EMLSAT00000009776, EMLSAT00000009776-705623 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000009776
Unique NameEMLSAT00000009776-705623
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s633supercontigLSalAtl2s633:227794..252871 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000009776 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000009776EMLSAG00000009776-692542Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000043404EMLSAE00000043404-752332Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043405EMLSAE00000043405-752333Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043406EMLSAE00000043406-752334Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043407EMLSAE00000043407-752335Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043408EMLSAE00000043408-752336Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043409EMLSAE00000043409-752337Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774887auto774887Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000009776EMLSAP00000009776Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000009776

>EMLSAP00000009776 ID=EMLSAP00000009776|Name=EMLSAP00000009776|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=736bp
MFSSEVEFSVRWFYKREVEKDWRPFMGYDSLRIELRYRHIWQTKWSDVDR
RTNTLREEYHNSHRASVRTMINNAHQQRRARSLSRVHYDRATGPHTAMLM
NGYVDESSQSSPMSHPSQSLHHGGPPMHHQHIPRTHPAAQEEYYDSGEYE
TASGGVGGGSANQSGIRPSTAGNNYNPYSQRGPHYSTRGRQKSYRHYRSS
DNFINDDREMRIVVRGGVYEVDLVEWKCHSIYWPGEAFDILRGTWFHETT
WQPVQCEHADRIEREHLSRFLNHKMADYVWDPTTSSRLEKQVHHTINFPE
FHVDWLSPEEVYLHRENASSQIYRGISASLGFKKPTGTRLFRGYRELSSH
SDKLADISHIVFVIHGVGQVVDDTTILRNTNILRDNVHAMIEKHFKSYQN
ETGQRIEFFPVEWRSSLTLDEGIVNIITPQRIMGLRNLLNSSAMDIMYYT
SPLYRMEIWSALQEELNRIYEMFVQRNPYFEANGGKVSITAHSLGCVVTY
DILTGWTQDVEHSWYSLQAHSMSHHPANHGRGRGRPAPMNEHRQTPMNAA
QSGLLFRIENFFCLGSPLSVFLTLRWRDPQNTEYHDYILPRSLCKYLYNI
YHPCDPVAYRVEPIFMKFYAQIEPVHLYSENDPNKSPPGMPSVLPTTSSG
IHGYNYASQMNKISNHNVHHQSNTHPPAKSSMATHHQEVKLPDGQRLAYR
MDYVLRETGNTYIAAVTSHTAYWSNADVAYFMFKKT
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mRNA from alignment at LSalAtl2s633:227794..252871-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000009776-705623 ID=EMLSAT00000009776-705623|Name=EMLSAT00000009776|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25078bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s633:227794..252871- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTTTCTTCTGAAGTCGAATTTAGTGTTAAATACAAGAAACCTCTTTC ATGCTCGTAAATTTGTAACTGTTTCTAACCCATGGTTTGTGTTGAAACTT