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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s71 | supercontig | LSalAtl2s71:527215..540148 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010834 >EMLSAP00000010834 ID=EMLSAP00000010834|Name=EMLSAP00000010834|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=211bp
MFEKCFGIDLPKYPVPAISSNLESVVTTPIGRNHDKKIGFDKNKSIGSLM
WQGREAEAIRQLQRYIEHKANISSFEKLNVTSQSLISSSTGLSCYLRFGY
HSPRLLYHSMRTFSEQMRSLLYLYFVTYCGDNFSMWLRFITTGAMRECGC
GYHIILSFNNFYMFIILSKLVVKLILMGTIFAPEDIRRQVGCVIGVDYPV
PILPSLLKKAF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s71:527215..540148+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010834-706681 ID=EMLSAT00000010834-706681|Name=EMLSAT00000010834|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12934bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s71:527215..540148+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTTGAGAAATGTTTCGGCATAGGTTTTTTGGAATTGTATAACAAAAA
GCTCATCAAAAGCTTTAAAAAAAAAAAGACTAAAGCTATAATAAGGGATG
TGAAAAGGATCCAAACCATTAAGATCGTATAATTAGGATTAATTATAACC
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CCTCTAACCCGAAAAATAACTTTCTAACCATAAATTCAATTTTTTTTAAC
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ATCGTCATAATTAATTAATTAACTATAATTTTTAGGTCATAATAAATTTC
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GGTGTCTACTAGAGTTTCTCCATTTTAGGATAATCTGTTCATATGTTATA
TATTGATTAAAAATGTATCTTTGAAAAATTTTAGTCTTCATAGCCTGTTT
TTGTGATCTTTATGGCCATTTGAAAAGGATTTTTTTATACAAAATTCACT
ACGTGTTAAAAGATTGAAAGATTTCAATTTTGAAGTTTTCATGATGAATT
TCAAAAGTTTTATTAAAGTTCATTTTCTCAAGAAATAAAGAAGAACATAA
TCCTGATTCTTCATTTTGAAGAAAAAAAAATTGTAGTTCAACGAACCACA
TCAAATACTCAAATGATCAGATCACTGTACTTCCCTTCAAATCAAGTCAA
ATGAGATTTCGGGTAGTATATAAATGGCAATGAAGTAATTTGTCATATCA
CCTCTGGCCTTACTGGTTATTTTGGCTTAGTAGTTACAACTCACTTATTG
ATTCATCGAATACATAAAAAATTTCATTGACTGTATAAATACTTAATATA
TATGTAGGAAAAACAAAAAGAAAATTACAAGCAAAATTTGTTGTAAAAAC
TACATTTGACCACAAAAGTTTTATAAAAATAAGGTTGACAGTTAATTAGA
TATGGTCATCCAATTTCTTTCAAGAGTATCCGTAATTATATTACGATAAT
TATTAGTTCAAATCCTTGTTCAGAGTAGAATTAATTGGAATCATAACATA
