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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s809 | supercontig | LSalAtl2s809:40312..97371 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011640 >EMLSAP00000011640 ID=EMLSAP00000011640|Name=EMLSAP00000011640|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=226bp
MRVPAVVESGREPHVILDCDYDIGDNEGSQIDVKWYFKDDPQPFYQWLPG RNPQTIGDLFKGRIDLSFVVDEKNGFKRHRAIKIIRPTTELSGTYRCKVS SFVDEDFETKRMTVSSSGFKTLLHKARLKTNQSHMQSHRANQRGETTTLT VERDGLFDISVHKILLEEKLKPETVFGCILSIPDTSYTVKEETMYFPGKV PTTQKKKKISMFFIKKKKILPIKKIL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s809:40312..97371- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011640-707487 ID=EMLSAT00000011640-707487|Name=EMLSAT00000011640|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=57060bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s809:40312..97371- (Lepeophtheirus salmonis) CAGGTATTGTGGGTGTAGAAATTCGTCACATGAGAGTACCTGCAGTCGTG
GAGTCTGGAAGAGAGCCTCATGTTATCTTGGACTGTGATTATGATATTGG
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CGCTGTTAATAAGTCCGAAACGTTGGAGAGGAAAAAGGGCTCTGTAAAAA
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CCTCAAGTCAATGATGACCCGTGCAAGAGATACCAGGGCTTCACACCAGC
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TTATCATGCCAAAAATACTTTTGGCTCCGGACCAAGCTTATAATTTAAAA
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GTACTAACTGAAAATGAGGAGAATAAAAAAATAGTGCCATCTATGTGTAA
AGCCCATGAGTTTTGAATTTATGTGTTACAAGGGATCATTTTCATTAATA
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GAAAACTATCTCTAAAACACTTGAATATTTTGCCCTAATTATTAATTTAT
GTGGAATTAAAGACAAATTAGGTTTTTTATAACTATAGAAGATTGGTTTA
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TCTTGAACAATTTGTAATATGTTATCTTTTAACAAATTGGTCATTATATT
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GTTCCTTTCCTTTACACGACTTCGTTTCATTTATTGTATCAAACAAATTT
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TATTTGTCCTATTCGTTATATTTCCATGTTTAATCCCAAATAACTTATTG
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AAAAAAAGTGCATTATTACTTAAACATAGAGTAACGTAGTTTCTTGAGTT
ATTTGGAGGTGGTAAAATCACCATCCAAAAACTTTAAAAGGCTGGGCTGT
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ATGCCATTACAAAATAATCCTCAACAAGCTTGACAAGCAAGACTCACCTG
CCTCCCACAGCCCTGAACGTCCCCTTTTGATTTCGGCATTGTTGTACACC
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GAGGCAGCTATATTGATAAATAATGTAAATAAAGTCCTCTATGATTTTAT
TTATAAATTAAATTTTCCAAATTTTGGCGATATTTTTTYAAATATAACAT
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TTTAATAATGATAAAAAATCAATTATGAAATAGTAATTAAGTATCAAGTA
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AAGTGAGATAAGACCGTATCAAATTAGTATTTTAAACGTTAATTGTGAAA
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ACAATAAATGTAACAACATGTGGTATGGGTAAAAAAAACATAAAAATTGA
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TCTTATAATGCTGATATTGTGAACTCAGACTATTTGAATCATCAATAATT
