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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s800 | supercontig | LSalAtl2s800:5918..93267 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011601 >EMLSAP00000011601 ID=EMLSAP00000011601|Name=EMLSAP00000011601|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1305bp
SPHIRPIPIVKAIQGKDLRISCPVSGYPIQSILWQRDGYKXPSNGRQSVF ENGTLVIREARKLEDEGYYTCSAFNPRDESHTGTIQIQVLSPPTIMPFLF PNKLLSEGMRSAVSCQILEGNLPIRFSWNRDGRPIGEDSPKLDRGIYIRS TDQYSSTLVIEELRFRHRGNYTCVASNSAGYASYTTVLIAPKWIRIPEDV HAVDGAEXFIHCEVEGYPKPNLSWNKVTTGMYTCTADNGVRSGISKTINL TVNSPPRFLEEKVHLAVRKGEKGILICEVAGDENIDILWRRNGMPISEGE DARYSIENHYTLYGSVSRFVISPILDQDAGPVTCEAVNQYGRDQKDFILS VEDIPSSPRGVRISNVGSRSLEIGWEIPHDGNSHILNYLVEYSNLPDERD KGEKQRRKMTAPGDAVNLIIQNLRPGTKYKFNVLAENRHGISSESHAVII RTQEEPPGSPPRNVEVLSKSSTELRVLWTSPPISNWNSELLSYKIGYKEV GSNSGLQYMYQTSSSHLSESVLLTSLRKFTSYQIIIWPYNKEGIGPSSIP NGPPTEGRCMSLSPSSLEVLWSKPEPEKRNGIIRGYIVKYYPMEKYYDSE GALQTKETDSEIIRLNSLMKFTNYSINVHAFTRAGVSKKSSALFCQTQED GKINLKESSVLSGPNYIELGALQYNRRYDIWVKAETSAGYGSPSDVTSVI LGSTIQAQIVSFGESLTIPWKKNLVLDCLNVGIPIPSIEWKHRGNSIMEN SKYQIYPNGSLSIHHIDEGDESDYRCVVQNIHGSDEVVYNIIVQVPPKAP LLTLKNVTFTSARLSWRSTPSIKEPIMGFTIFYRREHGKWHIVKENPFTE TDWIHDLYCGSNYTFYITAYNHVGTSVPSTIISAKTSGFIPEITKKVVTS NITMVLVDLTAFYDGGCPILYFVLEYKKDTQPKYTMVSNNVSPLDEEYTI RGLDPGTQYFIRITAHNSAGSSVTEFAFSTLSSLGSELPPPIKDSREHRT SVWSWIIRIVTFFVIIGGIIMATAYGSIVLRKLRNKTGIFSPSDEDDQDN LRSTMDRRQSYPKSPIFENRHYFXPPQPTTPAPSLNQFMRKVSVVDHGSG GHVGLVCSAQGASNRGHTLSQVFQPCSTTKTTDTWIDPDMYPFATFSTQP GNPRQVTLNLQHPHSHQRMCSYGNIFASSTPGVINPSMMTTTTCPLTGTE VVTINGFDTLVEPMYSKVNCRSEEFLSRQVPSSTPPVRSENLLHPEVRHD SDSDVDYRPKLQRPPNKGKLKRRAQVITAQRYXSSSSEENDSPMQQRLGT TISDH back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s800:5918..93267+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011601-707448 ID=EMLSAT00000011601-707448|Name=EMLSAT00000011601|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=87350bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s800:5918..93267+ (Lepeophtheirus salmonis) TCTCCACATATCCGCCCAATCCCAATCGTCAAGGCTATTCAAGGAAAGGA
TCTCCGTATATCATGTCCTGTATCAGGCTATCCAATTCAAAGTATACTTT
GGCAAAGAGGTAAGGTTACTAATTATATGTATGTTTTGTCTGTTGGAGTA
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CTCTCATATTCTGATTTATGAGTTGTACAAATATGATTTATACAACACAT
