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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s68 | supercontig | LSalAtl2s68:1450700..1474633 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010395 >EMLSAP00000010395 ID=EMLSAP00000010395|Name=EMLSAP00000010395|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=381bp
MDFNHSSPSSATGIGEEEEELLEIMEFPRWAIANSHYLEFHNRMAPDIDF SCISLLLASIFIYLMFLLIVITARRRKIPTFFIGTVIIFTGSVLAFSYVD PFWYTGSVIINSTYNLRQPDNFAVGEVKMKFGLRTFNVSYVSLDHINDDL SFSYNELFRFDSSHPKRNLQDVFKRSLQNGLPNPIICILDHLSFSPNREG LSWSNAGTAVADALIFVIFFFIVGIILLILTPKYGIYFIALDGFSLLGVV LLYFLKVPRDPLIIIEGTHXIFICVCSKKVEYVSTFFELNFDTPWDDQIL VRQSAEAKENNEIDRQYHRRVSIKKMRRSVRRLQDSFNAKISVKFRNHLS ESRSSSCDQIETIVFYSSGRIYRKISRDPCS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s68:1450700..1474633+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010395-706242 ID=EMLSAT00000010395-706242|Name=EMLSAT00000010395|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23934bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s68:1450700..1474633+ (Lepeophtheirus salmonis) TTCAAGGGCATCGTTTACTGTTAGTACATAGTTACAAAGTATTATAGTCA
CATCAAAAGGTACAGTTTCTATTATTTCTTAACATATATTTTTGCTTATT
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AACAAAAAAAAATGAAATTCTTTGTTAAATTTTATAGTAGAAAGCCAAAA
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TACGATCAGGTTACGGATTTTTTTTGTTTAAACCGGACTCGTAGACTGTA
CAAACTCACCATTGCACTATGTTTGGCGTTAGTTAAAAAAAATAATATCG
ATCGACTAAGTATTTATTCCACAATCGCGGAAAAGGCAGAGTGTCTTTGT
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TGCACAGGTCCTTTAAATGGGCAATCAGGAAGGAACTGAAAGAGTCCGGA
GATGATAATTACTCTGCTCCAACCCACACTGTAAAGACCTGATAGATTTA
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ACAAGATTCTGAAATTGAGGTGACGAGGATTATGGCCATTATGAAGTCTC
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GGTGACGTGCAAAGGCCGTGATTGATGATGAAGTAGGGCTTATTGAGTGA
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GTAAATGAAATGTAATATTTTACGAAAATTAATAATTAGTTCTGAATTAA
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AATATCGAACATTTATAAAAAGCAACTAGAATGGGCTCTCTGTAGAGGGT
AAAATTCTCCCTATTGCCATTATTACTAAATTTTTATTTTATTGTTATCT
TTTCACATACACTAAATTCCCACGAAAGATCATTAATTTTAATTATAAAA
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TAAAGTCCCTTTTTTCAATATATTTTGGGATGGTTTTGTTTAGACCTGCA
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AAACCACTTCTGCGACTTTGTCGTAAAGGAGTTTGAATTTATTATTCTTG
GATTGATTGATTTTCCTTCCATATTAAGTTTCTTCCAGGGTTTTACAACC
AACAAGTTTGCTTGGGATTTTATTTTTATTTTGATCATGATTTTTTTATT
