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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s656 | supercontig | LSalAtl2s656:177518..206284 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010003 >EMLSAP00000010003 ID=EMLSAP00000010003|Name=EMLSAP00000010003|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=2054bp
MCITLLVVVVLSFVRVGITQHPYDYRRSSGLFPSVFNLAEGADIFSNTTC GASEQEIYCKLLSETSSARQCGICDAAKKDKNHPIEFAIDGNENTWWQAS SLQTGLESNYATITVDLKEVFQVAYVLITTGISPRPGNWLLERSIDGKIW APWQFFADSDEECWTAFGVEPRKDKPSYHSDAEVICTSYYSKLEPLEHAQ IHVSLVNGRPGASGPSRTLVDFIQARFIRFRFLKLQLLPSDSYLMSGFNA IRADDSIATQARRYFYSIKDITIGGQCPCNGHANECPVDHETMKYECKCK HNTCGTLCNQCCPMYNQKRWRPGKFISGNYCERCQCFNHADECYFDPQVE AERKSLNSDGKYEGGGVCINCRDETIGINCESCREGFYRPNDMSQFDSKP CRRCDCDSINNPGSTGSCYPNQVHDSEKRGGDCVCKEGYTGKKCEKCDRG YHGYPNCIPCTCNLAGTKNGACIGYCECKDNVIGSSCDACKPGYFALHES NSNGCLKCFCYGVTEDCEAAYLGVEVLQHGEGWKVTDLRRSVVVEPYWST VTNGVTVAEEDMQGIETYFWEAPSQYIGNRLVSYGQEIRVRTSWHKARGD TAGSPIRAPEVILEGENMMIAYGTTRYKNRNNATINVNLVEEGWYHIPSN LRQIKASGSDNEIPDFVGLPVSKVEFMKVLGSMARMLFRSKYHTDQLEGT LHTAEIEFGSERSVSLKKTLAVERCICPPGYEGLSCEQCSYGYTRYNETL YEGMCRKCNCNGHAASCDPYTLKCAECQHNTIGDQCERCIDGFYGNPLSG TPADCKPCKCPLDISSNNFSPTCQEVSSLDYDKYSLAPNEYVCNACPRGY AGPHCERCENGYFGNPLAVGNVCKPCDCNGNSNPYSPDWCDHRTGQCLIC MGNTIGRKCERCMPGFYGNALAGRCLPCDCNPYGSSSTECHPTTGQCNCR EKKYLGRTCSKCKDGFGNLRAGCRQCNCNPTGSVSDFCDAHSGQCHCRPG IDGLTCDKCKPFNFGFSIDGCRPCNCHPHGSKEEQCDLFNGQCYCKDNVH GSQCEECMVNYWNINSKKGCTKCRCDMMGSAHNDCDDISGQCACKPGVGG TLCDACVVGFWGFSPTGCKKCFPCDKPGHVCDPDTGRCICPPLTHGDDCS LCASGTWDYHSYKGCQYCKCHSKGSLSEQCDLLNGQCKCMTGFEGQLCDQ CSPGYYNFPNCRPCNCNPAGTASGECFDDGLCKCNEDGACSCKENVEGKK CASCKLGTFGLSLENPLGCTNCFCFDRTQSCTQADYFWTQLAFPEGRTLS ITRGNSPLNVTEGLTLIPFQEFDVSIGILGPYEEPLYWDLTTQFLGDKLT SYNGYIRFTIHSDGELSFKSAPLFPLVQIQGSRTSVNRETLMIVLQNVKK ILVRATDKMKATKIQLKGVTLDVGKPLLDQGRSLRLAVGVEQCDCPKEYS SSSCQNPGKGYYRNYDKHEEETITTSFIKYVGNSRQCSCNGRTNECAPET GLCLNCRDNTAGLHCDICTSGYYGSPNQPRGCQPCKCPSASRNFATTCSV NEEGIFFCECQKGYTGPKCXQCDYGYYGSPKSENGKCVPCNCNELGSLSD QCHSKTGQCSCASLDIVGRDCSQCQPRHILTRNQKCQNCEDSGCTSYLLN FVDLMENVLWAANVTELDPAPNIRLTNLKRRSSALEDDINAALRNKNRMI QIHKIGSGTEPQSEIIQLEVNKNLKTAKKLAYEAENIYQESINIETDISI IRKNLRNIVDRLNSYSVSGIGSEASINQVLFEAKQWLNEMKTHNFGEIDI