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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s82 | supercontig | LSalAtl2s82:1042852..1053088 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011827 >EMLSAP00000011827 ID=EMLSAP00000011827|Name=EMLSAP00000011827|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=308bp
MNECGPSGDDSSLIEDWPCSSNYESHWQRQQKSVRDRSEKCFERGEMSDI
GILSVDENWWFGATVKDFYTIDETMCEETVFWDLNYSMTFNEMSPKYIKD
KVMKMIENLGARLFEHPNFVWIERTGIEEILNRRKPGSCEPLIILNNLLR
WVLYQLDRLACCEIHNKSGSEIPIQIRLEWIKDCRDEKYSHIDIDDLEMN
LRKGTEFMPWTELSQVDYLKYVSGSKLISEEKLLQTSLELMGIVVQSPDR
LKYSEYNFRNKSLTMDFNQTDPKEDTRKDLSFNKSNREICIHGMMDGSKK
DLNSLISI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s82:1042852..1053088- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011827-707674 ID=EMLSAT00000011827-707674|Name=EMLSAT00000011827|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10237bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s82:1042852..1053088- (Lepeophtheirus salmonis)
AATTCCTATCATCAAAGCAATAGCCACACAGGTATGTCAATATAATTAAA
GTGCAATTTTGTGTTTTATTTTTATTCTAATTGATTATTCATTTATTGCC
ACTTTTAGAATGAGAACAAAAAGAGAACAAGGGGATTAAGGCAAGGAATT
TCTTCTTATGATAGATAAAGCTCTCTTCTCCATAATATATACAAATCCGA
GTACGATTTGAGTCCTTTATTCAATTATTTGAGACTCGACATGGCAAAAT
CTTCAGGAAATTGTGACTTGATTTGAAATTGAGGACTGAAGTAGTGTGTA
AAAAATGTAATTCAAGTTATAAAATATATGTATACACACAATAGATATTT
AAGCTATTATGAAAAGTTTGAGCGTGTAGTGAACTTTGTCCTATGTGTCT
CATTTTATTTTCTAAATGTAGGAGGTTGATCAGTTCAGCCACAAAAGTAG
AAACATATTTTTATTATGCATGTTCCGTTATTACTTGGGGCACAGGAGGA
GTTTGCAAGAGGGCGAGCTCCCCTTATCCTTGATCCTTGGTTGTATCAAT
ATATATTTGTTATAAACCTAGTCTGTCAATATAAGTAATTTACCCCTTCC
TTCTTCAGTACAAATGTTTTATTTTTAGACCGAGAACCTATACTCAAATT
TGGTAAATTGTATAAACTTGCCCCCTCGTTGAAATTCGATTATTACAACC
TTTTAATAATAAGAAAATAGCTTCACCAGGTGAAGCGAAGAATCGGTGTA
TGTTTAGAGTAAGGGGAGAGGGATATCGACTTTTTCGATATGTTCGGAGA
ATTAACACTGGTAAAAAATATTTTTCCTCTTTGATCTTTCTCAAGGTATA
TTGCTTGTTATAAACGTTTTAAAGATTGTTTTTTCAATGAATCTATGACA
