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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s688 | supercontig | LSalAtl2s688:44883..67737 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010371 >EMLSAP00000010371 ID=EMLSAP00000010371|Name=EMLSAP00000010371|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=729bp
MNRRRNFQEADAECNMHSEQNNQARLLSIHDPTEQQFITSAFLNLGHRGS YWIGFNSEMDFYQWTDSSPFSYSNFVSNDESKHYKGPPPIPDANVCPAHW HSTNTRCFYTSDNDWDYEEAQKECTNKNSYLASIHDEHENQFIASTLQHP SQSYWLGLRKEKLHSEYEKWLDGSEIDYTNFAQKIMELPNEDTSSTFYGV HMNQQGLWRPSESTTKSQFVCSAKQTHFITCPPGWKKSPSSCYILIKLEK TFHKASRECKDRGGYLARIESIEEEDFLISYIFDEKKALGIEHVWIGLKT KKKRNHYYTWEDGSDLRFSNWERKYPLQSEDISCVWLNEKLERFWTNVKC SSQSAYICEKPQTITENPPPEERGCTHEQVPYQGNCYEIFLTQKTFDEAI HACAEKQGSLLKIKNMEILSFFEDQAYIGLREFPQLGGFHWLDPSFPYGS YTNWDDGQPNSYGGSQACTKAQPSVTEMTYTLPKCNENGEFDEYDGNCYL YVKEQKSWSEAKNYCRSKKSNLVSVQTLQENSFLTAYLENDSWIGLYFTK ENKEVQWTDGREPTPDLVGKCPETHGWVKGPINHCYFFGEKVGLFYTGAE ELCAKVGGTLAGIHTRADNDWLKKNANTKHKGHWIGIQRVVLETEPFKGG FHSWVQGYRNKRGTHGEFIPITGKWSLEESKNVRDHFICSAKMSFVMNPV PSIPTSTPPENTNGLSAGGIVAIILGSLI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s688:44883..67737+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010371-706218 ID=EMLSAT00000010371-706218|Name=EMLSAT00000010371|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22855bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s688:44883..67737+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGAATCGAAGACGAAACTTTCAAGAGGCTGATGCAGAATGCAATATGCA
CTCAGAACAAAACAATCAAGCCAGGTTGTTATCAATTCATGATCCCACGG
AACAACAATTTATCACAAGTGAGTAAATGCTTTCCACAAAATATTATGTC
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AATATAGTAATTATTCTTAATATTAAATGTGAATGTCCATGCGTGTCTTT
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GGCTGTATTTTGAATATAGGAAGGGTTCTTTGATTCTGAGGGAAGTCTCG
GTCGAAGAATTAAACCTGTCTGAGGGACCCGCATCTCATATACACCACCT
GTGGACGAGATTGTATTCTGGCATATTAGAAGGGGCTCTTAGGTACTTAT
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AAATTTAACTTGCCTTGCGGCGAGCACTGGGGTGAATTATAGCATATTTG
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GTGTATTTTGGGATATTTGGAGAGTTCCTTGATATTCAAGGAAGCGACTG
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ACCTAAATGCTAAGCCTACGTATGAAATTCTGCTCCTGGTTGAATCCATA
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GTTAGTTGAAGCGAGAGCTAAAAGTCTGGACTTCGCATCAGTAAACAATT
TGATCAAAACATTTAGAATATAAATTTGGTTCCGCACCCTATACAGTTAA
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CCGTAATCCCGACAGAGAAAACCAACTATCCCCCCAAATATATTTGTATT
