EMLSAT00000010014, EMLSAT00000010014-705861 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010014
Unique NameEMLSAT00000010014-705861
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s659supercontigLSalAtl2s659:208051..233740 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010014 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010014EMLSAG00000010014-692780Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000044551EMLSAE00000044551-753479Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044552EMLSAE00000044552-753480Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044553EMLSAE00000044553-753481Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044554EMLSAE00000044554-753482Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044555EMLSAE00000044555-753483Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044556EMLSAE00000044556-753484Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044557EMLSAE00000044557-753485Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044558EMLSAE00000044558-753486Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044559EMLSAE00000044559-753487Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774562auto774562Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010014EMLSAP00000010014Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010014

>EMLSAP00000010014 ID=EMLSAP00000010014|Name=EMLSAP00000010014|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=316bp
MKHLGSTKWILSSLLVVVLCCPKSLFGVTFRENDQRIPVDLLWERLLTDG
DLRLYNDPTPEQDDLLQGPYLKDNYPQLSREAAEFGVNPSYNSFYEPSLK
KIELEERNPMSDEMLERKRLDDENVDQYQLEVAXKMNEKKAEISMLPRAL
SSTHEQDIQRSDIFFISIVAGISALAVMTIVGAGFCYHKVQKNSRAGEEV
EYPAYGVTGPGKEISPTSGDRKLAQSAQMYHYQHQKQQMIAFDRSSGSER
GTPTGGIKGGPRSNVGAMLSDGDSDDGEEGDYTVYECPGLAPTGEMEVRN
PLFQDDNETPKNGRVP
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mRNA from alignment at LSalAtl2s659:208051..233740+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010014-705861 ID=EMLSAT00000010014-705861|Name=EMLSAT00000010014|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25690bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s659:208051..233740+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTTAATAGCTAGATCCAATTTTACAATAAGACCGGTCCAGAAGGAAGTTA