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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s823 | supercontig | LSalAtl2s823:161884..174464 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011791 >EMLSAP00000011791 ID=EMLSAP00000011791|Name=EMLSAP00000011791|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=392bp
MDVKNSSLPISLELLKYCYNSSITKMESKVNIVFWVEGVILGIVAVLGII
GNILTIIVLARISLNNVFNQLILALCVTDCFFNVFSLIEYSAKKAFGFIS
YDTPIYKDLWPKFIYPLHNITFTCSLFITLSVAIERYIAVCHPFLIHHRF
QNSQRSVKKRTCQYLLPTILGSILVNVPKFFEFKVKEVSVPEYSKSIFPT
NLRLSNMYQVYYINWTRAFFTAFIPFILLILLNGKIVNQIKKADKFISES
TNSQKSETKLARILVLLVFSFLICNLGKVVLNIYDIHMLGTIEACSQAQL
TFKSPFWVVIMISVNHLLFVMNSSTNLILFSVIGTQFKMTLLTILRLRSV
PKQTRRKNYVLNDNPHVKTHFDMNSSKSTYNHSVRTTNIDLC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s823:161884..174464- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011791-707638 ID=EMLSAT00000011791-707638|Name=EMLSAT00000011791|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12581bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s823:161884..174464- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATGTTAAAAACAGCTCATTACCGATATCACTTGAGCTCCTAAAATA
CTGCTACAATTCTAGCATCACAAAGATGGAATCAAAAGTGAATATTGTAT
TCTGGGTTGAAGGTGTGATTCTTGGAATTGTTGCTGTTTTGGGTATTATT
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ATTCAATCAAGTAATTTTAACAAGTGCACTGTATACATTTTTAACCGCAA
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TTATTTACAATTAATTATGATTTTACATTACCAATTATTTGATGCTGAGT
AACTTAGAACTAAAACACTTGATTACTTATTTTAAGAAACTTTTCTACTT
TACTATTTATGTTTTTCTAAACCCATTAACGTCAGAAAAGATTTATGAAG
GAAACCTTTTAATTTAGCTAATATGGATGTAAATACGAGATAAAACTATT
TCTCCCGGAAATTGAAGTCCYTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAA
CGGTTGTGTTCGTATGATCACACTAGGCAGATCTCAATATTTGAAACATA
ATTTCTATTATGTTTAATAATCGATATGTAACTTTCAAGCATCTAGTTTT
TTATTTATATATTTAATTACCACAATTAAGAAGTATTTCAAATGCATTTA
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GGAATCTTTAATTTTTGAAGAAAAAAAACCTTTATTAACATCGGAAGGTT
TAACTATCAGCTATTTAAATTTATCACACATACTCTTTTAAGTGTATATA
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TGACGAATTAACATTCCAAAAAAATTATATAGGAATTTCTCTTTGAAAAA
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GAACTTTTATTTTTGAAGTCTCTAACCCTTACATTAATAGAACGAAAGAA
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AATAGATAATAAGTCATGAAAAAAGTATATATTTTTTAGCTCTTGAGGAG
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TTATGTGTGAGCATTGAAGACGGAAAGTAACCTCGAAGATTTGTTCCAGA
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GTTCTCTCTTCAAGAATAAAATAAAAATGGTAGCAGCTTTGAAATTTAAA
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CATCTGAAAATATATCTGACATTCGGAAATGAATGTTATCCTGTTATTGC
TTCTACGTAAATTTGATTCTTTACTGTGATTTTTATCCCCTATTTTCAAC