TTTGAACGTAAATATATCCTACCTATGCTCAATTAATTGTGAATTATACA
GATGTACTTTTAAGTGTCTGAATAAATAGTGCAGGGTAATGGGAGAATGA
TTGATCAGTTATATTTATGAGAGTATATTTAATGATAAATGTTATGTGAA
GGAAAAAAATACTTTTAAAATTATAGAGTATTGACAAAAACATACAAAAG
ATAAACTTAGTTAGCAAAACAGTTTAAATTTCAATCTGATCTCATTTTAA
ATAACAGACTATAGGAAAAGGGATATCTGAAATAAATTGATAAAATATAT
ACCCTTTGTATCATACCTATTCTTCAGATCATTTAACCCTTTTAAACTGT
GACAAAAGGTACTGACGAAATTTTGTACAATATTGTTTACAATTTGTAAA
TCATACGAGTCTTATTGTATCGTTCCTTATCTAGTATTAAAAACTGTAGT
CCTCTCCAGTTCAGTCTCGATGTGGTCCATTTCAGTCCTAAAATGTCACT
CATTATATTTCTTCTTTTTTTAATCAGTTCGAGTAAACCAGACCGAATGA
CGAATGATCTTAAGGACCGATTCCTAAGGACTGACAGGACAGGTTCTATG
ACTGGACGGGCCTGAATGAATTAGATCTGACACAACAATAGTCTCAGGTC
TACCTTATTACCAAATTATTAGATATTCAATGAGCTGGAGACTAGGACTC
GAGTTCTACTTAAGTCATATTTTCTGGCTCAAGCACTACTTTGACTCATA
ATTCAAAGAATCAGGCCTGACTCGTAGTCAAAAGACTTGATTGAGACCCG
ATTGAATAATTTGATTAAATACTCGGACACGTAAAAGTGACTCGTGAACA
CCCCTGTATTTTCTATATGATGACGTCAAACAAATACATTTTTAAAAGAT
GTAAATGAATTAGTTACATACCTTTTGGTGGTAGTGGAGTAATGACACAT
TTAAAAAGGTACTATGAAAAATTGTCATTGTAAATGGTACTTGGAAAGAA
TTACTTCAAAAAAATTTAATTTTTAAACTACCTCAAAAATTTAAAATGGA
AAAAAACCCTCAAAATTATGTACTAGTCAGCCTCCCTCCTCCTGAGTACA
CAATCATCTTAAAAACATTTTATCAAGCTTTTGTTCAAAAAGTGTTGAAG
TAATTAAACAAATTTTGTTACCYAAGCCGATTCAAAAATATTTGTATCGG
AATAATACTATTACTACATTATATTAAGAATGCCCATTTCATTTTAGGTG
TATATACCCGTTTGAATGATATATTCATCGTTATGAATGAATGTGGGCCT
TCAGGGGATGACTCCTCATTGATTGAGGACTGGCCATGCTCTTCAAATTA
TGAATCTCATTGGCAACGACAACAAAAGAGTGTAAGAGATCGTTCAGAGA
AATGTTTTGAAAGAGGAGAAATGTCAGATATTGGGATTCTCTCCGTGGAT
GAAAACTGGTGGTTTGGAGCAACCGTGAAGGATTTCTACGTAAGATTATT
TGTTTGTTTTGACCCTTACTTTATAGAGTAATATAAATTGTATTTACTTC
TTCGATAGCCTTAACATGAAAATGTAGTAAAAATAAGAAATAAAATTGAC
TATTATTTTTGGAGGGAGAAAGTGTGTCAGTATTGATTTTTGTATGTTTC
TTCTGTCTCTTGTCTAAGAAATAATATCCTTCTTAATTTTATGAGCCAAT
TCTATTAATATAAGAATTAACTAATTAATAGTGTATATAAAAACAAAGCA
ATTCCCATGTGCCATAATCAAAGTTCCTGAACACAAATGAACAAGAAGTA
ACGTTTTTACAGGGCCATAAATTCCTCCTTGGCTCTGCAAGCCCTGTTCT
TCATCACATCCTCTACGAAATGGAATTCTGCGAGTCTAATAAGGATATCA
