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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s616 | supercontig | LSalAtl2s616:5915..14813 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009585 >EMLSAP00000009585 ID=EMLSAP00000009585|Name=EMLSAP00000009585|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1315bp
MYIWRDLILFLYACLWIIAVDGEDSACPFNQLCSCKSVPHIPELLESQKR
RSGDATEPTFHGQFGVFYENDMDLRKEDGKKKDSSVYSPEEYIRDIRCVG
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LNARRIYLGFNRIEFIDDEAFEDVEDMIDLIDLESNKLLELPSALGRLRR
LRYLYLQNNYISKIESPKIFDSFCSSLLAFSAAGNGLTEFPYTTLHNCKV
LRHLNLGYNKIYHIKPEFFVWASKLDTLILRNNRLTQLGPHVFRDCTKLR
ELSLSFNDFQVLDSEAFTDIGTTLQSLEISFGLNGIKAFPHNALRPLQKL
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TGIQILYLNDNALEMLQFAQFSGLTGLRILDLHKNKLRSLPRDVFQFSSV
ETLDLSWNEFVALPTSALNEISSSLRYLNLSHNKIEHLDSTMFSNFPHLL
SLSLASNKLTILPDNIFSGLGSLIILDLSYNAIRANLRELFHYVHRLREL
RLAGSFLRELPSFTLPSLVKLDVSDNHLSDLPYNYLTVEDGLYRLKYLNL
SGNDLIRLPARSWYYVPFLKSLDVSWNPLRVLTKESFYGLARLQILSVRN
LVDLKRFDSDSLTQLTNIRRLFIQSWPTIEKFKFRLGSLVSGLSSLHYLS
ARIEEPSGVLTDQILGAFGPKLKELEITGDKLTEITLDSLEGIDSYELTL
AIRHTNVSTLPIGFIQLFKNVFHLSLDIQNNSFRTLSPEVFYSNGSLWKY
NGTNIIQGGLSLQNNPWLCSCENVWLGIWLRRWMREALQLHISPIENGIN
VRNMIRSIECIEEKPLTDLREDMQCVSGHASSISFSKKMISHADRCFVIL
SVLFLLLLSQWNFLY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s616:5915..14813- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009585-705432 ID=EMLSAT00000009585-705432|Name=EMLSAT00000009585|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8899bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s616:5915..14813- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTATATTTGGGTAAGATATTAATAAATAATTGACAATTAGAGTCAACT
TAATTAATTACTTTAAAGCGTGTTTTTATTTTACTTTTCTCTCATTTCAC
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GTCTTGTTCAACTGTACCTCACAAATAGAAGTCRCAGGGCTTGCAGACGG
GGCTCTTGGGAGATCATATGTTGGGACTGGTGTAGACCACGAAGTTCTTG
AGCAGCCACATCTGGGACTTGTTGGTCTTGACTGTGTTTCTCACCATGCA
GGCACCCTTTATGATGTCACAGTCCTTAAAACCGGCCTGAATCATGATAA
CCGCTGTTATTCTTTTTCACTGGTTAGACGGGTAAAAGTTGTTGGAGTCC
ATTGCTATCAGAACCACGTGTTCTCAACTACTGACCCAATATTTTGGTAA
AATGATACGGTAATGCACTGCTACCTAACGGTCATTATGTGCATTAATAT
CAAGTGTCAAAAATATCACGCCGACCCTGCATAACTTACCAGTAAAGGTA
AAATGTATGCATAAAAAGAATTATTATGTTTACAAAAAGTAGTCATTAAC
TCCTCATTTAAAATGAAGTAAGAAGATAAATAGGAACGTGTAAACTTAAT
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AAAATTGACAAATCATAAAGTCTAATGATCTTCAAATAATGCTATCCTAG
GACATAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCTATGTGTTTATTTTAAGACAA
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TTTCTTATAGTCCATTGGTCCGGAACGGCTTTATTGTACTGCTCGTTGTG
GGCACACCGCCCAATTAAATCAAAGTTTTGAATAAAAACCCTACCATCAC
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AGTGACGAGAAGAAGTAATATAAAGCTTTATAAAAAATGTGCCTTTTTTC
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TATACGCGGTACAACAACTTTTTTAATAGAAATGATCAATTTATTAGAAA
ACTTTATTCAATCTTTTGAAATATAATTAACTCATCTAAAATTATATATT
TATTATAAACTGCTCTATTTTGAGAATGTGGTGACTACTTTTAGGGTAAA
ATTCTATTTTTTTCATAAAATTGTAAAATTTTTGAAAGGTTGTGTGCAAC
CTCTCAAAATTGATCAATATGGCTCAAACATGATGCTTCTTCATCTTGTA
ACAAAGGGAACGTTTTTGAACTATGCCTTCCCAATGTTAAAAAACACAAA
ACATCTTAAGTAGTAGAATTTCTCATTTTCAGGGAAATTTGTAAATTTTT
AAATTTCGTGATCCCGTTAGTAAATAATTTATACCTACTTTGGAATTAAC
ACCTTTCTCTCAATACGTTGCCCAGGAGCAACACTTTAGAAAATAGTCTC
TATTATCAAAAAAAATCAAAAAAACCTGCAAAAATTATTTTAGTTTAGGG
ATTTAGGGATATATATTTATGCATTTTAGCAGCAGAAATACCAGAGTTTA
CCTGTTTTACGATTGTTTGAATCCTTTCAGTTTCAATAACCTTTATATAA
TTATGTCTAGGAAATTGTATGTAAGTTATTTATTAGTAGAATATTAATAA
AAATGGTGTCTTAAGAAGYAAAATTTTTGGGGCATTCTTAATTAGTACTT
AAATTTTATATATTTGTAGAGTTTTATATACATTATAATATTGTGTTAAT
TTTTAACATTTTTAAAATTACATTATTATTTTTTTTGTCTTGGGGTATGT
TTTTAATACTCAAAACAATGCAAGAAAGTGATGGAAATTTTTATATTTCA
CCTATTTTAAATTAATGGGAGAAAGGGTTAAGTATTGTATTATTTTCTAT
ATTTTTAGTACAAATAATAGATTATAAACTGGCCGGAATCATATCAGAAA
TTCTCATTTTTTATTAATATCATTCGCACGCCTTGGTGTTTTGGAGCCCC
AAGGTCTTACTTTATTAATTTACATATCTCCATCCGACTCGTAACAACAA
AAATTAATAGCAAGTGATGCACTAGCTAATTTTTTAGAGAACTGGGAGTT
TTATTATGATTAGAGTTGAAGAAAATAGAACCTGCCGATATGCTAAAAAA
ACACCAAAAAGTTACGTAGTAGAAATTTATTTTCCAAAGCTGTTATCCTT
ATTTTTATTTTCTTGAAGAGAGAATTACTAAGTAACAGGTTTACTAGAAA
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AAAATCTGCTTGTCTTGCCCAGAAGTTGGTTTAATACATCAGATTGAAAA
TTCTAGCAAGCCCGATTACATGATGGTCGTACCTTGTGTTTCTAATCGCT
GTCATAATGTTTCATTAGATTAGATGTAGATTTTTTGTAAATAGCTATGG
ATTATTGATATTTTTCTACGAAAAATTTGATTTTTTTAAAATTTTATATT
TTAAAAAAATCATTTTTTGTGAACAGCTCTGTATTTTTGAAATTTTTTTG
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AAAAATATGATTATTTGTAAATATCTATTGATTATTGAAAAAAAATAATT
ATACAAATTTAATTGTTCAAATTTTTTTATCCAAAACAGTGTAATTTTTG
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AAAAAATAAATATATATATATTATATAATCCTGTGGAAGCCCTTGGTACT
ATCATAGTATTTCGATTTATTAAATTACATGGTTGTTATGTATTTATTAG
TAATGTAACTGTTGGCATTTAAACTGTAAAATGTTATTAAATCAGAGACT
ATTTGAAAGGCTTCGAACTCTGATCAAAGTATGCACCCTCTGTTGTGATG
