EMLSAT00000010395, EMLSAT00000010395-706242 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010395
Unique NameEMLSAT00000010395-706242
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s68supercontigLSalAtl2s68:1450700..1474633 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010395 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010395EMLSAG00000010395-693161Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000046229EMLSAE00000046229-755157Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046230EMLSAE00000046230-755158Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046231EMLSAE00000046231-755159Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046232EMLSAE00000046232-755160Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046233EMLSAE00000046233-755161Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046234EMLSAE00000046234-755162Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780774auto780774Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010395EMLSAP00000010395Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010395

>EMLSAP00000010395 ID=EMLSAP00000010395|Name=EMLSAP00000010395|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=381bp
MDFNHSSPSSATGIGEEEEELLEIMEFPRWAIANSHYLEFHNRMAPDIDF
SCISLLLASIFIYLMFLLIVITARRRKIPTFFIGTVIIFTGSVLAFSYVD
PFWYTGSVIINSTYNLRQPDNFAVGEVKMKFGLRTFNVSYVSLDHINDDL
SFSYNELFRFDSSHPKRNLQDVFKRSLQNGLPNPIICILDHLSFSPNREG
LSWSNAGTAVADALIFVIFFFIVGIILLILTPKYGIYFIALDGFSLLGVV
LLYFLKVPRDPLIIIEGTHXIFICVCSKKVEYVSTFFELNFDTPWDDQIL
VRQSAEAKENNEIDRQYHRRVSIKKMRRSVRRLQDSFNAKISVKFRNHLS
ESRSSSCDQIETIVFYSSGRIYRKISRDPCS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s68:1450700..1474633+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010395-706242 ID=EMLSAT00000010395-706242|Name=EMLSAT00000010395|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23934bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s68:1450700..1474633+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTCAAGGGCATCGTTTACTGTTAGTACATAGTTACAAAGTATTATAGTCA CATCAAAAGGTACAGTTTCTATTATTTCTTAACATATATTTTTGCTTATT CAACATGAACTCAAATCTTCACATTAATTATGTATTTTGGTACAAATTGA AAGCTATTGTTGTGAATTGTTAGCATTTTGGGTACGTCTAAAAAATAAAA AAAACGAAAGTAAATCATTTTTAGAATATTTTAAAGGAAAACATCTTCGT CGTTATGACGTTTTATTAGATCACAGATTCTTAACAGGTACACCGCGGGA GTATTTTATAATGGCTCTAAAAATTATTGTTTAATACACATTAGTGCAGT AAATTCGAAGATCAATTCTGGTGAAAAATAAATATCGTCCTAAACTCAAT AATGAGGAATCATATATACATAATTTTTTTGAAAAAATTAAAATTTTAGG AAAAATTTCAAAATCAAATATCAAATTGTTTGCAGAAAAAATTCAAAAGT