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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s807 | supercontig | LSalAtl2s807:247223..273212 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011638 >EMLSAP00000011638 ID=EMLSAP00000011638|Name=EMLSAP00000011638|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=560bp
MPALHHSTYNSFGYGYSRRGLESTLIMSRVCTSSIDTCVLNLEIQRQERR RRLARLRNDPDEDDEEKNESEKQNRSFLRKRLPPTEVRDKMGNLIYRRGE SDQERYSRELEQWIRKMKCTGNGGMRLEQFKDIKVGLDTNPIIFGSPSLE PYPNIYKEPDYKFKGGKDENGRWKGKGVIEFANGDTISGSFQNGYRHGEC KIETNRLNLRALAGTYENDRLCGKAKLVFQNDTSLEGYFLDGVLHGFVRY FDAKGRLTFIGNHRNGRPHGPCWKVVKGGGCVVGRVNESGELTGIRIAYI FPDYQTALVGTFTKGVLEYARVAYLKTVVEDRGIKVPIFSEPSGCLYEHE IIDYDXKIKNPLLPDPYESRLVEVKQSNVPGANDGLFAKIRIEASTVXAF YYGKPVLNADLEDKDDWEKNAYKIFDPSRPNGTMDIPVEFRDIKNYCATL AHKTNHSFLPNAEFLSFDHPRFGVIPCLVTNHDVEAGEEIFVHYGXXMDG CPDWYEVVWLQGTYPVPESLKEGWDLEQKKSNIVNDSVSLSNVDMVENGK SSDGNVKLEE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s807:247223..273212+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011638-707485 ID=EMLSAT00000011638-707485|Name=EMLSAT00000011638|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25990bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s807:247223..273212+ (Lepeophtheirus salmonis) CTCAACTCGACAAGCAAGAAAATAAAGTCATAATTATTAAGCATGAAAGC
TACGTGTATATGACTTTTTTTTTAAACTACACTCGTTCAACGTATACCTA
TTCTAATGTTTTCATAATTTCCCGTTAACATACATTGTTGTCATAGTTGC
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TTTATTTATTTAATTAATCTAATGAACGCGCATGACAGGTAATGAGGGCG
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CTCGACTACACTTTTTGCATCTATGTCGTGGAGAAGGCCTGCAATTTCCA
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CATGTCAGAGGACTACATCTGCACGAGCTTACAGGMCTTCCGCTGCCTAG
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GTATGTGATTAACTAGCTAATTTTTGATGAAGCTGGATAATTGCAAAAAT
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AAAGTATAAGTAAGCATTATGTAGTATTACATTTACTAAATCGGACCTAA
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GAACTAGACGCAAGCCTACACACATTGAGTTCAAAAGAATAATATCTCTT
AGTCTTGGTGTCTCTTGAGCTACGTCGTTCCATGATTTGTAATTAGTAAC
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TCCCAGAAATCCCGTGAAAACAGAATCCAAGAATCCCCACAGAAAAACTC
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AAAACGGGCCATTTTTAACCCTCTTGTACCATTGTCTCACGTAGTAATGT
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GCATTTTTTTTACTAAGTTATATAATTTATTATAAAAAATAACAGAATAA
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AACCAAATTGTTTAATTTATCATTCTTTTATTGTGACAATCAATTGTGAC
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TCCCACTCAATTTTGAGGAAAATCATTCTATTTTACTTTTGTGTTCATAG