AGATACCTACAATTGAGTTATTCTTTTTATCCATTTCAAATTCCATAGAT
GTTTGTCCAGCTCACTGGCACTCAACAAACACCCGCTGCTTTTATACCTC
AGATAATGATTGGGATTATGAAGAAGCTCAAAAAGAATGTACGAATAAGA
ACTCTTATTTAGCGAGTATTCATGACGAGCATGAAAATCAGTTTATTGCT
TCCACTTTGCAACATCCTTCTCAGTCTTATTGGTTGGGTCTTCGAAAAGA
AAAATTACATTCCGAATACGAGAAATGGCTAGATGGAAGTGAAATTGACT
ATACAAATTTCGCCCAAAAAATAATGGAACTTCCGAATGAAGACACCTCC
TCGACCTTTTATGGAGTTCATATGAACCAACAGGGATTGTGGAGGCCCTC
GGAATCAACCACGAAGTCTCAATTTGTATGCTCAGCAAAACAAAGTAAGA
TTTTACACAATTACGGATAGGTCCAAGTAATATTCATAGGAGTAACCCGG
TGCTCTTCCGGGTAAAATCAAAAAAGTGTTGGGATATGTATTTATATGGG
TATTTGTAATATATACATCAGTAAGGATATGAAAATTATTGAAAACTTAG
AGAGTGTAGAATCCCTACCTAAGATAATGTTAAACGACATATCTACTGAC
AGAGATACCTGCAGTGCTCTTGGCCTGTATTTTCAAGAATGAAAAAATAA
TTGATACGAGCACTAATATACTTTTCTTTTATGCTCGCCAGGATTTTGAC
AGTTTTCACATATTTATTTATCCCCATTGACAGATAGTTTTGAGTCTTGC
CCTTTTTGTAAGTATACTAGTATGAGCCTGCCACTTGAACGGGCGAATGG
GGAGGATAATGACAGTATAATGTGATGTAATGTTTGCTTAGAAATACATA
GATGTTTGTAACCTCATCATGTATAGAAAGATGATGTTGTCTTAAGTAAT
CAAGAAGAAATATTACGAAAATAATATATCAAATTAGTTATAAAATGTCA
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CTAATTTTTAATAGTAATGTGTAGAACAAAAAATGTTGCTGAGCAGAAAA
AACGGAGGAGAAGGAAGATTCAAAAGATTTTTTTTGTATATAAGTGAGTA
CACAAAGGACTCATATTTTTGTAAATTAAATACTATGTTCTACTCGAGCC
CGAAGTACAGTTAACCATGTCGAAAAAGATACCATAAATCCATCCCTACA
TTTTTTATATTTGTATTATGTATTTACTTATAATTTAATTACACATTTTA
GCCCATTTTATAACCTGTCCACCTGGTTGGAAGAAGTCTCCTTCTTCTTG
TTACATTCTGATAAAGTTGGAAAAAACTTTCCACAAGGCGTCTCGGGAGT
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GATTTCTTAATATCATATATTTTCGATGAAAAGAAAGGTAAGATCATTTA
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GTCCAAAAAAAAGCTAAAAGACTTCAAACCATTCAGTCCAGCCCTAATAA
AAATTTTACAATAACTACAACAACTGAAATGACGTAGTTACTTACTATTT
ATCAACCAAATTATACTTTTCCAAAAATATTTTAAGTTCCATATATAATG
ATCATGACCGGCAATTTTGCCTCTATAAGATCTTACCCCACGACAAGTTT
TTTTCGTACTTTGCTGTTGTATCTCAATCAGATCAAGTTTTTAAAAAATA
CAAGGTTATAACATAACGTATGTACAACTTCCACCACACTTTATAATAGT
TACGTCATAGAATAATTTGCGTGTATTGTCAAAATCTGTTTTCTTGCCCA
GCAGTCAGTCCGATACATCAAATTGAAAATTCAAACAATAGTATTGTCAT
AGAATATGATTGGTTGCGTGATTTGTCAAAATATGTCTGKCTTGCCTAGC
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TACTATTTGGAGTAGTACAAGCTTCAATCACGTAATTTGTTATTTTGAAA
AACATCATTCCCGATGAYAAATTCCTCTTGATCAACACATATGAACTGTG
ACTAGTTAAAAAGCTATAATATTTATCATCATTGTAATTTGTATATCCAT
ATCACAAGGTATTTTTAGCAACTCTTCCATTTTTGGACAATACTCGTATT
TTAAATCCCTAAAAAATGAGGGATGGACAGAATGTAAACAGCTCAAAATC
GAATATATATGATAAATCAATCATTTTGATATTATTTTCCTATTTTATTC
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TTACTCTCGGCGAAAATGTTCCCGGCAAAATTTTCGAATATTATATACAT
