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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s718 | supercontig | LSalAtl2s718:92120..102469 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010820 >EMLSAP00000010820 ID=EMLSAP00000010820|Name=EMLSAP00000010820|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1340bp
MDSQIGSPRTPMSERQQLALIRCMESKRADSPPRTPLRSLQNRGEEEAKT PKTPAEEKLRRKLCKKNAKGETPLHAXAIKGRSTLVRRLLALGASPNVKD NAGWSPLHEXANRGNLKVARVLIRYGADVNSLGDGKETPLHDAARNGHIQ VVQYLIKSGAYLGARNISANTPLDVAAHPENRCRNPQLQETIEYLNSIGT SEAVDSKDLESSFSDSSSDTSSCEDPDEEAIKFLGLEYTKREMKKALVSK SANLTSCSDKFVNPSSRVTVRLQPPLXPSXPSIKTRLTYGMEDTHAQSTS STTTAAPKEDIYEFKSSSKEATPVRSSQSPEPKHEAENKVTEDKPDKRPL DEGLEEDPKRKKQKKDELSKGRGSRGSSMEKGPICPKTAKTRVSNNEQQS QAMSGSPKKPESDSDDDNSKKSTDSSGLKVPPLKIVLSAGNNSGNATPPS SGVENNSRNETPTISNSINQNPSTSGIENNSKKLSASLGRYVNKEDNNSF SNNEEGRSEEANDGDSGGTNEKGGRMTRSKAHQGTPGPDGFGDSQVEDNV NSNSSSIFTRGGNGGNNGSSNGNGXSNLNGNNSNGGNPNGNLGCGGNGNN SAIEPMNDIEKYLHIRKQIEQRRKNLFPVQPKPPQGFKDYLMNRKSYLLQ ENASERLRQIPLIQPPPSLEGAMVELFKEQEEARRKLRMKHVVEKEKLVL SVEQEILRVHGRAARALANQSLPYSLCTILRDEEIYTPIDPQQEEKNRDI RSRYNGRLFLSWLQDVDDKWERIKEQMVLRHHNEAESLNAVQKMDWEWKL KEISDNPSSFNDSIKPQIDDLLIPMDQLYHYRNFSFGGCNIPSKTQNFIN GKFIDSSTSKWIDVHDPANNEIVTRVPQSTNTEMENAVESAKAAFKTWSK TSPLSRQQVMFKYQALIKENMSEIAKLITREQGKTHSDAEGDVLRGLQVV EQCCANTNLLMGENLPGITKDMDLISYHTPLGICAGIAPFNFPAMIPLWM FPMAXICGNTYIXKXSERXPTACMALVELLKEAGMPDGVXNIIHGQHDAV NFICDHPDIRAISFVGGDAAGKHIYNRGSANGKRVQCNMGAKNHGVICPD ANKEYTINQLVGSAFGAAGQRCMALTTAVLVGNAQSWINDIKEKASKLVV SAGSDPGADFGPVISPQSKQRINDLIQSASNDGADIILDGRNITVDKYPN GNFVGPTIISNMTENMEAYKEEIFGPVLCVINVETLDDAIELINKNRYGN GTAIFTNNGATARKFTQDIDVGQVGVNVPIPVPLPMMSFTGSRGSFLGDS HFYGKQAIGFFTQTKTVXXLXRQADATVDSKVTTSMPVQN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s718:92120..102469- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010820-706667 ID=EMLSAT00000010820-706667|Name=EMLSAT00000010820|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10350bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s718:92120..102469- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGACTCCCAGATAGGATCCCCGCGGACTCCCATGTCCGAACGACAACA
GCTAGCTCTTATTCGATGTATGGAGAGTAAAAGAGCGGATAGTCCTCCAC
GTACGCCGCTCCGATCTCTTCAAAACCGTGGTGAAGAAGAAGCAAAAGTA
