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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s741 | supercontig | LSalAtl2s741:435656..457785 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011025 >EMLSAP00000011025 ID=EMLSAP00000011025|Name=EMLSAP00000011025|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=223bp
MGGKKLQIGVLAVQGSFEEHVKALNQVSNVSNRYDIHVFEIRCKDDITEN MEGLIIPGGESTTLSVFFKDQEFFEKIKVWINNEKHFVWGTCMGMILLSD EITDQKVGGQIQIGGIKIKVARNYFGRQAQSFETKLSLTSKDFPYVDSFP DFHGIFIRAPGVISLLDDSKVQILANLRNSQTGEKEIVAXRQGRLLACSF HPELTKDYRFHQYFVDIIATREI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s741:435656..457785+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011025-706872 ID=EMLSAT00000011025-706872|Name=EMLSAT00000011025|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22130bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s741:435656..457785+ (Lepeophtheirus salmonis) TTCGTTCTGTCTTACGTGTATGGATATCCCCACCATATGTGAACGTTATT
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TGTAGCATATATTTACTCAAATTATTCATGCTATAAAACGTTAGATACCA
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TTTTAGGATATTTTTTTTCTATGTATGTATTGTTTCACATCTGTGAAACA
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CCTCCCCCCAAAAAAACCAGTTAAATTTGTGTAACACCTCTGCTTCAACA
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ATACTCGGATATCAAAATATTTATACATAAATTGTTTTCAATTCTATATG
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AACAAAACTTGATCCTTTAATTTAAAATATACATCTTTTCTTGAAAACAA
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GGAGTAACAACAGAGGGATTTTTGTACCTAGTGTTGTGTTTGTCTTTTTT
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ATATATCAATAACAAACACACACCATAAATTAATTAAAGTCAGATAAAAT
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GACTCGAGGTTTTGTCGATTTCTAAATATAATTCCGAGGAATTAATTAGT
AAAATAATTTCTCTATAAATAATCAACTTATGAAAATAAAAGCAGCATGA
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GCCCGGGMAGAGCCCGGGCAGTACTAGTACAGTGNAGTTTGTACTACGTT
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TTTCTTTATTCTTTTGAACTACCTAAAGTCGTAATTTAATGTCTGCGTCT
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CCCGATGCTAGTCTTTATTTTTTCTATCCAGTCCAGTCTTAGGACCAGTC
CTTGGGACTGGTATTTCCGACTGTCAGTCCTTTAAATTTATGTTTTAGGA
CTGAACTGTCTTCCTTTCCAAATACGGACTGATACGACATTTTTTGTACC
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GTAGTTCTTATTTCTATATGCAATTTAATTTTTTTTAAATCAAAAATAAA
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ATGTTAATAATTTTAGGAGTACTAAATTTGATATTATATATTCATTTGTA
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CTCAGTCATCTTAATTTTAAATATCTGTGATTATAGAAATTTGGAACTTT
