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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s784 | supercontig | LSalAtl2s784:20192..74498 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011351 >EMLSAP00000011351 ID=EMLSAP00000011351|Name=EMLSAP00000011351|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=371bp
IRYICSHDKIIQLKLLKVKFIWLIGIQEEFYIMEYTYFHCCILILFIKIE IGLGLKCHQCSSYTLKHCHDPFYHEDGKFKTNNFLNECPSDKKYNLCRKI YQIVRGDERVIRSCGYEEYKNECYKTVLEEYTTKIVLIISNITLIQSLSN EGTTSINNEMPCVKRLNQLYCNGAGSAYPLGRISTFIDEHKALIKRMFGD MQETEPKLTKQTSLKTPASTIYFRSSTSFKSTRFSRSILEGFIEDFDVLK KTNKTRTRRETSFPGITLKDDPNKVDSCESSIEISQPYWAENSNNQIRAI VNTKQFNQAIHQEICSKSRTVRCAGDCSCEQKYKWHRLLSYDPNNDCSGI FMDWFLFPSCCSCRCLKKSHI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s784:20192..74498+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011351-707198 ID=EMLSAT00000011351-707198|Name=EMLSAT00000011351|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=54307bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s784:20192..74498+ (Lepeophtheirus salmonis) ATTAGATACATATGTTCACATGATAAAATAATACAGCTTAAGCTTTTGAA
AGTTAAATTTATATGGTTGATTGGTATTCAGGAGGAGTTCTACATAATGG
AATATACTTATTTTCATTGTTGTATTTTAATTTTATTTATAAAAATAGAG
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ATAAAGAGAGACTTTGAAACTTATTTAACATAATAATATTGGATCATACT
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TTATTCTTATATTAGCTCATTTTGGACCAATGACAATCGGCCTTTCTGAA
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GTATTATAAAGAATGAATTTTATTTTCCTTATCAGTTGTTATTATTATTT
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AGAATGAATTTTATCACTGAAAAATAATTCCGCCTGCAAAAAATTTCCTC
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AGCCAGCCTTGACTTAATTATAAGATTTTGCCACATATTGCTTCTTTCAG
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TATCTTTGATTATTTTAGATTCCTTGAATTGTTTTAAATCTGATATCTTT
TTGTCCTTCGAAATTTTGAAACCTAAGAAATCGTTCTCACTCTAACAAAA
TTGGCCTCTGTCAACATTATATCTCAGTCAATTTTGTCTCAATGTTGCAG
ATACTTTAGACATTTGCTCATGATGCTCCTTTTTTGTTTTAGTGTAGATT
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TATCATTCTTTGGAACGTACTTGTCGAATTTTAAAGCTCAAATGACATTG
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CATATTTGTTTTCATTAATTGATACGTGTATGGGTTTGTTGTACCACTAC
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TAGAGGTATCACCTTCTCAAAAATCCGTTTAGCTTTTTATCGTACCCTTC
