EMLSAT00000009098, EMLSAT00000009098-704945 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000009098
Unique NameEMLSAT00000009098-704945
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s572supercontigLSalAtl2s572:252815..272447 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000009098 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000009098EMLSAG00000009098-691864Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000040387EMLSAE00000040387-749315Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040388EMLSAE00000040388-749316Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040389EMLSAE00000040389-749317Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040390EMLSAE00000040390-749318Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040391EMLSAE00000040391-749319Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040392EMLSAE00000040392-749320Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040393EMLSAE00000040393-749321Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040394EMLSAE00000040394-749322Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040395EMLSAE00000040395-749323Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040396EMLSAE00000040396-749324Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040397EMLSAE00000040397-749325Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040398EMLSAE00000040398-749326Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040399EMLSAE00000040399-749327Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775391auto775391Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000009098EMLSAP00000009098Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000009098

>EMLSAP00000009098 ID=EMLSAP00000009098|Name=EMLSAP00000009098|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1438bp
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EMHDSWSRDPSSVHVSWDAYFRGSQYISPPSLGTYSKSNEVPLSSMLPAL
QSTSSGTQPSTDVIDSHLVLQATIRSYQVRGHLAAHTDPLNIKNMSTEAA
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IGAEFMHIHNLDEVNWIRKRLETPGILDMSVDEKKRLLARISRSAGFENF
LAKKFTSEKRFGLEGVEMLIPGMKTIVDRSTELGVESVVMGMPHRGRLNV
LANVCRKPLDQILTQFAGLEAADEGXGDVKYHLGTYIERLNRATNKNIRL
AVVANPSHLEAVDPVVLGKVRAEQFYRGDTEGKKVMPMLLHGDAAFAGQG
VVYETMHMSDLPDYTTKGTIHIVANNQIGFTTDPRYSRSSPYCTDVGRVV
NCPIFHVNADDPEAVISVCKIAAEYRHEFHKDVVVDIVGYRKYGHNEIDE
PMFTQPIMYSIIKKHKNILDIYADQLIHEGIVSKEEVKEVIYKYEQICED
AYKKSNAQTEIYNKHWLXSPWSGFFEGKDPMKASSTGVHEETLENIGKKF
