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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s794 | supercontig | LSalAtl2s794:281844..292908 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011488 >EMLSAP00000011488 ID=EMLSAP00000011488|Name=EMLSAP00000011488|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=352bp
KLDYVCKGNGNCTIDVARRNQCQSCRFKKCLMVKMKKEAVQQERTPRISC
IKATQTTSYTFSNLKNKSSKANPISSRRLYLLSTSFRESSNTEIIDDTYL
TKNILSTVVNSKKENIVINIENNKKCIETILNAPSHKRTTPSFQFYPSPT
ITLLSENSLHEISVKLLFTVVHWAKSVPSFVEFSVNDQNVLLREAWSRLF
ILGTAQWAILINEEKLMLNCEEKSKDHTNLLFHHAKKMTKIVQKIRDQNL
DYNEYTILKALILFSPEGNNLIESHQVEKLQDQTLIMLEEYCSHNDNRVN
KPKYTFNLRRFGKLLLAFSNIFQITSKDVESLFFQKTLGSISVDRIITDS
FK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s794:281844..292908- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011488-707335 ID=EMLSAT00000011488-707335|Name=EMLSAT00000011488|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11065bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s794:281844..292908- (Lepeophtheirus salmonis)
AAACTTGATTATGTATGTAAAGGAAATGGAAATTGTACAATCGATGTGGC
AAGACGTAATCAATGTCAATCTTGCCGTTTCAAAAAGTGCCTTATGGTTA
AAATGAAGAAAGAAGGTATTGTTAAATAATTGTCTAAAATTGATTAATAA
TGTTTTTCTAAATAAAGGGTCGGTTCAACATTAAATTGTTAGTATATGGA
AACTATCCTAATAAATTTTGAAAATGCATCCGAACCTCCTAAATACCCGC
CTTAAATGATTTTTTCTTCCTTAAACAATTAATCTTAGATTATAAAGATC
TATTTAATCTTTAGGGGAGCTCAAAAATTTTTATGTGAGGTTAAAACGAG
ACATAATTGCTATAATAAATGAAAATGTCTATGATAAGAGGATTCATATA
TACCAGGTGTGACAGCCTGTGGCTTTATGGAGACCCTTTACTGATCCCCA
TAACAAAATTAGGACACAAAAATTGTTTTATTACAATATTTTGAGATCTG
TGGTGAATTTATCTTTGGGTACATAATTTAAACTTAGACTCAGTTTTTTT
AATCCTAATTCTAATCTGAGTTTATATTTCAGGACTTCTTAATATCGCTC
CAAGTCATTTTTAGCATATAAGATAATCATGAGTTTAGTCTCCGTACCTT
CTCTCCTCACCTTCTTTTATAATATTTATTTGAATCTATAGAAATGGGAA
CTCACATAATTATATCAGTTAGAGCCCTGGGGTATGCTATAGGAAAGTAT
TTTTTTTTTTCTTGTATGCTTTTCGAATCATATCAATGCCCAATTAACAA
CCAATAAGAAAGCAAAAATACCTTTAAAGACAAAGAAGAGAGCATTCTCA
AGTACTCCCTTCATTGCTTGTATTTGTAAACATATGTTTTGTTAGTACGT
AAAACAAAAAAGTAAGCAGAATCACGGCAAAAATACAAATTTTACGCTAC
ATAGTTATGATTTGTTACAGTTTTTCGCTTGTTTATATTTTTAACTACTG
GCTGCAATAATGAGTAATGGTTTTAAACTCTTGTGTAGGTAAATTGAAAT
TATTTTCATTATTTTATACGCACTGGGAAAAACTGTTCATTTTCGTCTCT
TTACTTCCTAAATAGCTCAAGTTTTACTGTGGATTCCTATGAGTATCTTC
TGTTATTTGAAAAGTGTAATGCGATCGTAGACTCTTAAAAATAATTTGAC
