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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s78 | supercontig | LSalAtl2s78:713611..733542 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011436 >EMLSAP00000011436 ID=EMLSAP00000011436|Name=EMLSAP00000011436|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=127bp
MYNGLIKDSPIIFIENPYDQNDWYGWTSLTSQTDIQIVGDDLIVTNPKRI QIAAHNKSCNCLLLKMKESQYIRYNSKYDDFDNIHKPCKRLVLGQEFDLG ERLMSFLRLFSKHFTTSLLFIIEWGYM back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s78:713611..733542+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011436-707283 ID=EMLSAT00000011436-707283|Name=EMLSAT00000011436|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19932bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s78:713611..733542+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGTACAACGGTTTAATCAAGGATTCGCCAATCATTTTCATTGAAAATCC
CTACGATCAAAATGATTGGTATGGATGGACTTCATTGACATCTCAAACTG
ACATTCAGATTGTCGGAGATGATCTCATAGTCACTAACCCCAAGCGTATT
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GTAACAGCTGGAGTACCCTGGTATCTCAGAGATCCAGTGAAACTGAGGAT
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TGGAGCTCCAAGCAGATCAGAATGTTTATATTTATATTTTCAATTGTTCC
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GTTACCCACAAAAAAAACTTGTAATAAAATAAGTTGAACCCAAACTAGTC
AGGGCCGTCTGCAGGATAATATATATATTTTTTCTACGGGAGGAGAGGGG
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AAATGCCCGCCCGAATGACCTTTTTTTAGAAAATAACCCCTCAAAAAAAA
ATCATTTGCCCATAATTTTTTTTTCTCGAAAAATAAAAAAATCCTTGATT
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TATTGTTGTGTAAGTTACTATGGATGATATTTCACTTGCTATTGGTCTAA
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TGAAATATATGTATATTAAATTATCAGTGTACTTGGTTGGAGAAGTGATT
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GTCAGAGGAGTTTTTCGTCAACTCCTACATGCCTGCAGGCGATGTGTAAA
GGATTTGATTGATAATGAAGGTGGCCATATTGAGTGAAAAAAGTTTTGCA
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ATATCTATTTATTAAACAAATACGTCTGAGTTTGCTAATGACTAATGGAG
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TCAGTTCTTTATTTAGAACTGTAGTTCAGTCCAGTCCCACATGTCGGTTA
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TACATATATCATATATATATATATTCTTTGACTAAATAAACCCTTGACAT
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GCCAATCATTAATTACTATATATTTTTACATAAAAAATTATTTATTATTT
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GAGTCTTGAACTAAAAACATGTAATAAAATAATCTAAAATTACTGATTTC
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CTTCTTCTTCTTATCTACGTATGAAGGGGGGAAGAAGAAAAGGAAAAAGT
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TTTTTTATCAATAAATAGTTCAATTTACTCATTCCATAATTGGAATAAAG
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TTGATCTTAGGGCAAGAAGGGKAAAAGGGAGGGTCTCCAGCCACAACTCT
CCTTCCCTCACCATCTTCGACGACAGAGAAGTTTTCAATGTTTGGTGAAG