TTAACTTCATTATTGTGTGCAATTTTAAAACACAACTGACGTCTTCTGAC
AATTCATCTATAGAATCTCTCTATACCAGGGGTTGTGTAACTTTTTAGCG
GATTAGCCAAAAAGAACTTGTAGTAAAACTAATTTACCCCAAAACTAGTG
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TCTGGATGGATCGTATTTAGAATACAATATAAATCGATTCTACAGATGAA
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GCATTTACATATATTAAAAGTGAAAATAGAGCTTTATTCTTTTTGAAATC
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TTTCAGCCAAATACTATTCCTAAAGCGTACCAAAATTAACAACTGACAGC
AATGGAACAGCATTTTGCATACCTTGTCATCTTTACATTTATCTTTCTCA
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TGTAAAGTATTACATAGTGTTCAAACACCATTAATAAAATTGTATTTTAT
TAAGCATGACTATAATTAGACGCAGTTTAAAAGCAAAAGTCTTTTTAATT
AGATTAATTTGTTTTCCCACCGATTTTTACTCGTTCAAATATCTACTCAG
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GGTGCCCTCTCAATAGTCTCCTACTGCAGTCTGTCCTGAACCTGTTCTAA
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TGGAGAGGTTGGAGACGAAATATCGTTTATAAGAACAAAAAAAAAATTGT
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TTCCACCTCCCCAGTGGGGAAAATTTTGGGGGCATCGCACGGGTTTGACG
ACAAAAGTCAAGGTTCGGCCAAAGTGTCTGCTATTTGTCTATGTAATACT
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ATCCAGAGCTCTGTCTTGCATATAAGCCACCTCATTTCCAGTTACATTAC
TGTGGCCTCTTATCCGGCAAAGAGAGAAGGACCTCACTAACAAACGACCT
CAAAAGAGTTTTCGTATCTCGGACAAGTTCTAACTATATTAATCAGAACA
GATTAAAACATCATTTTTTGTTGGCCTACATTTTTTTTTTTGAACTTTGG
CGGAATCATTTTTGATAGCTGCATTCCACGAACGAAGTTTCTATACCACG
GTCGTTGTTGTATATTATTAATTGGTATATAACTTGCATATAATTAATGT
ATATTATATTTTGTAAAATTGTGTAAGATAGAAAATGCTAGCAGTTAATT
ATGGAACATCCAACAGATCATTACAGTAGTTCAAGTGTGTATATACTATT
ATTTGCTAAATGGAAATTTAGAATGTTCATTCAATCTATTTTTAAATGTT
TTGTTTGCAAATTTCCATAGCTTAAAAACATTTAAGATCAATTTTGGTAC
CTGCAATTCGCAAAAAGACGTGCTGACTATAGACTGGTCCGTTTTTAACT
CTTTATTTTGCTCTGTTTTGCCTTGAATCCCTTCCCAAAAAGGAAAAAAA
TCCCTTCTTTAGTCCCTATGTGTTATTGATATTAAATAGGGATGTGAAAA
TTATATAAACCCTTGTGAGTGCAATTTGAAAAGAAAATGAATGTTGTTAG
CTTTTATAAAAGACATAATATCAGCTGATAGAGTTAATTATAAAAACCAT
CGTGCTTCTTGCTCGCTAAAACCTTTGGGTCTTCAAAATAGGGAAAAAAT
AAGAGACCGAATATCTCTTAAGGTCACCAATAAACATTTATTTTAAAAAT
GTATGCTCACTAGAATTACAATAATTTTCACATACCTAAGAACAACAGTT
TCTAAATTACTCATTTTATATATTTTGTCAAATTAAATTACACTCATGTT
TTAATTCCAGGAGTATTCTATTAATTAATAATAATTTATTAAAAACCATT
ATTGTAATATTTAGATGGCTACAAATTMCCCAGCAATGGCCGGCAATCCG
TTTTTGAGAATGGAACCCTCGTTATTCGAGAAGCTCGTAAACTAGAAGAT