TTTTCCTTTCCACTGAACCACATTCTTATAAAGAAAGGGATTGGATGGCC
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GAATCCAGTTTGCGATATTTCCTGAAAATCTTTTCAGCCCGTCTGTTGAA
GTTAGGGAGTGTACTTTATTGTTCTGTGATCGACAGTTCTAAGGCATGGG
TTAAAGTTGAGTGGTTCATTAGGACCTAAAGGAATGCGAGTACCAACGAC
TGAACTTTCCCAAGAAACTGCCATTCTATAACAATCATTACACAAGGTCT
TTATTAATTCAAAACCTTCATTTGGTCCAAAAAATATTCTGTCCGAGAAC
TATTCTCCGGTGATCCTTTGAACACGTATTTGTTTCTTTTGGCCCAAACG
TCTTCGCTTTTCATATTTTTCTATAATACTTCTGTGTCGACTGAACCCAA
TCCTCAGCTATTGAGTTAGTTAATAAGCCGATCGTTGGAGATAAACTGTC
GTTTGTCTCCCCAGACAAGGTGTTTCCTGGAAAAATCTATTATATCGCAT
GTTTTTTTTGGAAAATGGCGTGTACTTCGAGATATTGACTTTTTTTGTGA
AAGACCAATTTGTTCCCGATTTGGAGTTTTTCTAATTTTGTAATATTCAG
CAAAAAAAATCTGTTGACTTCCTTTGCCACTGTCTCCAAATTTTTTTCGT
AATTCTCTTTAATAAGATGTTCTTGGAATATTGACGAGACCACAACGTTT
CCAGCTTCTTTTTTTTTTAGAGAGGTGACTAATTCTGTTTTAGTTATGTT
TAATTTTAATCCTGATGATCCTTCAAAATTCAACAAGTTTATCTATNCCT
TCAAATTCAACAAGTTTATCTATAACATTTATTAACGAGATTTGTATATC
ACTTTGTGATCCTGTTGTAAAAATTGTAATTCACTTTGAAAATCGCGGAT
AAATAATATGACAATGATAGTCAAGAAGCGCTTAAGAGATCAGTAGCAGA
TGATTTCGGACCTTTTTTCCGTTTCTTTTCGGAGGAAAGGTTGCTGTATA
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TCCACCTTTATTTCAAAAAAAAAATCTTCCAACACCTACAAATGTATCTA
TATGAGGCTCATGAGCTATTTCCTTAATGGCCTCTCTCTGATCCGTAATA
TTGCTACAACTTTGTTCTAATACCAAACGATTATAACTATACAAACTTTA
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GTGTATCTCAAACATCTCTTGATGCTCTTCATATATATTTTGTGTTCTGT
TTGATGAGGAATTAATCGTCCTTATTAATCAAAGCCTTATAATTAAGATT
TGTTTACTTACATTTAGTAGATGTGGCAAGCGAAAAATACATAAGAATTA
AGTAAAACCTTTTAATAATTATCCTATTATTTATCTATTTGGTTTATCCA
TTGCGTGGAGGGATATGATCAAATGGATTAAGGTATTTTTTTTTTTGTAT
CATTAACTAAGATTCTTCTTAATTTTTAAATATATAGAGATTAAGATTTC
CTTTGGTTCAATCCTCTATGTATCAGTTACAGAGTGGTTAAGCAAAATTT
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TTTATATATTTTTTTGACGTCTCTGAGCGATTCGAGGAGTTCCTGCGAGT
ATTTGACAAATATGTTATATCTTTTTGACACAAATCTAACAAGTTAAAAT
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ATTTGGCTATAAAAGACATTACCAAAATTGTTTGAGTGGATGTCTGCTTT
GGTTAATAGATGGAATATTCTAAGGAAGTATTGAATACAAAGAGAGGGGA
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ACACTTTAATCTGGCCGAGGCACAAAATCATAAAAGACTGTCAACACGTT
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AGTAATGAGTCAACTGTAAAAAAGTTATCTGACAATATATTATTCACTGT
GGATGAGGTGTACATTATACAACCCACAAAATGACCGAGGATTTACGATA
TTGACAGAAGAGGTTCAAGGGGTTTTCCAAATAAAACAACATGGGCATAT
ATGATGGTCCTGGGTGTTCTAGACTCAAACTATTAAACTATGCTCATTAG
TTCTTCAAGAAAAAATAAAAGTGATGCCTACTACAAGTAGGGTTGTGTTG
GTCCTTTTTTAGGACTGAAGATCAGTCCTGCATATCAGTCCTTAAACTTA