TCTCTCGAAAGACCATTAGCCTGCAGATGATAAGCAGCACAAACATGATG
TCCCAAATGCTTCCGACGCTCTCATGTTAATTAGCCTGAGTAAATAGAAA
ACAGAACACCGAACCTCAAAAACCATCCCGAGAAGAAAGTTTTAACTACT
TTGTCTTCTACTGTATCTCTTATAGGGAGGACTTCTARCCACCTCGTAGC
TCTATCCATCACTACAAAAGGTGGATGTATCCCCTAGACAAGGGTAGAGA
TCCTACTAGGTCTACATGTATGACACCGAATCTTGGAGGGCCGCATTGAA
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CCATGCAGCTCTCCGTCCATGTTTTTACATTCATTCTAAGATCAGGCCAC
GGAAGCTTCCCTGAACCTTCGTGTGGGGAAGNNNNNNNNNNNNNGTGCCT
TGTCTTAAAATCCTATCTTCTTAGATCCAAAGAGGATTGATCCTTTATGA
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AGTCCTGATAACGAAATATGATTTCCCAAACTTGTGAACAATCTCACAAT
GGAACTCTGAAATAAAAAAACAAATATTCGTGACTACATCAAGGTCCATG
ATGGGTTATTTCACTCCAACGCTGAACTCAACGACTTATGATCTGATTAG
ATGCCGAATTCAACAACTTCGAGCTACCAACAGAAATTAGAAACTGCTCC
TCTAACTGAAGGGAGTTCCCTGTCAAAAGATTTTTTTTTTTGCTGAGCTG
GAGTCAAAGCATTGGACCAAAACGCTAGTAGTGTCCATGCACTACCTGCC
CAATGATCAAGGGAAGCACCCATTCCTGTCAAGGATGCATCCGTTGTAAG
TGATAGAGGAGTGTTTTCTTGTCGAAAAACTAAAAGAGCACATCGAAAAA
GGGTATCTTTAATTGCTTGAAGGGCCCTTTGTTGCATTTCCTTCCACTGG
AATTCGGCGTGTTTACGCAATAGGGGATGTAGGTCCTCGTATAGTATAAG
CTGTGCATAGAACTGAACCATACCCAAAAAGGCTTGGAGTTCCCTACGCA
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TGTGCAATTACTTTCTCTCCTATGTGATGTCCTAGGAAAAATATTTGCAC
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GAAGAGGAGTGCCCAGTGCTCTTCCGCTGACTTGGACTCAATGATAATAT
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AAACGTTTGAAGGATTGAGCTGCATTTTTAATAATATTAATCGCAACTCC
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AATTATTCAATATGGCCGCCTCTAGCCTCAATCACAGTCTCCACACGAGG
TTGGACCTTGGCGTAGGTTCCCACAATATAAYCGCCAGCCAATTTTTTCT
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TTCTCTCTATGACAATCCACACACAGAAGTCGAAGGGATTGAGATCAGGA
CTGGAAGAGGCCCAGAAGATCTTTTCTCAGAAGTCAGCAAAGTGCTCCTT
GCAGAAGATGTGTCCTCAAGGCCGTATGGCGGGGKGCWCCGTCTTGGGTC
CGCACATAGTTATTCCCAGGATAGATACCCTTCAGCCAGGACCTTGTAGT
AGGCCTCAGCCTCGATTTTCTCATCGGGCTTGAAGAAGAAGGGATCATTT
TTCTTCCCATCAGATGCCACTACTCCCAAGCTTATTATTTGGGACGGATG
TTTTTGTCGTGAAGGTGCCCTAGACTCCCTAGGTGATGCTGCAATAAATC
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TTTTATTCATATTAACTCATGTTTCGTTTAATTTCGATCAAATTATACAA
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AAAAAATATCATTTTTATGATGCAGAAAATTTCTTTATCGCACTCTGTAT
ATAAAAAATAAAATTTTAATGTTTATGAATGCGAGCAAAATATAAAAATA
AATTTTGTTTATGAATTTAAATATTATAATGAATTATACTTTATTTTTGG
ATATTCATATTAATTGGGTTGATGTTGTACTAGTCTTGATTTATTTGGTC
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AATATCAGTACTAGAGCTGATTTAAGAAAATAAATAAATAAAAGTTGAGT
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ACGCGTAGTACTTCCAAAAGAGATGTGGGTAACCTAAAAACTCCCCGCAG
TTCCTCCCAATTGCCTCCTATACTCTCCCCTTAAATGCTTCAATTTGATA
CAGAATCACGGAGTTTCAAAAAATTCAACAATTAAACTCGATACATATCT
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TTGGCAGAAAACAACAAATTTAATAATTGAACCTGAATCCGGATAGTTAC
