EMLSAT00000011638, EMLSAT00000011638-707485 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011638
Unique NameEMLSAT00000011638-707485
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s807supercontigLSalAtl2s807:247223..273212 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011638 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011638EMLSAG00000011638-694404Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000052058EMLSAE00000052058-760986Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052059EMLSAE00000052059-760987Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052060EMLSAE00000052060-760988Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775626auto775626Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011638EMLSAP00000011638Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011638

>EMLSAP00000011638 ID=EMLSAP00000011638|Name=EMLSAP00000011638|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=560bp
MPALHHSTYNSFGYGYSRRGLESTLIMSRVCTSSIDTCVLNLEIQRQERR
RRLARLRNDPDEDDEEKNESEKQNRSFLRKRLPPTEVRDKMGNLIYRRGE
SDQERYSRELEQWIRKMKCTGNGGMRLEQFKDIKVGLDTNPIIFGSPSLE
PYPNIYKEPDYKFKGGKDENGRWKGKGVIEFANGDTISGSFQNGYRHGEC
KIETNRLNLRALAGTYENDRLCGKAKLVFQNDTSLEGYFLDGVLHGFVRY
FDAKGRLTFIGNHRNGRPHGPCWKVVKGGGCVVGRVNESGELTGIRIAYI
FPDYQTALVGTFTKGVLEYARVAYLKTVVEDRGIKVPIFSEPSGCLYEHE
IIDYDXKIKNPLLPDPYESRLVEVKQSNVPGANDGLFAKIRIEASTVXAF
YYGKPVLNADLEDKDDWEKNAYKIFDPSRPNGTMDIPVEFRDIKNYCATL
AHKTNHSFLPNAEFLSFDHPRFGVIPCLVTNHDVEAGEEIFVHYGXXMDG
CPDWYEVVWLQGTYPVPESLKEGWDLEQKKSNIVNDSVSLSNVDMVENGK
SSDGNVKLEE
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mRNA from alignment at LSalAtl2s807:247223..273212+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011638-707485 ID=EMLSAT00000011638-707485|Name=EMLSAT00000011638|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25990bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s807:247223..273212+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTCAACTCGACAAGCAAGAAAATAAAGTCATAATTATTAAGCATGAAAGC TACGTGTATATGACTTTTTTTTTAAACTACACTCGTTCAACGTATACCTA TTCTAATGTTTTCATAATTTCCCGTTAACATACATTGTTGTCATAGTTGC TGTTAAAGTCACACTTCTGGTTACTTTACTGTTAAGCAGTTGAACATAGT TCAATAGGGTTTTTCGGAGTTCAAAAACAAATAATTGTAAAGTAAGACAT