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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s649 | supercontig | LSalAtl2s649:353131..422335 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009940 >EMLSAP00000009940 ID=EMLSAP00000009940|Name=EMLSAP00000009940|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=806bp
MALVASPSSVWRDPNIMSASANSIXSSLSLSEPSGDPLSLEHSSSKSIHD ESHEIICVVCGDKSSGKHYGQFTCEAVQKGRTPSSLHQGPLFGLNFPNHS NSNIINLNTPNNSNNNPDHHIVPGTSYLSSYISLLLRAEPYPTSRYGQMQ MSNMVGIDNICEFAARLLFSAIEWARNIPGFPDLPITDQVALLRLVWSEL FVLNASQCNMPIHIAPLLAAAGLHASPMAADRVVAYMDHIRIFXEQVEKL KSIHVDSAEYSCMKAIVLFTTDAPGLTDVSVIEQLQEKSQCALEEYCRTQ YPNQPTRFGRLLLRFPSLRTVSSTVIEQLFFIRLVGKTPIDNLIRDMLLT GSSFQWPYXAAMASSIAVSRGLEEISCPSLSPVMALVASLAANSVWRDPS SSESSSSSSMNNNNNNSLNEEVIIKDENGQDISCVVCGDKSSGKHYGQFT CEGCKSFFKRSVRRALTYQCRGSRSCPIDQHHRNQCQHCRLKKCIKMGMR KEAVQRGRIPASQQNVLPFGFNGDRSSNVGSGGGSGGTGGSSGSSSSSNN SNSNYLSSYISMLLRAEPYSTTRYGQLQMSNMVGIDNICEFAARLLFSAI EWARNIPGFPELPVTDQVALLRLVWSELFVLNASQCNMPLHIAPLLAAAG LHANPMPADKVVAFMDQIRIFQEQVEKLKGLHVDPAEYSCMKAVVLFTTD ACGLSESNMIEQLQEKSQCALEDYCRNHYPNQPSRFGKLLLRLPSLRTVS SGVIEQLFFVRLVGKTPIETLIRDMILTGSNFQWPSSGSPPSSSSTTTSS SYSCVT back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s649:353131..422335- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009940-705787 ID=EMLSAT00000009940-705787|Name=EMLSAT00000009940|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=69205bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s649:353131..422335- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGCACTTGTCGCCTCCCCTTCCTCCGTTTGGAGGGATCCTAATATCAT
GTCTGCCTCTGCCAACTCCATCKCTTCTTCCCTATCTCTCTCAGAACCAT
CCGGTGATCCACTTAGTCTTGAGCATAGCTCCTCTAAGTCAATCCATGAC
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CTACTATGATTCCCTCATTAATCCGTCTTTGCGTAGGCTGCAAATCTTTC
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TAGCTGCCCCGTAGATCAAAATCATCGGAATCAGTGTCAATTCTGTCGGC
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AAAAAAATCAATTATTTAATTGTTTGAAAAAAAAGTCAAAAATCTATAAC
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TTTTTTTTCAAAAATATAACATTTTTTGTAGCTATGGATAAAAAATCCAT
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GGAGATACCCCTGACATKCGCTCATGCCAATACAGGATTAGCTCAAAGAG
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GATCATGAAAAAGCTCAAAGCCTTATTTATAAAAATTCCCTACCAAAAAA
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TGCCAACCTAGGGAAGCACTTTTGTTTCCAAAATCATCAAATAATCCTAG
CCAGTCAATCTGTATCCCATAGGGAACCGAATTGGCTTCAGTTTGTCACC
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GGTGGGGGACACTTCACAGAGGTTACAGTTGACTTTTCCAAAACATAGAA
