EMLSAT00000010402, EMLSAT00000010402-706249 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010402
Unique NameEMLSAT00000010402-706249
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s68supercontigLSalAtl2s68:516095..533261 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010402 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010402EMLSAG00000010402-693168Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000046299EMLSAE00000046299-755227Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046300EMLSAE00000046300-755228Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046301EMLSAE00000046301-755229Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046302EMLSAE00000046302-755230Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046303EMLSAE00000046303-755231Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046304EMLSAE00000046304-755232Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046305EMLSAE00000046305-755233Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046306EMLSAE00000046306-755234Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046307EMLSAE00000046307-755235Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046308EMLSAE00000046308-755236Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046309EMLSAE00000046309-755237Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778321auto778321Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010402EMLSAP00000010402Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010402

>EMLSAP00000010402 ID=EMLSAP00000010402|Name=EMLSAP00000010402|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1360bp
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GTELCEPFIRAPKRRNDPGFYEGVSTPMDLLRIQQKMKMEEYESLWVFKE
DVDLMLSHWLXYYPENSEESKNARELKELFYKAYERVEAGENPAVXLGER
EGLGELAWLLEELFVSLLSATSEEEPQSIKLSVIKDPIDLKTIATKMQEH
AYGSIVELEEDFLLMCKNAMTFNEPGSQIYRDAKSIIKLAKNKKTELETF
RLNRDKRGAGRPPARRQIIRKQYSSAEIRKKLKNKEYGKLSDMVNDMNIM
FENCKAYNRSDSQIFKEGVKLQRLMTSKVEEIQSGKVVPNGMTEIKETVV
SPHFNSNSTHNIVALKNMRILYNTILIHKDDEGVQLVSAFMELPSKKDYP
DYYEVIEHPMDMNTINNKIKNGAYKNEEEYLQDMKLMFANCKKYNEERSE
IYKDAVTLERVLIAKGREIGLSAGLGRGRPSKKKFLSSDSKNIKMKALFD
ALRDYKDVKGRQLSLIFLRLPNQRDFADYYEVIKKPIDFEKISTKIKTYV
YDNLEETLADFILMFDNACKFNEPDSQIYKDALTLQSLALKVAREMNETA
GSVTDVAQRVQDILNSIFIAVYNHQDENGRSFSDSMSEIPEYDIKIVNDQ
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DSVELQAFFIKVRDEFCERGTLLKSRALLYTQVHLDAAITALKAKKFAIE