TTTTAAATTTGAATTCAAAACTCAATGTGACTCTTACTCGAACAAAAACC
TATGACTCTGAAAGGCTGGAATTGAATGGAATCCCTCCAATTGCAACTGA
GGCTCTATTAGAATATATTTATAAAGACAAGTAAGATGATTATTTTATAA
TTACATGTAGTTAAATGTGAGGCCCGTCAACACAAAATTAAGTGCGGATG
ACATATATATCTATTCTTCGACAAGTTATCGTCTACTCTTATCAATAAAT
TACTTTGTTTATACCTTTAGAAACATTGCTAATTGCAATTAAAAAAGCCT
AAATTGATCGTCACCATAAAAGAATGATAAATTAATAAATTTTATTTGAA
ATGGGCCTTATAGAGGCCAATATAAGTCTTTTAAATCAAATAAACTTTCT
AGAATATAGTACAACTCTTGAATATCTTAATCCAGTACACAATTTTGTAT
AAAGAGCTTATATTTGAGTGAAATATATCTGAGTTGTTAGCTTGAATGTA
TATATGAAATAAAAAAAATATTTTTCTTGTTTAAGATTGCTTTTACGATA
ACGCACCGCATGTCTTCTTTTGAAACATATATATTTTTTTAATATACATA
AAATTACATCATTTTTTCGTATTAACATTTATAATGATATAGTTATGTTA
ATTTAAGGTTATATGATGTAACTAGGGGAACAAGCTAATAAATAGATTTT
ACTTTTATCTCTCGTAAAGTATATCAATTAAACTTAATTATAAGCTTTGC
TTATATATATTGCAGTGCATTGCATTGTACAACACTTGCAAATTGCCATG
ACCATTTTATATACCTATGTACAATTTATGGAAAAGTTCTCCTTTTCCAG
GATCCAGTTGTACCGGGATTTCTTGGGATTTTATATGTACGGGAAAATCT
TTAATTTAATTTTTTCATTATATAAACCTCATTTAATTATATACTTTATA
TACATTAACTTAAATGTTGAAGACTAATTACATTAAGAATCACGTGGTAT
AAAGTGCTTTGCAAAAGATGTGGTATATGCATCGTTAACTGATATTACTT
AATGAAGGGAGAACCTTGGGCCCTAAAAAACAACCTGATCACTATTAGTG
ACATTGATCAAATGAAAAGATTGAGAGGTGAAAATATGTGACGAACCTAA
TATATATTCTTTCTTCCACGCATCAATACTGAAGTGTAGATTTTTTACAT
CTATATTTAAACTAGTTTAAAATATAAATATCTTCATGAATATGTAATTT
ATTTGAACTTTTGTTTTTGTTAAGGATCTGCATGATAATTGGATGAGATA
AAACCTTATTTTTATACTTTTTAGCTTTGAAATACTTTGAAAGAATATAT
TTTTCGTAACTATATTTATAAGAGCAAGTTCAAAAATGGCGTGTTGGACA
TTTTTAAAATAGTATAACGACATTTTTTACTGTCTAAAAAAATATTTTGT
ATGTTTTACGACATATTCGAAAAATACAAAGTAATAACTGAGACTCGTAG
ATTCATTTTTTATTTAAAAAAATATTATTTCGATATATAGGAGGCTTTAA
AAATCTTTATCTTTTTCGGACAACGAATTAAAGTGTCTGTTGTAATTTTT
TTTCCAGGCATACTTTTTTAATGTTAATATTTAATTTTGTTAATAGTCAA
TTTATAAACACAAAAAAAGTTGTTTAGAATTATACTTTCATTTTTATTTA
AAAAAATTATGATTTCAATTAAGAGGTGTTCAAATACGGAAAAAATTTAC
AAACTTTCCATCTCAATGGGTTACTGGATACAAAAATACTAAATTTCACA
TGATTGATTATTTACTAAAGGGATTCTCAGGATCACAAAATTTAAGAACA
