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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s659 | supercontig | LSalAtl2s659:208051..233740 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010014 >EMLSAP00000010014 ID=EMLSAP00000010014|Name=EMLSAP00000010014|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=316bp
MKHLGSTKWILSSLLVVVLCCPKSLFGVTFRENDQRIPVDLLWERLLTDG DLRLYNDPTPEQDDLLQGPYLKDNYPQLSREAAEFGVNPSYNSFYEPSLK KIELEERNPMSDEMLERKRLDDENVDQYQLEVAXKMNEKKAEISMLPRAL SSTHEQDIQRSDIFFISIVAGISALAVMTIVGAGFCYHKVQKNSRAGEEV EYPAYGVTGPGKEISPTSGDRKLAQSAQMYHYQHQKQQMIAFDRSSGSER GTPTGGIKGGPRSNVGAMLSDGDSDDGEEGDYTVYECPGLAPTGEMEVRN PLFQDDNETPKNGRVP back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s659:208051..233740+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010014-705861 ID=EMLSAT00000010014-705861|Name=EMLSAT00000010014|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25690bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s659:208051..233740+ (Lepeophtheirus salmonis) TTTAATAGCTAGATCCAATTTTACAATAAGACCGGTCCAGAAGGAAGTTA
TCTACAATTAGTTAAATTTATATCAGTCTCAGACCGGTCTAGGACTTCCA
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CACAACTTTCAAGAGAGGCTGCAGAGTTTGGAGTGAATCCCTCCTACAAT
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TATGAGTAAGAAAATGAGTTTAAACCTTTGATGTTTATTTTTAATCCCTT
GTGTAGGTGATGAAATGTTGGAAAGAAAGCGTTTGGATGATGAGAATGTG
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GATATCCATGCTTCCTCGAGCTCTTTCCTCTACACATGAGCAGGATATAC
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CTTCTAATAATTTTCATCTTCTACACTTATGTTTGGCCATTGGCCATGGG
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GCCATGTTAAAACAAAAAAAAACGAAAATAAGCATCTAAAGAACAATTAA
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TGTCGTGTTTAAGTCTCGCTAATGTKGTTACTTTATTGTATCACGCAACC
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ATTTTTCACAGCTTAACAAGAGATAATTGAAATTCAATCAATCAACGTTC
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ATTTATTTAACTTTAATACTGTATCAATGTTTACTGTTTAATGGCTGMAT
CAAAGCTGGGAATCCGGACTTCAGTTCTACTTAGGTCTACAATTTCAAAT
TCGACATTGAATGGATCTTAATATACTCGAGACATAATTGAGTTTCGTAA
ACAGCTCTAGACGGCGGCGCTGGATTGTAATATATAAAGTGGACGTCAAA
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ATTTTTTTTCAGCTTGGAAGTACTTTACAGACTTTTCTTGCTTTTTTTAA
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GTAGTAGATTACAATCTTCAGTGAGCTATGGGAAAGGATAGAAACAAAAG
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ACGCAAGCAAATTCGCCATTTCCACTTTTATAGTGTCAGGGAACTATGTT
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ATTAAAATAGAGAGGTTTTGGGAGTTCTTCCTGCATATTCTGACTTTTTT
GTCCTTTCTACATAAGTAAACTATAATAAGCAGTTGTCATATCTTTCATC
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CAAAATTGAGGTGGAAGAGATTATGGACATTATGAAGTGCTCCAGGATCC
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TATCTAACGAGTATGACGAGGACAAGGGAACAATCAGGAGGGCTGTGAAG
GAGGACTTGGGATTGTCCTCTTTCACAGGGACCCCACGCCACCTGTTGAT
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GGAGCAAGGCAAATGGATACACAGTAAAACATTCTCTGATGAGAAGATTT
