|
|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s697 | supercontig | LSalAtl2s697:336252..342887 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010509 >EMLSAP00000010509 ID=EMLSAP00000010509|Name=EMLSAP00000010509|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=127bp
MDVSPLPXPAKFVDMYKMFFPSGNAEQFCDHVFRTFDTDKNGFIDFKEFL
LAIDVTSAGTPEEKLKWAFRNVLLETNVETFIQGVPMDVDAVTGTKNYPN
HGWSLSTSNECNIHYVNTISLELYLLD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s697:336252..342887- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010509-706356 ID=EMLSAT00000010509-706356|Name=EMLSAT00000010509|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6636bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s697:336252..342887- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGACGTCTCMCCCCTGCCANCCCCTGCCAAATTCGTGGATATGTACAA
AATGTTTTTCCCATCTGGCAACGCAGAGCAGTTCTGCGATCACGTTTTTA
GAACTTTCGATACGGATAAAAACGGATTTATCGATTTCAAGGAGTTTCTT
CTCGCCATTGACGTCACTTCTGCCGGAACACCCGAAGAAAAGCTTAAATG
GGCTTTCAGGTAATGCCTTTTTTCTAGTACAAGTATTCATATATGTGTGG
ATGAAATTATTATATTATTATTATACTACTCAAGGCAGTATTAAGTGGAA
GAAGCTGACTAAGATGAACATAACCGGTTTCTTCTTCCTTCCTCAGTCAC
TTCGAGAGGAATCTCTTCTTTTTTTCTCTCTCTGACTCCTTTTTTTGTTC
TTCCTTTGGGTTGATTTCTTGGGTGGTGGTGGTGGTGGCGAGTCCCTCTT
TACATTTTACCACAATCTCAACCACCATCATGTAGATGTATCATACAAGA
ACAKCTKCCCTCCTCRCCTCTCAGMGRCCGCCGCTACCTTTTCCTACACA
TACACAAATATACCTATCCAGGAAACAATGTGCATACCGCATACATTCTC
ATGTACCTTTAATATTACCTACTTTAGTAACAAGGCACACAGNCAGCAAT
AAATATATCTATCTATCTATGAACATATGTCCGGAGACTTGTTGATCCAG
TAGTCAGCACAGTGTAGTGCTCAGGGACTGATCAGAACCCGCCTCCATCT
TTTTCAACCCTTTGTTCCTTCTCTGGGGGTATTTGTCTACCCCAGGGACT
TACATATTTCTATGCAGGTGGTTTCGATTTATGGGTATCCATCCCAGAAG
CTAATATACATCTACATATCTACTTGAACGGTAGTCTGTACCACTCAGTA
GCAGCCACTAAGAGTCCTCACTTTTTGTAACTCTGTTGCTTCAATATGAG
ATTAATTTGTATACTTGTTGATGTAGTCTGTATCAGTTGTCACTACTGAA
AATGTATCTCTTTAGCCAAAGCCTCGTCTTAGTTAATTTCCTCTCTTCCA
TCTTGTCATTATTCCTCTGTGCTTTTCTGGGGTTTTTATTTACCCCATAT
GGACAAATAAACATACTTTCTGTATCCAATTGGTTTTTGAGTTTATTAAC
TAATTATGGAATTAATTTTATAGAAGTATATACCCCAAGAATGAATATGA
AATCGGGGGATTGAAGGAGAGTGGGAGATGCCTGATTCTGTATAGTACAT
GTCAAATGTCATGATAATAATTTAGGGATTTATAAATTTGTAAATTAAGT
ATTTAATATATTCACTGATGCTTTTAGCAGGCATCAAATGTAACAATTGC
TTAGGCAAAATGAAGTTTTATATTGCTTAAATATCCATTTTAATGTTGGG
GTAGCTAAGAACCCCATATAAGTACTAAAGTTATGATTTCAATGGGTTAC
TCCTAATGTATTCAATCCAGTCCGAGGACGTGTCCTTAAGACTGTCAGTC
CTTTGGAAAGTGTCATTGTAACTCTCCCGTCTCTTACGAGTACAGGCAGT
AGTTATTACTTTATACTTAAATGTTATATCTTCAAGAATTAAATTATAAT
GGTGGCTGCTTTGGAAAAAAATTGCCAACTAGGCAAGGCCGKTCTCGATT
TCTAGGTCATATTTTATACACTTCTGCTCATACACACAACACGATTAATA
