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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s5 | supercontig | LSalAtl2s5:1166280..1223183 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009386 >EMLSAP00000009386 ID=EMLSAP00000009386|Name=EMLSAP00000009386|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=941bp
MDLEEEEVVPFSNEVKLINELEAEEEDDEDPGILDLSGHDLEKLSRAHKE CALTTTTLLLDNNALQRLDNIHTYQCLEKLSVQNNRLARIFQVGKLCHLK ILNLANNSIVAMEGFKELKLLSWLSLASNKIKTIESLTQNVHLEHLDLSG NNIPHISDLSYLRNLKTLLLHENRIGTLRLCDRHLPSGLSTLTLNDNQLM DLTDASNLSNLSDLVQLTLANNPCIFQPEDLSKQFDYRPFVINWCLNVQV LDGIPVGAKESILSDMYIRNHSPRSNTLPRSSTLKSPRTNLFANKLPRRN SDASRTGGLCSSSSVENFKRTGSISSLSRSNVRSNPRSSPSPMRKSVGGH STSQMNLCSYPVVLPRKLYDNNQNLNIXTQSLRFPSNNLNYHSMIGNIEK NNDLMTTSLDPSLLENIICNDTMGNSYTKNMNDSLNRHQNSNQRISDAWM KQRNGDNNGYIHRPDILFNNSEVDQTQSLIYPRLQSKLNTLPESLNSPDV PVPMNFSGKDDPLLSYVTETRVSPLSSCSLPVADSKPFESLPIKIDKSTY SDEGSHHRDLEGKKKNNISQKKANSVQSNPKREINKSRGQEPANAKTTKR KVIPRSQSSRHISSEPLLSKSSLSESLYSKNVRNTNRSSSARSTNVTRTD NGTKGGGRSMSRSSSVSTRQSKSTETEKKERKVEQLQGSLRGIVKFMSTF TNVNLDHTRPSSSVSQPDGSFASYPNLENSFENNAQLRSIFNSLEDPTFK STLKTMPLNSSFNNPPSTSSLASSTCLSQSGDCLSHDENQSSFSHKNKAL GPNKGNNNKIRTSSTCVRPTSLVIKNVKEPSMKKLMYTNSKSYSESSSQA PSSVKEFAEDLVDDVLTGTMISLPCSMKSVQSDVTDISLSLQDDTLDSST EKGPNGSKCTSNFNDTPTPTDRVNSLNSDEHSSQIDTDSLE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s5:1166280..1223183+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009386-705233 ID=EMLSAT00000009386-705233|Name=EMLSAT00000009386|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=56904bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s5:1166280..1223183+ (Lepeophtheirus salmonis) TAAAAGTTGAATAACAGAGATGTGGGAGTGACCTTATCCATTATTATTAT
TATTGTTATAAAGACAACTTTGGCTTATTAAAAATGATGATGAAAAAACT
AGTGAATTTCTGGTGTGGCTCAAAGTTAAATTAGCTCATTTTTGAATGTG
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CCCTTGGAGTCATTGGGAGTAACGGTAGTGTTATGCCCATTTTCTTTGAC
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AAAAAGAATCGGCCCCTCTCACAAGGCCTGCAAGACTAAAAAATTGTTGA
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CCGAATATGAATACCATGGCTTACTTCCTTTTGGGGGGAGTTAGAAGGGA
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AAAAAAGAAGAAATTGGAAATAAGATTTTTTTTATTGTATTGTTAGTTGT
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AAATTATAAGCCTCAGAAGTAAATTCGTGGTTTTTTTAATTAAAGACAAT
TAACAGTGTTTATTGTACTTTGATAAAACAAAATAAAGTAGTTTAAGCTT
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ATTATCTCTGTTTGATCTATTAACTTTTAAAGAAAATACACTTCTATTAA
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GACCTGGACCATATTTTTTTCCTTAAATATCTCAAACATAATATTTTCTG
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CGGTTTTGGTTGAGAAATAATTCTAATAATACCCATTAACGAAAATTAAT
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TTGCTCAATTAAAAACCATTAAACCTGATTTTTTTAATAAATTTATATAT
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ATATTGGTGAGGTTGCATGCTTACCTCAATCTGAATCATTGGAAAAAATA
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GCTGTAAGTATAACAAAGTACTCGATTTACAAATCAAAAAATCATTCAAA
