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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s73 | supercontig | LSalAtl2s73:772248..780443 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011003 >EMLSAP00000011003 ID=EMLSAP00000011003|Name=EMLSAP00000011003|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=116bp
MMLNLMRQTLSSTPKWASALNPTRSLSSTAETHTGQQWDESDFRNFRFLN
TEKEINEKFAIDLVSKVPPIEVTERIVACDGGGGPLGHPRVFINLDDGEP
SACIYCQLRYVLKSSH back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s73:772248..780443+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011003-706850 ID=EMLSAT00000011003-706850|Name=EMLSAT00000011003|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8196bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s73:772248..780443+ (Lepeophtheirus salmonis)
GCCGTCTCGGACAGATATATCTGCCGAACAAATGAGCTGTACTATTGGAA
ATATTGGTCCATTGGATTATTTGCCTCAAATATTATACATGAATATCATC
AGAATATAAGCTAACTTCATTGCAGGTTTAAGGCCACTAGAAAAATAGCC
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TGGCTACGTACGTGATCTGAAGCTGAATTGAAAGAAAATAAAGTAAACTG
CTAGGAATCAGCTGTTGTGTTTCTTCTTCTCTCCCAAGGCAAATAAATGT
TAGATAGCGTAAATACTAAATACTAATTATTAATTTTTTTATTAATACAA
ATTCTGTAGGAAATTGGTTGACATTTCCACTGTGCTATGATGTTAAACCT
CATGAGACAAACTCTCAGCTCGACTCCAAAGTGGGCTTCAGCTCTGAATC
CTACTAGATCCCTTTCATCCACAGCTGTAAGTTGGACTTCATTTTGTTTA
AAAAAATGTTCCTTTTTGTTCAAGAGGGAAATTAAATTATAATTCGTGAA
TGGATGGAAACACAAATTATTTCATATTTAAAGTAAATGATGAGTCATTC
AAGGCTAATCTCTAGATGTATACGATATTAAATTTGATGAGAGATGGAAC
ATCTCATGGGCAATCGATATTGCATTGTTCATATGAGCCCAGGCTAATTT
TATTTTAAAAAGTCAGAAAACGAATGCAATGATTTATTTGTTAACGTTGC
TTTGTTCTATTCTTACTCATTCTATTTATACATAATTTCTGATTCTTGAA
TGATGTATGTATTTGTAATTTCTAAAGAAATTGTACGAAATTTTTTTATT
CATAAATGTATTCCTACCTAGATATAAATAATTAATGTATTTTATTATCT
CATCATTCAATCCATTATGTATAATAGAATGCTTCATAGCAAGACATACA
TAAACATTTAATTACTTTTGAGTTTTGACACAAACTAACTTTGTATTATA
AACATTTCATCTTAATGATGTAGTATCCTAAATCAACTTTTTCCAAATGC
AAAGCTTGGATTGGACATAAGACATGCAATTATCTGTGTTATGTTTAAAA
AACTATAACATAGATTCGTTCACAATAAATGATATTAAGGACTGTAGATT
TGGAGCAAAAGTGTAACTAATGTAATATATTGTTTTGACATATCAACATC
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CTACGAGTGGGACGTAATATATTAATTGAAGGGAAACGAAACGATAATAG