GAGGGCTACTATACATGCTCAGCATTCAACCCACGAGATGAATCACACAC
TGGAACTATTCAAATACAAGTCCTTAGTAAGTCAGCTNNNNNNNNNNNNN
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CCTGTCAAATCCTTGAAGGCAATCTTCCAATTCGATTTTCATGGAATCGA
GATGGTCGTCCAATTGGGGAAGACAGCCCCAAATTAGATCGTGGGATCTA
CATTCGCTCTACAGATCAGTACTCTTCAACCCTCGTGATTGAGGAACTTC
GTTTCCGACATCGAGGGAACTACACATGTGTTGCCTCTAACTCTGCAGGC
TACGCCTCCTATACCACTGTCTTGAGTGTGAATGGKAAGTAGTATTTAAT
CCTACATTACCCTGATTCATTATGTAATTACATACAGTTGCACCGAAATG
GATTCGGATACCTGAGGATGTTCATGCAGTCGATGGRGCAGAGGKCTTTA
TTCATTGTGAAGTCGAGGGATATCCTAAGCCAAATCTGAGTTGGAACAAA
GTGACAACAGGTGAGTGAGTTTGACTTTGGGATGGATTTACAATGTTAAT
GCATTCATGGCCAAGTTCTTTAAATGAATATAAGTTGTCCTAATATATTT
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ATTTATTTATAAAGCTAAAATAAAATGAAATACAAACCAAGGAGGGAAAA
AATAATGATATAACTACATGTACACATTATCTGGGTATGGTTCTAAGACA
CTTTTGTCGAATACCATTTCACCGAAATGACATTTTGCCGAAAAAATAAT
AAATTTATTTGATAATGATTCATAGTTCAATAGTATGTAATTCTGATTTC
CGTGTCAACGTACCCTTAAGACTGTTAAGGGCCCCTCCCCTTTTTGTGGG
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AAAAGCTACATTGGGCTTGAGAAAAGTTCGGGGAAAACATTTCATTGCGC
GGCACTGAAAAACAACTTTCCAAACTTTTAGGACCTCAACATGTCACTGC
CCTCCTCTCCAAACTCGAACCCCTCGGACTACTATATCTCAGTGCCTCTG
GAGGAGAGTTTGTGCGCTACTCCTCAAAGCAGTGTATAGTCTCTAGAGAC
TTACACCAAAGAGTGGACAAAGCTTGAGTTTGACTTCATTGTCAAGGCCT
GTAAGGAATTTATGCCTCATATTCAGGCCACTATTAGAGCTGAGGGCTTA
CATCCTAAATAAAAGTTGTGCCAGGCACTATTTTCTAATAATTTTGTTAC
ATAAATGTCCTCACAAAACCTCTTATACTCTTGAAAAATTGAAAATAATT
AAATTTGTACAACTAGATAAGCTMAAGCCTGTACACTTTTTTTTTTTCCT
ATTTAATATGAACGGCCCCGCTCGATACTATATGCAAAACGCCTGCAAGA
TTTTATTAATACGACAAAATTGTCATTTCTTAGCTCAAAAATGTATGGAC
GTATTACGTATGTATATAAATAAGGACATATAGATGTACAAGAAAGAAAC
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AGGATCTTTCTCAAAATTGAGTGTGGATTACATTGTGAAAAATTTGTACA
AAATATTTTTCGTTTAAAAAAGATGTACAAATTTTCACATATAAAATTAA
TTTTTTTAGAAAAAAAATTCAAAAATGAAACTTCAAATTTTAAATTTTTT
GAAATAAAACTTTAAATATTATTGTTTATTCTTTTTTTAATTTCAAAAAC
ACATTTTGTATAAAAAAATGTAAAAATTTAATTTTTCAGACATAAAAGTG
TTATAAAAATCTACAGCTATTTAAAAAGAATTAAATTTTTTGTAAAAAAA
TTTTAAATATTTTACTTTTTTGATCTACTGCATTATTTGCCTGAACGGCT
TTTTTTTAAAGAAAATAAATCTTTGAAAAACTCTCTAGTAACAAACAAAA
ATTACTTAATTTGAGGGACCTACAGCCCCTCCAGGCCAAGACTTGCGGAC
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CTGATTTTTGTTCAAGATTGTTTTATTGTTGACGCATCACGTATAATATA
