EMLSAT00000010675, EMLSAT00000010675-706522 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010675
Unique NameEMLSAT00000010675-706522
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s707supercontigLSalAtl2s707:125677..150368 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010675 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010675EMLSAG00000010675-693441Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000047567EMLSAE00000047567-756495Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047568EMLSAE00000047568-756496Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047569EMLSAE00000047569-756497Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047570EMLSAE00000047570-756498Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047571EMLSAE00000047571-756499Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047572EMLSAE00000047572-756500Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047573EMLSAE00000047573-756501Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772764auto772764Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010675EMLSAP00000010675Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010675

>EMLSAP00000010675 ID=EMLSAP00000010675|Name=EMLSAP00000010675|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=419bp
MREVINVHIGQAGVQMGNACWELYCLEHGIHPDGLMPSDESIGQADDSFN
TFFSETSGGKHVPRAVFVDLEPTVIDEIRTGTYKDLFHPEQLINGKEDAA
NNYARGHYTIGKEQIDVTMDRLSVDFGKKCKLGFSIYPAPQISTAIVEPY
NAILYTHTTLEHCDVVFLVDNQAIYDICRKNLEVGRPTYSNLNRLIAQII
SSVTASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHYPLATYSPVISASRAYHEK
LSVDEITKNCFEPSSQMVKCNPQRGKYMAVCLLYRGDVVPKDVNAAIAAI
KVNKTVQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVHRAVCCLSNTTAIQ
EAWAALDHKFDLMFAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEARXDIAALELDYQEV
ATDNFSSEDYEDDEADDHY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s707:125677..150368-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010675-706522 ID=EMLSAT00000010675-706522|Name=EMLSAT00000010675|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24692bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s707:125677..150368- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGAGAAGTGATAAATGTTCATATAGGCCAAGCGGGTGTTCAAATGGG AAATGCTTGTTGGGAACTGTATTGTTTGGAACATGGGATTCATCCAGATG GATTGATGCCGAGTGATGAGTCTATTGGGCAAGCAGATGACTCATTTAAT ACGTTCTTCTCAGAAACTAGTGGGGGAAAGCATGTTCCAAGGGCCGTATT TGTGGATCTGGAACCAACTGTTATAGGTAGGGCAAGTATTCCTCTCATAA ATTATGTTATCTCCCTTCGAATTATAATTCATAATCAACAATCCCTTTTT TCCCGTGCTTTCTTTTTTTTTACATAATTTTAATAATTCATGTTCAATTT