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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s65 | supercontig | LSalAtl2s65:608176..666648 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010032 >EMLSAP00000010032 ID=EMLSAP00000010032|Name=EMLSAP00000010032|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=682bp
MYINPLVNTFSLKADMRFSRKSYPIIPNTFLFFLVLGTSTSSLLHVQASQ TEASSHHHAHMSMSKQELRRIFQVEHHDDVPRYEVIKIHSVIRRRRRRRS SDDDDFDEIVHRVNLRTHGQDFNLELQRNQHLLKKSFNGSNFWFADSPVG DDGNRDANISYTPHFGNEDEEEIGFPYQDPKNRAAVLLFKDKTENAFLMD GMISEDLVVKPITPDMRDRLSIPRSPRFLPFPEEEDETEEEIRSPRVISS NRLLHDDYAFLDEDEDIEDEDVMVQRNKRSSEENEIRFNSGYHIIFKRKN VGEDHSSDYHHMENEEKSAFTQIDERVVKERIHSRNKRQAPYIIFPEILC IVDYDGYRYVISFWNGIDLRYKLLKSPSVKISIAGIIISRGRDATPYLER NRVGKDAIDSAAALTDMGKYLFLERRLPVYDIAVAITKLDMCRKKSQYGG DCNRGTAGFAYVGGACVVNKKLEKVNSVAIVEDTGGFSGIIVAAHELGHL LGAVHDGSPPPLYLGGPGARKCRWSDGFIMSDLRHTSKGFRWSRCSVKQF HHFLNGETATCMYNSPHSDESLPRVLPGKLLSLDAQCRKDRGTSACFKDD RVCAQLFCFDAGSGYCVSYRPAAEGSRCGDGKMCLNGKCVNEHENAVDFD SDGFVRRSGTVDFEEAPSHQSTDLDLLKIPLY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s65:608176..666648- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010032-705879 ID=EMLSAT00000010032-705879|Name=EMLSAT00000010032|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=58473bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s65:608176..666648- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTACATTAATCCACTGTAAGTTGACACAATTCGTATTTTTATATATAC
ATATTAAGGTTAAGAAGTACTACATATATATATTAAGATGTACAAAGAGT
CACATTCTATATTCCTTTTATGAAAAGTAGATATTTATCAGTTTACATAT
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ACGCCTATAGTTGTATTAACCTCTTCCAACGAAGGTGAAGTTTTTCCTCT
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TCTGCCGCCAAGCTTGCGTTTTGCCTTGTGGTAAGAAAAACTGTAAAATA
TGGCGACTTTTCTCATTGACGACTGCTCAAACAAACCTGAGTCAAACAAT
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CACTATAATAAGCCGAACGCACTTATACAACGCGAGATACACATTACTAA
AGCCATCAATTGAAAGAATAATGGATTTCTTTTAAGTACACCTAACATAT
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TTGTCTCCCCTGGAACAATTTACTTATGATGAACAAAGTGAGTAATTGTA
TACTAGCCACGTTAAGAGGAGCATTAATAGTCACGTACAATTATACACAT
TGTGGTTATTATTACATCATGATTTGATCTGAAAAAGTGACGTTAAGTCT
ATTTCCTAAGCATCAATAAATTCATCCAGGCTACTCCAGTCAAGTTTCAT
TTCTCTTTGATGATGAGCATCCTCATAATTTGTGCTTATGATAATGATAA
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AAATGTCAAACTCATTATCATATGACGAATGAATTTCGAAACTTTTTCTT
TTAAATAACCACATATCAATTTTTAGTAATGATGCCTTAATTTCGCGCTG
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TGCACTGATTATTAAAAAAATACTTTCCCTTTTTGCTCCATAGAATGATT
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CAAAATGATATAATGGAGAATAACAAATAACACTTTTTTTAAATCTTTAT