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TTGTATCATAGACTTACAAAGAAACCTGAACTAAATTAATTCATAATATT
TATTAGAAATTGACAAACTTCAAAAAAAAAATATGAGTAGGTTTTAATAT
ATTTAATATAAATTATGGACATAATTTTAACATAGTTTGTTTATTCTTTT
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AATAATGRTATCCACTGATATTCTAAAAAAAGAGTAACCGATAATTAACG
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TTATAAATTCCCACCCAACGTTGTATAGTTAAGAATGGTTACAATTTTAA
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AAAACTCTCAATTAAGGTATGAGAATAGTAGACAATATGGATCCTTGATA
TTACAATATTAAACTGGCATATCCTCTAAATATTAAAACCATATTAGTTT
CTTAATTACATAATTATAATTGATAACAAGCACAAAAAAAAAAAAATCTG
GAAAATTTAGACTATTAGAAGAAAGTATGAATAGATTGTGCTCCAATGAA
AAGAAGATATCCTTCTGAAATTCTTGAAATCAATAAATTTTTCTGAGATT
GTCTGCCGTTTGGACAATGAAATACGAAAAAATGATGGATAGTATTTTAT
AAATTCAAAATATACAATTTTCCTCAAACGGTATTTTAAAAGATTCAATG
CACCCATAAATGGGTGAAACAATATTGGGCAGAAAATTTTTAAAGATGAA
GAAGAAAATATTTTTAGAATCGTTGTAACCCTTTGGGTACAATATACAAG
ATTTTAGCTTTATATATTCCATCTGGAGAGAAAAAAATTTAAGACAAATT
AAGTAAAGTTTAAGTTTAATCCTAAGAAAGATAGGGTCATAATAGCCGGT
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ATTCCGAATATTTCAGAATAAAAGATCTGGAAAAAAAAGAAAACAATTTA
ATGATTCTTGCAGATGTAACAAAAATTATAGATCTACCTTTGTCAGAGAC
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TGTCAGATCAATTTATTCTAACCAAAACAATTATTAGAAGAAAAAAAAGA
CTGTATATTATGTGAAGAATTAGAAACGTTTATCAATAATAAAATGGAAA
TTAGAACCCGTACTTTAAATGAAAATATAAATTCCAAAAATTTAAATCTA
TTACGGAACATATAAAAAACTAATTGAGTTGATATAATCAGTGTCATTGA
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TATCAACGCCTATATACTACCAGGAAAGAGATTAGGACGGAGAGAAAAAT
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AAACATCTATGGAGCGTTTTCTTTCCTTTTAGAGGCAAGGACAGGCCTAA
TTTTCAACAACAATTAATTAATGGACTGTAATACGGGTTTCATTAAAGGC
GTCTACATACAATCTTCACCAGTGATGGGCAAGTTAGCTTATCTTTTTAA
CTAGTTAAGTTAAAATTAATTATTATTTCATTTTTTTATTACTAGTTGAA
ATAAAGTTAACTTCGATTTCTATGAAAATTAACTAGTTTAGTTAAAGTTA
ATTAACTTTACAATAATTTAAATTAAATTAACTCAACCAACCTTGTTTAA
GTTAAAATTAATTTCGATATTAAGAAATAACTATTTAAGTTAAATTAATT
TCGATATTAAGAAATAACTATTTAAGTTAGTCAATTGAGAGATTTATCAA
ACCTTTATATTATAGATTATTCTGTCAGTCTCTCTGCCTAAAATTGTATC
CTCTTCCAATTGAACGACCAATAAAAAAATACAAATTCAAGTTACTACTA
AAATGGAAGTCTAAGACAGCTAAAATTTTATACTTTTGAATTTCTATCTA
ATTTTAAACTATATCGAAAAAAATAAAAATAGAAGATAATATAAAAACGA
CATTTTCTACCACACTGAGAAAATATTCATTTTATCAATTTGATGTGGAA