TGTATATAAGAAGTACTTTATACTTACATAAAAAAAATGAAAAACTTTCA
TGATATTTTATTTTATCATTTTCCCTTTTTAAATAATATAAAAAGAAGAA
GAAAAGTTCTTTTAACCCACGACTACTTTCAAGAGGTAGGTAGTTGAGAA
TGTAAGAAGGAAAAGATATGATAATTSAAAAATATATATATATTAAACAT
TTTTATTTAATATTTCATAAATTCGAAGGAAACAGGCCAGGAGTAAGGGA
ATGAATAAGGCACTTCCATAAATACAGAACATGATAACTATTATAGTACC
AGCAGATTGTATGTATATACATAGGTATTCAGTATATGTAAGCACTTTAA
TTCTTTATTCTAATAGGTAGATAGCTAGGAATATCTCATATTTATGGGTA
TATCTGAATATATGTATATTATAATCATATATCAGGGGTGTCCCATGGAT
CATAATTTTGAAGGGGGGTTGGTTATTGGAGTTAAATTAAATTTCTTTGA
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AATTTTTGTAAAAAATAAAAATCCAAATATTAACTTTCCAGTGAAAATAT
GTCAAAAACGCATATGTATCAACAAAAAATTAAATTTTTTGATTTTTTTT
TTTTCGAAAATGCTTAGTTATTCATAAAACTTTAAACCAAGTAGCAAAAC
GCAGCCGTTAGTTTTTATACTATGGTGCAAGGTTTTAAAACCTTTTTTCT
TTGTAAGATGTCGCTTTTCATATGACGTCACTCTATAATATTTCTTACTA
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TCTTTGATTTTTCCTTTTTTGAATTCCCATTAAAGTGAAGAGGCTGGAGT
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ACATCATCCTAACTCCTAATTATATCTCCAAATAATAACTATACAGTACC
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TTATGCATGTAAAATATGTCCATAAACACATATGACATGCAGTGTATATT
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AATAAGAAGCTCCAGCCTCTTATAAAATACGAATGAATATTTAATTATAG
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GTAACTTCCCGGGAAATGAGAAACTCTAGTTTATATATATCTGTATGAAT
GGGTTTACCTATGTATATAGTATAAATTATGCAAAATATTGGTATACATC
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TTATTACTTAAACCATGCATACATACATGCTTTGATATGATAGCTTGCTT
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CTCTCATACTGAATTCTGCTACTACTAGTAAGACATACATAATCTGAGCC
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ATCAGATACCCGTCCTTTTTATCTGTCTTTAGAAGACGTCTCCCATTTTA
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AAATAAAATACTTTCAGTGCCTACATATGTACTATTTCCATACTATCCAT
GTACTTTTTTTGTTTAATGCCCACTAATGAGCTTATGTTTTTTAGTAAGC
GTGAGATCGTTCAATTCGTTGCAAAACAGTCTAGTTCCTCTCCTCAGAGT
TTAGGAGAACCTCATTAGAAATTGTGAATAGACTAGAAAATTGTTTAGGG
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GCTAACTCAATTATGCATAAAAACGACTCACCATATAAATTTAGTTGTTA
AATCATTGACTTAACTCGAGTCGAACCGAGTTAATAATTGTTCGACTTCA
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TTTTTTTTTCTTTTGGTAACCTGCACAGGGGGGGGGGGGGGGGGTTGTAA
