EMLSAT00000009185, EMLSAT00000009185-705032 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000009185
Unique NameEMLSAT00000009185-705032
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s582supercontigLSalAtl2s582:50131..73086 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000009185 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000009185EMLSAG00000009185-691951Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000040760EMLSAE00000040760-749688Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040761EMLSAE00000040761-749689Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770644auto770644Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000009185EMLSAP00000009185Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000009185

>EMLSAP00000009185 ID=EMLSAP00000009185|Name=EMLSAP00000009185|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=386bp
MFDSIIDLFFMPVTIAIGVLGNSLSIVVLRNKEIQLRDSFARILIALAVF
DLTLILSSACIFTIPCFSDTYAKLLYPHIVPFFLPAAQIAMTASVYTTVI
TCFDRYIAICRPALLGCCGRSEQKTSWCLICGTAIFSIVYNFTRFFEFRP
ELTIDPSTNLTVFSVEQTALRKDPLYIQWYILIANFVFMGVFPSIIMIVF
NLLVVRAVNXANKKRARMTKRQQRNITVTSMLVSVVVFFLICHSVKFIVT
LYEIWESVISPEENWPPWVQFLTKLSHWLLILNSSSNIAIYVHKDPKFKA
VFKNILFTYFNKIKTCCVSLRILQKKTPSEDNNSMIEFDNNKNIKNDGQH
DLIEPNYVHVEVVQEDKRSCEELCNQSQKEMKSFDV
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mRNA from alignment at LSalAtl2s582:50131..73086+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000009185-705032 ID=EMLSAT00000009185-705032|Name=EMLSAT00000009185|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22956bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s582:50131..73086+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAGTCTGAGGGTGAAGAAGGTGAATCCATGTTCGACTCCATCATTGACTT ATTTTTTATGCCTGTTACAATAGCAATCGGAGTATTGGGGAATAGTTTGT CGATTGTGGTTCTTCGAAATAAGGAAATTCAACTGAGGGATAGTTTTGCA AGAATTCTCATAGCCTTGGCTGTTTTCGATTTAACGTTGATCCTCTCTTC AGCTTGTATTTTTACGATACCGTAAGTATTAAATTTTTAATTATGAATTG AATAAATCAAAAATACTTTTTTTATCATTCAAAGTTGATTAATTTATCTC TTAGACCTCATCAAATAAATACAGAAATAAAATCTAAAAAAATCTTTATT TATATTTACACACAAACACTTCTTAAAAGTAATAAAAACAATCCTTTGTA AAAATATTAAAAACACAGAAACAAAGTTTGAATGGCCACTCGGTAGAGTG CAAACTTCCGTTTATGGTAAATTTTCCTAAATTAAAAAAAAAATCTTCTC TATATTTAAGTCAAATATGTGCAATGTTCAATCAAATTAAATTTAATATA TTTTMCAGCCATAATTTAAAATGAGTTACCCATTGTGTGGCACAAAGTGC AAAAAAATCCATCATTAGTTTTCAACAATATTAATTGTATTCCAAACTTA CATATTCGAATGTCGTTTGAAGATTCCGTATAAAGTTCTCAAAATTGTGC TTTTGACGTTGTATCGAGGTTATATTCAGTTAATAGGATCTATTATATAT ATCAGTGTATAATTTTCAGTTTAAATAATTCTGATTGTCTTATATTGATA TGATTCAAACTCACTATGAGCTATCTTTTACTTTTTTTAAGTAGGCAAAA