TGCCTTTCTTTTTTTTTTTTTCATATTTTGAGCTTTTCAAGAATATCCGT
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TGATGTATATAGCTTTACAATAGACGTAAAAAAATTATAGAACTGTTTTA
CATAAAACAATTAGTAACGTTTTTGAGAGAGGAATATCTAGTTATACATA
TGTGGTGCGTCAACTTTAAAAAAGTCTTAAACAAAAATCAAAATTTGGAA
AACATCACAATTTATCTTTTTACCTCATATATAGATACAACTCAATATTT
CATATACATATTTGAGTAAACTATAGGCTTATTATTCAAATTTGTGGGAT
GAGATAAGATACCCATGAACTTTTACAATTGTTTAAAGCTTTTACTTAAT
TTAAAAGACTTATTTTGGTTCCAATATAAGTATTTTCCAATCAAATCTGT
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TCAAACTTAATATAATTTTAATGTAACTCTCCGAATTTACGAGACCAGAT
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TTTAATAATAATGACACCAGCTAAGGAGAAGAAAATTCATTCTTCATACT
ATTAATTCCAAAAAAATGAGCCTGACAAAAAACACACACGATTTGCATCA
CTAGTAATTTCCCATTTGAATCCTTTAAGGTTAGCATGGGAAAGGAGTGG
GATGACATGTATGAGGAACATTTGAAAAAGACCTGAAAAGAATTCAGTCC
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TATAAAGTATCTTTGTCCTACTTCTAGTACATTTTGAAAGTCTGTAGTTA
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ATGCATCAACACTGTCTAATTTAATCATGCCTAATGTCCATCATTTTGAC
AAGTAATTAATCCTCTCTTTTTTATAACCAACAATATATCTACCTACTAG
GAAGATATGATGCGACTCGGAAAAAGATTATTTGATTATAATAATAGTCA
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CAAAATATGCATTATAGCGGCCGACATTAACAAAATCATCAAGAGCTCAA
ACGTGATTAAGATTAACACCTTGAAATTATTTAACTTGTGAAAAAACAAA
TATTCGTTCTTTAAAATTCAAAATTCCACATTTTGCCTAAAAGGCACTAT
CTACACAAGGTCTAAAGGCCTTGCACATTCCGATGATATACTCATCGAAC
ACACTCATCCACTCCCACTAAATGGAGGCCTTCAGTTCAACAGTATTTAT
GTGGTAGACAGCAGAGACCTAGGCCTTAATATTACCCTAATCCCACAGTC
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GTTGTTGCTCTTTATCGGTCAACCTGTTAGCCTTTACCACTGCTGTAATG
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ATTCCTGATCGTCCCTTCACTTACGTTGTGTTTATTTTTTTGTGAGCTTG
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AACTCCTCCGACCGCTTTATGTTGTAGCCCAACTCCCAGACTTCCGTGAA
TAGCTACAATCAAAAACTCAAGCAACTTTCTGAATCTCAAAACAGGGCCT
TCACTTTTACAATCTTGACCATCTCTCAGACGGGAATTCCCAAGTGGAGC
AAATCTATATTTCTTCGACGACATCACAAAACTGGCTTGTATTACTAAAA
ATTGTATGACGGTAAAAGGAAGGCCTCAAGACGGATCTCTCAAATAATGT
ATGTTCCATTGCCCTACGTTAATTTTTTCGGAATTTATTTAGGTTTTAAT
AGATGTTGCATTTTTGCTTACGCACGCTGTATAAATATGTGTGTGTGTAT
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TCTGTCTTACTTCCTATAGGAATATGTAAGTATAATAAATTAAACTTGCC
TACGTACGTTCATTCATTTATCCCTATAAGGTCCATTCCTTCCTTGAATA
TTGATTCATGAAAAATATGTAGTGTCTATTGTATTGTATTTTAGGGATAT
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GGAATATAATGGGGCATTATTCTACTAATCATTATTGATTAAAGAGAGTT
TTTATTTAGTACTCCAACTCCCTAATATTAGAATGGGCTCTAAAAATCAA
ATTAAATTTTGGTCCTAGTTTTTGGATCCAAGGGCATATTTAAAGTACTC