ATGTGCCTTCTGCTACTTCTCATAAAGTCGATAGTCTTATTGCATGATAA TTGTGATAAGTACATATGTGGTGCGTCAACACAAAAGAAACTTGAACGCT TTATACAGGGTTCTGCACTGGAATTAGAAAATACATTTATTGATTTATAG TCAAAATATGGTCTGAGCATTAGAAGATTTTTTGAATTTTTGAAGTAAAA ACATAGTATTCATTTTAATTAATAAACTAAATATTTAATCTTCCATTAAC TTTCCGAAGTTAGCTCCAATTAACCAAACTAGKCCATCCACATAAATATG AAAATTCTTGAACAATATGAGATCAGATAATATCCATCTCGAAAACTGAC TAAAAAATGAAAAAAAACGGAAATTTATTTTATTAATCACCTACCCTCTT GTATGTGCAGGCGGGAAAACTCGTCTGTGTTGCACTCATACGGGATCTGG TTGAGGTCAAAGTTTGAGTACAACCCTCTACATACACACCAAGAGGCCAA TATTTTACAGACATATTTAAAACAGTTATATGCTGTGTATTCAAATATCT TGGATGAATTAAGATGTCCAAGAATTGTATGTATAGTGTAGAACCTTTAT CTTATTTATCTGATTAAGATATCTAGGAGTATTTGTTTCTAGTTTAAAAC CTTTATTTTATTTATACGACTTATTTTTACCCCAATATGACATTTTTAAG GAAAATCTGTCCATTCCTTTTTTTTTTATAGTGACAATCAATTTTCGCTA ATTTAAGTACAATTTACGACACCGCTAAAGAGTAAATCAATTGATGATAT TTTTTTGTTGAAGAATGCAAATGTAGTCTATTTCAATTTTGAGAAAAATC TTTCTAGCTTGCTTTTGTGGTGACATTTAGTTGATATCTAAAAAGCCTTA ACATCGATGTTACTAATGATACCTTCTTCTTAATGATAAAATATTTAGAC AGCTACGTAGCAAAGTTTTTAATATTTATATATCTACATAACATATTATA TATCTAATACTAAAACTATGGATAAAAGTGTGTTATTTTCTGGTATCCAT AGAGAACAAGCTCATTATTTATTCAGACGGCTGTCTCCCTTACATTAATA ATTTGTTGTTTTTTCGTAAAAGCTAAAACTATTTTTTTTAATAAACGTTT ATAACAATTTTTATTTAGGAAAAACTGGGAAATGTTGCAACCCTCTACAA TTCTCCTCGTACATGAACACAAGTTGTTCCAACAATATTTCAAATTTTAA GGGTGTTAGATAATAAAAATTATTTTTAAAAGAGACGCATTTTTGTCAGC CTTTCTTATATTGGATAATAGAGGTCAAAGCCCGTAGAATGCAACACTTA ACAGATGGGCATAAATTTATCCACAAACTGCCTGGAAGGCGCTTTATTTC GKCCGACGTAATTTTCTTGCAGTTCCGTTTGAAGACTCACCATTTTGGAA GTATTTCCCAATTTTTTTCGACCGTAAACATAATCATTTTTTAAACCGGA GACCTTTGACACAATATTAGACACAATGAAAATGTTACTACAGCTGTCAA ACGTCAAAAAAAGTGGTAGTTCAAAATGCAACCGCTAGATGGGCCACCCG TTAGATGGTACTATTTTTTTTAATTCACCTCATTTTCAGTGAGTAACAAC CATGTGTTTTGTTATTTAAAAATAATGGATCAAAATTAATTTCGTGTATC AATTTTATACGGCTACTTGAAGGGAAAAAATACCATTCAAGCTAAGCAAT GGCTTGAAAAGTGTTATTGGACTCTGCTTCAGAAAATGAAAAAAAAACTA ATAATAAAAATTTAAAAATAAACAATTTTGAACGATTTGTTTTCTTTATT AAGATCAACCCTTTTAAGTCCATTTTTTAGTATGAGAAATAAAAGCCTGT AGCCCCCTTTTAGCTTTGAAGGCCAGGTTTTGTTTAATCAATCGGACCTT TTGTCCTACGGCATGTGTCAAATTCTATGACAAGAACTCATATTGTTGCG TGTACTTTTTTTGATTCAATGGCCATGCACACAGACTCCTCCTTTTCCTT GCCCCTGCAGTGTTCTCTCAGACCTTCTAGCAGTGGAGTCTATAGGAATG GGGGATGTAGGGGGTGTTCAAGCACACCCACACAAAAATTGTTACATAAG GAATTTAGATGGCTTTATCTCTCAGTCTGTTAAATTCTCGACTACAATGT AGCTGAAATCTCCATCAATAAACTAGGATTGCTTTCCTATAATATTTTAC ATCTCAGTGTCGAGATGGGACCAGGCAGAGCCATTACAGGCTTATAAAAC TCGATGCCCCCTATTTTAAAATTCAGTAGCCCTAGTCTAACATACCAATA GATATTGAATTGAAAAGTATCCTTGAACGAAATAGTACATAACCATTTCG AATTCTAGTATTACGATGTCAAGGCAATGCTTTTCCTAAAGAAGTCATTA