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TCAACTTAGAATAACAAAATAAATTTAACTTTAAACTAATTAACTTAATC
AAGTTATGTTAAAAATAAGTTAATACAGTTTAAAAAAATTACAAGTTAAG
TTCACATTTAATTTTGATAAATTAAAAATGAACTAGTTAAGTTGAAGTTT
AAATAACGCTGTTTAAATCATTAACATCACACGACGAGAAATTTACTTAT
ATTTCCGGGACAAGAAAAAGATAATAATAATATTACACATACATAAAGTT
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TTATGATTTTTGAGGGTATAACAAATGTATTTATTAGCAGAATGTTTAAT
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TTTGAGAATAATAGNNNCCTTATTTTGAGAATAATAGCTAATGAAACGAA
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TCTTAAATTAAATATAATCTACATACTAAAAAATAAACCATCTTACATTT
ATGTTAAATATACAAAATTAAACAATTGGAATCATATAATCAATAACAAN
NNNNNNNNTATACAGAATATTGAAATAANNNNNNNNNCTAAATATTTTCT
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CATGTGGAAGTTGCTATATACAATTGTGCACAGGATAGATATATCTCTAC
CGATGAGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGCACAGGATAG
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TAAATCCATCTTAAAGATTTAAAGCAAAAGCTAATTATGTTGTAATGTCC
TGCGATATTACTCCTTATTAAGAGCATCAAAAAATATATTTTCCCCGTCA
TGTATGATTGTATAACAACATACTAATTATTGCTAATTATAATGATACAC
CCAATCTAACTACCCCCGTTGTTGTTACCATTTAAGTAGTTGTTTTTGCC
TTTTATGAGTTTTCTGAACACCATTTCTTGGAGCCTATCAACCATAGCTA
AGCCTTAAGGGATAAAAAAGTAATATTTATTGACCATGTAATATTGGAAA
ACATAATGATCATACCCAAGTATTTAAGTGAAGAAATTAGTCTCAGACAA
ACTAGATGCGAACCATCCAAAGCTACTACCCCCGTTGTTGTGACCATTTA
AGTAGATGTTTTTGCCATTTAATGAGTGGTGTATCATAATCCTTGATATG
TTTAGCTAAAATAGAATCATATTTTACGGTTAGATTTAAAAAAAATTGAA
TACTTACTGTGAGATTGTACAAAATTCAGAGTTCCATTTCGATATTAGTA
AATACTTTTTACTGATAACTTGATCGTCATTTGGTGTGGATGATAAAAAA
CTTTTTTATATGTATTTCTATAAATGACATCAGTACCAAGATCCTCCGTT
AATTTAATGATGGTTCCTCGGGAAGGGATAGGTTTACCCGTATATTTCTC
CATAAATTTTTTGAACGTAGGATGATTAGTAATGGATAAGGTATACTACA
TGCAATAAGCATATTTGTGAGATCAAAGTGAAAGTCTAACTTGATGTATT
CGTTATTAACTTGATTTTTTAGATGAATATCCATGCTCTTGATATGAGAT
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ATATCGACAAATCCGACAAACCATCTGTTTCTGATCCGGTAAGTATTTCC
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TTTAGGCATTCTATTCAGTTCTCTATCGACTATCACTATCTAATATTATA
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GAAGNAAACCATCTGTTTCTGATCCGGTAAGTATTTCCCAAATTCCTGGG
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AATAAAGGCGGGYATGATAAKGTTCTTCATTMATAGAAGAAGAWGAATAT
TATTTAATCAATGATGCCATAAGTATTTCTTCTCTTCTCCTCGCACGCTT
