EMLSAT00000009220, EMLSAT00000009220-705067 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000009220
Unique NameEMLSAT00000009220-705067
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s587supercontigLSalAtl2s587:248884..261122 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000009220 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000009220EMLSAG00000009220-691986Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000040915EMLSAE00000040915-749843Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040916EMLSAE00000040916-749844Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040917EMLSAE00000040917-749845Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040918EMLSAE00000040918-749846Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040919EMLSAE00000040919-749847Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040920EMLSAE00000040920-749848Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040921EMLSAE00000040921-749849Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040922EMLSAE00000040922-749850Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775261auto775261Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000009220EMLSAP00000009220Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000009220

>EMLSAP00000009220 ID=EMLSAP00000009220|Name=EMLSAP00000009220|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=342bp
SSVLNEQTFKNIRPFEKSLANTSGTYYHLNDVYEYEEETVEFKGHRNFQV
MELNLPSCKGPMTSQGLSEKEKNGIIQLHNDLRKKISNGTIEGLPRAKFM
NTMYWNSSLEDESFPYGQNMAWGQDSIKEAAVQWFDEYKPYIEAGVDPLI
YRDSTDEEVQDNKLGMIGHFTAMTNAKSFAIGCYKVVAXIEXIDFQTIYC
CNYSPPGNVIKIEENGEMKNIPAYEVVELDNLLSTESNDTDSDPGKTLKE
NYLSKKNHTKENYSTRAKEDDRKINETGGLVSLLKDKEIKSFRDKRVVVV
LVNPPIETDTVEVSDLKDIEDNLIESFKSHTQRNKFHFSMSL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s587:248884..261122-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000009220-705067 ID=EMLSAT00000009220-705067|Name=EMLSAT00000009220|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12239bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s587:248884..261122- (Lepeophtheirus salmonis)
