EMLSAT00000011547, EMLSAT00000011547-707394 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011547
Unique NameEMLSAT00000011547-707394
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s79supercontigLSalAtl2s79:462538..470647 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011547 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011547EMLSAG00000011547-694313Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000051607EMLSAE00000051607-760535Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000051608EMLSAE00000051608-760536Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000051609EMLSAE00000051609-760537Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777885auto777885Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011547EMLSAP00000011547Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011547

>EMLSAP00000011547 ID=EMLSAP00000011547|Name=EMLSAP00000011547|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=64bp
MNEVDEKMLNIQNKNSSYLVEVIPNNVKTAVCGIPPHRLKMQISMDEMKF
SETAKNSSKHQCSN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s79:462538..470647+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011547-707394 ID=EMLSAT00000011547-707394|Name=EMLSAT00000011547|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8110bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s79:462538..470647+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATGAAGTGGATGAAAAAATGTTAAATATTCAAAATAAGAATTCATC TTACCTTGTTGAAGTGATTCCCAATAATGTTAAAACAGCCGTTTGTGGTA TTCCACCTCATCGCCTCAAAATGCAGATAAGTGCAATGAAAATTCAACTA CAATTCAAAAACTATTTTAGCAACCAATTTACTGCCATGTTCCGCAGATA AAAGTTTTTACATTTGTATACTACTAAAGGTATGGATGAGATGAAGTTTT CTGAAACAGCAAGTAAAATGAAAGATTTGGTCTTGGGATAACAGTAATAT CCACAAGCTACAGCTGAAAACAAAGGAGAATTTGATGAAAAAGAAGAGAA AATTATGGCTTGATTATTCTTATTTTGAGAGTGTACTCAAGTATATCCGT AAATATAGTAAATAACAGTGCGATGAATTTAATTTCATGATTTATTTTTG GTCATGTGCATCCATATTATTTATTTGTCATTAATGTTGGGTTTACGTCT ATACGAAGTAAATTTTTATAATTTTGACAAATGTATTCGAATCCATTTGT ATAAAATTAAAAGGCAAAAGAAAGACCAATTTTATGAACTTGTATACAAT TATAAATATATCCTTCGCTTTGCAAAGCTATTTCCGTTCTACCGCCAGGT TCAGATACTTGAATATTAACTATTTGCTGTCAATGTCTCCAATTTCGAGA TACAAATAGAAACTAAAACGTACGGGCAACTTATACAATGTACTTTGACA CTTTAATATACGCGTAAAATCCTATTAGTATATTTTTATTTTGTTTGTAC ATCATTATTTAGTCTTTTTGTTTCACTTGTCAGTAAGAGTTTTCGAGAAT AATTGTATACAATATAGCTACTCTTATTTTTTTAAAGATTAGGAATTTTA ATTTTTTTTCCAAATATAAAAATGCATTTTTCAACATTTTAGGCAGTTAT ATACTTTTCAAATGAATTATAAATTGATATATATATGTCACCGCCAGAGA