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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s582 | supercontig | LSalAtl2s582:50131..73086 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009185 >EMLSAP00000009185 ID=EMLSAP00000009185|Name=EMLSAP00000009185|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=386bp
MFDSIIDLFFMPVTIAIGVLGNSLSIVVLRNKEIQLRDSFARILIALAVF DLTLILSSACIFTIPCFSDTYAKLLYPHIVPFFLPAAQIAMTASVYTTVI TCFDRYIAICRPALLGCCGRSEQKTSWCLICGTAIFSIVYNFTRFFEFRP ELTIDPSTNLTVFSVEQTALRKDPLYIQWYILIANFVFMGVFPSIIMIVF NLLVVRAVNXANKKRARMTKRQQRNITVTSMLVSVVVFFLICHSVKFIVT LYEIWESVISPEENWPPWVQFLTKLSHWLLILNSSSNIAIYVHKDPKFKA VFKNILFTYFNKIKTCCVSLRILQKKTPSEDNNSMIEFDNNKNIKNDGQH DLIEPNYVHVEVVQEDKRSCEELCNQSQKEMKSFDV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s582:50131..73086+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009185-705032 ID=EMLSAT00000009185-705032|Name=EMLSAT00000009185|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22956bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s582:50131..73086+ (Lepeophtheirus salmonis) AAGTCTGAGGGTGAAGAAGGTGAATCCATGTTCGACTCCATCATTGACTT
ATTTTTTATGCCTGTTACAATAGCAATCGGAGTATTGGGGAATAGTTTGT
CGATTGTGGTTCTTCGAAATAAGGAAATTCAACTGAGGGATAGTTTTGCA
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AGCTTGTATTTTTACGATACCGTAAGTATTAAATTTTTAATTATGAATTG
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GAAAATTGCTTCCAAGCTCCTGGGATTTTAAATCTTATGGACTACTCTTT
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GTATAAATTATTCTTAAGTTAAGGCATGGGACCAAATCGGTCCTGCAATT
GTTTGTAGTGCTGTCAAGGACTTTTGTCACTTCTGATGGCAACTGTGAAG
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AGGCTTTGTCTTTTTCTTTTATTACTTACGAACCATATGCAGATATCATT
AAAAGTATTTCACAACTTTTTTTACATAGGTAAAATATTTTTACAAAATA
TTTACATTATTTTCTTTTAAAATAACTTCGTTTGATTTTTAACAAAATAG
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CCCTTTCTTTTTGATAGCCTCGAGAGGCTGGAAGCTCCTGTGAGGAGKAT
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GTGTCTAGAGGAGACAAATGTCATATTTTGAGGTAACCAAAAGTTTCAAA
AGTTGTCTCTATCAAAGGTAATGATCTAGCTCTTTCTTGAGTGAAAACAA
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GGATATGTATTTCTAATAATGTAAAAAATAATTAAAAACATATAATTAAT
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AATAACTATTTTTACTTAGTTATTAGTGATTTACTGCTAAGATACATATT
TTAAGCTAAACATTACACAAAAAAGTTGGCAATGCAGCAGTTTAAGGAAT
AATTATGGCATATTTTTAATACATAATATTAGAGTCTCATTAATATTAAA
ATTTGACTTACGAAATACATAAACTTTGATATAAAATACAGTTAATTTAG
ATAAAGTAGTTGATCTTTCCCTTATTGAAATCCAAAAACAAAAATTAATT