KARTELSHARILHENMKKLIYGTNEIPRLREDLYKGENKLNDLLKFIDHG LGNSRFTANKNRKNNLTLYEILNSFTKTILLNQKSDKNIFTSLNMYQNGH DVLGEAWESFSALPDKYKILSGSVGKTLEDEEIGISGVVEDYRQRYIEXC EQHGLQLQKIAQELAKMLQNTVGNHVEQTLKAVNVYGNIVTAIERAQIAS KSALKKANLALNKAKNDNKPLSNRAEEVRIKSKDLLQEAEGLKKKFFGFK ILLE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s656:177518..206284+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010003-705850 ID=EMLSAT00000010003-705850|Name=EMLSAT00000010003|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=28767bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s656:177518..206284+ (Lepeophtheirus salmonis) CTGATTTATTAAATCATCTGTGATAAATTTCTATTTTGAAAGTATTTGGT
TATTTAGCTGAAACCATAGTTTTTATAAAAATGGTATCATTGCATTAAAG
GACAGCATTTATTTCAGGATGTGCATTACATTATTGGTCGTGGTAGTATT
ATCCTTTGTACGAGTAGGAATCACTCAGCATCCCTATGGTAAGTGTTACT
CTAATGGTAAGAAAATCGGGCTATTTACATTATTTTATGTTCTTTTAGAT
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GTGGATTTTATTCAAGCAAGATTTATACGCTTTCGATTTTTAAAACTTCA
GCTTTTACCTTCAGATTCTTATTTAATGAGTGGATTTAATGCTATTCGAG
CAGATGATTCCATTGCAACTCAGGCCAGGCGTTATTTTTATAGTATTAAG
GACATTACGATTGGTGGACAATGTCCATGTAATGGACATGCAAATGAATG
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AAATCAAAAACAAAACCTAATATATGTATTGTACTTGAATATGATACATG
TATGCCCACATATGCATTAATATATGCACTTACATATAAATATTATGTAC
AATTCCGCTCTCCAAAATTTTAAATAAAATGATGCTTTAGTTGGAGGATT
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ATTTTTATTTGTCTACATAGTCTTCTTGTAACTCTACACACTTCTTCCAG
TGATTCTCCCATCTCTTGATCATTTCCAAATAATATTCAGCCTTTTTCTC
TCTAAAATAATTGTTCACAAGACACTTTTGCTTTTTGCTCCATTATAACG
AGTTGTATTGACTTAGACACGTCAAATTTTAACTCAATAAATCGTTATAC
ATATTTCTGCAATTTTATGAATCTAGTTAAAGGCTACACTTTCAAAAATA
AATATTTAATGACAAGACTACATTCGATTTTGTCCATTTTCCCAAAAACA
GTCACATCAACCCACTCAAACGACTTTATTTAACAATTGTGCGTCCAAAA
CGGACGAAACTTTAGGGAAGGGCTGTCAATAGATTCTAGATAGATGTGAC
TAGCCTTTATTTAGGAGTACTCCCATCTTCACGTTGAGGTCTGACACCTT
TCAGACAACCCTCGTTTAGGCTGTGTACAAGTTGCAATTTTATACAAGTT
ACAACTGGTATTATCAGTTTGTACAACTATTACCAACTATTAATTGACGT
CATTTTGATCTATTAAAATTACTTGTTTGTTGTAGACAGAGTGGATATTT
TAAATGCAGAGAATGTATATTACAATAATTTCCCCAAAAATGAATTCAGC
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AGGGTAGCTAGGAGACCACATTTCCTTTGCCAAAAACCTGAAGGTCTTAA
AAATGTTGGTTTTCCGTAATAAATCAGGATTCAATTACCCGATTTGGACA