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AAATGTAATTTATTTATTTACTTTTTTCGCATATTTATCAATTACTACAT
GGATGTGCAGGTAAATTGGAGCATTTTTAATTGGCTATAACTACTGATAT
TTTAATTTTACAGAAAACATTTTGTTCAAAATTTGTTCGTCCATTGATGG
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GGAGGGMCTAGAAGGAGGAGCAGGMCGAGTTGACGTGTGCAGGATTTAGC
TTGGCCCAGAACTTAACGATTGATTTCGCGAGGTCGCCTAACTGTTGTGA
AACCTCGAGGAGACTTGCCTCTCTAACTGCCCCTAAAATATGTAGTCCAT
AGGGTTCAAATCATTGGAGCTAGAGGGATAAGTCTGCAGGGACCAGAAGT
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AGGAGTGAGTCCTGCTGAAAGGTAAACCTGTTTCCCCCATTGTTTGCTTT
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AGCATCTCTTTTTGGTTGAAGAAGATCGACGGCATCACCGTCCCGTTGGA
CCCAATGACCCCCAACGTCATGACCAAGACTGGAAACTTAGTTGTGTAAA
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CTGTATACCATGTTTACGGTCCACTTCTTCTCGTCGCGGAATAAAGTTTT
AGGACGATGTATATCTTTGAGGAAGTTCAATAATTTGCAGCTCCTGGTCA
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ACTGACTCTGTAGATTTTTTCGAGCACAGTAATGGGCGTTGCAGGGTTCG
CCTCAATCGATAGTTTGAGGCCTACCAGAAACGTGGGATTCCTCTTCTTG
ACGCTTCTTGCCTTGTGGAACTTCCGTTCGGACTGGCCGGMTAGCTTCCC
CTTATGGTAGYTCCTATAGACCGTCAACCTGGGATACTATATCATCTTTG
CAATCCCGAGAGGATTGTGTCCTGCGCAAATCTTTTCGACAACGGCCGAC
CTTTTCTCTTGCTCCATGTTTGTTGGTTTACCTATTTGAACAAAACTTTT
TGTGCATAAACTAGAAGGCCAACCTCGTATTTCTTGTTAAAAAAAATCCA
GTAAAATTTAAATTATCCAAGTTATAGCACTTTAAAAAATCTCCCAATTT
GCCTCCACATCCACGAGACAAAGAGAATGATGTAGAAAAAAAATATATGG
AGAAAAGAAGAAGGGAGAAACAGAAAGGAGGAGAGAGATTTAGAAAGAAT
GAAGGAAAATGAGGTTTTATTTAATTTTTGAATTGGTAAAGAATGAATAG
CCTTTTCCTCAACATTTGTCATTATTATTTAACTCATGAGTTGTGAGCTT
CCATTGCATTCAATTATTCAAACATTCAATTATATTCAAACCCCGATTTA
ACATTCGTATATCTTTATGAAAGACGGAGAGTCACCTTGAGGATTTGTGG
CGGAGTTATAATTGTAAGTCTTAGTAAAAATTATAATAAAGGATCGACAT
TAGAATAATTCTTGTCTATGTCCTTGTTCATTCTCTTAACGACATTTCGC
ATAGTGCATGAAACTTCATGACAGCTAACCTGCTTTACTCTAAAACATTC
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CCCCCAAAAAAAAAACTACGATTTTCATCACTAAAAATACACATCGAATG
TACAGTTAATCCTTTATTTGAAATGTTTCATCTCATTTTTCGGTTGCAAA
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TGGTGCGGTAACTTTTTGATTAATAGTTCAAAGTACAATCTACGGTGTAG
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ATGAATATTCTTCGTTCTTATTCCTCTTGAAGGAGTAGTCCCGTTTCCTT
CTTCTAAATAAGTTTTTAGAACAAGGAAGTTGCCGTTCATTCTGGTGTGT
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GTAGATGACTTGGATTTACAATTGCATATTGTACCCCTACTTCTACAGTT
GTATTAAAGGGTTATTTAAAAGTACCTGTACATCATATGTACAAATAATA
ATCATAAATGACTGCATCATAGGTAGCACTACATTTGTTAATTGTATGTA
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AGAAAACTTTAGAATCTGACCAAGTCCATTCTTCTATTACTTGTACACTC
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CAAAAGTTCCTTTTGTCTTATTAAAGAAACGTGGGTATAAACATGTAGCT