CTTCCCATAAAATCTTGGTAATAAATTAGATTTCTTCGAGTCATAATTAA AATACGACTCGATCATTCGAGGGTCGTTTGAAAAGTCCATGCTCAGTCTG AGGGATGGTGGTATTACTGGAAAGGATTCATGTTTATTTCCTTCCTCCCA CGGCTACTTGTAACTGATCTAATAAAACGCCATTACAGTTAAGCTGCTCT CCTCACAAATGCACTTGATAGGTCATGGCTATTTACTATAAACAAACCAA GTAATTAGTTTAGCTATAACATCCCCAATAGAAGAGGAGGATCAACTAGG CCAAAGACGACTTCAAAAACAAGTTTGCTAGGGCAACATTGGAGACGGAA AATATAGATCAATATCTCAAGACAATCTGGGATCCAGTCCTCCATCCGAA GGAAATATATCTGAAATATAGGGATATCGTCAGGMGMCTTCTTTWCTGGA AGACATTTTAATGACGCTCGGGCGCTCTGTGTGGATTTTAGTAGAGTAAA GACAACCTCTCACGTTTCCCGGAACTGTGAGAGAAGGTTGGGAAGGGTAT ACGAGAGAAAATAGAGAGACACCCTGATCCGGATGAGCTTATGTACGGCT TCGAAGGAACCAACGAGGGACTCCGTTTGGCGTCGAAGGTGATATGCAGG CTCCAGCCTCTTATCACTTCAGCACGTTTCAGTGGTGCCCGCCCTTCACC AATAATAGCGGAATATAGCTGTGTGTTGAATTCATTTAATGCCATAGAAA TGTGGTGATTGGGATTGCTAGACTTAATATTTTTATTGTATTTTTTTTTT CATTTTGAACAATGTTTATTTGTTTTTATTATTGGAATCATCATCAGGTA TGATTCTAATTGTGTTCTTTTTTTTTAATTTTTTTTCTCTACCGTTCTTG ATTTTTGAGGTGTGGAGGAGGGAAAAAATCAACCACAGGGAAACTTGATT GTACGTACATAAAAAGTAAGGTAAAATAGCTAACGTATGTGAAGGAGATT ATGCTAGCTTAGGTGAATATAGTTTTTTTATAATTTTAAATGTTAATTAG ATTGTAATAAAAAAAGAAAAACAAAGTTTTGCTATAATTATGCTCTGTTT CCATAAGGACAGGAATACAATTTATTGTTGATTCTTCGTTGTGTATATAT ATATTAGCTAAGTATTACCTGGTGTTGCTCGGGCTAAGGAGGGAGAGGCG AACCATATTGAAAATGGTCAAATTAATGGAGAAAATTAAAAGTATATTCA GAAAATACTTCTATACACTTATAATTATAATAGGAATGTTTTGTTGTAGT CGAAAAAGATCCATATAAATTCAGTTAAGTAAGGTAATCTACAAAGTCTC ATAATAGCCTCCCTCTCTCTCAAAAAAAAAAATACTCTTTATTATTGCCT CGAGTAAAATTATTATAAATATAAAAATTGCAAATATATTTGCTTCAAAA ATTCCCAAATCGACATTCGCGAATAAATTGTAAAAAACTGTTTTGCACTA ATTTTGCAATATCTTTTTCGTACTTACAATAACAAAAAAAAAGTTATGAA AAATAATGTTATCGAAAACATAACCCTCGATTATTAGTTCATTTTTGCAA ATATTGGAAAAATTACATAATAAAATTTGCTAAAAATTTGAAATACTGCA CTAAGTTGAAAGCATTGTAAAATTTAATGTCCAAAATGATCATTTTGTGG AATTTCATTTAAAAAAATTGAAAAATGACGTTTATAAAAATATATGGGGG GAAAAAGAGAGAAAAAAAAATCGAAAATTCATCAGAAAATGACAGATGTT TCAGTTAAACATTTTTTAAATTGGGGATAATTAATATGACAATGATAGCC TTGGAGTAGTGAAGAGATCAATAGCAGGTGACTTATTTGTCTAACGGCCA GATAATTTTGGCCCTTTTTTTTTTGCATTTTTTTAAAAGAATAATGCGTT ATACAATAAAAGAAATTACTTGTAAGTATTCTCCAAATTGTCAGGACTAT CAAGTAATTTTTTTGTTCCTTTTATTTTTGCATCCGGCTGGGGACTCAGT ATGTATCACTATTTATAGTCCAACGAAATATATAAGTATGTTGTGGCTGA TATAATGATAATCAATATGGAGCAATCATCAGATTAATTTCAAGTGAATA TATTTTGTATTTAGACAGATTAAGCAAAATTTATATGAAGTCATCTGGTC TTTATCTTCGATTCATAAAAAGTACCAAATTTTAATTTTATATATATTTG TAAAAATATAATTTTCTATGAGGACGTATTTTATTACTCAAACATTTACT TAATTAAATTCTTGTATAAAGGGATCACAAAAAACATATTGAATTACATA AGGATAATTCAATTATTGTTTATAAATTCGTAATATGACATTCACAAAAA GTTTATAAATATGGAGAAAAATATTTTTTTATAATTCTGCAAATGTTTAA