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GATCATTTTCTTTTGCCTGAACACTAAACATATGTTTGACTGTATATGAT
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TATTTGGGTACATTTTAAACCCTATGTATCTGTTCCTATCATATTCCTAT
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TTTTCAGGTCATATTCTCTTTCCATTCGTATGTTATAAAAAGTTAAAGAT
TTCACCTTTTTAAGACAAGTCTATGCCATTTTTTTCTTCTGTTTTATTGA
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CTTATTTCTACTATTTTCTAGGTGAACTTAAGTTTACCTTAATAAGTATG
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ATTTTTTTTATTTATTAATCTATTAGAGGAATCTATTGCAATAAACAACA
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CCTTTTCGTTTTTGATATGACGGGCTGAGCTTTAGCTACTTACGTTAGTC
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ATCTCACACTCAAATAAAAGGCCTCGACAGATAGCCAGAAAAACTTGCTT
GATTCATATACTGATGATATGTTTGTTTTTAGAGATGTGGAAATGCACAT
ATTTTAAAGCGTGCAAAGATACAATTGAACAATTTCTGAGTACATATTAT
TAACATCCCAGTTGTAACTCGTAAAACGGATTGTATCCTTGCACTCTTAG
AAATGTTCACCTTTTCATTTCTCTACTCATTATCAAAGAATGGTATCCAA
ACAATTCTATGGTGAATATATACAAATAATCCAATTTCAAATTTAAAGAC
AAAAATAAAGTCAGTCGAATTTTTTGCATATCTATATTCTATTAACATTG
TATTTTCTATATATTTGCTAAATTAATACACAAAATAAGCAATAGATAAC
AAAAAAACGTTTATCAATTTCAAAAGAAATCAATATTCAAAATGTAATGG
ACGACCTGCTAGCTGTTGAATGATCTCTATTCGGATGAAGTGTTCTTCAT
CTTTTAAAAGTTCGAGAAACTTCCAGAGAACTGGATGGCATGAAACATCT
TTCGCGGTAAACCGACAGTGTTTCCCTTAAAACTATTTGTTTGTCAGTGG
TAATTCTTCGTCCGTTTGATTGAACATGTTCTACAATTTGATGGAAAATC
TAGGACTACCACTATACCACTTCGTCTATAAGTAGAACTTGACTACTGGT
TTGAATGTATATTGCGACGAAAAGGCTACCAATGTAAGGCAACAATCAAA
ATCAACGAAAACTATGAATTTATTGAACAAATCAACGATCATAATCATGC
TGCATTTCAAACTTGGGCACAAGTGACTATTATGATAGCCAATATTAAGA
GAAAAGCTTAAATTATATCTACAAAATTAATAAACGTAAATGATGATGTT
GCTGCTAATCTTTCTACAATTGATTTAAAAATGTTTAATAAAATAAATAT
ATCTGAAATTAAATATAATTAGAATATTTCCTGGTATAAATCTATTTTAA
ATGTAGAAGGTTTTCTTCTTTAAACTTTCTTCCCCCTCAAAGAAAAAAAA
ATTAGAAGGAATCTGATATTAAAAAGGGTCTTAACCCATAACTTCCCGAG
TATTGAAATCGTTTGAATTTTTTGAGGAAATTTTGTAATGTAGCTTCCAT
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AAATAAAAAATATTTTATGACGTACATTGATAGAAATTATTTAAAAAGTG
TTGAATACGGTATTTTTGAAAACAATTTTACGAACCTACGTCACACTTTT
TGCATTTATGTATATATCTTGGCAAACAAGATGCACACACATTTCGCTTA
TTTGTTTTGACAATTAGCAGCTCTACATTGTCGTAAAGTAGATAAAAAAT
ATTTGTTTTATGCTTTAAGTTTGATAAAATAATGGTGTGAATATTTTAAC
CATGATTGGTTACCTATGATTTTGTACATACTCGTGTAAAATCATTTTTT
TTTAATATTTTGTTTCTCCTTTCAATTTAAAATTACACTACTAGGTATTT
CTTTAAAAACGCCCTGCTTGAATCATTTGCACATTTTAAAACCAATAATA
AAATAACTAGTACCATTTTTTTCTTCGTATACTTATTGCATAGTTTAAAA
CATATTATCCAATAGGTTAACTTCTCCGTAGTTTTGCAAATTTTGAAAAA
ATTAAGCTGATTTACTTCAAGGTTTTTTCTTCGTATCTCTCGAATATTGA
TTGCACTTTCCAATTGCATCTTTTTCAATAAAATTAAATATGTTCAGACG
TTTCTACATATTATTTGTAGTTCCGTTTATGGTTCCATAGAGAATTAAAA
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TTACAGTAAAATTTTGAATTTTTATAGGGTGGAATTTTACATTGGATGGG
ATATTTGGGTGGGGTCTGTTTTCTCATAACATTTCTAATTCGTTTTAGCT