TAAAGTTCCCTCCTTCGTGACTTCACTCCACTTTATTTCTTCTGTTCTAA
TTAGTTCTAGTACTGCCGGTCCCAAGACCTGATACGGACAAATAATTCAT
TAATGGATCATGTGCATTGCATGATCTTTCCACCTCTGGTTCTAAGATTC
GGAGTTGATCGAATAAGTTAGGAATGTCACAACACTAACTACAAGATACT
GAGGCACACGACTATTCTCCCATAGCTGCAGTAAAGTTTTAAAAATCGTG
TAGAGCAATAAGGCGATGAGCAAATTAAAAAAAAAAACTTTATTATCTGC
AAATTGGTGTGATCGACAGTAGCTTTGGAACAGAATATTATTTTTTCACA
GTGCCCTCTATGTGAGTAAAATACACCTATATTTTTTCTCAAATAATATT
ATCATTCAGGCAGTTGGGTTACTTTACCGCAAGACGGCGCCACACTCTGT
CTATTTGTTGACAAACTAATATGAATAAGCAACACGCATGCCCTATTTGA
TCAATTTCTCCCCTTACTTTTTGCTGTTGAGCACCATACAGAAGAAGATA
AATCATGCACTTGATCTAAGTAAAAGGTCCTTCTGGCCTAAAATTACCAA
GAAATTGATCAAATATCATGAAGAAGCAATCAGTAAGACTTGTACAAGGT
TTAGACTATGAGTCGAGGCTTTGATCAAGGCTAGTGAAGGACATATACAA
TAGATCCAACTAAAGTTGGATCTTAAGGGACCGTCAAAATGAGTCCACTG
TAAAAGAAATCCGCCTTATCGAATAAATTATGTATTCTATTACAACTCAT
TTGGGACTTTCAAAAATGCCCCTTATAAACTAATATCCGTAGTCCACTGT
ATAATAAATTTGTTTACAAATAAATACATTTCATTGCCCTTCAAATTTTA
TTCTGATACATCTAATTAATGAAAAGGGTTAAGCCCTTACCTTATCAGAT
TGGGCATTTTAGCATACACACACTGTATATACTTAATATAAGTGGGAATT
TAATTCGTTAAGAAGAATGTTTTGCTTAGAAGTTTTTCTGCTGATGAGTC
GTATTTATCTTATTCTGTATTTATTTCAATTTATCCAGCAAGTTTATCTA
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TGCCCTTCTATTTGTTGTAAAAAAAGAGGGGTTTATTTTTGAAAATAAAA
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AGTCAAATTAAGATACGTGGCCTACTATTTTATTCATTATTAGACATCTT
CAGTCCCGTTTGCCGACTGCCCAGACCTCCCTGTACAGCATTACGCAGAA
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TAATAAAGTTTTTTTCTAAAGCTGCCTTATGTATTAAAGAGTGAGAATAA
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AATTTTTATCAATAATTAAACCTTAGTAAGGCCGCAAATTGCCCTCTAAA
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TGCAATGTATACGGGCTGATACTCTTTCTGTTCGTATTGTACAACAATGG
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CATTTAACCTGGTAAAAGGTAGATTGATGATGACAAAACATCAATGATGA
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TTTTGAAATTACAGCCTGAAGAGTATTTTTTATTTTCCAAAGCTGTTGTC
ACTATTGTTTAGTTCTTGAAGAGAGAATATATAAGTATAAAGTAATCAAT
GGTGAGTGTGCTAATGATAGACGGAGAATAAAACTCCGTAGATGAGTCCG
AGAGTTATAAATATACAGAGTGGTGATCCAAAACATTCAGTAACATTTAA
ATACGATTTTATCCCTGTTATTTTTAATTGCAAGTTTTCGTTTTGAACCA
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AACAACAAAAAAAAAAGGCTACGATGTCTGCACTATTGTCTATACCAAGA
AGGGTGCAGAGACAACGGTATCTTGACCTCAACCCTCTGAACTTTGCAGT
TAAAAGCATTTTAGGAAAAAATGTTTGCCGCACATCTGATCCAAATTTAG
ACTGGATCTGAGTTGCCGTCATGACAGCGTGGTACGCCAAGGACACGACC
TTCATCGTCAAAAGCTGCTAATCTGTTCGCCATCTTGTTGAGGGGGTTAT
TGCTTTTGAAGAATAATATATTGAATGAAAATATATTTGAATATAGTATT