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TTATTCTTCATTCAAGAATTTTTTTAAAAAGGAGAACATTTTCGAAAAAT
AAAAATATATTTTGCTGGGTGCAGTTACCAAAATACAAATTACTCTTTCA
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GCTGTCGTTTAATAGTCGATGAGATTTTTATAAGAGCGCATGGAAAAGGC
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AATTTTTGTATATTTCCCTCCTTTTTTTCTAAGCCTTTAGATCTATATAA
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TTAGCTTTACATCCTCTTAAAATGTATTAATTTACACTTTTCCTAGTATG
TAATAGTGAGTTGATGAGATTTACTTCATATCTTAATTAGATCATCCCCT
TTATTCAAAAAGAAAAAAAATCTTATTTGAGGGAGGGGGAATAAGGAGCA
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TGAAATATGATTTTTATAAAGTATAACCATTTTTATTACCTATTCATAGA
TCTAATATCGATTTTCTATACTTCTTTATGGCTTTTTTTATATTCATAGT
TTCTTTTTAATGGCCTGTGTTCTCTCTCAAAAAAAAAAAATTAAGTTAAA
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AATGGCTTTCAAGTGACTAATTGAATTCTTTCTTTCATAAGATACATTGT
TTATAGGCTTTTAAAGGCTATGGCCATAAGATCTGATCGTTAACCAAAGC
TTTTGGTTTACATGTAACACAATGGGCATCTAAAGTCATTGTGCACGTCG
ATAAGAAACAGTTTGTCGTGGAAGCAGAAATTAATCGGCAAAATACAGGA
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TGTTATAACATTTCATTAAGGCTGGACATAAAATCAATGCAGCTGAATAC
ATGAATATCATTCTTGATTACTATCTGTGGCGCTTCCTTCAACAGCAGGT
CAAAAAACGCTGCAAAATCATTGTTAGCTCTCTGAAGGCTAGGATCACAA
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TTCAGGCCAAGGATTGCAAAGGTTATTGAAGGCTGAGGAGGTCACATCAA
ATAAGTCAAAACACACGATCACTAGCAACTACATACTTCACAATTTGTCA
TTAGATTTCAACAATTAATAAACATGCTATAAATATTACAATTTGCACAG
AAAATATGACAATTTTTCTCTCAAGCCCCCACACTGATGATAATTTCAAA
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ATAATTCTGAATTGACGAAATTTAATCATATTACCTAATTGGAATTGGAT
TCATTTCGGAAAATAACATTTTTTTAAACCTTTACAAAATTGACAATTAC
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TATTTAATGATGAATATTTTGTATTAATACAATCCTCTAAAATCTCTTAA
TAAAAATTAATTTATAGATAAGCAAAAAAATGACCGATTATTAAATATTG
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CAAAACTGTGTAAATCAAAATTTTAAATTAGTACTGTCAATATGAAACAA
AAAATATAACTTTTTGTTTATTAAAAAGGAAATTTTGTTGTCACACACTG
TAAATATAATATTTGTAAAATGAATAATAAGTAGACTTAGAATTTGTGAG
CAATTCTCACACGCTCAAAAATTGTGCCCTTTGACTTTTTGGAGGAAAAA
AGGCTCATTGTGCCATTTTTTTTCTTTGCTCTTTTTTCTAAACTGTTGTG
AAATTTTTATAGGAAATGTGTGTTGTAATTAGATTTCTCAACAGTTTTGA
TGATTCTTTGAGGATATTTTTGTAAGGAACATCCATTTTCAAAAACTCTT
CTTTATTAGGCTTTCTTTTGGAGGTAAAAATAGGTATTTAACGTAATCAG
GGCTACAATTACATGATGGGATATGTTAAGGAATCCAGATTCCCACAACA
ACCATTTAGAGGAAGGATAAATTTGGCACAAAATGGCCTGTTTAATAATC
CCCCGTTGAATGTTGCAACATAGGATTTTGCTCCAAATTGCGAAATCCTG
GTCTTCCCTTTATACAAAAAGTTGCATGTATAATTAGTGGTGATGATATG
CCTCCGACCATCAAGTCTCTCGAAGATCACGTCACACACTTCAGATTTGC
TTCAACTACTAGTGTGGACGTAGAACGGTCTTTTAGTAGTAATAATACTG
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CAATATAATCTATGAATAAATTATGATCAATATAAAATAACAATGATTAC
TTGAATATTTCTATATTTTTTTATTTAAATAAAAATGCCTCAATTTTGTT