ACTTTTTGTTTTCAAACTAGTGTGAAATATAATTTATTCTTAAAATGTTA GTTAAATATCCCTATAAGAAGGATGTACTAATGAGTTCCTCATTCTTTTC CTGTCTTTCAGGTACGATGGTTTTACAAAAGAGAAGTGGAAAAGGATTGG AGACCTTTTATGGGCTATGACTCTCTCCGTATCGAACTTCGCTACCGTCA CATATGGCAAACAAAATGGAGTGATGTTGATCGGAGAACAAATACACTTC GTGAGGAGTACCATAATTCCCATAGAGCCTCAGTTCGAACCATGATCAAC AATGCTCATCAACAGCGTCGAGCACGTAGCCTTAGTCGAGTCCATTATGA TCGTGCAACAGGTCCACATACAGCCATGCTCATGAATGGATACGTAGATG AATCCTCACAATCATCACCCATGTCACATCCCTCTCAGTCTCTACATCAT GGGGGTCCTCCCATGCACCATCAACACATTCCAAGAACCCATCCTGCAGC ACAAGAAGAATACTACGACTCAGGAGAGTATGAAACTGCTTCAGGAGGGG TTGGCGGGGGATCTGCAAATCAATCAGGAATCCGACCTTCAACTGCAGGA AATAATTACAATCCTTATTCTCAGCGTGGGCCTCACTATTCCACTCGAGG AAGACAGAAATCATATAGACACTATCGATCCTCGGATAATTTCATCAATG ATGATAGGGAGATGCGGATCGTTGTTCGTGGAGGTGTGTATGAGGTGGAT CTTGTCGAATGGAAATGTCACTCAATTTATTGGCCAGGAGAAGCCTTTGA TATACTTCGTGGAACGTGGTTTCATGAAACGACTTGGCAGCCCGTGCAAT GTGAACATGCTGATAGAATTGAGAGAGAACATCTTTCACGGTTTTTGAAC CATAAGATGGCGGACTATGTGTGGGATCCAACAACTAGTTCAAGACTTGA GAAACAAGTAAGTTTTGGGTAATATTGGGAATAATGAGTGAGCTTTCTTT TTATATATGAATCATGTATCTAGAGCAGTGATTCTCAAACTATGGTCCGA TAAATCCCTTTAGCATTATATAGAGGTTTTAGTAGGGAAAGGTACTTACA TCTACCACGAACAAATTTTCTTGTAAAATTAAGAAATATATTTCTTTAAA TATGTCAAAAAATGTCTTTATACTATTTTTGCACAACATTATGTCGATCA TTTTCAAATATTAAAAGTTATCAATAACAGCAGTACTTGAATATCCTGAT TATTTATCAAGCAGTACACAATATAAAACGTTTGAGAACCATTAATCTAG AGAACTCTCTCCTCCTAAATTTAAAAAAAAAACCTTTCCAAGTAATATAA AAAGCCATTTTTTATTAATTTCATATCGTAAACAACATAGTATTCGCATA AAATATTCATCTATGACATTTAATTTATCTATTCTTACGTCAAAGTTTTA TTTGCTTGTAGAATGAATAAGATTGAATATTTTATGATATTTTTAACTTA ATTATTAAACCACTACTGGATAGATATCATACAATAAATAATAACGCTGA CACTAAATGCTTAAATGTTCAGATGTTAATAAATAATTTATCGAATATAG TACAATCTTAAATGCATGATTAATATATATTACTTTTTAAACTTGTTAAT CAAATAGAACATACAATTGGATGTTTGATATTATAATTGATTTATTTCTT AATGTGAGTTTCTACATCTGTCACACGTTTACGCACACATATACAACGTG TATAATTTTGGAGTAGTAAAATAAAGAAGACTTGGCCTTTCCTTAAATAG 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ACATGAGTTTAAAGGATAATGATATTATTATTTTATCGAAAAAAAAAGCA AATATTTGTTATTGTATTTTCTTGTTCCTCAAGGCATACATAAATGTTAT CGTAGGTACATGAAACGAATATATTTTCAACAGTACTATTTCTCCTGTAY CAGCCATTGTTGAGGAGACATTTTCTATTAGTTGTATGATTATTTAATTT ATTATCACATAAATTAGATAGGATATGAGTAATTATCCACTTAATTTTAC AAGTAGGGCCTAACATGAGAGAGGCCTAGGGCAAAGATAAATTTGTTGAC CCTTTTACTAATGTCATTTTTTTTCAATTTTCTTAGCAAACTAAAAAAAT AATACCCCTTAGTGGGTGTGATAGTGAGAAGGGTCTTACCTGTGGCTAAC ACAAAAATATACATTGCATTTTGTTGTCAGCTGTTGATGTGTCTACTTCT GTTCTTCTAATCAGTGCTCTGAACTTTGATTAGTTCAATTGTAATAACCT ATTGTAAAGCTGGGAATAATTCCAACAATAATAGAAAAATAGTTCCATAT