TATACACTTATTTAAACATTTTCATAACTTATAGGTAGGGTAGTAAATCA AAACCCTGTTTTTGTTGTTGGCAACCGGAATATTATTTTTTTATTTTTTT TCTAACGCAGTAACCAACATACTTTTATTCTTGTTGAGAGAAAATCTAAG TATTAAGTGTAAGCACGAGTGTCTGTGCACATGAATGACGGAGAGTTACA TGGATTAGTTATAAGTCCTTGTTAGACTCAGAGTAGAATTGAAGATCGAA AACGGATTAATTTTTACTATTGTCCTTGCTTGAAAAGGAATGGAACTTGT TTTATTTATTTAATTAATCTAATGAACGCGCATGACAGGTAATGAGGGCG TCTGCAGGGGGTGGTCGGGAGGGGTGTCGCCTCCTCCCTCTCCCAAATTG AGGGAATTTTTCTTGTGTAATAGATTTTTTTTTGTTCAAGATGAAAAAAT TTTACGCCAAATTATGATTTGTTTTATTAAAAAAAAAGTCATTCAATTTA ATTTCTTTTAAATAGCAGTAGATTTTTTGAAATTTTTTTCGAAAAAATGT AACATTTGAAATTTTTTTCCAAAAAAATCAATTTTTCAAATTTACTTCCC AATCAATTTAATTTTTTGTGAAAAGCCATGTATTTTTCAATATTCTTTTT TAACTAAAATTAAATTAGAAAAACTAATTCAAAAAAATAGTATATCTTTT ATATATAGGGTAGGGAAGCAAAACTGGGACCAGAAAAATTGATTTAAAAA TACATTAATAATTCAAAATTTTCAATAATAGGCAAAAAAAAATAATGCCA ACAAAAAATGAAGACAAGCTTTTTGCTAATTTTTTTTCACTCAATATGGC CACCTTTATTATCAATCACAACCATTACACGTCACCCTCCACTTCCTGAC ATCCTGGAGAGGTCTTCTCCATTTGTTTTCATCTTGGCCAACTTAAAAAC CAGGCATCTAGAATACTTAACAATGACCTTTATCTTCATCACATCAACTC CAGCATCTTGGAGATCTGAGATATACTGCCTTTTTGCTTGTTTCTCCCTT ATGACGATGAAATGACTAACTGATTTGTTTAGTTTGTTTATGTAAAAAGA ACGGCGGAAACACAATATCAAAAAATAATCACTGCACCTTTTTATAGTAA AACATTAATTTACCTAATTGCCTTACCCTATTATAGCCTGCGGACCCCCC TGGCTAATTTGTTGTCCCCTCAAACATTTTTTCAAATTTCTGGGATGAAC ATGTTTATCTTCCTTTTTTTACATACGGAGAACACTTGATATTTACAACC CTAATATTGGGACAACGTATAACCTAAACAACTCTGGAAATCTTTTATGT TGGGCGTCTTAACTGTGACAGTGCCCTAAGAAAAAGAAATGTGCGATACC TAAATCCCAATATAAAAATAACATTATTTTCAAAAATGTAAATAAAATGT GGCCGTTTCAGCCTTTTATAAATGTAAATTTCTAAAACATATATTATATA TTAAGTATTATTAGAATTACTTTTTATGAAAGGCCAAGCCTTCTTCTGAC CTTTTTAAACAATTTATGTCGATATTTAATACAATGGATTTTTTAATAAT TAAAAAATAAAGACCTTTCCTTTTTTTTAAATATCTTTAAGAGAGAAAGT AATTTTCTTAGTTTACTCATGTGACCTTTATGTGGAAAATAAATTTTAAT TTTTTTATTCAAATATTTTCTGTTGATTTGATTTGTTTCGGTCATTTTTG TTATCAATTATTTCTTTATTTCCAAATTACCTTTGACATATTTTCCAAAT AACTTTATTAGATAAGAAAGTAACCTTATACAAAAAAGAAGAATAACATA TTTACAAAACTATATAATACAATGGTTATCCCAATGTAGGGTTGTAGGAT ATATTTTCTCAATATATAGTGTATTTAAAAGAAGTATGTTATTCAAATTT AGAATAGGTTTTTTTGTTATGTTGATTAAGAAATATAATTTTGTATATCT TATTTTATGCTTAATCTTCTGATTTATTGCATTTGAATGTAGTTATTTTT ACAGACACCAGAAAGGAAATAACCCCATCCTCTCCGTTGCAAGACTGTTT TTAATGAGTTTTGAATTCTTTGCTGTAGCTTTGATATATGAGTCCATCAA CACAAAAGTCTGCTAGAATTATTTTTCTCAAAGCTGAGTGTGGAATACAT