ATTTTGGGATCTCATTTTTCAAAATTATAGCATTATTTTTTTCTCATTTT
GGCTCAAAAAATTCCTCCAAAACTTTAAGTCTAGTAATAAATAGCGGAGT
TACGGTATGATTATATTTGGTATAAATTTATTTAATAAAAGTTGAATATA
TGTAATCAAAACAAACCAAGTAAATGAGAAAAAAGTGAAAAATATTTTAT
ATAGTTAATAAATAACGAGGTTTTCCTTTCCCTTTTTTGAAAATTTTGTC
TCCATGAGAAGAGACATTGACTTGCTTTTAAAAAAGGAGGAGGAAGAGTA
AAATGTGTATTTGATTTTTTATTTATTCATCATTTCTCATTGATGTCTTA
TTGAATATTTATTACTAGATTATCTTTCCTTCGTAAATAATAATTTGTAA
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ATTAATAGCCAATTTGCTTTCAAACCAACAAATAGTTCGTTTTTGGGTGT
TTTTTTTGTTTTTTTTTGCTCCTTCTAAAAAGTTTGAGTATCTTCTGCAA
AGTTCGAAAATGTCTTGATGCGTTTGATATATATTATTTATCTAATATGA
AAGCTCATGAGCAGTGCAGTAAATAATGGAAAATGAAGTACGAAMACTTT
TCACATTGGTATCCAACCTTGGATTTAGATTATTTTAAAAAGAAATTATT
ATTTCTTTTTAGACCGTGTAAGAGTTAAATAATTCTCCAATAACGGATAA
TCTCTTGGTGTCTTCCTCATCCATAGCTGAATAACTGAGCATTCAATATT
TATCGATTAAATTAAGAGATTTTCATCTTCGTCTATTGGACATTTATTTA
TATTTTTGTTTTAAAATAGACCGACTGCAATATTTGTGTAAGTGGGTTTT
TGTAGTTTCACTTTTTATTAAATTAGTTCTTAACTTTCATAATCAATATA
AAATTAATTTTAAGGCTCGTAATTTACTAGAAAATATTACATTACTCTTC
TATTCTAGATTTATGGGAGTCGAAAATTGCAACATACCATAAGTTAACGT
ATAACATCCTTTTAATTTGTAGAAAATATTATACTTGTCCTAAAATTAAA
CAATTGTCAAACGAAGTCGCATGTCATGTTTCCTAGCATCTATAATGGAT
TGACTCTAATTATGTATATGAACTTAGTTTTATTGCCATTTTTGAGAAAA
AGGTGAAGACTAATTGTGCTATAATTCATATATACAAATATTTTATAGTA
TCAATTACTGTTGTTTATAGATTTAGAAAAATATTTTAGAATAATTTAAT
ATTAACTTACATTATTTTTGCTAAATTTACACGACGATAGCTTGTTTAAG
CATAAAAATTACACTGCTGATACTCTTGAGTACAGAGAAATCGTATAGTT
AATACTTTTTTTATAAAAATTATATGATCTTAGTCGTATACAGGGTCGTG
CACTAGAATTAAAGGAAACTTTGACCTGATCCACATCCTGTATGAGTTCA
TCCCCACTAAGATTTTCCTTTTCATACAAAAGATTAGGCGATTAATAAGA
TAAATCTTTATTTTTTTAATTTTTACTCAGGTTTTGAGATGGAGAAACAA
GATAATGACAACAAGATAAACATAATGTAGTAGGAGTATTTTGATAATTT
GAAAATTTCACAATTATTTGAATGTAAATAACTCCAGAGTTAATTATGCT
AGATTCATATAGTTGATGCCATTTGATCTCTTGTTATTCCACATTGGTGC
AATTAGTTTAGATTAGGTAATTGGAACTAATTCTGGGACAATTTATAGAA
GATTAAATTTTTTCTTTATTAAGTAAATGGTAAGGATCGTTTTTTCAACA
TAAATTCAAACTAATGCAAATATTGACAAGCAAGAGTTGAAAAAGGATCA
AATGTCAGCAATACCAACGGTTTCAAATTGTACGACAAGGTCTAATACAG
TTTTGAAATTTTGATTTGTTTTCACTAATCGTTTATTGCTTGAAAAAGTG
CATCACAAAGAAGAACATTAATTTAGGCCAGAAAATACAAATGTTTTTTT
TTGTATTTATTCAAAACTTGTGAATATTCAAAATATCAATTAACGCTAAA
ACCATAATTTGACTTTGAAATCAATATTTTCAACTCTGGGAACGTTTATA
CAAGTTTAATATTTTTCTTTATTTATTAAAATGATCACTCCGTGGAAGAA
TTTAGGCCTATGAATATCATATTGACAATTTATATGCTATTATCATCTAT
TAAATAGAACCAAAAATTGTCATTTTGCATTTTTTTCTGGATCTGATTAA
GGTTCAAATATTTCCCAACTGCGGTGCACGACCTAAATAATATTTTCTTT
AAAATGTGTTCTCTATCTACTACAAAAGACAATAATCAGAATACAAAATT
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TTTCCCCCTCCAAATTAAGAGAAAAAATTCAAGTAAAAAGGAAACCAAAC
GGTACTCGACAAAAGCATGCAAAATATTGTTAAACATCTTTCCACAATCT
TCACAGGGATCATTAAAAAATAAAACAGTCTGTCGAAATCTGGAATTGAG
ACGTAATTTTTTTTGTTTCGACAACTCTATACTAAGAATTCTAGAGTGTA
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