TACGTGGTGGTAAGAGTCTTGAACAAAAATCCAGAAGAAAAGGGTGATAT
GCCCAATTGATTTTTTACAGTCTAATATGTATTATTAGACCTTGTGCTCA
AATTCCTAGGAGTAGTTGAAATACTATCCAAAAAGAATTTTAACTTCTCA
TATACATGGATGTATATGTATAAAGAATCATCATTTGATTTATGTGACTT
AATCATGACCTTTCAAATACATAAAATTTCTAATTATTTCATTCTAAACG
TTTGAGTGTTGTGGCGATAGCAATAATTTTTCGTTCGGCTCTGGTAACAT
ACTAGTTATGGGTATTGCAATACTTTCAAACTGAAAATAATAAAATAAAT
ATGCCTGTGAAGACTATTTGCATGTACTTACAGAGTGAGTCCGTGGGATT
TTTCTTCAGGATAGAGCTAGTAATTAAATGTTGATTCCTAGCCCATTTTG
TTTGGAAGCTGGGTCAATATTTCTAATTTAAATGTTTTAATAGCCCAATC
ACGGGAATACCAAACAACACGACTGAATTTTTGTTACGTTGACTTGCAAT
ATGCGGGACTACTAAACAATGGGTCAGATTGATCCTTGACCATGGGTATT
GACGACAATTATTCCTCTCAAAAAATACATATGTAAGCTGAACTCACTTT
TGAGAAAAGTCATTCGACCTTGCTTTTTTGTTGACGGGTCACATATATAT
TTTGATAGCGCATGTTTGTTTTGATAAAATATATTTTTACATTTTTTTTA
AATTGTAAATAAAAAACCTCTCCAAACTCACTCTGTCCATTAAACTAATG
AGGAAAAAAAAATGGTATATCGTCCCGTTGTATACGATTTTTTCTTGTTG
TTATTCGTTGTCGTATTTGAAAAAATTACATTGGATCAATATATATTCCT
GTTGCTGCAGTATTTTTACTTTGCTATATGTAGTGTTGTACCGGTCTGAT
TCGAACTGAGTCAAATAATTTGAAAAGGCAAAAGGAAAGGAAAACAATTA
AATAGCGTATTAATTTATATTCAAAAGGGATGTAAACGTCCGTTCCCATC
AGTAAGGTTAAGGATGCGGCCCATACGAATGGCTAAATGATGTCAGCATA
GTTATCAGCTAGTGACGTCATTCTCAATCGTTTTCCATCAACTTATATAA
TCATGTACTTTAATTATGCCTGAATTAAGAATGATGTCACTTTATAGATC
TATACAGCATTTATAACATTGATATTAATTAAGAAAAGGTAATACTGGGA
TGTTAAAATGGGGCCAGTAAAGAAAAGGTATTTAACTTAATTGTCTACCC
CTCTATTCCCTATTTTAATATATATTTTAACCTTTATATCTGCTAAAAAT
ATGCTATTAAATCGTTTCACCATCTTATTTCCAAATTGCTGATACAAATT
AACTTTGTTAATATAAAGAATACGATATTTGATAGTAATTACTAGTGTTG
GGTTTCGGTCTGGAAATCCTAGACCGGTCTGAGACCGTTATATATATATT
TTTTTTTTTGGGTCTTATAGAAAAATTCAGTCTAGATTAATCCAAAGAAA
AGATTTTTTGTAGGGAAAAAAATCGGTTCACGATCTTAGACCGCGGTTTG
GACCGATAAATCTGACTAGAAAAATCACTTAAGACCGAACCGAAAAAATA
ATTCGGTGCTGGAACGAGTCTCAACACTAGTAATTACCCATTTCTAAGGA
TTTTTAGCACATATTACTTTGATAATATTCAAATATCATGTATCATTGAG
ATCAAGTAGTCTTAATGTCAAGTCTTTTTTAACTTAGAAATACCTTTGAT
GGAATTTAATCAAGATTGATAGGAAATGTGTTCATTTTATGTACTTAAAC
AGTCAACATTGAGGCCTCCAGATGGCGTATCCATCAATTATTATGCAATT
TATGAAGTCAATGGAATAAATACATTCAACAAATAGGTTAAATTCTACGT
AGCTCAACGGACTACGCGCTCGGGGAAAATTATTCACTTGAACTCAATGT
GCGTAGGTGCGACACTCTGTTGTTCCTTGAGCAGGAAATGCAATTCCTAT
GTCGGAAGGAGTAGTTGCAATCCTATAATGTTTACTTAATCATTAAAACT
CTATCTTACCAATTATAAGAACATTAAAAAATCAATTATGATGCAATTTA
TGACGTCAGTAGAAATGCTTAATTAATATGTTAGATTGTGATTGATTAGA
AAATCGTTTGGAGGAAAGGCATATGAAAAACACTTTTTGTAGTATTTAAC
GAGGTTTGTTATACGAATCATAAAGGCGACTCATGCAAATATAAATCAGT
CTGAATGAGGTTTTTTTTATGCAAATTGAAAATCAATTTACCTTCATTTG
AGTTGAATAAAAAAATCATGCACTCAAGTCGAGTGGAACTGAGTGTATAT
AGGGGAGTACGTAGGGGGTTTTGTTAATTTCCCTGGTATAACTAATCTAC
AAATTGATTCAACACTAAAGTTGATAGACCTTATAATCGTTTCTGTAATT