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ATTAAATTTTTCCTAATTAAGTCATGCTACTGAAAGTTTTGGGTACCCAA
TACTGTAAGTCCTTGTTGGACGATGAGTAGAATGGAGGATTTGCATCGGA
ATACATTCAGCCTATATGTCCATGATATATATGGAGTAAAATTTGTATTT
AATTCATTCCTACCATGGTTTTTTGCAGCTGATGAAATAAAACATCACGA
CAGCTAAGCTGATCTTTTCCCAAACCTTTTTTAAATAGTCATAATGACGA
TTTTCGTTTCTTTTTATGCTCCTTTCATTGGTTAGAGGGAGTTGCATTGA
TTAAGTATCAGTAAACGTTATAGTATTACTCCCTCAGAACTGGGAATTTT
CTTTAATGTCAATATACATGTTGTATATTTCTTTCTCTTGGAATGACCGG
GACGCGAACTTACACGCATTGATTTCAAGAGAATCATTTCTCCCGAGAGC
GTTGTCCATGAGCTATGTCAATTAACTTTTACATATTTGATGAATCACTG
CGTATGATACAAGGCTTCAAGTTTTTCCACTAGATTTGATTCTTCTGATT
TCTTCTCAAAAAGAGAAGAAAAAAAAGTGTAGAGTCCTGTAAGTGAAAAT
CTGTTCTCCACAAAACAATTTAATTACCAACCTACAAATTTGACATCTCA
TTACGTATTTGAGCAATAAAAAGCTTTAATTGGTTCTTTAATTGACGACT
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ATGTTTAATAACTTCTTCATCAATTATTATTATTATTTTTTTTTTCATAG
TAAAGTTATGAATGCTCCATGAGTGTTTATGAAGAATGATTATTATATAT
AAAAATAATTAATTAATTTTGACATTGATTTGATTTACTTATTAATTAGG
TTTCTCTTATTTAATACTCATGTGTGATATATGAAGGCTTACGGACCTAC
GGATTAGGGGTGAGTCTGATGCTCCAACTAAATATATACATTGTACAAAT
TATATTTACTACTCATTAGATTAAGACACGGTACCAGTTTCTGAAGACTC
CCTCCCTAATATTTTTTATCATATCTTAAATATTTTTTAAGTCTATTTTT
AGTGTTATCACATATAGAATCCAAAATTTTAGAGAAGATAAGTCTGAAAT
TTAGCAAGTAGACGTATAAAATAATCCACACTGTTCTGATGGTATGTTTT
GGACCCTCCAAGGTCATCAAGAGCCTGTTTTTGACCGTACTACAACTTGA
GCCCCTTCTAGGATATAAATAAAATAAAACTATTTATATACCAGATGAAA
CTTGTAACTTGTAAACTTTTTGGAAAGAAAAAAGAAATTGGCCTGTCATT
TACACAAAAATCTTTATTCATTTTTTCTGATACATAGCCAATGTCAAATT
CATTTATTCTACTCGGCCGTCGTTGTCCTCACAGATGGCGAAAAGAGTTG
CAAGTATTTGTTATGAAACTCTTCGTCGACGTGGGTCTTCATGGCTTCAA
TGTTCGGGMGACAGATGCTATAAGCCCTCATCTCGATGTGCGGCCAGAAA
TAAAATAAGAGAGGATTGACATCCGGAGTGTATGTTGTTAAATTGGCCTG
GAACCAGGGCTTCATGTTGGTATTTGAAAAGTCGACTTACATAGCTGCTT
TCAGCTTGTGTTAATAATTTTAGAGGCTAACCCCAGGACAGTACTAAGAA
AAGATTAAGCTTTATCCTTCAAAATTTAAGAATTTTTTTCATACCAGCCT
CCCTCCAACAAAAAGAGTAAAAAAAATAATTTGATCATAGTATATTATAA
AATTCAGCATCAATTAAAAATTAATTAGGAAGTTAAAATATTAACTTTTA
AGGATATTATAAACTACAATTTAGTAATTGGATAGCGCTACATGGCTGGC
TCTCAATTCTCATACATTGGGACATAAGCAAACTATTTTTAAAAAATATC
TGCAAGGGCGTGTGACAATAAGTAGTTTGGTGGCACAACATCAATAATAG
TTAAATACGGTTTTTATTTTTGATTAAAACGTTGCATAGTTATCAGTTCT
GGCCTTGGAACCACATTAATCCTACATTCCGTTTGACTTTACAATATCAT
TAAAATAGGTGTTCCCTACCACTCTTGAGCCACTTAACCCTATAATAAGC
TGACTATTAGTCTAGCATCTTTATCCCCAGAGAAAAATTAAAAAATATCC
TCGGCCGTGGACAGGGGAATTGGAGCCATTTTTTGTTCAAACTTCATGAT
TACACATTATAAATTCTCTTAATATTATTAATTACAAATATCTAAACATA
TTTGTTTGTTCCATCCCCCAAGGTAATACCTTCAAGTGTGAGCAATACAA