AAAAAAACATTTCATTAATTATTAACAACATTTTTTTATTTTATTTGAAA GCTTTTACTCAGTAATCTTTCTAGGAAGTTCATACTCGTATATACCTACC AAATAATCTCATAAAAATAAATTTACTAATAGATGAATAAAGCTCGTCGT CAAAATTATCTAGTTAATACTATTGAAACAAAATAATTAATTATTATTAT ATTAAAATTGAACACATCAATATGTAAGTGTGTCTTCAAATCTTTGCTCT AAAAAGAAACAGAAAAAAAGGTCAGAATCTGTTGGTAGTTGGCCCACTCT TCCATCCACAAAGTTATTATTCAATAATAGTGTAAAATTGTTCACAATTT CATAACAACTAATTTAAATTGAATCAATTAATATTAAGGTGACTAATTAT AGAAAAATCAAATAAACAAACATTGACAGCTAAAAAGAAAATACAGTGTG AGCTTTTGTATTAGTGAGGTGATTCCGTATGGAATGACCCCAAGCAACGC GTTACCTTGCTCATACAAAAATTTACAGTGTATTTTCTTGTATTATTGAG CCCTTACTCGGGCTGAAATATTGAGGAAACTGTTAATTTTTATTCATTTA GAGAGTCATTTTTTGCAAATTTTTAATACCAATGTTGTAGAATACATGAT TGGTTGTCAATTGATACGAAAAACATTGTCCTAGTCTTAGGGAGCCGAGG AAGACCATTTAAAATGTATCCATGCATGGGCATTTTTATTAATTGTCTTC CTCAAGGCCCCAGTATGTTCCCCAATAGCTTTACAGGACTATCCCGCGCA GAGGAGTGTTTCTATATCAATCCTCTTCACCTAATGGATTTCTTAGAAAG CGATATTGTCTACAACATTACTTATTAACAAAATGGTAAAAAATTTAATT TCTCAAAATTTGTATAATAGAAATGAGTTAACAATAAGGGTTGGTAAGGT ATAATAAACACATAAATTTAGTGATTACTGCATGCATTTTTAGGTCAGCC AAAGTCGTTCGTGTATCAATAATTATATTTTCCACAATTTCCCTGAAAGG TACCACTCTCTCACATTTAAAAAAAAAGAGGGAAGGAGGATTCCGTGAAA TCCTTGCAGAAAAAGTAAAACTTCTCTGTTTTACTTTTTGACTTTTTAGT GAAGACTGCTCATGTAGCAAGACAATTTTTATAACCATCAATCTCTTGAA TCGGTGAATTGATTTCTTATGACTGATGTCAAACCCACTTTATCAATCTC TTTCTCCATTCTTTTCGGCTTTTCGGAGTAGCTGGGAAACAAAAACAACA GAAGGGGTTAATTTTTTGTTAACACTGAATGGCTCAATTTKCCACCTCTA GAAACAAAATTCCTATTTGATTCTTGAAATTCTCAAACAATTCTGGGACA GCAGGTTTGAAAGTTCTCAATAAAAGAAAAAAAAACTATATTTATTAAAT AGATATTTCTAGATTAAACTTTTTTTTTGGTTTATTTCTGTAATTTAGAA ATGTACAATAAAATTAAGAAAATTAAAACAATTTTTTGAAAATCTTATAG GTTTTTTTATTTTGGATCACAATGACCCAATCTATAGTTTTTCGTAAATA GAAAAAGCACATTTAAAGAATATAAAATTAAAAAGTTATATGAGTTAAAA CCCATTCAAGAAAATACCAAAATTTATATATTTTTATAAAATACTTTCAA TATTAAATTTTATAGCTACATTAATAACAGCATGCTCAAAAATGATGTTT CTCAAAAAAAAAAATCATAAAAAGACTTATTAGTTTGGAGAAGTTAAATA TGTAGTTGAACATTTTAGTTTATAATTAAATCCCTTAACAAAAGTCAATA CAATAACTTATAGGATTTTGAATTAAAAGATAATAAAATACTCTGTAGTA GTTTATCACATTTCATAAAAATCTTCAATAGAATTAATAAAATGATCTGG TCGAAAACAAATCAATAAAAATTATTAAAGTTATACCACTAAAAAAAGTA GGATGGTGACAAAAATACAACATTTAAGCATGGATCTTTAAACTTTCTGT GGATATGCATTAGACGGCGAAGAAACGTCATATTATCGCTCTAATCATAT GTGTAGTAGCGTATCAAATCCCCGATGTACTTCCACGTTAGATTAAAATA ATCCAGAACTTTTATAGCAAAAACAAAGTATCTTGCAGCTGTCGAAATAA GAATAGCTCTAATTTCTTCATTTTGGGTAGGGTCGCCTTCTGTCAACATC TCTGCTATCCTACTTTTACAACTCAAGAGAGCTAATATTTTAATTCAAGT TTTTGTAGGAGCACTCAAAATATTTGAATTAAGTCCAAATAAAAGATTAA CAGTCCCACATTTATCACTTATTCCTGTTATGTTAAACAATGTGGATCTT