ACATGCATATACATATGTTGTGAATTTAAGAAACAACCACTACTGATTCT
ATCTTTAGTTCATTACTTTTCGAATGTGTGAACTTTATTGTTGTTTAATC
TAGAAACAAGGGAATGTATATTAAACATTAGGCTGCCCTATTTTCTGATT
AATATTTTTTTCCACTGCAAACTGAAATACATTCAGCATTGGAAACTTTA
TAAAAAACTGACACGAACATTTGTATTTTTGATATTTTCTCAACTAATAA
AAATAAAAACAAAAATGTCGGCTCAGGTCAATTCACATATACTTTCAGTT
AGTGTTGGGGTACCCTTATTTAGGACTGAAGAATGCAGTTCCTTCTGGTT
CAGTCTCGGTCCGGTCCAGGGGTAAAAATTTATATTGCTGGGTCCTTCAT
GACCACTCAACTTTATTATTTATTTATTTTTAATCGGTTCTAGTACTTAC
AGTACTAAAGATCGGACCAAACATGTAAGAACAGGCACAACACTACGTAA
AGTGGTGTACTCAGGATTTTTTTAAAGTTATGGCCGTGTGGGAGAGTGTT
GGCTCCAGAAGCTTTATGACTTTTTAGAAGAAAAACAGTCTTAGCGTTCC
TTATTCCCGGTTTCAGTACCAATTTAGTATATTATTGTTTTAAATGAATT
AATACTTTTGTATAATGATGTAAATCCGGTGTGTTTTTAGCTGGCCTGTT
AATTTGTAATTGGTAGTATAAAGAAGGAATTTTCTTTTCCTGTGCAGTTG
TCATTATTATTTAATTCCTGAGTAGTAGTGAACATCCTTTTACAAATAGA
TTCAATTATATTCAAAACCTGATTTAACATTCGTGTGTGCACATAAAAGA
CACAGAATAAGCCTGAGGGTTTGTTACAGAGTTATATTTGTAGTTCCTTG
TTGGACTCACAGTAGAATTGGGGATCAAAATTGGAGTAWTTYTAGCCAAT
GTCCTTGTTTATATCCTTTTGTCCTTCCTCTCTTGTCACAACTGATTGTA
GCTGATCTAATGAAACGTCATGAACATTTTTCAAATTATCAGAGTTACCA
TGTTAATTTTCGGTGTTTATTTTTTAATATAACCATTCTTCAAATTGTCA
GGGTTACCATGTTGATTTCCCGTTCCTTTTTTTCTAATATAACCATTCTT
CACTGGATTTTCATCATTGCTCATGTAGAACATGAGTACCACTATACCAA
GACTGACATTTTCGAAGTGATACAGTTAATTTTGATTTGAATGCAAAATG
ATTTTTGGGTCAAGATTCGGCATTTTTAGACCTCTTATATAACATTATCA
AATATGCTGATGCTATAGGTAAATGATTTGGTGTGTCCCTGATGTATCAA
ACACTGGTGGTAGTGCTTGACATTGATAGAGTTATGAGGCGTTGACAAAC
AGACACACTTTGCTTTATTAATGAGAATCTCCTCCTTCAAGAAATCATCT
GTGCTATTCTCCGTTGTTGTTTTTTACATGTAATTACTCAACTCTTACAT
GTTCTCTCCTTAAGAATGGAATAATAATTATAAATCTCAATCTATATTCT
ATACAACTCTTTATTAGACTGATAAGAAACGTACTCCTTGGGCCGATCCA
ACAATAATTGTGAGGAAGGGAAAGAATTGTAATATTAATCCTCCTCTCAA
ATTTGTCCTTGCATGAATGAATGAATGAATTGTAATTCAAGCTATGGCTT
TCATAAATATAATAATGTATTCACCATTTAAATTCATGTGTATTCGTCGT
CATCATAATAAAATATCAAAGATTATTTATTTGTCAAATTGATTCATAGT
CGATAAAGGGACATAGTTTGATGCGGATTACGTATATATAATCTAATCCC
CTCTCTATTCCATATATTAAAAAATTGCAGACCACTCAAAATTTGTTAGT
TTACCTATATTTATACCGTTATGATTTTTGTTGAACCTAACTAATTTGTT
ATTTTAAGAAACCTTCGGTCTAGACCAGTCTCTAAAAAAAAATCGATCCA
GTTTGGTCCCTAGTAAATCGATCTTTTTCACCCCATGAATATCAAATTTC
ACCCCATGCAGAATCAAATATGGAATTTACAAATACAAAACCTTTGTTAC
TTCTAAGAATTAGTGGGTAAAGATGGATTTTATGTGTACATAATCAACCT
CCAACGTTTTTTGCTCAAGATTTTTTTGGACAAACTGCACCGACCTAAAA
TGTATACAAATTATGAAGTGCCCCCCCTTATTGGATCTATATTCTATCAT
AACATATTTAGAAATGTCCTTCTCGAAACCAATGTTGAAACCTTTATTCA
AGGTGTTCCTATGGATGTTGATGCCGTCACTGGAACTAAAAACTATCCCA
ACCATGGTTGGAGTTTATCTACTAGTAATGAATGCAATATCCATTATGTA
AATACTATATCCCTCGAATTATATCTCCTTGATTAA back to top
|