SNGPPNAEDFKIHKSMIRILKARAQMVENRTIDWALGEAMAFGSLLKEGI
HVRLSGQDVERGTFSHRHHVLHNQDKDMSTYNALVHLYPDQAPYSVSNSS
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VRQSGLVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQLCADDPEYFPPVDEDFTIR
QLSHINMIVANCSTPGNYFHILRRQIALPFRKPLIIMTPKSLLRHPECKS
SFDDMSLGTEFKRMIVESGLASENPQNVQKLIFCTGKVYYDLIKARKERG
LEDRIAISTIEQISPFPFDIVKEECDKYSNATLVCCQEEHKNQGIWSYVQ
PRFQTAIGGYSRIINYVGREVAPSPATGSKAMHNKELNLFINDAMSFGCT
TNMETNQTNVQEFILSDSGQQFIIEETISVDEPQTWIITTDVLPSEAHEE
ILSPVTTSSSSPSVTTTHYRPIVMKVPEPPPEPIPVSEHYKQVLQEQIPT
CYAEVAXASLSQLRQKGSSFLRAHASRHGITNASRKLTSQVLTELTRHYA
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VLAKTLLELSACGTSLLRPEAALHRVHNASRKSKDVVVSELWEHYVHFHN
DQLSQPSSPSDKKSFGKGMLDFHYDDINLKGQGEQKRGKERAANSRVLLV
TTCYNRHLNIMTEGEVNPKAYPLAEQALTAKILNLVQEASNYKQLHKGAN
EATKTLNRGQAEFIILAADAEPLEIVLHIPLLCEDKNVPYVFVRSKQALG
RACGVSRPVISASVTQNEGSQLKPQINSIQKEIEKLLV
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mRNA from alignment at LSalAtl2s572:252815..272447+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000009098-704945 ID=EMLSAT00000009098-704945|Name=EMLSAT00000009098|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19633bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s572:252815..272447+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTGATTACTCCGATCAAGGGAAGTTTAGTTATGATTCTTCGCCGGGACTT CAAGGAAGCCTTTCGTCACTCTTCAATACATCCATCCAGCGAGCACTAAA TATATGGAGAATTCACGAATTTTCTGGAAACACGTAGGTTGACATTAACA ATCCTCTTTAGTATTCTTACGTGGCTAAAAAAAACTCTTTGATTTTATCA GATTATGGCCATGGGTAGTGATTTGATTAATTATTGGGCCAAACAACATC ATATTTGGGAATCTATCCGATGTATCATGAGAAACGTTCGTTTGCCAAGA AGAATCCCTCTTTTTGTCTCCTAGTCTCAGTTTTCCTGTTTCTTCAGAAA GAGTTCCAAGGTGGGTTTCGAATGACTCATCATTTTCACTTAGATGCTAG TGTAAAAGAAGTTTAATCCTCAGAATAGGTTTCCTTAGTGACTAAGGAAC GATTAATGAAGAAAGTGAAAAGTTTTTTCTGGGGGGATTGGACGAACGAA AAAATCATTTATATTGTGAATAATTATTTTCTTGCTCCTAAATATAAGTA CTAAGTTAATCGGTGCCCTCTGATCTTTTTTTTCTGCAATGGAAGGAAAT ATTGATGTTTTAATATGTTGTAAATTTCCAAGCATTTCTGAATTAGCATT ATAAATTTTTCTTGATTTTTAATCATATAGTATTAATATTTAGTACATTC ATGATGATATCCAGATGATCCTTTTAAATGTCTTTTTTTTTCTTTANNNA TTGAAATGTATTTATTTAGCATATAATTGTTTTTATTCAGTTAAGAGTAG AATTGCAATTATTTATTTTATAATTTATGGGTTGTGGCTAATTTTAAATT AGATGATTTCAGTTTATTYGATTACTTGTTTGAGTATTATTTTAATATCA AAGATTTGAGATAATTTGTAGTTACATTTAATATCCAAACTATTCGTACA ATTGCATAATTTTGAAAGATGAAGTGCATCAGAAAAGTAGTGATGATTCA AACAGGTGGCTGGTAAAAYCAAATTCTATTTCAACCCTACCTTTTGAATG CAAAAGTATAGTTTTAGTACTTCAGAAAAAATAATTTTAATTCCTGGCCA