EMLSAT00000010918, EMLSAT00000010918-706765 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010918
Unique NameEMLSAT00000010918-706765
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s72supercontigLSalAtl2s72:652018..675950 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010918 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010918EMLSAG00000010918-693684Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000048802EMLSAE00000048802-757730Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048803EMLSAE00000048803-757731Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048804EMLSAE00000048804-757732Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048805EMLSAE00000048805-757733Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048806EMLSAE00000048806-757734Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048807EMLSAE00000048807-757735Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048808EMLSAE00000048808-757736Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048809EMLSAE00000048809-757737Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779147auto779147Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010918EMLSAP00000010918Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010918

>EMLSAP00000010918 ID=EMLSAP00000010918|Name=EMLSAP00000010918|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=474bp
MVSRRKILSRSRDDLNLEDGYYLEEEDLWYQKEKLYRDHVQEVLDKWGSI
DDEIWAKVIVLERNRRVAKAYARAPVLTISGSEDGFDGFRIGVNGFANPM
RDPKTEEFKAQIGAGCKIKMDETGNIMVKRFAKSPVFVKNTIEENAVSND
VLKLPDGQLEFEKPVKLFDMKKFQQNVNRELKRTVPDRKKLECQCVAAIA
FVKNEPELLDSPIWIMLINVVALEMLRAKMPPGPSRASSNDTILNSSNDN
NNKNSDPRKRFPASGSSDEDPYSLTPSGSSGSSGKGNRSREELAXRIPPG
EKEFYGPQNWAKHHIRQIPDYSDDMEDENXLTKKRXPRLKNARHKSTDSE
RTGRKPIEQSNLDDPYYCGLRARVPAYVQQSVKKDKQSKTNNSNSNNNCL
GVRSPVPSRSTPNLQNLAQLPGAHPFWWHSRLYPENELSSYHYPGRMRNQ
GYRNSMPPPISALAPAHKFRNNWD
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mRNA from alignment at LSalAtl2s72:652018..675950+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010918-706765 ID=EMLSAT00000010918-706765|Name=EMLSAT00000010918|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23933bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s72:652018..675950+ (Lepeophtheirus salmonis)