AGTTATGTAACTATGACGTTACTATCCCACATGACATATATAAGATGCCC
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GCCTCACCGAATGTGAAAGACAATGCTGGATGGAGTCCTCTTCATGAASC
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CGGATGTCAACTCCCTTGGGGATGGAAAAGAAACTCCTTTACACGATGCC
GCTAGGAATGGACACATTCAAGTGAGAATCGTTCATTTATTAATAAATAT
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CCATTGCTATTAATGTAAACACATAACAAGTGAGTGATATCTTTTAATGA
GCTAGTATTTTTACCTTACCCATAAATAGTATTTGACATTTGAGATAGTG
ATATTTAGTTTAAAATACAAAACGGATCCTATTATATCAATAAGGACCCT
GATTTTGATGGTACATCTTTCTTGGCCCCTCTAGAGTCAATTGAAGTAAA
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ACCTTTTCTATGTCAACTGACTATGAATACTTTTACTCTAAAATAGGTGA
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AGGTTAAATTTATAATATTTAGAGATCCTGGCTCCGAATTTGCAGTTCTT
TTAAAAACTTGCAACTCTAAATCATAGATAAATAGGCATATTATCTGTGT
TTTAAACCGAATCTATGAATAAATATGCAACTGCTGACTCCCGGCTCACT
TATCGGTCTTAAATTTTACTTCATAGGAATTAGATTTACCTAGTACTAAA
AATTTCATTATTTCGATCCTTTTAAGCTTATAAATGGGATATAGAAAATC
GATAGAGTCAGACTAATGTTTCCAATTGGTAATATTTTGGCGCCAAATAT
AAGAATCTTGTTCATCCTTATGAGTTAATTACAGTATTAATCCAAAATTA
ATGGGGGAATATTTCATATTATTTGTGTAAAACTTATTCTAATTCCAAAT
CCATTCAATTCCGTGCGTAAATGCAACTTTACTAAATCCTGGCTCAATTA
AATCTAATTACATTATTTTGATGATCCTAAACTCATTAATTGAGGATATG
AGTAATTGATACAGTCTGTATGAAGTTTTCTATCCTTTTCTGTTCGGCAA
CTAACTTATAAATACATCCATCATCTTATTAATTAATTATACTATTATTT
AAATGCACGGACACAATACTGTCTAATATAATATTAATCAATTAATCATC
ATTCAACCCTTTGATCTTCTCTCTCTCTTTCTTAATTCTCTATTAAGATT
TWCGTTTTATATTTTMTACATCTTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNACTTTTAACTTTAAACAGATAAAATGTTCGATCTAAACTAT
ACTTTTGATAATTTTTTTTGTAATTTTCTTGTGGAAAAACTTGTGGTTCA
CTCCAGATATTAGTAGAACTCATTGTCAAATATATTGTCTCTTAAAGTTG
CGTCACCAGCCTCCAATTTTTTTAGGATATATATTGCTGTGTTAATAAAT
GTTGGGGCTAAGCTTCCCCAAATAATGAAAGCTAGCAACGTCCCTGCCCA
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GCAATTTATTTTATTAGATTGATACATTAATTTTATATGCGTATTGTCGA
TCTTAAGTATTGAATTATATAATTATTTGTATGATTTTTTTTAAATTCCA
TGATATTCAATGATCCTCTTATAAAAGAGTATAGTTTTAGAGCGTTTTCA
CGTGACGTCACAGTTTTGAAGTCCTTTTTGGGGGTTAAATAACCAAGTTT
TATTATAATAAAACCCTTTTTTCATTAACATAACGGAAAATAGTGAACTA
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TAAAAATATGTAAAAAAAATATTACATCTATTTTTTTTTTTGTTGAAGAT
TAATTATTACCTTGGAAATAATAAAATATTTTGTCCTATCCTACTTTTTA