KNNFPNEDLDNSESSKINGATNVLTVSLNSQEYKVGDYVYISSNVQENNL
IYRIEKMYSGEGILSFYGTQFLYPKDTHHLPTRKFLDREVFSSDVRKIIN
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EFIKRNVNLKIRESSIVLRRIPSVYKHRVERQKAELEEIEAMEKSLGNII
PPNVXWXPXPFDYPLPQPLDEGITYFEQYTIPGPITLKRGDNVYVRAENG
KNLIVQIDTMWTTSDGMAYFHGPWFVTPSETPQNPSQSFYKQEVFLSTIS
DTNPLLSAVGKCTVFEVTDYTTRRPSEVVEGDVYVCESIFDETKRAVRGL
LPPTGLKKYSFNSGSVQEDEIYFFKKPIHIQKVPERVVNPLPPTPKMSLS
NNFEVDNEDSLDGISSVCSNTSVVEPTPKKNKGPSKKIVXAYTVYSSDKR
KLVFESNKECTFGEISRIVGDQWKQLSDLEKQVYEERAKKVNKENEIKFL
QEQRAFEEKKRQELMNHSGTSTPISFGNNGNITFNAMPSTPASSKNALSM
ISINNTNQRNFNCISPAPSPGPPVMTNTKVIEPIFHTVPPRPPKTTSLRS
LHQVYRGAYY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s68:516095..533261+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010402-706249 ID=EMLSAT00000010402-706249|Name=EMLSAT00000010402|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17167bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s68:516095..533261+ (Lepeophtheirus salmonis)
TGAACATAAGGTGGTTTAAGAAATACAATTTAGGTGCTGCCATAGAGGAG CTAGAAAAGAAGAACTTGAGTTGAAGATGCTTACGCTAGATGTCCCACAT ATAAATATGGATGTCATCTGGCGTGGTAGTAAAAAAAGGAGAGAAGCGAT ATTAAAAGAAGGAATTGTGCTGCCTGTTCCAGCTACAAATACAGGAATTG GCTTCTTTTTTTTCCTCTTGATTTCTCTCTTTCTCTCTCTTTCCTTCTCT TTTTCTGTCAATGAACGTAGAGTGGGTTTTTCTCTATATCTCTGTTTCTC TTTCTTTAGCTAGGGTTTGTTTATCTCTCTCTCTGTTTCTCTTTCTTTCT CCTCTTTCTCTTCCCTAATTTTGCTTAAATTAAAATAAACGTATGTAGAC AAATACCTTCTTAGGTATTTACTGTTTTTGGTCCAATTTGCCTTATTCTT TGATTATCTGTGATTGTTTCCATCCGTGAGGCAGGAGAAGGAGTCCATGT TACCGAAGCGTCGGCTCTCTGAAGAGGACACGGAGGCTGTGCCCTCCAAC ACGTCCCCTGAAGCGGGAAAGAAGAAAAAGAAGTTGGACCCCGTAATTAC TGCGTACTCATTCGAGAATTTTAATGTTTTCTGTTTCCCCTTTCCTTGAC AGGAGTGGCAAATCTCGACTCTCTACGACTTTATCCGCAAGTACAAAAGG GAGGATGGAACCGAGTTATGCGAGCCTTTTATTCGAGCGCCCAAGCGGAG AAATGATCCTGGGTTCTACGAAGGTGTCTCCACTCCCATGGATCTCCTTC GCATCCAACAGAAAATGAAGATGGAGGAGTACGAGTCCCTCTGGGTCTTC AAGGAGGATGTGGATCTCATGCTCTCACATTGGCTCSCATATTACCCAGA AAACTCGGAAGAGTCCAAGAACGCACGGGAACTCAAGGAACTCTTTTACA 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GATAATCAGCATTCTTAAATAATTGATCATTATATTTCTGATTTATACTA AATTAAATTTTTAATCTCCAGTTGAATATCTACTGGAAAAAAGATTTGAA TATATCTGTACAATATTTGTTGAATATTGGTTATTTTAATAGTATATGTA TTTATGTGAGGTATTGCATATACTATTAGACTCTGGGCCCACTATGTGAT GTAGAAGATACTTTTAAAAACTATATTTTGCAGTATTAAATTGTCGGTTA GAAATGGTTGAATTGATTATATTTAAAAATCTTTTTACATTTAAGGTTAT