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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s790 | supercontig | LSalAtl2s790:293938..306129 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011461 >EMLSAP00000011461 ID=EMLSAP00000011461|Name=EMLSAP00000011461|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1313bp
MTSTSERSDSLILYVNGHKIVEKSIDPRLTLSTYLRSHLGLSGTKVACGE GGCGACTVMISTWNGHTVSHKSVNACLIPLVSMHLCAITTVEGIGSTRTK LHEVQKRLADAHGSXCGXCTPGFVMSMYSLLRNKAVPDMEDISTYFQGNL CRCTGYRPILEAYKTFTDTKFGEGNNYKRITTGKCPCKVNEEEPTDIRSN VLKCDPTQEAIFPSELKEMHPPKSRKYIGPDLIWYVPLNLKELFNIKKSY PDARIINGNTEVGIEVKFKISKVHVNDLHNIEINDNFLQIGASCSLSKIE ELCDHLIESEKHSKMQIIKEIKFMLQVFAGKQIRNVATLGGNISTGSPIS DLLPILLSTSSILRVGSATYGLRDVTLDSKFFLGYRKNMLKNEEIIINVL IPFESQNEYFKTYKISKRIEDDIAIVNGAFLYQICPTTTNILKAKVAFGG IGPYTKLLNQTNSFLQGKPWNESTFELAMNRLLDETNIPMGSPGGMERYR QSLVLSLFYKSFLDINTERSGKVTSQYKEKEFKSIQLYDFSLSQGKNSVQ GTIQKPKKHISADLHTTGEAKYVDDYNKTENEIFCVFVYSRMSNALIKSI EYSEAVNSPGVLGFISSKDIPKESNLFCVSLLKDELIFADTKVNCYGQII GAILADTREHAKDGASKVQVDYEKLDPILTIEDAIESSSFFPLPHSKLQA GDPSNIFESCDHIIEGKVQTGAQEHFYLETQCGLIVPTETGILAHSSTQN PTETQQCIAKMLNIPMNQVNVSVKRLGGGFGGKETRSIPFTLAAAWAAVQ YRKPVRFALERDEDMIMSSYRHPFLGKYRVGFNDGGIIQCVDIKLYANAG WTMDLSFAAMERAMLHCENSYRIKHLSIEGFCCKTNLPSNTAFRGFGGPQ VMMIVENYIERVGDTLNMSPESIREINMYQEGDVTYYGQELENCSLRRCW QECEALSQFSERRRSVDEFNLGNKWRKRGLSMIPTKYGIAFGLPHLNQAG SLIHVYKDGSILASHGGVEMGQGLHIKIAQIISTVLEVPLSIISICNTMT DKVPNTSATAASVGSDLNGMAIKAACEEINKRLAPIVDSYPKASWNEIIT LAYESSISLSCTGFYSTPDLGMNWKEGKGRPFNYFTYGVGCSVVEVDLLT GMHCLLKTDIVMDLGESLNPAIDIGQVEGAFVQGYGLFTMEQLLHTPDGE LITKGPSNYKIPGFKDIPKEFNVSLLRGSKNSRAVYSSKAVGEPPLFLAA SVYFAIKDALKYARKENNEDIIFNLEIPATSERIRLASNDWIISKXPPLS LSSSGNKPWSIQV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s790:293938..306129- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011461-707308 ID=EMLSAT00000011461-707308|Name=EMLSAT00000011461|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12192bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s790:293938..306129- (Lepeophtheirus salmonis) AGGAATTCGAAGGATGACATCTACGAGTGAGAGATCCGACTCTCTTATAC
TCTACGTAAATGGTAAAAGTAAAAAAAATTATTTTGTACTTTTCAAATAA
AAGTACAATTACATACTATGTAGGTCATAAAATCGTCGAAAAATCAATTG
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AAACAGCTTATTTTAGATGAATGTGGTGTTGTATAATTGTGAAATACATA
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TTTACAAATCATTTATCGAATACATAAGTGATGCATATGCTTTTTGGGTC
CTTACTTCCTTTTTTTAGTTTTTAACGTATGATGCACTTGTACATATATA
TATCTTTGACCCGTTGCAATAAAAAAAACAAAAAAACATGCTATCCGGAC
AATAGCTTGAACTGATAATATAACTTTCAATATTTGGGTGACTTATATCT
TCACCAATATTGAAGCTAGTAGGTTCAAATTTTGCTATCATCATCAAAAC
ACCTAGTTCATAGATTGTCAGTTTTTTAAACTATCTATATTAGTTATAAA
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AAAATGTTGTTGTGTACTAGTAGCTACTGAAGTAAATTATTGTTATCATT
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GCCTGTCATTTCCACTCATGTAACACAGCAGATTTGTTAAGTTTTTTATC
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TCAGAATTTCAATCTATGATTACCCCCAAAAAATTGTTAAACTCATTTTT
TGATGTCTTGTCAGTTAGTATGCTTTCGTGCTGGGTCGTGTATGGGATAT
AATCAGAAAAAAAGGACTTACAATAATACAATTGTTGAAGTAAAATACCA
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TGACATAACATAAATCGTTAAAAATATAAGAAGAGTGATTCTTCACAATG
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CTTATATATCCCGTAGTCTGTTTTTGGTGTTATCTTACATGGAATCCAAA
ACAGTATTACAGATATATCTGAAATTTAGCAAGAAAACGTATAAAAGGAC
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TGAGCCAGCTCGCCACTTGGTTACAGAGTTAAATATGAGATCCTAAGATT