AGTCTATCACTTTCTTTAACCTTACAATTTTTTTTATTCATATMCTACCG
GTAATACCTACCATTTGTTAGGCATCGATACACAGACAAACTATACAATA
CCTTTCATAGGTTAGAATATAACCCACACGAAATCCTTAGGGTTACTTTT
TGTTTCTTATCAGGACACTTCTACGCCGTTCTTTAATAATTACTTATTTT
CCTCTAACGGATTATAATTGTACCCTGCTATACACCCCAAGATATATAAA
AATCCTTCTTATTCCTTTCGATCTACATTTTATCACACCAATACTTTTTA
GCAAGCTCCTGAATAATAAAGTTAGATTATTTGCAAATTTTCTATTTACC
TTAATGGTACCTTGTTTAGTATTTATTAGTTTATTTAGATATTTTTAATC
AAGGTTTTACGAACTTTATTGACGGTATTGCTTCAAAGTCGTTCATGTTT
TTTCTTCATTATTTTTTTAAATGTGAGGATTTAATGAAAACAGATGAGGT
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AAACGCAACTCTTCTGTAGTTAAAAGTATTTTGAAAAAAGGTGTTTTTTT
TTAAATGAAAAATATTAATACAAGTTTTGTTAGAAATATAATTGATATTT
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GGGTTGTGGTTTCCATGAAAAGAAAAAAAAATCGGGACGAATAGATTTGG
TATAGAACTGTTACGCAGAGGTGCATGAATTGATGTTACCCCCTCCCCCG
ACTAAAACCTTATTCAACTTTTTCGAGCAACAACGCTTTTATATGTAATT
TGTCATAAGTTCGAGAAATATCTTGTCAAATACTGTCAAAGTTCCAACTA
GTAACAATATTGCACTTGTCCAAGATATTATTTAAAAAAAATTATAAATA
TTGTTCAATTTGTTGCAATTAGTCTGCAGAACGTCTTGAGGTACTTTTTC
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CTACATATCCCTCCCCCTTGACAATACTCTACGTTATAAATAGAAGTGTG
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AGTGATCTTTGAGCTATTTTTATACTTGAGTTGCAATGTGAAATGGGGCT
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TTTCAGTTTAAAAAAATTAGTTGGATTGTATTCAATCCAAAATACGATTT
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AGTAATCAACATTGCATTTAAAGAAAGGATGATCAAAATACGAAATCGTG
CATTGCACATAGAAGAAACTTTGACCACTTCCAGATCCTAAACAAACGCA
TTGAGAATTTTTTTTTTTTTTATTAGCATGGATGGTAATAACATTTTAAT
TATTAATAAAATCTCCTTGCAACTCAATCACTCCCTCAATTATCTCAAAG
AGTCAACATTCCAGTTCATTAAAAAATATTAATCTTACAGAGTTGGGAAA
AAATTGGTTTAAAAGTCTCATTATTGTTTTAAAAATCAGTAAGTATTTTG
CATATTTTTTAAATTTCCATTTTTGTTGTGATTCACTGTTTCAAGGAATA
GACGCTTAATGAAAAAACTCAGAATATCAAAACTGTATTATGTAAAAGTA
AATTTTTGTAACTCATAGCAAAAATTAGTTTAGACTTTAATATCTTGACA
ATACTGAGATGTTTTTTTTATAAAAGTGTGCTTATCAGATTATGCTGACA
AAACTTTAACAGAATAAAAACAAAATCCTTGATGTTCTCCAGTAAGGAAC
TCTATGTAGTTATTATATGTACTTCCGTGCCAGTACGTGTCCAATGGGGT
AAATGAGTTTACAAAGCTCCCCAAATAAACTATTTTAGATGTTCCATAGG
ATATGCCTCCAAGGAAGACTCATGATCGTGTTGGGCTAATAACTGACAAT
CAATTAATGGAAGACACGATTAAAATGAATTGATTTTTCTTGTCTTATCT
TGCCTGATTTGAGTTCCTTGGATAGCCATTTGTGAGGTGTCTGGTAGAGA
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CTTCAATATGGACCCTGTCATGTATGGCAAAATATTTGTGAATTGTGAAA
TTAATTTTAGGAAATAAATTGTACATTTTTTATTAATTTATGGATTTAAA
ATCCCTGTACTATAAAATGATAAAATAAAATGTTTTTATATTCGCGTAAC
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ATACTTTCCAATCCAAACCAAATTTCCGTTTATTAAATTTATCTCTTGTG