CCTCTACTCTTTTTTTTCTTTGCCCAGAGTTTGGGCGGTTTATTATCCTT
AAAGTAAACATATAAAAATAAGCAACTTAATTACCTTCCAAAATAAACAA
CCGAGCATAAATTAAAATATAGATGTTCATAACAATATAAGCATTAAAGT
GAGAAATAAAGTATTTACATATCCAAAAACCTTTCATGTAACTCAGTATC
TCTCATACAATATCTGTGACAGTCGACTCCTTATCAACGTTTCCAGAACA
CTTTTAAGACCTTTGTATAGATCAATCTTGTGCTTGCTATCTAAAAACAT
TCAGAAATGAGCMCTCCCGAAATGTTCCTCCGTCCAAAGTTMCCCTATCC
AGTAAGAGTTATGTGATTTCCATAAAATATWAAAAGACATGACCTAAAGG
CCGCCATATTTTAGGGGATTAGGAATTATCATCACTGATATATATTTTTT
CTTATTTAATTTTAAAAATGTCATCTCTATCACGAGAATCTGTGTGGCAA
TTTTTTSATCATACGGAGTTACTCGTAAAAGGTGAATCACTTTTGAAATT
ATATACGCGTTGAAATCCTGAACTTTGTCCCTAGTCTTTAGATTGAAGGG
TGAAAAAAGCGACATGCCCCTCCCCCCCCCCCCAATCTTTCTGGTGATAT
CTTCTAAAAAAAATTCTACACACTCTGTTCCAATTCAAGACCCTTATAAC
TTTATTCTTTCTATCGTGGTAAAGGTTGGCCATGATTCTTCAATGATTCC
ATGATATAGGCTGAGTATATCAGATTTCTCAGGGTTTATTGTTAGTCCAG
AAACTATGGAAAAAAAATCTAGCGAACGTAAAGTTATTTTTCAGGTTTTA
TTATTTGCAGTGGATCCCCCAAAAAAAATCATAATTAAGTTATCTGCATA
AAAAAAACACTTTGGGCGGAACGAAAGGGTCGAAAGAACAATTATGTTAC
CATCTATTTGAACTTTCTGGATGCCAACTAGAGAAAGTCGTTTCTGCTTT
TTATGAGATATTTGATACAACTTTGCCTTGGACTAAWAAAAAGGGGACTG
ATCMCTTATTAAAAAAAAAAAAAACTACCCTACAGGAGGAGCCAAGAAGA
TGCAACAGNAGNGGTAAGCATCTCCGTACGTCAGTATTGCACTTTGTCCT
CTTAAATCTACAAAAAAAACCTTACCCAACCGTCTACCACCCAATCAGGG
GTTGATTGTGTTGTCACGGCAAATCTATCATTTTAGCATAATATACATTT
ATACACCCCAAGTTATCATTATTACAAGTATGTCCATGTCCTTCAACTTG
TAGTCAAGAATCTTCTCTGTGGTATAACCCTGTTGAGAAATACAATGGGG
AAAGTCCAAACTTTTTACAACTTCATTGAACGGTCACCAAAAAGGTCAGC
TATCTACAAGTCGGTGAACATAACAAGTGAAGATAAGGAACTTGCCCAGN
NNGATGAGCCTGAAGACCCAGTCTGCAACCTCGTGGAGTCTCCACTCCAA
TGCCGAACACGTTGTATCTCTAAAAATGGTCAGAATCATGAAGACCCTCA
TAATAATGAGAAAAGATAAAGAAGCATTGTCGAGTTCAACACGAACTTCT
CTGCTGAACAGAATCTTTAAGTCACGGATTTGTCTTCTCCCTTGAACTGT
TGAAGTCACTCCTCAGACTCACATCTAGCATGTCAGATGAACTTCAAGAC
AGAAATGTTGACCTAACAAAGGGCCAGAAATACGTCAACCTAGTGATGAG
TACTCTTGAAGATCTTAAAATGAGAAAAGCTTTGAATCAATATGGAAACT
TGCTGAGCTGAAGTCGTCTGAGCTAAAATCCCTAGCTTACCAGATAGACT
CAATTCATTTGAGCTGGAAGGAGGAGAAGATTATAACGAGATGAAAGTGG
AAAGGAACAACTGAATCCTACTTCCGCGAAACACAGTGTTAAAGTTAATA
AGATTGCATTGGAGATTGAGAACAAAAATACAGACAACACATTGGATCTC
ATTACAATCGTCAATGACAGTGAGTGGGAAACCTGTGTCATGAACCGTGT
CGCCAAGTACTATAGACTTAATCTCGAGCAGCTCCAGTCAGACCAAACAA
TCTTCCGGCAATTCAAAATAAATGTTATAATATTTCATTTTGCAACATAT
TTGACATAGAAGACATGGTTTCGTCACAAATTGTTGCGGAGTTAATAAGC
TCAGGAGTGTTCCGACTGATGCCAGAGCTATACAAGGTGATCGTGATCCT
