EMLSAT00000010238, EMLSAT00000010238-706085 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010238
Unique NameEMLSAT00000010238-706085
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s679supercontigLSalAtl2s679:81514..109700 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010238 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010238EMLSAG00000010238-693004Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000045508EMLSAE00000045508-754436Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045509EMLSAE00000045509-754437Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045510EMLSAE00000045510-754438Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045511EMLSAE00000045511-754439Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045512EMLSAE00000045512-754440Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045513EMLSAE00000045513-754441Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045514EMLSAE00000045514-754442Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045515EMLSAE00000045515-754443Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771638auto771638Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010238EMLSAP00000010238Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010238

>EMLSAP00000010238 ID=EMLSAP00000010238|Name=EMLSAP00000010238|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1985bp
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IQDDMEEETANYIYQEESLFMDRKRAFPDEEDHQIFEEDEGEEGDFKRMR
LSDAKHKDTRSLTWQFFDKVKGGDTEEXRCHICDKRYHTAGGSTTVMHRH
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LCGRQYSSTDSSTGIMLRHLRKQHVKEYKEEILRREAEEESQETSRPTAL
PAKKPPRKTQSSRSSAWTYFTRIGPSSVKCNICSKDYSNIGGSTSAMIRH
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ETSQSKFGGSGGLGSYTPSKIQMXEAPFQLGXSRRPPSLSRGASESSSGN
ITSKKDGEVAGEDQVLRPVEDAVSWSGSFSSDILF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s679:81514..109700-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010238-706085 ID=EMLSAT00000010238-706085|Name=EMLSAT00000010238|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=28187bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s679:81514..109700- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATCGAGACGAGCAAGGGACAACATTCAGTTTGTCTGCTGAAAATGA GGTTGGTAATTTTCGTCGAAGAGGCGATTCCGACGATGAGGAAGGGTTCT GCCTCGCTTGTGATGATTCTTTGACGCTGACAGAGGAGGATATGCTTCGA CATCTAGTGGAAAAGCATCCTGAGGCTCAGAACAGAAGTATTCTTACGAT TCATGAGGGACGAGGAGAAAAGGAGGACGAAGATGGGGATGAGGGTCTGG ATGAGGAGACGACGGTGTTGATTGTAGCTAAATCTCCAGACAAAGAAGAG GGCGATGAAGAAATTGTAGATGAGGAAGGGATCCAATCCTATTTCAAGGA AAGTGAATCCAAGGACATGATGGAATGTCGACTTTGCTCCGTCGTGATTC CCTCTTCGGATATCCTCAAGCACATTGTGGAAGTGCATCAACAAGTGGAA ATCCAAGATGACATGGAAGAAGAAACTGCCAATTATATTTATCAGGAGGA GTCTCTTTTTATGGACCGCAAACGGGCCTTCCCAGATGAAGAGGATCATC AAATTTTTGAAGAGGATGAGGGAGAAGAAGGGGATTTCAAAAGAATGAGG CTTTCCGATGCAAAGCATAAGGACACTCGAAGTCTCACATGGCAATTCTT CGATAAAGTCAAGGGAGGGGACACAGAGGAAGMACGTTGTCATATCTGTG ACAAACGTTATCATACTGCAGGAGGATCAACAACCGTCATGCATCGTCAT CTCAATAAAGAACATCCAGAGCATCTCAAGGAAATCAAAGAAGACATGCT CTCTGATGACCCTACCAAAAAGTGTCTCAAAACCACTTCTAGAAGTGTGG TTTGGACTTACTTTATCAAGGCACATAGTAGTAATATTGTTCTCTGTAAA CTTTGTGGTAGGCAATATTCATCAACAGATTCATCTACTGGGATTATGCT 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