TTCTATTCATACCAAAATTACACCCTTGCACATACATTACGATAAATATA
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TGAAACAAGATAATAAGATCAAATTCGCAATTCCGAATACTGCCCACCAT
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CATGCGTACTTTCACACTCTTTTACAAGGTTATCTTTTCCTGGAAAAAAT
TCAACAATTCCCCCAATAGTCCATTCTTGATCTTGACCTTCATCTAAAAC
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TTCTCTTCTGTAGATCTAAAAAATATTCTTTCTTCCAACGTTCTCTTACT
TGTTTTAATAAAGTGATTGAATTTCTCCATAAAGATTCATGACTCAGACT
ACCTTCGACTATCTTATTCGGAATATCTATCACATTGAATTCGGTTAAAA
GCATTGAAGGAGTCAAAACAATATCTTCTACTTCAGTAGACAATCTAGTT
AGCGGTCTACTGTTTATAACAGTTTTAATTCAAATTAAAGCTGTATTGAG
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TTGCTCTCGCAATCTCAAATTTGCAGGATCTATAATTAGTATAGCTACCA
CTGATTGGGATTGTATACCTATAGGATGCTTGGTACCTTTAAATAGATAA
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TCTTACTGAGATCTATACATATACTGTCTTTGTTGATGTCGTAAAATAAA
CTTTTCGGGGTTTTTAACGTCCATTGGAGTCAATTCTCGATTTATTGAAT
TGGGGTTCCCCTATTCTACACCACTGAACAAATTTCAGCATCCAACCTAT
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TAATAATTCAAGCTTTTCACTCAACCGATTAGGCCCATGAAGCCATAACT
TGGAGGAACCTAATTCTTTCGCATTAATGCCCCTACTTGCAGGGTCTACT
GGATTATCTGCACTACGAACATATCTCTAAGATGATGGTCTTAATATTCC
TTGTATAAATTCAACACGATTTACAAAAAAAAGCTTCCATTTACTTGAGT
TAGAGCTAATCCAATGGCACAGGATTATCGAGTCTGTCCAAGCGTACAAA
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TCACAAAATATAAAGATATCTGAAACAGTGCCATTTCCTAATCCATTCAC
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AATTTTCCATCTTCTAAACAATTGATTAGGTAAATAATCCTCCCAAACTA
TTTTCAACTTTCATGTATCTTGAAGAATTATTTTAACAACAAAAAAATCT
TTGGCGAGGAAGAAACATCACTTTGACAAATAGTGAATTTGACCAGGACA
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TTTTTAAAAAATCATGTAACACTTTTATTTCCGTTACCCTCGATTAAGCT
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TTCTACTTATGAATTGTTCGTATACCTCTCACAATTATCTCTTAAAGATA
CAGAAACTTCATCCTCCAAAATCAATAAAACAAATCTTCTTACAATAGGT
TGTCCCAAATATATATAATTCGCTTTTAGAGCACGTTGAGTCGTAATTAT
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AGACCCACGAATCTATGGATCAGCTTGGATATCATACTCCGACTACAGCC
AAAATTCTATTTCAAGATTTTGATAGCTTCGTCATAACTTTCCTTGGTCA
CATGAAGAAATGAAATTTTCCTAAAGGCTGCACCCTGGAGTGCAGATCTC
AAAAAAACAACAACTTTGTTATAGTATTGATATTATAATTATCCACATTG
GCTATAAAATTCTCCATCCATGACGCATAAATCGTCAATTCTCCATTAAA
ATTCGATAATTCCAATTGGGGGAAACGTAACATTACGATTTTAGACTCAT