GTCCTCTATTCCAATCAGCAGCTGTGAGGTGGATCGGTCATGTTCCTGTC
TCAGAAGACTCAAGAAGCACACGAGGACCACCATGGGCCAGGAGAAACTC
TCGTCTCTCATCCTCTTGAATATGGGCAAGGTGCTCCATGAGGACAAGTT
GAATTTGATTGACACCTTTTGCGTCAAGGAAAGAGAGGAAAAACTTCTTC
CCTTGATAAATATCCCTTTTTTTCTTCCTTTATTTTCAACATGTCACTAC
GTATACATGTGAGTTAAGAACATCAAGACTTGTGAACATAGTCTACTATG
TTTTCTGTACATTTAATCGTTTCATGGTCTATAATAATCTCGTTCATTTA
CTTCCTTCCGTTATTATTTTCCCAATATTTACGAGGTTTAAATTGTTTGA
TTTTATTTGATAGTTCAAAACTTTTGCTATCATTCTCCCCCAATGAATTT
TTTACTATATTATACTCCTTCCTTGCTGAATAGGTACCCATTGACTTTCC
CTCTATAAATTTTCCTTCTGATTTTGCATTTATCAATGTTTGCCTGAATA
AAATAACAGTAAGACAGTCCATTGGACGATATTCTTGTAATATCTAATCT
GGGCTGTAGCATTTGTTCTATTTAAATATCCACGTTTATCACTGAAAATC
AACCATTGACCCCTGTAAAGGAGAACCAAAAATCATCCTGAGAAATGGTA
CTGGTCGTAGATATACATCGACATAAGTTCTTCTTGCAGGAACATTATTT
GCATAAGGACAGTCTTGTTCGGTGTTCCCCTTTCCTTAATACATATTTGA
TCCTAAAGATAGCCCAATAAGTTCTTAAATAACATCCAATTCTGAAGCAA
AANGAAGCAAAATGAATCAATATTCAATACCTTGTTATTCATTACAATAC
TAGAAATGAACTCCAGAAACAATATGATGTAATGTTTTCAAAATCTAGCA
TGTAATATAATAAAAACATTCACATTTAAAAAATACCTTAGGTTAATTCC
ATGCCAAATCCATCACTCAAAAACAGCACCATCTTTAATTTTTTAATCAA
ATTTGGTACATAATATAATAAATATTAAAAAAATAATTAATATTGGATAA
AAACTAAATATAATAAAATTCAGCCTTTTTGTCCTCCAATTTAAGATTTA
GAGGCTTTTAAAGTTTTGACCTTAACGCCAACTACACTATTTTTAAATCG
CTGTACTCGAATGTTTTGAAGATATCGATATATAGATAACTGTTTTATTC
TTTTGTTGTATTTTATTGAATAAGCCAACAAAATAAGTTTTTAGCTGTTA
TTTAGGATTTTCAATTTTACTTAAATTTTTATATGTTAATCTATTATGTA
TCATAAATATATACGAAAAGTCTTTAGAGATACCTTCGATTCTACTTAAA
TACTACAGATGAAAATGTAAAGAGCAAATTTCTGAATATATGATAAATTT
ACATACGGGGGTGTCCAAAAGTCTTGAACATCTTATATTTGGCGGTAAAG
TATACTACCTCTAATCTGATTGGTTGTTATACATTCTGATTTCAATCCCT
CTCTTCTTATGTAAAAATATTACCCTTAAAGGTATTTTTATTAGTCAAGA
TGCATCATCTAAGAAAAGTAGTACAGAATCTTCATCGTGCTTGCAAAATA
TCTCTTCAAATTTATCCGATTTTGAGACCTGCAATCAGTCTCAGTTCTGT
TAAATATAACATTACTTAGATTAGATGGACTGGAAACGTTGATGATAACC
CAAGAAGTGGACGCCAAGGAATAACGTCTGAAATGTTAAATTAAAAATAT
ACAGAAACCCGAACAGATCAATGGCAAGAATGGCTAAGGAGATCAAATTG
TCAAGAGCTTCGATAACTCAAATCATCCATAAGGACCTGGGGATGGTTTC
TCTGAAGTTTCGTTACTTTCAAAAATTTAAGCGTCACAACAACCAAATCT
TGGCTTCATCATCAAAACATATATCCTTAGACCAAAGAACAGTTCCGTAA
CGGGTTAATAGTCGATACCTTTTAGTTGGGCAGGGAGTTCAAGTAAAGGA
GATAAACTTCCTTTGGTTTTTATTTCGGAGGGCCTTCGTATAAAGATGGG
TGACTAYTATCCATATTTTTGGAACCTGCGGTCCTTCCGTGGCTTAAAGC
AAATTCATCTAAAACAATTAAAGTAATCTTTCAGAAAGATGGAGTTCCAA
TACATACCAGCGTTCAATGCCAGGAATGGCTTGAAGCAAATATTTATTTT