TCACTGTGGACCAGGTCTACAACCGCTGGAACGGCCGTTAGTTTGGGGGA
TCACCAGAAGAGGTCAAGGGGGTTTTCCATACAAAACATCCGCCCCAAAC
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TTTTTAAGGGAAGAAAATCGCCTAGGAGACCTACTACTAGGTGCTGAGGT
TCACCATACTGCCGTGGCTCAAGGGCACCTATCCAGAGGACAACTATGTG
TGGACCCAAGATGGTGCACCCTCACACACATTGGCCAAATGGCAGAAGTT
CTACGCCAACAACATAGTTAATTTTTGGCCCATGGACATGTGGCCATCAT
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AGGGAGACTAACTGGACATCTCACCCGAACGTGGACTCCCTAATGGCCAC
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CATATTGAGTGAACATGTTCGTAAAGGTCGTGTATCAAAGTTTTGTTAAA
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AAATCAGTCATTCAGTCCACGTTTTGCTGCCGAGCCTGTACAACTGATTG
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GACTTGTTGAAAAACTCCAAGAATGACTTCTAACTCGCTTATGCCGTCGA
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TGGGAATAGTGGCATCATACAGGAAGATGATACCCCGTATTGGTTCCCAA
AAGGCCTGAAAATTGGGACCATGGAGTACCAGGATGTTTTAAGGAGGTGG
TCTTGTTATGGGGGAGGTCCAACTATCCATTGTAAAAATTTGTGTTCCAG
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TCTCCCTCAGCACCCCCTCGTGCCACCATCACAAAATAGTTATCCCATGC
GTTCGTCTTTACTTTATCAGCCCTTTAAATCATATTTAAGAAGTGTTTAA
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ATCTTCTCTATAGCGCTCAGTGTTCAAAATATAATTCCGTTCCGTTCAAT
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TGGGAGTCAATCTGAGTGGAATATCATTCTCTATATGGAATCACCGAATA
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CAGCTGATTCATTTACTCAGTCATTTGGGTATCTTGTCGCCTCTATCTAT
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GATAATGCAAGGAGGGTGGGGGAGCTTCTTCTGATTAGTTAATTATTAAT
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ATATTGATGGCCCATTGTCACGCTATGTACTTTGAATGGTACGTGTAACT
CATTAAACCCCAAATCCATCACGCAAACAGGGTATATCAAAACTATTTCC
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ACCTCCATTAGCCTTAATGATGTGGCTAAACTTGGACTCAGTGTTCATAT
TGTCCCAAATCTCAGTGACAGGTGCTTTCATGGCCTCAGTGTTGAGGTGG
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ATTTATTCAGCCCAGTTTACTCTTAGGACCGGTGCTATCGATCTTTAGCA
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GATCCATATATCTCTGTAAATTTTTTTAAAACCGAAATTAAAATAATAAT
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TCTTGAAAAAAATCCAAAAATTATATTTTTTGGGAAAAATTCAAAAATCC
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AAAAATTCTTAGATATTCACAGAAAATAAATATTTTTGAAAAAAAAAATC
AAATATTAAATTTTTTTGTTAAAAGCAAAAACTTCTTAATCTTGTGGGTG
GGCTAGTACCTTTCCAGCCCACCTACTGCGGACGCCCCTGACATTCCCCA
TGAATAAAAATTCGCCAAGTTGTCGTCACACAACTTTTGAGATTTTTTTT
TTTTTTGACTAGTTACTTACAGGCTTACTCTCAAGGGCTTTGTTGTGGTC
CTTTAGCTTTTAAGTCATCGTAATAATACCCTTGAAGCAGGGATAAGATA
CAGAAGATCTCGGCATAACTCATTTCCGCATCAAGGAACGCGAACATACG
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TTTCACAATAATTGTTTATTTTATTGTTGATATTACGAAAGAAAAGTCTG
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CATTATTCTTGCAAACAATTTTGATGGCAAAACTATCTACAGATCCTGGA
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TTATGGACATATTTTATTTCCTCAGTCATTTTGATTGGATCATATTTGTG
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TATCCAATTGTTGATTCTTTTTAAGTAGTAAATTATTATGTTAGAGATTA