TTTAGAAATAATCCATCAATAAGAACTAAGAAGATTTAAAAATGATCAAT
AAATCATAATCAAATTCAGATATAATTACATTTTGAAATAAGACCAAAAG
AGCATTTTCCTATTCTAGATCACTGTATTTATAAAAGTATGAGACATATT
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GCTATAAGTTCGAACTTAGAAAGTGTCGTCACAACTCCCATTGGGCGTAA
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TAAATTAGGTTTCGATAAAAATAAATCCATAGGTTCACTTATGTGGCAAG
GCAGAGAGGCAGAAGCTATTCGCCAGCTTCAACGTTACATTGAACATAAG
GCTAATATATCATCGTTTGAAAAATTGAATGTAACTAGTCAGAGCTTGAT
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AGATTTATTAAAGTTAAATAGTGAATTTCTACTAGTTTATTTAAGATGAA
GGATGAGGAGCCTCCTTTATCTTTATTTTGTCACTTATTGTGGAGATAAT
TTTTCTATGTGGCTGCGTTTCATAGTCCTAATTTTGATACAATGATTTGA
ATAAAAATTATACAGACTACTGGGGCAATGCGTGAATGTGGATGTGGCTA
TCATATTATCCTTTCTTTCAACAATTTCTACATGTTTATTATCCTATCGA
AATTGGTCGTCAAATTGATCCTAATGGGGACTATATTCGGTAATCAATGA
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CAGAGCTTAATAATTATGAAAAAAAATTTATTTATATTTGAGATACACAT
TCACCATTAGTTGAGCAAGCATTTACAGCCATTAGTGTATTTAGCTATAT
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TTTTTTGTTTTGTTTTGACCATAGTTTGCAAATACTGAGTCTGTCCCAAA
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TGAATCTTAAAGAGATTGGCCCTTATGCCATTTTTCATTATTTAAATCTA
ATTTGTTCAACATACATTATCGTCCTTCGACGACAACTTTAAACTAATTA
TATTTATTTTTAAATTACTCTAAATAATATTTATTTCATTTGAATTATAA
CACTTTGGGTATTTTCAGTTCATTTAAACTCTTTTTCAAACTGATTCTCC
ATTTCTAGAGTTGATTTTTAACTTCATAAAGTTTATTTATTAAGTGAGAC
ATTGATTTAAATTTGTAAAATTTTGTATTAAAATTTCACAATTCTTAAAT
ATAAAATAAATGGAGCCAAACATGTAATTTATAAATGTCTTATCTTTTTT
ATCAATTGAGAATTAAACTTGATAATAATTTTTATATAAGGATAACAATT
TGATGTTAATCTGTAGTTAAATTTTAAAACGGCAACTTATTAAATTATTG
AATCCACAGACGATACATTCCAATACTTAAAAATTATTTATTCATGAGCC
TTGGAAAGCTCCAGAGGATATTCGACGCCAAGTAGGATGTGTTATTGGTG
TTGATTATCCTGTACCCATAGTAAATCATGAAAAAATTCAACGACGTTCG
ATTGAGAGAAGTCTTTTAACAGCTATCTTCCTATAGAATGTTTAATTTAC
ACAGTAAGTATTAAAAATAAGTATGATTTTTATGTTAATCTTTGATTGTT
GTTTTTCGATCAAATAGATGCTCCTTTAGACTAAATTCCAGATTCAGAAG
TACTCAAAAATCAACAGGCTTTTAAAAACAGACCAGATAACGTTCAAATC
TTGATTGAAACTGAGAAGAAGTATGAATTTCAATCTCACGAAAATATGCA
AGAGAAAGACATTCAGGATGATACATGAAATGAAAAAAATCTTATTTTTA
AATTCAAGTACTGTGTTGATATTTTTATATATTTTTATTATATGTCTACA