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AAGGGATATATGTTGCCCGTCTACAAATAAGCAACCCAGAATTATTTTTT
CTCAAAATTGAGCTTGGATTACTTTTGTAGGTTATTAAACAAATTATCGT
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TTACACTTAAAGTAAGAAAAATTCAGCATCTCAATGAAATTATATACAAT
TAGAAAGATTTTATGCATTTAAATGAGTCATATCGAGACAACTATTTAGG
GGCGTCCGTAGGAGAAAATTTTTTAGGGAGGGGGGGTTTGGTTTTGTAAT
TTTTTTGAAAAAATTTCAAAAATTCAATGTCAAATATTAAATTTTTTGAA
AAAAAATATCGAAAATCTACAGCTTATTTTGGAAAATTTTTGGAGAAAAA
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GGGGGTCTACAGCCCCTCCAGACCACTCCCTGAGGACGCCCCTGTTATTA
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TGTTTGTTTGTTTGGAGGATTCCTAATAGACATAAATATTGAAACTCATA
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ATGTTAGTCTATAGGATTTTGTACAAACTTGGTATTAAGGTTATATATGG
TCACAGTAAGAGGTCATTAAATTTTGAGAGTAAACAAAACGTAAAAAATG
CATAATTGACCATAACATTGCTACAATTTGATTTTAAGTAGAGGTTTTGC
ACTTTACTGGATGTACACTCTTGTTATATTTGAAATGATTTTGTAATAAT
TTCCTAATTTCGGTCAACCTTATTCTTGACCATTCTCTTTTATGAGAAGA
TTTTAATTTTTTTAAGTAATAGGTTCTAACCGTGCGCCTCGGCTTTCCGA
AGTTAGTTTTGTTTTTTAATATATTAATTAAAAGCTCTTATAAAACAAAT
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AATTTCTATTCTACCTATTTATTTTACCATATGTTTAACAGATGGAATAT
CGACTTAAGGTTATTTTGATAAAAAAAAATTGTTTACACCTATGACTCAG
GCCTATTTGTAATTTTCCCTACCAAATTATTTAACTATTACGTAAAACTT
TTATTTGTCATAAATTTTGTTAATAGTTATTTATTTGATTTGATAAAACA
TAGCTTTCGATACTACATACATATTTATAAATATATTTTCAAGTACAGGA
GAACCTTGATTGTCGGGTGTCTTTTTATACAAATGTTTTGCAAAGCGAGA
AAACATTTTTGGTATTTCACGGGCAAATTGTATAAGTTTGTCCACTGGTC
ATAGTTTATCTTTCTCTCTCAAAATTGGATACAGTGAAGGCGGATAGTTG
AAATGCAATTATTGCCACGTTTTATAACAAGGAAATAAATCGCTAAGTGC
AACGAAGCGACGCATCGCAAAACGAAGAATATATTATTGGAATAAGAAGA
AAGGGAACTCGACTCTATCGATCACAATTGCTCGAATAAGATTATGTACT
TGAGATGTGATCACCTTTGGCCTCGGATCGACTAAAAGTTCCTCTCCTTA
CAAACTTACAACCTCCTCCATTTAATGAGACCTTCCAATTTTCATGATCC
TCCAATGTGTTAATTTTATATATATATACAACAAAGTCGAGATCCCCCTC
CTCCTACTCCAATAATATATTCTTCCCTAAACGAAGTTGTTTCCTTATTA
TTTAAAGGTTGTAATAACTGAATTTAAACTATCGGCTGMCTCTGATTTCG
AGATAGAAAGAGAAAATAGGACTGCGGACAAACTTATACTATGTACCCCA
TATTAAATTAAATTGTGCTAATAAAAGCCTAGGATGTTGATCCACTTTGG
TTCTTGGTAGACCATGTAATGTGTATCCTCATCCAAGGCTCAGTTATTAG
