EMLSAT00000009722, EMLSAT00000009722-705569 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000009722
Unique NameEMLSAT00000009722-705569
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s627supercontigLSalAtl2s627:26617..51432 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000009722 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000009722EMLSAG00000009722-692488Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000043132EMLSAE00000043132-752060Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043133EMLSAE00000043133-752061Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043134EMLSAE00000043134-752062Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043135EMLSAE00000043135-752063Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043136EMLSAE00000043136-752064Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043137EMLSAE00000043137-752065Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043138EMLSAE00000043138-752066Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043139EMLSAE00000043139-752067Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043140EMLSAE00000043140-752068Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043141EMLSAE00000043141-752069Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043142EMLSAE00000043142-752070Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043143EMLSAE00000043143-752071Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043144EMLSAE00000043144-752072Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043145EMLSAE00000043145-752073Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043146EMLSAE00000043146-752074Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043147EMLSAE00000043147-752075Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043148EMLSAE00000043148-752076Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043149EMLSAE00000043149-752077Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043150EMLSAE00000043150-752078Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043151EMLSAE00000043151-752079Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043152EMLSAE00000043152-752080Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769739auto769739Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000009722EMLSAP00000009722Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000009722

>EMLSAP00000009722 ID=EMLSAP00000009722|Name=EMLSAP00000009722|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1531bp
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ENKTNILERMLNLGCNIHAKNKEQYSTLHLASMYSRDDTIKMLLSKKADP
SISGGPKQQTCIHLVCSRPTSQALQILRSLMTVAPKNARLIPDADGNIPL
FXAIDSGNINVCRELLTQDTEAQIKYTKEPLNETVLHLAGRRKDNDLLRL
