EMLSAT00000010371, EMLSAT00000010371-706218 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010371
Unique NameEMLSAT00000010371-706218
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s688supercontigLSalAtl2s688:44883..67737 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010371 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010371EMLSAG00000010371-693137Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000046110EMLSAE00000046110-755038Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046111EMLSAE00000046111-755039Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046112EMLSAE00000046112-755040Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046113EMLSAE00000046113-755041Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046114EMLSAE00000046114-755042Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046115EMLSAE00000046115-755043Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046116EMLSAE00000046116-755044Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046117EMLSAE00000046117-755045Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046118EMLSAE00000046118-755046Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046119EMLSAE00000046119-755047Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046120EMLSAE00000046120-755048Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046121EMLSAE00000046121-755049Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046122EMLSAE00000046122-755050Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046123EMLSAE00000046123-755051Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770468auto770468Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010371EMLSAP00000010371Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010371

>EMLSAP00000010371 ID=EMLSAP00000010371|Name=EMLSAP00000010371|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=729bp
MNRRRNFQEADAECNMHSEQNNQARLLSIHDPTEQQFITSAFLNLGHRGS
YWIGFNSEMDFYQWTDSSPFSYSNFVSNDESKHYKGPPPIPDANVCPAHW
HSTNTRCFYTSDNDWDYEEAQKECTNKNSYLASIHDEHENQFIASTLQHP
SQSYWLGLRKEKLHSEYEKWLDGSEIDYTNFAQKIMELPNEDTSSTFYGV
HMNQQGLWRPSESTTKSQFVCSAKQTHFITCPPGWKKSPSSCYILIKLEK
TFHKASRECKDRGGYLARIESIEEEDFLISYIFDEKKALGIEHVWIGLKT
KKKRNHYYTWEDGSDLRFSNWERKYPLQSEDISCVWLNEKLERFWTNVKC
SSQSAYICEKPQTITENPPPEERGCTHEQVPYQGNCYEIFLTQKTFDEAI
HACAEKQGSLLKIKNMEILSFFEDQAYIGLREFPQLGGFHWLDPSFPYGS
YTNWDDGQPNSYGGSQACTKAQPSVTEMTYTLPKCNENGEFDEYDGNCYL
YVKEQKSWSEAKNYCRSKKSNLVSVQTLQENSFLTAYLENDSWIGLYFTK
ENKEVQWTDGREPTPDLVGKCPETHGWVKGPINHCYFFGEKVGLFYTGAE
ELCAKVGGTLAGIHTRADNDWLKKNANTKHKGHWIGIQRVVLETEPFKGG
FHSWVQGYRNKRGTHGEFIPITGKWSLEESKNVRDHFICSAKMSFVMNPV
