNRNRDEIFDKGYVTIDTKHCHIER back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s56:643388..654849- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009076-704923 ID=EMLSAT00000009076-704923|Name=EMLSAT00000009076|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11462bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s56:643388..654849- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAATTGTAATCATACAAAAAGGAGATACCTTATCCTCCTTGTTGCTAT
TACTGTTCTAATGATATTCTTATACAACAATTGTTTCCCAACAATCACAA
CTATTAACATCATTCATGGAGCCAAGATTCTATTTAATCATAAAAAACTC
ATGGAGCAGCGATTAAAGACAAAAAAATTGACCTTTGAAAAATATGGAGA
CTATAGGATTGTGTATGACGACATCTTAGAACTTGAGAAACTGCAGAGTT
TCAACTTTGATCTTCGAGACATCCATAGAAACGTTATTTCCAAACTGTAT
GAAGTTTATGGAGGATCTTCATCTAATATAAAGAAGAATCTTACTCCTAA
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GTTTTAAAGTGTTAATTTATAAGCAAGGGGATACAAATTTTAGAAAAATG
AAAAAGGATCACCTATTTCCATCTGCGCCTTTTTTAAACAATAAGAGGTT
TAATACTTGTGCACTTATTTCAAATTCTGGTTCAGTTATTGGATCAAAAC
TAGGAACATTTATTGACGCTCATGATCTAGTTGTAAGGTAAATAAATATT
TGTAAAATTAAAATTGTGTTGGGAATCTATATATTCAATTGTAGGGCACA
GGTTTCCTTGTGACATTATATCTTTTGACAAGTGAGTAGTGAATAATCAG
ATACATATTCGAAGTTTCGTGTCAGTCCTCATTTAGGACTGAAGACTCCA
TTCCTGTCCAGTTCAGTCTTGATCTGGACCATTCAGTCCTGTATATACGA
ATATACTCTAAAACTAAGTCAAAGTTTTCCTTGATGACGTCACTCTATTT
TTTTATGAGTAAAAGTATTGACAGTCTAAAGGACCTKCCGCCTTAAGGAC
CTGTCCTAAGACTGATACGACCAGTCTTAGGACTGGACAGTTCCTAATAA
ATAAGGACTGACACTAAACTAGATATGCGTATTTTTTTTATAGTTTTAAC
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ATGGTACTTTAAGCAGTTTATCAGTTATTAACACATTCTGGAATTAATGA
TCCAGGTTTCTAAGAATGTTATTTTTGCGTCCTTAATACTTACTATATAA
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CTGTCAAGGGACTACTATGTTAAGTGCTTTCAAACATATATCTATGTAAT
CACTATTTCTATGAATAAACCTGCTCAATCGTGTTTAGAAATTAAATTAG
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AATATGAGAAGAATACCGAGAAGTTATCTAACTAATAAGTACATACTTTA
CCCAAGTAATCAGGTTGTATAAAATATTAAATCATTACTTTTTTTTGAGT
AAGGAGAAGACCAAAAATATAGATAGCTATGATATGATATAATTATAGGA
TATAATAGCTATGGTAAAAAGGAATGCCTTTTTTTTCAAAAGATGGCTAA