TGTCCCTTATCGATTTAAAAAAAAGGTACATATCTAGCCATTTTAAGAGA
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GGCATCAAGATATATTCAATGACAAATGAAGTTTTTATTTATTCATTTAG
CTATTTTATGAAGTTTTATCAAGGTTTATTGAAAATTTGTTTATTTTGTG
GAGTCAAAACATTAACATAGAGCCCCCAAAATGACGTCTCATTCAATTAT
AATGTGAGTGAAAACGTTTTCTATGCCTAATCAATTATATTTTTGTTGTT
GTTGAAAATTTCTCAAATTTGTGGCTTTAAATCGTGTTTAGTGTGAGCGG
AATTGAATGAATTATTGAGATCCGGGCCATGATTGAATTAGGAATAGAAA
GAGAGAGTGAGAGAAAAGAAGAAGGGCTGTACTGGCCTGCTTATTTTCCC
CTCAACTTCTTTTTTGTAGCTGAATGAAACTTGGCGTTTTTCTTGGGTTT
CTTTCTTTATAGTTTTCTTTTTTTTAATTCATTGTTTATCTCTTTGATAT
TTATTAATGATTTCCCTTTGAATCGAAGGTTGTTCAGTATTTAATTAAAT
CAGGAGCGTACCTTGGGGCTCGAAATATCTCTGCTAATACTCCCCTTGAT
GTAGCAGCTCATCCCGAGAATCGCTGTCGTAATCCTCAGCTCCAAGAAAC
AATCGAGTATCTCAACTCCATTGGTACATCTGAAGCTGTTGATTCCAAGG
ATCTGGAGTCTTCCTTCTCAGACTCTTCTTCGGACACTTCTTCTTGTGAG
GATCCTGATGAAGAGGCCATCAAGTTTCTAGGCCTTGAATACACGAAAAG
AGAGATGAAAAAAGCCCTGGTTAGTAAATCCGCCAATCTGACAAGTTGCA
GTGATAAGTTCGTGAATCCCTCTTCTCGCGTGACTGTTCGTCTTCAGCCT
CCTCTTGAMCCCAGCAMCCCATCCATTAAGACACGCTTAACCTACGGTAT
GGAAGATACCCATGCTCAAAGTACGTCGAGTACAACGACAGCTGCTCCCA
AAGAAGATATCTACGAATTCAAGTCTAGTTCCAAAGAAGCCACTCCTGTT
CGATCATCTCAAAGTCCGGAACCCAAACATGAAGCTGAAAATAAAGTAAC
GGAGGATAAACCTGATAAAAGACCTCTAGATGAGGGTTTAGAGGAGGATC
CTAAGCGAAAAAAGCAAAAGAAAGATGAGCTCTCCAAGGGACGAGGATCT
CGAGGTAGTTCAATGGAAAAAGGACCCATTTGTCCAAAAACTGCAAAAAC
AAGGGTTTCTAATAATGAACAGCAATCACAAGCTATGAGTGGAAGTCCAA
AGAAACCTGAATCAGATTCCGATGATGACAATTCCAAAAAGTCTACAGAC
TCCTCAGGCTTGAAAGTTCCTCCTTTGAAAATTGTTCTATCTGCTGGTAA
CAATAGTGGGAATGCAACACCTCCTAGTAGTGGAGTCGAAAATAATTCGA
GAAATGAAACTCCTACGATTTCAAATAGTATTAATCAAAATCCTTCCACG
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CGGAAGAAGCAAACGATGGTGACAGTGGTGGAACTAATGAAAAAGGTGGA
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TGGAGACAGTCAAGGTAATATAATTATATTTCAGTAAATCATATTTTAAA
AAATATGACGTCCATCACTTTCTTATTTTTCAGGGGCTAGTTCATCATCA
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TCCTCTATATTTACTCGAGGTGGAAATGGTGGAAATAATGGTTCTAGCAA
TGGGAATGGCTGMAGTAATCTAAATGGMAATAATAGTAATGGAGGAAACC
CAAATGGAAATTTGGGTTGTGGAGGGAATGGMAATAATTCAGCCATTGAA
CCTATGAATGACATTGAAAAATATCTTCACATTCGAAAGCAAATTGAACA
GAGACGGAAAAACTTATTTCCAGTTCAACCCAAACCGCCTCAAGTATGTT
TTTTATTTATATAATCTATTGTATAATTACGTATGAATATTTTTAATTCA
TTTTAAATAGGGATTTAAAGATTATTTGATGAATAGAAAGTCATATCTAT