TAACAGGTGAAGAACAACCCTTTTTAATATCCAGAAGCTCTTTCTCATAT
CTTATTTCCGGTTTCAAGTGATTGATATTCAATTCTCTTGCAAAATTTCA
GGAAGCCTTCATTGTCTTTCCGTGCTTTTTTTTGCAACTCCCGAATTTGT
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TAGAATTTAATTAATTGTTCCATTTCCAAACAAACACGTTCATCAACTCT
TGGAGTCTCTATAAGTAAGGTGATACATCTTTCACTTCATCAGTCAGCTC
TTGAAAAGACTCTTCGAAACATCCCCTATCCTCACAAAGCAGTGCAATAC
CTAGTATAAATGGTGCTATCTTATATTTAAACAACTTATATTGAATATTA
ATATATTTAACAACACTTTTTATTACACTAACGACTTCAGATGATATTAC
CCTATGCTATTGGCAACCACAAATTCATCCAATTCCTTAGGATCCGGGTC
GACGGACTATGTTACAGCCTCCCTCGAACGTTTTCTTTCCTTTTAGAGGC
AAAGATGGGCCTAATTCTTAATAACAATTAACTAGTGGACTGTACTACTG
AATTTATAAAAGGCGACCACATGCCTACTTCATCAAACACAATGATAAAT
TGACTTATATATCCGGAACAAGAAAAAGATAAAAATAATATAAACCCAGG
TGACCTGTATTCCATATGTATTAGACGCCCTTATAGACACCTATTTATTT
CGGTCAGAAGGATATTGTGTAGCGAACAACTCCCAAAAATCGAACTCTCA
TACTCCATTAAATTAAAAGATAAACAAGGAGAAACATTTGTAGCACTGGT
CGAATCAAGCAAGTTGACGAAAGCCAAAAAATTTCCCATAACGAAGGTGC
CTATTCAGAAGGATCAATAGAGTAGATAATAGTGGCCATAGTTTTCCTGT
ATCTTTTAATCCCGAGCAAGATCCAGTAATGGAGCATGAAAAAACGGGTA
TGGGTGAGGGAAGTAACGAGGTAATAAAACCAGAAGATAAAGACACAACT
GTGAGCAAACAAAATAATGTAATGGCATCTCTGGAAAATACAAAAGAAAT
AAGTTCACCAAATCAGGCAATCATACAAGGAGAAAACTATACTGGAACTA
ACTTTGATGTTAACACACCTTCCGAGTAGGGAGAGAGAAAACCAAACGAA
AAATTTATTATAGAATCAGTGTATGAGCGCCAAAATAACGAATCAGAATT
AAACTCCAACGAAGAGGACCCTCAGGATAGATCAGGAAAAAAAAAAGGGA
ACTAAATATCTCCCTGGAACAAATTATGAAACTTCCACCAGTGTCCAAGA
AAAACAAGAATTGCCCCTCGTCTCCACATTCAGTTTAATGAACGATTAGT
AGTGCCTTTTTTCAACATAAACATCAACTAAATAATGGAAAAAATTCAAA
TCAATAATATTTTTTCACAAAGAAAAATAGCTGTAATAGCTCAGATGAAC
ATCTAACCCAAAATCTACTCAAACACATAATATCAAATGGAGTTATGCAA
AAATCATAGCGGACTGAGGATACTACAGGCAAATATAAACGGGCTTTCGT
CAAATAAAAATTTAATAAAACTATTTAAATACTTGAATGCCATCGACCTA
CCAGAGGTAGTGTGTTTTAAATGACACGAGAATACGCAACATATGTGAGT
GGTCTTTCATGCAATCAAAATATAATAATTACTCTTCCAGTGCAATAACA
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TGTGCCATCAAAGTCAGTGATCGTGGATGAAAATAGGAACTATATATCAG
CTGTGGTGTGGTTTCAGAAATCGCATTATAAAATATTAGTATTATATATA
CCTTTTGGAGATAATATTTATGCAGAACTAAACTAGCACAATTTGGATAT
GACCCCATGAGTGAAAAAGTAATTATAGCTGTAGATTTAATACTGCAGAA
AAACCAGTTAGAGACTTCACATCTCCCTTTGGGTTTTCAAATTCCAAGGA
GTTTGTTGCGTGGAGAGACACTAATGACGTATATGACTTGGTAGATATAA
ATGGAAACTAAAAGCCCACATTTATCAAACAAAATGCAAACGGAAAATCA
AAGAGCAGAATTGATCACATTCTTCTTTCCAATTAAATATTGCATAACAA