AGTAATTTGTATAATTGTACTCGGTTTACATAAGATGGCATTAGAAACAT
TATATTTTGTTCTAAAAATGTATTTTATAACATTTTTGACTCAGTATTGT
TTGAGGGGGCGTCGAAGATGGGCACACGCGAAGATAAAGTAGGCCATATT
TTACATCTCTTCTTCGACAAAGTGTAAAACAAAAAGCCATATGGCTTAAA
TGTGAATAACATTTATTGACCTGATACTATAACAGGCAATCACGTGGTAT
TTTGGTTTCGTTGATTCTTTGTTGGTAACTTTGATGTCAAATTTGATATA
AATACCCTTGACGAAAATGTGGGTAAAATAATGGAAATCGTAGAGGCCGA
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AAAAATCAATTAAAAATAATGGATGTATTTTTACTACATATAACATTTAC
GTACTTTTATGTATAAACTGTTTCCGTATCTTTAATTAATAACTATCAAA
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TCCGAAGTTATGAAATTTACGATCTAAAAAAATTTAATTTGACCTGAATA
TTAAATTCGTGTTACAACAAGTCTAAAGGTACAAGTAATTTAACAAAATA
AATTTGCTATTAAATTTTTTTACAGTTTTTTAATAAGGTTTTGTGCTAAT
TGGTCAAAAAAAGCAAAGACTACCATAGGTTAAATTTTTTTCTGTAATTC
CACCTGTCTGCTCATAAAAGAAATGACAACCATTTATATTTTATATGTCC
CAAATTATTGACAATTCTTAATTTATTACTCGAAATGGAATAAACACGTT
ATGTTACGATAAATTTGAGCTTTTTCCAAATATTTACTGACCTTTCTTCG
AAAAAAAAGAAGAATTTTTTAGCTAAATTAATTTAATAAATTGAGTATGA
AGAAATCCTCATTGTACAGAAATTAAACTTTTATTATCTTTACTTGATCC
AAAAAGTCTTTATTCCCAAATTTTAATAAATAAGTAAAATAATTAAGCCT
TATTTTATTTTAAACTGAGATAACATTTTGGAGCACTACTATTTATTTCA
AATGTTCCATACGTGATCATGCAAGGCATATGCTTTCACACAACAAATTC
AAAGAAGGGTAGGACCGCAAGATCTTGTGTTCCTTGTCAGAAAAAACTAT
GGCTGTACCTATAAAAGAAATTTCTCGAGACAGATCCTTACTTATGGAAG
GTTCGAGATGAATACCAACTAGCTTTTGATACAATAATTCATTTAAAAAA
TGTTAAGGATCTTGCTGAGCGGATAATTGGTCTCATTAAAGAATATAATG
GTTTACTAACATCTGATGAACCGCAACTACGATCCTCATACAAGTGGTCG
AATATCATCGATGCTTATATGTCCTTGATTCAAGGAATAAGACAATAATA
GATGGTAAAATATATATATTAATATTTTTTTTTTTACTCGGCCAACTGGC
ATTACTTTATTCTATTAGTCTTCATAGTGATCAAAACTTATAAGAAAATT
GAAATTGTAAAACAATCAGAGAAAAAACTCGTCTCAACAATATTTATAAT
AAAATTGACGCAGTTATTAAATAGAAAAGGAATATTTATACATACACAAA
ACCGAAAACAAGATAACAACAGCCGAAGATAAGATCAAAACAAAACTTAC
CTTTTTTTAAACTTAAATTAATAATTTGATCACTGGGATGATGCCATTGA
TATTTGATTTTCCTGCTGATCTTTTTGCATAAATTATCTGCTGAGTTTTG
GTAATTATGGAATTAACCTTTTTTTTCTCCCTTCCCATTGTAGTGAGCAA
TCATCTCATCTCTACCGATCGTAGCTCTAAAATTCCAATGTAATTCGTAG