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AGGCAATACATAACATATTTTAAGATAGAAGCAAACATTAATAGTAATAT
TAGATATTATACACATTTGAAGGCTGTTTTTCTCGAGATCCACTTGAAAG
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GGCAATTCTCCCCCCGGCTGTTTTCTTAGTATCTTAAAAAGAAACAAAAC
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AGAAAATACTAAGGAGATGGAGAAATAATATATTTTCTGAGGATTGTAGT
AATATCTATTTTCATAAAAATAATGACACTTTATTTGCTTGAATTGTGTT
CAGTGTGCGAGTAAAATAATTAACTACCTGACAGCAAACAAATAGGGTAA
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AGGTCATCCAAATTGGCATAGTCGAGAGGGAAACAGTATTGGGAGAAGGA
TTGCAAAGTCGAGAGGATCCTTCAACCAAATCAACAATTTATGGTCTCTC
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TACATAAAAAGACCGTCCCAACTCCTTCATATACCTCCTCACAGTCCAAT
CACTGTGGTTGAGAGATTTGGCCTTCTGCCTGCCTCAACGACTTGACAGA
ACTTGTAGTGATTGCAGTGTCCATATCCACCATGATCTCGATTTTCTGGC
ATCGACTACTGTCAAATAACCTCTCAAGACTCTGATTTGAATCTACCATG
CTTTCAATGTCGTAAATAAGGCTCCGGGACCACCGTACGACTTTCATGAT
CTCATTGAAACTCACAGCAAATCAGACACCAATTTCCACTTCAAATCGAT
GTTTACAATTGTTGATTTAAAAAAATAACTTTTATTGTTTATGAACCAAA
ATATAATTTACTTTGTAAAAAGCAATTTAGTAATTAAGGATATTGACGGT
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GGGATATAATGAAATGTCTCGGAGTTTTACGCCAAGAAGAAATTACCAGG
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TCTTATCATAAATAGCAATAAGACTGTAGAAATTGTGGAATAGGCCTGGT
TTCCTCTTAGAGGCAAAATTCTGTTTTTTTCATTAAAGTATAACATGCGT
AGCTGTACTGAAAAACATGCATTTGCCGACAAAAATAAAAATTGTCACAA
AAAAATTAACAGAATATTTGATTAAATTCTTAGCTTTATCTTAGCTTAGA
CTTGGTGGCTCACCCCGCTAAAGTTTATCATGTTTAATGAAAACATAACG
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TAAATTCAATTTCTCATTGATTTGATAAATCTAAGATTTAATTTATAGTT
TTACAAATTAATTAATTCAATAATGTAATATACAATTCATATATAAATTA
CTGTCATTCCTTAATTGCTTAATTATTTTGAATATATTTCCTTGGTAGGG
TAATACACCATTGGAAGAGGCAGAGCATGATGTTATTGGCTAAATAATCT
TCTGTTGCCTTTTTATATCTTTCCGTCACAACAAAAGTATTCATCCAAGT
GACTTCAAGGTTCAACTCCACACCTTGAGAATGATTCAAGTGGAATTGAC
GTGTAATCTAGTTAGACTTAATGATATTCATTTGTTCTAAAACAATGATT
TATGCTTGAACAATAAATGTTGATAACTTCACAAGTAGTGAAGCGACATA
GACTCTGAGAGACTCCATACGATATTTCACTAGGTTAGAATCTGGAGATA
GATTAAACCATCCATCATATAATGGAGGTATCCATGGTTTCAATGACATT
ATTTTGGCAAACTAGCTCCGTTATATTCCTTTGCAAAACTAAGGGAGAGT
TATCTTTTTATTTAATGTACCGTGCGCTTGTTCCTACCTCTCTTCTTGTT
CATTAACAGTTATTTGAATGATTTACTTTTTGGTATGTAGCTATATATTG
AATTATTTTTCATTTTAATTCTACTGTCCGGAAATATGAACCATCATTTT
GTCTAATTTTAAAAATTCAGTGACTGTCCGAAAAAAATTTTTATTCATAA
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AATGTAGTAAATAAATTAAATATTAAATCCTTCAACTTTTTATTGAACTA