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TGTAAGTACACAAAAGGGTCAACCTACTATTGAATGCTCCAGGCTTTTTG
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TCTGTAGTGTTGGATCGTTTGTTTAATCGGAAAGGGTATTTTTCCCATTC
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TGCCAAATCAACTTTAATTCGAAGATACGGTTGATCATTTGGTGAGGCAT
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GCTCTAATTCTTTGCAAAAATATGCAATTTGCAATGACAGGATTCCGCAA
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TTTACATTTAAATATGTATTAAATTTTATATACAATCCTTCCATCCTGAG
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ATGTAAACCTAAATAATTAAAATGCCATTCACAAAAGAGTGTTTGCTTCT
AAAAGATTGATATTCAGTAGCAATATTGATTTGAATAAATTTTTTTTTTT
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ATTACATTAACTTATTCTTGATTATTTTCTTAATAAAAGTGAAAACAAAT
CAATATTGCAGCTGAACTAGACATTCAGGAAGTAAGTACTCTTTTGTACA
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TGAGGTACTGCAGTACTGACGTATATAAAAAGGAATTATACTAAATAATC
ATTGGAATATATACAAACTGAAACATTACTAGATAAAATATTAGGCCGCC
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ATTTTAACAGATATCTTATACCAGAAAAAAAAATCCACGTGGTTTCAGGT
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GGTGAATGTGTCAAATATATTAATATGAATGCATATCAACATAGATAACA
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GATGTTTTGTACAGAACACCCCCTTGACCTCCTCTAGTGATCCCCCGAGC
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GGCATGGGGTCCTTGTCTAAGAGGACAACTCCAAGTCCTCCTCCACAACC
CTCCTTATTGTCCCCTTGTCCACGTCAAACTCATTAGAGAGGCGATTCTT
GGATTTTGTGGGGTCCTCCTTGATCTTCTTCTTGAAGTCCCACAGAACCT
CAGAATCCCTTTTCAAATTTTGTCCCCCACTTCTTTCTTTCCTTGAGAGG
TCTTTTCCATCCTTTTTCATCTTGGCCACCTTGAAAATGAGCACTTCACA
AAGTCCATAATCTCTGCCACCTCAACATTGGCATCTAGAAGGTCTGAGAT
CCCCTACCTTTTCGCTTCTTGCTCACTCATGATGAAAGATTTGGGAAATG
TTTATTATTGTTTAGTTATCCAGAAAGGACAGAAAATTCGGAATATGCAG
GAAAAAATCAAAAAACCTATCTATTTTAATTACATAATTAGCATTTATTA
ACAATCCACGTTTTGCTTCCGAATCCTGTATATCTTTCTAATTTCTGGTA
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ATCATCAAGAAAAATGCATGAAGGGAAAGGCAGTCAAATATCAAAAAGAA
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TATGATTCAAATCTTTTTCCTATACATATAGATAGAAGGAAATCAGATTT
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GAACAGTTACAACAGTACCCTATTTTCATCAAAAAACATCAAAAAAGCTA
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TGTATAATTTTTGTCTTGAGTAAGGAAAAATTATTGATTTGGAAGGAAAA
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AAAATTAATCTTTAAATTTTTCAAAAAAAAAAATACAAAGTATCCAAGCT
TGCCTCCAAAATATAATCCTACGGACGCCTCTGAGTGCTGCAATTTTCCT
TGCATTGTAAATTCATTTTAATATATTATTTTATATCATTACACTTCATA
TCAGGCATGTTTTTAAGCGAGAGCAACACCCCCAAGAGCTAATTGAGAGT
TAAATTATGGGTTCTATTATACTGGTCAGTGATCTATAATTTGAGTTGAA
TATTTTGTAGTGAAATAAAGAGCACAAAAAGAAGGAGAGGGTGAAACAAT
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TGATATCGTGGGAGAAAATGAATTACTGCTATAAAGAGGATAAATCTTCT
ACAGTTAAAATAGCATAACAAAAAAGAAAATATCGTAATTATATTTCAAT
TTCAATATATTTATGTTATTATGCATTTTTAAAACAATTTAGAGGAAAGA
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GTGAATAATAATATTACTTTAAAATTTCCTTGCAAATTTTTAAATTCAAT