GAAATCCCGTCATATAGTTCCTTTAGATAAGCACAATTCCAAAAAAGATG
GTATGTGGTTTCACTTTGGTTGGAATTTTTTTTTGCTCCTACTTCCAAAG
TTACAGAAGGAAGTTAGTACTTAAGCCACCTTTCAGTGGACGATATTTAT
TTATTTTAATAGCTTTGATGCTATTGTACTCAGTTTTACTATGCCTTTTC
TGACTAAATAGTCTATGAACGGTTTCATACATTATTTTGTGGCACACCTT
GGAATTTTTTGAGTGGTAGCACTTGAGGTTCTCATTTTGAAAGGTATAAA
AGGTGTTTGGACAGCTCTATATGGTACAATAATAGTTTTGAAGTATTGCT
TAGTCATCTTATCTATGAGGAAGCTCGAAAAATCGACGTACGCGGCAATC
TCAGCTGAGAGAGTTCTTACTTCTACCAAGCTAAGTCGCTCACGAATTGG
CATTTCCCAAATGAGTAAAAATTCAGCATGCATTGATGCATGTCTGCTTA
CTCTGCAGAAATTTCCCATTCGGTTGGAGAAACATTCCAGAGTTTGCAAT
ACCTTTTTGTAACCTGTGCAAGGATTATCCATAAAGTGGCCTTTCCTTTC
TTTCAGAAAATTATCTATGATATAGAACCAGGGTTCCTTGCATTTCCACA
TCTTTCTGAACCTTTGAAAGTTTAAGACCTTCCACATTTCGCCTAGGTAT
ATCAAGGATAGTCCTCCGTTCCTCAATGGAGCATGGATTCTGTCATAGGA
AATATTATTTTTCTTGTCCATTTCGATTAATGAATCTTTAATAACAGTTA
TTTTTTGAAAGGTTTTCTAAGTGAATGGTATTACTCTTAAAAGATGTATC
ACTCTAGGAACAACATTGTGTTCCATACTATGATGTTGTACCAAACGTTC
AAATTCAAGTTCCTGAAGAGGCTTCAGGATCACTCAATACTTTTAAGAAT
CTCTGTGTTGTTCTTCTGGCTTCCAATTGTCCCTACCCAAGATCCTAGGA
GTTTGATATCCGTAGATATTTGAATAGGAACTCAAAATATTTGTTTTCTC
TTGACTCATTTTTAATCCTGAGGAAAGGGCAACTCCTTGGAGAAGAGTTA
AAAGGCTCTTTTAATTGGCCTAATGGTGTCAAAGACACTCCCTCACACAA
TTAAAGTAAAGTCATCAGCCTAACTTAGACACCGAGGTTATTTAAAAAAT
CAATGAGATACCAACAATTTGAATATCTCGATGAATTTCTTGCAGAATTC
AATTAATACCGATATTGAAGAGAAATGTCGATTTAGGGTCACCCTGTCGG
ACTCCCCTTTTATTCTTAAAGAAATTATCCAGGTTTCCATATTTGAGGAC
AGTACGGGAACCTGATAGAATTGCTCCAAAGATCCTTATCATAAAGTCAC
CAAATCCTTTCCGATATAGAGAACGAACAACGTGTTCGTGTGATAGAGAA
TCAAAAGCATTGGCAAAATCAATGGCCATTATCGTCGTGTCGTTCTATTT
GTGCTGAAAAGTTAGCTATCAGTTTACCCTTTCAACCATATTGAAAAGAA
TGGATGTAGGTGTTTGTGATATTATTGAATCTGCTTGCAATTACATATGA
ACAGATTTTATAAAGACAGTTTTGCATGGTTAATGGTCTATAGTTCTCAA
TATATCAAAGATCCTTATTAGCTTTTAGGATCAAGACTATTCTGCCTACT
GAAGCAAAATCAGGAAAAACCAATGGCTAAAATTTTTTCATAAAAAGTAA
GAAGAACTTGGACAAGTATTTCACTTANTTTCTTATAAAACTCAAATATT
CATATATAAGAAACTTTTCCATAATTGTATTAGTTGTGGAACTGGAAAGT
CATTATTTTCATTAAAAATTATTAGTTTCAAAATCGGAGAGGGAAGTAAA
GTTAAAAAGGATGTAATTGTAGTTGAAGACTGTATTGGAATACTTATTTC