PSIPTSTPPENTNGLSAGGIVAIILGSLI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s688:44883..67737+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010371-706218 ID=EMLSAT00000010371-706218|Name=EMLSAT00000010371|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22855bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s688:44883..67737+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATCGAAGACGAAACTTTCAAGAGGCTGATGCAGAATGCAATATGCA CTCAGAACAAAACAATCAAGCCAGGTTGTTATCAATTCATGATCCCACGG AACAACAATTTATCACAAGTGAGTAAATGCTTTCCACAAAATATTATGTC ATCCAAGGCCAGTTTTAGAGAGGGGCACATGTATCATCTTCTCGAGCTCA CCCCTCTACTTTTATTTATAAAAAAAAAAGATTGTATAACATTAATCAAC AAAATTTCAACTTTTTAGGTACACAGTATTAGAGTAAGGATATTAATTTC TGCGTACGCATAGATATTTATCTATTAACTTATCAAGAGAGAGGGTATAT AATTAATTTTATGTCGGTTCCTATTTAGGACTAAAAGTTCAGACTAAGTT CAGTCTCTCTCTAGAACAGTTCAGTCCTGCATATCAGCATTAAAACTCAT AAAATTTTTTAAATTTTGTCCTTGATGGCGTTTACTTTAAACTTTTTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTGTTCTAGTACTGACAGTCCAAAG TACCGACGGTATTAAGGACCGGTCCCAAGAACTGATAGGAGCAATAATAA GACTGTAAAAGTCTAAATAAATAAGGACCAACATAACACTATTTATAACA CATAACTATCCTTATTTTGTACTCTCAAAAGTATATATAAGTTTAATAAA GTGAGGGTTAAAAGCAATTTCCTCTACGAGCCTATGTAGTGGCTATGTTA CAATTTGTTTAGCCGCTGACTATAGTTTGCAGGGGCATGCTCATTGCAGT TTATTTATGTTATGAAATTCCTGAGAGAACAGGATATCGCCGCTTAGTGA ATGAAAAAATTGGACCTGTACATATATCTTAGCCAAGCCCCGCTAACACT GGCTTTTATCTATAATACTTCATTAATTATATTTTGTAACTCAGGCGCAT TCTTAAACCTGGGTCATAGAGGATCGTATTGGATAGGGTTCAATTCTGAA ATGGATTTTTATCAATGGACGGATTCAAGTCCCTTTAGCTATTCTAATTT TGTCAGTAATGATGAGAGTAAGACTTGTTTAAAANNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGCCTTTGAGAAAT GTATATGGCCATTGGGTTGACGCCGACTGCAATAATGAAAAACTTCCGAG TATATGCAGTAAAAAAGGKAATGCTTATCTAATTAATCAAAMAATACATA AGTATTGAGGGGTTTCATGCAATGTTGCAGGAACGTCCAGAGGACTATAT TTTGGAGGTTTGGTTTTTGAACTTTTTTTTTTTTAATTAMAATTTTTTGG AAAAAAATTTAAAACAACCAGAGCTGTTAACAAAAGAAAAAAAAATTGAA AAAATTTCTAAAATTAAATTGCAAATGTTTCGTAGAAAATTTCAAAAATC TAGAGCTATTCTCATGCATAAAATGTTTTGGAAAGAAAATTCAAAGCTAT TTTCAAAATAATTAAATTTTTTAGAAACAAAGTTCAAAAATCCAGAGCCA TTAAAAAAAGTTATAAAATTAAATTTTGAATAGAAAACTTTTTGCAAAAA AAGAAATTCAAATATGAAATTTTTTGGAGAAAAATTCCACCATACATAGT TTAAATTAAATTTTTGGTTAAAAACTAAAAAAATTTAATTAAATTGACTG AAAAATATTATATTTCTAGTAATAATATTAAATTATTTAATTTGGGGGAA GCTATAGCCCCTAAAACCCGCCTACCGCGGACGCTTCTTGGGTCAGTCTT GTTGATTTCTGCTATTTTGTGAGAGACCTAATCAATCACGGGTTATATCA GTGATAACTATTTTTTCATTAATTCTCCGTTAATTAACATTCTTTTGAAT ACACGGTTAGTGAATTGGGTAAAAATACACCCCCAAAAAAATAGTTATTT ATTTATATGAGAAATAGTGAAAGATTATCATAATTACATATTTCAAATTT TCTTTCATTTTTTTACTATTTCTTCCATTTTGCAGACGTAATTGTGAATA AAATTACAGAAAAAAACTTACGCATAACACTTAATTTTTACACTAAACCT