ATCATTTCCTGGTAAATGAAAAACCTTAGTATGTACATACATTTATATTA
GTGTTGAACTTTAGGCCTGAAAATACTAGACCGGTCAATAGTTGTTAGAA
ATTTTATTGGGCCAAACTAATGCGTTCCATTAAAGAAGTTTGAAGCACAG
ATATATATGTATGGCAAAAGTGTGAAAAAAATATTTAGGGTAGAAAAAAA
AACATTTGAGAATTTTTTAATAAGTCTTTTATAGCGTAAAAATGTCTGTA
GATTATGACTTTTTATGTTTCAATCCTGTATTTTGTGTCGTTTTGCCGAG
AAATTTGAATTTGTAAACAATTTTTGCGTTACAAAAATTTAGAAATCCTA
ATTTTGTTGATCTATGGAATCTACAAAGTACATTTAAATAACCATTATTT
ATATTCAAATGATAGATAATGGTCAGAACTTTGAAATAAAACTGTTTAAT
TAGTTGTTCCTTTGCATAACTTTTGTGCAAAAGCCGTTTAAAAAATATGT
ATCTAGTAATAAACTGAATCGAAAATTTACACTTCTTGATAAACTCCTGG
ATTTGGGAAACCATATCAACAGATAAGGCAGGACTACAGGGCTGATTTAC
ATATATTTTTTTTTGAAATTTAATAATCTTTAAATTGATACCTAATTTAT
ACTGCTTCTTGTACCGGAATATTAAAAATATATATATTACGCCTATTCCC
TAATTTTATTGATGTGTGAAAAAAATACCGTCCGTCCCTAAAATGGGCAG
TACATAAAAACGTTAAGAGATATATACTTCAAAATTTGATCGTTTGTACC
TGAAATAGTATATTTTAGGCTGATGAGTTTAATTTTTTCCTAATAGCTGT
AATATTTCAGTTTTGTTTTTTTGAACGATTTCCGCATTTAAAATTTAAAT
CAAATTTCGCATTACAAGAGTCCACAAAAAAAATACGGAATGAGCAATAT
TCTTGAAAAGTCAATCGATTATGCCCATGAAATACTTCCATATGAAAATG
ATGTCCATTTGAGTTAAACTACTCAATACTTCTGATTTTTTTTTCCTTTA
CGAAGCAACAGCAACTCAATTTTGGAGTAAAATATTAATATTTTAGAACG
CGTGATATTGCGTAATCGAATGACCAGCAGCTACTTGATATTGACTAAAT
GAAAGTCCATTTTGTCACATAATAACTACAGGTTCTCAAAAACACAGGTA
TTTGCCTAATTGATTCACATGAAGAACTTAAAAATGCTGAAGTTTTATTT
TCATTTCTGTCAGATTAGATATACCTTTACAAAATGAATATATCTAAAAA
AAAACATTGAATATTTTGTATTTCTCACTTTAGATTTGAAGTTTACATAA
AATTTTGATTTCAAAAAAATGTATTACTTATAAGAATTCGATACTTGATA
TTGTCCAATTTTGGCAGTGAAACCAGGGTCGAATCTCAAACCATGTTATA
TATATATAATTTATTTTAACTACTTTTTAATTAAATAGGTTCTGTAAAAG
TGACTTTGAGAATGGATATAGTCGTAATTTACTCTGGAGGCTCTGGCATG
CAAGTGTAGCCTTGGAAATGGATCATTTAGCACAGATTACATCAGATGTA
GGTTTGATTACATAATTATAATTTAATTATTCTTTCAATCATTACTTCAT
TTCACAGATACATTTTAATGAGCGTTTTGACATTATGCCATTATTCAGGA
CATTAACATTTTTGATGTATTATTGTCAGCTATTGATGATAAACTCATTG
AACTCAAATCTCAATGGTCCAACATATGGAGTAAATGAATTAATAGGCAA
ACTATTAAATATTAGTCAATGAACTACTGGGCCACAAGGCAGATTAAATT
TTTTCCCCGACACTTCTCTCAGCATCAAGGAACCCTTCTGATATACCATC