TTCAGTATATGTACTGAAGGGCAATCCGAAAAGGTATGAATAACTGTGTT AAAAAATCTTCCAAAGWCTTTGCAAGGAGCAATGAACAATATAAATCCTT AATTTATTTGAAATTACGAAGTAAATCTTTTTTCATCTATTCAGGAGAAT ATGCTTTTATCACAGTATTTATGGGTGGGATTGGGAATTATACGCCCAGA TTTTCTTTGACGATTAAAATAAAAATAAATTAGTCAATCATTGCTGAATG CAAGTGTTTAATGTTATAAAACTTTGGATTTTAAAATATCAGAAACAGTC AAAATTGATATTTAAAAAAACTTGATATTTGAATTTTTGGATGTATTCAC CTGTCCTGAAAAACTAAAAACAATGAGTTTTCATTTTATGAAAATTAAAC TTCAGGAAAATTCCAAGCTATTTGCCGTTCATGGATAAAAAAATCCTATT TTGCTAAAAAGGTGAAGTTAAAAAAGCTTTCAAAGACAAGGTCAATAAAT ATATAATAAAAAAGATCGATGAAGAGGAAATGAATTGTAGAATCAAATTT TTGTTGTTCTAAACCTAATGGAAGCATACGCATAACAACAAATCTCACAA AATAAACTTCTCAATTAAGGAAATTAGTTTACCCTACGAAAACACCTATA GAGGTTGTTTTGGAAATTAACTCAAAATCAATATAGTTTAGCAAATTTGA TCAAGTCAATGGATATTGACAAATGTCCCTCCTTAAGAGAAGTCCATAAT CAAAACATTTAAAACACCATATAGTAGAAATTTTTAAGCAAACTGCAATG GTTATTGGTTGAAATAGACTAAGGTGCTTGATTATTACTCTTAAGGATCA TTACAATTAATTTAATTGCTGTTTCAACAAAATAAAATTAATTAAAATAA AAACAGGAAACAATGAATACTTTATTAAAATACAATTTATTTCTTCTTTC TGACATAAGTTAATTAGTGCATTTATATTAAATCAACTTTGTTATGGATT ATGCCACGGTCAGTTATAAAAAGGACTTTATTATAAATAGCTACCTATTT GCTCCTTCTTGTTTTGAGATTGTTATTGCTTATGAACGAAGGCTTCTTGA ATACAAAATAAAGTTTTGTTATTTTCAATGTACCACATTTTTTATGTCCT CATCCCATTCCTTTACCAATCGGTTGTAATACAAACACACTCTAATGGAG AGTAATTCCAGTATAAATATCAACTTACAACTTCAATTGCTCATTATGTC TCCTTACAACAGTATAATCCCGTTATCTTTTCATCGAGAACAAACCCGTT GTGGACTTTTGTATATTTTAATAAGTAAAAATGGAAAAAAAAATCGTTCA AAAATTCAAAAATTGTATCCATCGCATTGGCGACAAAGATTTACTGGATG TTGGTTCTTTCAAAGGGGAAAATTGTCGAAAGTCCTTCTTAAGACTTTCA AAACTAACAAAAAAATACTCTATCGCGGACAGCATCGACGTAGCGTCACG TTCAACTCTACATCGTGGCATCAATGCACACTTATGATAGCACAACAATC TACAGCTTTTAATCCCTGAAACAGGGACATAAATGCCATCCGGATCTAGA ATTTGATCAATCTAAAACAAAAGTATCCTGTGAAAGATTTTTTCTAGTTC TTCTTAGCTTATAACAATTCTTGCTAAAACCAGAAGCATTACTCAAAGAT TACAAAATGGTTGGCAATAAGTCCTTATAACGTCATTTGGATTATGAAGA CCAAGTACCCACAGCAAGTTATGGTTCTTGGCGTCGACAGCATCCAGAGT CACGTTTTGCCACCCTTTATCTTCAAATAGGGCCTGAACGTTAATGCCAA GGTCCACATCAACATTCTGTGCCAAAAAGTATTTCAAGAAACAGGAGCAT CATGGAAGACTGACTTTGGAAGCAAGAAGGGACACACTTTCACACCAAAA GAAGAACACTCAATTTTCTTGATTCACAGAATGGGATGTAGGTATTGCTG AGTTCTTGGCCTTCTTAGTCTCTGGAATGGAACACACTAGACTATTTTTT TCTGGACAATATTGAAAAAGTTTCTATTGATGGTCCCCATAGCAGTTCCT GAAACGGGGATAAGTAGAGCATTTGGTACTTTACTCAGTGGGACGGTAAA AAAGGCAGTGGTACGTTTCCGAGACATTGTGAATGTGTGGTCTGAGCTAA CGGCAATTTTATTTATTGAATGTCAAATTTTCGTTAAAATGTTGATATAT GTAAATGTTTTAATAAAATCGGTTGAAAGATAAAGTGAATGATAATTTTG AATCTCTACTTGCTAGACCACAAAAACCGAAATTTTGGACAATAAAGGTT ATGTTTATGTTTTGAAACTATAGCCAAATTAGTAGTTGTGTTAGGTATGT