CATTAAAAAGTTGCTGAATATACGAATAAATTTTAAACAAGGTATTATCA AAGTAAATAAAGAATGGCATAGGATCAGCATACTTAAAATTAACAAGTTT TATTCTTAGATACACGATGCATATACAAAGGAATAAGAAGCATTTTATAA ATCTCGGGGTGTATAATATTCCAGTTCAGTAACGGAGGGTTAAAGTGTAG GAAATGATTTAATTGTTGTACGTCAAAATATATTCAGATTTTCATAATAC TATATGAGACTGAAAAATATGGGTTCACGGTGGGAGACTGCGGTCTGGAC CCAAAAATTGCTCTAGAAAAAATCACTGCGTACCCGTCTCAACAACCCAA AACCATCCTTATTCGCAAATGATATTATAATGGCTTATAATATTTATATT TTTAATTATATACCTTTAGGTAAACACTATAAAGGACCTCCTCCGATTCC TGATGCAAGTAAGTTTTAATGTCATTAAGCATTTCGCTGAGTCATTACCA CTTCTTTATCGAACCATAGATAATTGTCCAGAAGGCTGGCTCAGATCTGG GCATCAATGTTTATTTTTCTCATCCATCAAAGAAAACTATAATAATGCAA AGGCTAGTTGTAAAGCAAAAAAATCTACTCTTGCTTACATTTTGGATGAA AGAACAAATTATTTTATTCAAGGACAAATAAATGATGGCAGTGGAGATGC CTATTATTTCGGCTTKWATGATATACAAACCCAACATCAATATGTATGGC CAGATGGAACAATATTGAGTGGCTATAGTAATTGGGCGCCGAACGAGCCT AACGATAATCATCATGTTCAAAACTGTGTCGAAATTTTCATGGATGGTTA TTGGAACGACAGAAGTTGTGATGGCGAAAGAAAATATATTTGTGCAACAC AATATAGTAATTATTCTTAATATTAAATGTGAATGTCCATGCGTGTCTTT GTCCTTCAATCACAACCAAACTAATGGATTGATTTTCCTGAAATTATGAC TCCACAAACAGTTTTGGAAATAATTTTTATGGCGTCAATGTCATGACGGC CTTTAAATAGCCTTTCCTAGGACTTCACATGTAGTACAACATGAGGGCCG GGCTGTATTTTGAATATAGGAAGGGTTCTTTGATTCTGAGGGAAGTCTCG GTCGAAGAATTAAACCTGTCTGAGGGACCCGCATCTCATATACACCACCT GTGGACGAGATTGTATTCTGGCATATTAGAAGGGGCTCTTAGGTACTTAT AAATGCGGCGGCGAAGCTGTTTCTTAATAATCAGGGAAACGATGGTGGAG AAATTTAACTTGCCTTGCGGCGAGCACTGGGGTGAATTATAGCATATTTG AAGGGTGAAGCTATATTTTGGTCCAGTACTTCACTTGTACAGTATAATGA GTGTATTTTGGGATATTTGGAGAGTTCCTTGATATTCAAGGAAGCGACTG CGAAACTGCAAGTTTCGCAGCTGATCACAAAATAAAGCAAACACTTCCTC TTTGAGTGAAAGAAGATATATAATGCCTATATATTAGTATAGTCATACTC ATAAAAATCAATAGGAGATTAATTCATTTTAATTTCTTAATGACACAGGC AACACCGGACAAGCCTACTATAGTGCTTCAGTATAATTGAATGTCAACAG TTTTCCCTTTTGGATCACTTAATTTTCCAGAGGTAGCTTGGATTAGACAC ACCTAAATGCTAAGCCTACGTATGAAATTCTGCTCCTGGTTGAATCCATA ATACATGGAGTGTGCGATGTAAAATCACCGACTTAACTTTAAATCAATCT GGATTATTTTAGAGTGAATATTTGAAAATACCAGATTGTGCTATTAAAGG TAGTGACTATTCCAGTTAATTAACAACTAAAAAAAAGACTTTCAAAGATC AACCATTCAGACCATAGATGTAAAAAGAAAAGTGTGTCTGATTTGATTCA CACCCAAGTGAATGTCAAGGAGATCATGAATGTTGTTGGGTTCTGATTAT CAATTATTCTATTCGAATAGTTGTCGGGTTTATATAATTTTGTTTTTATT ATTATACAAATTTTATAAACTATTTTGTCCCTGGTTCGAATTCATAACAT AGTAAGATTTTTTTCCTGTATGCATTGAAATTATTCCAACTTTAAACAAC CAATTAAGTCATTTTATACATTACGTATTTTGATGAAAAGATTCAAGATC GTTAGTTGAAGCGAGAGCTAAAAGTCTGGACTTCGCATCAGTAAACAATT TGATCAAAACATTTAGAATATAAATTTGGTTCCGCACCCTATACAGTTAA GCCTGGTCTAACAGGCACCTGATTTTAGCGTGTTACAACACTAAGGGGCT ATATTAAGTTTTCAACTTTATATTGTCTCAAAATCGGAAGTCTGGTCTTA GTGTCCACCTTCAATTAGCAGGTGTGTGTTTTTTGTTTTTTTTTCAGTTC TTGTCTGACCGCTTAATATAGGTTTATCTGTAATTAAATGAAACTTATTC