AGTTCAGTTCTAAACGAACAAACATTCAAAAATATTCGTCCTTTTGAAAA AAGCCTTGCAAACACGAGTGGAACATATTATCACCTCAACGATGTTTACG AATATGAAGAAGAAACAGTGGAGTTTAAGTAACTATTAAATATTATTCAT TTCATACAAATATATATTTTATTAATTTTCCATTTTGTATTCTCATAGAG GACACCGAAACTTTCAAGTCATGGAGTTAAATCTGCCTTCTTGCAAGGGC CCTATGACTTCTCAAGGGCTCTCTGAAAAGGAAAAAAATGGTATTGTAAA AGAGAAATGATTTGCAAAAAAAATCAAAAAAAAATCTGATCCATATGAAT TATATCCATCGCTAGGGATAATCCAGCTGCATAATGATCTTCGAAAGAAG ATATCTAATGGGACTATAGAGGGTCTTCCTCGAGCCAAGTTTATGAATAC AATGTATTGGAACTCGAGTTTAGAGGATGAATGTAAGAAATGGCTAAATC GATGTCCAGATGGATTTAATGTATGTATACCTATATATCTCCTAATCAGG ATACAACAACATAGCTCCCTTCTTTCAAAAGAAAATAAAACAAGTGTAAT AAATTAGATTTTTTATATTATTGTTTTATAATACCAGTACACATTTAAAG TTTTAAAAATCATATAAGATAGTTGACGTCTCCTATTGTCCATACTAATG ATGGGACAATTAATTGGAATCGGAGAATCAGATTTTTTATTTTCTGGAAT CAGTATCGGGAATATAATCTTTAATTTAGGATTCTTATTTATAACTGGTA TTTCACTATTTATTWCTTTTCTAAGTTATTAAAAAAAAAACCCTGCTTCG TCACCTCCACCCCCCCCCCCCCCCAGAATTAACGATAACGGATTTTTGCT TTTTCTTTAAAAATGTAATATTTGAAATTTAATTTAATTTTTTAAATTTT TTTTGAAAAAATTCCATTTTTTGTGAAGTGGATTTTTGAAAAATTTTTAA TTATAAAATTGTATATTTCATATTTGTCTTAAAAATTTGATATTTCATAT ATTTTTTCATAGAAATTTTAATTTTAGGATTTTCTTTAAATAAAATTCCA AAAAAAACAAGCCCTCCCTCCCCTAAAATTAAATCTCGTGAACGCACTGA TAGAAAAATACTTTTTATATATTATTTATAAATATTAAAAAAATTGGCAT TTTTACTAGAATCGCATCGTAATCGGCATTGGGATTTTTTTTTTAATCTT CCCATTACTAGTCCATAGACTTAGTAAACCGAATTACCGGTATTTTAATG CCATGGTGTCTTTCTTTAAATATATTTTCATTACGAGTTTTTAGAGGGAA TATCATTTTTTACAAAAATATGCACATATTAATAAACAACATATTTAGTT ATTATAATTGTGGATAATAAGTTGATTAAATAATGAGTTATTGGGGTCTT TGCAAAAGTCTTCAAAGTGTTGGTTTTTCAAGAATACACCTAGTTCCAAT TACTTGATATGACTAAACCACAACAATTTAGATTTCTTGCTTGCCATTAA ATCTGATGACTTCAATTTTAGCTCCTTACATCATTTTATGGGGAGATATT TGTGTTTAAATAATTTCTTAAATTTCAAATCTTTTTTAGTATATTAGAAA TTGAAGCAATTAATTGATTTTCATAAATTGCACTATTAATAACTCAAAAG ACCAATTAGGATAAGTTTAAATTTGTATAAAATATTTGCTGAAACCACTT TTGTGCATTATTTATTTTCTACGGCAAACCGTTTCTCATTACCTCAACGC ATCTTGGCAACTGACAGGACGTATTTCCAAAAAACTTATAAAATCTCTCC TCTAGAATAAAATCCCCTACCACCCCACCACTACTTCTACAATCTGATTG CCACTCATTGTAAAAAATGAAGTTATGTTGTCACCCCTGTTGTTGGGTTA ATAAATTATGAAAATATTGCTATTTTTAGCACGCACATCCTCCAAGTAGT TGGCAAGCGTTTCCATATGGACAAAACATGGCCTGGGGACAGGACTCAAT TAAAGAAGCTGCTGTTCAGTGGTTTGATGAGTATAAAGTATTTTTACATT CTTTTTATGCATTTATATATCTATATAAACAACTAATTTGCTCCATAATA GCCCTATATCGAAGCAGGAGTAGATCCCCTCATTTACAGAGACAGTACCG