TGGTCCACTAACCAAATTAAAAAATTTCTTAAAAATACTAATTTAATTAA ATTTCACTGTATTTTTCTTTCTTTTTTTCTACATTTCTATCAAGTATCTA TATTATTGATTAATTGAGATACAATTTATAGTACAGGGTCCACCCCACCG CCAGGCCCATTGAGGATATGACCCCTGACTCTTTTTCAATTTATATTTTA AACTGCGATATTTTGAAATAGTTATACGTAAATTATTTTTTGGCTTAGAC ATAGACTCAAATATATATATAATATATCGCGTTCCTGACGACCACCATGA GTCAATACAATAGCAGACAAAAACGTTTTGACTATTGAATCACGAATATT TTAGTCCTGTTTGTAACTATAAATCATGAATTAATTTATATGAATTTGAA CAGAATTTATTGTGGGGATTTACTCTTGCGCCATGATTATGTACCTTTAT ATTTTACTCAAAATATAGGCGTAACCCAATAAGTTTTGTTTGCATTGCCC TTTGAGGAATTCAATTTTCTCTTAATTGGTCAAATAGTGACATGTATTAT TAGATACCTATTCAATATAATCTTTTCTACGATTCGTAGCATCCGAAAAT GTTTGGTACAATCAATGAAATAGCTAAAATGGAAGGAATTTATCTTGATT TGAAAATATAAATCTATGAGATATCCTAAACATTTCCCAGCTTCTTGCCT TTTAATTAATTCAAACAGAATAGTAAAAATAGTTGCTCTTTTATAATATC CAAATGATTTCATCGACAGCGAACATATATATCTTAGGATTTGTAGATTT TGATATGATCTGAAGATTGATCATATCTAATCCTTGAAAATTGTAAAGCA ATATTAAATATGACATTAAAACTTAAAATTATTTTCTTATTTATCAATTG TAAATAATGGTGTAATACAAATTCAAAGTTTTAAATTTACTTATGTGCTT CATTGATTTATATTTATATTTTATTTTAAATGTTTAGCCTTAATATATAT TTGATAAATGATTAATTTATTACAATTTAAATTATCAATACAATGTTGTC TAACAAGAGGAACCGACCTTATGAAGTCTCATATAGTCTAATTAAATTTA CATATAGCACTTACTATGTGTCCTATTTTTAAAAGTCACTTTTGGCAAAT AAGCCTAAACTAATACAGCACTAATAGGTAATTATTTCATCGAAAATTCT GGAAAACAGCTCATAGAAACTTGCTAGAAATGGAAGAATCCCAACTTTGG GCAAGTCGTTTTTTCTAAAGTTTTGGTGACTGTTTCTAATAGTAATAAAG AATATAGTAGTAAAGTAGAACGGATTGGCAAAGGTAAAGCTACGCTTATA ATCAAATAAGCCTTGTCACAGTAGACTTAACCATATCTTTTTTATGTTAA ATATTAACTATATTAGAGGGGCATCATTAGTACTGGTCTATACCTAGATA TGATTTTTTTTAAGAAGCAGTTGTATGTAAAGAGACTGCTTTATTTCAAA CCTGTTTGAAGGAATTCCTCATTTAAAAAAAAATATTTTATAATATATAC CAGTAGTACGCTGTTCATCAGCTTTTTCTATCGTATTCATTCAAAAATCT TCCAAGTTCATAATAAACTTTGGGATTCCATTRCCTTGATCAGTAACTAT TTAATTATATAATTTTTCTTCCAAAAAATAACATAAAAAATTGTTAAATA TAACCGTCGAGTATGACCTTTCATGACTGACATTACTTTCTCTCAAGCCT ATTTTATTGCCGAAAAGAAAGTCATGAACACACACAAAAAAAAAAAAACC CACGACACACTACTAGTGGAGCATACTATATACATTTTGACGGACCAGCT GACTATGACAACTTCAACGTACGCGTTTGTGTAATGTCTTTTTTGTATGA AAGCTGCAGATAGCAAGCTGATTTGAGCTGATACTTTACTTAAAAGGATT CAATTGTCAAGGTTTTTTTTCTTTAGGGTAAATCATTAATGTCCTATATA TTTGTGTATATATATATTAACAAAACTGTGCCTGGAAAAAGGCCAACAAT GAGTTGTTTTCATTATCGGACTCTGTTGAAGTGAATTCATATTTCTTTTA ACTTGATATTTTGCAGGGGAACGTATCTATCATAGAGCCAAAGGATGCAT CGCTCTGGAAAAGCTCTCAAGTCCTTTATACCACTTCTTAATAAAAAAGA GGCACCATGGGTTGTGAGGGCCAGCTACAGCTCAGCTCCTCCTCCCCCGA CTCAAGAGTCTTTTCTTACGTCTAATTCGGGTTCTTACATTGAGGAGATG CATGATTCGTGGAGTAGAGATCCTTCTTCCGTTCATGTGTCCTGGGATGC