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TCCGAAAAGAACAAAATTCGGTTTTCTGTGATACCTAAGTTCATTTTAAA
GCTTTTTGCATCGATCAAATCGTAATTGCTCTTGTTTTTGAGCGAGGAAG
GGTCGTTCAATATGTCTCAAAGACTTGCTACCAGCTTTTTTTTTATAGCA
TTAGACATTGTTGAATCGCTCACCGACCACTTTTTCGCCAAGTCCGTCAT
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TTCATTTTAATTGTTTGTATACAAGATAATCATTCAAAACTCCCGCTTTT
ACATCTTCATTTTCTCAGAAAAAATAATAGATGAAGTAGAAAGTTCTGAG
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TTTAGATGTTCCTAAACTGTTTTTTAGCTAATCTACAGTTCTTGAGGAAT
GGAATAAGTTCTCAAATGCCGTTCCAACTCGACGATTTCCATTACTTTAT
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TGKCTGCCTGCRCTGCCGTTTCACTTTAGTCGTAGTAATACTAAACAATG
CATCAAATTTTCTCGTTTTTTCCTTTCACTTTGGAACGCTGTAACACAAA
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GAAAAAAAATAATATTGACCTGTTTTAACAAAAAAAAAAAAAAATCAATC
AGACACGGTCTCATTTAAAATTCCGTCGTGTCGAGGMGAATTGTTGATTA
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GTTGGGATTAAATCCGTCTTTATATTTAAACACAAACAATTGGTCCATCA
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TTTATAAAGTAAACAAAAAAAACGTGAGTATTTACTCCWAATAATGAGGC
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GAAAAAGTCGATCTCCATCTCTTCCTACTCTCTCTATCCTAATTGCGATA
ATTGAAATTCAGCTTTCCGCTGTCGTTGTCTCCAATTTCGAGATAGAAAG
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TTTATATTCAAATTACCAAAACGGAATTGACGAAACCAAAACTTCCCTCG
CGATTGGGTGTTACAGATTCCGGACCATAAGCACTTTCCACATTTTCAGC
CGCTTGGCTTGCCTTTTCGCCTTGTTCGAAGAAAAATAGTAAAATATGGT
TTGTTTTCCCTTTGTTGGTGTCCATCTTTGACGCGTCTGCACAAAAAATA
CTGAGTTAAACAATCACAGAAGTTTTTCAGTAGGAAACCTTATCTTTCTA
ACGCGATCCAATGTGAACGGATTGCACTTAGACAAAGCCAGATTCACATT
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TATACATATTTGAATTTTTTCTCCTTTTTATAAATGAAGAGGATTTAATC
CCCTATATTTGACGATAATATTGTATAGATGGGTACGTGTGCATTGGTCA
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GAACGATTTTTAACCCTATGTATTTGTTATTCTTAAGTATCAATGTCTAT
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ACATGATGACTAATGAATAAATCCATCAATGTTTTGGCAATGGGTATTTC
AATAATGGTTTTTGAGCATGATATGAATAATATACTTATATGAGTATTTA
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TGTATGATGACGAAATCGTGCAATACTTTTTTATGCTGAAATATATTTAT
AAGCCTTGTAGTCAAAACACCWCCCTGGATCCCATACATTTACAGAGCAG
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GGATTTGGGAGCAGTAAGAGATAAAATTAAAAATATTCAACTTTTAAACG
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GCTTTTTTTAAAAAGTTAATTTTTTTGAAAAACAAATTAAAATTCTTTGA
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GAAAAGAAATTTGAAAAAATTAAAATTTTGTGGAAAAAATTTCTAATATA
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TTTTGTAGAAAAATTTCTAATTTAAAATTTTCAAATATTACATTTTTTAG