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TACTTCTTTTTTTGTCTTGAAATATTTGTTCTTCTAAAAAAAACACATGA
AATTAATTGACAGGGAAGTGAGGGACAGTGGGTCATTTTTCTCCTTCAAT
AATTATAATTTTTGGAAGTATCCGGACATATTTAAAATTATTATTATTTT
TTTTTTTAATAATAAACATGAGTATATTTTGTAAAAATCAGGAAATTATA
ATCACGCATTACCTTGTTATTTTATAAATCATTTTTGATTCAGTTTAATC
GTTCCGCTAAATTTGGTATTTTGACAAGCTATTATATCTCCTATTTTGAA
AATAATGATAAACCATGGTCAAGAATAATTAGTCGGCCTTTCCATGACAA
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TATTATTTGACGCAGTGTGTGAACAAAGATGAACATTAAGATACAAAGAT
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AAAAGCCAATGCCTTACACGAACAATTCTTGTCCTTCCATTTTGTTTCCT
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CATTTTAACCATTAAGGTCAATTTAGAGAATGCACATAAAAACATTGATT
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AACTAAATGGAATATTTGTCCTTACTTAGAAAATGAAAGTAGTATTATAA
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CAAACATGGAATAAAAAAGGAAGGTGAGGGTTTTATGTTATGGCTCTGAG
TACATACAACTTGTACACAAAGGGTACAGAGGTAGGGATTTTAAATCCTT
AACAAGTTTAGACCTCAATATATTGGCAATCCTGAGATCTATATTTATGA
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AAATACAAACAATGTTCGGCAATTATTGTGAGCTTTCCTGTCGGTCAGAC
GCCAAAGGAAATTATTGAATTAATGAAGCTTCCCAAATCAACTTTTTAGG
ATGTTGCCTAGTCAATCGAAGATTCTGACGTGCGAAAACACCTCCAAGGA
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ACATATATTTAAATATATTATCTTTAAATTTTCCAAATTTATATCCACAC
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AACCCAACATCTGAAAATATGTCTTTTTTTATTTTTTTGTACTTTATTTA
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CTCAGGAATTATATGATAGCAGCTTAGAAAAAGAAAATTCACTCTTCAGC
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TGAAATACGCTTGAGTCTAGAACAGTAATCAGGAATTCTTATTATGACAA
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TGAAAGAATAAAACACTAATTTTATTAAAGTTAAGGAAAATATTGAATTT
CTACCGTGTAGTATAATATCAAAAAAGGACCGTCAATTAAAAGTCCAATA
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TTTTGTCCCTAATCGTTCAAAGATAAAAGTTGTACAAATCTAGACATTTT
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TTCATTGATTTCAAGTCGTATTCAAAGCAAATCTTAAGTCTTTTTTTATT
CTTTAAACTGTTTGATGGAGTTTAATCAATTTATTGAAAGTTTGTGCTTT
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TTTTCTTTTTTCTTGTGACGTAGTGTAACTGCATGTACCGCTTCTAATAT
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TAAATCCCAAAGATATCTCATTAACACAAAAATATACATTGTATTTTGTT
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AATTTGGTTTTTAATTACATAGTATTGCAGCATGAATCATTAAAGAATCT
ATTTTGATTCTTTTTGGTAAAGTTTCTGTTCAGCAATGTGGTCGTTCGAC
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TGGCTTTCGGCAAGGTGCTATAGAATGATACGAAACATCACTTGCTAGTA
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GCAATATAAACTTTTAAGAATTATAAAAATTAATTGATATATTTTTAAAA
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AGAATTAAATCTTTGCATGAACTTTTCCGTAAAATGTCAAATTTCCTTAC