FIEGGAAVDARNNGARGIHTAAMKGHVSVINTLLAKGENVDAVTNDNYTA
LHLAVEAGKSAVVETLLGHGAAVHIKGGTIGETPLHIACRIDEVRGEKCT
KMLLKSGAATNLPMSDGRGPCHIASECGSISVLKELLENNGDPGKIDETG
ETALHKACKSCHYEVIKLLLSYVETRDGNCDEFIHKVNTRGESALHYAAK
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YTELVEFFVKKHNATIDSHNMRKQTPLHLAASAGQLEVCRLLLELGASLD
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AYHGEEDVVRELLTHVPSSMKSELPSSPGHAIARELATESELTPLHLAAF
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SGAPTTVQTKNGKTPLWFAAAEGHIVVVIYLIKQEHDSYNLLEDRKFIFN
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VSKFSEHICNELVSISSGADNPGVILQATDRRNSPFLDILIECELKKVIA
NSAVQTYTTELWKGGIEHWPGWKIFILLSCFAFFPPLWLIFSLPLNNKYN
KTPIIKFGCHLTSHIYFMIFQIITTCLPLYPITRSSLFPYWNEWMVLIWL
SGLLLRELTDPGERRGLGAIKIVIIVLYLIAAGIHIAALFVEQKDWSRLM
YIRNQLSGVAVLCCCAQFLDFLSFHHLFGPWAIIISSLIIDLGKFLTVLL
LFQFGFTMLVMAMNQPYSKLGSPENLKEDMQPEVNVTAIKGFEGLFFSLF
GLTKPQDLKMTVYNEEWTLELFKVLFSVYLLVTVIVLINLLIAMMSDTYQ
RIQQHSDTEWKFGLAKLIRNMHRTNASPAPINLVTTWAVFMYQLFKKNLK
KKDKYKRMKHEQRRPSEGLKTSSLKKKMGKVSPFTDAASTNEGAHAASVS
XMRSRNMLEHAIHWQPIIKKYRDLKNETSEN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s627:26617..51432-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000009722-705569 ID=EMLSAT00000009722-705569|Name=EMLSAT00000009722|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24816bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s627:26617..51432- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAAAAGTCATAGTGTGAGTCTAAGAACTTTCTAAGTTGTAAAGCAACT CTAAACCTTTATACCACGATTTATTTTTTTCATTATTTTTTTGTTTTTGT TTTTTCTTATTGTATATTCGACTTTTATTTCTTGTACATACATAGGTATA GAATAAGAAAAGCCATTTCTTAAAAAAACATAAACATAGTGTTGAAAAGA GAGTCAAGGAGGAATGAGAATCTCCCTCAAGTGTTATAGATATTTGATAG TGTCTCCATTGCACATAGCACAATAAGAAACGTCTCTGAGCCAACCAATT AGAATGAAAGTTAAAAGGTACAATAATTGTATTAGTTCAAACTTGTTCAA GTTACTATTTTTTGGTTTGTAAATGTGGCCCGTCAAGACAAATGAATGCA AGCTAGAATGACGTTTAAAGTAGCCAAAATTGATCATCACAATAAAAAAA ATGAGATATTGACATATTTTATACTNNNGATATTGACATATTTATACTGA GCCTGTATTTGAATAAAGTATGTTTATGAAACATTGGCTTMTAGGMATAT ATGAAGTAAAAAAAWAATTACAGATTTTAGTTCAAGATTGTTTTGATGTA GACGTACTCAAAATGTAATAGTAAAGTAAAGTAATAGTATTGTATGATAG CATCAAATTTTGCCCTTGGGCTAATAAGATACAAGTGTAGTAGGTATTTG TTCATATTATTAGGTTAATATCTGATAATAAGAACATAATACATAAAGTA TAATGTATAACCGCGAATATGTGTTTGCTCATGAATGACGGAGAATAACT CTGAAGATTTGCTAGACTCKGAGTAAAATTGTGGATCGACAACAAAGTAA TCCCTGCCCTATGTTCTTGCTTGATACGGATTGGGTCTTATGTTGATTTC CTTCATCACACGACTGCTTTCAGCTTACTTTATAAAATGTCTAATACACG TCATGACAGCTTAGCTTCTCTTCTTCCAAGCAATCTTCAAATTGTCAGGA TTACCAAATTAATTTTTGATGTCTTTTTTTCCACATACCGAAAGTGCTTA CGATTTACAACTCTAGTTATAAATCTTATTTTTGTTAAGGGATCAACGTT TTGACTTTATCCTGAGTTTCCCTAGTATTGCAGTATTGCATCTTTTTTGT TTTTTTTTTGCAGGGGGAGGGGGTTGTAATTATATGAGGTGAATCATTTT AATTACAAACTATTACTAAATAGTGCAATCATTACTCTATACTTTGTTGG