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ATATAGAAATTGTACGAGGAAAAAATTTCAATCTGCATTAAAGATGCGAT
CATCTTCATGGAAGTTTAAACAATATGACAATTTATATTGCTTAGGGATG
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TTATCTACTTATGTATGTTTAAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TCCACCACACTTTTTAATGGTGAGGTATAAAATTTAGATCAAGCTTAATC
GCAACTTGTCACTTTTACAGCGTGCAGCCGTTACTTAACAACGAACTTTG
AGACCTAAGACGGAACTGGGTTGGACCAAATGAATTAATACTAGCACAAT
CCAAACGCCTTTGTCAGCTGCGAAGGTTTAGACGTTGTTTTTTGTTATGG
CGCTAAACGAAAATTGTTTGGTGTCATTAAAAAAAATGCCATCAATCAAC
ACAGTATATATTCCACAATCGTGGAAAAGGCTGTGTGTCCATATTAAGAT
CCGTACGAGAAGTTACAGCTTTGATGTAATTCGTCTGCCAACAATAGTCT
GGTCCATGTTATACTGAAGAAAAAAAACAAGAAAAAAACGTTGACTTCGC
TGTTTTGGACCAGGTTTTTAGCCTCCAAGCTCACTGCACNCTGTGTGTCC
ATATTAAGATCCGTACGAGAAGTTACAGCTTTGATGTAATTCGTCTGCCA
ACAATAGTCTGGTCCATGTTATACTGAAYAAAAAAAAAKAAGAAAAAAAC
GTTGACTTCGCTGTTTTGGACCAGGTTTTTAGCCTCCAAGCTCACTGCAC
CTCAATTCCYTGGACTTTTATGAGTGGGGTTCAGTTGAGCGATATACCAA
CAGATCATTCTGCTACAAAAATATGACCTGATGTCCTGGATAGGGAGAAA
TTCCGGAATTTAATATATGAGAGTGTCATCAAGACCTGCTCCTGTTTCTG
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AATTCAGCTTTCTTTTAGCATTGGTTTTTATTAAAATAGGATTACTTCTT
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TTATGTTTGAACATAACATATAAATATATTCAAACGATAGCAGGCATATC
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GAGTCTAACCATATCTTTATGGATTATTTTCTCATATTAAGCATCATCGC
CAGATGTCTAAGTAGTCATCTCATTATTTCAATTTTTTTATATATCAGGG
AGCGAGTGTGAATACTTATCAAATTGGAGTCGTAATGGGATCTCCCCGCT
GTGAGTGAGTCAAATTGAGGGTCAGTATATATACAGGGTGTATCAAACGG
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CTATGACATTATTGTTTGAATAAAAACAGACCCAGTGTATTTACCTTAAA
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TGAACATTTGCTGGAGAACACCTCACAAAGAAACAGGGAGTAGAGGGTCC
GAGATTCGGAGTTCTTGTCTAGATTAAAGAATAAGATAAATACTAAGTCA
TAAGGAGGCACCCTGTAAATAATTACCAATTCTTGTTTAAGGTTAAGATG
NNNNNAGACAGACGATTATTAATATTATACACTGTTGATGATACGTTTTT
ATTCCCCTTGTTGAGGTGAATATGTGTATGTGTGTGTGTGCCTAAAAATG
ATGGATGAAATAAATTAAAACCATTTATGAGGCCTCATTTATTTCCATCT
GCAATCATAAAAAGTGCAAAATAAAAAAAATATATTAATTGCAAAATATA
CGTACATACAAATAGGTAAAAAACAAAAGAGTGAGAGAGAAGCTCTGGTT
TTTTTTCTGTATGTTATATTTTAGTTCCTTTATCTTTTTCGCGTGTGTGG
TCATGGACCTAGGGTATATTTAGATACAATATATTTATGTACGTATTTCT
TAACTCCCTTTTTTATTTTCTCTCTTTTTCTTTGCATAACCAAAGCAACA
AATGGTCAATAATTTAATTAGTCCCATGAAGAAAAATACACGAATACATT
ATTATTAGTATAATAATAATTTTTATGAGAGGCTTTTATGTCGGTTTTAT
TGTACTTTTTAAGAGAGATCCTGCGTGTGTTTGTCCGTGACAATTTTACC
TCATGAGATCAATATTAGAAAATACATTAGTCCTGTTCTTTGGATTACCA
AACTTTTATTATTACAGAGATCAATTTCTATAACTAAATTATTCATAATA
ACACTATTGAGTGTGTTGCAAGTTCCACTTATGTAGTCAAATTGATAAAT
GCCCTTTGTGTGGGACTATCGGGGTCAATATAACTCTCTTATATCGAATA
AAGGTTCTAATATATAGTGAATATTCTGAGGTATCTTAATGCACCCCACA