TTCTCTGAAAAAATTTTATCGATATTTTATAATATTATCTATCATTCAGG
GAGTTGGTATACTCTTTGTCGCTTTGTTTACAAACTATTGTAAGTAAACA
ATATTCATGTCTCAACAGGGGGTGTCCGTAGAATTATATTCTTGGGGAAG
GGCTTGTTTTTTGTAAAAATTGTCATTTTGAAAATTAAATTTTTTGAAAA
AAAATTTCAAATATTATATTTTTTGATAAAATTAAAAAAAATCCATGTCT
ATATTAAAAAAATTAGATTTTAAATGTAAAATTTTATAAAAAAAAACTTA
AATATGAAATTTTTTGGAGAAAAATTCCAAAAATCCATAGTTATTCAGAA
AAATTAATTTTTTTGTGAAAAATGTTATAGGTACAAAGTTAGTCTTCAAA
AAATTTTTTGAAAAAAAAAATTCAAATACACTGAGCTGTTCAAAAAAAAA
ATTACGAAAACAAAATTTATAAAACTACATTTCAAAATAAGATTAAATAA
TAAATTTATCAGTCAACAATTTCAAAAAGTCAAAATTATTCACAAACTAT
TAAATGGATTCGGGGAAAATTTAATTAAATTTCAAACTTTCTATCATTGT
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TTTTGTAAGCAAAATACAGGGACTACCTCCTTATTGTAGTTTTAGGGAAC
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TGGGAGAAATTATTGTTCAAAATCCACTTTTTACTTTTTTTCTTTTTTGA
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CATAAATTATTTAAAATAATGTATGACGGACAAGAAACTTGTAAAAAAAT
ATATTTCTCGGGTAGTTTCTTGATTTTTTTAATTTGGTCATTTCAATACT
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TTTTAAGTCTGGGTATCAAATCAAATGCTTACTTTAAATCCCTACCTACT
AAATGAATATATGGCATAATACGAACGAACTCATCAACAAATAAATAAAA
AATTGTTTACATTAAGATATAGTTTTGTTATCATTTATTATCATTATATA
AAAAGCACGACATCCGGACAATATACTGCACAATAAAGGATCTGAGAATA
ATTCCGCATTATGACAAATCTGCGGTGTTTGAAACAGCGTTATGCAGGAA
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GTATAATAAAGTTTACATTCCGAGGATATAAAACTATTTTATTAAATTGA
TATCACTTTATAAACTTGGAAGTTGATCATCTTTTGATTTGTCAATTCAT
CTCAAGTAGCTTTACTCCGTTCATGTTTAGCTAATTTATCAATTTCTTCG
TCTGTCATCGGCGGCCCGKGTTCTTTATTGAACTTTATAATGTAAAAAAA
GAGGKTAGTATGTTTTYGGACTGGGKCAACAATTTTTATTCTAGAAGGTT
TAAAAAGCTTACATTTTCATTGCTCTCGTTATTATTCAGTCAATAATTAT
AATCTTTCATAATTAAAGCATTGGGCATTGAGCATGTTTGGATTGGATTG
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TCTGAGATTTTCAAATTGGGAGAGGAAATATCCGCTTCAAAGCGAAGATA
TCAGCTGTGTTTGGTTGAATGAAAAGTTGGAACGCTTCTGGACAAATGTT
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AATAAACCTTTGTCTCCTTTCAAATTTTGAATTAGACGTGCTACATAAAA
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AAAATCATATGTATTGTGGGTAGGTAAAATAAACGAAAGCTAACAACTTG
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AACCAGCTGTGGCAAGGGGAGGAAAAACTAAAGAAGGACACATAGGCAAG
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AAAAAATTTAACAGCTCAGGACTTAAATAATACAATAGACAACAGCCGAG
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GCACGCCTTTTTAAATAAATGAATCAAATCCCTAACATCCTATTTATAGA
ACAGCTAATTATTTGTTCTCTGCCACTCTCAGCCTTAATGGCCAAAATAC
