EMLSAT00000010003, EMLSAT00000010003-705850 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010003
Unique NameEMLSAT00000010003-705850
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s656supercontigLSalAtl2s656:177518..206284 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010003 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010003EMLSAG00000010003-692769Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000044497EMLSAE00000044497-753425Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044498EMLSAE00000044498-753426Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044499EMLSAE00000044499-753427Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044500EMLSAE00000044500-753428Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044501EMLSAE00000044501-753429Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044502EMLSAE00000044502-753430Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044503EMLSAE00000044503-753431Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044504EMLSAE00000044504-753432Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044505EMLSAE00000044505-753433Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044506EMLSAE00000044506-753434Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044507EMLSAE00000044507-753435Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044508EMLSAE00000044508-753436Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044509EMLSAE00000044509-753437Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044510EMLSAE00000044510-753438Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044511EMLSAE00000044511-753439Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044512EMLSAE00000044512-753440Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044513EMLSAE00000044513-753441Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044514EMLSAE00000044514-753442Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044515EMLSAE00000044515-753443Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044516EMLSAE00000044516-753444Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044517EMLSAE00000044517-753445Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044518EMLSAE00000044518-753446Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044519EMLSAE00000044519-753447Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044520EMLSAE00000044520-753448Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773926auto773926Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010003EMLSAP00000010003Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010003

>EMLSAP00000010003 ID=EMLSAP00000010003|Name=EMLSAP00000010003|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=2054bp
MCITLLVVVVLSFVRVGITQHPYDYRRSSGLFPSVFNLAEGADIFSNTTC
GASEQEIYCKLLSETSSARQCGICDAAKKDKNHPIEFAIDGNENTWWQAS
SLQTGLESNYATITVDLKEVFQVAYVLITTGISPRPGNWLLERSIDGKIW
APWQFFADSDEECWTAFGVEPRKDKPSYHSDAEVICTSYYSKLEPLEHAQ
IHVSLVNGRPGASGPSRTLVDFIQARFIRFRFLKLQLLPSDSYLMSGFNA
IRADDSIATQARRYFYSIKDITIGGQCPCNGHANECPVDHETMKYECKCK
HNTCGTLCNQCCPMYNQKRWRPGKFISGNYCERCQCFNHADECYFDPQVE