TCTACAATTAGTTAAATTTATATCAGTCTCAGACCGGTCTAGGACTTCCA GACACTTATACCCAACACTAATATATTCATTATATTATACTAGTGAAATT ATTACCAACCTAGATATACACATAGTCTCACTATGTAGGTCCCACATGTT TATCAATACATATATTATATAAAAGAACACGTGAATCAAAGCTGCATTTT GGTTTAACACCCTTATCAAATTTCCTATTCAAGTTATTTTAAATACATAG CCTATGATATATAGACGACAACTTTGTACAGCCTATCTAAGTAGTACCTA AACGAATTCATAGTCGAAGTGAAAACAACAAGTGTTTTTTTATTTGCAAT TTGAGACAAAAGAAAAAGTTTTTGAGAGTCAAACACCTCTCATTTACTTT GCAACAGGATCCCTCTGTTTTTGGAGTGTGTTTCTTTCTTGTTTGGTAAA CACTTTTTGGTTTCAAACCTTCATAGAATCAAGTGAACAACTTGGTATAC GTACTAAGTCTAATATGTGCCAAGGAGATATTTAAAAGAGTATCAGCTCT TATGAAATACGTATATACAATAGTGAGATATGAAAAGTTGCTAGCTCAAC TCTCCTCTCTACATCGAAGAAGGCAACGAGCGTGTAAGTAAGGACTTTAG CTCTATGTAAGAAGTGATTACATCCACTCAAAGGAAATAGGGAGAGAAAA AAGAGAGAGAGAGACGAAATGAAAGTCTTTTGACGTCATTTCTATCAATA AAATGGCTGTTGATGAAGTTTTTTAGTGTGGGCCTTTTCTCACTCTTTTC CTTTAATTTATTTCTCTCTCTCCCTCTGTTTTCCTTCAGTTTTTTGTACT TGTTCATTCAGAAAAAAATCAAGAATAATTTAAGCTGAAAAAATAAATAA AAAAAATAACAGCACACACAACTTATAAGAAAAAATACGGAGCCGTCAAA GTGAGTAGTTATAGAAGCAATTTGATCAAAACTCCAGATATCCATCTTTC TTCCTCCCCTATATTGTATTTACACAGATCCCTAATATTCCATCAATGTT GTCTTCGGCTAACACAAAGTAGGATCCTTGAATCAACAGAATGAAACATT TGGGATCCACAAAATGGATCCTTTCATCGCTATTGGTTGTAGTCCTTTGT TGTCCAAAGTCCCTTTTTGGAGTTACATTTCGTGGTAAGAGTTTGAAAAA TAATTGTTATTTTTTAGCAATATCCTTCTAACAGATGGTTCATGTGATAT ATATCTATATGAAATATAATATTTGTGTAAGGCACACATTAATTTGAGCA AAACAGAGAAAAGGAAAACTTGCGTAATGATGATAAAAAGTTAGAAAGCC TTCTTCCTTGGTAGGCCGCCWTCTAGCCGCTCCCCCTCCATTTACTACTC ACTTAATAGAGAGCCGTTGAATAAATGATAACAGCCTGTTGCTACATTCC ATTCATTCWCTCTAATGAGACACTCAAAATTGAGCCCCCTGTCTCTTTTA AAAGGAAGTTAATTTATCCCCCCCCCCCCCCCCCATATAATAAGTAATTT AAATTTACTCCATTTTAAAAAAATAATTAAACGCAAGTTTTATATAAAAA GTATCGCAACCTTAGTTAAATAAAAATTTATATTCATATTATAAGCCATG TCATTTATGTTATAAGTTAAAAGGATGTATGAATGAGGTATCACCATATT ATGAACTTAAAACGAATATAGTTGTGGTGCGTCAACATATAAATAATATT GAACAAAAATCAAGAAATGTAAAAAATCTCATTTTGTTTCTTTTAATTCA AATATACATATTTGAGTCAGTTATAGGCTTATTATTCAAATTACTGTTAA GATCCACAATGATATTAGCCCTAGCTTAGACCTTTTACTTGCTTTAATAA ACTGATATGCCCCCTTTCAGCAATAAAATATGTCAATTTACCATTCTTTT ATTGTGACAATCCATTTCCGCTAATTTAAGAACGATTTGCTGAGGACCCA AAGGCTGTATAAGAAAAATTTGTTGATAGAAATAAACTATAATTCATTGA TAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACGTATATTGGCTTCGAT ATGGCCCTTTTCAACCATAAAATCTATTAATTCCTCTTTTTTTTTATCGT GACAATTCATTTCGGCTAATTTAAGTACGATTTGGAGGATACCCAAAAGG KTTATAAGMATAATTCGGTGAMAGTAATTGAYGAATATTTGTCAAAAAAT ACGGATTCAATCCACGTTTAATTTTAATACAAATAATTTTCTCTTGCGTA TTTGTTCATAAGCCACATATATGTAATATATATGATATAAGTAAGAATGC TTGTTAAAAGGATGTATGAATGAGATATCAGTAATTTATGAATTTAAAAG ATTATATTAGTTGTAAGGAATACACACAAGAGAAAGAAATATTCAACACC TAATAGGAAGTAATAGTAATAGATATAGAAAATAAACATCGTTAAATTTA TTTGTCACTCCAAAAGTTTTTGATGAAATGTGTTTACACTCCATTACGTT TATTTTAAATATTAACGATACCAATTTTTGTATATACAGAAAATATCCGA ATATGCCTTAAAAATTTTGAATGTCAAAATAAATATTTACAAACGTTCTT GGGGTTTTTTTGTTTCAGAAAACGATCAAAGAATACCAGTGGATCTACTC TGGGAAAGGCTTTTAACTGATGGGGATTTGCGTCTATACAATGATCCAAC ACCAGAACAAGACGATCTACTTCAAGGCCCATATTTGAAAGATAATTATC CACAACTTTCAAGAGAGGCTGCAGAGTTTGGAGTGAATCCCTCCTACAAT TCCTTTTATGAGCCTTCATTAAAGAAGATTGAGTTGGAAGAGCGGAATCC TATGAGTAAGAAAATGAGTTTAAACCTTTGATGTTTATTTTTAATCCCTT GTGTAGGTGATGAAATGTTGGAAAGAAAGCGTTTGGATGATGAGAATGTG GATCAATATCAATTAGAAGTGGCTCSTAAGATGAATGAGAAAAAAGCTGA GATATCCATGCTTCCTCGAGCTCTTTCCTCTACACATGAGCAGGATATAC AACGGAGTGATATCTTTTTTATCTGTAAGTAAGCAACGGTTTTACTTATA TTTGACCATAGGTGTTGGAGACTAGAGGGTAAGGGGTCATTAAAGTTGTT CTTCTAATAATTTTCATCTTCTACACTTATGTTTGGCCATTGGCCATGGG TAAGATTGTAAATCGTAAGCATTTTCCTTATAAAAAAAAAAGAAAATTAA TATGATATCCCTGACAATTTGAAGATTGTTTGAGAGGAGATCAGCCTAGT TGTAATGACGTTTCATTAAATTAGCGTCGATCATCTGTGAGATGATGTCC CAATCACAAGTTTCTTACCGTATCAAGCAATGGTAATCAGTAACATTTTT GCCATGTTAAAACAAAAAAAAACGAAAATAAGCATCTAAAGAACAATTAA 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TGACCACAAGAAGAAGATCAAAGAGGACCCCACAAAATCCATGAATCTCC TATCTAACGAGTATGACGAGGACAAGGGAACAATCAGGAGGGCTGTGAAG GAGGACTTGGGATTGTCCTCTTTCACAGGGACCCCACGCCACCTGTTGAT GGGCACTCTGAAGGAAAGGAGACTGCAGAGGTGTAAGAAAGTTCGTGCTT GGAGCAAGGCAAATGGATACACAGTAAAACATTCTCTGATGAGAAGATTT TCACTGTGGACCAGGTCTACAACCGCTGGAACGGCCGTTAGTTTGGGGGA TCACCAGAAGAGGTCAAGGGGGTTTTCCATACAAAACATCCGCCCCAAAC AATGGTCCTGGGGTTTGTGGCGTGTGACGGCAAGAAGATGCCTCCCTTCT TTTTTAAGGGAAGAAAATCGCCTAGGAGACCTACTACTAGGTGCTGAGGT TCACCATACTGCCGTGGCTCAAGGGCACCTATCCAGAGGACAACTATGTG TGGACCCAAGATGGTGCACCCTCACACACATTGGCCAAATGGCAGAAGTT CTACGCCAACAACATAGTTAATTTTTGGCCCATGGACATGTGGCCATCAT TTTCGCCCGACCTGAACCCGTTGGACTTTGCTGTGAGGGGTACTTTGGAG AGGGAGACTAACTGGACATCTCACCCGAACGTGGACTCCCTAATGGCCAC CATTAAGAAGGAGTGGAACAAATTGTCCGAGATGTTCATCATCAACTCCT