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ACAGTTTCTTATTTTGGGGGCTACAGCCCCTCTACCCATCCCTATGCAGA
TGCCCCTTGATATGAATTGGTTGAGGCGAAAGTCTAGGAAAATTGGATTC
CTTATTTCGAAAAAAAGGGATATTGACTAGCAGACAGTATTCAAAATAAA
GCAAAGTATATTTCTATGATTTGAAACTTCATACTACTGATAGTTCACTT
TGCTTAATGATAATATAAAAAAAGCTTTTACCACTGACTCTGTTGCGTTT
ATGTTGAGAATCCCTGCCATAGGGAAAGAAATGTATTGATAATACAAAGG
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TTTAGGCGTGAACCTCAACTTTGACAAAGGGTATAAACAGAGATACAGGG
AGATCTGCAGGGGGGTATGGCTGAGCCCCCCCCCCGGATATACTCCATTG
GATGCCCCTTTAATATTTAGAGATACGAGCTCCCCAACATACGAGTTTGT
TTGTTTTAGGTACGAGAGTTAGTAACAGGACGCTAAAACTTCATACTTCT
TAGGAGATAAATAGATTTGACTTACGAACTCCGTCTAAATACAAATTAAA
CTCGTATGTTTAGCTATTACTGTATAGTGTTCTATCTCTGAGTAGAAGGC
TGTAGTATAATTTTAACATCAACTAAAGGGGAAAAGTTTCATTAATTGTT
ATATCCAATAAAGTTATTAGCCTTTGAATGTAAGGGAAATAAACAAATGT
GACGTTATTTTATACCCCCTGTTTCAGCTGATATAAAATGTATTTCTTTC
TTAATGCTACAAATCCTTTTATAATTGGTGAAGTAAATAGTTCTGAGTGT
TTATTTGTTTTATTTTGCCAATAAAATTAACATACTTAGGATTATCCGAT
TTAGATGGTTCCAAAAGGTTTTTGGCCAATATTCAGTTCCTGACCAATTG
AATAAGTGCTCATTTACCTCGACTCAATGCTTCCCATTATTTTATTGACA
TTTACGACTTCCATTTTACCAGAACGAAATCGTTGGAACCACAGCTTTGG
TTTTGAATTCGATACTGGTTTGAGTCCATAAACAGCACAATTATTGGCCT
CCTGCTCCAGGTTTTAACTTATAGGATGTATCAAGTATTTTTTTCTTTTT
TCACTTCCGTTATGCAAATCTGTAACACACAACTTGCTTCACCAAACACA
AAGCTATTAATACAAAGCTATAATACTATACAAAGCTATAATATTGAATA
TTGAATTAATAGGGAAAATCAAGCCATGCTTATCTCGATCATTCACAACA
CAAAAGGAGATTTTTTTTTGGGACTGAAATATGATGCAAACACATCTACA
TGGACTTGGCTTGATGACACCTCTTTAAATGGATATTCAAATTGGGGAGA
TGAGGAACCCCAAATAGGAGACATAAATCCTTTGAATGTTTGTGCTATTA
TGGCAAGCCAATCCTTATACACCGGAGTATGGAAGACAGCAAAATGTAAT
GATCAACATGATTTTATATGTCAATCACCAAGAAAAGGATTCACAAATCC
TCCTGAACCAACGACCCCGCATACTACAATAGATCCCACCTTCAAATGTC
CTGAGAATTATGTTTTCATCGATTCTTTATGTTACTATTTTTCTCCGTAT
AGGAGACATACTTTTGAAGGGGCTGAGAAGGAATGCTCGCTTATGAGAGG
ACATTTGGTTTCCTTCAAAGATTACGAACATGAAGATCGAGTTTCGGAGT
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AAAATATATTAAAGCAACAAACAATTAAATAGCATATAAAAGAAACCTGA
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TCTATTCGTGCMCTCCAAGCAGTTGGGCATCTMCMCAGCCACTGTCTATG
CCGTTAGAGAAGAAGAACAATTCTGTCAATAAGGCGAATGAGTTAAAGAA
AACAGCCCAGGTCAATACCCTCATGTCCATGGGGGCTACGCAAGAGTTTT
ACACCAGATGGTCCAGATAGATATCAAAAAGGGGGCAGAAAGAGACTTCT
AAAGTTGTAGAGTGCACTTTTGACAGTAGAAATGAAAGAAACCTATCTAC
TGTATAGCAAAACTCTTTTCAATCAGGTTTTTTAACTCTTTTTGAACACT
TTTGGTCCCCATAAAGCCAAGCTGCCAGCCCTTTTGACTCAGCCTTTTGA
GTGTATGTCGAGGGGAAGGCTTATAGTGCCTTCTTCCAAACATGGAGGCC
CTCAAAACTACTTTTAGCCAACACTGGAACGCCATGGCAAAGGACTACAT
CTTCAAACGGGAGTAGTCCTTCCTCCCACTGCCTAAAATTGCCGCTAAGG