CCATAACATTTCTCAAAAATATTTCAAAAATCCACAACTGTTCACGAAAA ATTAAACTATTCTCAAAGATTTTCGAATATTAAATTTTTTTGGAGGAAAA TTTCAAAAACCCATTTCTATTTAGAGGAAACTAAATTTTTTGGAAAAAAA AACAAAAAAAAATGAAATTCTTTGTTAAATTTTATAGTAGAAAGCCAAAA ACTCTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGCTCAGCCCTTCCKGCCCACCTCTAC AGACGCCCCTGCCTTATTAATATCGATCATAGGGACTGCTCCTTAAGACC GTCGGTCCTTGAGACCTGTCCTTAACTATCAGTTCTTGGATTTTTTCATA AAAATACCTATAGTTTATAAAGCCAAATAATATGTATGATATACGTATAA AGAATATTGCATAAATCTTGAAAACATTTTTTTTTTCATTATAATATAAA AATTCCCATATATTCATACTCGTGACCTGAAGTTACGCCCTGTGCAGTTT TGCCGTGGGAAGTTTCGCCCACATACATATATGAAGCATGAACGTATCTT CCACATATAATTTAAGGTCTTCCTTTACTTCTACTTGAAGTCCTTAGTAA TTAATTATGAAATTATGACATTTGAGTAATCAATATGAAATAATGTTTGT TTCTTATTATTATGAATTCGAACCGTTTGATTTGCTCTATTTTAAAATAT ATTAAAATTGAATTAAATGCACTCATTTTACACTTCTAAACGCAAAAATG CATTACAAATGACTTTAATGGGGGGGGGGGGAGGGGGGACTAATTTTAAA TCTTAAATTACATTTATGCCACAATATTTTTATGAGGGCGAAACTTCTGC AGGGCGGAACTTCCTAGGGCGAAACTGCCCGGGGCGTAACATCCTAGAGC CATTCTGATTTCGTTATTTTAATTTATTCTATTATATAATTGAATGGAAA AAAAGGGAAACACCCTCATTGACGTCAGGGATTGATTTCACCTGCTTTAA GAACCGACTAGAGGGACTAGACTGGATTGTGGMCTTAAATAAGGCCGACA TAACACTACTTTAGAGCCCGTATGAGAGTCCTTCAAATGTTAGCCCCTAT CGAAGGATCTTAGAACTTCAGTTCGACATGCCTTCGTCCAGAGTTCAGGG ATCCCAAAAATGTTTATTACAAAATACTCACAAGAAAGTACTTTAATTCG ATTTTTATTAAAAGTTAGCATTTGAGCAAAAATTWGGTTATTTATTGCTG AGTATAWAAAATGACKCGRTAGCNAAGCCGCATGTTAGATTTTGTCAATT TTTTTGTTAGACCTACTCATACTCTATAAATAAGCAAAAACTTATTTTGG GATCTGAACGAGAACACTTTCATTAAATCTTATAAACATAAATGGTCGTA ATTATCAAGGTTAATAGAAGTACAAGGTTAGACCATCAGGTAATCGGACT TGGTGGAATTTTCAATGTAATGTGTTGAACCGATTGCTGGGCAAGACTGG CAGATTTTGACAAAATATACAACCACTCAAATCTATGACGTTACTATTCC TAGAATTTTTAATTTAATGTATTGTACCCACAGATTTTGAAAAAACACGC AACCACGCATCTACTATGACGTCAATATTAAAAGTGTAGTGGAAGTCAAA CATCAGTCGTACACGCGTTATGTTATAACCATGTTTTTCTATTAACCTTG GTAATTACCATATTAGTACATTTGCATACAGCGTGAGGACTCAAAACTTG CAGTATCGTTGAATTATGACTTTATCACTGTTATTTTGAACATTGAGGTT TCATTACACAAACAAACTACAGCTAAAATAAAAATCAACAAGTCTCTATG TGTAAAAAGGCCAGAGCAACAAAAAAAAAGCAGAGGGGGTTGTCTGTGAC AAGGAGGCTCCAGAGACCGTGGTATCAACATTTAGACCGCCTACAATATT CAAAAGTATATAACAGCCAAGAAGAACCAAAACTTCTKCTGCAAGAATAT GKCCTGCCTCTATGCAGCCCTCCTCCAGTCCTGACCTCAGGCCCACTTTA TAGATGTAAATGGCTTTGCAATCAAATTGTTTTTGACGGAAGGAGTTGTT TTATGTAACAGATTAATAAACATACAACGACAATGTCTTACAATTAAAGA AAGAAAGAAAACAAGAGAAAGAAAACAAGAAAAAAAAACTTTGTAATAAT TATTAGAATTAGTTCTACATTATACAAAGAAAGAGTTTGAAGATGTTTTC TATCCTTTCTTTTGTTAATTGCTATATGTATCTCTCAACAACGATAAATT ATTATGTATTAAAGACTTATGCCCTTCTTCTTATTATTCTTGTTTTTGTT ATTTTAGCGTCTTCATCTCATATTAAATAGTAATTATATATTATATACAT