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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s76 | supercontig | LSalAtl2s76:605773..612974 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011252 >EMLSAP00000011252 ID=EMLSAP00000011252|Name=EMLSAP00000011252|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=221bp
MNCATVSIIAGNRFEKSIFISGCRRFISKRKSPVILVGEEDDSSSMALQV
IEETLTVGEPGGLHSWRTATSSLHGSWPTWTRKSLAKPCGLPEAFKEAGS
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NVQCGYYVHKIDYSDPGGIINQKGCLHAAEEWFEPNILVVAVSAVFIAFL
EILGICFPQNLRTDIIAQMPK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s76:605773..612974+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011252-707099 ID=EMLSAT00000011252-707099|Name=EMLSAT00000011252|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7202bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s76:605773..612974+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATTGTGCAACTGTTTCAATTATTGCTGGAAATCGGTTTGAAAAAAG
TATTTTTATAAGTGGATGTAGAAGGTTTATAAGCAAGCGGAAAAGTCCAG
TTATTCTCGTCGGAGAAGAAGATGATTCTTCCTCCATGGCTCTTCAGGTC
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TTTACAGTCTTGGAGAACAGCTACTTCCTCACTCCACGGTTCTTGGCCAA
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GTCTTAGGGTAGTTAAGAAGCTTGTAGATAGCAGAGGGCTTGTGTCCTGC
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TTGTTTGTTGTCAAAACAATTGTGGTGGAAGTTATAGTGTATTGTTCACG
CAACCTTTTATATTAGTATGATTTAACCGTGAATATCCACATTATGGATT
TGGATGAAGTTTAAAGTAGTTCCAATTTATCGTGGACACCCTGTATACCG
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TTTTTTCCGAGGAAACATCTAAGTATGAAGTCAACACGAGTGCTTTTCCT
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TTAGATCTTGTTGGACTCGGATCAACAAAGGAGTATGTTTTTTCTATAAC
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TCTCCTCCAAAACATTCTCCAAATTGTCAATTTTTAGTTTCTTTATTTTA
TTTACAAAGCTTAAATACTTTCTCTATTTACAACTTTTTGTATGGTACCA
TTGACTTAATAAATAATATCCATGCTAAAAATAGCTGTCTATGATATAAT
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TCTATTGTATAACTCAACCGTTCCTTCAAAAAGGAAATAAAACAATTGCT
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TATTATAATAATTTTTCATATCTAAAAAGATAAAAATTATAGTTTAACCA
GTCAACGTTGAACACTGACTAGGAGAAAGGAAGTGGAAAGAGGACAGCTG
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TGTCTGTAAAGTATTACAGTTGCAAAAGCGTTTACAATGCATATAATCGC
CTATGCCTGACAATAAGTAATCAGGTCTTGTGATTTCAAAAATGTAATTT
TCTTCTTATCGATCTACATTAACCTCCCTTGGCATGCCCTCGGAAATGTT
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TCCTTTCGACATATTTCCCTCTCTCAACCATGGGGTATCTGCAGGATTAT
ATTGGAGGGGCGAGGGMCTTCAGCCCCTCCATCCACTCTCTGAAAACGCC
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TTGGAAGTCAATTGCTTAAACTCAAAACACAAACCTGAACACCTTTTTTT
TTTTCAATATTCACCCGACTTTTATGCTCAATCGTGTAATCAAAAGGCCG
AAGTAGAAAGAAAGCTTGGTATTATCATAGTTATGGTATTTTCTGCTCAA
TTTTTAACACAACACTCTATTTTGTCTAACTGATATGATCATTACCACAT
TTTTTCTTATATTTGTCCCTTTTTGTTTTTACTATTCTTGGCACTTATAG
GGGTTTTAAGGAGACATGGGATAAATTCCTAATATTAAAAGTCCAAGTAA
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TTTCTCTACTTTTACAAAAATTTATAGCTATCACGATAGGAAAAATTACT