ATACACCTTGCCCTCTGGTTTGTGTTGGTGACTTTCGGGCCTCCAAGGCC
AAATTTAAAAAAAAAAACTGTTTAATTTTTTTTTGAGCCCCGGCAGAAGA
ATTTACTTACCTTAGGGACCACAAGTTAACCTGCACGACCCATGAGCGGG
CTGTATTTCGGGTTATTATAAAGGGTCCTTGATTATCAGAAAAGCGGCTG
CAGGTGGATTTTTTTTATTGTTTCATAGTTTGTTTTTCCCAATATAATAT
AATTGTAATGAAGTTAAACACGATAATATTGTCTTGAAATGAAATTATTC
AAAATCATGTTACTTGCAATAAACTAACTTTATGATGGTATTAACCCCAA
CAAATTTGTATTATAATGACCATGCAACGATATTACCCAAACAATTTTAG
CAATATCTTTTTTAAAACGATCATTTTACTGTACACCGCAGGACCCAATA
AAGATTGTCTTCTGAATTTAGAATAATTAATTTTCAAAGGATATTGTTTA
TTACAAATATAATTACTATATATATATATAACTATTTTTGAATGTGCAGA
CAGATTTCTCTATTACTCAATTTAAGGAATTCCACAGAGTCTTGGTATTT
GAAGGATGAACCTATTGGCTCSYAACTTTTCCSAAGTCATTAATCCATTT
CTCTTTGATATTNGATAGAAACTTTATTTTCCTCTTTATACATCCCAGAT
GAGCTGACTACATCCCGGGACACTTAAACAGACTGAAATCATCAACCAAA
TTAAAATCAAAAGTTTCATCAATCTTAAGAGTGAAACAGTTCTTAAAAAT
AATATATTAACTTTCAGATTCATACTTTGAATCTTGCGTCTTGAATTAAA
CCAGGCCCATTCCGCTACTACTTCTACAACCTAAGTGCCACGCATAGTAT
AAAAAGTCATGTTGAACCCCAGCACCCTGTATTTGTAATTTTTCAAAAAA
CCCGTGGTTTTAGCCCTTTTTTGATGATGCAATACGTTTACAACACTAGC
AAGTAATATGCTAGAATTTTGTACTTGTTTTCATGGCTTAGATACTTGCA
ATTGCTTCCATGAAGTTTTTGAGCCCAAAAATAGTGAAACTGAGAAGTGT
TGTATTGATCCTTATTTAGGATTGAATACTTCAGTCCCGCCTATTTTAGT
CTCGGTCCGGTGCAATTTAATCCAGCATGTCAGTCCTAAAACTTATATAG
TGTGATAGTTGATGAAGTCTCTCAACTTCATTTCCTCTTTTTTAAATCAG
TTCTAGAACTGACAATTCGTAAGACCGGTCCCAAGTACTGATAGGACCGG
TTCTTAGACTGGACTGGACCGAATAAATGAGAACTGACAGAACACAAAAG
TTGAGGTCATAGGAATAAAATGAAAAAAAAAAGTTAGCTCGTTGTTAATG
ATCTATGACTGTGACGTCAGTRAAAGCKTTYTATCCACTAAATGTATTCA
TATAAATGTATAATCATCAAATAGTTGGAAAAAAAAATTGCAAAAAAACT
TGACATTTATTCTCATTTTGCATATTATATATATATTTTTTCGAACATTG
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ACACTGTAGTTTTATTCTCTTATTTTTAGACGATAGATGAGACAATGTGT
GAAGAAACAGTGTTCTGGGACTTGAATTATTCCATGACGTTTAATGAAAT
GAGCCCGAAATATATTAAGGATAAAGTGATGAAGGTAATCCATCGACTTT
GGGCAACTCTTTGCAAGGGAGAGTAATCTCATCTCTATGACCGTGGGACT
AAGATACTATAACTAGGGATTTATCGGTCTGGGAGCTTTATTAGATATGG