TGTATTGATTCATCCACTCTTTATATTGTCATGACTCTTAGAGGTTGCGT
GATTTAATTAATTGTTCCGTGAATTAATTACTTATTTTTTGAATCTATTC
GTCTTGAAGCTATGAACATCTGAATAAAAAGCACCTATTTTCCACTTTAA
ACAAAGATAACTCGAGTTATAGGTATAGCAAACTGTCACTGAGAGCATAT
TTTTTGGCAGATTTATTAAAAAATGGGCTTGAATTGTTCATATAAATGTT
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GATTCAGAGCTAGAAGGAGGAGCCTGCGTTGACAAAGCATGTTGGTGTAT
TTTCTCACTGACAGAGGCATTCAGAGAGTCCTTGATGGCATGAAATATTC
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AAGACCCAAACATCTTGGGGCCCATATTTCCTTCCCACTGAAGCCTTAGC
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GCTTAAAACTTTACTAAAGTGTGTTGATACAACAACATTTCTGCCAGCAA
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GGTACACGGATGTATTATAAACGTATAATATATATGGACAAGTTTAAAAA
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ATGGACACTTATATACATATATGTATATTTTTACATCGAAAATATATTTA
TAAAAAAAAACCCACCTTTATTTCACAACCTTTATTCCGTATTGAATAAA
TAAAGTTCTTTTTGCTCTCCCTGTTTTACATATTTTGTGTTTATTGACTT
GGGTTTTTGATGATTAGAGATAGGATTTTTGTCAGAGCAAGAGGAGAATG
CAGGAGTGAGACATATGGTAGTATTGAATTAAGWCCCTTATTAATGTCAA
ATGCCTGTTATATAGTATCGGATCTGTCCTAGGACTAATTTCTTAATCAA
TCTCCCCCACCCCCTTTTTTCAGTCATTTTTTTTATCGGTCCGATCTTTT
TTCCCATTATACTGACCGATACATAGGTCTATTAGTCCTACGGTCCTTGC
TATTTTTTTTTAAATTTTCTTCNNNNNNNTTTTTTTATCGGTCCGATCTT
TTTTCCCATTATACTGACCGATACATAGGTSTATTAGTCCTACGGTCCTT
GCTATTTTTTTTTAAATTTTCTTCTCTCATAGCTAGGATTGAAGAGTATA
GGAACTAAAAAATAATAAATGATAGGTAGAAAGTATAATAATACGTTCTA
GTCACACATCTCCTACAGGTATCTTGTTTCTTTGAAAGAAGTTATAAATT
ATGATACAATTTTAGTGGCTCAATAAACGTAGTTAGTAGTAACTACGTTT
TTTGAGCTATTGTATGTACCATAAAAGACCAACAAGGACCGGTCCTAGGA
CTGACAAAAAGTTTTTATTACGACTGGATAGATAAGACTGCAGCCTTTTT
AGTTTTTGTAGACCGATATGATATCTGGGAGAGAAAATGAATTACTTCTA
TAAAGAGGAGACATTTCTACATTTAAAATAGCATTGATTCCAGGAAAATA
ATATAATTATATTTAAATTAATTACTATTTATTTTATTATGCGCATTTTT
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GTTTGTATAACTTTTTCTGTTGTTTCTTATGAGATAACATCAAAAAATTT
GAGAAATGAAGAATAATTTTAAAGATTGAAAGAATAGGCCGTTGAATTTA
TATTTCAAAATGAGCATAATCTTTTGTTATATGCGTTATCTGTGACTATC
TACTGTTTTCTGTTTTTATCTCATGTAGTTGGCCAATTTAAGAAGACTTA
GATATCTGTTCCCCCCGAGACACTTCCAGCTCCTTCCTGCATGGGGATAC
CATAGGAACATAAATCTATTTTCCTTGTAAAAGAATTTTATTAATACAAT
TTTCTTATACTTTCATGTAGTAAATTGACATAAGACTCAAAATCTCAGGT
AGGCCTAAGTTAAAAAATGGATAAAACTTTATACAACCTCTAACTAATTA
TCAGGCTTAACTGGATGATATTGTATGAAACCTCGTAAATACATGTCCTC
TAAAACAGCTGTTCCCAAACTTTTTGTACTCAAGGGACAACAAAATACTA
ATAAAAATTGATTGACGCACCTCTTTGAATTAAACTAATCATTTGGATTA
TTATAAGCTATTACAAATAATGTATGGCTGKCATAAATCGTATAGCAGCC
TTGAACTTTCAATATGTTGAACTTAATTGCAACAATAAAGAGTTGTCCAA
TTCAAGTACACCTATATAGCGAAAAAATGAGCATTGCTCATTTTCAATTG
AGTGGAAGTACACTAATTGCTATAAAAACCAAAATTAGTAATTGAATGGG
AACGCGCTCAGAATTTCTTGAGCAGACTAATGCTCTAGTCCTCAACTGAA
AATTTACTAGCATAAGGGATGACGTCATTGGGATCTCAAATACAGGATTA
TGAGGATGCAGAATAATTGAAAAGCCTAATTATTGTTTTGGTAAATAAAG
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TTAATCCCCAATAAAGAGTTGAAAAATACCTACATGGTAGCTTATGAACA
TATTTTATTTCCTCAGTCATTTTGATTGGATCATATTTGTGACGTATCAA
ATACGTGTGACCCTGTATCTACATGTATACATGCTAAACATTATCCAATT
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