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TTTCTTTGTTTTTTTAAAAAATTATTATTCGTTAAAATTTATTCTCTTCC
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AAAAAAAATTATCCGTGGAAATTGTTAAAAGAGGCTTAGGTAATTTTGCA
TTTAACTATATTGACCCTCGACTTTTGGCCTTAAAACCATTTTGCAACAA
GGATATTTTCACCTTGGCATATAAATAAATGGGATTGATAGGTTGTTTTT
CTTATTTTAGTTAAGAGTGAGGTTCTCTTGGAATTTAAAATCAAAATATG
TAAAGTTTAATAATATAAAATGCATGAAAGGGTTGTTTTCTGTTGGATAA
ATGATGGAATCATGTACCAATATTTCAATACACAAAATCCCACTATGTAA
TGAATTGGAACCAGAGGCAAAATAAGTAATACAATTAGTTTAATTAGAAA
ACAAAAACCAATAAACAAGGCAACGATTCGAAACGAAAAAATGCTAAACA
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CATCATTATTTCAACAGGAAACAAACATGTAATGCAATATTATATTAATA
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TTATTTATATATAAGGCGAAATATCCATGAGGRAAAATGGTTTAAGGCAA
AAGTGTCCTGAGGCAAAATTCTTTAAGGCAAAATTACCAGACACCATCAA
CAGCCCAACAGTCCTACCAACCTCACATAAAAAAATCATACGACTGTCTG
ATGACGTCATAATTATATAATTAGCCCACCGTCCACTTGAAATACCTTCC
GTCACAGGGGGTCCAAAGGCCATGATGTCTTGTCTAGAGTCAACTATCAA
GTCTTTGCTCATAACCATAAAATATTAATTATTGCATTGATAAATTCATT
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TTTTAGTTTGCAGTTGAGATTATTTTATTTTTTGGGGATGATGTTTTTCG
TGTTTATACATATATTTAATCACATTTGCATAACAATATGCTTGTTTATA
TATTGTTATTTCCTCTTCTTTGCATATGTTTGTTATAAATCCCATTGTTT
TTTTAATGTATTTTATTCTTTGATCATAATATTTTAAAAGAATATTAAAA
ATAACAAAACCTGTCACTACTTTTTCTAATTTTCAGCATGCATATGATAA
TGATATTAGATAAAATATAATGTTAAGCCTTAAATTAACTTAAAATACTA
CATAGTTAAATAATTAACTATTGTATTTATAAATGAGCCAGAGTTATAAA
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AAGTAGACATACAATAATTTATATAAAAAAAAACACATTATTAATCTGAT
AGGCCCACTGAAAATATGATGTGGTAATGTTCAAATAAAATTCTGAAAGG
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CATTAGAAAAAAAACAACAACAACGTAATAAATGTTTTTTATAGGTTAAA
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AGCATACCCTTAAAGAAGATATCGTTCCATATTCCTCATTTGAGTGTTCC
CTACTATAATACTCATCCTGGAACATCATAAGATAATGTTCCAGACTCAA
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GCTTAGCACCGTCAACAGTGCTCCAATACTTCAATGAATTGAATCTCTGT
ATTCCTCTTCACTGAGTCTCTTACTCTCTATTCTAACTAATACTCAAGAC
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ATTGATATCAGAATTTGAATTTCAAAGCTAAAATACATTCCAAGTATTCT
CGATCCAGGCACTCTGGATAGTGAAGTATCTTGTTACCTTAAATATCTCA
TTTTTGGGTTCAATGTTTTATTTTGGTTACTGGGCCTATGCCTTTTGGCT
ATTGGTATTCGGGCATGAACATAAAATAATACCTTTAACAATCTCTCTGT
GCTCACAAATATACCCTTGGATCCAGCCTTTATTTTCATCTGGGCAGGTA
CATTAACATTTGTAAATTGACTCAATAGGTGTGTTGGAGCATTAAGGGAA
AATACTATCCTATTGGCTGCAAATGTTGTATTTRTTMCATTGCTATTAGT
CATAGAGATGATAGCCKGAATTCTGGGTTTAGTCTTTAAAGATTCGATAA
AAGAACAAGCATCGAATGGTTTTGAAACAGTTAATGTACTTTATCGTGAT
GATCTTGATCAACAAAATCTTATTCATTGGATTCAATATGACTGGCTATA
ATGTTGTGGCATCGAAGGCCCCCATGATTGGGACAAAAATATTTACTTTA
ATTGTTCTTCTGTATCTGTTGTATCAAAGGAAGCTTGTGGTGTTCCCTTT
TCATGCTGTAAACCAAAAGTAGATGAAGTTATTAAGAATGTGCAATGCGG
GTATTATGTACACAAAATAGATTACTCTGATCCTGGTGGTATAATAAATC
AAAAAGGATGCCTACATGCTGCAGAGGAATGGTTCGAACCAAATATTTTA
GTCGTTGCTGTATCCGCTGTTTTTATTGCTTTTCTTGAGATTTTGGGAAT
ATGCTTCCCTCAAAATTTACGCACAGATATAATTGCTCAAATGCCAAAAT
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