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TTATTGATTCTGTATCTRGTTCTGAACTTGATATATTTCTATTTTTAGGC
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ATAATACATAGTGATGAGGAATATCATAGCTTATATTATAGAAAAATATT
TGATTTACAATTTAAAAAAAAAATATTGAAAACGTATGCATCTTCAAGAA
TTTTTGTTCCATTTTCTTTTTCTCTAGTGATCCCATTCAGAAATATTAAA
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TCCTCTACAAGGAAAGAGTCCACCATACTCCCTTATAATGTGTGGTAGTT
TTTCATAGATGAATTCTCCTACCGTTATTCGTTGTGGAATTTTGAACCAA
ATTAGAACATCTCTTGAGATGGATGATCAAGTTGGAAGTATCTTCCTACA
ATTGCCTCGATGTTTCTTTTAGGAGGAAAAATATGATGATAGTAATAACT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTAATCATATTAAACACTTTTACATAAGTTTTACTAACACAACTTTTAAT
TTGGGATTGTTTTAAGGGTAAAAATTACTCTGAACGATAATAGTCCCGAA
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AAGATTTTCACCCCTTACGGTTCCCCTATGTATTTTGAGAAAGATGAATC
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TTTCTGGTGTCACAACACAAACTCGTCAAGGAGCTCTTCAATCATTAAAA
TTAACCCCAAGAATCATCTTCTAGTGAAGTAAAACACGAAATATCCAGGG
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ACAGATCCTTCAATCTCCCTTAAATTGATTTAAGCGTAACACGATACTCG
TTGTTTGTATTCCATACTTTTCTCATCGTGAAGATGGCAGCACTCCTAAA
TAAAAGCTAGGCACATTCATCTAGAATCTGTTGACAGTTACTCAGCAAAG
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GACCATCCAAGTATATAGATCATCAGAATAACAATGAATAAATGTGTTCT
TTTAATTCTTTAAAACATTCATTACACGATTGTTTTAATTCTATGTTCCT
CTTCAATTTCATAACTATTCTACTAACAGTTGGTCAAAAGAGAAAGGAAC
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TTTTGCTGGGTGGTAATTTTCCTAAAGCCCCGTAATATTTCGTATTTTGG
TTTCCATGGTTTTTCACTCCAATTATGGACATGTTTTGATATCTGTTTAT
ATTTGTTTAATTAAAATCTTATATTTACTGGGTTTCCAAGTAACTTGTTG
CTTATTCCTGTTTGATCACATATATACATCCTGTTCTCAAAAGAAACTTT
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AGGGAAATTGACTCATAGGAAATGAAAAATAAGGTCAAAGAAATGAAAGA
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TCAAACAAGAAATAATATATTTAATATCAATTGATATTGGGTTTGAATGA
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TTGTGATGGAAAAGGGTTGTGCATGTCTTTTTCTGTTTACCCTTTAGAGA
TTAAATTAATTTGAACGGATATTGAGCAATACATAAAAAAAATTACTAAA
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AATTCCAAAATCTTTATTGAGTAAGGGTATAACTCAACAAGTTTGACAAT
CCCTACTTTAGCGTAATGGTAGGGGATAGTCTGTTACAATTTTATGAATG
AGTTCTTATTAAACTCGTTGTTAGAAGACGTATGGGGTTTTTCAGATTGG
TTATGATCTCAATTTTTAATCTCTTGCTCTCATTCCACTAAAGTTAACAT
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GCTTATGGCTATACTTGAACTTACAATATAAGGTGTTTTCTTGCTTCTGG
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CTTTAGGAGAATATATATTTTTTGCAGCACAAATTGAGTTACAGAATTCA