TTATTTCCGTGGTTCTCAATACATTTCTCCACCATCTTTAGGAACTTATT CTAAATCAAATGAAGTCCCTTTATCATCCATGCTTCCCGCTCTACAATCA ACATCTTCTGGAACTCAACCTTCTACAGATGTTATTGACTCTCATTTAGT TCTACAAGCAACGATCCGTAGTTACCAGGTTAGAGGTCATTTAGCAGCAC ATACAGACCCACTTAATATTAAAAATATGTCAACTGAAGCTGCTAGGAAA TTAATTATAAGAAGTGCAGATTTAGCTAACCAAGATCTTGACACAGTTTA CATACTACCACCCACCACTTGGATTGGTGGAAAGGAGAAATCTTTGCCCC 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TACACTACAAGCAATACTGCCTATTGTTCCTGCAAGTTTCGATGCGACAA AGCAAGCTCCATATGTTCCAATGCTATACTGAAAATAAAAACCACAACAG CTGGTAAAAATATTAAAACTTGATACAAGAGACCTTACCAAGAAGCAAGC ACTTCTTTTTGCCTCTTGACATCGCTCAACATTATGAGGGTCTTGAGGTA CTTTTAGAGGATGTTGTCTGAGATCTCTAATTATAAATCCAAGCCCTCTT TTTTGACGATTTAATAAGGGAGGAGGACTTGAAAGTGAGGAAAAGGAGTC GATTAGTTGTTCATCACTTAGTCCTTGGCAATGATCCTCTTGAACTTCCG AACAATTTCTATTTAAAGATCCATGTTCCCATGCAGAACTAAGATGTTTA AAGCTCTGATCCTCAAGGAACTTTGATAGTCCAAAATGAAAGTTTTGTAC AAAATTTGAATCCTCTGAGGTTGATGCTCCCAAGACACAAATCATTCTTT TTAAGCATTGCTGTTCATTAATAAAGATTTTGATCTGGGATTCTATCACT TCACTACTGAGAAAATATATATTATTTATAATAGGTATACTTAGATAGGT ATGCAGGTGGTTGGAAGTGATTTTATAGTGGGGGGGGGGGGGGGAGGGGG GAGATATAAACGTATAAAATAATTTTTGCTGCTTCAAAAGTAATTTTTCC CACTATGTATTTATGAATATTGCAATGCAATCTTATTAAGAACTTTTAGT AATCAAAATCACCCAATAAATTGAAATGGCAATGCCTCATTTTGCAGATT ATACCAAGGAATTATTACGCTGAAGATTTTGAGAAATTGATAATAAATGA ATTAGTTGTTATTTACTTAAAGAGTAAAAATGAAAAGAAACTCTATTTTA AAACTAACATGCATTTTCAATTAGGTAGATACTTGAATTTAGAGCAGCAT TTCATTTTAAAATTATCTTAACATCAATTATTCACAGTATTTACCTATTA TACATCAGAAAGTGATAGATTGTACTTAATCAAATTGAGGTAAAATTAGA TTTAAAGCTTACTTTTAAAAATACACTCTTACTGTTATCATGGTTTTTTT TTAATTATCATGATTAATAAAATAAATTATGACATGTGTCTTTAAAAAAA ATATTTTCAGGTCGAAAGATATTCCGGCCCTATATTTGATATTTGAGGCC ATGGTTCCTACAATAATAGTATACATAAATGAAAAAAATTAAAATTAGCG TATGATCCTTTAATTTCAAGGAAAAGTTGATTATAAATAACCTTTTATAG ATACAAAATAAATTTGTTTTTTCTGAATAAAAACACCTGCAAAAAATAAT TTAATCGTTTTTTTAATTAACTATTCTTTTAAAACAAACACAATACAAAA TATTTATAAAAACCCTAAAATTAATGACAAGTTTCTATAGAAACTATTTT CTCTCAAGGACTAACTATATTATTAATTGCAATTCCAAAATATGATTTAT TATTATTATAATAGGCAATCATTGGGATGAATACTATTTTAGACCTATAT ATACACTTACACAATTTATGCACTCCTCTATATAAAAAGGTAAAATTTAT ATTATATATATATGACTATTTTCCAATTTTTGAGAAACCTTCATTATAAA TATGGAAATGGGATATTYAAGCCTCTCTTTCTCAAAATCTATTCTTTTGA GAAGAATACAAAATGTCTGGACTTACATTTGGTTATACTCAATTTGAGAA TATTATTGTAATGATTCAATTATAATGATATTTTAAGATTAATTCGAATT TAGTGTTGTGAAATAAGGTTTTTGTTAGAGGAAATTATTTAAAGTAACTA ATCCGATAACAAAATATCATTTGGATAATTATCATAGTTAATATTAGGTT 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