TCCCCACCCCGTACCTATTTTGGTATCAACTACTTACAAGTCTAAGCTCC CATTATACATAAAGTTTTAGGTAAGAAATTATCAATCTCATATATTTATA GTCATATAACTTATATGCACCTTTTCTCCTGCTTGGCTAGTTGCTAGCTT GCTTGGTACAAAAATAAAGTATGACTCTTTAACCATCAGGTAAAAAAATA TATAGACAGTTCTTCAAAAAATAAAACCCGTTTTTATATTCCATTAAAAA CAACTTTTTTTGTGTTCAATTCTTCTTTTGAACTTGTTGTCAGGTTGTTG TATAATATTGTATATATACTTATACTAGGTAAAAAATTGCATTGGTCTGT CTTGAAGGGCTATATATATATATACTTTTATATTGTTTTTCCTTTATAAG TCCTTCAATTTGAAATTGTAAATATCCATAAGATGACTACTAAAAACACA TATAACAAAAATCCTTCAATCTTGTAAATTATTTTATATTACTATTATTA TCAAACCGTTACCTCCTGTTATCAATAATAATTTCACAAGGATATTGAAA CTATAAATGAATTTATGAAGAAACGAACATATTTCTCACAAAAAAAAACC ACAATTTTTTTAGATATTTTTATTTTTTGCCAAGACGTTGTTCTCCTTTC TTTTTCGAATCATTAACATTGTGTATGTTCATTGTACAAAAAAATGAATA AACATATGTTTATCCAAATAGGTAGTTATATTACATATAGATATAAAAAT GTTACAGTAGAATGGTCCGAATTAATTATAGTATTTCATATTTTTCCTTT CTTTTCTTTTTCTTCCACTTTATGTAAATGAGAGGTTTGTCATTGAAGCA GTGTTTCTCAAACTTCTTGACATGTATCCCCCCCTTTTTGATAACGTTTA AGTATCCGTAATCAAGTATACCTGTTGGCCTGAAGTTGTTGTATGTGGCA AGATCCACAGTTTGAGAAGTCCTGGATTGGGGGATGAGTTGATGAATGTA TTATTGATATGGTTCTCAAGATCTGTCTTAGTATGAAGACCAATATTTTT TGAGAGAGTTCATCTCCACCACTAAAAGTAATAGTATTGGATTTGCCCCT ATAGTAATATCTCTTAATGTTTTATTAACTTTTCAAAGTCATGGTCTGGA TTTGGTCTAGAATCTGTAATAATATATTTAGTCTAGTCTCGTTGTCTTTA ATCAGACTAATACAATTTTTTAGATTATAATTATAATTTTCTTACAAAAA GATTTTTTTTTTTTTCTTGGGCACGATCACTAAAAGTCTTGGTATCCTTT TCATAAGAAGTATTGGTCTCGACTTTATGATTATATCTTGATTCCTTGTC ACCACATGTACCAAAGTAACTAGATTAAAAGTGTATTTTTAAACCAAAAA AGGTCAATATTGTTTTTTGGACTCGATCCCTTAATATCTTGGTTTTGAAT TGATCTCATTCCATCAAAGTCTATGTATCGGCCATAATACAATGATTTCA TTGTCTTAACCCATGCTGTAGCTTGTAATTCCCAACCTTTTCATCACTCT GAAACTCAATAATCTTGCACCATTTAAAATATACTCATTGAAATGATTTA TTTATCATATATATAATCTTTCGTGAATACGTTAATGGGACACTGTGTAG CAGAGAGACTCAGAGGATCCCCAGTAGGGGAAAATACTGACTCAATTTAA TGGATTTTACACGGGATAGTTCCTTTTTTATTTCTACTTGTTTGCGGCAG GSAGACGGGGYAGCACGAAATGGAATAATGGATTATTTTAAAGATAAAGA CTTCCTTGAGGATTTATCGATTTACTGATCCAAGATCAATCGCCCGTTGA GTTCGTCATGATTATTCTCTGGCAGCAGATTAACGATGATTTATGACTCC TCCCCTCTCCAAAAATTCAAATATTGACAGCTGATATGCTGTCTCTGAGG AAGGGGAGTTACGTTATTTGTTTTAATATTACTTCAGGTGGGGTCATTTA AAAAAATTATTTATTTGAATTTGTTTCCCCAAGAAATTAAAATGGATAGA AAAAATATATCATCCGTTAAGGGGCTACAATTATTTCCTTAAAAAATTAA TCTTTGTCTTCTGGACTGAATCTCTATAATATATATCGTAGTTGTCTTAA ACAAAACAAAAGTGACCAAATATCTACATACATTAGTCATTTTTTAAGTA TATACGAGTACATATTATATTCGTCTATATTCCAGCATGGACCACCTAGA TAATGTTGTTCTTGATGGTGATGAATAGAAAAGGTAGAATGTTTTTTTAA TTTTTTTCTAACATATTCTAAATATATATTCCCCTGCATTGTATATAATA GTCTATTTCCGTGTTGTACAGATTTAAATTGAGGATATGTATGTGCAGTC AAGATGGAAGGAAAGGAAGAAATATTAAACTATTTTTTACATTTATATAT ATATATATCTTGTTTAAAGATGCATATAATCTATATAAATTATTAACGAA ACAAAAAATGACCATCTGCTTTGAACTTTCTCCAATTTCTTCCTTTTATA AAAAATAATAATAATATATATAAATGTGATTTTTCACATATTAAATAGTT ATATAACTATGTACTAGGTAAATATATTTGATTTCCCTTCATTCACTAAT TAATTATTAAATTACCTTGTAGAACGTTACATGATGTTGTTTTTAGTTGT TACGTACATATGTAGGTGGCCTCACTTATGAAACTCAGACTATTTTTTTT CTCCTTGTTCAAGGATTCATGTGTGTTCATAAGGAAATCATAAATTTAAT