AATCCCAACAGTTTAAATTTCTAATTTGACATCAGATCTGTTAAAATCAA
TTTAAGCTCTTTAACATAATTATTAATTGAGTTATTTGCGTACTTGGGTA
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AAGAATAATGGTACTGTTAGCTTTTGAACACCTTGCAGAGCGACAGAATA
CAGATCAATTAATCGTTTAACATTCCTTGAGAGTTGAGGGATCTGGCTTT
TAAAATTGACTCTAAGGTACAGTGGTGGGTAGCAAAACGTGGACTCGAGA
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GTTGAGGACAATCTCAAGTTGCCCGCTAAAGTAGAACTCATAATTCATCT
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TACTCATATTAGGAAATTTCAGCTCTTTTTGTTCCACATAATTCTTGTAA
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ATAGCATTAAATAATTGCATCTCTCAATCTTTCAAAAATGTCAGAAATGT
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TGGACTACAAAACGTGGACTGTTAATTAATATTCATTTTCTCATTAATAT
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GCATAAACAAACTGTCTATAATAAACATTTCGTTATCTCATTATGAGAGG
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GAGGCTAACATGAAGAATGATGAAGACCTCTCCAGGAAAGCACGAAGTGT
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AGGACTACCGGGAGGGCCGTGAAGGCGACTTTAGATTGTCTTCATACACA
AGGAACCCAAACCATCTTATAACAAAGTCCACGTTTTGATTCCCAACTCT
GTATATAATACATATTTAGTATATGTATAAACGTTCAAGGGACTATAAAT
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GAAAATCTCCACGATTATATATATGGTAGCGAGCAAATCTTAAACTGCAA
TAAAAATGTTTTTGATTAAAAAAAAACTTGCGTAGCGTAAGTGTTTCAAT
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TTTCATCACTGAAAATTATTATAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGTGATAAATGTGAAAAGGTAATC
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GTTATTTTTTAGTTTTTAAATATATTTTTGGTTTATCATCAGTTCAAAAA
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TGTTATGATGAATATCTTAGAATTCCCCTTCAAAAACATATAGTAATATG
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CCTTCAACCCTTCGATCCTCCCATTCTTTTTTAATTCTCTACTAAAGATT
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TCAGTCGATTATTCTGTCGTTTTATGGGACTCCATCGTTCTTATATATAG
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GTAGAGGCAATGATTCACGAGGTCAAAAGTCACTATCATAGACCTTGATG
TGAAACGCATTTGCACAATGCACAACTCTTCCATTAAATAAGATGATATC
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GTACCTTTCCCATTCCTTTAAGTAGTTTGCCTCACTACCCCCAACGCCTT