TGGGACAAATCTATGTGCCCCCCTTTGATTCCAGATCTTAACCCCCTCGA
CCACTTTGTGTAGAGTTATCTTGAGTCGAAGGTAAAACTCGTCAATATTT
AAATTTGGAGGATATCCGTGCCACAATTTAGATGATTTGGGTGAAATTCC
CCATCTATCGTGCGTGCAGCATGTGAAGCATTTCAATGACGTTTAAGGGA
GGTAGTCGATAAATGATGCAGTTATATTTAATAGTTTATAAAATATGTTA
TGAGATTTAATAAATTTTCTAAAATATTTAGTTAAAGAGGAGGGTGCGAT
TAACCCTTATATGGACGAGAGTAAAATAGAGTGCGATATATTATTGGTAA
TTATTATTCCCTTTTACAAAGTACTTTATTAATAAAATAGATTAATCTAG
AACCAAAGTAAAGTTAGAACAATCATATCTAAAATTCTGGAAGATAACAT
GATAGACGAAATCTCCTGCAAAAGATGGACTCATACAGACAGATCTTTAC
TTAAAACAATTGTGAAATCAAGTCAAGTCAACGTTCTTTTTTTGATTAAT
TTTACTTGGAATGATCCCTTATTTATTATAAAGGGGAGCAAAACAAAAAT
TCAAGATTTAAAAGTCAACTTAGTAACTTTTCTATTTGTAGACAATTTTT
CAAATAATATTTTTTAGATTATTGTATGTTACTATTTTTTAAATTTTTAC
TTAATAAATTAAAAAATTTAAATGCAACTTGTGCAACATAATCCATAAAA
TGATGTCCTTTATCACACTTTAATTTAATAGGAATTGTAAATTCTTCACA
TTTTAATATGTGGACAAATTTTTCCAGTAATAGCCTTCTTGGATTTGAAG
AGTTTATTAAGACATGTTTTGCTTTTTTTTGATGAAAAGATAATGGCGAC
TAATTGATTTGCATAATGTTCAGTTAAAATATAATATAAATTATTACTTC
GTTTATTTGTGAAAAATAATAAATTATGAAATAGCCAAGAAGTATCAAGG
AAGACGAGGGAATTAACAGCTGATACAAGATATTTTTGTGCTAGTGAAGT
AGTACTCTACCCTTTCTATAATAGATGAGTATAAAAATTGGAGTGCATTT
TATGAAAATAGATGACTGATACTCTATATAACCCCTATAAAGTTCAGCCC
AGAGGCAATAATATAAGTTATTTGACTTGATTGATAAAAACAAATATTTT
AACTGTATATATATTCAAAAATATTAGAAATAAGTCCAAAGAATGATCTA
ATATATTATTCATATATCGAAAGAATAATCTAATATATTATAAATATAAA
ATAAGCTATATATGTACTACTTGTAATCATTTTTATACTATCAATTTTCT
TTTTTGAGGTAAATAAATTTGGATTCCAAATCTGGCAAACATAATGAAAA
ATCGATTGGTCTCTCAATCTCGTTCCTTGATTTTCAAAACGATTTTTTTT
TTAGATTGGCATTTTGAATCATACAATTGGTACCTCTTTTTAAATTTAAC
TCTTTCAGGGCATTTCAGGAACTCAGTTCAAGTTAACTTTTGGTTAGACT
TCTATGTCATCCATGAGTCAGGATTATGATCATCCATTTCAAGAGATGCT
CGAATTCCTAATTTTTTCTAGTATATCTTAGGATTGTATTGATACTTGAT
CTATGAAATAATAATTCAATTGAGGCCTAAGCGTCATATAAAACAGAAAA
AAAAGAGAGTACTCCTTGGCTGATCACGTAATATTAAAAAAAATATATCA
TATTGTGGTCATTATTATTTCATTCTTGATAAGAGAACATCTAAACTTAT
TGAATAACAAAATGTAAGTGTATTGACAAAAAACAGAGAGTAACATTGAT
GATTTCTTAGCGAATTTGCTTGTTTTTCGACACCTAATAACTCTGGATAA
TGCTAAGTACTACTGCTTGTGTATAGTAAATAGAATATACTCCAAAAAAA
ATTCTATTAGCTATTTAGAACTCATTGAAAGACTAAAGATTATTAATTGC
ATAGTAGAGTGTATTTAAATTTTAATTTGTTAATATCTGCTACTAATCAA
AAGTTGGTCCTATATATATATATATATACATACCCATACAAAATATTGTC
ATAGTTCCAAAAACCATTGAAATCATGAAGATTCATATTGACATTATGCA
AATATTATCATGTTTAAGAGTAAAATTGAAATAGTACCATCGATAAGCCA