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ACATAATGTTATTGTTATATTTACAATTTATGTCCAAAAACTTGTTAAAA
ATAAAAATAAATAATGTTTTATACGTGAATGCTGTATTACAAAAAAATTA
ATTCTCAACACATATCATATATAATTCGGTTACGTATATATACTTACTAC
AATTAAAAATGTATTTGTTACATTTTTTCAAAAATAAATAAATAGATATA
TTCCTCTCAGTTAGGATAACCTGTAATGAAATGACTCCTAATTGTATATT
TTTTAGTTCTAGTGTAAAAGTTAAGCCTTTGTTTGTGAATATCTATTTCT
TAACACATTCAGTGAAATTGGTAATCTCCAAACCCAAAAATAAAACATAT
TTAATTAAATAGTAAGCAGTTGAATAATAATAGTAATTACATTATTTAAA
TTTTGCATAATTCTTCCATCTATTCCAACCATTTTACAAGCGTTAATATC
AATTTAAATCTGAAAAATATTTGATTCAGTACATTCATCAAGAAAAAATA
TACTTTTATTTTAAAATACTCTGAACAAGTTTGTAGGTTTAACAGGATAT
ACAGGGTCGTTCAGTTAAATTATAACCTCCTTCAATTGCATTTCGATCAA
AAAGGGAAGCAAGTAGAGCTTTGAAAGTTTATCTACAAATACTAATACTA
CCAAGGAAAAACTTCAATCAATTTGCAACCATGTTCTTAGTGAACACGGG
GCCTAAAGTATTTGAAATCCTAGATCACGTCCGCAGGGTGACTTTCTCCA
GGTACTTGATAATGAAGGCATTCAAAGAGTCGATGCTGTTGTGTGAATTA
GCAGAGACCTTACTCTCTAACTAATCCTAAATAATTAATCCATGGGTTTC
ATAAAAAGAGGAGTTAGAGGAGTTAGTCCGGGGGTCCCAAAATCGCATCT
TCTCATCTTTTAACAAGTTTTGGGTATTGCAGGCCTTGTGATAGGGGACC
GAGTTTTATTTAAACAGGAACTTGACTCCATTGGGCTCAGATTTTAACCA
AGGCAGAACTTAGTAAAACATGACTTCAGAGTATCTGCCGGCACCTGCCC
TCTCCTTTGGCTCAAAGAAGATGAGGGAATGACACTGATGTTGCTCTCAA
TGACTCCCAACAGTCATGATATTGGTTGAAAACTTGGTTTTAAAGATATG
GAGGACCTTAGTTCTCTCTTTAGCCTACTATTTGTCGTTCTGGATGTTGT
GGGATTGGTTGTTCCTCACTCGAATAAAGGATATTTCAGTTACCATGGGA
CTTCAAACTGTATAACAATTTTCTTCTGTATAAACCTGGGTAGCCTTCAT
TTTGTCTGTAAGGATATGTATTTCGTAGAAGTGATATTTTTTCATCCTCA
GGTTAGTCTTTATGGCCCTGGAGATTGTTGCTCGGATTACTTTGCGTTTT
TTGTAAAGAGGGTTAATCGGAGTGAGAGGAGATATCTTCATGTACCAGGC
CTACAAGGCTCTGGGAATTGTTTTTATCACTCCAGGACTTGTAGGATTAT
CTTTTGTTTGTCTCGTCTTTCTACTGTACTCTTTGGATGCCAAGGGATAT
TCTTGATGTGTCCTTCGCAGACAAATTATATAATGGTTTTCCATTGTCAA
TATTTATTTTGAAATGAAAGCTGTGCAACTGACTTAAAGCTAACACTTAA
TCTTTCAATTTAAAATTAGAAAACTAATGTTATATTTTGTGCAAGATTAA
AAGATAGGAGGACAAAATTTACGTGTAATGTAAATAAAAATATATTTATA
AGGAACATACTATAAGTATTTTTAGGTGTTTAAACTGTAGCTTTATTATA
ATTAATAAGGTTTTTATTTATGTATAACACTTTAAAGAAAAATAAATTTT
TTTATAAATTTCCTTATTTCAATCATTTTGGTAAAACTGAAGGATTAATT
TAATAGACACAGGTAATTTAAGTTATTATGGACATAAAGGTTCTTCATCA
