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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s80 | supercontig | LSalAtl2s80:222871..263126 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011641 >EMLSAP00000011641 ID=EMLSAP00000011641|Name=EMLSAP00000011641|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=706bp
MRMKLVITVIYYSTILGLLLGTHAQEILRKKRDADSIDFRNAYDDPETGL KCVNKESTIQKKEQERLLECVHSKINVCHYTYVTRFTSQRVEKCDDHYEK ICRIIFKDLPTNETVKHCYRPMVKECRSKDENVDDDNLICKTVFETECST RYVEKQSKDEKAPKKYVGLTACKKLPIELCGSQYCDFVPGDETCHNKTVT SIIPVPEESCDLVPQETCKGVYKLVPYLVPESQCKDVPREVCTYGVKSTR LGEKPIVTKWCYDPDEGTNPSEIVRTGGAREGSNSEVLKNFLSEEERSGV INTRRPLIEGISPPPINEILLNEGNIEEGVAQGGTQRPNSQPTFTQIPAF GNRQNNINNNRNRVSFGNKAINTQNTDGTILSTNGKDTATGPAPIPSEVE YFDQYEDFNVSPPIPTQETRPLNKSDEDTTPATTPKPFLFNGEGGVVGTA SADVQNDFGLKFQVDQVSLKQFDEFLKEYEANYENVDNEQDDFPDYTNFG FNANNNNVNGRQYSSSNDAKDVFPRSTTPRRTFSTTPSYDTEFEFISNDE DISNEDLTTPLPSLSPGAVSRRRAPKRNGNLVFRNNQNIPDNFEPLLDVA GSQDENSVQISEAASVQDLSKVSKSSFARVIKHNDSESSIGQTIIVRNTP EAIKLFGIKNIPKDFLLRSSGVNNFKIMLKIVLAHSLHYLESKKQSSLSK IEWTET back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s80:222871..263126+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011641-707488 ID=EMLSAT00000011641-707488|Name=EMLSAT00000011641|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=40256bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s80:222871..263126+ (Lepeophtheirus salmonis) CTTAAAATGAGTGTATTTTGAGAATCCGTGAGGAAAAGAGTCCCCCGGAC
ACATAATATATGAGACTTTAAGGCACTTGAAATATTGATTGTGATCAACA
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ATTTCCATTCCATTTTTTAATTAAGAATATTTCTTTTCATTATTGATCAC
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GATATCCATTTAATATTCTAGTATCGTTTGAAATATGTGTGTACTCCGGT
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CGAATTTAAAAATCGACTCATCATTTGTGTCAAGTCTAAAAATTATTGMC
CCATGTCGAGTCAACACAAGACTATACCTAACTCTGCCTTCCTTATAAAT
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TATTATTTATATCAAATTGAGAAAAGACAAAGAAGCACACTGTCCAATGA
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GGTCCCCAAGGTCAAAGAAATAACACTATATATATTTAATCTGCATTTGA
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TTTCTGTTCATTCCTTTTTTTAAATGAAACCAGGAATCCATAATCAATTT
TTCTTACAATTTGGTTAGCTAGAAATATTTATTTCCCCTTACGAGATCTA
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CTTATTTATTCTGTCCGATCCATTCCATTCTTAGGAGCAGTCCTTGGGAC
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TCTGCTTGGGTATATATGTAAATGAAAAGAAGCCCCCTCTCTATCCATTA
GCTGACATTGTACATAATACACAAATATATATATTATTGTGAAACATGGC
ATGTTTGAATTGTCTACCTATAATGATGGAAGAATATAAAAATATTACTT
ACATAGATTATTATTTAAACCTAATCAATTCAATTGTCCGAACAGAAAAT
GAAAAAAATATATTTCCATTTTTTTTTTTTGCTTCTCTCTATTATTTCAA
AATATTTACGTATTATACACTTATATATATTTGGAGTGAAGGAGTTTCAC
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TTGAAACTCATTTGTACGAATACTATATAAAGGAAGAAGGATGGGATATA
AATATCTATAAATACCTAAATCATATACAATCTAATCCAGAGATAAGAAA
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TTTTTACAACGTGTAATACAGGATTTATCTAATCAAGTGGCACACATAAA
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GGACATTTATTAAACAAAATCATCTGAAAATAGTACTCGGCACAACTTTT
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AATCCCTTGCGGACCTTGACTATATAGCCAGACTCGAGCTTGGTCCACTC
CTTCTTAATGGAAGCCTCTAGAGAGTCTACACTTCTGTGAGGAGCTGCAC
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GTTTGCCCCGAACTTTTCTCTGGCCCAAGGTAGTCCTTTCTTATACATAA
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GGAGGGTAGATTCCCCAACGCCCAAAATAATTGTTCCAGCCATACTGAAG
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ATTTTGAATATAGTCAACTTTTCATATGAAAAATAGCAGTTTTTTAATCC