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AAGTTATAATCGCCGTAAAATAATATAAACATTTGAAAACTTAAACTTTT
TGGAAAAAAATTTCAAATATTAAATTTTTAGAAAAAAAATTCAAAAGTAT
ATAGTTATTAATAGAAAATCAAATTCTTTTGGGCAAAAAAAATAAAAGTC
CAAAGCTATTAACAAAAGAAATTTAATTTTTTTTAATTTCAAAAGTCCAT
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GTGAACACCTTGATTAGGTATTTTTTTAGTAGGATGTTTAATACAAGATG
GATTCTATTAAATCCAAATGGATTATATACATGTGAAATAAATCTGATAA
CCCTCATTTATTTCTTTGTTACATACTTTTTTCTCTCTCTCCCAGTGAAG
AGCGTCTTTCTTTCCTTACTTTATCCCTCAATTATTGAATTAGATATTCA
GTTCCATCCAAGTATCTTAAGCTGTTTAAACTTCCTTTCATTCAATGAGT
TGAAGAATACACGTGTATATATTAGGGTATTTATTACAATGTATGTATGT
ATCTGCATTATCCTTGAAAATACGTATCCATATGTAAAGATTGTATTTTA
CATACAGGGTGATCCCATAAAAGTTCTATTCTGTAGGATTATGATTGTAG
TTTCTACAAGATACCAGATAAAAAGAGTTCAAAAACATTTGATATAATAT
TGAACAGGGGCGTCAGCAGGATAATATTTTGAGGGGCCTTGGATTTTGTA
ATATTTTTGAAAAAGAATCCAAAAATTATTTTTTTATAACTGTTACAAAA
TCTCAAATATTAAATGTTTTGGAAAATTTACAAAACTAAAAATTTGAAAA
TACATAGTATTTTCCCGAAGATTTTAATTTTCTAGAAAAAATTTCAAAAA
TTCGGAGTTATTCACTAAAATTAACATTTTTTGGAAAGAAATTTCAAAAA
TACTTATTTATTGACGAAAACTACAATTTTTTGAAAAAAAATTCATATTT
TAATTTTTTTGCTCTGCTGCATAATTTGCCCCAATAAACTTTTTTTTAAG
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ATCATGACCAAAAAAGTTATATCTAAAAGTGAAGAATCCTTAATTTGAAG
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AAGATGTTGTTCTCATTAATCCAACTAGCATTGTTGTTTTTTTGTTTTAT
TTTTCATACAAAGAAATTAATGCAAATACATACAAATTACTCGAAAAAAC
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CCTAAGTTTGCAATATAAATAATTAATTAAAAACACTTGGGATGCCTCAC
TAAATATTCTGCTTATAAGTTATTTGTAATTACATTTTTAGAATCTCAAT
AAGCAAATCCCTCCCAGATTGTTCCTCATAAATTTAATGACCTATTGAAC
AAATTAATTCAGTGACTTTTTTATTATGTAAAGAAATCATTACATGGAAT
TGACGTTCTTATGAGAATATAAATTATTACAACCTTTTATTAATTAATAT
ATTATTAACTTCTTTTTTAAATAGATGGTATTTTAAAGGAGATTTCCACC
CCCTTGGAAGATCTGATGTCTCCTTCCAGAGAATTTAAAACCAACAATTT
AGATTTTGGATTATTAAAAATGTAAAGAGATGTAAATTTATGGAAATAAC
TTCAATTTTCGCAATTGCTATTAATTGAATACCTGTTACATGAATTAGTA
AGCATCCTATTATTCTTTTTTTAAATGTGCATAATATCTTTAACTGACAA
AATGAATACTAAAAAATAAACAAAGTAAATGTTTTTACTCATCGTATCAT
ATTAGACATAAAAATAGGGAACTTCTACCCAAAAATACTATTATTTTCAA
AATAGAATGACCAGTGCCACGACAAAAATGACATGAGAAGGTTGTAACTT
TCCCAAAGTCAGTTTTTGATTGTCCCCAGTGGAAAAGGTCTTTGAGCAGG
GGAAGAAAAATACTAACACTAAATCAGGACAGTATATAGGGTGAAAACTC
AAAAACGAGAAAATTATAAAAGCCTTTTTTCATTTCTATATATTTCATTT
TGTACCATTTCATGTAACAAAAGTTAATAATTCAACAATTTTCTACACAT