ACCTTCTCCAGCCTGGACCTGCTGCAGGTGCGCTAAACCTGGTCCCTGGG
CAACTTGTTGAAAATCACGATGATGTGCTGCTTTAAATCGGTCACCGTGT
TGCACGAGGACCAGTTGGTGTCTTGTTCAACTGTACCTTACAAATAGAAG
TCACAGGGATTGCAGACAGGGCTGTTGGGAGATCATATGTTGGGACTGGT
GTAGTCCTGGAAGTTCTTGASCAGCCACATCTGGGACTTTTAGGCTATAA
AAAAAAATACAAACGGCCCTGATAGTCTTGACTGTATTCCTCACCACTTC
ATGATGTCACAGTCCTTAAAACCGGGGCGAATCATCATAACTGCTGTAAT
TCTAACGGTCATTATGTACAATAACATCAAGTGTCAAAAATAACGCGTCT
ACCCTGTATATTGTATTTGCACAATGTTAATAATAGTAATTCATATTAAG
TTAATTTAAATTTGTTTTCAGAGGGATTTGATACTATTTTTATACGCATG
TCTATGGATTATTGCTGTGGATGGAGAGGATTCTGCTTGCCCTTTCAATC
AACTCTGTTCTTGTAAGTCTGTACCACACATTCCTGAACTTCTAGAATCG
CAAAAGCGTCGTTCTGGTGATGCAACAGAACCAACGTTCCATGGCCAATT
TGGAGTATTTTATGAAAATGATATGGACTTAAGGAAAGAAGACGGTAAAA
AGAAGGATTCTTCGGTTTATTCACCAGAAGAGTATATTAGAGACATTAGA
TGTGTTGGAATCCCTTTAGCGAAAATTCCAAGTATAGCTTCCTTATACCT
CAGAGATTAATTCATTTAAACTAATTTATGTTTTAATTTCATTCATAGAT
TATCCCATTCCTTTTTTAAGCTCAATTGATATTATTGATGGGAATCTTGA
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GACTAATGAAGAATAAAATACGCTTGATTGAATCAGATGCATTTAGGTAA
TTCAAAATATTCTAATAACATATAATGATTGCTATAAAGACATTATAAAT
CTATATTATCCTCTATTAGAACCTTGGCGACCACCCTGAAATCCTTGGAT
CTAAGTTACAACTCATTAGATAAAATACCAGAAAATGCCTTTTCACGTCT
AACAGTACTCAAATGGCTCAACTTATATGGGTAAGTACCTATAAATTATT
TTCAATATAACATAAATCCCTTTGTATTTATCTCACACAGCAATGAAATA
TCGGATATCGGAACATCAAATTTACTTAATCTCAAAGCCTCCGTGTCGAC
GCTTTTCCTTGGTGGAAATGACCTTAAGGATATTCCTCCATACTTTTTTA
ATACCTTCAAAAACCTTACTTGGCTCAACTTAGATCATAATCATATTTTC
CACATTCCTGATACTTGCTTTCCATCAACTCTCATTACATTAAGTCTCTC
ATACAATCTCATTAATAAGTTTCCTTCAGGAGCCATTGCTAACATGCCAT
CACTAAAATGGTTCACTATTCGTGGGAATTATATAGAGCAAATACCTCAA
ATACGCTTTGGGTCAACGAAACATTTAGACAAATTGGACATAGGAGAAAA
TTTTATTGTTTCATTGCCAGAAAATATGTTTAATGGGTCTGTTGATGTTA
TCGATTTAAATTTGGACTATAATTATGTAGAAAGGATCGGACCTCGCGTT
TTCAAGTCATTGAACGCAAGAAGAATTTATTTGGGATTTAATCGCATTGA
ATTCATAGATGATGAAGCATTTGAGGATGTCGAGGACATGATTGACTTAA
TAGATCTAGAATCCAATAAGCTATTGGAACTTCCATCAGCATTAGGAAGA
CTTCGGAGACTAAGATATTTATATTTACAAAACAATTATATATCAAAAAT
AGAGAGTCCTAAAATATTCGATTCATTTTGTAGTAGTCTTTTGGCATTTT
CAGCCGCTGGTAATGGACTGACAGAATTTCCTTATACTACACTTCATAAC
TGTAAAGTACTTCGCCATTTGAACTTGGGCTATAATAAAATATATCACAT
AAAACCAGAGTTCTTTGTTTGGGCATCTAAATTAGATACGCTCATTTTAA
GAAACAATCGTTTAACACAGTTGGGGCCACATGTATTTCGAGATTGTACG
AAATTGAGAGAGTTAAGCCTAAGTTTTAACGATTTCCAAGTCTTGGATTC
TGAGGCCTTTACAGATATTGGAACAACTTTGCAATCTTTGGAGATTAGCT
TTGGACTCAATGGGATCAAGGCATTTCCACATAACGCTCTACGACCACTT
CAAAAACTAATGTGGCTAGCATTTGATAACAACGAATTGAGTTCAGCTGA