CCAATCTTCTAAGAAATTGATCTAGAAAATTGGTAAGGAGGGTGGGGATA
AATAGATTAACGCCTCTTAAAATATGGTTGAATMCCCTCCGCCATCGGAT
TGGCTCAGCGGTAGTTAGAGAGGTTTCTTGGATTTAGGTGATGCTATGGC
AGTGGTTTTTAAGAATTTAGGAGTACCCCCAATTATCCCGTGCAACCTGA
GGTGTTGGAACTATTTTTGATATTGGAAGGGGTTCCTTGGATGTATGTGA
ATCTTTGGCGGTAGTTTTTAACTATCTCACACTAACCCCGTGATCCTGGC
CAACCCCAGGGCTTTGAACTAGTTTGTGGTTATTAGAGGGGTTCCTTGGA
TATATTGGGCACTGGCAATTTTCCTCCATGGCAATTTTCTCCAGGGTAAT
CGTCTACGGGCAGTTTTCTGCGTACGTGTAAAAATCCTCTATAGTGGACA
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TTACTATTTTTTTTTTTGTATCTCTCGAAAAAGTTCTTTATTTTGTGTTG
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ATTTATAACAATACAAAAACAATAAAAGTATCTAAGGACATAGAAAAATA
TAAAGATCATATAAATTTTCAAAGACCAATGAAACGACACAAAAAATAAA
GAAATAAAATAAGTAAAAACCCTAGTTCATTAAAAATTTAAAATAATTTC
TTGCAATGTTTAAAATACATGCACCAATTTCATTTTCTTTGCATTGATTG
CATACACACAATACTGATATTTTACAATTACTGCATGCACGTTAACGTTA
CTTTTTGATATTAGAACAAAAAAAGCACGTCTCTTTATTGGCCTTCCAAA
AACCATTTCTAGTTCACCTGCGAATGTCTCATATATTGGCCGCAGTGATT
TACATTCATATAGAATGTGAGATGTAGTTTCTTGCTCTTCCCTACAAAAG
CAGTAAAGTTTGTCGTTGCTTAAAAAAGCTGATACTTCCAGGGTTCCAGT
AATCACACAATAAGAAAACCCCTTTTCAGAAGGAGTGAGCAATGGGTTCT
GAAAACTATTAAAGGCTTGTCCTTCTATTAACTGTATGTTTCTCCTCTTT
AAAACATTTTTAATCAGTGGTAATGATGATTCAAACAACATTATTTTTAT
TGATACAACTTTTATCTTTGCGAGCTGCTGTCTTAAGCAAAGCTCCTTAT
TAAAATCATAAGTATGCCCATGTCTTATCTTCTGAATTTAGGAATTTTTT
TATAGGTCATAATGGCTTAAAGATTATCCCTGTAATTAACAAGATCATCC
AAGTAAAAAAAACGGCAATTTCTATAAAGGCACCTTTTACTGGAGCGTAC
CCACCCATGACTAGTTCAAGAGTATAAAATATGGATAAAGTATCATAGTT
ATTCTAGTACTAACATAGATATTAACGAATTATTTCCTTTCCAACAGGAT
AATATAATATATATGATAACTAAGAGCTTTCTTTCTTTTTGAGGATTATA
TTATTTTATTAATCCTTTCTTGTCATTCTCCCCTCTTCTCCTTCAGTAGG
AATAAATAATTAATCATTATTATAGAAGAAGATTCCCTTTAATTTCATTA
CTGATATAATTAATATCTCTTTATAAAAATAATTAATTTATATATAAAAC
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TATATTACTTGTAATACAGTTTTCTACAATCCATAATCTCTTTTTTTTAT
ATGTACACTCATTTTTATCGGATAAGATTATAATTAAATTAGGAATGGGT
CACATGGAGAGAATTCTTGCCTATCTTTAGTGGAAATTGTATTAAAAAGG
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TTTCCTTTTTGGTAAAAACTCTGTGTAGCGTCAGAACATCTTTAATAGAA
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GTCGTCGTTAACTCCCAAAGGAGGAAACATCGACACGTACTGACCTGTAT
CTTTTCCAGGAACATAATTAAATAGTTTCGGAAATAATTCCAAATCTCAT
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TGATAAAATGCTCTTTTTCCAAGGTATACACAAACTAAATATTCCAGAAA
CTTTGATTTTGTACTTTGGCTTTGCCTGCCTCAAGGGTAAAGACATTGTG
TATTATTATTGTTTTTCAAAAACTTTGCAAATTAAAACCATGTTTAAGAA
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TCTGGAAAGCTACGATAAAAACAAGGGCTTAATCTCCCAAATTTTGTGTG
GTTTTTGAAAAATGTCTATAATAAAGCTTTATGGCGTTTGAGGCAGACAT
GGCCAAAGTCCAAGGTACTTGTATATTTGCCTTTGGATGAAGGTAATAAT
ATCAATTTGGATAAGCTTAAACTAAAAATCCAAATGTGAAGACGTCTAAA
TTACCAATTTTATTTAAATTTAGGCAAACTAAATATAAGTGACTATTAAT
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TGAGACTGTGTCTAAGACTTATTTTTTCACTATGGTATTAAGTGATTTTT
TTAGACCAATTGGTAATGATATAGGTACTCAGACTTTCACATCATGGACC