GCAAGGCTTTCCACCACCGTGTGGAGACTGTGATTGCTGCTGAGGGAAGT CATATTGAGTGAACATGTTCGTAAAGGTCGTGTATCAAAGTTTTGTTAAA AAAAGTTTCAAAATTATTTGTCAAAAAATAAAATTATTGATATTTTTTTT AAATCAGTCATTCAGTCCACGTTTTGCTGCCGAGCCTGTACAACTGATTG AAATTGGGTAATTCATTGTCGAGAAGGAGGCTAAATGTCAATGCATTGTC TATTTGATTTACGCCAGGCACATCAACAGGACAAGATAAACTGGACTTTG GACTTGTTGAAAAACTCCAAGAATGACTTCTAACTCGCTTATGCCGTCGA TGAGGTTCCCCCAATCAACCAGACTAAGTTCCCAACCTCTAAAATGATGT TGGGAATAGTGGCATCATACAGGAAGATGATACCCCGTATTGGTTCCCAA AAGGCCTGAAAATTGGGACCATGGAGTACCAGGATGTTTTAAGGAGGTGG TCTTGTTATGGGGGAGGTCCAACTATCCATTGTAAAAATTTGTGTTCCAG CCAGAACGTTATCTATATGTGGAAAGACGATTTTTGGCCTCCCTTCTCGC CCAACTTGAATCTTTTTGACTACGGTACTTGGAGTTATGTCGAAAGTGTG TCTCCCTCAGCACCCCCTCGTGCCACCATCACAAAATAGTTATCCCATGC GTTCGTCTTTACTTTATCAGCCCTTTAAATCATATTTAAGAAGTGTTTAA ACTTTTATTTCTTGAATTTTTCGTAAGTACTATTGGTACGGAACGCTAAA ATCTTCTCTATAGCGCTCAGTGTTCAAAATATAATTCCGTTCCGTTCAAT TTTGCGTTCCATTCACTTACCTGAAAAAAAAAGAATTAAAGTTTAGTGAC GTGATGAAGGACCGAACATTAAAAATTTTAAGATTTTTATTAAGGACTGA ACTGGGCTGGTCCGAGATGTACGTCCGTCAGTCTTTAGTCCTATATAAGG ACCAACACAAGTCTACCTCTGGGTATATTGGTTAACTTTTTATTACAGAA TGGGAGTCAATCTGAGTGGAATATCATTCTCTATATGGAATCACCGAATA TTAATGTAAGAAAAACCAACAAATGTGACATCATATTATGCCTATTTTTT CAGCTGATTCATTTACTCAGTCATTTGGGTATCTTGTCGCCTCTATCTAT TTATTTTGCTATGGGTTGACATTATAGGATTAAATATCGATATGTTATAT AGATATGATGCAAGAAGCAGTTAGGGAATGTCTGTGGTTGCTTACAAGTC GATAATGCAAGGAGGGTGGGGGAGCTTCTTCTGATTAGTTAATTATTAAT GATTAATTAATTAATGTTCAATATAATGTGCAAGCATAATAGTTTATACT TGAGAGTAAAATGGATGGATCTCATTAATGAAATAAAAAGAGATGATGAA ATATTGATGGCCCATTGTCACGCTATGTACTTTGAATGGTACGTGTAACT CATTAAACCCCAAATCCATCACGCAAACAGGGTATATCAAAACTATTTCC TGATTCGAAACCTCGAAATTAATCGAAAACTATGTACTTTATGAGTGTCA TGTTGTTACACCTTTTTTTTATTTCTGTAGTTTTGTTATAGCTCAATATG ACCTCCATTAGCCTTAATGATGTGGCTAAACTTGGACTCAGTGTTCATAT TGTCCCAAATCTCAGTGACAGGTGCTTTCATGGCCTCAGTGTTGAGGTGG CGTTTACCATAGGTCTTGCTCTGCACAGGCGCTCATAATGTAAAGTCCAG CGAATTCACGTTTGTTGAGTATGGTGACCACTAGTATTGTTTTGGTCCTT ATTTATTCAGCCCAGTTTACTCTTAGGACCGGTGCTATCGATCTTTAGCA CAGTTCCTTAAGACTGTCGCTACTTTGGACTCTCAGCACTAGAAATTATT AAAAGAAGACGAAATAAAGTTGAATGACGTTATCAAGTACTGTTCTTTAT CCGTTTTAGGACTTATATACCGTAATAAACTGGACTGGTCCGAGACTGAA CTGGTCAGGACTACATTCTTGAGTCGTACATAAGTATCGACACAACACTA 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