AERKSLNSDGKYEGGGVCINCRDETIGINCESCREGFYRPNDMSQFDSKP
CRRCDCDSINNPGSTGSCYPNQVHDSEKRGGDCVCKEGYTGKKCEKCDRG
YHGYPNCIPCTCNLAGTKNGACIGYCECKDNVIGSSCDACKPGYFALHES
NSNGCLKCFCYGVTEDCEAAYLGVEVLQHGEGWKVTDLRRSVVVEPYWST
VTNGVTVAEEDMQGIETYFWEAPSQYIGNRLVSYGQEIRVRTSWHKARGD
TAGSPIRAPEVILEGENMMIAYGTTRYKNRNNATINVNLVEEGWYHIPSN
LRQIKASGSDNEIPDFVGLPVSKVEFMKVLGSMARMLFRSKYHTDQLEGT
LHTAEIEFGSERSVSLKKTLAVERCICPPGYEGLSCEQCSYGYTRYNETL
YEGMCRKCNCNGHAASCDPYTLKCAECQHNTIGDQCERCIDGFYGNPLSG
TPADCKPCKCPLDISSNNFSPTCQEVSSLDYDKYSLAPNEYVCNACPRGY
AGPHCERCENGYFGNPLAVGNVCKPCDCNGNSNPYSPDWCDHRTGQCLIC
MGNTIGRKCERCMPGFYGNALAGRCLPCDCNPYGSSSTECHPTTGQCNCR
EKKYLGRTCSKCKDGFGNLRAGCRQCNCNPTGSVSDFCDAHSGQCHCRPG
IDGLTCDKCKPFNFGFSIDGCRPCNCHPHGSKEEQCDLFNGQCYCKDNVH
GSQCEECMVNYWNINSKKGCTKCRCDMMGSAHNDCDDISGQCACKPGVGG
TLCDACVVGFWGFSPTGCKKCFPCDKPGHVCDPDTGRCICPPLTHGDDCS
LCASGTWDYHSYKGCQYCKCHSKGSLSEQCDLLNGQCKCMTGFEGQLCDQ
CSPGYYNFPNCRPCNCNPAGTASGECFDDGLCKCNEDGACSCKENVEGKK
CASCKLGTFGLSLENPLGCTNCFCFDRTQSCTQADYFWTQLAFPEGRTLS
ITRGNSPLNVTEGLTLIPFQEFDVSIGILGPYEEPLYWDLTTQFLGDKLT
SYNGYIRFTIHSDGELSFKSAPLFPLVQIQGSRTSVNRETLMIVLQNVKK
ILVRATDKMKATKIQLKGVTLDVGKPLLDQGRSLRLAVGVEQCDCPKEYS
SSSCQNPGKGYYRNYDKHEEETITTSFIKYVGNSRQCSCNGRTNECAPET
GLCLNCRDNTAGLHCDICTSGYYGSPNQPRGCQPCKCPSASRNFATTCSV
NEEGIFFCECQKGYTGPKCXQCDYGYYGSPKSENGKCVPCNCNELGSLSD
QCHSKTGQCSCASLDIVGRDCSQCQPRHILTRNQKCQNCEDSGCTSYLLN
FVDLMENVLWAANVTELDPAPNIRLTNLKRRSSALEDDINAALRNKNRMI
QIHKIGSGTEPQSEIIQLEVNKNLKTAKKLAYEAENIYQESINIETDISI
IRKNLRNIVDRLNSYSVSGIGSEASINQVLFEAKQWLNEMKTHNFGEIDI
KARTELSHARILHENMKKLIYGTNEIPRLREDLYKGENKLNDLLKFIDHG
LGNSRFTANKNRKNNLTLYEILNSFTKTILLNQKSDKNIFTSLNMYQNGH
DVLGEAWESFSALPDKYKILSGSVGKTLEDEEIGISGVVEDYRQRYIEXC
EQHGLQLQKIAQELAKMLQNTVGNHVEQTLKAVNVYGNIVTAIERAQIAS
KSALKKANLALNKAKNDNKPLSNRAEEVRIKSKDLLQEAEGLKKKFFGFK
ILLE
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mRNA from alignment at LSalAtl2s656:177518..206284+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010003-705850 ID=EMLSAT00000010003-705850|Name=EMLSAT00000010003|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=28767bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s656:177518..206284+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTGATTTATTAAATCATCTGTGATAAATTTCTATTTTGAAAGTATTTGGT TATTTAGCTGAAACCATAGTTTTTATAAAAATGGTATCATTGCATTAAAG GACAGCATTTATTTCAGGATGTGCATTACATTATTGGTCGTGGTAGTATT ATCCTTTGTACGAGTAGGAATCACTCAGCATCCCTATGGTAAGTGTTACT CTAATGGTAAGAAAATCGGGCTATTTACATTATTTTATGTTCTTTTAGAT TATCGAAGATCTTCTGGTCTTTTCCCTTCCGTCTTCAACTTAGCAGAGGG AGCAGATATTTTCAGTAATACGACCTGTGGAGCCTCTGAACAAGAAATTT ACTGTAAACTACTCTCTGAAACCTCTTCTGCTCGTCAATGTGGAATTTGT GATGCTGCAAAGAAAGATAAAAATCACCCTATTGAGTTTGCTATAGACGG AAATGAAAACACATGGTGGCAGGCCTCATCCCTACAAACTGGCCTCGAAT CCAACTATGCAACAATTACAGTTGACCTAAAAGAGGTTTTTCAAGTTGCA TATGTATTAATAACGACAGGAATAAGTCCAAGACCCGGAAATTGGCTTCT TGAAAGGTCAATAGATGGAAAAATTTGGGCTCCCTGGCAGTTCTTTGCGG ATTCAGATGAAGAATGTTGGACTGCTTTTGGCGTAGAACCAAGAAAGGAT AAACCCTCTTATCATTCGGATGCAGAAGTTATTTGTACATCATATTATTC CAAATTAGAACCCCTGGAGCATGCACAAGTACTGCAATTAGAACACATCC AATATGATAATCATTTTACATATTCCCATCTCTTCATTTTCAGATACATG TTAGTCTTGTAAATGGCCGTCCCGGAGCATCAGGTCCATCTCGAACGCTC