TTCATAAAAAGATAAATGTTTGATATTATATCAAATTTCTTAAAATACTA ACTAAATATTAACAATATAATAACTTAGAGTTTTTTATTCATTTATAACC CCATTTAATTACAAGCTAAGACATGCAAATCCTAAGCATTTTTTAGCGTG AACAAGTGTTTTTATATTTCTAAGCTCTTATCATTTTCCTTTAGGATATG TAGAGTGATGCTAATCACTAGCATTTTGTGCAGGTAAACAATAGAAGTCT AAAAGCAACATGGCTGCCCTGACAATGTGAATACATTTATAGAGGAGAGC AGCTTAGCTGTCTTGGACTTCCATTAGGTCAGCTACAAGCAGCTCTGAGC AGGGGAGAAAGAGGATTTGAAAATAAATAAAGACATAAGCAGTGATTAAT TACTCCTATGTCAATCCTAAATTCTACACTGAGTCCAACAAAGATTTATA 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CTACGATCCGACTTTTGAGTGCCTCCTCGAATCTCCTTGATGAATTGCCA TACCACATCCAATATATTTTCCAATATGAATAATCCATCAGGTATAAAGT CTAATGATAATTGATAAGTAAGTGAATAGCACTGTTTCTATTCGTATTAC ATTACTGTAATGTTTGTTTATTTAATTTAAGCATAATTATTAATATTACT TATTTTGTCTCAGGTTCGAACACATTAGTGATTAAATAAGTGAGATTATA ATATAAAAAAATAAAAGAAAGCGAGTCTTCCCCCGAGCGAGCTTTATCCT ATACGAATTTCACCCAATGTGAGTAATCCCAGTACGAACTTTCCCTATAC ACATTTTCCGTATNNNNNNNNTAGATCCATAGGAGTCTTTCCTGCCTATG TTCTTGCTTTGTACAGAATAGGACTTGTGTTTATTTCCTTACTCTCATAG TTGGTTGCAACTAATCAACTGTTACATACTGAAAATATAATTATGATTTA TATCCCAATTTATCCAGTTATATTACTGCTTAGTGCACAATCTAACTTAA TACGTGATGAAAAATAAATTTATTATCTCTTATATTTGTTCTAAGAATAT TGAAATAATTTTATTTATTATTTCTTAAAATAAAATATTTAAGATATTCA TGACAAGATTACTTTAATTCAATTATCCTTCCTCTTTTTTTCATAAGTTT TTTACTTATAAAAAATGTATGAAACTTTTTTAAAGAGAGATTAACGTCAT AAATTGAAAAGTTTCACATCAGTGGTGCATTAGTTTACCATTTGTTGTGT TTTAATTAGTTAATTGTTTTTGATACTTTTATGCCTGTAAGATCTTAAAT TGATAGTCTAATTTGAAACTACAATGGTTATTTATATTTTTAGTAGTACA ATTTTTCCTAGCATTTTATATTGTCTTAAATCTATGTGTACGTTAGAGAT 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GCGTTTTGGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGTGCATTTTCATTGAGTTCCCTTTGG ACCAAGGCTCACAAATTTTCAATGGGAGACAAGTCATGACTGTTTGCAGG CCATCTGCCTTTGCCCCCATAAGGAATCTAAGTTGTTTGAACACTACTAT TGTGCCTTTTTGTAGTGGTGAGCAGGGGCACCATACTGCTGGGAAATGGC TCTTGATATATCAGACAACCTTTTCCTCTTCAAAGGAGGTCCAGTTTCCT CAGTGCGAGACAAAGTTGAAATCAGAGAACTGCTGAGGATCTGTGTTACG TAGTACTGAGCCGTCCCAGTTTGGTTTTGGGAATCAGGTGAATATCTGAC ACTGTCTGGTGGCTGATAACGGCCCAAACCTGAATTTTCAGAAGAAATTT CACAGTTGGAGTGAGTTCCACATCTCCCTTATGTCTTGCACAAACCCGAT CTGTTTGGGGATTTGGGGCATGAAATAGCTCAAATAGACATTCATCACTC AAGAGGATACATTTTCAGTCATCTGCAGTCCAGTGTTTCCGCGCACGAAA AGAATTAAAGCCCTTTGATTTTCTGAAAGTTTGGGGGTGCAGACGATGTT TGTATGGCAAAGCATTCAAAGAGTGCCTCAGGTAGTTGTGGTTAAATCTT GCTGCAAGTTTCCTTGTGGATTGCCTCTTTTTGGTTGAAAATGTTTGAAA TCACCAGTTTGGGAACTTTGCTAATTTTTTTCTTCCTTTCTCAACCCATC TGATTTGAAGGGTTTGTCCTTCCTTCCTTTTCTTGCACCAATTTTCAATG GTTCTGAGAGGAATCTGTAACCTTTGAGCAACGTCTATCTGGATTGATCT ACCCTCTATTATGCCAACAGCCTTTGCCCTGGTCTTTTAAAGAGTGTTTT 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