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TTTTACAAGTAATTTCAGATTGTACAAGTAAAGATTTCTACGTCTAATTA
TGCTTTATTCAACTACATATATATCATTGTGTCAGCAACTAATAGTTGAT
TGTGTCATTTCATTTTGATCTACTAAGATTACCTATTTATTATATACTAA
AGAATCATATTTCTGTTGCGATTTGAACACTTTCTTTAAGCTTTAACTCA
TCTTATTTTTATTCAAATGACTATAAGCTTATGTTAGAATCAAATGTGCT
TAAGACTTTAAGTTACAAACGATGCACTCGATCTATCTACATTGGTTTAA
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TATTCTGGTAGATTAAATATTGTAAATAATAAATATGCTTCTAATTTTCC
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GGAAGCAGAGCGAAAATCTTTGAACTCTGATGGCAAATATGAAGGTGGAG
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TTGCCCTTCATGAATCTAATTCTAATGGTTGTCTGAAGTGTTTTTGCTAT
GGAGTAACGGAGGATTGTGAAGCCGCATATTTAGGAGTAGAAGTATTGCA
GCATGGAGAAGGTATCTAGATTGATATGGATTCAAATAGATATAAGCATG
AACTGTTAATTCTACTTTTTTCTTTTATAGGATGGAAAGTTACTGATCTA
CGACGTTCCGTGGTTGTAGAACCATATTGGTCAACCGTAACAAATGGAGT
AACTGTTGCTGAAGAGGATATGCAAGGAATAGAAACTTATTTTTGGGAAG
CTCCCTCTCAATACATTGGAAATCGACTAGTAAGCTATGGTCAGGAAATT
CGAGTGAGAACTTCATGGCATAAAGCAAGAGGAGATACTGCAGGATCTCC
AATACGAGCTCCAGAAGTGATTTTAGAGGTAAATATTCATTTTTTTAAAG
ATTTTGTTTTAGAAAAATATTTTGACAAAATTAGGGGGAAAACATGATGA
TTGCATATGGAACAACTCGATATAAAAACCGAAACAATGCCACAATCAAT
GTAAACCTTGTTGAAGAAGGATGGTATCATATACCCAGCAATCTTAGGCA
AATAAAAGCTAGTGGATCAGATAATGAAATTCCTGATTTTGTGGGACTCC
CCGTCTCCAAAGTTGAATTCATGAAAGTCCTAGGATCCATGGCAAGGATG
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ACTACACACGGCAGAAATTGAGTTTGGATCAGAACGGAGCGTGAGTTTAA
AAAAAACTTTGGCAGTGGAACGTTGCATTTGTCCACCTGGATATGAAGGC
CTTTCCTGTGAACAGTGTAGCTATGGCTATACCCGCTACAATGAAACACT
CTACGAAGGAATGTGTAGAAAATGCAACTGTAATGGGCATGCTGCTTCCT
GTGATCCTTACACCCTGAAATGTGCTGTAAGTTTCATACACAAGTAGTAG
TCTAAAATACTAGCCTCTTTATGCAAAACAAACAGGAGTGCCAACATAAC
ACTATTGGAGATCAATGTGAGCGTTGTATTGATGGCTTCTATGGAAATCC
TCTTAGTGGAACACCGGCTGATTGTAAGCCGTGTAAATGCCCATTGGATA
TTTCATCAAATAATTTCAGTCCTACATGCCAAGAAGTGTCCAGCTTGGAC
TATGACAAATATTCTCTTGCCCCAAACGAATATGTGTGTAATGCATGTCC
ACGGGGTTATGCTGGACCACACTGTGAGAGGTCAGTCTTCATATATATTT
TCAGATAATATTTTAAATAAATAAATGTGATTGAGCATAAAAGAGACATA
ATTACATGATATATCTCTTTATATTTAAATATATATCAATGAAATATACA
TGAAGGTATCAAAATGATTCCCAAAAAACATACATAGATATATTTTTTCC
ATCTCCATCTTATATATCAATCATATGTTTTTTTCAAATTTTAATGTATT
TTATAAACGAAATATCTTAAAGTACTTGCTATTACCCCCAATGCGTCATA
TTTGAGTTTACATTTAAGTAAATACCCACAGCCCCAGTTTTGATAGGAAT
