EMLSAT00000011025, EMLSAT00000011025-706872 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011025
Unique NameEMLSAT00000011025-706872
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s741supercontigLSalAtl2s741:435656..457785 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011025 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011025EMLSAG00000011025-693791Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000049281EMLSAE00000049281-758209Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000049282EMLSAE00000049282-758210Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000049283EMLSAE00000049283-758211Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000049284EMLSAE00000049284-758212Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777660auto777660Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011025EMLSAP00000011025Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011025

>EMLSAP00000011025 ID=EMLSAP00000011025|Name=EMLSAP00000011025|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=223bp
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MEGLIIPGGESTTLSVFFKDQEFFEKIKVWINNEKHFVWGTCMGMILLSD
EITDQKVGGQIQIGGIKIKVARNYFGRQAQSFETKLSLTSKDFPYVDSFP
DFHGIFIRAPGVISLLDDSKVQILANLRNSQTGEKEIVAXRQGRLLACSF
HPELTKDYRFHQYFVDIIATREI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s741:435656..457785+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011025-706872 ID=EMLSAT00000011025-706872|Name=EMLSAT00000011025|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22130bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s741:435656..457785+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTCGTTCTGTCTTACGTGTATGGATATCCCCACCATATGTGAACGTTATT ATAAAACGACCCTCAATAGTGTTTTCTTTGTTTTATACAATATCCATTTC TTATATAAAAAAAACATCTCTTACTCATTGTGCTCATTGTTTAAGAAATT TGTAATATTATATAAGTTACTTTTTTTTTAATTTTTTTTTCATGGAAAAG TTGAAGTAATATTTCAATTCCTTTTCTTTAGATCTACAAATAAGTAAGAT GGGAGGGAAAAAACTTCAAATTGGTGTTCTTGCAGTTCAAGGATCATTTG AGGAGCATGTCAAAGCATTGAATCAAGTTTCAAATGTCTCTAATAGATAT GATATTCACGTTTTTGAAATTCGATGCAAAGATGATATAACTGAGAACAT GGAAGGACTCATTATTCCAGGTAAGTGTTTTTTTTTCTCGATTATCATTA AGTTATTCAAAAATTATACGTTTGTCAAGTCTTAAAATAGGTGTGCATTT AGTTCTGCATAGTGCACCCATTAATACAACTCAATAAAGAATGCTATAAC ATTATAGTTACTCTTTTTTGATAAATAAAGTATACAGTTGTAAATATTAT CGTGACCAGTAATTTTGATTTGAAAACTTTGAGACCAGTAATTTTGTCTC AAACATTTTCTCCTCTGGTAATTTCGCCTCTTAGAGACTTTGCCACATGA CATATTTCGAAAAGACTAATTGACTATTGGTACCTTACTCATAGTCATTC TCTTATTTGATGCTCGAAGTAATGTAAGAAATTCAATAAATAAAAAGAAA AGAACGTTTCAAATGTAAAAACTAAAGATTAACTAAGAACCTACAATATG TAACAGGGATTCTCAACCTTTTTTTAGTGATATACCACTTGTAGAAAATA TTTATTTAACTGAGTACCCCCTTACCAGTACAAAACATTTTTAGCTAATA 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TTAATCATATTAAACACTTTTACATAAGTTTTACTAACACAACTTTTAAT TTGGGATTGTTTTAAGGGTAAAAATTACTCTGAACGATAATAGTCCCGAA TTCCTATAATTCAAGATATTTCAGAATTCAGATAACTGAGATCAGTTTTG GATTCTGCGCTCATACATAAATTTTGTTGTTGTTTTCAATTCATTTGTAC AAGATTTTCACCCCTTACGGTTCCCCTATGTATTTTGAGAAAGATGAATC ATCGTCTGAAGACCCATTCATGTTTGTAGATTATTTATGAATATTCTTAC TTTCTGGTGTCACAACACAAACTCGTCAAGGAGCTCTTCAATCATTAAAA TTAACCCCAAGAATCATCTTCTAGTGAAGTAAAACACGAAATATCCAGGG AGAGACACTTCCACGAGTTTATAAAACACTTTAGAATGAACAGCACTATC ACAGATCCTTCAATCTCCCTTAAATTGATTTAAGCGTAACACGATACTCG TTGTTTGTATTCCATACTTTTCTCATCGTGAAGATGGCAGCACTCCTAAA TAAAAGCTAGGCACATTCATCTAGAATCTGTTGACAGTTACTCAGCAAAG GTTCAGCCATTTTGGAATCGCAGTTGTTTTAACAGTCGTTTAAGTGAGTT GCTGTGAGTGTTTTTGTGACAATATACAATATCGAGTTTCGATCTTTCAC TAAAAATTTATTTTTTAAAGTGTAACAAACCTTTAATACATTGAAACAGT AACAAGCATTGAGGACTGTGTAGAGTTAGAAAGAGACTGTGTTCAAAATA ACGATATGAGAAAAAATATCTTGTATCTTTGTTATGTCAGAAACTTTGCA GACCATCCAAGTATATAGATCATCAGAATAACAATGAATAAATGTGTTCT TTTAATTCTTTAAAACATTCATTACACGATTGTTTTAATTCTATGTTCCT 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TTATGATCTCAATTTTTAATCTCTTGCTCTCATTCCACTAAAGTTAACAT CTGCCTAATTTAACACTTGTTTAAACTACTTATTCATTTAAAAAAAAAAG AGTGAAATATTTATCAAATTAGTTTGAAAAGCAGAATTTCATTTAAACCT TTTGTAAATCTTATATGCGCAAAGCGTAAACATATATTAATTTGAATGAA CAGTCTGTATTAGTGTTCCGGGCTTTTCATTCCCGTCCCCATTATTGTTT CTTGAACAACCGTATAAGAATTTACTATTCTTATAAATATTGTATCCTTA ATTATTAAACTTGATTGATAATGATACCAGTGGTTGATATTAAATTTGAT TTGATTCATCAATGTCAATTCAAATAGGACAACTTTTCCATTTAGAGGGA CCAATTCATCCCTAGTCTCCATATTCAGACAAAAAATCTTACCTTTTGTA TATTTAAAGCTGTTATCTTTTATCAATACTTCATGACTGCTATTGTAATC AATCTACATATTCTTTCAATAGCTAGCTTCTTTGTTTTTATTACTAAATG TGTCACTGTTTTTTCCCTTTCCAACGAATGAGTTGACATAACTGTGACAT CAATCAATTTGGGATCATCTCGTTATCACCATATGGCGTTTGTGATGTAT GTACATATATTATATTATAAGATATGATCATTTCTACCATTGTTAAATAC ATAGGATTCCTGTTGTAGATAATAATATATTCTGTATAGTTAAAATTGAA TTATTTTTTAAAATGTTGTTAGTTGGTAAAGGGCTAAAAATCGTAAGCAT TTTCGGTATGTAAAAAATAAAGACACCAAAAATTAACATGGTAACCCTGA CAATTTGCAAATGTTTTGCACAAGAGCAGCTAAGCTGCTATGACGTTTCA TTAGATTAGGTCCAAGGATATAAACACAAATCCCACTCCATATCTAGCAA 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