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ATCCTTTTGATACGACCTTGAATAAGCTATTTACTATCTTAAAACATATC
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AATCCTATGAAGTTGATAGCAAAAAAAAGGAATGAAAAAGTTTACTTTAT
GCGGAGTTTTTACTTTATGCTTCTTCTATGCGAAGTATTTTATTGAGAAG
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TCTCCAGATTTGACTTTATTTATAAGTCTGGTCTTTTTTTCTGTTGCCTT
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AAGTAGGCACCGTCGGGTAGTAATAAATATAGGAATTTCAGGAAAAATTC
TCTTCCTCATTCTTTTGCATATTACAAAATTTAATTTGAAATTTGTCAAA
TTTTAAACAAAAAACTCATTACGTGCAAGGAATATTGTTGAAGATATTTA
TTTCAAAAGAGTTATTCGTTCGTAAATAAATGTATCCCCAAATACACTAA
TTTAGCACTAAATACTATAAACACGGATACTGTTTTAAAAAAAAGGATCA
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GATCGACTTCATTGTTTCTAAAATTCCATAAATTAACCATATCCAATGAG
ACATTAAGGGGTGGAAACTGTTAATATGTTTATTCTATATTATTGCATTG
TCTTTTGTTATTTATTTTCCATCAAAAATATTATGAAATATTAGATTATA
TCAAAAATAATCCTGATAGTTATTTTTGCATTTACTTTCAAAGTTTGAAA
TAAAAGATTACGCTCTGTTTACTTTTTGAGCTTGTCGTTAATTATTTGAA
ATGAGTGATCCATACTATTGCAAAATACACTTATTTATCGTATATTGAAG
TACTTGATTAGCAAGGGTTTTTTTTTTTTTTAATAAGAGCCACTTTGGAT
GAGTTCGTAGTTATTATTCTTTAAAAGGCAACTCATATCGCTACAGAAGT
TATGCAAATGTAGGAACTAGTGTTGAGTTCCAGTCTGAAAGCCCTTTACC
GGGGTGAGACCTTTATAAATTTTATTGGATAAAATGTATTTTGATCTTTT
ACAGAGGAAAGAAATTCGGTCTTCAACAATCACATCCAACATATCTTGGT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTACTGCKA
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TACATTTTGATCCATTGTCTTGACCGAAATATCGGTTTAAATCGGCATAG
AATAAATAACTTAAAACCTAACGGGAAAAAGGAAATCGATCTCGGACCTT
GTCTCAACACTATGTCGTTACCTTTATTGTATCACGCAACCAGTACTTGT
CCCAATTATGAACTTATTATTCATTAAATAATCGTAGGGAATTATTTACA
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CTATAATGTTTATTTGTACTTAATCAGTACAACTCCATCTGTCCAATTAA
CGGGACATAAAAAATAAAAAAAACTCATTGTAATTTAACCAAGTAACATT
CAGAACACTGATTAGTAGAAAAGAAGCAAAAATCATTGACCTCTGACAAG
AAAATAGTATCTGTTAAAAAGGTTGCAAACAAAGTCGTTGTGGGGTAAAA
TATGGTTTTACATTATCACTGTGAGAGAAAAATATTGAGAGTAATATCAT
TGTTAGCAATATGATTGTGAGTAATTTGATTGCAAGTCAATATTATCGTG
TCCAATTTCATTGTAATTATATTATATTCGGATAATCAAACTATTAAATG
ATTTTTTTTTTAAAACAACGCAGCCTCAGCATCATGAATCCTTTCCATAT
AAAAAAATACACCCAAGCCTGGACCTCTGGTTAAGGGGTTAAACTCAACC
GCTGCAGCGTTTATAACCATCAAGGACCCCTTATAATATGCAATAATACC
CCCCAGCTCAAGAGTTGTGGAAGTGAACTGTTGGGCCTTGAATCAGGTTA
AAATTTTCTACCACTTCTTCCTGAGTATCAATGAGCCCTTCTAATATCCC
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GTGTTGGCGAGGTAACGGCGTGATCAATATAAATGTATCCATGAATAATA
GTGGATAACACAAATTAGAGTCAAATTTGAAGGATACGTTTTAAATGGGA
ATCTTTAAAATAATGGATTTCTACAATAATAGAATTTAAAAAGAATGAAT
TCTACACAACAGGTTATGAAAACTTTCACAATGAATAATTTTAAAAGATT
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CTTTTTTTAAACATATATAAATAATGTGTGGTGAGCCAAAGGTGCATTTT