TTTTAGAAAAATGAGACTGTCTAATATTCTAATAATCATTTACAATTGTT
TTTATCTATCATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
TTTTTACGACGACCACAAAGGAGAAGAAGTTGTCTAGAATGGTCAAGCTT
CTTTTGAGTGTGTCCATTAACATGTGGCCTCCCTGCTAGTCGGGGGAGCT
GCCAGCAACAAGTCCAAGTTGTGATTTTAAACCAATTCACGCATTCTATT
CATTCTAATAATTTATACTATTGCAAATATTTCTCACACAAAACCAATGG
TTTATTTGAGCCATTGGTTGTATAAAGGGGTTAAAATCTGTAAACAATTA
AATGAAGTTTCTATTTTTAATTACTAAACAGTTCTTGTATTCTAATTTTA
AGATTGAATATATTATATAAGCATTKCTGCCATAGAAACCACTGAATGTG
GGGAAAAATATGGAAACAAATTAAACCTCTCCTATTGGCTATAGAGTATC
TTTAATATTTAAATAATTCTGTATATATTGGTTAGATATTAAGATAATCT
CTTAGTCTAWTTGTTTGATTTTTACAGCCAATAGTGCAGTTAAACCATTG
GTTTAGGTTAAGAAATTCATTTTTACAATAATAATTTTATGGAAATGAGT
ATTATAAGTAAATTGGCTCAAAATAACAAGATTCCCTTGATTTAATAAGC
ATTACCCCACTGAAAACAATTGAATGTGGCATTTGATTACATAATTAGCA
AAGTATAGGCTCTCGAGCCTCCTGAGCACCTCTGTCCAAAGGTTTTGTGG
GGTACTCGTGAGTGAGGGCAACCCAAAGTCGCCCTTCACAGCCCTCTTGA
TTGTCCTATCAGCCACGGATAAGTCGTAAACAAAGCAATTGATCAATTTG
ATGGAGTTCTTCTTGATCTTCTTCTCAAAGCTTGAAAGGGACTCTGGATC
TTCTTTAAATCATATCTTGATCTTGGCCACCTTGAAAATAAGGCTCTTGG
AGCACTTCACAATGTCTATAATCCTATCTGCAGCAACTACAACATCTAGG
AAATCTGAGATGCGATGCTTTTTGTTTTTTTTGCTCACTTATGATAACGA
AAGATTTAATACAGTTTGTTTATGCACAAAAAATAGCTGAACCAGAATGT
CAAAAGATAATTACTAAACCTTCCTACTTTAGTTAGAAAATTAACATTAA
TTAAAAGTCCACGCTTTGCTCACGAACCCTATAAATATGAGCTAATTAAA
CCTCTCAAATCTCCCAAACCCATAGKCCTGCCACACTAATCTTTTTTTCG
AAAGCGATAAATTAATTTGAGCTGGATTTGATAAAAAATATTGAAATTAG
AGAATGTGATTTTTGTGACATTTAAAAAATATGGCGAAAGTGAAGAATAC
TTTTTTAATAACAGAATTTAAAAAAAAATGTAGATAGTATTATGTTACAT
AACTATGGAATAATGTATTTCATGAATCCATCAGTTGAGTTGTTTACGAA
CTACAATACACAGTCCAAGGGGTCTTAAAGACGACTTTTGATCCAATTCA
TCATTTAAAAGAGCTCAAAAGTAGATGAAGTTAAAGATCTGAAATTTCAT
TATTGAGATCCAAATCATAGTTTATTTGACATCCCTACTAAATTTTATTC
AAATTGAGTTAAAAAAGTAAAAATTTAATTAAAAAGTAAATTTTTCATGC
ATTGACCATATATGTATTAAGCATATACTAACTCCAGAATTTCCACTTCA
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ATTAAAATTGATATCAAAAAGTGCTTGGTGAGAATATTTTGAATAACCAT
ATACTTTTTTTTTCAATAAAAAAAACAGGAACACAATATCATTTTCCCTC
CTGTCATTCCGATTGTTCAAGTAAATGTCGCCGATAAACTAATTTAAACG
GTTAAAACTGAGTTATTATCAGACAATTGAAATTCTGCTTTAGATATACT
TTCGACATTAACATGTACTGATCTAATAATTATTACTTTACATAAAGATG
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