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TAATAATGATAAAAAGGAAGAAACATGAGAATTGAAAATAAATAGATGAG
ACAAGCTTAAAATGTATTATTTCTCCTTCAAATATAATTAAAAATTACTT
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GATCCTTTTTATGTAAAAATTCTATTTTTCGACACTAAAACTAAGAAACT
CAAGTTTGAACATTGAATAACATTTTAGAGCAAAGTCATTTATTTTTTCA
AAAATTGTTCTTCTAGTGTTAACCTTTCTATAAATATGACTCATAAATTC
TAATGGGCGTATCTGAAGATTAATAAACTCATAATCATGTGTTTTTATTT
ATATACTTAAATGGAATAAACTTTCTAATACATTTAAGATTTTATCAATT
AAATTTCTTTGAAGCCCCCTCTTCATGTTTACACATCCTTTCAGAAGTAG
TATGTATATACTATCTACATAGATAGTAAATATTTATTTACAGTCATCCT
CAATCCCATTTAGGAATTTAATGTACATATACAGAGATATGAATCTTTTC
TTAAATCGATACATATTTTAAGAAAATAAATCCGATAAGTGGAGAAATAA
AAAATGACTTTTATCTTTTTTTTTAAGGGACGCACAGAAATCTTCTTCTT
AAAGAAAAGAAAAAAAGGATGAAAAGTTAATCGATTTGGAAAATATAAAG
ATCTTTTCCTAGTGAATACTAATGAATCTTGAATCCCCTCCTCCCCCCCC
CCCCTCCGTTCTTTTCAACATTCTTCCTTCTTTATAAATGTGAATACCGC
AAAAATAATGAGATCATGTCGTATATTGTTTGGATCGGAGTAAGAGCTAA
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TCTAAGCACTTTCAGTATGAAAAAAAAGCATGATAACCCTGACAATTTGA
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GTCCTGTAAGGACTTATAGAGTTATAATTACCCAACAAATTCCCTGTGTT
AATCCACGTTATGCATAAAGACACACAATATGTTTTCTTCTCAATAATTG
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ATTTCATAATACATGTATTATATGTGAAAGACTCAATGGCAAACATGCTC
TGGAAATATTATTTGTAGAACTTAATGTACCTAGGCTCGATACGCTCTCC
TAAGGAAGCATCATTTTGCTTAAGGACTTCAAAGACAGTTTCTAAGTCGG
ATGGCGTAAAACTATAATGTTTAGTAATACTTACATAATTAGTACAATTT
TATCTGACCAATTAAATGATGGGATGGAAGGGAGGATTATTAAAGCAGAA
TATGACTAATAACATTAACTAGATTCAATATTTCACCAAGGTTAGCGACA
AACTTAGGATATTTATTAGAGAGAGATGTTATCACAACAATGTTTTGGCA
AATAATGAACAGTAAAGGCCACACGCAATTATCGGGTTTTTTTTTTGCTT
TTTCCTAATCTCAAAATAAGTATTTATCTAGACTTTTTGTTCAGCCTTAT
ATATGACGCACTTCAAATATTGATAAAAAGATCCATTTTTTGAAGTTTAT
GAAATTGATGGCATTATTGTTGGATAATATGTTCGAAGTGAGAACAGGGC
TTAACGCTTCCATCTAAAGATGAAGTTCATTCAATATCTTACTCTTAACT
AATCAGTAATAAGGGATACGCATGGTGTTGTTAATGAGCCCCTTTATTTG
CAAATTTTAAGTAAAATTGTCATTCGTCCATGGATTAATGTAACAAATTA
CGTAAAAGCTTAATTAATTAATTTGTACTAACAAACCAAGTCCATAATTT
GACATATCACGTTCAATTAAGAGTAATAAACACATTTATTCTTAATCTTT
TAACTTGTGACTTTGTATTCAAAAATCTATAGCTATTCACAGAAAATTAA
ATTTTTGGAAAAAATTTGAAAAAAAATTTCAAGTTTAATATTTTTTGATA
AAAAAAATCCAAAATCGAAATTAAATTTTTTGCTCTTGTAAAAAGCAAAA
AGTAATATGTTATTTTTTTTTTTGGGTGGGGGGGGGGAGGAGGGGGTGCT
ACAGCTTACATCTTGCTGACGTCCTGAAAATTCTAAATAATATTTAAATA
AGTTATAATATAATCAAGTAAATAGAATCAACCTGAAGCAATCTCGATTG
GACTTCCATCCGAGACAATATAGCATTGCTACTAATATGCTCCAACAATC
TTCTTTTTACCTCACGGAATAGCTGAGGACTGGGTGCAGTCGATATAAAA
GTATTTTGGAAAAATATTAACCTTAGTTGGATAAAAAGACTACAACGATA
ATATATGCCTGCAGATGAAAAAGGATACATAGACTCAATTGATTATTAAA