TACAAGAGAATGCGAGTGAAAGACTGCGTCAAATACCACTTATACAGCCT
CCACCTTCATTAGAAGGTGCTATGGTCGAGTTGTTTAAAGAGCAGGAGGA
AGCTCGTCGTAAACTTCGTATGAAACATGTCGTCGAAAAGGAAAAACTAG
TTTTATCTGTCGAACAGGTAATTTATCATTTATTTATAATCCGTTTGAAA
TATTGTTACTCTCAAATCACATAGGAAATATTAAGGGTACATGGACGTGC
AGCTCGAGCACTTGCCAATCAATCTCTTCCATATAGTCTTTGTACAATTC
TCAGGGACGAAGAGATATACACACCAATTGATCCCCAACAAGAAGAAAAA
AATAGGGATATTCGATCGCGGTATAATGGGCGACTTTTCTTATCCTGGCT
TCAAGATGTAGATGATAAGTGGGAACGTATTAAGGAGCAAATGGTGTTAA
GGCACCATAACGAGGCTGAGTCCTTGAATGCGGTTCAAAAAATGGATTGG
GAATGGAAATTAAAGGAAATATCCGATAATCCCTCTTCTTTCAATGACTC
AATTAAACCACAAATTGATGATCTACTCATTCCTATGGTACATGTTTCTG
ATGAGTTCGATTTAACGGATTGTAGAAATTGAGCAAGTACCGGTTATTGT
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GTTATGTTGATTTGTATTAATTTTGTAGCAAGTCCTGTAATTAAATGAAT
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CGAAGTAAACTGTATCAATATATTTATATTGTGTGCCAAAATTTATTTAT
GAATATTACTTTTACAATGAATTATTAAACTAGATTCATGGGAGTGAGGA
TTTTCCTTAGTTTGAATATCACACAAATAGTGATTAATTTAGTCAGGGTA
TTTTGTATTGTAGATATGCTCAGCAAGATAAGCCCTTCTTCGTTGGTTCA
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TCTGATAAATAATTGTAAATTATTAAGTTAATTTCATTAAAAGTTTTATT
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ATACTCCATTAGGTATTTGTGCTGGAATTGCCCCTTTTAATTTTCCAGCT
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TAAAAATCACGGTGTCATATGTCCTGATGCAAATAAAGAATATACAATCA
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CTTACAACTGCAGTTCTTGTAGGAAATGCGCAATCTTGGATTAATGATAT
TAAAGAAAAGGCCTCCAAACTTGTCGTAAGTGCTGGAAGCGATCCTGGAG
CGGACTTTGGACCTGTTATTTCTCCACAATCCAAACAAAGAATTAATGAT
CTCATTCAGTCAGCTTCTAATGATGGAGCTGATATTATTTTGGACGGTCG
TAATATTACAGTTGATAAGTACCCTAACGGAAATTTTGTTGGACCTACTA
TCATTTCCAATATGACTGAGAATATGGAGGCTTATAAGGAGGAAATCTTT
GGCCCTGTTCTTTGCGTCATCAATGTTGAAACGCTTGATGACGCTATTGA
GCTTATCAATAAAAATAGATATGGTATATTCACCAGATAAATATTTTTTT
TTATTGGACATATAAATACTATGATAATACTTTCTGTTAAAATTATAATT
TAATTTATGTTACGTCTTGCAGGTAATGGAACTGCTATTTTTACAAACAA
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TCCAGAGGCTCTTTCCTCGGTGATTCACACTTTTATGGAAAACAGGTTAG
TTGGAAATTTATTCAGTAAAGGTAAATTTTTATGATTATCCTTAGGCTAT
CGGGTTCTTTACACAAACCAAAACTGTTMCTCAMCTCKGGAGACAAGCTG
ATGCTACCGTAGATTCCAAAGTTACAACCTCAATGCCTGTTCAAAACTAA
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