ATGTAATACATACAAATTAAATTATGGTTTTTCTTCATCCTTGTCCTATC AGAGCAAACAATAGTACACAAAGTTACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNGTAGAGTAGTAAATTCTAAGCAATATCAGTAAGAAAAAAC ACCAAAAATTGACATAATGACCCCTCACAATTTGAATGGAAATTGTCCCA TGACAATTCTATAGTCAAATGGCAAAATGAAGCCTATGCCATCAATATTT GTATCAATATATCGGCTAACTGATAACTTTTTTGTTCGAGAGGGAGTACC CGGATTTCTAGTATTCCTCGGGAATTTATCATCAATTAAAAATCATCCAG CATTAATTAACTTGTTCATTGATTATTATTTAACTATTTTATGATGCAAG TACGATCAGGTTACGGATTTTTTTTGTTTAAACCGGACTCGTAGACTGTA CAAACTCACCATTGCACTATGTTTGGCGTTAGTTAAAAAAAATAATATCG ATCGACTAAGTATTTATTCCACAATCGCGGAAAAGGCAGAGTGTCTTTGT TGCAATCCGCACTGGACGAGATAATGTTGAGATTGCAAACTTCTAAAGCC TGCACAGGTCCTTTAAATGGGCAATCAGGAAGGAACTGAAAGAGTCCGGA GATGATAATTACTCTGCTCCAACCCACACTGTAAAGACCTGATAGATTTA CCAGGTTATCATAATAAATATTTCGTCATCAAAGAAGTTAACAAAAAGCT ACAAGATTCTGAAATTGAGGTGACGAGGATTATGGCCATTATGAAGTCTC ACGGAGCTTGGTTTTCAAGGTGCAACGATGGAATAATTATGGAGAAGACC TCMCTAGSAAAGCAGGATGGAGGGGATAATTTAAAGAGGGATCTGGAGTT CCTGTCCAGCTTGAGATGAAGATCAAGAAGGAAACCATCATATCAATGAA CGGAACTCCCCATCCAAATATGGTCATACTGACGTCTGCATAGTGGTTGC ATGGGACTACGTGTCTTAGAAGTTTGTCATCAACTTACTTACAGCCTTCC GGTGACGTGCAAAGGCCGTGATTGATGATGAAGTAGGGCTTATTGAGTGA CCAAATTTYCAAAGGCCATTGTAACAAGTTTAAATAAAACTATATTTATG TTAATATTNAAATAAAAAATTATTTAAGTATTTCATAAGTGACCTCTCGA GTCTACGTTTTGTTTCCAACCCAAGTATAAACATTTGTTTTTGGGATAAC TTATTCGTTTCCTTGAATTTATTTTTGAGTGGAATTTGAGTATAAAATCA TTTTTTAATCAAATTAATTGATAATATGCATTTTCCTAATATTAGTTTGA CTTTATCGATATGATCGATTGAGAAACTTAAAGTTGTAGTTATTTCTATA TATGTTTTATGTTATACACCAATAAGAACATTTGCTCTTAATTACCTATA TTCCTTAAAATGGCAATATTTTTGAATAAATATTTTATCATTCTATGCCA ATTATAAGAAAAAAGATATTTTTGTTACATCAATTATTACGTTTGAAATG TAAGTCTAAAATAAATATAAGGTTATATTCAAATTGACCTCAAAATGCAT TGAATTAATCTCAATAAGTAAAATTAATTAGGTACCAGCACCTTTTCTTT GTAAATGAAATGTAATATTTTACGAAAATTAATAATTAGTTCTGAATTAA ATATTTAATTAGATGATAAGCTGTTCTACAATTATAATAATTACGTCATT TAAGTATTGTATCATTTTTTGAAATATTCAATCAATTTTTTGCACTTGTC AATATCGAACATTTATAAAAAGCAACTAGAATGGGCTCTCTGTAGAGGGT AAAATTCTCCCTATTGCCATTATTACTAAATTTTTATTTTATTGTTATCT TTTCACATACACTAAATTCCCACGAAAGATCATTAATTTTAATTATAAAA ACAAATCAATAAAAACAGTGTTTTTTCAAGTTTAAAAAAAAAAGAATCGA GGATTCCAAATTTATTAAAAGGATGGTGTAATGTAAAATTTGTCCGGTTT TAAAGTCCCTTTTTTCAATATATTTTGGGATGGTTTTGTTTAGACCTGCA GGAAGAGGAGTCATTTTTGTTCTACATACAAGCGTAAATAATCGTGATCT CACCCGATCACAGAAATCAAATAGGTGGAATGAAGATTCTACCGCTTTTT TACTTCTTCGACTTGCTGGTATATATCAAGAATGTCGCCACCCTATAGCG AAACCACTTCTGCGACTTTGTCGTAAAGGAGTTTGAATTTATTATTCTTG GATTGATTGATTTTCCTTCCATATTAAGTTTCTTCCAGGGTTTTACAACC AACAAGTTTGCTTGGGATTTTATTTTTATTTTGATCATGATTTTTTTATT