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ATTACTTAACTTTTATTACTTCACAATTAAATTTATATTTTAGTTTATAA
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ATTATTTTTAATGTGAGCGGTTTTTTATACCCATGATAAGAAAAGGCATA
TTTGTGAACAATATTGATAATTAATAAATCGTAAAAATCTACAATTAAAT
CTTTCATTTTTTTGAGGAAGCGTCTTATACTAAAAATATATTTATAATGA
AGAAGTATTCTGTTTGTCTCTAATCTATATTAATGAAGTAAACCTTATAT
CTCTTCCCTTCTGTATGAATGTATGTCTAGACAAAGTCATAAGAAATAAC
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GCATTGAGCATGTGTAGCTGCGACTAAGCCAAGTTGTACTCTAGAGACTA
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AAATACTAGCGGCATTACCCAGAGTGTTGACGATTTTGATTTGATGACTC
CTCAACAAATCCTTAGTGTAAAACTCCGTTTTGCATGTGCAAATTCCCAC
CGAGCTACTCACTCAATAATTAGACGTTCTCTCCTCAAGAATTAATAACA
GCTTCAGAAACAAAAATCATACAATTTGATGAGCCAAAGAGTACTTTACC
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TTTGATATACTGTACCGACTGCTGGGCATGAAAGACAGATTTTGACGTCA
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GATAAGTTATTATTTCCATTATAATAATTAATTATCTACAAGATGGATAT
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GGAAAATAAAATATTTTTAGTTACAAAAATTTTTTCCAAATATTTCGTAA
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GAACAGATTATTAGATGAAACCAATATCCCGATGGGATCTCCAGGTGGAA
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TGATTAAATCCATAGAATACTCAGAGGCAGTCAATTCCCCAGGAGTTTTG
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GATGGAGCTTCAAAGGTACAAGTCGACTATGAAAAACTTGATCCTATTTT
AACCATAGAGGATGCAATTGAATCATCATCTTTCTTTCCTTTGCCTCATT
CTAAGCTTCAGGCAGGAGATCCATCAAACATTTTTGAAAGTTGTGATCAT
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GACACAATGTGGACTAATTGTTCCCACCGAGACAGGTATATTAGCTCATT
CTTCAACTCAAAACCCTACAGAGACTCAACAATGTATAGCTAAGATGTTG
AATATTCCTATGAATCAGGTTAATGTGTCAGTCAAACGCTTAGGAGGTGG
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GGGCTGCAGTTCAATATAGGAAACCCGTTCGTTTTGCATTGGAAAGAGAT
GAGGATATGATCATGAGCAGCTATAGGCATCCCTTTCTTGGTAAATACAG
AGTAGGATTTAACGACGGTGGAATCATTCAGTGTGTTGATATTAAACTTT
ATGCTAACGCTGGATGGACCATGGATCTATCATTTGCAGCGATGGAAAGA
GCAATGCTTCACTGTGAAAATAGTTACAGAATAAAACATTTGAGTATAGA
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GGAGATACACTAAATATGTCCCCTGAATCAATCAGAGAAATAAATATGTA
CCAAGAGGGGGATGTAACTTATTATGGACAAGAGCTAGAGAATTGTTCTC
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ATTATCCATGATACCCACTAAATATGGCATCGCATTTGGACTTCCTCATT
TAAACCAGGCTGGATCACTCATTCATGTCTACAAGGATGGTTCCATTTTG
GCTTCACATGGAGGTGTAGAAATGGGTCAAGGTCTTCACATAAAAATTGC
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GTCGGTTCAGATCTCAATGGAATGGCCATAAAAGCTGCATGTGAAGAAAT
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GGATTTTATTCTACGCCGGATCTAGGGATGAATTGGAAAGAAGGAAAGGG
TAGGCCCTTTAATTATTTCACATATGGAGTTGGTTGCTCGGTGGTAGAAG
TGGACTTGCTAACTGGAATGCATTGTCTCTTGAAAACAGATATTGTTATG
GACTTAGGCGAGTCTCTTAATCCTGCCATTGATATTGGACAAGTTGAAGG
AGCTTTTGTGCAAGGCTATGGACTATTTACAATGGAACAACTCCTTCATA
CACCAGATGGGGAATTAATTACCAAAGGTAAACAAGGAGAGGGGGGATAA
CTTTGTATCTTTTTATAGAACTAAAAGCAAAACGCATCTATTAATAGGCC
CTAGCAATTATAAGATCCCTGGATTTAAAGATATTCCAAAAGAGTTTAAT
GTTTCTTTACTAAGAGGATCCAAAAATTCAAGGGCTGTATATTCTTCAAA
AGCTGTGGGAGAGCCCCCTTTATTTTTGGGTAATTCCTGTTGTATAAAAA
GTTAGAACTTACATATATTTTCCATGTTTTTTTATTTTCATTTCAAAGCT
GCGTCTGTATATTTTGCAATCAAAGATGCTTTAAAATATGCAAGAAAAGA
GAACAATGAGGATATTATATTCAATTTGGAAATCCCTGCAACCTCAGAAA
GAATTAGACTAGCCTCCAACGACTGGATCATTTCTAAAATKCCTCCTCTA
TCCCTATCATCATCAGGGAATAAGCCATGGAGTATTCAAGTG back to top
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