TTGTATTCTTTGACGAAATATCGTCAATTTCTATCAACAAATTTTTCTTA ATAATCCTTTGGGAATCTTGCAAATTCCAGTTAAAGTACCCAAAATTGAT CGAGACAATTAAAAAAACTGGAAATTCATAGATTTTATCTATTTGATAGG GGCCATATCGGGGCCAATATAAGTATTTTAAATCAAATATAGATTTTAAA TTCTCACCATTACCCTTGAGTATCTTAACTTATCCCACAATTTTTAATAA AAGGTATATAATTGGCTAAAATATGTCAAATATCGGCTTGTTTATGAGTT AAACAAACAAAATTGGTTTTTTTCTGATCCTTGATTTATGTTCAAGAGTG TTTTTCTATTTACGTACCACATATACACGTCAATTTGACGTTACCCATTT GCTAATTATGGTCTGTAAACACAAAATCAAGTCAGAATGATTGTTTTCAA AATGCAGTCTTTCTAACATTTATATTCTTCGACTCATTATCCTCAATTTC TAAAAACTTATGATTCATTTTTAACCCTTTGACAGTACAAAAAATTACAC TTAAAATTGATCCAAAATTCATTATCACAATTAACAAATTAAAAATATAT TTGAAAGGCCAAATCAGGGCTAAATTAAGTAAATACAAATCAAGTAATGG TTGAGTATCTCAAATTATCCAAGAAAGTTTGAATATAAAGCTAACAATAT ATCCAAGAAATATTAGGCTCTATGTTTATATGGTGTAAAACAATATATGG GTAATTTTTMGTATTATATGATTAGGTGCCATTCAAAAAGGGGAACCTGT CTGTCATTTATGTTACAAAATGTAACATAAATCCTATAGTGTGGTAAATG TCTCTTTGAACGACCCCCAATGGAATTAAAAGAATTGATATTTGTTATCT TTTGTATACATGTCTTGTTTTTTTAACTATAAATATAAAAATGCATTTGT TGAATACAATGAAGCTTTCCCCGGTACATGAAAAATCTGAACATTTACTA ATTCAATAATTAATTAAGATTGAGTGATTCAATTGAATTCAAATGATGAT ATATTAAAGAATAAACAATCAGTTACAAGACGAAACAAACTTGACTCTCG AACTTAGTTATAAGTCGAAAAATGACACTTGTGATAGAAGAATTTCCATT CGCGCACTCCAAGCAGTTGAGCATCTCCAGGACGCCTGTCTACACAGTCA GCAAGTCTAAACCGTTGGAGAGTAAGAAGGACTCCGTGAAAAAGGTCAAA CTGCATCCGGAGAAGTTAAAGAAAACNCCCCAAGCCAATCCCATCAAGTC CACGAGGGGCCCATACAAGAGATTTCCAAGTTTCACACTAGACTGTCCTG 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TTTTTGAATTCCATAACTTGCAAAATAAAAATAAAAAACTAACTCAAATA GTATGTGATTAACTAGCTAATTTTTGATGAAGCTGGATAATTGCAAAAAT AGACAATCTAAACCGTGGGGTAAAATCTCTTATTCATATTGTTGTAAAAC ACATCTTATATCTAAAATACAGAACAATTTTCCCAATATGGAAGAGTTTT AGATTATTGACATGACACATAAAACATGAGTGTGCTTTTTAGGTTGGTTC AAAGTATAAGTAAGCATTATGTAGTATTACATTTACTAAATCGGACCTAA GAATCGTCTCTGAAGTCCATATAATAAATGGTATTTCCTTCTTTAAGAGC GAACTAGACGCAAGCCTACACACATTGAGTTCAAAAGAATAATATCTCTT AGTCTTGGTGTCTCTTGAGCTACGTCGTTCCATGATTTGTAATTAGTAAC TTAATGAATTATGTATAAAGATATGAAACTTGTATTATGAATAAATACAA TATGGTTTTTTTCTGGAAGGAAAAAACCATATTTGTCGTAGGTGTAAAAC TCCCAGAAATCCCGTGAAAACAGAATCCAAGAATCCCCACAGAAAAACTC TTGTATAAAAATTTAATTTTCATTTTCGACCTGATATTTTTTCTGCAGAG GACAGTAAAAAAAACTTAATTTGAGCAAATTTTAAGCCTTTTAGGTCATT TATGACGTGGTATAGGTCGTTTTAGTTTGGAAAAAATGATACTTTTGGTC