AAAKTATAAGCTACCAAATTTAATGATTGACAATCATCTATAACAAATAA
ATTAAAAATATATATATTTATTTAATAAACAGTCACAATATATTTTTTAT
AAAGTTAAATTACTTCATGTGGGATCCTCCTTGACATCTCCTGACTAAAT
ACAAGTTCCTCCAACAAGTAAAATGCATGTCTGGAAAGTTTGCGCGATGT
TGACTTGCAAATTTGACTATTAATATTTGATTATTTTATTAGTGATATCA
TTAAATTAAGGTTGTTGAAAGGAGCGTCCGAGTTCTTAGATGCATTGATC
CAAAAATTGATTCGTATTCGTCCTATAAAAACACATAAATTGACAAAAAT
TTGGCAGTCCTTATTTTTCTCTGGGATTTAATTTAAATTCAGATTTTAAG
ACTATATATTTTGATATCTAACAGGGATAGTATATTGCACCAGGTATCCT
AAATTTAACTACTCGCTTAGGAGCAGCACCAAGAAATATTATGAATAGCT
CTAAGAATTCACTATTATTGTCCCTCGGAAATTTATTTTCGAAATGTTCG
TGGTATATCTTCATCAAGCCTAGTTATCTCTTTATCTGGCATTCTGTATT
CATTCCCAAACACTCTTGGAAAACAACCCCAATAATTAATTCTATGATAT
TGTGCTTATATACAAATGAAAATAGTTTTTTCCATGTAATTTTTCAAGCA
AAACACAAACTCCGATATTCCTACCCGTGTTTGAACTTGTGGTGGAAAAA
ACACATTCCTTTGATATAGTTAATAATCCCCATTCTTTCAAGGTTTTGAA
AACAGATTTTGCTTGTGCCCTCCCTTGAGAACAGATATCAACTTTGAAAT
AAATGTCCTAAATTTTTGAAACATTGCATGTCTTTGCCCTCGGCCTTCAA
TAACCTTTGAGGTCTTTTTTTTATAAAATTAGCTCCTAATAGATTTTCAT
TGCAATATTTTTTTTATTTCTCACAATTTTTGTATTTATTTTATAAAACT
TGTGTATACGGATATTTTTCCTCAAAAATGGTCATCCAGGTTAAGGTCAT
CAAAATTAGGACTTTTTTTTTTTTTGTTGAAATAAGTAAAAAAATGGTAT
TTGCAAAATTTTGTAGATATTAGTAGACAATTATTTGCTTTGATACGCAG
GTGAACAGACTAATAGGCAAAAAGGCTAAATTTTATTTAAATATTTTTAT
TGTTCTTTTATATGCATAAAAAATGATTTATCATTAACATTTATAAAAAA
GTTTGACATGAGCCAATGATCCCTTCAGCATGAAGTCCACAACATATAGT
ATTTTTTTCAAGATTAAATTTAGGTCTCGTGAACCAATTGTGGATTGCTG
CCTGACCAATAACAAAAAAAATTTATTAGAAATGGCATTCAGTCAAAAAT
GAGCTTCATCACTGAAGATGACATTGCGACGAACATCAGCATCAACATTG
AATGTCGTCTTTGATGGTAAATTTGGATATTTTGCAATCGTATCTCGCTC
CATTATAAAAATGTATACTAATGAATTTTCTAAATATCAAAGAAAGAATA
CAAATGTGGCATTTTTTTTTTTTTGTGTAACGGAAAAAAAATGAAGCGTC
CTTAATGAAAACCACTTTATTTTTAAACTTATTTATTTCATGTTTACCTT
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ATTTAATATGCGTAAAAATAATTGCAAAAATAAAATAAAAAAACAATAAA
AAATAATCAGGAAACTTTTGATTCCGAAATGGTTAAATATTATTATAATA
TTTTTTTTACACTAATCTCATTTTAAATATAAAAGGTTCTTCTTTCCAAG
GATTTAATTAATTTTCTCTTGCAAACAAAAATCCTATATTTGCAATACCC
TAAGTTCTACCTCGCACTCCACAAAAAATTACTACTTATACAACATTGAA
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NNNNNNNCCGCAGTTACATCACTCACTCTATTTTATTTTTTGATATTCCT