TATTAAATAATTCCATGCGGGATAGTTCGTTGTAGAAAACCCCATAAAAT CCGTAATCCCGACAGAGAAAACCAACTATCCCCCCAAATATATTTGTATT AGATACCTACAATTGAGTTATTCTTTTTATCCATTTCAAATTCCATAGAT GTTTGTCCAGCTCACTGGCACTCAACAAACACCCGCTGCTTTTATACCTC AGATAATGATTGGGATTATGAAGAAGCTCAAAAAGAATGTACGAATAAGA ACTCTTATTTAGCGAGTATTCATGACGAGCATGAAAATCAGTTTATTGCT TCCACTTTGCAACATCCTTCTCAGTCTTATTGGTTGGGTCTTCGAAAAGA AAAATTACATTCCGAATACGAGAAATGGCTAGATGGAAGTGAAATTGACT ATACAAATTTCGCCCAAAAAATAATGGAACTTCCGAATGAAGACACCTCC TCGACCTTTTATGGAGTTCATATGAACCAACAGGGATTGTGGAGGCCCTC GGAATCAACCACGAAGTCTCAATTTGTATGCTCAGCAAAACAAAGTAAGA TTTTACACAATTACGGATAGGTCCAAGTAATATTCATAGGAGTAACCCGG TGCTCTTCCGGGTAAAATCAAAAAAGTGTTGGGATATGTATTTATATGGG TATTTGTAATATATACATCAGTAAGGATATGAAAATTATTGAAAACTTAG AGAGTGTAGAATCCCTACCTAAGATAATGTTAAACGACATATCTACTGAC AGAGATACCTGCAGTGCTCTTGGCCTGTATTTTCAAGAATGAAAAAATAA TTGATACGAGCACTAATATACTTTTCTTTTATGCTCGCCAGGATTTTGAC AGTTTTCACATATTTATTTATCCCCATTGACAGATAGTTTTGAGTCTTGC CCTTTTTGTAAGTATACTAGTATGAGCCTGCCACTTGAACGGGCGAATGG GGAGGATAATGACAGTATAATGTGATGTAATGTTTGCTTAGAAATACATA GATGTTTGTAACCTCATCATGTATAGAAAGATGATGTTGTCTTAAGTAAT CAAGAAGAAATATTACGAAAATAATATATCAAATTAGTTATAAAATGTCA CTMTTTGGCTTTATTGAACAGATTAAGTTTTCATAAGTCTTCATGTGAAT TACAACAATCCCAAACGAACCAACTGGCTAATGTAATCTTCCCTTCCCTT CTAATTTTTAATAGTAATGTGTAGAACAAAAAATGTTGCTGAGCAGAAAA AACGGAGGAGAAGGAAGATTCAAAAGATTTTTTTTGTATATAAGTGAGTA CACAAAGGACTCATATTTTTGTAAATTAAATACTATGTTCTACTCGAGCC CGAAGTACAGTTAACCATGTCGAAAAAGATACCATAAATCCATCCCTACA TTTTTTATATTTGTATTATGTATTTACTTATAATTTAATTACACATTTTA GCCCATTTTATAACCTGTCCACCTGGTTGGAAGAAGTCTCCTTCTTCTTG TTACATTCTGATAAAGTTGGAAAAAACTTTCCACAAGGCGTCTCGGGAGT GCAAAGATAGAGGTGGCTATTTGGCTAGAATAGAAAGTATCGAAGAGGAG GATTTCTTAATATCATATATTTTCGATGAAAAGAAAGGTAAGATCATTTA GAGGAAAGATTTTTGAGTACATTTAGCAGGTAAAAATTATTGTTGAAACC GTCCAAAAAAAAGCTAAAAGACTTCAAACCATTCAGTCCAGCCCTAATAA AAATTTTACAATAACTACAACAACTGAAATGACGTAGTTACTTACTATTT ATCAACCAAATTATACTTTTCCAAAAATATTTTAAGTTCCATATATAATG ATCATGACCGGCAATTTTGCCTCTATAAGATCTTACCCCACGACAAGTTT TTTTCGTACTTTGCTGTTGTATCTCAATCAGATCAAGTTTTTAAAAAATA CAAGGTTATAACATAACGTATGTACAACTTCCACCACACTTTATAATAGT TACGTCATAGAATAATTTGCGTGTATTGTCAAAATCTGTTTTCTTGCCCA GCAGTCAGTCCGATACATCAAATTGAAAATTCAAACAATAGTATTGTCAT AGAATATGATTGGTTGCGTGATTTGTCAAAATATGTCTGKCTTGCCTAGC AATGGGTACTGTTCATCGAATATAAAGTTATAGCAAGCCCGATTTCATGA TGGTCTAACTTTGTATTTCTATTAACCATGGATAGGATTAATTATATAGT TAGGATAGGGAGAAAAAATAATGAAATGATTTATAGTGAATTAGTTCTTA TACTATTTGGAGTAGTACAAGCTTCAATCACGTAATTTGTTATTTTGAAA AACATCATTCCCGATGAYAAATTCCTCTTGATCAACACATATGAACTGTG ACTAGTTAAAAAGCTATAATATTTATCATCATTGTAATTTGTATATCCAT ATCACAAGGTATTTTTAGCAACTCTTCCATTTTTGGACAATACTCGTATT TTAAATCCCTAAAAAATGAGGGATGGACAGAATGTAAACAGCTCAAAATC