AAAACGGGCCATTTTTAACCCTCTTGTACCATTGTCTCACGTAGTAATGT AAATTGTGTATATTTGTTAGCTCACTCGTTATTTTGGAATTGTTAATCTG AAGAATAAATTGTCTTATTCTGATCGTTGTTATTATTAGTGTTAGGCTGG TTCTATCTGTCTTTNTGTTAGAACTTTCGGTCCTTGGAATTTTTCCTAGA AATGTTGATGGGTTATTAAGCCCAATAATATATATTAGATATTTATTAAG AGCGTTGCACAGTTCTTGTTTTCATTATAATGAAATATAACAAGAAAATA GCATTTTTTTTACTAAGTTATATAATTTATTATAAAAAATAACAGAATAA TTACAAAAAAGGATAAAGACCCACAATGGTGTCATGAAGGATTGATTGAA CATATTTAAGGATCAACATTTGAGACTGGACTGGAGAAGACCGGATTCAA CTGGACCGCAGCTTTCTGTCCTAAATTAGGCCTCACACAACACGACATAC GCTCCAATGCTTTATAGACATATTTGAGTCCCTTATAGGATTTTTATTAA ATTTTGTATGTTTAGTGATGATACCCAATGATTTGGGAAAGAGTTTATAA TCTTTATTTGATATATGAGACTTAAATTGACCCCAATATAGCCCCCTTTA AACCAAATTGTTTAATTTATCATTCTTTTATTGTGACAATCAATTGTGAC TACTCTAAGTGTCATTTGTGACACACGCAAGGGGTTAATAAGAATAGTTT TTTAAAAAGAAATAGAAAATAATTTGTTGTGGAAATATAAAAAGTGAAAT TCCCACTCAATTTTGAGGAAAATCATTCTATTTTACTTTTGTGTTCATAG GCCACATATAATGATTTAATTTCATTAGAAATACGTCAATTACTTATAAA TACTTCTTTTTTTGTCTTGAAATATTTGTTCTTCTAAAAAAAACACATGA AATTAATTGACAGGGAAGTGAGGGACAGTGGGTCATTTTTCTCCTTCAAT AATTATAATTTTTGGAAGTATCCGGACATATTTAAAATTATTATTATTTT TTTTTTTAATAATAAACATGAGTATATTTTGTAAAAATCAGGAAATTATA ATCACGCATTACCTTGTTATTTTATAAATCATTTTTGATTCAGTTTAATC GTTCCGCTAAATTTGGTATTTTGACAAGCTATTATATCTCCTATTTTGAA AATAATGATAAACCATGGTCAAGAATAATTAGTCGGCCTTTCCATGACAA AAACAATTTATCTCTAGTTAAATTATTTCATATAATCTTTTATTGTTTCA TTTATTATCTTTATGGAGCAAAGTTATTAAAATATGATTGAGGGTANGGG ACATGGTTTTTATGTAAATATATGGACATACACTACGAATAAGTTTTTTT ATGTACATTATGTTAAATTGCGTAATTACTTTTTGTCGTTATTTTCTCTT TATTATTTGACGCAGTGTGTGAACAAAGATGAACATTAAGATACAAAGAT TTTTTAGGCGGGGGGGGAGGGGGKAATAACATAGCAGCTTTAAATGTTGG AAAGGCCATAAATTTCTGCTTAGTGTATTAACATATTTAGAGTGGCCCGT AAAAGCCAATGCCTTACACGAACAATTCTTGTCCTTCCATTTTGTTTCCT TCATAATGAATATTCCTTCTGCAAAATATTTTTGACTTTAATTAATATTT AATGGCGGCCCTTCCTTCTTWATTTTTTCCACTATATTGAAAAGTTGGCC GAGGAAAAAAAAAAAAAAATTCCACTTTCATAATACACAATTTGCCATAA ATTGGTATTTTATAGTAGTTTTAATATTCAATCTTTTTTAACATCAATTG AATCATCTAATATTTATTTGTTAACTAAGTACTGTATCATCAAAAAAAGT CATTATTAACTCCGTATTGATAAAATTTGCATTTATTCTACATTTCATTT GTGTTAAGAAAATAAAAATGTCCACAAATGTTGATAAATTACCCATTTTA TTTAAACCTCTGCATGTCGCTTAAATGTTACCCTTTTTGGCACAAGAATA CATTTTAACCATTAAGGTCAATTTAGAGAATGCACATAAAAACATTGATT 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