TTCGACCTTAGTTATAAGATGGTTTTCTCGTTCTATTTGTCTACAAAAAA
AAACCTCTTATATAAATCTATGTTTACATGTACTTGTTTAAACACTATAG
AAATACTTTATTTTTATTCCTTTCATTTAGTTTTGTTTATTTATTTTAAC
CAACGGCGATAAACAAAGCCCATATAGATCGACTTATTTTATAAAAATTT
AAAAATTATCATTCTTAATTATAGTGATGCATTTATAATACAAATATTAA
AATAGAAAAGACAAAAACATAAAAAGACAGTGCCTAGGTAAATATACACA
AAATCAATTGAGGTCATTTTCACTTCTCTGGGGAAAGTAAAAAGGTATTT
TGTTCCAAAGAATAATAAATCTGTTATAGATACTATCCTTAAAAATGTCA
ATCTTTGGTTTTGGTACGTAGATGGTGTTTTGAGTGGAGAGTCTCATTTT
GATAAATAAATATAGCTTTTATTTATTATCCAGGTTGGGGTAGATAGGTT
AATTTTGTTGCTTAAAATTCGGTGTTGTGTAATTATATCTTTAATTGTAC
GTCTATGAGACAAAGTGATGATGCCAAGTCTTTTGATTTTGCATACGTGG
TTCTCGTTATCTCCCAATGAAGGAAAAAATGACACAAACCTGGCTTGCAC
CTTTTCTAAAGAATCAATCTAGTAACTTCTTGAAGATTCAAGATCTCAGA
TCCGTACGTTAAAACCAAGAGGACAAAAAGTTTATATAGTTTTACCATAA
ACAAAGGGTCACGAGTTTTAAAGCTTCTTTTAATAATTCCCAGATTACAA
TTGGCCTTCTTTATAATGTATTGAATATGCCTCTTAAATTTCAAATCACA
AGAGATGTAGATTCCTAAGTACAAGTAATAATCTATCACCTTAAGACTTG
GGTGGATGAACTCNTTTTCTGGAGAAGTAGGCCACATTTATTTTTATTTA
TTGGCTTACTCCAAGTTACACTCCGGATAATAAATTCGGTAAAGACATCT
TCCACAGAGTTTAAGTCAGGGCATATGATTTTCGTATCATCCCTGTATAA
GAATGTATCTTCTGAAAAATTCTCTTCGAAGTCGTCCAAGTAAACTATCT
TGTGGAACAGATAAAGTAACGTCACTAGGCTAGGAACTTGTTATTTGTTT
TTTTACAAACATGGCTTGAGTTTCATCGAAATTGGGATTTTATTTTAGTC
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ATTTTCCAAGACAATTGGGATCTTTTTTAATTGATTCTTCGTTATCCCTA
TTTTCATCGGGTTTGCACATAAGAATCTTTGTATAGAATTACATAAACAC
CTCTAGAAGCATCTGAAGAGTCATATATATAAAGCAAAAAATCTGTTGAA
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GATGTGAATTAATTGTTCTTTAGATACACTTTAAAAATAGAAATATTTGC
AAAAGTATGTTAGAAAAATAAGATATTTCTGGGGTTATATATGTACGCAG
AAAATTGAGATATTATTCAATAATAATAATTATAAAATAAAACTGTAGCA
AAAATAATTCATGTATGAGGCACATATCAATACCTAATTTTAAAAAATGA
AAATCAAAACTAAGGTTTATTCCGTTTAAAGTTCAGAATGTTCGAGCTTG
CTCCAGTAAGATCCACAATGCAAAGATCTAGAAACTATAGAGAACTTATT
GTGTACAAATTTAATTAAGAAGAAAGAAAATGAAATAAGAATTGTTGTTG
AAGTGGGCATCATGTTTCCTACAGATCAAATAAATTGATGCTTTTAGTAT
TGTTTGTATCTACAAACATTATCTCAAAAAAGGTATTTTTAACATAGATA
TATGTACGTATGGGAAGTAATGTTTTAATTCAGTAATCTTAGATGTAGGT
ATGTATTGCAATTTATGTTAATATATTTACCATTGTCAACAAAAATAGTA
TAATACTTTCCATAAAGCTAAAAAAAATATATGTCTTATCATTTCTTGGT
AATAATACAAACATGGATAATGACAAAAAATCCTTGTAGCTCAGTAAACG
ACAGGATATAAATAGCCCTTCTTTTTATGTTTTGTCTCTTTTTGTAAGAA
CAAAAATGCTTCAAAATGCAAGTAAACTAAAATTACACTATGCAACAAAA
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TAAGCCGTCGAACACGAAAATGACCATTAAAACTTTCAATCTCTACAGGG
TTGGACTTTAAAGCCTTCAAAAAAAGTTTTTAGGGTATAACTACGATTCA
GTGCCATATTTCGACGTGAAAGAACTATATAGATGAAAATCAAAGTAAAT
AGCAAATTGATCCAAACATGTCAGCATTTAAAAAACGAACTATTTATTAC
TTAATCTTGATAAAAATTAATAAAAAATGTATNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TCCCCTCAATTTAAATCACAGCTGAAATAATATAATATACCTTATATTTT
AATTTGAATAAAAAAAAAAATGTTTAAAAAAGGWAAATTTTGATTGATTT