TAGAACAATTTTATTAAATTTTGTATCATTGGAAAAAACAGATTCTGCCA
TTTAAAAAAAGGATATATATCATTTTGTCATCTTTTTTACATGAAGTGAT
TGCCTTCTACGCCGGGAGTTCAGTCCAATCGATCCTTGACTTTTCCGCAG
GGGGATGCTTAGGTCTGTCACGATAACACATTTTTGTGTGCAATTAATTT
TACAATAAATTATTGCGATAATCGATAATATTGCCGTTTTGACACAATTT
TCAACTTGTTAAAATTTAATAATGCAAGTACACCCTTTCGAGGATCAATA
AACTTTTACTTTTAAAGAAACCTGGAACTGGATATCTGGAAGACATTTAA
AATATCCAGAATTAATGAACAAAACATCCAAAAAAAAATAAGAAAAATTA
TTTTAACCAAAAATGCTCTTGAATAAAACCAAACACAACCAAAAACAATA
AATACAATTTAAACACTAAATAAAAAAGATGTAAACCAGATTGCACTTCA
ACAAATAATAAGCATTAGGCTCAGACATACAGGCAAAACTGCCAATTAGT
ACCTTTGTGTAAAAAAAAGTGCAAACCAATAACAAAAAATATGACTGAAA
GCGGATACTTCAACAGGTCATATGCAAATCTATAGCTTCTTTTCTTGCAG
ATTCCGGGCAAGAAATACCAACACCGGATTAAAAACTTTGGATATCCAGT
TACTTTGAAGCGTGCAGATGAAATTTATTGCAGCCGGCAAAAAAATATCG
CTCATTTTTATTTATTGCGCAATTAATCGATTTATTGCATATCGCGAAAA
TGCCTTTGGATGTTACTGACTGAAATTTGTCGAAAAGACAACGGGTTTTA
TTTTGTCAAAAAAATGAATAAATTTATGTTGTCAAATTTTGTATTTATTT
TTTGTCACAAATTGGAATTGAAAATATTCACAGTCCTAAAATGTATCTTT
TCGATTCTNGTCAATATTGTCAAAAAGCTTAACACAGTTTTAAAAAATCC
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TCCCATCACTCCTCATGACACACATATTATGCATAATGATTGCTGGAGAG
GACAACCCCTTCATGTAATAAAAAAAGTTGAAAAAAATTATCAAATTATT
AAAAAATATACAATTTTATTATAGGCGGTGGKAATCTGTTCTTTCTAATA
AAACTCAATTTACGTAACTACACAAATCAATGAAAGTAAATTGTATATAA
AAATAGAATGAATACTCGGCAGAGCGCATACTTCGCCCTAACATCATTTT
TATTATGAGTTATACATCAGAATTTGTTTCAAAGTTATGGTCAATTATGT
GTTTTTAGCGTTTTGTGTTATCTATATTTCTCAACATTTCATGGCCTCAT
ACTGTTAACATATACACTACAAAGTTTTACCAAAATCGGTTTCTAACTTT
TTCCGTAATCCTGCTTTCGAACAGACACGACAAATTAACGGAGGCGATTA
CATCAACTTCGTTGATGAAGGTAATAAAACTGAATAGGATTTTTAGATGA
ATATTTTAGTTCTGGAAAAAGATAAACTATTGATTTGGAATACGAGAAAG
CTTCTGGAATTGATTAAACCAGAGTTGGACTTAGTCACTCCTAGTGTTGT
GTCGGTCCTTATTTATTTGGTCCAGTCCAGTCTTAGGTAAGGTTCTATCG
GTCCTTGGAATTTTTCAGAAAAATATCAATGGTTTATTAAGCCAAATAAG
ATATATTAAATATGTATTAAGATTATTGCACATATCTTGCAATTAAATTT
TTCTTCATTATTATCCTAATACGATATAATATGAACATATTATGTTGCTA
CTTAATTATATAATGGAATAATTTAAAAAAAAAAACGAAAACACCCTCAT
CGACGTCAAGAGGGATCAATTTTACCTTCTTTAAAGACCGCCAAGTAGGA
CTGGACTGAATGGGACCGAACTGGACTATACCCCGATCCTCGGTCCTAAA
TATGAACACAACATATGTTGGAGTGACTTACTCCAACCTATCTGTTTGCA
GTTTACCCTGCACGTTCATTAATTGAAAGAAAAAAAATGAAATTTTTACT