TCTGAATTCAATATTATTTTACAAATTTATTATTTATATTTATTTATCAA
TAATAGGTGAGTCGTTTTGAATTTTGAAAACGGGACAACGGGAAATTTTT
TTTTACAATTTATTTCTGTAAAATATGAGACCGAGGGAGTGGGTTTCAAA
AATTCCCCAACACATATTTATTTAAAATGTATATTTTTTGTATAACAGAT
TTCTTTTGTAAGGCTGACAGACCACATTCTCTCTATCGTAAAGACAACAT
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TCAATAATTATTCCCTCATAAAATTGAAATATGTTGGTTTCGTTTTTGAT
GCATAAAGATGAAAATAATACAATAACTTGCAGATAATGCAAYAAATTAC
ATTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAACCATGAACAATTTTATTATGAAAG
GTTTAAAATTATAGTCAATTATGATATGTTTGTTTTGGTTTTTGATGCCT
AATATTTAAAATAAAATAATTAACATACCTTCTTAGTAAGAACGAAGCTT
GAACCATTTCATTATTATAGGTTTAAAGTACTAGTCCAGTTTCCCCAGGA
ATAAAAATTTCTGGTCATTATTATTAATGATGTGGAAAATATATATAAAT
ATAGTTTCAACTGAAGTAAGGAACCTCCAAAATATGTCTAGTTGTCCTGA
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TTGTATTCAAATCAAGGATCTGTCGTTGTATGTAGATTTTTACCATTTTA
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ATATCTCCGTGAATATAAAACTTAATTTGAACTTTTGTGCTTCGAACAAT
GCTCATGATGATCTAAATCATAGTTTTTCAAAACTTTTTTCAGGCTTGGC
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TAGATCTCCACAATCGGTAATTATAAGTATATTAATTTGATTGAAATAGG
TCAGATCCAATTTTTTTTGTTGGCAAAAATCTCGATACGATATGGTGAAC
TTTGGGCTTTGCTCAATGTAGTTTTTGGGTACATTGTATAAGTTTGCCCA
CACTTTCTCTTTCTTTCTCAAAATGGGAGACAGCAACAGCAACTAGTCTA
AAATCATAGATGGCAACCTTTTAATAATAATGAAACAACCTTGAAACAAA
TTATTATTTAGATAAGGAGGAGAGGGATATCCACTCCATCGATCATAAAT
GTTTGAAGAAGTTCCCACGTAGTATTAGAGTATCATTACAGTTTCTACTA
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GGATTTGATGACATAGAATTTCCTCTTCATAATGCCAATTACATGCACCC
TGTAATTATATTGAAATGGTAGTTACGAAGAAAAGTTGTAGCGCTTTACT
TAATTAGATGTGATCTCCTGCACATATAACCTCCTCCACATAATGTGACT
TTCCATTTCCTTTCATGATGATTCAAAGTACTAATTGTCCGAATATCTCG
AAAATGTCGCGATATCTCTCCTCCTAATCCAATAATATATGCTTTGCTTT
GTGTAGTTATTTCCTTATTAGTAAAAGGTTACAATAATTGAATTTCAACT
ATTCATTGCCGTTGTCTCCAATTTCGAGATAGAAAGAGAAGGTATGACGT
GCAGGCAACTTATAATATGTACCAGTCGTTCTGAATTACAAATAATTCTT
GATCTTTCGCTCTTGTTGCCTCACTTCTAAGAATGGATTATCTACCCAGT
CTGGTATTATTAACTATAAAATATCATGATATCATTCAGATGCAATGGCA
TACTTGATTTTTTAGATCATCACAAGGCCCAGTTTTAGAGTCGAAAAAAG