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ATATTTATGTTTGTAGTAGCAAAATATGAATGCTCTTAATTTTGAGAACA
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CCTACATCAATTTAAATGTACCCTACAAACAAGATTACTTGTCTAATCCT
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TTACATACTACCAAAAAAAGGCTTATGCTTGTTTACAAAGTTGGAGTATT
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GTTCAAAATATTCCCTTTCAAGAAACAAATAAATCATTTTTTTACTCAGT
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TATCATAATCAAATCCTTCGCAAAAATATTTTGATCTGATGATTTATTTG
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AAAATAGTTGATATAAGAATACATTAAAGGATAAAATTTACGCCTAAGCA
TTTTTTTTTTTTTGCTTTTTGGGCAACTAGCGTTACTTTATTTCTAATAA
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AAAATAGCCTATAAATTAATAATAAGGATCATTCATGCCTTTAAGATATA
TGTAATTCTTAGTCTTATTCGGATAAATAATTTGTCGAATTTTTATGTAA
TACCTGTCCTTCCGTATTCCTACAATAGTATTCTAAAAAATACATCTATG
TCGGTTGTTGCTCAAAAGTTCTTGCAAATGTAATATGCGATCTYCTCATA
AGTTTTTCTTAAAAGCTTGCAGCTCTAAAAGAGATGACCAAAAGTCTCGC
TTGCTTCATTGTGAAAGGAGCAGATATTTCTGTGGTCGGTCTGATTATGG
CTCCAACCTCCAACTTCTTGAGAGTAAGCGATGTTTGAAACATCTCTGAG
AAAATGTTGATTTTTTACTCTTTATTACTTTAATGCTGTTATGTGGTACT
TTGTTAATTTCCCCCCTTTTTAATTAATCACATAAAGGTACCAAAGTAGA
TTTATTGAAATATCCTGTGATTTCTGAAGTAAAACTTTCGAGGCTGTCAA
CCTGAGCATTTTTAATGAGATAACGTTCATTCTCAGAAAGAGAGAGAGAA
GGAAAGGCAGAAATGTGGAAAAACATTTATTCATGTACATTCATGTAATT
ATATTGTAATTATTCACTCGTCGAAAGGGGTGATAAAAGACAATAGGTTG
TTTAAATAACCGTCATTAGAAGATTTGTATTTGAACCTATGTTGTAACTC
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AGAGTTTTGTTTTTTATGAAATTCCCACATAGGAACTCAATATGGCCGCT
TAGTGTCGTGATACACTTAAATCAGGTGACCGACAGACAAGATTTAATAG
TATTTGTGTTTTGAACTAAAAATCCTTTATTCAGAGAAAATCGTATAGTA
AATATTTTGTTATTGACTTAAAAACTAAATAAACATAGTAAAATAGTTGA
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TTATGAAGTGTGTCCGTAACCACATCTTTGTATAAAAACCTGCACAGACA
TTTCATGACACTTCAAAGTGTCCAAGTTTTGAAGAATAGTACTTGAGTTT
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ATTGTTTAAAGAGCAATTGTGACAACAAAAATCGTCCTCCCTAATGATGT
ATCTAAGGTAATATTCGATCTTTTGAAACAAATTATCTGCTCTTTAATTT
TGACACATTTCGAGTTAAAGATGGTTATACAATCAATTCTACTTAAAGAC
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GTTTGTAAAGAGTTTTTGAAAAAGTTTGATCGTCATAATGGTTGGATGAT
GACAATTGCACTATTTCTCTAATTGGATCCTTTCCTCCTTTCTAAAATAG
AATTCCCTTTCTGTCAACTTTTCATTTTTTTATAAAAAGATATCTCCATT
GGGATGGTTTTTTATTCAACTTCTTTTGAATTTTGATTACGGCTCCGCCK
GATAAGTTGTTACAATTGTGAAAACAAAAAATCCTATCCGTCATCAATTT
TTTTATGTTCCTTCTATTCGTCAAATACGGAGTTGTTTTGATTATTTATA
ATTAAACACCCTAGTTTTTCAATCAATTCTCTTGACGTACGTCGTATAGG
GACTTTTTGTGTACAAAATAGCTACTACGGCGCCATATTTTTAGTCACCA
TCTGACAGGATATCAAATTTTACACACAAAGAGAAAGCCAAATTTATGTA
GAAAAATTAATATTAGTTCAAAGCATTATTTTTTTGTGATATTAACTTTG
TTTAAGCATGGATTTTTCTCATTTGATAATGTTTTGAGTATTAATAATTG
TTTAAAATCCATATAGTTTTGCTGTGATTATAAAGCTGTGAATCTGCTCA
CAAGTCCTGCCCCATCTTAAAAAATCCCTTTATCAGTTATAATTTCTCCC
AAGTGGATTGTCCTTTGAACTACGATGTTCCATATCAATTTTATAGTTTT