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CGAGTAAATCCCGAGACCTGCAGCAGCTTCCACCTACGCCTGGAGCTTAC
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GACTTCAATACTTTTTGTGTTAAAATGGTTAAATAATAAAGGTTGACCCG
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GATCTATCGACTCAAGTCTACAAAACCCTTATAATGCATCAATCAAAATA
TTATTTTGTTTATAAATTTTTCATTAACTTTCTTGATCTTTCAAAAATAA
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TTTTTCTTGCCCTTTAACTTTTTTTATATGTAATAATTACAGCTATTATG
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CCTATCATCATACCCTTGTCTTGTCTTTACGTGTGCGTATATACACATGT
AAGTTATAATTAATGCTGAAAATTGTTCTGGTTGATAAGGAATAATTATC
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GTTTTCAGATGTTTCTGTTGAGGAAAATTGAAACGGATATTTATTGCATC
GCTTCTCACGCTCATTTTGGAAAGAATACGCATCGAGTTTCTGAGTTCTA
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ATATTATTTATAAAATCAATGTTTGCTGAGTCCAAACGTTCACAACGCTC
TGCATTCTTGACCATACCAGTGGGTAAAGTATGGAATGCCCTCCTTTTTC
CAGGCTCAGGAATCTTGTGGTGGGACCTTCATTGGAAACATTTTAAAAGT
TGTCCCTTTCACAGTAGTTGTGTGCGCAGTAAACTAATGAAAACCATGGC
ATTGATCCCATGCCCCTGTTTGAAGATGAAAGACAGCCTAACCTTACCCT
TGCTGCTAACAACGTCAAGAACCATATCTGGCTCGTTATATTTGCCCTTC
ATGATTCTAGGGACGTTATAAGGACTTTTTGCTAATCATTTATTGTTACT
TGAGTTATACTTCTGCGTTTGACTGAGAAGAACTAGACTAGTTTCACAGA
CGACTCCTGTTTTAGCTTGATCAAAGCCTTGATTTAGGTGACTATTTTCT
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CGGAAGGAATTATACCTCATATTAAGGAGAGATACAGTCCCCTAGAAAAT
TGATTTAAAGAGCTTTTTAAAACAATGACAAAAAATATTTCACAATTTTT
TAAAACACATATATTTTTTGTGAGTAAATTGACAGTTAAGTGGGAAACAT
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ATAATCAGTACTACATAAAATGTACATATCAGTGTCTGCTTGAAGCTAAT
TATTTACTTGCTTACTTGGAATAAAGGATTGAACGTATGTGTATGTAGGT
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CTTTATTTCTATGGTTGCTTCCTATTGTGCATACCAAGAAATAGACTGAG
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GAAACCTGTCAATTTTAAAATCCAAGGATGTTTAGACTTATCAAAGAAAT
AAGTGCTTACTTTATTAATAATTGAATATGAAGGGTCTTATTGTAGATTT
CAGAGTTGCACGTTAAATAATAATATTCTTATCAACTTACAAACCATAAA
AAACACAAACAGATCTTCATAGACCAAGTTTTATACCCATTGTAATTGAA
ATATTTACTATTATATTACACGCATATTTATTCTAAATTTTTTCTAGCTC
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AGAGATGGAGGATGATTAAACGTTCAAAATTGCTACAAAAGTGAAATAAA
ATATGAGCACATTGAATTTTAAACTTCCACAAGATATAATTTATTAATTA
GCAATTGAATCTCATCAAAATTAATACTATGAATAGATGTGTTACTGAGT
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AGCGGCGACGAAAKGCCTGGSATCCGCTTTGGATGTAAGTCCTCTGACAT
GGCGTGCTGATTGGCAATGGCTATAAAGGCCTTGTTATTTGGATGACGGG
CACTGCAGGCCTTCCCCTTGACATACATACAAAAGGTGTAGTCGAGGGCT
TAGTATCAGGGCTGTAGGGGGCCAAAAGTGGCAAAAAAAGAGGTCAAAAG
ACTCTTGCAATGGAATGGATGGGTTTTTTTCATTGCTGGTGTCAAAAGTG
GCATTTCCACCCTCTCAAGGATCTTTCCAAATCCCTTCTTGGATAGCTCT
CTGTACAGTCTGGTGTTAAACATCGAGATCTCTTGTGTTGGCCCTCATGG
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ACGGCGTAGACGGCGGMCCTGGAGAGGATCATCTGCTTTGAGTTTACCAA
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GTCATAGAGCTGAGGTTTGTTTTAATTCGTAACTAATTGTTTATTTATAT
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GTGGCTACCCGGGAAGAAGGGYATTGGGGGMGGMAGNCAATATGGATAGG
GATAGTTCACTTCCTTGGCCAAAATATTTTTGTTCAATCTAAAAATATAT
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GCGTAAAAACTTGAATACAACCAATGATTGATCAAAAAAACTTGATCCAT
TTACAAGAATTGAAATATACTTTAAATGCTAATTTTTTGTGATATTAAAA
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CCGTACTCCTTTGCTACTGCTTGTAAATGTAAGCCCCCGATAAATCCTGG
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GAAATGGTTATGGTAACAATTATTTAGGACCTTCAAGGCCATGGTGCCCT
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