AATCAAAAAATTCCCGGAAGTTTCCTTTGATAGCCATGTAACTTCTGATG
AAGATGAATAAACGTTAAACATATTCATCATTATCAATGCCAAGCTGTGG
AAACAGTCTGGAATTAAGAGAATGTGCCTGGATCTAATTAATTGCTTTGA
TAATAGTATTAGTTGATTTGTAAAATAGACCAGTAAGATTTTTATGCTGC
CAGATACTGCCTGCGGATTGCACAAAGCACTGCAAGTACACCAGGTACGG
CTTTTCAAAAGCAACGATGCCGAAGTATAATGGATGGMGCACCATCTATT
TRACTGCAAGAATGTTGGTAAGTGGGTTATTTTTTTCTTGAGAAAAATTA
TCAATGATATCAAATACCAACTCTCCTTCAGTATTTATTATACGACTCCT
TACACATACATACATTTTCTTTAACCAACTTTTCATCTTTGACAAAAATA
AACATAAGCTAAAAACAAATATTCATTACCTAATTAAATGGACTCATATA
AGTGAAAACTAATTTATGTTGCAGTAAGAATGCTGCAAAATTTATCTTCT
ATGTTTTCAGACATTTAATATATTTTTTCTTGAACTGAGTTATTAGTGAG
AAATATAAACTTCATAGTTTGGGCTGGTGACTTATGTGCATCTGTGTGCA
TAATCTTTCTTACTGCCAAATTGTGTAAGTCTCACCAGATATAGGCAACA
GCAAATATATGTAAATGGAAACACGAACCGTTAGTTGATAGTTGTGAACT
GATTAAAACCATATTTACAAAAAAATTTTTGTTCCTTGAACTTTTCTTGA
AGAACCAAAACAAATAGGTTTAATGACTCTCAAGGACTTTTGGTTAAAAT
AGTTTCTTTAATTACTCTCACTTTTCGCCTCCTTGAGAGATATCATACGC
CTATCGCTTACCGACTTCAATTCTTTGATACAAGTCGATATACCCTGTTT
CGTAGAAAAATCAAATTTTGTTATTGGTTTACCAAGGACGCAGACAAATA
TTAGACTGAAAAATTTAAAGGGGATCAATTTATATGTTTGCTAATTTTCT
CCAAAGAAAAAACTATGATACATAGATACATGTTTTGTTTTTTCAAAAAA
AGTAATTAAACTCCTTATTTTATCATTTGGAAATTTGAAATCTTTATTTT
TAATAGGAAAAGAAAAAAAAATAGCTTTTGAGCAGATCTGTTACATTATA
ATAGATAATTGGGTATCACTACCTCTTAACTGACTTCTTGGCTTGTTTAA
TGTTCTCACACTACTATTATAAAGCAAGGTATTGAGCATGTTTTTTTCCC
TTCTGAATTGCCATTTCAGCATTTTCACGTCATTTCGTGGACATTACTTG
TATTTTATTAAGTGGACTGCTGAATTTATAAAAAAATATGATAGCTTGTA
CAAATAGTTATTACCAGTGTCTTTAAGTAGAAGGTTATGACCATCACATG
CACCGTCTAGTAAAAAAAATGATAAACCTATTCCATAAAACTCTTAATAT
ATTTAAATATAAAGCATATAGTATCTGTTGCAATTCTTTGGATGACAAAT
GCCTTCTTCCCTATAGTGTCCAAAACTCTACATATGCAAGTATTTTTTTT
TGCTTTTCCTTTTTAAGACATATACACGTAAACAAGCCTTACTTTGGAGA
TATCCTTTTGGAAAGCAAAAAATGATTTTTTTGTACTGAAATAATCCCTA
TTTATGTAGCCAAACACAGACCAAGATAATTACTCTTTATACAAATAAAC
TGATCTCAAGAAGCCTCTGCTTATTGTTTTGGGCTTGACATTTTTGTTCC
TTTGAAATTATTCCCTTCTTACCTACTGATTGACGACACTTTCTTTCCTA
AAGGCATTTTATAGTATGTTTAGTCCTCATCCAACAACAACATATATAAG
TTTTTATTGCTAAAAATAAGTGATTACTCTCTTTAAAATTATTTTATTTT
TTAGCTACCTTCATTGCTAAAGAAAGCTTTTTAA back to top
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