CAATACTACATTTTATATTTTTATAATGTAAAGAAGACTTTTTAACATCT
TTTAACAAGAAAGTATTAGTTTTATTTCCAATTTTATCTTCAAAGTCAGT
TTTTTTCTATTTTAAAATTATTATTAGTCTATGGAAAGATTTGAAAAGTT
ATAGTGAAATTGATTTATGCACTATTTTTGTTATTAAAATGAATAATAAT
ATTAAATTAACACAACAAACATTTTTAACAAACATACAATGGSGMACTTA
AAAAAGATAGGAAAGTTTTATTAATACTTAGAGAACAAAGTCTGCACAAT
CTTGTATTAAAAACGTTCAACAACAAAAAAACAACAACAATATCCAATGC
CTTTATAACCAAAATTTTATTTAAATCCCATGGATACATTTAAAACACTA
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TTTGTGAATAAACTTAAAAAATCCCACTCTATTTTTTTTTTCAAAAAACA
AAACTTGTTGATTTATTAATAACTGCCCCTAATTCATTATTTGTATGTAT
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TTACGAATTCAATTATTAATAAAAGTTGAGTGATTGAAAGTAATTCATAT
TTCGTAATATTAATGCGTAATCAATTAGTTACAAAACAAACCAAACCTCA
TGCAAGAGATCTCAGGATTTCACTCGAGATTGTCCAGAAAGCTATGAAAA
AAAGTTGGTGGAAAGCCCTTGTGAAGGTGGAGAGGCCACTTTGAAATCAG
CAATGAAAGAAACCCATCTCCTCAGTTGAAAGACTTTTTTTGAGTTCTTT
TGTACTCTTTTTTCATTTTTTTTGCCCCCCATAGAACTCTGATAAGAACC
CTCTCGAGTACTCCTTCTGAGTGCATGTCGAGGAGAAGGCCTGCAGTGTC
CATCATCCAAACACCGAGATCACTGTCGGCCGGCTCTGGAAAACCATGAA
AGAGGACTATATCTGCAGCGGTTGCCAGGCCTTCCGCTTCCGCCTGGAAT
CCATAATTGCCACTAAGAGGGGTTATATCAATGATTAAAAGAGCTTAGAC
AACCATCTATTTATCGTATTAGTTTTGTTGAAATTCTATAGTTAATCAAT
AAATTACATCTTGTTGAAGTTTAAATTCAAACTGTTCAGATTTAAATGGA
CCACTCGGTATTTTAAGTAATTCCTTTTTCCCTTCTTTTTTTAAAGAATG
AGATGGTTATCATTTTAATTATCCTTTTTCTGACCTTAATATTTTCCCTT
TGCAATAAGAAAATTGCTAAATCGTCTTTTTTTGTTGGTGATAAGAGATT
AACATGCAAAGCACTTCTAGAGTAAATAAGTATAATTCAATTATATAATA
GAAAAAATTATTTTATATTGATTAAATGCTAATTACATTCTTTATAATTC
ATTTACAAATATTGTTCATGCTCAAAGTATGTACAAACAGGTTTTTTTTA
CTTTTTATACATCCTTTTTGCAAAATTTTATTAATTTTAATAATCCAAGT
ACATTATGTATGTAAATTTACTTATTTACGATTGCAAAAGTACAGAAAAA
GTGTGTTAAAAAATTTAGAAAAATGTAAAAGAAAAGTTTTTAAATAATTA
TAAAACTTTTTGAAGTACATATAATTAATAATCTCATTAAATAATTGTAA
ATACTAATAAATAAATTGGGAATATTTTTTGACAGTTACTTATTGTTCAC
GACTATTGACTTCTGATGGAAAATAATGTTGTGTATTTGGGCTAATTTGT
CTTAAAAAGATGACAACAATTAGACTTCTTTGAAGAAAAAAAGTACAGAA
AGGACATATTTACTTTGTATTTTTACTCATAAGAATATCAGTTCTTATAT
AGTATTTTAAAACTAATTGAAAAGCCATAGATATAGTTTTGCTTCAATTA
ATTATTACACTACAAAAGTAATGAGTTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGA
CAATGAGGTCTTTAAGAAATTTAAACAAAGGAATCACCAATCGAGATTAT
TATTATAATCCTGAAAGAAAAGTTTTATTTTTTTGTGATGATTGTACTGC
TTTGATTCCATAAAAACTATTCAATTACCAAAAAAAATCCTTTATGACAC
GATTTTAATAGATTCTCTTGTAATGAAAATACGTGTAACAACATATTTCC
AATGAAGTTGCATTGGAGTGTAGACGTTGAATATTTATCGATTACTATGT
AACTCAATGAAAGTTGATACTTTTAAATATACATATGTTAATAAAATAAA
GATTTAATGCTTTGAATCCAATAAAGAAGCAAATTTATTTTCCATAAAAT
GTGTCTCTCCCAAACCTCAGCTACAAAAAAAAGTAATATTTCGATACAAT
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