ATTGACTAACTATAGAAAACTTAGGATTATTCCGCTCAATTACAAGCCAA
TAGATGGATTAAATCAATAAAGTTGAGGATGATTTAATACAAAAATAAAT
TAAAAAGTAATGTGAAGCCTCTCTGAAGAGAATTAAAGAATGACATGACT
GGAAATGATAGCAGTATACAATTTGGCTACTAAAAAATTAAATGTATAAC
ATTCAAAGTTAAGAGAATTTCATTATGGAGACCAATTATCATACGAGAGT
CAACATTATGAACAAGAAAACACTATATAAAATTGAAAACCCTTGTAAAA
TAAAAATGAAAAAAGAACCCAAATGATATATAGCTTTATTATAAAATGAA
AGTCAATAAAATCAATGAGAATGTCAGACGTACTAATTATAATATTATAT
TGGGATCCAAAAAATGAAAATTGATTCCAGGAAGAAATGATAAAGGTTGA
ACAAAATAGTACTCTCATAAGGGCTCTGTGAGAAACTTTGATTTATTCCT
TGGTAAAGAATAGAAGATGAAAAAATAGACAAATAAAGCTTAATCAGATG
TAATGATAGACATATATACAATTATAAAAACAATTATGGAACGATATTTT
ATTACTATAGGGGACATAAAAAATTAGAAAAAGAGGGAAACACTCATTTT
GCATCACGACAATTTCAAGAAATTTTAAAAGATTGGGGAGTAGAGTGGAG
ATGTTTATCACTAAAAAATTCTTAAACAAATGGTCTTGCAAAATCTGTGG
TTAAAAACTAAAAAAATTAGTCATGAAGATGAGAGATGAGAAAAACCACA
TGGAGAAAATTTTTAAATATACTAGGGTATTTTTTAGTCATAATATGAGA
TCCATATTACCAAGAATACCCGAGATCAGACCTGGAAAAGGTAAAGATGG
TACAAACAAATAACAACATTGAATACGGAAAAATGAATGAATATAGAGAT
TTCACTTCAATATTGTAATCTGAGATCATGTATCAAAGAGATGGTTTCAT
GAAGGTACAATTATTACAAGACGGGGTAGGAAAATAGAAAATATTTTATA
AAAATAAAAAATGGACGTTCATGGTTACGAAACAGAAATTTATCCAAGTT
GACTTTACTCAAAGGGAAAACATAAGACTATAAAATTCACCGATAATATT
TAAAAATATTGTTTCAAGGATCTTTAGAAAGGAAGAGGAAGGTAATTTAT
GACAATTATGATACACTAGGAGGTATGGTGATTTAACTTCATTTGTTTCG
ATCATATTTGTAAATATTCATACAATGAATTCTTTTTTAATATTAATATA
GCTCACATTGTCAGAACATATTTATTTTCAATGCATCATCACCTGTATAT
AGAGTAGAATAAAGTATTACAAGTGTGGATATACAACAGATGCCATTGTA
AAATATGCTTCTACAAGTTACAGCCAGAATATAAAAAACTTGTACAGCCA
ACACAACGTTACCTCGCTAACACAAAAAAAAGTGTATCAATGTTACATTA
TTATGTATTTTCTGTAGATTTCCACTTCTCCCTTGATACGTCATGGCTAT
TTTATAATTTTTTTTTCTTGATAAATACACAAAGTAATTAGTTATTTAAT
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AAAGATTTATTTGCTTTTGTTTACAATTGCACTAGCTATTTTGATGACGT
CACAGCGAAGTCAAATGAGAAGGAAATTAAAATTTATCAAAAGAATGGTA
TTAATACATAATATAATAATATTTTAGATTATTATCCGACAATTCTATTA
GTAGGATTTTTCCCCCATCTGACAATTACGTGAATAAAATTGATTTTAAA
AAAGATTAAAAGTTGTTACGAATAAAAAAAAATTAGAACATAAATTTTCA
AATAAATATAACCATCATTATAGCGAAGAAANTTAATTATATACAAAGAA