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GGACTGACTGTCTCCATTATCCTTCTTTATGAGTTTACAAATATAATTTA
CTACGAGAGTGTTTCCGTGTCGCAAGGCTGAATAGAGGGAAACAAAAAAC
AAAGAAATGAAGGTGCAAGAAAAGAAACAGAGAGTGGATCTAGAAAGAGA
CGGAGAGAAAAGAGAAGAGAGGAAAGACAGAGAGATAGATAAAGAGAGAT
TGATAGAGGGAAGTAAAAGAAGGTGTTTCCCCCCGTCAAAAACAGCCTCT
TAATGACCTATGAGATCCCAAAAATATCATATGGGTATGCTTGGTTATTT
TATACGTTTACTTGCGTAAATTTCAGATTAATCCGTTCAATCTTTTTGGA
TTCCATGTTTGATAAATCCAAAAACTGACTTATAAATAAATATACAAAAT
TCAACATATTTAGCTACATATGACGTTATTATGCTCATGTTCAAAATTTT
GAAACACACCTTACGTGATGAGAAATTCATCTAAAGAATCGACCTGGACC
GATTTTTAAATTAACTCGATCCAGATTCTTTTTTTTTTAAATGACCGAAC
TCCAACACTATTGAGTATTTTTTGTTAACCAATCTTTTATTCTTAGTTTG
AAGGCAGAATGGATGTATAGTCAGAGTAAGGGACGACATTTTGCAGTGGG
ACAGCATAAGGAACTGTGCAAATATCTCCTCTCTATCTGCCCACTTCATC
CCGACGAAAATTGGGAAGAGGACAAAAAGTTAAATTTAATTCTATCGAAA
GTGCAGGAGCATCAAGAAAGTCTAAGGAAAGARCCAGCCGAGTCACTTAA
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TTAAATACATATTTTAATTGATGCTAAATGCTTACTAAATATTCACTGGA
GAGTATTATTCTTTAAGCAGAATTACCTTTCCTCACTCCTCCAAAAAATA
TATAAAACAGACAGCTGATACAAACAAAGCTTAACAATAGTACCATAAGG
CCCCGCCCACACATAGACTTTCACCTAAAACGATATTTTTTGAAAACTGC
TTCTAGAGAGGAAAAATCACAGAACGCCGTTCACACGGTAAATAACTTGT
ACAAGCAAATTGTAGAAATAAAGTGAAGGAGTTACTTTTTACACATCGAA
TGCGCTCATTTTCCCATCTCTAATAAGTAATGATAATACTCCCATTAAAT
ACAAAAAAAATATTATTAACTTGCTGGGATTAAGCAGATTTCTTTCTTTT
ATGTATTCAAAAAAATTTGAATACGAAAAAAAATAAAATTGGCATCTTTT
AAAAAACATTGCCGAGTGGGCGAGGTTGAGTTGCACTTTTGCCTTCTCGC
AGAACTAAACCAAAGTCCCAACATTAAAAATACGTTGATCAATGAAGGGG
ATTTATGTCAATTTCAGATATAACTTAATTTTCTGCTTTTATTTTTTTGA
TGCGACCACTTTTTTTTTTCTTCATAATTTACGTAAAAAGATAAAGTTTG
GTGAATAAACATAAAAATAGTTTTGAGCAAAAATCAAGAATGCAAATATG
CATACAGTCTGATAATGCATATACATATTTGAGGCATTTATTGGTTCTGT
CTTCAAATCTGTTTTAAATTAAGATATCCAAGGTTTTTAGCTATGGCTTA
GAACTTATATTTGATTAAAAACACATTTATTAGGCACGATATTGCCTTTA
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CTTCTTTTGTAAGTAGTACAATTTGATGTACACCCAAAGGGTGTATAAGA
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AATATGCAAATTCATAACATATAATATTACTTTCTCATAGATTAATATAA
TCTACAACATGGGTAGTTTATATTAGTAAAGTTTTAGTTTCATCAATCGA
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TTTTCAAAATCATTTTGAAAAAAAAACAACAATTAATATATGAGATACAT
TGATATACCATGAGTAGAGTTGACAAAATTATAACCTGCCGGTATGCTAA
AAAAACCCTGGAATAAGTGGTTACCCTTAACAATGCGAAAAATATAGATG
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GCATAATTATGTTATAAAATTTACATGTGGGGGTTTCTTAGTCTTTAAAT
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TTCTACAATAAGTATCACAGACTCCGACTTAAATTTTTATTGTAATGTTT
TCTAAACTGCCTTATTTCAAATTAAAAGTTTTGAAATGTCTGCCAGAGAC
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TTCCTCGAATATCGTATGGCTCSATAAGTTTTTCTTCAATTAATTTATGT
TTGCAACATAGGCTTTGGCACTACTGATGTCGATATTCAATACCTTATCT
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GGCCGTTAACCAAATGCANTTTGCCAAAGTGTTTTAGATACGAATTATTA
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GGTACGAGGTCTCCGTAGCCTGCCAATGCTTCCAGCGCCGTGTGGCTGAA
GTTATCGAGAAAGGGGGATAAAAATTATTGAATGTTGTTTTCGGTGGGTT
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