TAAAACTCATAATATATGAGTTTCATATAGCTTTGTTGTTTCAAATAATG
TGAAATACAAATTTTGAAAATCTTATCGATAAAGCACAAGTGTATGGTAT
TTCAAAAAGTGGTATATTTAAGGATGCCATCTTTGTAATGAAAAAACTAA
GTTTAGAAACTAGAAAAGGAAAATGATTGTTGCATGTGCTTTTTCTTCTT
TTTTGATCATTATTCAATAAGGTGTTGTCGTGTCAACTTTTCTCTTTAAA
GTAAGCATTCTTTCCTATCTTTGGTGCAAATTAAAAAAAAAATGCAAAAT
ATTAAATGAATATATATGAATCTAAGTATAATTTTAAAAAATCCCTTCAC
AAATTTTATTTTAAATATTTAAGGCAAAGTGGTGATTTATTTTCTCCTTT
TAAAATCATATAACAGTATACTTCCAGCTCCATATTAGGAGAGAATAAAT
TGCATCCGGTCTCATGATATTATATCAAATCCTTCAATATCTCAATCACA
GTTTTTCTTCATGCTTACATTATTGGAATTTTTCAACATTAGGTTTTAAA
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CTGCCTTTATAAATGCTATTCACTATAGCTTTAATTTAGTTCAATTATAT
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AGCCGCATAATTTTTAACTATTTCCGGATAACATGTCATGATATGACATT
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CATAAAAAAGAATACAAAAATACAAAAACGAACAAAAGTCCTGTGATATG
TAAATTTTTAAGTTGAATATTTTTCTAAAATGTAAGCTATTATATTTCTT
ATTAGTATGAAAGTTGAATAAGTTATAAGGGTCTAAAGAAGGATGACGTT
TTTCATCATTCTAAGCCTAAAAAAGAAAATATGTCAAGTTATGAGTAGGA
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GACTGTATTAATGTTGAAAAATGACCATGAATGACAATAGTCCAGAAATA
ATATAATCACAGATATTTCAGACTTCAGATGAGTGAGATAAAAACTATGA
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TGAGTTCGTATCTTTTTTTCTAAAGTTACCTCTTTTTCTAAATAAAAGGG
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GCTGTTCAACAGGAAAGAACTCCACGAATATCTTGCATTAAAGCAACACA
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TCCTTCACATAAAAGAACCACACCATCATTTCAATTCTATCCTTCACCGA
CAATAACTCTTTTATCAGAAAATAGTTTACATGAAATATCTGTGAAACTG
TTATTTACAGTTGTGCATTGGGCTAAAAGTGTTCCATCCTTTGTAGAATT
TTCAGTAAATGATCAAAATGTCTTACTTCGAGAAGCATGGAGTCGACTTT
TTATTCTTGGAACCGCTCAATGGGCTATACTTATTAATGAAGGTAATTGT
CGCATTATACTATAATTAGATAAATATCTATTTTAGAATATAGAAAAGCT
TATGTTGAATTGCGAAGAAAAATCAAAGGACCATACAAATTTGTTATTTC
ATCATGCCAAAAAAATGACAAAAATTGTGCAAAAAATTCGTGATCAAAAT
TTGGATTACAATGAATACACTATTTTGAAGGCACTAATATTATTTAGTCC
AGGTAAATTAATATATCGAAACATATTCTTTAATTAATATACTTGTATAC
ATTAATAGAAGGGAACAATCTTATAGAATCACATCAAGTAGAAAAACTTC
AAGATCAAACGCTCATCATGCTTGAAGAATATTGTTCGCATAATGATAAC
CGTGTTAATAAACCTAAATATACATTCAATTTGAGACGTTTTGGCAAACT
TTTGTTAGCATTTTCAAATATTTTCCAAATCACTTCAAAAGATGTTGAGT
CTTTATTTTTTCAAAAAACTCTTGGAAGCATATCTGTCGATCGTATCATA
ACAGATTCTTTTAAA back to top
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