TAAGTGGATATTATTCACTAAATATGAAATACATTAACTAACAATAAGAT
CTTAATTTTTCATTTATATTGAATATAATAAATATAGAGTTCAATGTAAT
TATATCTCTAAAATAACCGAATATGATGGATGACTTGAATAAGAAAATTT
TGTCTTGTGATTCATGAGTGAATAACCTTGGAAAATGCAACGACATTCAA
ATATTCCAATAAAATCTAAAGAAGTTAAGAAATCACTTATATTTTTAAAG
ACATAATTACATAATAGTTTGCAATAACTATGTATATACAATAGTAGAAT
AGAGTAACTATCGAGAAAAGAGAAGCACATTATCTTTAAAATCTAGAATA
ATCTTCCACTTGATTCCAAATTACAAAAGGGACTCACAAATAATAAAGAA
ATCACTTATCAGGAATGAAACTTAAAGTGTCCAGGTTATATAACAATCTA
TATATACCATATATCTATACGTTATGTGCGTCAATGTACTCCTTATCCAG
TTGATGCCTTGACAACCCTGGCCTCCATACTAGCTATGATTTTTGGCACA
GTGATACCCCTATTTATTTATAACATATTGCCAAAGTTTCCTATTCATTC
TTGATCAAATATTGGCTAGTACATTTCAGATTTTTAAAAAAAAATGCGAT
TATTTAAATTTTCTCATTTTCCCTTGATTTTTCGAATCTTCATACTTCAA
AATAGCTTAGTACCAAATTTCATGAGGCTCTTTTGGACAAACAAATATAT
AAGAAAAAGTAACCGAGTTGAAAATTTTGGTCTGAAACAAGTATCTATAT
CTCAGAAACTACTCACAAAATTATCTGCTGAAATTTTGCACACTTAATCT
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TGGGTGTCATTTTTGTTTTGGTTGACTTGACATGGAATTATCCTACTATA
GATTATCCAATTAAGTCTTTGAAAAAAAAGTAATTATCCAATTACTACAA
CCCTATATTTTACATTCTCTTAAATAGTACTTCCTATGAATAGAATTATG
GAATGGTTTATATTAAGAGTAGGTTTTGAACTGGCTATCTCAATTAAAGT
ACATGTTATATATACAATTATATGTATTTTTTTTAACTTGTAAATTTCTT
GGGTTTTTGCCACTCCCATTTTTTTTAATAAGTATTTCTTTGTTTGTATG
CTTTGTTTATCTCTTTCTACAATAGAAATTTTTGGGTTATCATCATGATT
ATACATTTATTTTTCCTGCTTCTTAAAAATTATACAAGTCTTATTTTACC
TTCCTCTGATTCAATTTTGGCGAGAAAAAAAGTCACAGCCAGGTAGAAAA
ATACATTTTTTTAAAAATAAACCTTGACCAAAATTTTACTGATTTCTAGT
TATGAAAAAAAAATTTGTTATTTTTAATACTAGATGAATGCACGTTAGTT
TATTTTACTTAATTAAATAGTAGATCTGTTTTAATTAAATAACGTAATCT
TGTGTCTTTATGCTATTGAATGAAAGCAACACGTGTATCATTCGAGAATA
AATTATATATTGGTTCCTCCAAACAAAATCGTGAAAAATTAGTAATTTTT
GACCTTTACTATAACTAGATTCATATATGAAATTTTATTTTTGAATTGGG
TAATAAATTACGTAAATAATATTTTTATTTTAAAATTAATTGAAATATAT
AAAAAGTGTACAAGAACTCAAAGATTTGATAAAAAAAAGATAATTCAAGG
TAACTAACATGATCAAGTACAATCACTATAATAATTACAAAAATATGGAA
CTTAAAAGATTATGAAAAAATAAAATTTTATTGACTACATATAATTATCT
TATTTTGTTTGTTTAATAATTACCTATAAATTTCCTTTTACAAGGTGTAT