TATTATTTTATTGTACATAGAAATCAATGCTTGGAGTCTAATAATTAATT TTAAGGCCACAATAAAATTTTTGTATGTTCCCTCAAAACCGAACTGAAGT TAGTATTAAAGGGATTTATTTCAATTCTCTCCCCTAGCGCTATGTTGATC CTTATTAGTTCAGCCTAGTCCATTCTTAGGACTGGTCATTAACACCGATA GCCCTTGAAATTTTCCATTAAAATATTGATGGTTTATTAACCCAAATAAG ATATATATTAAGATTATTTCACATATTTTGAAAACAATATTACATTTTTC ATTATAATACGAACATATTTTATTGTTAATAAGTTAAATAATTTATTCTA TTATATAATGGAATAATTAAAAAAAGTGAAAAACACTGTCATTGACGTCA CAAGGGATTGATTTTACCTTTTTAAGGACCATCAATTAAGACTGGACTGG ATGGGACCACAGTTTCAGGCAGACACAATACTACTTTCCCTTGTCTCATT ACTAACGACTCTCATTATTTTATTTGACACCTTGCATTCTTAAAATATGT GCAGGATTGTTTTTCTTTGGTTACATTCTGCACAAATAGAAAATAAGCCT TCCAAGTGTTTACCTGTTAATAAAACCCCAGAATCTATTGTATATTTTAG ATTCATCTAGCTAAGACATACAATTACGATCCCAAATGGACTACAGCTAA TAAAAAACATTGTCTTTCTTCTTTGCTGTTTCCACAGACTGATCCTTAAA ATCTTTAATAGCTGCTCATTTATCGACATAAGAATGTTTTATTGATATAT TTGGTTGACTTTTGGTTCAAATGAGTACTATTGAAGGGAATTTGTGAATA TTTTTAATACTAGTAGAGTTTATTCAAGTTTCAAGGACGTCACTCACCGT ATTTAAAACATGTTTCCCTTGTATTTTTCATTGACCAACTTAAAACTATT TTCTCTGCCTTTTTATTAGTGGAATAGTTATAAAACTAACAATATATATT TTGTACACGACTCAGATGGAGTTTTTTCCAGTGGTGAGATAGTGTCACCA ATAAGATTATTTTACCTTTGCCTCTGCATTCACAGATTCCCCAACACATA TAACGTGAAAAAAAGCTACATGTACACAAAAGTGCAGTCTCGTATTCATT GAAGATAGTGAAAGGTTGAATTCAGGTACCTACATTACTATTTGAGAAAG ACAGTCTTCCCCTGGGCCAGGAGGACCTACAGAGAGGACTGATTGCTACG ACAGGAAGGTGCCAGCTATCACACTTCCAAACTCACACTAGAAATGTAGG TACATGCATCTTTCCAAAGTATTCCCGGCCTCCCGACTTACCTAATGCTG CCCCAGCGGACTACACTTTTATTGGACATTGAAGGGTAGTCCCAGTATTT ATTGATTTTTATATCCAAATATGTTTTTTTTTAGTATATGACTGGTCAGT TCTCGTATTATGAATATGTTTATATAGAGTTTATGTAAAACCATACACCA GAAAGTTTTTTTTAATACACAACAGATTGGGAAGATTAAAAAAATCTTCT TGTAGCTTACAAAAACAAATCTCACAAATCTAAAAATGCTTCAAATTTAC ATACTTAGTTAGGAGTTGTTACTTAACACAAAAAATAATAATTATATATT TTGTAGAAAATGGTTCCACAAGTTATATTATATAATATTAACAAATTAAT TTTGAAAAAATTCTATTTTTACATTCCCAAAATAATTATATGTGATTCAA TTTTAAAAAAATAAATGAAATCTTGAAATTAATTAGTTTTCCTAAAAAAT ATTAAAATTTCTGAATAATATTAAATGGGTTCATTTTAATATTTGGTTTC TTATTTTTTTTTAATTAAAGGAAGATAACACGTTCATGTTTGATAATATA GTTTACTAGCAGGGCACTGAGTAAATGGGAATAAAAATAAAGAATTTTGG TGGAAGTAAAGAAACAGTGTTACCTGGCTAAAAAAATACCCTTTGTTCTT TGTTTTCAGCTGTCAATTCCTTCCTCTTACTTAATACGTTATGGTTCTTT CATAATCTATTATTTTTGATAAATAAACAAATAAATATACTACATAGGAT AATGTTCCGTTTCAAAAAGGAAAGGAGTACAATTTCTTGTTGACCTCTTG TCGTTCATAATATAAATATGGACCATTTTATTATTTAAAGGAAGAAANTA TTGGCTATTAAAAAGAATACAAATTTATAGCTACACTTATATTATAACAT TTTTTTCTGTTTCTTTCTGAGGAAAGGTTGTGTGATACTATAAAGTAACG AATTGGGAGAGAAGGATGTAAATTGAACAATCATAGTAACATGTAGATGG TTAATAGCTGACATCATTTAGGGGGGAGGGGACTTAGCCCCAAAAGTTAT CAAAATTGCTATACAATTACTTATATTAATATGTTTAATTTTTATTTAGA TACTAGCAGAAGCTGCCCGCGTTGCTGGGCTGAATAGAGGGGAATAGAAA