AAGCTCAGGTTTATGATAAATTAGAACTGGTTTTTTAAATAAAAAAAAAA
ATTGAAACTTTTTTTTAAATTGTAGCTTCAAATATTCGGACAAAATTTTG
TTATCTCTCTAAAAAAAAATATCCTTTTCACACCCATGTTGGTTATTGAC
CAAGCATTAGGAGCCATGTGCAAATTATGTAAGCACATTTTTGGCGATTT
TTGCCCAACCCTACACGTTTGCAATTGGTACGCTTAGTATACGTACTTTA
TTATTATAGATTGTGTTCACAATTTTAAAAACCTCCTACGAGCGTATGTA
CTTTTTACATGCCTCTTGGTGCTGTTCAAGAAATCACAAACGTACTCTCG
CTCTTACACAATTATGGCTCTTTTATGATTTCTTAAAAATAATAAGGTGA
CCTTTTTTCATAAAGACATTTTAGTGTAAATTTTAATGAGCAAAGGGGGA
AATTTTTTTCAATCACTTAAAATTGTGAGCACGCTTCCACTTAGACTCAT
AAATCTTGACCTAATGCTATGACCATTGAATAATAGTAACAAATGAAATG
GTGTGGACAACATCTTACACCGGATTCGATAGTTCCGTTGAAACTGAGCC
GGGTATAACTAGTGTTGGATTGGTCTAAAAAAACTAAACGACTGCATATC
TATCAGTCCGGTCCTTTTAAAATCTTCAATCCAAGGTTCAGTCCTTATCT
GTCTTTGATGGTAACTACAAAAGCTGAAATGATGTAATTCATTACTATAC
CATTTCAGTTGGAGAATTTTTATCACAACCTCTTTCAAAGAAACAAGATA
CCTAAAGGTTAAAGTAGGAGGTGAGTGGCTAGATAAAAMTCAAGTGTCAT
TATACCTTTTTAGCTATAATTCATTATTCACTTTATTTTGATATTCTTCC
ACCCTTGTTTGGAGGGAAGATATTAAAACCATAGCCAGGACTGAAGGACC
AAGTAATCTGTCCTTGAAACCGTAGAATGGAAAAAAAGATCGGAGCATAA
AAAAGGCTGCAAAGTGGGGAGGGGATACTGATTAGTGAATCAGTCGTGGG
ACAGATCCAAAACTATGTACATTATTGGATATGACCTTTTCCTGCATAAC
CCTAAATCATTTCATAGTATTTAATTGTTTATGCGTAGCTGATCACTTTA
AATTATCTTAGATGATAGAAAATTTAGGAGCACGGCTTTTTGAGCATCCA
AACTTTGTTTGGATTGAAAGAACTGGAATTGAAGAGATTCTGAATCGACG
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GGTATGTATTCCATGGGTTCCTCATTAATTTAAATTAAGTTTTAATTGTA
AACTTTTCGTAGGGTGTTGTATCAGTTGGACCGTCTAGCTTGTTGTGAGA
TTCATAATAAAAGTGGTTCAGAAATTCCAATTCAAATACGACTGGAATGG
ATCAAAGACTGTCGTGACGAAAAGTACTCACATATTGATATAGATGATTT
AGAAATGAATTTAAGGAAAGGAACTGAATTTATGCCTTGGACCGAATTAA
GCCAAGTAGATTATTTGAAATATGTTTCTGGATCAAAACTAATTTCAGAG
GAGAAATTACTTCAAACATCTTTAGAACTGATGGGAATTGTTGTTCAAAG
TCCAGATAGATTAAAGTACTCCGAATATAATTTTAGAAATAAGTCTTTGA
CGATGGACTTTAATCAAACTGATCCCAAAGAAGATACGAGAAAGGATTTA
TCATTCAATAAGTCTAATCGTGAAATTTGTATCCATGGTATGATGGATGG
ATCTAAAAAGGACTTGAATTCCCTCATATCAATCTAA back to top
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