GAATATATATGATAAATCAATCATTTTGATATTATTTTCCTATTTTATTC TTATCCTTTCTATTCAATTAATCTGATGGAGATGGAACAGTAAAGTTCGA ACCGACAATATAGTAACATAAAAAGGGGGCAAATATCTCCTCCAGGCAAA ATACCAAATATACAACTATAGACAACTCTAAACGAATATGGACAGAAAAA TTACTCTCGGCGAAAATGTTCCCGGCAAAATTTTCGAATATTATATACAT TTCTCTGAAAAAATTTTATCGATATTTTATAATATTATCTATCATTCAGG GAGTTGGTATACTCTTTGTCGCTTTGTTTACAAACTATTGTAAGTAAACA ATATTCATGTCTCAACAGGGGGTGTCCGTAGAATTATATTCTTGGGGAAG GGCTTGTTTTTTGTAAAAATTGTCATTTTGAAAATTAAATTTTTTGAAAA 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AAAAGCACGACATCCGGACAATATACTGCACAATAAAGGATCTGAGAATA ATTCCGCATTATGACAAATCTGCGGTGTTTGAAACAGCGTTATGCAGGAA CCCTTTGTATTTTAAATTCAGTGCTAAACTTTTGCTGTCTGGTTTCTATT GTATAATAAAGTTTACATTCCGAGGATATAAAACTATTTTATTAAATTGA TATCACTTTATAAACTTGGAAGTTGATCATCTTTTGATTTGTCAATTCAT CTCAAGTAGCTTTACTCCGTTCATGTTTAGCTAATTTATCAATTTCTTCG TCTGTCATCGGCGGCCCGKGTTCTTTATTGAACTTTATAATGTAAAAAAA GAGGKTAGTATGTTTTYGGACTGGGKCAACAATTTTTATTCTAGAAGGTT TAAAAAGCTTACATTTTCATTGCTCTCGTTATTATTCAGTCAATAATTAT AATCTTTCATAATTAAAGCATTGGGCATTGAGCATGTTTGGATTGGATTG AAGACAAAAAAGAAAAGGAATCACTATTATACCTGGGAGGATGGCTCTGA TCTGAGATTTTCAAATTGGGAGAGGAAATATCCGCTTCAAAGCGAAGATA TCAGCTGTGTTTGGTTGAATGAAAAGTTGGAACGCTTCTGGACAAATGTT AAATGTAGTTCACAATCCGCCTATATATGTGAAAAACCCCAAACAATAAC TGAAAACCCTCCGCCTGAGGAAAGAGGATGTACTCATGTATGAAGGGCTG TAATGTCGGTGGGTCAGCACTAAAGGGTCGTAATTTAGTACAATCTAATA ACACAAACTTTGAAAAGTCGATGCTAGGGTTATGTCGGTTGCAATTTATT TGGTTCAGTACACTCATTCTTTTTTTAAATATGTCTATGGTTTATTATTT CATATAAGATATTTGAGATATATCTTTTTTCGAATTTCAATTACGGGTAC 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TATGGGTTTATAAATTATAATTCGTATATACGTACTAAAACTGAGTGATT CATTATGCTGACCCAGTGATATGTAACCAAAACCTCTGTATTACGAACAA AATATATATTCTTCTAGGAACAAGTTCCTTACCAAGGTAATTGCTATGAA ATTTTTCTGACCCAGAAAACATTCGACGAAGCCATCCATGCTTGTGCTGA AAAACAAGGCAGTCTTTTAAAAATCAAAAACATGTAAGTAACTAGTATAT CCAAAAAAAACGGGGTTCTCAACCTATTGTATCTGAAGCCTCATTTCAAG GCACGCCTTTTTAAATAAATGAATCAAATCCCTAACATCCTATTTATAGA ACAGCTAATTATTTGTTCTCTGCCACTCTCAGCCTTAATGGCCAAAATAC ATATTTACTTAACCTCAATGAGACACTCGGACTTGCCTCTGGGTAATAAT AAAATAAAGTCAATATGGTTTGATACACAGGGTAGTATTCAAAGTTGCTT ACAGTTTCTTATTTTGGGGGCTACAGCCCCTCTACCCATCCCTATGCAGA TGCCCCTTGATATGAATTGGTTGAGGCGAAAGTCTAGGAAAATTGGATTC CTTATTTCGAAAAAAAGGGATATTGACTAGCAGACAGTATTCAAAATAAA GCAAAGTATATTTCTATGATTTGAAACTTCATACTACTGATAGTTCACTT TGCTTAATGATAATATAAAAAAAGCTTTTACCACTGACTCTGTTGCGTTT ATGTTGAGAATCCCTGCCATAGGGAAAGAAATGTATTGATAATACAAAGG GATTTAGACCAACAGTTCAGCATAGTTAGGATTTAGAAGATTAAAAACTC TTTAGGCGTGAACCTCAACTTTGACAAAGGGTATAAACAGAGATACAGGG AGATCTGCAGGGGGGTATGGCTGAGCCCCCCCCCCGGATATACTCCATTG 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