CAAAAAATGAAGGTAGAAGGAACGAGACAGAGAGAGGGATGTAAAATGAA AAAAAAGTGAAGAACAGAGTGAAGGAGAGAGATATAAAAAGAGAAGCGGA AAAATAGGTTTTAATTCGGTCAAAAATAGCCTCGTAATGGTCTTGGAGGA TCAAAAAAATATCCTAGTATCATTGTTTGATTATACTTTTACTTGTTTCA GACTCATCTCTTCGACTATACTTAATTCTATGAATGCTAACACCTCAAAC TGACCGATTCATATATATAAGATAACTTGATACTAAATTAAAAACAAGTG ATATTTGAATTAAATTAAAGTGTTTTTTTTTTACTGCTAAAAGGAATATA TTTATTGTGGATCATTAATGTGCTTATTCAGCAGAAAAATTTGAAATAAC AAAATACAAAGAATAATAAGTTTTTGGGTAAAGAAAGAAACAAAACTTGC 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AGGCTTTGTCTTTTTCTTTTATTACTTACGAACCATATGCAGATATCATT AAAAGTATTTCACAACTTTTTTTACATAGGTAAAATATTTTTACAAAATA TTTACATTATTTTCTTTTAAAATAACTTCGTTTGATTTTTAACAAAATAG GTAACTATATATTTTTTTTATTTTTTCAACTCACAGCGTTCATTATCCAT CTTTTTTTAAAGTTATAAATGAAATATTGACAAATCTTTTCTGTAAAAAA AGTCTTAGATAACCTATAAGTTGATATTATCTAGAGGTACACACTTTAAT ATTTTACGTGAGGTTTTGTGAGGACATTTATTTAACAAATCATCTGAAAA TAAGGCACACCACAACTTTTTTAGATTGAACGATTGTTTGAATGCGTTGC CTAAATCCTGTGCGAACATTCACGACATAGTAAGGCTCGATCTTGGTTCA CCCTTTCTTTTTGATAGCCTCGAGAGGCTGGAAGCTCCTGTGAGGAGKAT CMCAGCCCCTTTCCTCCATACCCGCCTAGATAGAGTAGACCAAGGCTTTT GTGTCTAGAGGAGACAAATGTCATATTTTGAGGTAACCAAAAGTTTCAAA AGTTGTCTCTATCAAAGGTAATGATCTAGCTCTTTCTTGAGTGAAAACAA AATGGTCCACCAACTTTTCTTTAGCCGGAAATAGCMCCTTCTTANCCAGA AGTTCGATGTAACCATATGCATTCAGCCGCTCCTTCCTCTCTACAAAATG GGATATGTATTTCTAATAATGTAAAAAATAATTAAAAACATATAATTAAT TACATATACTTAAGGTTGGAAGATAGGAAAAGAAGGCATAATTTTCGAAA AATAACTATTTTTACTTAGTTATTAGTGATTTACTGCTAAGATACATATT TTAAGCTAAACATTACACAAAAAAGTTGGCAATGCAGCAGTTTAAGGAAT 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GGGTTGTGGTTTCCATGAAAAGAAAAAAAAATCGGGACGAATAGATTTGG TATAGAACTGTTACGCAGAGGTGCATGAATTGATGTTACCCCCTCCCCCG ACTAAAACCTTATTCAACTTTTTCGAGCAACAACGCTTTTATATGTAATT TGTCATAAGTTCGAGAAATATCTTGTCAAATACTGTCAAAGTTCCAACTA GTAACAATATTGCACTTGTCCAAGATATTATTTAAAAAAAATTATAAATA TTGTTCAATTTGTTGCAATTAGTCTGCAGAACGTCTTGAGGTACTTTTTC CAACTTGGTCTCTGCAGGTGCTCAGAGGGAGTCCTTCCTCAGGACAGAAA CTACATATCCCTCCCCCTTGACAATACTCTACGTTATAAATAGAAGTGTG ATAAGATAAGGTGAAGAGGTAGGCAAAAATATCATCCCAAAGTTGTTCAA AGTGATCTTTGAGCTATTTTTATACTTGAGTTGCAATGTGAAATGGGGCT CATCCTACCAAATCTCTGCACACACTATTATTTTTTTTTTTGTTTTAAGG ATAAGGGAATACATAGATAGACTAACACAAAAGCCACATCAGGTAAAGCT TTGATAAATATATTATTCAGAATAACTTAATTTATAGGTTCACTATGATT TAACAAACAAGTAAAATTAAATATTAACATAGTTGTAAAAGTTATTGAGG TATTTTATCCCATGCGAGTAATTTAGTTATTTAGATTTAGTTATATCAAT TTTCAGTTTAAAAAAATTAGTTGGATTGTATTCAATCCAAAATACGATTT AGTATTAATTGCTTCAATACTCACAGATCCAAAAGGTAATTAGTTTCAAA AGTAATCAACATTGCATTTAAAGAAAGGATGATCAAAATACGAAATCGTG CATTGCACATAGAAGAAACTTTGACCACTTCCAGATCCTAAACAAACGCA 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