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TGAGGGGTGACTCACCTAAATAGGGGCCTTAGCCCTCTCAATCTTTAAAA
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TGCTTCAAATAACTATTTTTGTCATTACTACATTACGATCCAAATTGTTT
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ATAGTACGAAATTTCTTAATAAGAAGGATTTTTAAACCTCTAGAATACAC
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TTATTTATTTGGAGATCCAAGATCTTCATTGAAGTATTATAATAATACAA
TAAAGTCCAGTTACAGTGTTTAAAAGAGGATTCCCTACCAGAGTTGAGAG
TTGCAATGGCATTCATATATTCCAAAAGTAGAATTTTATGGAACTTCCTT
TTTTATTATAGATGTATACGACGATTCCGTAGAAGACGTGGAGGCATTGG
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TCACACACAGTTCAACATTAGTATTTGAATAATAATCAACTACTTTATAA
GTAATATTTTGGTAATCTGATAAGATATTTGAAAAAGTTAGCAGTAGAAT
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TGATGTTATTGTGAAAGAGGCCTGGCTTTTTGTAATTGATACCTGAATAC
ATTTATGTCACACATATAATATATATCATATTGAATCTCAAAGTTTTGGT
ACCTAAAATTCAATAAAAGAGATTAATATTTTATATAAATTTTTTATCCA
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GATGCCCAAAAGTAATGTTGCTAATATTAATTTAAAAATAATAATAATCT
ATATCTTTTCCTTTCTTTTAACTCAAGCAAGAATTGGCAAAAATATAAGG
AATTTAAATGGTTTAATTATGAGTCTATGTCAACTGTGTAACATGCAATA
AGATTCGTTTAATATTTGGAGTAGCATTTTTACCCCTATACACTAATTAT
GTAAAAAGAGGATGTTTACTAACAGAGGGATTTATGTGTACGTAAATCAT
ATAAAATTATTATGTTGGAATCATACTTTATTGTTGTAAACAATATAAGT
CAATATTATACAAAGTTTAGCATGTAATTTTTTTTAAATTTGTATATTAT
AAATGATAATGGACAATGTTCAATTTCTATTTCAGCGTTCCAGAGTACTC
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ATTACATCAACTGGACACGTGCTTTTTTTACTGCATTCATTCCGTTTATT
CTTTTAATTCTACTTAATGGAAAAATAGTTAATCAAATAAAAAAAGCAGA
TAAGTTTATTAGTGTAAGTTCATTAATCATCTTTTTATTTATAGTCTTAA
AGTTAAGGAGGAGATACTTTTTATATTTATTTAGTGTTTTGCATACTTTT
AGTGACATTTTATCGGATTAAGATATTGTGTAATTACTAGAGTTGTTAAA
ATAGAGATTCGAGGAAGGACGTATTATCTGCTACTCCAATTTATAAAAGA
GCTTTAAAGTTGTATCGGCCTCTGAGTATATCCCTAAAATGACCCATATT
AAAAAATCCAGTTGGAAATGTTATAAAACGTGAGTAAAATTTGTATTATG
GTGAGTCGGCGGMTGTTGGTACAAATTTAGAGMACTTCATAACAGAAAAA
AAAAAGTATTCTAAAAATATGACTTTTATTCAACAAGTTCATGCCCAGGT
CATCTTAGAATATTTTAACAAAATAGATATACATTAAAAAATTTCACTCG
CCCATAAAAACAACAGTCTTAGACATAGCCCTAGTTAAAAGCTTATACAT
ATAGATGACAACTATTCTTGTATGGATGAAGATTTCCTTAAAAATTGGAA
TATTATCAAACCAGACTTATGTTCAAAATAATAATTTAATTTTTTTTTTC
TAAACTACAAAAATATTATCTCTTATTCGTTTGCAGGAGTCAACAAACTC
TCAAAAAAGTGAGACAAAATTAGCACGCATCCTCGTATTGCTCGTCTTTT
CCTTCCTCATTTGCAATTTAGGAAAAGTTGTTTTGAACATTTATGATATT
CACATGCTTGGAACGATTGAGGCCTGCTCTCAAGCTCAACTTACATTTAA
ATCTCCCTTCTGGGTGGTCATTATGATATCAGTCAATCATCTACTTTTTG
TTATGAATTCAAGCACAAACCTTATTCTTTTTTCCGTCATTGGAACTCAG
TTCAAAATGACTCTTCTCACGATTCTGCGACTTCGCTCAGTTCCAAAACA
AACCAGAAGGTAAAGTGATATAACAATACCCTTTACACATTCACTTACGA
TACATCCTTTTATCAATAGGAAAAATTACGTACTTAATGACAATCCTCAT
GTTAAAACTCATTTTGACATGAATTCATCCAAATCAACGTACAATCATTC
TGTAAGAACTACGAATATAGATTTATGTTAG back to top
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