AGATACGTCCCTATATAATGCTGGAGATTTACAATACTTAAATTTGGAAA
ATAACAATCTCCATGATTTACCCAGAAACTTGCTTCACAAAAACGTTCAT
TCGAGCTTAATTGATGTGAGACTTGCTCACAATCGAATATCAATAATAAA
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GAAATAGTATAGTTATCCTTGAGTCCACAGGATTTTTTAATTTAAAAAAT
TTATTCACACTTATTCTATCACATAATTATATAAATCAAATTGATCCAAA
GACATTTTCCAATCTATTGAATTTACAAAAACTGGATATGAGCTACAATA
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AACAATCCCTTGCATCTTGATCTATCCCATAATCAAATCGACTATATCCA
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TCAGTTATAATATATTAACAAGAATCCCTAAAGAAATATTTAAGTCCATC
GTAGACCATTTGAAAATCCTTAATCTCAGTTTTAATCAAATTTCTCGCAT
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TCCTCAATCTTTCTCATAATAATCTTCGTGATCTTGATAAAAGATGTTTT
GACACTCTCACAGGGATTCAGATCCTTTATTTAAATGATAATGCGTTAGA
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ATCTCCATAAAAATAAATTAAGAAGTCTTCCAAGAGACGTATTTCAGTTT
TCGTCAGTGGAAACACTAGATTTAAGCTGGAATGAATTTGTGGCCTTGCC
CACGAGTGCTCTTAATGAGATTTCCTCATCCTTACGTTACTTGAATCTGT
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CAACATATTTAGCGGTTTGGGATCTCTGATAATCCTGGATTTGAGTTACA
ATGCAATAAGGGCAAATTTAAGAGAGTTATTTCATTATGTGCACCGTCTT
CGAGAATTGAGATTAGCAGGCTCATTTCTGAGAGAACTACCTTCCTTCAC
TCTTCCCTCTCTTGTCAAACTTGATGTCTCCGATAATCACCTCTCGGATC
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CTATGTACCTTTTTTAAAAAGCCTAGATGTATCATGGAATCCTTTAAGAG
TACTAACAAAAGAGAGTTTCTATGGATTGGCCAGATTACAGGTAATAGCC
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TTTTAGATATTATCTGTTCGAAATCTTGTGGACTTGAAACGTTTTGACTC
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TTATCAAGTTTACATTATTTATCAGCTCGGATTGAGGAGCCTTCTGGAGT
CTTAACTGATCAAATACTTGGTGCTTTTGGTCCAAAATTGAAAGAGCTTG
AGATTACAGGTGATAAGCTTACAGAAATTACATTAGGTAAGCACATTAAA
TCCAATCATATTTATCAAGTTTATTATTTTTTTTTAAAAACCACAATATT
TATTTAAGATTCACTGGAAGGGATCGACAGCTATGAATTAACATTAGCTA
TTCGTCATACAAATGTATCTACTCTTCCGATTGGATTCATCCAGCTTTTT
AAAAATGTCTTTCATCTCTCACTTGATATTCAAAATAACTCATTTCGAAC
CCTATCCCCTGAAGTTTTTTACTCAAATGGATCTCTCTGGAAATACAATG
GAACAAATATTATACAAGGTAAAGGTTGTTTGTTTGATACCTCAAAACGA
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GGTTGTGTTCATGTGAGAATGTATGGCTTGGAATTTGGCTTCGTCGTTGG
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TGTTCGGAACATGATTCGTTCAATAGAGTGCATAGAAGAAAAACCATTAA
CAGATCTTCGTGAGGATATGCAATGTGTTTCAGGACATGCTAGCTCCATT
TCATTTTCAAAAAAAATGATTAGCCATGCTGATAGATGTTTTGTTATTTT
AAGTGTATTATTTTTGCTGTTACTGAGTCAATGGAATTTTTTGTATTGA back to top
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