TTGAGAAGAATAGACAAACCACCAACTTATTTTAACCCTTTTTTATATTA TCTTTTTTAGAATAGGTTGCCTGTTACAATAAACGTAAYAACTCGTTTAT AGTTTAGGTCTACAAAATAAATAAATTAAAAAAGATATTCATTTTTAATT TATTTTTCTTACCCCCCCAAAACACAATTTGGAATTTGGAATCATCAAAT AATAACATCATTCATGGAGTTTAATTATTTTCTCGCAATATGGTGACACT CACTATTGTTTTGTAAACAAACTAATATAAGTAAATTACGTTCATGCCTC ATATAAACACGTTTTATAGGGCATGGATAATAAAGAAGGGATCTATGTAA AGAAAAAACTAAGTATAGTGATTGGAAAAGAAAAAACAATTGTCGCGTGT GCTCTTTCTTCTTCTTTGTTCATAATTTAATAAGTCGTGGGCGTGTTAGC ATCTCCCTCTAAAAGAAGAATTATCACCTATCTTTGGTACAAATTGATTT AAGAATGCATAATAAATTTAATATATAGAATAGTCACGCAAGCAACTAAG CTTGTTTTTCTTTATTTCCACTCCTAAAGGAATTGAGTAAAAAATGAAGT TGAATCTTTTCTTTTTTTAAACCAATCACTACTTTATATTTCCCTCACGT AGGAATAAATATTCTGCATTATTATTCGAGTTTTCTATAATTCCATGCAA AAGGGTAATACAATGGGGAAAAATTGTATAAAGTAAAGAAATATGAAGCT TTACATCTAGGGTAAATACTACATTACAGTTACATAAAAACTATCATAAC ACCGTCAATTAAAAATATAATACTTTATATTCAGGTATAAAAGAAACTTA TGTGAAAGTGAGATACGCTCAAGTCTTTAACAATGATCAGAAATGAACAT TACAACGACGGATCTATTTGACTATATCCAGAAATATTCTAAAAGTCCTA TATTTTCAATTTAAGCTAACATAATAGTTCTTGATAGGTAATGATTTGAT TGCACATTTGCAATATAAGAAAAAGGGGCCATAAATATTTTACATAATAT GTAAAAATTTGATATATATTATATAATTAAAAAAATATGATTTATTTATG TTAATATTCATAGCTTACTATATATTACTAAAATAATTAATAATTAATTC CCTTATAATTATTGAGCTATTAAAATTTAGCCTATCGAAACAGGTAACGG TTCCAACCTAACTGGTTCTTGATATCGAATATTGTTTTCTTATAGTTGCA AACTGAAAAAGTTTTTTTTTATTATCTGAAGCTGTTATCATTATTCCATA TTCTTGAAGAGAGAATAATAAGTATAAAGTAGTCACGAGTGCGTGAAAAA 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AAGACCCTTATCTCGAAGTGTAAACCAGTTTCAACTCAATAAAGTCACGA ATATGTGCATGACGTAAAATTTAAAGGAGTGTTCAGTTTTAGACGCGCAC ACCTGAATGTTTTTGTGTTAAAATAACTTTTATAATTTTTTAGGGCATAA TTATGACTCATATACTTAGAATTAGGGTTTTAATTAATAGTTAAGGTTTA TAGTTAGATACACAGAAAAATACATAGGCTTKTCCAAAACGTTGACTTCT WTTWTATTYCATTAGATGAAWCCCAGTCAAAAGACGTGATAACAATGAAC TGTGCACAAGAAGTTCAAAGTGCATTAATAAATTTTTGATGACTCAGAAT TAGAGATTAAAAAAAAGATTTTTGATTGGTATACATGACTCCTCTTTCTC TTATAGTCTCTTTAGCTATGAGAAGAAGGAAAGAAACACAAATCCCACTC CGAATCTAGCAGCTACAATTGCAGGAATTTTCTAAGATATTGCTCCTCAA TTCCACTCCATGTTCAACAAAGACATAATACTTATAATTCATAAACCAAT CACCAGCGTTACTCTTCGTTAATTATGAGCACATGCACTTAATGTTATCT CCTCAAGAATGATAGTAGCTTTAGAAAATAAAAAACTTGGTTTAGATTGC CAATATATATAACTATACATCTTTGCAACTCCAGTCATTACTATATATGG TTTATTTTATACATACCAAAAGTGCTTACGATTTACAATCATTAATATGC TCTCTATAGATCTCTATAAAAGCAGCACGGATTCTGATCTCTTTTTTCTA TTGGCATGAAAGTGCATATTTCTTATTTATTCATTAACATACTTGAATGC ACATGTAATTAACATATTATAATAATGAAAGGCGCCTATACCATATTGGG CATTCATAAAAGTACTATAATCGTCGCCTAATAAACAATATTTTATAGCA 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