ATGAGGAAGTACAAGATAACAAATTGGGAATGATTGGGCACTTTACAGCC ATGACGAATGCCAAGTAAAATAATTAGTTGTTTTGACACATATCTATATA AAAACCACCTTACTATTAATCACAGATCCTTTGCAATAGGCTGTTATAAA GTCGTGGCTGRTATAGAGGKGATTGATTTTCAAACGATTTACTGCTGTAA TTACAGTCCTCCAGGAAATGTAATAAAAATCGAAGAAAATGGAGAAATGA AAAATATYCCTGCCTATGAAGTGGTCGAATTGGATAACTTACTTTCAACT GAGTCCAATGATACGGATTCGGATCCAGGAAAGACTTTAAAGGAAAATTA TTTATCAAAAAAAAATCACACAAAGGAGAATTATTCCACGAGGTTGTAAA TAGTTACTTATAAATGTTGCGTTAAAATTGTTCTGTATATAAATAATGTA ATATTATTTGCATATTAGTTTTAAGTATGGATTTAAAGGAAATATATTTA AAACAATATTTATTTAATAGGTCTACAATGTTAACAACTCAATCAACTAC AAAAAAAAAGTAAGTAAAAAGAACAAATATTTTCTAATTTCAAATCCAAT TATCATCCATTAAAAAATTAATTTATTTATTACGTTGGTAAAGATGTCCA AATATATATGTTGGCAATATCAGCCATTTTGAATTGTTGTTTTGTTTTTG ACAGATAAAAATGTTAAGTGTCTTTTGGTGTCATAGATCCAATCAAAAAA TAATTTAGGGTACAATTGACAGATTGTGTTAAAAAAAATTGTTTTGTAAA AAATAATTATTTCACAAGAATATATGATATTTCAAAACTTTTGATATAAT TTAATTCCCAWAAGGTCAATTCTCTCCATTTTTTATTTTTTCAATACTTA AAAAAAAAAAAAATTCAGAAAAATAATTATTTCACAAGAATATATGATAT TTCAAAACTTTTGATATAATTTAATTCCAAAAAGGTCAANNNCAGAAAAC CTCAGAGTATAATAACAAAAGACATTTCACTTAATAATCTGTCAAAAGTA TGCAGTAACATGCAAAGCAGCTGATATTGTTAAACCTCCATTAGCGATTA TTCTTTTATTAACACAACTACTGAACTAGATTAAAAGGTTACACGAAAAG ATAGACAGATTTTTTTACATCTATACACAGTCCAAATAGACTCAAAGTTA CACTATTTAAGTATTATTACTTTTTTTTAAATTATCAAATCAATTCTGTA CTCGTAACATTAATCAAAATGTTAAAAATACTTTATTGTACATTGCTAGA AATATTACTTTTATTAAAAAAATTAATATTTATTGTATTTGTTTGGAGTT TTATCAATATAAAATTTGTTATTATCATAGTTAAAAAGTTATATTTTCAT TTGTTATGCAAATTTTTTAGAAATTTTCATTATTTTTAAGGAATTTTGAG TACAAAATAAGTATTTATCAATTTTTACAAGGTTACATGGGATACATTAA TTAACAAGTTATGTACAGGGTGACCAATAAGTCTTGGAACAGCTCCTACA ACTTAATATTTCTCCTAAACAGGTGTATATTTTTTAATTATGTTTCTTCT ATATGGTTTATGCTATCTCCGTCTTTGTTTGTTGTTTATAAAACTTTTTT CTGAAATATGTTCTTGCCCCTCTAACGACGACATCATGATCCTGACGCAC GCCATAGTTTCGCTTTATTTGGTTGTAATGTGGTACAAGGAGACTAGGAG TGTCGATGAAAGGCCCAGGAGGGGTTGACACATGTCTATGAGGACACACT ATGTTAAATATATAAAAGCGAAAAAAGACAGAGTGCTGGGTCGGAGCAAT GTGTTCAAGTACCAAAATTCGGCTTCAGTAATGGTCGGGGTGGTCATCAC CTCCTGCTGGACGCCCTGTATCTTCTTTTTTGAGGCTGTGAAAGTCAATC AAGGTGTTTATCTTGATATGTAACAATCCCTTAAGTACTTCTCTGGATCC AGGAACATCACTGGGAAGGGTCTTACTGCTTTAAGAAGGACAGAGTATCT ACATACTTCAGTCTGTGCAAGAGTGGTGCCAGACTACTTTCGAGCAAATT CGGACCCAGGACATGTGGCCCCCTTCTTCCCCAGATACCAACGTAATAAA