GAGGCTACATAAATGATTGATTAAGAGAGCTCAGGCACACATCTATTTAT
AGTATTAATTTTTTTGAAATTCTCTTGTTAATTTAGAAATTATATCTCTT
TAAGGTTTAAAAATCAAAATGTTCATATTTTAGTGGACAACAATTTCCTT
GCTCTCTATTAAATCATTGTATTATTCTTAGTGTTGTGTGGGTCCTAGTT
TATTCAGTGGTGGTGTAGTCCAGTACCATCTTAGGACCGATCCTTAAGAC
TGTCAGTACTAGAACTGATATAAAAGAAATAAGATAGATAAAGCTCAAAA
GCAGAACTTTATAAGTTTTTAGGACTGATATGCGAGACTAAACTGGGCGG
AACAGSGGTGTTCAGTCCTAAATAAGGMCCMCCTCAACACTTGGAGCTGC
CACTTTTGAGTTTATTCAGAATAATAAAAGAAAATGTGGAATAAAAATAT
ATATATATAGATATTATCTAATTAATTAAAACTCCTTTAAACTTTAATCC
AATTCCAGGGAAATATTATCCTTCTTTGAAGATCAGGCTTACATTGGACT
AAGAGAATTTCCTCAACTTGGAGGATTTCATTGGTTAGACCCTTCTTTTC
CCTATGGGAGCTATACTAACTGGGATGATGGACAACCAAACTCTTATGGT
GGATCTCAAGCCTGCGTAAGCGTTCAGAAAAAAAGTGGACAATGACAAAC
TGTATGAATGACCTCCCTTTTATCTGTGTCACGACTCCAAGCGCAGATCC
CTTCCCAACCCTACCACCTGATCCAACTGTTAATCCTAAATTACCATGTG
AAGGAATGGATAATAGTTGGTTTATGTTACCAAATCAAATCGAAAGTTAT
TGCTATAAGTTTAGTAGATTTGAAGAGACTTGGCACACTTCTTTGAGACA
ATGTAGAGATGAAGGGAGTGAGCTCGTATCCATTCACAACACTGAGCAAA
ATAACATACTTTGGCATATCCTCCAACATTTAGCTATAAAGGAGTGGTTT
GTATGGNATGGGTGTTAATGGTTTGAACGAAAATGAGGAGMACAGATGGA
CAGATGGAACTCCTATGAACTTTGTGAATTGGAAAGGTGATGACAGTGGG
GAACATTCAAGCATGAAAAGCTGTGGGGAAATGTTGATCAGGGAAGGTGG
ACTCTGGCAAAAGTCTCATTGTGGAATAAAGAGACGATTTATTTGCAAAA
AACCACAGCATGGTAGTTTTCCTTCACCTGCTCCTCCTATTATACCCAGA
GGGCATTGCAAAGTGGGGCTTCCAGAGTACTTGGGATACTGCTATAGTAT
AGCCCTCCAAGAATTTAACTGGAGTGATGCTCGAAAAAATTGCTTATCGT
CAAAGTCTGACTTAGTCAGTGTTCACAGTATTAAAGAAATGTCCTTTTTA
ACCAGTAGGGTTTTGCCTCTATTAAATACATCTTTGTCGTGGATTGGATA
TCAGGATTTGATTCATGAGACAAACTTTGGATGGAGTGATGAAAGTCCTG
TTGACTATACAAATTGGGCAGGAAATGAACCTGTCAGTGGATTCTCAAAA
GTAATTTCTTAAGATTTATGTCACCATAATTAAAATAGTGTTGGGTTTCG
GTCTAGAAATAGTAGAACGGTTGAGACTGTTATAGTTTTGTAAAATCAAA
ATGATTCGGTCTTCAGTCGGTATGAACCAGACTCATAGAAAAATTCGGCC
CGACCTAAAAATTACCCTTTTTATTTTTGAAAAAGACTTTTCGGTCTACC
ATTTAAATTTCAATATGAAGTTTACGACTGCTCCCTGGAATAAACTATTA
ATCCAGATTGCTATAGAAAACATCAATTGAGTTCGAACCGGATGAGAAAA
TTGGTCTAAGACAGAGTCTCAACACTAATATACATATTTATTTTATATAC
ATTTCTAACCAGCTAATGTTGGCATTCTTATTTACAGAATAATGACTGTG
TCGGCGCTTATACAAGAGATCCTCATAAAATAGGGAAATGGGCGAATATA
AAAAATGATACAATGCTTAACTTTATTTGCAAGACTAAAGCTCAACCTTC
TGTAACAGAAATGACATACACACTACCAAAATGTAACGAAAATGGGGAAT
TTGATGAGTACGATGGGAACTGTTATCTATATGTTAAAGAACAAAAGTCT
TGGTCAGAGGCTAAAAATTACTGTAGAAGTAAAAAATCGAACCTCGTATC
TGTTCAAACCCTGCAGGAAAATTCCTTTTTAACTGCATATTTGGAGAATG
ACTCTTGGATAGGCCTTTATTTCGTAAGTTTACTATATTTTGCATTTTAT
GGGTTATTCCTAGAGGTGTAAATAAAAATCATGGCTTGGTTTCAGGMAAT
TTTGTCCCATGTATTTCATTCTTAGAGATTTTTCCGCCTTTCTTTGTTTT
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