TTTTCCTTTCCACTGAACCACATTCTTATAAAGAAAGGGATTGGATGGCC TTGTTGTAGGAAATTAGTGGCACGAGACATGGAAGTGACCCTTGTGCGAA GAATCCAGTTTGCGATATTTCCTGAAAATCTTTTCAGCCCGTCTGTTGAA GTTAGGGAGTGTACTTTATTGTTCTGTGATCGACAGTTCTAAGGCATGGG TTAAAGTTGAGTGGTTCATTAGGACCTAAAGGAATGCGAGTACCAACGAC TGAACTTTCCCAAGAAACTGCCATTCTATAACAATCATTACACAAGGTCT TTATTAATTCAAAACCTTCATTTGGTCCAAAAAATATTCTGTCCGAGAAC TATTCTCCGGTGATCCTTTGAACACGTATTTGTTTCTTTTGGCCCAAACG TCTTCGCTTTTCATATTTTTCTATAATACTTCTGTGTCGACTGAACCCAA TCCTCAGCTATTGAGTTAGTTAATAAGCCGATCGTTGGAGATAAACTGTC GTTTGTCTCCCCAGACAAGGTGTTTCCTGGAAAAATCTATTATATCGCAT GTTTTTTTTGGAAAATGGCGTGTACTTCGAGATATTGACTTTTTTTGTGA AAGACCAATTTGTTCCCGATTTGGAGTTTTTCTAATTTTGTAATATTCAG CAAAAAAAATCTGTTGACTTCCTTTGCCACTGTCTCCAAATTTTTTTCGT AATTCTCTTTAATAAGATGTTCTTGGAATATTGACGAGACCACAACGTTT CCAGCTTCTTTTTTTTTTAGAGAGGTGACTAATTCTGTTTTAGTTATGTT TAATTTTAATCCTGATGATCCTTCAAAATTCAACAAGTTTATCTATNCCT TCAAATTCAACAAGTTTATCTATAACATTTATTAACGAGATTTGTATATC ACTTTGTGATCCTGTTGTAAAAATTGTAATTCACTTTGAAAATCGCGGAT AAATAATATGACAATGATAGTCAAGAAGCGCTTAAGAGATCAGTAGCAGA TGATTTCGGACCTTTTTTCCGTTTCTTTTCGGAGGAAAGGTTGCTGTATA CAATAAAGGTGTATGATCTCTACGGTACAAGCACATGATAGACGTTGTAA TCCACCTTTATTTCAAAAAAAAAATCTTCCAACACCTACAAATGTATCTA TATGAGGCTCATGAGCTATTTCCTTAATGGCCTCTCTCTGATCCGTAATA TTGCTACAACTTTGTTCTAATACCAAACGATTATAACTATACAAACTTTA AAACCCCATTAACCTCTATTAATATAATACATATGTTTATAGATGTGTAT GTGTATCTCAAACATCTCTTGATGCTCTTCATATATATTTTGTGTTCTGT 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AKAAATGTCTTRTTGGTWTCTWTACCTACCAAGTAAAGAGTTTTAGCCTT TTTTCATAATTTTATGGAGATGTGTGACCTAGAGATGACTTTTTAGGACA ACAATTTTACATAGGTTATTTAAGTTCCATATAACTACTTTTCCGCACTA GTTGTAATTTAAATTTGAAAAAATTTGAAAAACAAACGACCCAATTGGGC ATGCATGGTTTTAGAAGATACCATTTTGCTGTAAGATAAAACCTTTACAA AATCACAAACTTGTACACAACAGAAAAACGTAGATATAATGAAATATTGG TAAATCTGATGCATATTTCAATATTTATTGAATAAATTGGATAATATGAT AATTGTGGCAAGAGAGGATGGATCTATGTAATAATCGATATGATGAGAGT ATTTATTGTATTTCATTATTGTCTTTTCTCTAGTACATAATATTAGGTAT TCTCATTCCCCCCCCCCCTTTACTTTTGTTGTTCTTACAAAGAATATCCA TCATTCCTATCTCAGCCCGTCAATACAAAAGAAAGCTAGTGTGATTTTTC TCCAAATTTTGTATGAATTACATCCGTATTCTTTGACGAAAATTAACATG AATTTTTATCAATAATTAAACCTTAGTAAGGCCGCAAATTGCCCTCTAAA TAACCAAATCTGATCGTTGCAAATAAAAAATGAGAAATGGAAAGGTTTTA ATCGAAGGGGACCATAATTGGACTAATAATTTGGGGAAAAAGTAATTTTC TACCTTTTTTTTTACTCAGTATATCTTTTCATTATTAGTCAGATCAGATC ATACGATAAGTTGTTGTAAAATTATGAATTGTGAATCAGTCGTGAATGGT TATCTGTAGATTGTGAAGGTCTGAAAGGGAAAAAAATCGCCGTATTTTAC ATTTTTACTACGTAACAAGGAAAAACGCGTCAAACGGGATCAAAATAATT 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