GTTGGCAAAATATCGACGTCCTTAAAAGAACCTTCTTTTTAAGGAAAGAA AATTATACACATATGTAGTGCTTCTATAGGTAATGCTTAACGGATTGTAG GTATACAATCATACTCAGCATATATATATTATCTTGAAGGTGTTTTCTCC CTTCTCATTACAGCCCCAACTTCATGGTGAAGGTTGTTGTCGCTTTGTCG GATGATGATTGATATAATAAAAGAGATCTTCAAATTCTATGTTATTAATT TTTATCCCTTCGTAGTTTTTGAATAAAATATTCGTCCGTGATTTTTATAT TCCTTTTTTTATTATATTTCAGCAGTTTTTTTGACGAGACCCTGGTCCCT GTCGCCATGGTGTCTCGCCGAAAGATCCTATCCCGCTCTCGAGACGACCT CAATCTAGAAGATGGATATTATCTTGAAGAAGAGGATCTTTGGTATCAGA AGGAAAAATTGTACAGGGTAAGTGAATAAATCCTTTTTTTTCACTATTTA CAATATTTTATGGTTTTGATCGCTTGCGAAACTTTCTAAGTTTGGCGGGA AAAAGGTGGATCTTTAAGTAGGTAATAAAGACTCTCCACATCTGACATAA TTGACAAATATACAATGACGTATTTGGAATTATGTCTAGTAAATATTTAG TTGGGATGTATTGAGCTGTATGCAGTAAGAGATTAGCTAAAATGTTTATA CTACATTTTACCTGATATATGCCAGCATTGATAAGGAGACTATTATTTGT AATTTTAATTCCATATATTATACATTAAATTGCTAGCATTTCGTATTCAA ACTTGGAAGTATATATTGATAAACTACTTTTCATTAGCTAAGGTTATTAT AGTTAGCTATATGCTAGAGATGAGTGTTGAAATATTTATAAGGTAAGGAA GATTTTTATTAAGTTTACGCTATACCTTAATTTTTTTTTTTTTGTATGTT ACTGATTTTGCGTATTGAAATTTTTTTGCTATGTCTAAAAAAATCTTAGA 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TGTAGCTTAAGTTCCCTCCTTTTGCTGTATAGGTGTGTTTATTTTTTTGT TTTTGGTTTTCATAGTGTATACAACAGTTGAAAAATTATAATTAAACTAA AATTATTTGTATACAAATATTCTACTTTTCTCGTCCCATATCAGTCAAAA ACAAATTTTTACAAATTGACCAATTTTCTATGGATATTATTTTGATTTGA TTTGAATATCAGTCTAATTAATTTTGTTTGTTCTTAAAGCATTTTATTAA AGTTAATAAAGTCAGGATAATTTGTAAGTTTGTAAATATATTTTATGAAG TTATAATCTCAAAAATGAGCCCCCAAGATGAAATTGTCTTTAATCATGAT GCAAACAATGACTTTTTTGAAAATGGATTTTAGTTATTCAATCAAATTCT GTGGACTTTTTTATTTAGTTTAAATAAATAACTATTAATTCAATTTTTTT TTTATTTTACTTCGTAAATGCACTACTGCTAAAATGTAAACAATAACACA AAAGACTTATTCATTGCCAATAATGGAGTACGCCTTTAGAGGTATATAAA ATCATAATATGTTGATATATCTTGGATATAACATGTATCTATGTGCAAAG ATTGGCAATTTAATTTTATAGTTGATGTATGACGTAATTATTCAGATACG AGGAGCCCGTTGTTTTTTGTAGTGCTCTGGAACTGTGTTTTAATAAAAAA AAAAATGAATAAAAAACTACCTAAATSAATCTAATATCAATTCATAATCA TTATTATTTATTGTTCTTTTTTTATTATTTTTATATCATCATATTAATTC TCTTAAAATAAGTAATAATTACTAAGGGATGTAATTACAAGCATTTATCA TATTATAATTATTCTTACATAATTCATCCTTGCTAATTAATCAAAATAAC CACTTAAAACAAAATGGGTTCATATATGGTTGTTATGTTATATCATATTT AGGTATTATTTNCTTTTCTTATTTGGGAAGAAGTTCTTCTTCGTAGCCAA TCAGAGTTCGTTTCATTGGCATTAGATCTTTTTTTTCTTTATTCATGACC TTTAACATTTGATTGTTACATGCATGTACTATGTGTGTGTAAAGTATCTT CCACAAGTTAGTTAGTTACTAAGAACAACAATACATAAAATATTCTTCTC ATGTTATAATGTAAGCAAAATTATATTTTCCCCCTAAAACACATTTAAAG TTTTTGTAGTTTCTAATCTGAACAATGTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTCT TAAGCTATTATCATTATTATTTCAATCTTGAGGAGAGAACATCTAACTAT CAAGTTCGTATGAAGATGGAAAGTAACACTGCCATTTTCTATTTTTTAAC AGTTCATATGATTTACAACTCTATTAATGGATTTAATTAGTGCAAAGCAA