ATATCAATTTTTTAATTACATTTTTCCATAATAATTATTTTTAATAGCTC
ATAAAAAAATATATTTATCCATAAAAAACTTTCTAGGTGTTCGATTTAAA
AAATTAAGAAATCTCAGTTTTTTATTTAAAAAATACTTTTTTTTAAATTA
CTTTTTTATGTTCTTTAAGTCACTGCCTGTATTTTTGTACACCCATGTTT
TCTTCTACCTTCATTCTTTGTTTCTATTCTCTTTATTCAGGCCTGCAACT
CGGGTACTCCCTACTAGTATATATATAAAATAAACTTATTTATATAAGTA
ATTAAACTTTTTTTTGGGCCTCTGAGATCATTAAGAGCATGTTTTGACCA
AAGTAAAACCTCTCCTCTCTTATCTCCTTCTATATATTTCTTCTTCTCTC
CTTCTATATATTTCTTCTTTTCTCACTCTTTCTCTTCTTCCTCTGTCTCT
TTTTACAAACCCCTCTCTCTATCTTTTCTTCTACCTTCACTTTTTGTTTC
TATTACCATATATTCAGCCCTGCAACGAGGGGACCCTCCTAAATGTTAGT
CCATTTTAGTTTAAGAGCCAAGGGATACTATCTTTGAATGTCACTCCAAA
TTCTAAATATTTTCACAATAAAGACAGATTGAAAGGTTGAGCTAATTAAA
ATAAATACATTGCTTTACACATTAAGAGCCACCCTAATATATAATCATCT
AACCTCACATTCATTTTTGTAAATGTGACTATAAAGTTGAAAATTAAGTT
GAACTAAACGTCTGTGATATTTCATTTATTTTATACATACAGTGCTCCCT
ATATATTAAATTCTTCTTTTTTTTATCCTGTATTGGTATAAGATATACAT
CAGGAAGAACTATATAGAGTGCAACTTTTTACTGTTTTTCATACATAAAC
TTTAGTTGCATGATATTGATTTTCCTTTTATCCCTACTTAACACAATTCT
AAGAATTAAGAAATAATGACTTGCATTAACCAAAAGTTGTATAAAGTACC
TCATAATATGTTTACAACTATTTGTAAGAAAGTAATAAAAAAGGTGGCGA
ACAGTAATTAAACTTATGAAGGCTTGAATAAACTGTACATTCTCCTACAT
TGTTTATTTTATGCTGATTTGAAATATAATATATATGGTGCATCAACAAA
AAAAATACTTGAACAAATATCAAGAAAATGAGAAAATTCCAATTGTATAT
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ACCATTATTTGATTATTGGTCCCTATATAGATTTCTCAATTTAGAATCTC
TCAATTTCACATTTTTTTATTGTGATCATAAATTTTTCCTTTTGAAAGTA
CAATTTACGGCCCCTCCAAAAAGATACATAATAATAATTATTTGATAGAA
ATTGACCATGATTCGTTGAAGTGTACAAATGCAATCTGGACTCAATTTTA
AGAAAACTCATTATAGCTTGTTTTTGTGTTGACGGGCCACACATGTCCAT
ACAAAAGAGTTGGTCCCTTCTCTATAGAAGACTAATTAGACTATACACAC
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TTTTTATTATGGCAAACCTGTTTTAAACGCTGACTTAGAAGACAAGGATG
ATTGGGAAAAAAATGCGTATAAAATATTCGATCCATCTAGACCAAACGGG
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CATTTGATCACCCAAGATTTGGAGTCATTCCTTGTTTAGTAACTAACCAT
GACGTGGAAGCGGGAGAAGAAATATTTGTACATTATGGCTAKGAWATGGA
TGGYTGTCCTGACTGGTATGAAGTAGTTTGGCTTCAGGGAACATATCCTG
TACCTGAAAGTCTTAAGGAAGGTTGGGATCTGGAGCAAAAGAAGTCAAAT
ATCGTCAACGACTCTGTTAGCCTTTCTAACGTCGACATGGTTGAAAACGG
CAAGAGTAGTGATGGAAATGTCAAACTGGAAGAATAATAAAATAAATGAA
ACGTCATTGTTAAAATCTCACGAAAACATGAAAAGTTTTTAAGTCCGAGG
ATATTCTATTATACCACCTACATATATTCAAAATAATGTCCAAAAATTAA
ACTTTAAACTATAATCATGGGCTCTTTGATGATACTTTTTACTATTTATA
AAATATCATCTATTTAAAGATACATTGCCAATTGTGTATTCATAAGAAAG
TGTTTCATTTTAATTTTGTCTTATTTGTGTATAATACTAAAGTTAACTCT
TTCTGTACAAAAAATTTATATCAATTTATTAGATAAATCTTTTACAAGAT
CTCAATTATGTGACAAACTTTAAGGATATTAATATTCAATTTAAGGTTAT
ATGATTCATGCGCCACTAAAAATGAATACTTTTTACTAAATTTCTCATTT
ATATGTATAGATATACAAAATACATGCTTGTGATTTAAAA back to top
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