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ACTCAAAAACTACATCATTAACCGAAGTGAAATTTTACAGGATTATTTAG
AAATTTGTGAGAATTACATAGCAATCTATTTTGATATGCTAGATTAAAGT
ACTAAATAACTGTGGTGATGTAACCATTACATCTCGGACCATTAGAAACG
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TGTATCTTCGTTCCGTATGTTATCTTTATTTATATAATACATGCAAATAT
ATATATATATAAAGAGGGAGAGAGAGAAATGTATACAAAACTAAAATTAT
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CAGATTTAGTGTGTTTACGGTTTATTTTGGCATTTTTATATATGTAAAAA
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GTGTAATTCAAGTCAGTTTTTTTAGAATCGAAAGCTGTCTACTGAGATCT
GAAGGATAAAGCCAGTTATTTTTATATATCGTTCTGCTTTTTATATTTTA
TTTCAAATACCAACTGTCCTTATGTAAAAGAAATGAATAGTTGAATTTTT
TTTTATGTATACTAAACCATTAAAAAACTCCTGNATGATAACATCAGGAA
ATCATCGAGGATTGACGTATGAGGCTACTCAAATATCCTAAAGGAAAATA
AAAGCATTCAGAGATAAGCAGCTGTTAGTGKGATCATAGATATAACTTTA
AATGGGTGACTTAAGAGCTGAGAGTTAAAAATCCAGAAATATTTTGCTTT
AGAGGAGAAAATGTTAAACATATTGATATTTACCAAATACCAATGGAAAA
TTGTTTTACACTGGGTTTTTTTTTGGCCATAAAATTTGATCAAAAATTTT
TCCGGATCTTTCAAGAAATCCAGCCGAAGAACGGAAAAGTAGTATAACGA
ACCGAGAACTGTAAATTAAGCTTATGATGGGGAACAATTTGACAGCAAAA
TTAATTTTTAATCTTTCCAGTTTGAAGATCAGCACAGAGAAAAATTTGGA
TCCTCACCTCTTCTTTTAGAAATGACAAAACCATTGATATAATTCGACAA
AATATAATTTAAAAAAATATTTTTTAGAAATCTCTTAATTAGAGAAAAAC
ACACGTAGTTCAACAGTTCATATTTAAATTGTGAAAAATTGCGCAACGAT
GGTCGAATAAGATTTCCACTTGTTAATTCTTCAAAATATTATTCTATGCC
ATGCCCGTGGTACATTTAGATGGCCCCCCTAAACTTTGATGACGCTGTGA
GTGGACTCTGGGAGCTGCATAGTAAGCTTTTGGGTATCCCTATGGGTTGG
GAAAGAAAAATAGTGTCTTATCTGAGGGGAATAAATGATGATAAAAAGTT
TACTATGCAGTTACAAATCTCCACAGATAGTATTAAATATACTAGGCCCT
GCAAGGACTGTGGAAACCTATATAATTACTTAATATACTTCATATGTTTG
TGGACTGCCCTGCCATCTATATCCTTAAATATTTTGTATCTATAAATCTA
AAAGGGCTGACGAATAGGGAAGAAAAATATGTTAAAGGTCTTGTTCTTTC
TGGAATTTCAAAGAGGAAGGTTGGAACTTCTGAGGTAACAAGGGCTCTGG
ACTTTGCAATTCTTAATTGTAAGGCCCTTATTGCCAACCGACTACATAAC
TATCATCCTATTCGTAAAGATGAGTTGAAATCTATCATCTTGGCAGCCTG
AGCACGCTATGTCTCATTCATAAGTAAAATTCCAAAATCAGAATGTGAGT
CATGGAATTTAGCAGGATAAATTTTTTGGTGAATTTGCATGTTTATTGTT
GTTTTCTCAAAGATTAATTTTGTGAATATTTGTTGAAATTTTACATTGGA
GTATTTAGTATCAACTATAATGATTATTTAAGTACTTTTTACCCAATTAC
TCCGTTTTATTTATATATATATATACATGTTCAATGTAATAAATAAACCA
TATAAAAAATGTTAAAAAAAAATAGATATACCAACAAATACCTGCAACTA
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ACGTAGAACAAAAAACTTTGAACGGACAAAACGTCAAATGTACAAAATGT
AGAACCGAGATAATATAGAACTGACAATTTTTATAAAGAAATTTTTTAAA
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CTCTTATATCACATTTCTAATAGATGGTATTGCAACTTTTTTTACCAAGT
AGATATTTAAACGCATCATACAAAAATATTTTTTCGCTTTTTTGATTTTT
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