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AACAATAAACAAATAAAGTAAATACTTGTTCATGGCGAGTGTACTAACAT
AAAAAATAAAAAAATGAGCATACCCAATATAAATTGCCTTCAAAATTTGA
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CTTCTGATTAATAGAAAACAAAACAAAAAATGACAGTAAAATTTTTATAA
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CACTCTTCTTTCAAACGATTATGATTTAGTTTTTTTTCTGGATTATACAA
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ATCCCAAAATACCACCCCGGCTCTGAGTTTGTACAGCTGAAGTCCTGGGC
CAAAATACAGATTAAACTTTACTGGGACCCCGTTTCTTGACACCAAGTAA
CCCTTCTTATATTCTATAATGCACCACAGCCCACAAGTTGTGCAGGTGAA
CTTATGGGCCCGAAGCAAGTTAAATTTCCTCGTGCCCTTATCAGAGCACA
AAGGAGCCCTCCTAATATCAAAAAATGCATCCCACCTCTCAGGTTGTATA
TGTGAACCATTGTACCTCAAGGGTGTCGGCACTGTTTTTCTATGCACAAA
AAAACACTTATAATATGTTAGAATACACCCCCGCCCACGGATTTTGGGCT
CTTCGGCTGTACAGGTTAAGTACTGGGCATCAAGCCAGTTTAAATTGCAC
CACCACCAGATTTCAAAGCACCAATAMCCTTGGATTGTGGGCTGCTGGTC
CCTGAGGCAGATTCAATTCTTCCGAGCCAATTCCCTGAGCCTAAAAAACT
CTTCTTATATCCAAAATATACTCCGGTTCCCCGGTTGTACAGGTGAACTA
CTAAAAATGCTATTTATAGGTCGTCGTGGTCCCGAAGACCAAAGAAAATG
TTACCAGAACTGTTTCTTTATCCTTAAGAAGCGACATATAAACTTTCAGA
CAATTATATTTATTGGTTTGGCCATGATTGAAAGACAAACMCAGACACTG
ATATTCACATTTAATATATATATAATTATATGTCTCAATAGGAAAANTGT
TATGGGCGTTGATAGATTGAAATTGTTTTCATTAAGTAACTTGAGAGATA
CGATGAATAATGGTCTATGATACTATAAAAATTTATTGTTATTATTTCAT
AAATATTCGATTATTTTTAAGTATTTTGTTGATAAATTAATTCATCTCAT
TTCAGGCTGAATCATGCTCCGACACAGGGATTTGAAGTGGATGTTGGATC
TAAAACAGATTTAAGAATCGTAAATAGTATGATTCTTAAAAAAAATATAT
ACAATTTCTTTGATATAAGTAATATACTGTACCATTCTAATAAAACAGAA
TTACTAACTTTTGAAAGATCATTTTTAAACCAGAGGTTTGAAAGTTGGAT
CAAAACTCAAAAACCTTTCCTTGATTTTTATTTTAAAAAAAGAGAAAATG
ACTTGAGTGAAAAGTTTTACATGATCAACTATAACTCACTTTGGGATATG
TGGAAATGGTTAGACTCCTTAGTCAAGTATCCCATTATCAATTATATTCC
ATCTTCTGGTTTTATTGGTGCACAACTTTTAATGAGACATTGTAACATTC
TTCGTTTAGTTGAGTTTATTCCATCTAAAAGATCCACAGATCTTTGTCAT
TATTTTGAAAAATTTAGACACAAATATTGTGGATATGCCGGAGATCATTC
TTTATCGGCAGAAAAGTTGATATATTATGTTATGGGGAATCGAAATAGAG
ATGAAATTTTTGACAAAGGCTACGTGACCATCGATACTAAACATTGCCAT
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