TAAGGATCCCATTGACCTCAAAACAATTGCAACAAAAATGCAAGAACATG CATATGGATCGATTGTAGAGCTGGAAGAAGATTTTCTCTTAATGTGTAAG AATGCTATGACTTTTAATGAACCTGGATCTCAAATATATCGCGACGCTAA ATCAATAATAAAACTCGCTAAAAACAAAAAAACCGAACTAGAAACATTTC GGCTCAATCGGGATAAAAGAGGTGCTGGTCGGCCTCCTGCAAGAAGGCAA ATCATTCGAAAACAATATTCATCCGCAGAGGTAGTTATTCAAGTCTTAAT TTTAATTATATCCATCCTTGTAACTATTATTATTATTATTATTATCTTTG AATATAGATTTCTAAAATGATTTATCCAAAAGATGATGATATCGAAGATG AAGAAGTAGATGATAGTCTTTCGGATGATGAAAGTGACACGGATGAGGAT GAGGATGAAGATGATGAGGAACTTTATGATGGAGAAATGGGCGAACTTTT CAAATATATTAGGAATTATGATGTTGCGGGTCTTACAATTTGTGAACCTT TTTTGATTCTTCCTTCAAAGAAACTTTTTCCCGATTATTATCAAACCATA TCAAATCCTATATCGCTTAACATGGTAAGTGTTCATAAAAAAACTAAAAA 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TCTGTGAGTCTCAATATGTCACTAGAAATAAATACTTCACTAAGCTGAAA ACACCATATGAGTTCATCAAGAGGAATGTAAATTTGAAAATAAGAGAATC TTCTATTGTACTGCGTCGCATTCCGTCCGTATATAAACATCGGGTCGAAA GACAAAAAGCTGAGCTGGAGGAAATAGAAGCTATGGAAAAGTCCTTAGGC AACATTATYCCTCCTAATGTTYTTTGGAMCCCTWTTCCATTTGATTATCC MCTTCCMCAGCCACTTGATGAAGGAATTACATATTTTGAACAGTACACGA TTCCAGGTCCAATTACATTAAAGCGTGGCGATAATGTTTATGTACGGGCC GAAAATGGGAAAAATCTCATTGTTCAAATTGATACCATGTGGACTACTTC AGATGGGATGGCTTACTTTCATGGTCCATGGTTTGTTACTCCTAGTGAAA CCCCGCAAAATCCATCACAATCATTTTACAAACAAGAAGTTTTCTTGTCT ACTATCTCTGACACAAACCCATTGCTCTCTGCAGTTGGGAAATGTACAGT GTTTGAAGTTACTGACTACACGACGCGAAGGCCTTCAGAGGTTGTAGAGG GAGATGTATACGTTTGTGAATCAATATTTGATGAAACTAAACGGGCCGTG AGAGGCTTGCTTCCACCAACAGGATTGAAAAAGTATTCTTTCAATTCCGG TAGTGTTCAAGAAGATGAGATCTATTTCTTTAAGAAGCCTATTCACATCC AAAAAGTTCCGGAACGTGTAAGTTTTTTATTTGCCTGATTATACTAATAC TCTTTCATGGTGTTGATCTATGTGGGATAACGTTTCTTGCTTAAATATTA CTGTCTGAATATAGTTCGCACTTACATTAGTTATATGGTGAAGTTTTTAT ACATAAGGGTTTTTTTAAAACCAAAAATTACTAACACACCTAGTCTAGTA ACTTAAAAAGTGAATGATCACGTTAATTGGTGTTTCTCTGTAGAAACATT CCCAAATGAATACATTTTAATTTGCAGAAAATTAAACAATAAAATGTAAC ATTACCCGAATAATAGTCCCTCCGTATAAAATGACTAATACTGACATTTT GGAACTGTTTATGTTATGACCATTTTGTAACAACTTACTAATCGTTTTCA TTCTTGAGTGTGCCCCGTATTATGTGTATGACGTTTGGGAAATTAGAAAG CACTCTGAAAATAATAATCAAATTGAAATTTTTTGTTACTGTGATAATGT TATCTGATACCAACCTTCAAGTGTTGTTATATTAAATAGTAGGAATATGC ATTTCTTTGAGACGAAAAGAAAAGTGAAGTATTTTGAAAACTCAAATTTT AATACAATTAAGCAATGATTCCCAACCTTTTCATCACTAATGTGCTCAAC CAAATGTTTTATATATTCTTTATTTGATCTCTCGCGCTGCCCTTCACTAA TGATCCTAGCTAACTACATTTTTATTTTGCATGACTTATGTGAATTATTT ATTTTTCCTTCCATTCTTGTTTATGACAGGGGCTCAAGGGACTCCAAGGA AAGAGGCGACAAGACTTTTGAAATAATAATGGTACAAAAAACATGTATCT