TTCTAAAAAGTGGGGCATTGAAGAAAAAAAAAATATATGCTGTGTACAAA
TTGCTATGTCTAAACAAGTTGCAACTTGTCTAACCAAATGTACAATTTAC
AATTTTTTTCTCTTGAAATGTATTATTTAATTTCAACATTGGTCATTTTA
ATTAGCAACTTTACATTAATACTATCATTTCATTTTGATCTATTCACATT
CCATGGTTATTATGTATTTATGAATAACATAACTGTGGGCATTTGAACTT
TATAATGTACCACAGAATACTTATATTTAGTCATTTGTAGACAAAAATTA
CACCATTAATATAGCAATCATTAATGGAATATTCAATTATTGCCCCAAGT
ACTATAAATCCTTCATTTAAAATCATTCTTCTCATTTTTTTGTTGCGACC
TGTAGAATTTGCTTATAAAAGTTCAAACTTGTATAGAGAATGTATATACA
AGGCCCTGCATTTTATTTTCTATAAAAATATACTTACAAATTATATTCAA
ATTTTTGAAAAAAAAGCCGTACATTTATCTTTTCCTCAGGCCCGTCCTGA
ACTATTATGAGTATACCTACCCAGATTTCGGCCATGTCCAATCTGTTTCG
CGTAGGAAGATCAGCCTCAGATTAAACTCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNCAACACAAAACCTTTTATATAATATGTACATCTG
TTCCTGTTTGTGACTATTTTTATAAAACATGTATTATCAATTATTGCGTA
GTTTCTATTACCTTTTTGTTTGTACTTTGAGTGTTCTTTTGGAGTACAAG
ATATGCTATCATGTCATCATTATTTATTCTTGAGACATTTTTTTTTTTTA
TCTACGTCTCCAATGAAGATGATATTATTCTTAATTCGACATAATATTTA
AACGTAATAGTACTTTGTATGCGTTAACCGTCACTTGTTGACCTTGGAAT
ATAATTATTAATGATTGTTTCTGTTTGACGAACTTATTTGTAACTTATTA
ATCTTTAATTACTCATGGCTATTAATCAAATCATATAGCTACTATTGATT
GTGATGGATCATTTTTTGTAAAAAAAAATAATTTCAATAAGTTTGATATG
AAATATATATGCAGGTAAAGTTGAATTGATTTTCATTTATGTTAAGTAAA
TACTAGGTGCCCTGTATTCATTTTACACAAGATGTAGGTGACATAAAAGT
CCTTAGTTATTGTCGTTTTGAAAAAAATCATGAGTCATTGTACATTCCTT
GCTCTTTGTCTCTTATATAGAGAAAATTGGCTCATCGTTACAAAAACAGG
CTGAAATACTTGTGCTCTTAAGTGAGTCAGGAATACAGACGTATTCTCAA
TCAAATTATCTTATATTTCTATAAATACATTATTTTGATCAATCCTATGG
AGGTGCTGCAAATTGGTAGAAAACATTCTCTGAACAGTTATACAAATAGA
ATGAGATCTATTCTATTTGAAATATCATATCAAAGCTAAGCAAAGTATTA
TATATTAAATGAAAGCCATTGGCTATAGATGATATTCCTGGGTATCTCAA
TCCATCCTATATTTAGAATATAAAGCCCATATTTGACGGAAATAAGTCAT
ATAAGTAATATAGATATGACATTTTCTGGGTTTCGGTTTAAGGTTGCTTT
TGCATTGATGCATCAAAATTATATAAATATATCATATCTACTTTTTTATT
TGTAGATTTTAAGAGACACTTCTTCTGGATCGAAGGAAACACATACTGGA
CAGCAATGGGATGAATCAGACTTTCGTAATTTTCGTTTCCTTAATACGGA
GAAGGAAATTAATGAAAAATTCGCCATAGATCTTGTTTCTAAAGTACCCC
CAATTGAAGTAACTGAGAGAATTGTTGCCTGTGATGGTGGGGGCGGCCCA
TTGGGGCATCCTAGAGTTTTTATCAACTTGGATGATGGAGAGCCTTCAGC
TTGTATCTACTGTCAACTTCGTTATGTTTTGAAGTCCTCTCACTAA back to top
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