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CATCACAAGAAAGTGAATTAATTCAAGGGTTAACACGATGGTGATGGAGG
CAGTGGAGAAGGAAGAGTTATATTTTGCACTTTTATTAAAGATTAGATAT
ATTAAATGGGTTGAATTATGAAATAGGATAAGGCAATAATTCATGAAGTT
GAAGATGACAAAGGGTGGAAATAATAAGAAATATTTACAGTGTGGGGGGG
AAATAAAACGAAAAAATCTCTTTGATTACTTGCATCTTTATTGTTTGTAT
TTTTACACATTTTTTTTATGGTATGAGAGTGTTAATTAGTTCAAACTCGA
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ATCCCTTCCTGCTCCAGGAACCTTGTGGCTGGMGCCAAGAAGCTTAATGA
GMAGAAAAAAACTTTAAGAGAAAGCTTGGTAGTGAAGGACACAACAAAAT
ACTCACTGATGAGTCCATAAAACGGTTTATCAGTTAAAATSGAGGGCAAG
CCTAGAAAAAGAATCGCCCTTGCTAAGGATCTCCAAGTCGAAATGGGAAA
TGTGCCCTCCTTGATCATATGATCTTTCGCCTCTTTACTATGATTTGCAG
TACGCACTTTAGAGGAAGGTTTGTATGTCACCTCAAAAAAATGTGGTAGA
ATTCAAAGCTACAGGGGAAAAGGAATGGAACAATACGTCCGAAAATTTCA
TGATTTCGTCCTTCAAAGTCCGAGTAAAGGCAATGTTGATTACACATTTT
TTATCTACAGTTAATCTCTTTAATAAAGAATTATTGACCCAACTTTGTGG
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TAGAATAGAGATGCCACCAGTCTCTGCAACATTCTCGCCACTGAAAATGG
TGCAGAGTAGATTACACACGCGTTGCTGTTTTTGTTGTGACTCCCACATT
TTTACCCTTAGAGACATGGGATGAATACAAAACTTGTTTATTTTTAATTC
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AAAACATAACTAAATGCTACTGCAAGTTTTGTGTCCCCAATCTATATAGT
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TTTCTGACTAGGCTACACTAAGTGTTGGCATTTCTGTCGGTAAGTTCAGA
ATGTTTTGACGTACGACCATCATTTGTGTTGTTTACAGTGACTTGAAAAA
ATTAATTTGGCAAAAAAATGGAGTTAAGTAGTTAGCATTTTCGTGCGATC
ATTTTTCAACTCTTTTGACGTAGATTATCACAACAAGAGTGCATTGATGA
ACTTAAATCTTTGTATGGCGATGAAGCKCCATCCTATATAACTTTGGAAA
ACTGGTTTAATGAATTCAATCGTTACCACCCTCTCTCAAAGACGAATTCT
GAGAAGGTCGTCCAAAAACGACTGTTGTGCCAGAAAACATTGATACCGTG
CGTGAAGTGATAATGCAAGATCATCAATTAACATACCGTGAGATAGAAAC
ATCCTTGGGCATTTCTTTCACCAGCATACATACGTTATTATATGTACACC
TGGCCGTAAAAAAGTTTTTTTCTCCTTGGATCCCGCACAATTTGACAATC
GCTCAAAAGAATGCTCTTGTCGATTGGTGCAAGGAAATGTTGAAAAAATA
CGCTTTAAAAGACGTTTATAAGATTGTCACAGGTGATGAATCATGGATCT
ATTCTTATGAGCCCCAAACAAAACAACAARCAKCCGTGMGGGTCTTCGAA
GASGAGCCAAATCCAACGAAAGTTGTTCGATGCAAATGTTCGCCTGTTTC
TTCGGCAAAACTGGTCATGTGGCGACTGTTCCACTTGAGCATCGTAGGAC
AGTCAATTTTGAGTGGTTCATCACAATTTGTTTGCCTGAAGTCTTCGGAG
AAATTCGAGAAAAATCATTTTTCACCATGACAATACGAGCTCTTACCCAT
CAGGTCAAACCAGCGCCTTTTTGATTGGCCAAAACGTCGAATTGATGGGT
CATCTACCATACAGCCCTGTCTTGGCACCCCATGACTTCTTTTTATTTCC
GCACATCAAGAAAAGAATGTCGATTTTCGTCGCCAGAGATCCTGTTGAAG
TGTTTAAAAACCATGTTATGGAGATGTCTCAATCGGAGTGGAAAAAGAGC
TTCGACAATTGGTTTGACAGAATACAAAAGTGTATAAATCATGCTGGAGA
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CATTATTAGGTCAGAAATATATATATAGGAGCCTACGTACGTCAATTGAA
ACTTAACATTAGTAAACATCCCTTGCATTAGATCATACAAAGTTTTTCAG
TGATTTACTCCGATGTGAGCTCAATCAAACTTTATAATCCAAATGGGAGA
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