CTTCTCCATATAACCTATCCTGGAGAGGGAGGTTAGTATGACTTCCTTCT TCTGCAGCGTTGAGGGGKTGAAGGGCGCCAAATTGTTTGCGTGGGACTAC TATACCGAGGAGACAGTCCGTACAGTGTATAAAACAATTTTGAAGCGTCT GAGAGCTTTAGTAACTGCAAATGGTGGCCATTTGGATACAACTAGCATTC ATTTTGAAGGCATTTTCACGTTAATTGCAATTGGGGTAAAAAGATGTTTC AAGAAATACCTATTTGTGTATCCTCTTACCTGTTTAATTTCTCCTAAGAG TTATGGGTTMCCCTGTATATTTGAAGCCATTATTACAATTGATTATTTTG TTACTAGCTAGACGTTTCAAGAATATACTAAAAAGTGTTGCGTTGTTATA AAATGTAATTTAAAAGAAATTAAAGATAATTTTATAAAATATGGGGTATA GAAAGTCCTAGTTCACCAACCAAGAGTTAACATACATCCTAAACACGTAT AATAACAAAATAAATAAATGAACTTGATAATAGAATGAAAATTGAATTCG AAATGAGAAAATAACGGTTTCTTTTTTAGCAAAATGGCATATTCTGAATT AATAAGATTTATCAAGGAAAACTCAACAAACCCCTACCACAAGCACTGGA ACGACAGTCTCCACCAGGAAAAATAATACTCAAAAACAAAAAATTAAACC AAATAAATCAAAAAAGTAAAAACTTTTTTTACCATTTCTAAATGCAATGC TAAAACCGTTTTTCCAGGAAAAGAAGTAAATCCAAGGCGAAAAGGAAGTC TAAAAGCAGGAAAAAAGGGTATGAAATTATTATTATAGTGAATAAAGCGT TTTTATGTGACGTCAGCATTATTCATATCCGCCATGTTGAGGGTCCTTAT AACAATGTTTAACAATAATAATAATAAAAACTCGTTTTTCATTGATTTTA AGGAACATAGTCTACTATTGGAATACTAAAATAGGACTAATAAAATAAAG GACTCAAACCTTGATGTCCATCAAAAAAATATACCTGTATTGGCTAGTTT TATTATATATTGGAACCTAAAAAGTATCAAAAATATGGTATTACATCGGT ATACAATGTTATTTACATCTTGTAGATACAAATAATTATTATAATTGAAA GAATAAGATATTTGTCTTTAATTATCATACTTAAAAATGTACACATTTAG GGATTTTGTGTTCATATTACATTGATTTTTTTTGCAAAAATCACTGGTAT CAAGTAGCAATAAATGCAAATGTCAAGTTTTTATTTATTTATAAAGTTTT TTGATGAAGTTTCATCAATATTTATTAAAAATTTGTCTAGTTGAGCTAGT AAAAATATCAACTGTGAGCCCCCAAATGGCGTCACCTTCAATTATGATAT AATTTATGACGGCTATTAAAACGATTTATATCAATTTAAAGAACAGTTTC AGAGACATCACTAATGGTATCAAAATTACAGACGACCCCTTCTTTGGGAC TCATATTTAATATTTTTATAAATATTGAATGGACCAATTACAAAAAAAAA AAACTATGTAGAAATTTTATGAAATGGCTTTAATATGTTAAAATAGATGG ATACTTGTATTCAATACAATGGCAGTTGAATTAAAGTAGGGKAATGTGTA CTAAAAAGTCGTATTAAAATGTCAAGATTTAATAATAATTTATATGTGGG ATCGACTATGGACGATAAAAATAGAAAATAATTATGGAAAAATATCTTAT TCCTTCCAAATTAATAGTTAATTTATTAAGTGGGAGCCGCATGAAAGGAC AAAATTTCAAATTCATTTTACTGGCTGKATTAATTCTATTTCTCTTATTC GGAACGCTGAATTTAATCAAAAACTATATMCTCTAGAAGCCTAATCTAGT TACTCTTTTTCCCCGATACTTTTTATATAAAGTTTAAGTATATTACAGTT TAATATGMCCCCCATTAGCCTTAATTACCTGCGCCTGAAGGCAATGCATG ACCACCTGACGAACTCCTTATCCATATTGTCCCAAATCTCATAGATAGAG GCTTTAAGGCCCTTTGTCTTGGGGTGTCGTTTTGCACAGGGCTTGCTTCC