AAATTATGTTCACTCGTAACCGGTAATTTTGCCTCGTGGAGATTTACTAC ATGACATATTCGCCGCCTTTTTATATTTTTACATTATCGTTTCGAACTTG TCTTTTGTATCTCAATAAGATATTAATTAAATTAAAAAGGAAAATAGGGA TGAAAGATTTAATACTGCAGTAAAATTCGAAACGCTAATAAAAAAAATAA AAAGGCAGGGAATATTTCATGCGGCAATATCTTCTAGAGGTAAAATGACC TAAAACCAGGTTAACTCATTCACACGTCCTAGATCAAAAAATGACTTGGG 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CGTAGTGATGAAAGTCCGTTTTTTCATAATTGTTAGTATGAAGAAAGAAT TTTTTTTTCTTCAGCCCCGGTCATTAATATATAACTTCTGAGTAGTGAAC TTCCTTTCCTATTACATTCAATTATAGTCAAAGCCTAATTGAAAATTCGT GTGCGATCATAAAAGACTAAGAGTAACCTTGAGGATTTGTTGCAATTATA ATTTAAAGTCTTTGTTGGACTCCAAATAGAATTGGGAATCGACATCCGAG TAATTTTTGCCGATGTACTTGTTTATTTTCCTCCCCTCCTCCCCTGTCAC AGCAGATTGTAGCTGAACTAATAAAATGTTATGACAGCTTAGCTCCTTTC CTCCAAAACATACTTCAAATTGTCAGGGTTACCATGTCGATTTTTGGGTT CTTTTTATTAATAAGCCCAAAATACACACCATTTTTGTCACTGGCTCAGT AATTTCAGTAATTAGCAGAGTAATACTTTCACATACGAGTTTAACCCTGG ACAGAGCATGMAAGCCAATGCGATGTTGTATCCCACAAGAAATCATTAAA AAAATGCGCTCTTGTGTCCCGTTCCCATCTCTGGATCCGTTCATAACATT GTACATATTCAATACTACCAGTATTGATCGCAGTTCATTAAGAGAAGATA ACCTACTATATTGATACTATAGATGTGTCTGCCAACACAAAATCAATCTA GAACAGTTTTGCTCAAAATTGAGTTTAAATTACATTAAATGTTCTTCTAC GAATAATCGTCAATTTTTATTAACAAATTCGTTTTATTCACCCATTGTGC CTGTAGCAGAGTGATAAATATTATTTGAAAGACCATATTCGGGCCAATAT ATGTATCCTAAGTGCATATTATGTTCTAAACTAGAGCTAAAATTAATAGA TGAATTTTAACTCATCCCCCAAATTTGAATACAAAGCCTATAATTAACTT ATATAGGCCTTTGAAATGTTGGGCTCTATGAATTTATGTAGTAAAAAAAT AAATAGGGGTTTTCTCCTTTTCTTTATTTTGTGTATTATTGTTTTTATGT TGTCGTATCACAGATCCCATTTTTTTCTTTTTAATTATGACGTTTTAGAT ACAAGCGCTCGTACTTGATTGGTTATTTCCTAGATCAATTAGTTACGCAG TTCAAAGATATTCCGTGGACACTCCAAAATGAAGTGTTGACAGACAAACA CACAAACTTTGCTTTATTAATGTAGATATTTATTTTTGAAAAAAAGGCTA TTTCTTTAAAAAAATATATACATCTGTTATCAATGACTAATGCACTACCC AGTCTTGGACTCGTTCACACTTTTCCCGTTCAGGTGCTCATTCTTTAATT TCTTTGTGTTCATCCCTTCATTTTTAAAAAATTTTAATTCCTAATAATTT GGGACACATAAGTTGTTGATACGGATATCATTTTTTTGGTGTACGGTAAC TTCGTATCAGGACAATTCGCATACATTTATGAGGAAACGGGAATATAATT TATGAATTGTCATTTTATACCCTGAATGTTGGGGTGTTTTCAGGTACCGG AGATACTTAAGTAAATACTAAGAGCCCCTCATAGCCCTCCAATTGCACCC TGAAAGTTGGGGGTGGTTTGGGTTCTGAAAGGTCCCAAAACGGCATACAA CTTACCGCCAAAACTTGAAAAAACAATTATGAGCCCTCACAATCCCCAAA TGTMCCCTGAATGTTTGGTGGTCTTTTTGGGTMCCACCAGTATCCAAAAT AGGATGCAACTTACCGTGCATTCTTAAAAAGCAATTAAGATCCCTTCAAA ACCACCCAATTTTATCCTGAATGGTTTGTGATGTTTTCGGGTTCTTATTG GCTTAAAATTATAATCCGCTATATGTTCTTCCTATATATTTGGGGATTGT 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