TTATTGAATATGCCCCCCCCCCTCCCCCATTCTGACTSATGGCTTCAATA
AGGGGACGAGCAAAAGCACAGCTGACCTTGATGAAGTCCAAGGACAAGTT
GTTCCACTCCTCTGTGATCACGGCCTTCAGTGCATTGACATTTAGGTGAG
AAGTCTTGCTTGTCTTGCCCTCCATGACGAACCAAACAGCAAAGTCCAGG
GGTTCACGTCGGGTGAGGACGAAGGACAGAATTCTGCTAGCTAGAAGGCA
GCCATGTTCTTCCTGCAGAAATATTGCACCTTCTTAGACGTGTGTGCCAG
GGCGCGATCTTGGGTAAGCACATAGTTGTCCCTGGGGAAAGTGCTCTCCA
ACCATGGCAAGCCATGGTACCTGAGGACCTTATATTAGAAGTCCGTGTTC
ACTTTCTCGTTGGCCTTAAAGAAGTAGGGAAGTATCTTGCTGCCATCGGA
CGCCAAGAGACCGAGTGCAATTATCTGAGCAGAATGTTTTGTCCTGAAGG
TCCCCTTGACCTGAGCTCTTGATTGAACCAAGATGCTATCATTTTTCCTC
TTCAGAACAGCGTCCACTGTGAAGATCTTCTTATCGGAGATGGACTTGTG
TACGGAGCAAATCACAAACCCTAGTCCGTTGTGCTTGTTGTTCGGACATT
TTTGATTCCACAAAAACAAAACAAACATCACATTGTAGCTTTATGTCAGT
TCTTTCAAATGGCGCCAAGTACAAACTTTTAGTACANNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNCTTATCGGAGATGGACTTGTGTACGGAGCAAATCACAAACCCTA
GTCCGTTGTGCTTGTTGTTCGGACATTTTTGATTCCACAAAMACAAAACA
AACATCACATTGTAGCTTTATGTCAGTTCTTTCAAATGGCGCCAAGTACA
AACTTTTAGTACTGATGCTAGACGCCTCCGAAGAGGATTCTAATTTTTGA
GTCCTCCCCATGCTTTATATTATATCTATGTGCAATGTCTTTGCTGTTAT
TGTTTTTTATTGTTTTGTTTTTTTTTGCAACAATAAAAAATATAAGATTG
TTGCACATGATAAGAGAAATGAAATGATAAACGATACACTTTGTTGCTGT
TTTTGTGGGGGTTTTTTTTACAATGAAATATTTTGTTTTTATTACGTAAT
GAATAAAACGTATGCAGTACCATAATAAATGATCAGCAAACAGACATTGC
AATTAATAAAAAAATATTATGCACATACATAGTTTTAATTTAAAAAATGG
ACGTTGGGGAACAGCATTTCTGTACAAAAAATTAAAAAATAATTAATTAA
TGGATATTTTACTTGGAGACACTCACATCCACTGATATATAAAATATATC
CTATGTATATGTAAAAATAAAAGAATTAGAAAATGAAAGTGGTAATCTTA
AAAATTTGAAAAATATTTGGAAGGAGAGCAGCTTAGCTGTACGGACGTTT
TATTAGAATCACAATAAGGAAATCACGTTTTACTCCGTATATAGCAAAGA
CATTAGACCTATTCAAATTCATACTTTTTTGAATTTTTAATATGTTTCCG
CATTTTTCCCCCTGCTCTAAGATGTGAACAGTTCAAAAATCATTTTCTTA
GGATTCTATTTATTTATACTTAGATGTTCTATCTTCAAAAATTAAATAAT
AATAATAACAGCTTTGGAAAATAAAAAGCCCTTTTCAGATTGCCAACAAG
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CCCCCCGATTCTACTTCCCCAGGCCTATGGACTTGCCATTATTAACTCTA
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TTCATATAAAAAAATAAAGACTATTCATTGAAATTTAGTTTATTTTGGGT
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CAAATTCAATTTGCCATATTTTCTGGTTTTTTTAATTATTTTTTTTCTGT
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TCGATAGTTTTGATTATGATCCAAATTGCACAAGGAAAAATGTCATGAGA
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