ATATACATAACTATTTAAACAAATTTTATATTATTTTTTATATATATATT ATTAATTTTTGTTTTTACCCTTTAAAACTAAGGCTTTTTACAAAAACTTT TTTTTCGTCCATTAAAACTTTTTAGTACATATAATTATAAGAGTCTGCAT GTATAGTAATGTATTTCTTTATATCTTTTAATGGATGATGTTAAATAAAA CATATGTTTTAAAAAGAGCAATGCATTCTTCTACAAATTGAAAAAAAAGT ATCAACTATTTATTTGACAATAACGCATTCATAAAATGTATTTAAATAGG GAGTTACTGTATAAAAAGGTATTTTAGCCCTGATCTATTTTCATGGGGTG TTAATCAACCCCATAGACATCAATGCCCTTAGTATATTGATTTTGTTGTA TATTTTTGATACCCTTTCTATGTATTTCTGAATTTACCATATACTCTATG TATTCAATTTTTTAGAGATGATATTTCATTAGTTTCTTAATATATAAATA GGTAAGCTATTAATATAAACACTTATTTCGATGAGGGTGTTTCTATTGTA GATAAAAATATTTTTTCACCCTTAGCTCTCGCATTCAAAAAATGAAAAAT TCAAGAAATCTAGCAAAACAGTTTATAAATTTACGCAGACTTTATTTGAA ATAACTAAATATACAAATAAATCAAATACAATGGATTATGCAGATAAATT AATAGTTGAATATTACCATATTTATTGTTTAAGGATCATACAGAAAAGTA TTGTCTATAAAATAAACCTAGATTAAATGAAAAAAATAAGTCTTTTTATC AATCTCAGGGTGTTAAGTGAATCAGTTAACTAGTAAAAGGGTTAATATAT TGTATTTTAAATGCATCATTTAACGAAGATAAATTACGATTTGCGTTAAA AGACAGAAATAGATTAATATATAATTTTTAAAAAACCTTTGATCTATGTT GAACAATAAATGCAATAATAGCAATCCTAAATAGAATGTAGATTTTTATA CGCCATCGATTTAAATAATTGCTTGTTTTTTCCCCACTTTGAATCCGAAT TTCACAGCCAAACCTTTCCATTTCGTTCTTTAAAATTAAATAAATTATAT TCAATTATGTTTTTACCTTCATAATGATTGTTTTTGATTAACTCTTTTAT TTAAAAATTTTGAATGGTAGGCTTTTAAATTTATTTACCTTTTTTTTCTT TTATATAATCAGCATTATTTAGGAGTATTAAATGATAACTACGGTCTGCT TGCTACAACAAGCATCAATTACAAGCAATTTACTATCTTCTACAGGAAAA AGAACTCCTATACCTATTTGAAACATTATAAAGAATTATTTAACATGTTT TAATATTCAAGTATTAACAATACTCATAACTGAATTTTGAGAAAAGGGGG TTCAATTTTGTTTATCACTTTTTTTAATGTTATTAGCTGGGCAAATAGTT TGTTACATCACTTAATGATGTAAAGTTGGTAATTAACAATAGTTTTTTAT GCTAAATTACAAATATGTAAGGATGCCATTTTACCCTTCATTATTGAACA TGGGTGTTATAAACCCAAAGAAGAATTTTATAAATGTGTCTTATCCCCTT GAGTCTAAATGTTATTCCCAATACTTTTAATTAAATCAGTTAAATTTAGT TATGTTTTTGCCTTCGTAATTATTTTTTATGGACAGTTCATGTATTTAGT AATTATAAATAGTAGGCTAGTTAATTTAATTAATTGTTTTGCAAAAAAGT CGTTCAATNCAAAATTATAATATTGTAGCTTTWAWTTTTTTATAATCCCT CCAACCTCATCAAAAACTGATAGAGTATTAATTTGATTTATAAATTTTGC ATAAAGTAGTTTMTAWTTRATATWAAWATTTTTARTGTTTAACAAAAATA ATAAGAAATTTTATTTTATTGACACCCAATACTCAAGTAGTTAAGGAAGT TTTTAAATAAAAATCTGTTTTTTCTCCTTCATATACATCATACAAATATT GGTAGTACTTTAATTAATATTTACGAGTTATAAATTTATGAAATGGTTAG AAAAATAATACAAAATGTAAATGACATATTCATTATCAAAGTAAAACTCC TCCTCAGGTAATGAAGTTCGTTGGATTTTGGAGTTTTTTTATTACCCAGT TCACTAACTACCTTATGAAAAGGAAAGTTATTTACTAAGGATTATTTCAA ACATAACAACGATTTTGAAATTGGCATTTTTTATTGTCAATTTTGTTATA TGTATTTTCTACCTCTTTCTTTTTGAAGAAAACTCCTCCAAACATCAATG CTCAAACTGA
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