TTTTAAGCTTAATAGATTGACTCAAATGGGCTGTCCCATCACTTCTTCCT
AAAAGCAGTAATAGTGGGGCATATAATCCATTGGATACCTACTCGGTGGA
AACTGAATGCCAAACTTTGAATCGGCATAATAACTTTAAAAATTTGAATC
GGCATAATAACTCTAAAAATTTAAAACTCCTAAGGCATATTGAGATAACG
AATGTTAATATTATTACAAATGAGATACAAATAGAGAATATGGACAGTGT
AACAACAAAACAGAAAACGGAATACATGCGGAAATTTTATCAAAACCTTT
TAACATCCAGAGTAAAACCAAAAAAAGATACTTTATCCAACAAAAAAAAT
TCTAACGAAGAATTTTTGAGTCTCCAACGTGATTTTACACCATCTGAAAT
TTGGCGATACATTGACAAAAAACTTAAGTCGGACAAATCACCAGGTCTTT
CTGGATTTACTGCTGAATTTTAATTCCCGGAACTAGTTAAATATCTAGCT
ATACTTTTTAATAGGGCATTATTTGGGGAAGGTCATACAAGAGAGCAAAA
ACGTGGACTCATAATATTATTTTCTAAGGTTGGAAAGAATAAAACAAAAG
TAAATAATTGGAGGCCAATAACGTTGTTAGAAACGGAATATGAAATTTAT
TCTGGATGTTTAAAAGAAAGAATAAAATCCGAATTAGGAAAATAAGTCTC
CCCGAGACTCAGTTTGGGTATCAGGCCGGACGTCAAATGGAGGATGTGAG
CATATCCTTTCAATCTATAGTTGGTCAGGTGAAAAGAAATAAGAAATAAG
GATTCGATCTAGCATAAGTTCATCATTGAAGAATTTGCTATGAGGAACTT
TCCTGCTGTGTCCTGATCCACTGCAAACTATTAAAATATACTGATTCAAT
TATTGATATCGAAAACACACGTAGAATAAAATTAGAAAGTGGAGTAAGAC
AAGGAAATCCACTATGTTCTCTCTTGTTTCTTACTTATGTTGCACAGCTC
CAGAATATAATGGATACGTGTCTTGAAGAGATGGAAATTGGAAGAAAAAA
GGTGACTAATATTTTTTTTGCAGATGATTGCCCTGTCATCCTAAGTGAGA
AAAAAAACATAACTGAGAAAGCTTCAAAGCTTTACAATATACTTGGCAAG
TTTCAAAAGAAGTTCGGCATGAAAATAAATATATCTAAATCTCAATTGAT
TACAAATATGTCCACACTACCTCATACCTTAAAATTGTTCAAACTAGTAG
AGCCAGACATCGTGGTGGGAAATCCAATCTCTTTTAGAGACACGGTTGCA
GAAAATATTGAAAGAGTTAATAAAAATATATATGGCTCAATTCAAGAAAT
AGGAAAATATAGACTCACCATTTTAGACCGAATTAAATGTTGGAACATGG
TAGTTATTCCAAGAGTGAACCATATTCTAAGATCCACTGCCTATAACTAA
CCACAGAGTTAAATATTGAGGCAGAAAGGGAGGGAACTTATTCATTTACC
AAAAACGGTAGGATCAGGTCCCGTGTAGACTTAAATCTTTCATCACTGAT
GCCACCTCGTATTGTCTCAAAGCAAGATAAGATCTTCGAAAAAAATTCCC
ACAATTAATTCACATAGCATYCATTCCTCATAGATTACATAGTATTGCAG
ATATGGTTCAACAAAAGTTTCCTTGAACGAACGTACTTATTTTCAATGTA
TAGAAGATGTTTAAGATTTTGTGCCAAAATGGTCACAAAGAAGTCATGGA
TACACTCCCTCTAATGATGGGTTTGATATTTTCTTAATTAACTGAAAATA
TATTTTGTCTTGCATTAATTTACAGAATATAATGTACATTTATATATATA
CCGAAGTTATTTAATAATAATATACAACAATCTCTCTTCCTTAAAGTATA
AATAAATAAATAATTTAAGTTAAAGTTACATTCTAAACAGTACTCTTTTA
ATTGTGTTGGAATCAATATTTACTTAGAACTCTTGATCCAGCGACAGATA
CCGTTGTAATACTATCACATGTAGCTATTATATTTTGAAGTAATTGACAA
TGACATTCAATACATCGATGGGTAATATATTCAGTTCAAATTTTTGAATA
GAGTGGATGATCGAAATAGTATTCTTTCAGACACCAGCACACTCTTGCAT
AGTAGCCTCTCTTACCACATCTTGTGCATTCGNTGCTTTTTGCAGGGCAA
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