TAAGGGACTCATGATTCAGAATTGAGGTGCATGTCGGTTTTATTACACTG CAATCTCAGGGCTCGAAGCTTAAAAAACCCCAAACTTCAAAAAGATTCGA AGCTCGAGAGACTCAAAAAATCTTTAATATATTTCACATTACTATAATTA TTTTAGTGCTATCTATATTTTTATTTCCTTGAATTTAAAAATTATTGATG TCAACGTGGTGTTACCTAACTAACTTGCATATGTACACTATATTTTACTG CCAGCTGATCCTTTTTTGTTTCTTTTACATTTATCAGTACCCGTTACTTG GCTGAATTCGAATTAGCAATTGTTAAGATGCTGTGAACAATTCCTAAAAG ATAGAAAATCAAGTTAATGAACAATGCGTCAAATAAATCAAAGCTGGGGA TTCGTATTCGAGTTGCTTTTAAGTCTCATTCAACTAAAACTCCAGACTCG ATTTTGATTAAAAGATAAAAACATCATATTTTAATAAGATTGGAGGAGAC TTGAGTTTCAAAAACATCCTCCTTTATTTCTAACTATTATAATTATTTAA GCCCCATCTATGTTATNNNNNNNTTTAACACTTATTAAGACTGAATTAGA ATTGGGGACTCTTATTGACAACTTTAATTTCAGCTCAAATTCTCAAAACT GAGACTCTTTGCAGCGTTTTTGAAAGTCGAGAAGGGGTAATAAATGAAAG TTTATAAAAACCATTGTTTTCTACAAAAGTTATGATATTTGGGAATTCTC TAATTGTCTCTTTAGCTCCCCTGTTGCCTGTTCCCCGAAACTTGAATGAT ACTTATTAAAAATAACTCGTCTGAGTAGACTTAAAATTTTCAATTAATGT GCAATAATTTTTTTAATGAATAAAGAATTTGAAGTCATTATGTAATTAAT GAAAAATTAAAATGCCAATCTATAATTATATAAATATATTATATAGAAAA AAGTAATTATGCGTATCTATTCATTGACATTGGAATTTTTTGCGTTTCAA ACCTTTTAATTGTAGAACAATAGCATCATAAATCTCACATGGATATGTAA ATACAGGATTGTGAGCCACCGATTAATCCTATATCCTTCAAAATTAGTTA GTTGGTGAATATTATATTATGTTGGCAGACTAGGAGATTCAGTGGAAAAT TAATGGCAATAATGCTTTTCGTTCATTTTTGAGCTTTTGAACGGGAAAGA ATCTTTGAATTGGTTCATTTTTTGACTAATTTTTCTTTAAATTTGCTTGA CTACATAAATAACTTTTTGCCACCAGGGGTATTGAGAGTATATTGAATTA CTCTATAACTTACTACGTCATCTAAATTATCTTGCACGGTGTAACCTCAT TAACATCAAATTTACACTTTATTTAGTAATTAGCTGTCGATATTTTTCAA TCGTTCTTTTCCCCAAGTCTGTATTGTGGATTTTGTTGGTTGAATATGAA 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TTAGTTTCTTAAGAGAAGGTATACATTAGATGAGAAAAAGGTCAAATATC AGTAAGCGTAAAAATACCACCTTAGATAATATAATTTAGTGTTGTGTGGG TCTTTATTTATGTAGTCCAGTTCCATCCGGTACAAGGTCAGATCTTATAG GTCTTTGAAACGCTTCTTAAGTTATCTGTCCTCAGGTCAAACAACCTTAC TTTATAAGTTCTTAGAACTTAAATGTAAGACAAAGCTGGAACGGACCTAG ACTGAACTTATAGGGACTACAGTCTTCAGTCCTAAATAAGGACTAACACA GCAATAATATCAACTGACAGACATCACTATATTCTTTTTGAGGATTTGAA TTTTCAAAATAGGGAGAAATCACAAATGTAATGACACATATTTTACACAA TACTTACATCCTATTGTAGAGAAATAAATTCATTAAGAAGGCAAAAAGAT ATCGATTGGCAGTTCGGCATATTAACCATGTTGTAGATTAAAATCTTCAG TCTGAAGTAATGATTGTTTGTATTTTTTTAATTATGTACGAGTATATTGG GATAAATTAATTTGACTTACTAACTCCATCTAAGAACGAACGAACCTCCT ATTTCAAGGTATTACTTTATTTATAGGTATAAAGGTCTATTATAATTTCA ACCTCAGCTACACAATAGAAGTAAATTGGCTAACATTTATTTCTGCTATA CAAATTAATAGAAGAAAGGTTTCGGGATTACATTTATTTTATGTTTTTTT TTAAGCATACATTTTAAATATTCCTTAGAAAGTAGACAATTCCTAATAAA TACCATTATATATTTTTATTATTCTGTATGAAATTCGATTAAAGAAATAT AAAAAGTTAAAAAAAATTCTTTCTATTTTGTTTGTTGGAAAGTTTTWTGC WTTTYKAGAAAAAAATAAAATTATTTTTTGCTAAAATGCATATACCTATT 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