AATTGCAATACAAAGTCCATACTGGAATAAAATCTCTCTTTGCATATATA
TATGAAGTACAAGATCAGTTGGGATTTTCTCTTTTTCTTGAAATGTGTTC
TAGATTGTTTTATATTTTTTGCACCACATAAACAATTTTATTGATCAGAC
GTTGTGTTGAAAACTCCTCATAAATATGTATATAGAGGTGAGATACAACA
GTAAAGATAGTTTCACTTATAGTATGAAAACATAAAAATGCGAAATTTTT
TTAACAATCCATAGGTATTTACAAAAAATTAAATTTTTTGGAAAAAAATT
TCAAAAATTAATTTTAAAGTGTTAAATTTTTTTGCAAAAAAATTTGAAAA
AATAATTTTTTTTTTGAATTTTTTTTTTTGCAAAACAAATTAAATATTAA
AATATTTGAATTAAAAATTCAAATATTAAATTTTCTAGTAAAAAGCAGAA
ATTCCTTAATTTTTTTTTCAAAAGAATATAATATTTGATTTTTTTATTCA
AAAACTTAATATAAAAAATTAAATTTTTAAATCTTTATTCAGAAACTTAA
TATTGGAAGTTAAATTTTGAATTCTTAACAAAAAAAATTAAATTTTTGAT
ATATTTTGTGAATAGCTATAAATTTTTGAAATTTTGTTAAAAAAATTTGA
GTTTTTGGAATGTAAAAAAATCCAAAAACCAAGCCCCTCCACCCCTCCTA
AAAAAATAAAGAGATATAATTCTGTGGACGTCACTTAACAAGTACTATAA
GGGTATTTGGAAATTTAAGCACTTCCAGTATGTTGAAAACCGAAAAATGA
TGGGCTCTTATAACTCTCCGTCATTCATGAACATACAACTCTTGTTTACA
TTTAGATTTTCTCGACTTAAGAATGAAGGAATAATTGCAACAGCTTCGAA
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GCATTTCAGGTCATATTTAATTCAACTCATCAAATTACTAAAATATGTAC
TTGAATTATAAGTAGACAGGGTTGCACTCAATAGGAATTGGATTTTCGTA
GAGGGCGAGGAGAAGGCGGGAGCAAAAACTTATTGTACAAAATGAATGAA
GGCCCTTGTTACTATCAACGGTTTGTTAAATGATTTGAGGTGAGAAAAGC
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TCCTGCAGAGTACTCTTGCATGAAAGCCGTCGTTTTGTTCACAACGGGTA
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TTGTTTTGTATCGGTGGAATGAATATTATTATTAACCCTTGGAGTAGAGT
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TGATGGATCATGATGAAAGAGTCCAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAACAA
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AGTCTTGAATGTGAGTGTATATATAAGTGTATGTATGTAGTCAAGATAAA
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TGGTTATTTTAATGCATAGTTTACATCGCACGCCTTATTTTGAAGAAGAA
AAGAAATAAAAAAATAAAAAACAATTCCAGGAAATACGAAGTATAGTATT
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GAATGCAAAAATTCAATCTCAAGAGGGCGCGGTTTAATCCAGTTCATATT
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SGGTTAACCCCGATTAATATTTTAAGGAAGTAAAAGACAAATCATCATAA
ACTTTTTATTATGAGTTAGTTTANNNNNTTGAATAATAATAATTAGACTT
GTATCGGTCTTTCATATGGGACTTGAAATCGATTCCATACATAGGCGTAG
TTTGATATTTGTAAGAGGGAGGGGATGTGTATGGGGGGGGGGGGGCCTTT
ATTTATATATGAGGTGTATAATATATATCCTAAAAATTAAAAATAATTAA
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TTTAAATTTATGAAGCTGAAAAATGAAGAATTTATTTTTTATAAAAAAAA
TGTAATGTGATGATATCTTTGAAAGTAGTACACATTATAATTCGTAAATA
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CTGGCGGAGCAAAAAATTAGAAATAAAAACAAAAAAAATTATTTTTTTTA
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CTGAGCAATGCAGGGTACTTCCTTTGTTTAATAATAACACTCTCATCTTA
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