GTGGATTTTATTCAAGCAAGATTTATACGCTTTCGATTTTTAAAACTTCA GCTTTTACCTTCAGATTCTTATTTAATGAGTGGATTTAATGCTATTCGAG CAGATGATTCCATTGCAACTCAGGCCAGGCGTTATTTTTATAGTATTAAG GACATTACGATTGGTGGACAATGTCCATGTAATGGACATGCAAATGAATG CCCAGTTGATCATGAAACTATGGTAAGAGCCCTTAATTTAATGTTACCTG AAATCAAAAACAAAACCTAATATATGTATTGTACTTGAATATGATACATG TATGCCCACATATGCATTAATATATGCACTTACATATAAATATTATGTAC AATTCCGCTCTCCAAAATTTTAAATAAAATGATGCTTTAGTTGGAGGATT AGATTTATGGATAAAAATATCAATAGTAAATTTATTATGTATTTACGAGG GTGGTCTGAAAAGTTTCCGACCTAACAAAGATATAAGACATTTTTTCTGA ATTTTTATTTGTCTACATAGTCTTCTTGTAACTCTACACACTTCTTCCAG TGATTCTCCCATCTCTTGATCATTTCCAAATAATATTCAGCCTTTTTCTC TCTAAAATAATTGTTCACAAGACACTTTTGCTTTTTGCTCCATTATAACG AGTTGTATTGACTTAGACACGTCAAATTTTAACTCAATAAATCGTTATAC ATATTTCTGCAATTTTATGAATCTAGTTAAAGGCTACACTTTCAAAAATA AATATTTAATGACAAGACTACATTCGATTTTGTCCATTTTCCCAAAAACA GTCACATCAACCCACTCAAACGACTTTATTTAACAATTGTGCGTCCAAAA CGGACGAAACTTTAGGGAAGGGCTGTCAATAGATTCTAGATAGATGTGAC TAGCCTTTATTTAGGAGTACTCCCATCTTCACGTTGAGGTCTGACACCTT TCAGACAACCCTCGTTTAGGCTGTGTACAAGTTGCAATTTTATACAAGTT ACAACTGGTATTATCAGTTTGTACAACTATTACCAACTATTAATTGACGT CATTTTGATCTATTAAAATTACTTGTTTGTTGTAGACAGAGTGGATATTT TAAATGCAGAGAATGTATATTACAATAATTTCCCCAAAAATGAATTCAGC AATTCACGAATCTTTTACTCTGACATGACGGGGTCCATAGTGAAGGACAT CCCTTAAAACAACTAGTACAAGCTTCAACCACAGTCTAAAACCTGGTCCG AGCCTGGTAACGGCATTTATGACTAAATTTTTATCAATGTTGGCCACTGC CTTGAGAATAGAGACCAAAAAGGAGTCAACAGTGCTATGTGCACGATTAA TGGACTCTCTCTTCAGACGCCAACACATAGTAATCCTAGGGGTTCAGGTC AGGGTAGCTAGGAGACCACATTTCCTTTGCCAAAAACCTGAAGGTCTTAA AAATGTTGGTTTTCCGTAATAAATCAGGATTCAATTACCCGATTTGGACA AATCCCAACAGTTTAAATTTCTAATTTGACATCAGATCTGTTAAAATCAA TTTAAGCTCTTTAACATAATTATTAATTGAGTTATTTGCGTACTTGGGTA TTCAGAGAACATCTCAAGTATCTTGTATTTTTTCTTAGACAGGTTTGTCG CCTAAATCTGATGAGCATACTTTCATAAGTATAGATCTCAGGGTTACTAA GATGTTAAGGTCTAAGCTTGTTCCGGATTTAAAATCCCTATCCTCCTTTT AAGAATAATGGTACTGTTAGCTTTTGAACACCTTGCAGAGCGACAGAATA CAGATCAATTAATCGTTTAACATTCCTTGAGAGTTGAGGGATCTGGCTTT TAAAATTGACTCTAAGGTACAGTGGTGGGTAGCAAAACGTGGACTCGAGA GGTTTCTGACCTTCAAAACCTTTTTCAGAAGGTTGCGTGGGGTCCTTGTG 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GTTATTTTTTAGTTTTTAAATATATTTTTGGTTTATCATCAGTTCAAAAA ATAAATCATATACTTTGATTTGTACATTTGAATAAAATATCAAAAATACT TGTTATGATGAATATCTTAGAATTCCCCTTCAAAAACATATAGTAATATG CTTAAAAGCAAAATTAATTTATAATATTCAGTGAAAAATGAAAATGACAT GCACACAATACTGTTTACTATAATAATAATACTATTAATCAAGTAATCAT CCTTCAACCCTTCGATCCTCCCATTCTTTTTTAATTCTCTACTAAAGATT TACTTAATATGTTATGTTTTATATGTTGTACAATGTACATCCTTTGACAA AAAGATGACTCTTAACTTTAACGGATAAAATGTTCAATTTAAACTTTACT TTTAGTAATTTTTTTGTCATTATAGAAAAATGTTAAAAGTAATATATGTA TCACTCTCCGATTGAAACACTTATGTTACGCAGGTTTTTTTAATCAAAAA CATTTTTATTTCAGTTCAAAAATGTTTTCTTGATGGAAAATATATTAATT GTAGTACGTGACTTCACATAGATTTTCAAAACCAACAATTCGTCAATCAT TTTGATGGGTGGGTAATCAAGTTTTTCTAAACATCCCCACTTTTATATAG CATGAAATAGTTAGTAATACAAACCAATAATAGTTATTTGACTAATAATA GGAATGATTTTTCAGTTTTACTCGCCTGAAAATAATTTCAATAACGAAAT AGCATTTGCAAGTTCAAAATAAAACCGAATGAATCAAATAATTGTAATAT AATTTTGATACATTTTAAATATTGTCTTCAATCAAACAACTTATAATTAG CTCGTATGGCACACACTTAGTAATTTATTTATTTTTGTAAAGATCCCAGA TTTTCGCTGCTTAGAAGAGGATTCCTGAGTCAATAAGTTTGGAAATTACA 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