CACTTGCACCCAAAAGGCGTAGTGTAACGGGTTCACATATCGTGACTATG GTGGGCACATGATCTTTTCCTAAAAATCCATGTTCTTCTGGAGAAAGAAT TGGGCCACTTTGGGAGTATGTGTGTGTCCTAGGGGACAACCAAATTTCTG TTGGGAAAGCTGGCTTGGACCCATTGCATTAGCTAGAACCTCAACTGGAT GGKGTAGKAGGAAGCTGTGAGCCTGTACTCGACCAGGAACCAAATAAAGG GCATTTTAAAACCATTTGATGCAACAAATCCCACACTCACGAGCTCGAGT AATTTGTGGTGAAGATGATGTCAACATCGTCAAAGGGGTTTTTTTTTTTG TGTCGTTGTACATGGTCTTAGAATACACACCTGTTTGCTTGACTATATCC TCTTTTTTGATTCCGGCATGGAGGAATGCGGCGACAACTAACCGATTCAC ATACTCCATAGTTTTGAAAAAACAAATTAAATAATGGAAAATCAACACAA CTTCGATGTATTATTAAGTTTTTGCAGGAGAAACATGCAGTAAGAAATGG TCAAACAAAGGGATATATTTCAAGCATATACAAACTTATTATGTTTTACA GTTGGTAAAAACAGATGCTGTGTTCTAACTGTCTCGTCTAAATAAAGAGT ACATTTATATTTAGGCTATGCAGTGTCATTTAGATATTATTTTAAACTGA GATGCCTGGCGATTTTATACATAGTTTAGAAGATCCCTTGACCCAAAAAA GTTTAAGAATCGTCGCTCTACAATATGAATACAATATTAGATTTTATAAC GATGTAATAACATATTTTTAATACATATTAGTGTTTTATATATAGGTAAT AAAGCTAAACGTTAGGGAAATATATATTTGATAGACAGAGAAGGTTTAAG GCATTTTAACCGTCAGTCTCATTTTGACATCCAAGTACGAAGCAGAAGTT TACTATTTTCCTTCATTATGAGGAAAAAAGAGTTTTTATTACTATAAACT TGGTTGTTTAGTCCCCTTAATTGCCCATATCAACAATGCTGGCATCACAT AAAAACGTACACGCAAATACATATTTGTATGTTGAATGTTGCTTACAAAT CCCTTAGGAGGAAGTCCAAAGGTATGGCCAAAAAGTCACAAATAGGTAAG ATAATAACTTTCTACATACACTAAAATCCGTTCAAAAGCTAATTTTCTTA CTATATGTACGTTACCATTAGGGCTCTATAAAATTTGACCTGCGAGACTC TAAAAATACAAGAGACCAAAAATAAATGAGGGAAAATATTAAATGTGAAA AATGTTAGGAAGAAAATCAGCTTAGTTGTTATTACATTTATATTAGATCA GCTGCAATCATCTCTGATATGAAGGAAATAAACTCAATTCCCACTCCTTT TGTAGTAAATACATTTAGAATGGAATTATGTTGCATACAATATCCTTGAT CATTTAGTGTTCTTTGAATATTTAATCTTGTAGATCTTCTTCCTGAGGAT ACACGAAATTAAGACCATTGCTATTATCAGCTGCCTGTTATATGATTTTG GGGGAGAAAATGAATTACTGCAATAGAGAAAAGAGATTTTAAAATAACAT TAGTGCAATGAAAATATCATAATTATATTTAAAAAACATATACATATATT TCTTTTATTATGTGTTAGGAAAATAATTTACACCAAGGTTAGGCAAGAGT TCTTCTTTTAGAGGGAGATGTTAACACACACACGAATGATTAAATAATGA ACAAAAAAGACGAAAGAGCACACGGATTAACCGGGTTTTTTCTTTTCTAA TCGTTATACTTTGACTACAGTGAATAATTATCGCAAAATTTTTACCCAAT ACCATATTTATCATATCAAAATCCCTTTAAATCCCCCCCCCCGTCTCMCT CTCMGCTGTTGTGGGGCAGAAAAAGAGAGAACAATGTTTCGCTGTCGTAT TGAAGAAAATAGAAGCGTGGTGAATAGTAAGTCAAAAAACTATCACTAAT AAGTCCCTAACAATCCTTCCTTGTTACTTGACGTTATTCATGAGCACTCG TAGTTGTAATTACTTTATATTATAGTTAGATGTTCTCTCTTCCAGAATTA 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