TTTCCTTGCAATTTTTTTAATATAATCCAGTCTTCTAAGATATGGATCGA
GAGGATTGGTAAGGAGGGCGGAGGGATAAATAGCTTAGGGCCTCATAAAA
TATGGTTGAATACCCTCCACCATCGGATTTTCCCTGGCGTTGTGTGGGAT
TGCTAAAAGCCACCGACAATTAATCCAAGGAAACCCTTCTAATACCAAAA
AAATGTTCCAAGCTCTCAGGTTGGGCGGGGTACTTGGGGTACCCCTGGAG
CAATTTTTCCCAGGGCAGTTTTCCGTGTACAATACTAGATAGATATTACT
AGCGAACTTATTTACGAACTTTTCAGACCACCTTCGTATATGTAAATCCA
TTTTTAAAATTATGAATAAATAATATGACAATGACCTTAAGGTTAAAATA
GCAGTTGATAATTTTGACTTATTTGTCTAACTACCAACTGATTTCTGGGT
CTTTCTTCTGTTTCATTCTGGGAAAATAGTTTTGCGTGAGACAATAAAAG
GTAACGTCGTGATCGAAGTAATGCCGTGCTAAATTATGTGGGAAAGAATC
CATTTTGAAAAGTGACGTCATTTTAGGACACACAACCTCCCATTCTACTT
TTTACATAATATTACATACATAGATAGACAAAGACTGGAAATTAGATCCA
TATTATTATAATTGCAATACCAGGAGATATCTCTACAAACACATTCATTT
TACTGACTCACACACCCACATTGGATACGGGGAATAAAGAATCCCTATAT
TATTATGTATTTTCTTCAATTCTCCCCCTCACTCTCCCCCCCCCCCCTCC
TCCTTCTCCTCGTTCCATATGAGTAGACATCAAACCATCAGACACCCTTA
ATATTTTTAATATTTCTACTACATATATATGTACATACAACTTCGACGCC
CGAACGTAGATTAGGGTGAGGTCAGCTGTGCGAAATGTWCTTGAAACGAG
GAGGGGGGGGGGGGGCAAATAATAGTAGGTGTAATTAAAAAAAATACATT
ATTTTTCCAATAGATAGCTTTAGAAATGTATATCTCGTGTTATATAAGTG
CGATCAGTTTATGCTGGCGGGCATTAGAAAGATAAGATTTAGTATTAAAA
AACACTTCTGTAACAGTTGTCAGGGGTTTCCACAGGATTATGTATTTATA
TATATATATTTATTTTTTTGGAAAAAAAATCCAAAATCCAAAGCTGTTAA
CAAAAATTCAAAAATTAAATGTCAAATTATAAATTTAACAAAAAAATACC
CCTATTTCCGCGTAAATTTTTTTCATCCTAAACAAAAGATGCAGATTTTT
TTTAAATCAGAAGAGCTACAGCCCCTTCAGCCCAACCCCTGTAGACGCCA
CTGATTTTTTTATTGTTTGACTGAGTATTGTTTGAGTGTTCGTCAAAGTT
GGACACCAGCAAAGAGGAAATACGCCAAATTTTAGAGTTTTTCTGTAATA
ACGCAAGCCTGGCGGCTGAAAATTAGAATAGTGTTGATGATCCTGATACT
GACATGTAATTTTGGTTTCTTTGATTTTATTTTGGTAATTTTAATGTCAA
AGATGCAAGGCCAATTGTCAAAAATTATTAATAAAATCATGAAAATCGTC
GATTTCGAACGTCCTTTAAACACTGTTAAGATTGCTTAGGACATTATAAG
GATTTTTTTTTTTAATCTAATAAAAATATTGAATTACTTTTTATGACACC
TTATATAATGATAAACTCATATAGTCACAAAACCTTCTTCTACCGATTCG
GACACTATTTATAGCACTACTAATGGTCTTAAAACTATTTTAAATCTTAT
CATATCTTTACAGTAACCTAAAACAAATACTGGTTTGAGCGCCATAAGTA
CACTTGTGCACTTGTTGTTTAGCCGATGTTACCACAATACTAGCGTGTTT
AACCGATAACCTGGTACTGTAAAATATGAAACAACAAGCATTATATTTTA
AAAAATGAATTACACTAAAATAAAAATAGCTGCACCCAACGCATGTGTTT
AGAAAACATTCAGCTTGTGTTCAATTTTGTTATTTTCAGTTTTCGAAAAC
GTTTTGATCATAAATTATTTTATAACTATATTTGATAAAATTACAAGACC
AAAGTCAAGAATTCAAATATACTTTCATTGAAGAGGTGAGATTCTAAAGT
TTTTGTGGAAATATAGTTAGTCCTTATTTGGCGTTGGAGTAGCGAGCAAC
GTGGGTTTGCAGTTGAAAGTAAATATTGCCAAAAAATGGTTTGACATAAT
ATTTTATATAATAAACTAAGTGCAATTTAGCTCCTTAGTTTTTATTGGTG
CAATTTATGCTTCTATTTTTATTTTCCAAAAACTATTTTTTCAATTTATT
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