TTTTTCTCTCTATAGTTGGACTATAGAAAAATAAAATTTTTAATATTATT
TATACTCGAAGAAATTATTTATCAAAATATTTTAAAGTTAAATAACGACA
TATAAGAAGTCATTTACATTATTCTTTATTGAGTACATAAATGACTCCTT
TCCGATAATATTGTCTTTGAGTATATACATAGAAACAAATTTTGAAAATA
TCCCCCAAATTTGTGTTAATTATTTTTCAACTTTTTCTTATGAATTCATT
TTTCTAGCTATCAGGACAAAAATTAGATAATTAATAATACTTTAGCCAAA
CTAAAAAACAGGGTTGCCAGATGTCGTAAAAAAGCTTCAAATACATTTGA
ATTTATTTCTGGGCACTATGTCTATATTTTGAACTATTATCTTCTAACAT
TATACTTATGAATATATCAACTGATTAGGGTAACCTTAAAAAGGGAATAG
TTGCTGGATACTTGTACTATTGACATAAAAATTTATACATGTAATATAAA
TGTGTATGGGGTAAGTAATTTCATTTTCGTAAATGGATAGGAATGAGGTG
AGTCCGGGAAATGGTTGTATTATTCTATTAGATGAAAGGATCATTTTTTT
AAATTARTATCCGATAGAGTCTGTGTCGTTCCATTGAATAATCAATCTAT
TTATTTCCTTTATAAATATATGTACACTGAATGCTAGAAAGGGGGAAGGG
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AGACGGAAGGAAGTAAAAATGAGGTAGCTACGAAATAAACTTTACACTGA
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ATGTGGAAATCGTACTTCGATTTGAAATCATTAACATTGTTCTTAAATTA
AACTTAACACTATGTAGACCAACGATTCCCAACCTGGACTCCTTGGATCT
TTTTTGTTCTGTGGCGTATCGTCAAGGGATCCGTGAGAGATAGATTTCAG
AAATAGGTCATTATTTATAATTGTATATGTATGGTAATAGACGGTTAGGC
ATAAAAGATGCCCTATCTGTATGTAAAATAAAATAAACTGATAATGAAGA
TGATTATCTTGACAATTTGATTTAGGAGGACTATGAMAGGAAGGAACTAT
ACAAAAATCCAACTCAGTATATAGCAAATACATATATGCTTGGAATTACT
CCAACGTCGATTCTCAATTCTACTTCCCGTAGATTATGGACTTACACTTA
TAACTGCCGAGCAAAGCATCGTACTTACTATCTGTCTTCCACGGGGAAAT
GAAGTAGGTAATACTTTATACGGATACTTCGCAACTTTCTGAAATGAAAA
AGTCACTCCTATCTTTCGATACATTTTTTATACAGCTCTAGTAATGGGAG
TCTATTGTATATTACAAATGTTAAAAGGCTGAATAGTGATAAAAAGGTCA
GGAAGCACTGCTCTAAACTAACACTAAAATTAATATGTCCAGTTATAAAA
TATATTATATAAAATGTGTTCCAACGTACATGTTGGACTCCTGTCAGTGT
GGATTTAAAGATCAACATCGGAGTAACTCTTACCTATAGGTTAATCCGGA
ACATCTTTAACAACATATTAATCTTTTATTCCAATTTTAAAGTGAGGGGT
TGATTGTTAGGTTTAAGTTGGTAGCAGAACTTTTGATTCAATACAAATAT
AATGATGGTGGAGACCATGAGGAACATCATTTTCGAACTGGCTTTCGCAA
GACAAAACCCCATGTATATCAAGAAAATTAAAAATTCCATGGTACCCAAA
GAGCACAGTCTACGACGTCTACATCCGCTGGAAGGAGTAGGGGCATATAA
GAGAAAGCCCACAAGTCTTGAAGTAATAAAAACTTAGTTTAAAATTTATA
GTAGGCCTGAAACGGCCCCTGATGTAACTCATGGGACTTCAATTAACGTT
CTTGCCAAAAAGTGCCCAGTAAACTATGCTTTGGTCTCCAGAGCCATAAA
CACTGACCTAAGAATGAAGTTATACTGCCTCTACAAAAGAAATATACCTA
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TTATAATAATGTTAATGGGTCGGATGAAATGTAAATAAGGGTCGTACTTG
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TAAATTGGTTAGCATTTTAATTATTTTTTGTTATTTCTTACAAATATTCT
TTTTAAATTAAAAAGTTTCATTCAAAAGTCTTATAAAAATATTTATTAGT
GGTAATTGGTAAATGAGCTAATTTTTTTAGTCAATGTGAGATCGCCCAAT
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TGTGACATAGTACAGTTCGTTGCAGAAGCGTGGTATACGTATTTTCTGTC
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TCTATGAAAAAGAAAGCAATAACTTATTGAACATAGCCAATGAAGTAATT
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TGTTTTAGATAGATATTAGTAATTAAGGTGAAGTAAAAAGTTCTAAKCGT
TTTTTAGCTTTATTTTGACAAAAAAATAAAATATGTAGGATTATCTTTTT
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