TCTATTAAAACTACTTAATTATTAATTATATATGCAAGAATAATATAAGG TTGTGTACATTTGAACTTTATTATGTGCCATAGAGTACTTGTCAATTCGT AACTTCATTTGTAGAAAAGTTAAAAATTACAAATACATCAATCATCTATT GAAAATCCAATCATTGGTTTTTCTTTGTCAAAAGTACAAAAAAAAAAGTG ATTTATAGTGTTACATCTCTTTTTTTTTTACTTACAACGAGTATGTTAAT TACAATTGTTTCATTTCATTTCCTCCGTTTTCGTAACATTTAATTTCGTC AATATTTCGTCAAGAAAGAAAATGTTGTTTTATGCAGACAAAAGGTTCAT AATAAAATGTTTCGTTTCATCTTTGTCTGGTNAATCGTTATGCTAAAAAC AGTTGTTACCTATCAACACAAGCTATACAACGAAATATTCGCTGTTTGCA ACTTGTACAATATCTGACTTGTACACAACATATAAGTGGGGTGCCCACAG GGGTAGGGCTGGAGGGMTTGTAGCCRRCCCCCCCCCCCKAAAAAAAAAAW AATAATCCTGCGGACACCCTTGTATTCTATAGTATCCTAATAACTCATGG CTTTTGGTATTTCCAAAGCATGTTTTTTGCTTATCAGAGGGAAGCGAATG AATAATAAGTGACAATACCTAAAAACAGACATGCTGCATATACCATATAC AWATATGTATMAGTAYAYAAAAAGAAAAAAAGGACTTTCAGTTCTTCTTT TGATTTTTGAGGTTTCACAATACTTTGTTAGTAAGATCCTTTTGTATGAA GAGGTATAGAAAGGTGTGTGTGTCTTTATTTGTTTGTTTAGGATTGACTT TATTCAATATTTTGACTCTGTACCATTTTGTACATGTTCGTGATTTTGTC TCGTAAAAACTTTTTATATTTGATATATATATTAATTGATGGACTGTTTT GAAAATGTATATGTAATTATGGTTATGAAAATTAATGGTTTTTCCTTAAC GATCAAGAGAGAAAAAGAAAGAAAACGCGATTTATTTAAGCACCCTCCTT ATATTATAATTTATTTTTTATTCTTTTTGAATTTGTTTAGAGAGAAAGTA ATTTACTTTTTATTTAAAGAACAACAAACTATTATAAATGTATGAACTGG AACACACACTCAGATCAGTTCTAAGGCATTTCTAAATTATAACAGACTTG GAAGGGAACATTTAAAAAAGAAAAAAGACAAAGTTATTGACCTCCATTCA AAATATTTATCAAAAATAAATAATATATATTTAAAAATATATAAATAAAA CAATCAATAACTTTGTATAGTAATAAACTCCAGCATGTATTCTGAGAAAT TGAAAAAGGAGGGAAACTTGGATCAAGGAAACATGATTAAGGTTAGAGAT CCTGAAAAGTTCTCTATCCCTCATGTACTCTCCGACTTGTGTTTGATCTG ATGTATCTCTTGTGCTTTTAGTTACAAACTGAGAATGAGGTCAAGTCTTC GGAAAAGTCCAGCAGCAGTAGTTCCTCATCCACTGGTTCTTCATCCATGA AAACCTCCGTCAACATGGGAAACCCAAACAACATTGCTAAGCGCATCCTT GTCCTTTCTCAAAAAGGAGATTGGTCTGGTTGCGAACAGGCTCTAAAAGC TCTTGAAAGAGTTGTTCAGGATCCAGATATTGAGAGCGGATCTGAGCCTC TGTCAACTACCATGGACACTGTAACTGGAAATACGCCTCTCATGTACGCA GCGATGGAAAACAAAACGAATATTTTGGAGAGAATGCTGAATCTTGGCTG TAATATCCATGCCAAAAATAAGGAACAGTATTCTACTCTACATTTGGCGT CGATGTATTCACGGGATGACACCATCAAAATGCTTTTGTCGAAAAAAGCG GATCCGTCCATTTCTGGAGGAGTATGTTTCACGTCTTGTTGTGATGCGGA GCAATACTTTACATTTATCGTAATCCTCTTCTTTTCAGCCTAAGCAACAA ACGTGCATTCACTTGGTTTGCTCACGCCCAACCTCTCAAGCTCTTCAAAT CCTACGATCCCTTATGACTGTTGCCCCAAAAAACGCTCGTCTTATCCCTG ATGCCGTAAGCATCCCTTTCGTTCCCCGAATAAAATTATAATTAGTACTT TTCTTCCTTCTTTTTTGTGCAACAGGATGGAAATATTCCATTATTTSCTG CCATTGACTCTGGTAATATCAATGTCTGCAGAGAGCTTTTGACACAAGAC ACTGAAGCCCAAATAAAATATACGAAAGAACCTCTTAACGAGACAGTTCT GCATTTAGCTGGAAGACGCAAAGACAATGATCTCTTGCGGCTATTCATCG AAGGGGGTGCAGCTGTTGATGCTCGCAATGTAAGAATGAGTTTCATATTT TAATTTCCTAGCTCAATTACTATTTGTAATCAACAGACTGATGGAACCAC GGTTCTTCACATAGCATCATTGAATGGAGATGAAAACATGATCCGCACTT TATATCTAGCTAGGGCCAATGCAACCATCACAGACAAAGAAGGTACATGA 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